Прямые повторы - это тип генетической последовательности, состоящей из двух или более повторов определенной последовательности. [1] Другими словами, прямые повторы - это нуклеотидные последовательности, присутствующие в нескольких копиях в геноме . Как правило, прямое повторение происходит, когда последовательность повторяется с тем же шаблоном ниже по течению. [1] Нет инверсии и обратного дополнения, связанных с прямым повторением. Он может иметь или не иметь промежуточных нуклеотидов. Нуклеотидная последовательность, выделенная жирным шрифтом, означает повторяющуюся последовательность.
- 5´ TTACG nnnnnnTTACG 3´
- 3´ AATGC nnnnnnAATGC 5´
С лингвистической точки зрения типичное прямое повторение можно сравнить со словами «до свидания». [1]
Типы [ править ]
Есть несколько типов повторяющихся последовательностей:
- Вкрапленные (или диспергированные) повторы ДНК (вкрапленные повторяющиеся последовательности) представляют собой копии мобильных элементов, вкрапленных по всему геному.
- Фланговые (или концевые) повторы (последовательности концевых повторов) представляют собой последовательности, которые повторяются на обоих концах последовательности, например длинные концевые повторы (LTR) на ретровирусах . Прямые концевые повторы находятся в одном направлении, а инвертированные концевые повторы противоположны друг другу по направлению.
- Тандемные повторы (последовательности тандемных повторов) - это повторяющиеся копии, которые лежат рядом друг с другом. Это также могут быть прямые или перевернутые повторы . В рибосомных РНК и перенос РНК генов , принадлежат к классу среднего повторяющейся ДНК.
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ a b c Ussery, Дэвид В .; Вассенаар, Труди; Борини, Стефано (22 декабря 2008 г.). «Частоты слов, повторы и структуры, связанные с повторами в бактериальных геномах». Вычисления для сравнительной микробной геномики: биоинформатика для микробиологов . Вычислительная биология. 8 (1-е изд.). Springer. С. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.
