Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Дезинтегрин
Desintegrin heterodimer.png
Структура гетеродимера дезинтегрина из Echis carinatus
Идентификаторы
СимволДезинтегрин
PfamPF00200
ИнтерПроIPR001762
PROSITEPDOC00351
SCOP21кст / СФЕРА / СУПФАМ
OPM суперсемейство227
Белок OPM2ao7
Мембранома538
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

Дезинтегрины - это семейство небольших белков (длиной 45–84 аминокислоты ) из ядов гадюки, которые действуют как мощные ингибиторы как агрегации тромбоцитов, так и интегрин- зависимой клеточной адгезии . [1] [2]

Операция [ править ]

Дезинтегрины действуют, противодействуя этапам свертывания крови , препятствуя слипанию тромбоцитов . Они взаимодействуют с семействами бета-1 и -3 рецепторов интегринов . Интегрины - это клеточные рецепторы, участвующие во взаимодействиях клетка-клетка и клетка- внеклеточный матрикс , выступающие в качестве конечного общего пути, ведущего к агрегации через образование тромбоцитов-тромбоцитов мостов, которые необходимы для тромбоза и гемостаза . Дезинтегрины содержат мотив последовательности RGD (Arg-Gly-Asp) или KGD (Lys-Gly-Asp), который специфически связывается с рецепторами интегрина IIb-IIIa на поверхности тромбоцитов, тем самым блокируя связывание фибриногена.к рецепторно-гликопротеиновому комплексу активированных тромбоцитов. Дезинтегрины действуют как антагонисты рецепторов , ингибируя агрегацию, вызванную АДФ , тромбином , фактором активации тромбоцитов и коллагеном . [3] Роль дезинтегрина в предотвращении свертывания крови делает его интересным с медицинской точки зрения, особенно в отношении его использования в качестве антикоагулянта. [4]

Типы дезинтегрин [ править ]

Были охарактеризованы дезинтегрины из разных видов змей: альболабрин, апплагин, барбурин, батроксостатин, битистатин, обтустатин, [5] шистатин, [6] эхистатин, [7] элегантцин, эристикофин, флейоридин, [8] гализин, кистрин, можастин ( Crotalus scutulatus ), рубистатин ( Crotalus ruber ), тергеминин, сальмозин, [9] цабканин ( Crotalus simus tzabcan ) [10] и трифлавин.

Дезинтегрины делятся на 5 классов: малые, средние, большие, димерные и металлопротеиназы змеиного яда. [11]

Малые дезинтегрины: 49-51 аминокислота, 4 дисульфидные связи.
Средние дезинтегрины: 70 аминокислот, 6 дисульфидных связей.
Большие дезинтегрины: 84 аминокислоты, 7 дисульфидных связей.
Димерные дезинтегрины: 67 аминокислот, 4 внутрицепочечных дисульфидных связи.
Металлопротеиназы змеиного яда: 100. аминокислоты, 8 дисульфидных связей

Эволюция семейства дезинтегринов [ править ]

Дезинтегрины эволюционировали за счет дупликации генов предкового семейства белков, семейства ADAM. Семейство малых, средних, больших и димерных дезинтегринов встречается только в семействе Viperidae, что предполагает дупликацию и диверсификацию около 12-20 миллионов лет назад. Металлопротеиназы змеиного яда встречаются во всем суперсемействе Colubroida , что позволяет предположить, что они развились до того, как Colubroida расширилась, примерно 60 миллионов лет назад. [12]

Другие источники дезинтегринных белков [ править ]

Дезинтегриноподобные белки обнаружены у различных видов, от слизистой плесени до человека. Некоторые другие белки, которые, как известно, содержат домен дезинтегрина, включают:

  • Некоторые металлопротеиназы цинка змеиного яда [13] состоят из N-концевого каталитического домена, слитого с доменом дезинтегрина. Так обстоит дело с тримерелизином I (HR1B), атролизином E (Ht-e) и триграмином. Было высказано предположение, что эти протеиназы способны отщепляться от доменов дезинтегрина и что последние могут возникать в результате такого посттрансляционного процессинга.
  • Семейства белков ADAM и ADAMTS , которые включают важные ферменты протеазы.
    • Секретируемая протеаза ADAMTS13 , обнаруженная в сыворотке крови, расщепляет фактор Виллебранда и действует как естественный эндогенный ингибитор адгезии и агрегации тромбоцитов.
    • ADAM2 (бета-фермент, бета-субъединица поверхностного белка спермы морской свинки PH30). [14] PH30 - это белок, участвующий в слиянии сперматозоидов и яйцеклеток. Бета-субъединица содержит дезинтегрин на N-конце.
    • ADAM7 (апикальный белок 1 эпидидимии млекопитающих, EAP I). [15] ADAM7 связан с мембраной сперматозоидов и может играть роль в созревании сперматозоидов. Структурно ADAM7 состоит из N-концевого домена, за которым следует домен цинк-металлопротеиназы, домен дезинтегрина и большой C-концевой домен, который содержит трансмембранную область.

См. Также [ править ]

  • АДАМ Протеин
  • Эволюция змеиного яда

Ссылки [ править ]

  1. ^ Маклэйн М.А., Санчес Е.Е., Вонг А, Paquette-ШТРАУБ С, Перес JC (2004). «Дезинтегрины». Препарат Curr нацелен на кардиоваскулярное нарушение кроветворения . 4 (4): 327–55. DOI : 10.2174 / 1568006043335880 . PMID  15578957 .
  2. ^ Lu X, Lu D, Скалли М.Ф., Kakkar В.В. (2005). «Металлопротеиназа змеиного яда, содержащая дезинтегрин-подобный домен, ее взаимосвязь структура-активность при взаимодействии с интегринами». Curr Med Chem Cardiovasc Hematol Agents . 3 (3): 249–60. DOI : 10.2174 / 1568016054368205 . PMID 15974889 . 
  3. Перейти ↑ Rahman S, Xu CS (2001). «Идентификация посредством сайт-направленного мутагенеза аминокислотных остатков, фланкирующих мотивы RGD дезинтегринов змеиного яда, по их структуре и функциям». Acta Biochim. Биофиз. Грех . 33 (2): 153–157. PMID 12050803 . 
  4. ^ Lu X, Lu D, Скалли М.Ф., Kakkar В.В. (2006). «Интегрины в нацеленных на лекарства - шаблоны RGD в токсинах». Curr Pharm Des . 12 (22): 2749–69. DOI : 10,2174 / 138161206777947713 . PMID 16918409 . 
  5. ^ Calvete JJ, Monleon D, Celda В, Паз Морено-Murciano М, Марцинкевич С (2003). «Структура раствора ЯМР дезинтегрина обтустатина без RGD». J. Mol. Биол . 329 (1): 135–45. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (03) 00371-1 . PMID 12742023 . 
  6. ^ Betzel С, Шарма S, Синг Т.П., Perbandt М, Ядав S, P Каур, Bilgrami S (2005). «Кристаллическая структура гетеродимера дезинтегрина из чешуйчатой ​​гадюки (Echis carinatus) при разрешении 1,9 A». Биохимия . 44 (33): 11058–66. DOI : 10.1021 / bi050849y . PMID 16101289 . 
  7. ^ Calvete JJ, Ковача Н, Monleon D, Celda В, Эстэв В (2005). «Конформация и согласованная динамика сайта связывания интегрина и С-концевой области эхистатина, выявленные гомоядерным ЯМР» . Biochem J . 387 (Pt 1): 57–66. DOI : 10.1042 / BJ20041343 . PMC 1134932 . PMID 15535803 .  
  8. Перейти ↑ Mizuno H, Morita T, Fujii Y, Fujimoto Z, Horii K, Okuda D (2003). «Кристаллическая структура триместатина, дезинтегрина, содержащего мотив распознавания клеточной адгезии RGD». J. Mol. Биол . 332 (5): 1115–22. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (03) 00991-4 . PMID 14499613 . 
  9. Перейти ↑ Lee W, Shin J, Kang I, Hong SY, Chung K, Jang Y, Kim DS (2003). «Структура раствора нового дезинтегрина сальмозина из яда Agkistrondon halys». Биохимия . 42 (49): 14408–15. DOI : 10.1021 / bi0300276 . PMID 14661951 . 
  10. ^ Савиола, А.Дж., Модаль, С.М. и Макесси, С.П., 2015. Дезинтегрины яда цабкана Crotalus simus: выделение, характеристика и оценка цитотоксической и антиадгезионной активности цабканина, нового дезинтегрина RGD. Biochimie, 116, pp.92-102. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2015.07.005
  11. ^ Calvete, J (2005). «Структурно-функциональные соотношения дезинтегринов змеиного яда». Curr Pharm Des . 11 (7): 825–835. DOI : 10,2174 / 1381612053381783 . PMID 15777237 . 
  12. Перейти ↑ Juárez P, Comas I, González-Candelas F, Calvete JJ (2008). "Эволюция дезинтегринов змеиного яда путем положительного дарвиновского отбора" . Молекулярная биология и эволюция . 25 (11): 2391–2407. DOI : 10.1093 / molbev / msn179 . PMID 18701431 . 
  13. ^ Тейшейра Тов Ж, Фернандиш СМ, Zuliani JP, Zamuner SF (2005). «Воспалительные эффекты металлопротеиназ змеиного яда» . Mem. Inst. Освальдо Крус . 100 : 181–4. DOI : 10.1590 / s0074-02762005000900031 . PMID 15962120 . 
  14. ^ Turck CW, Майлс DG, Примакова P, Блобель CP, Вольфсбергская TG, Белый JM (1992). «Потенциальный гибридный пептид и интегриновый лигандный домен в белке, активном при слиянии сперматозоидов и яйцеклеток». Природа . 356 (6366): 248–252. Bibcode : 1992Natur.356..248B . DOI : 10.1038 / 356248a0 . PMID 1552944 . S2CID 4233338 .  
  15. Перейти ↑ Hall L, Jones R, Barker PJ, Perry AC (1992). «Эпидидимальный белок млекопитающих с поразительным сходством последовательностей с геморрагическими пептидами змеиного яда» . Биохим. Дж . 286 (3): 671–675. DOI : 10.1042 / bj2860671 . PMC 1132955 . PMID 1417724 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Disintegrins в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001762