Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Липоксигеназа
2p0m.png
Структура 15S-липоксигеназы ретикулоцитов кролика. [1]
Идентификаторы
СимволЛипоксигеназа
PfamPF00305
ИнтерПроIPR013819
PROSITEPDOC00077
SCOP22сбл / СФЕРА / СУПФАМ
OPM суперсемейство80
Белок OPM2п0м
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры
Не путать с лизилоксидазой .

Липоксигеназы ( EC 1.13.11.- ) представляют собой семейство (не гем ) железы отработанных ферменты , большинство из которых катализируют в диоксигенирование из полиненасыщенных жирных кислот в липидах , содержащего цис, цис-1,4- пентадиен в клеточные сигнальных агент, выполняют различные роли в качестве аутокринных сигналов, которые регулируют функцию своих родительских клеток, паракринных сигналов, которые регулируют функцию соседних клеток, и эндокринных сигналов, регулирующих функцию отдаленных клеток.

Липоксигеназы связаны друг с другом на основе их сходной генетической структуры и активности диоксигенации. Однако одна липоксигеназа, ALOXE3, имея генетическую структуру липоксигеназы, обладает относительно низкой активностью диоксигенации; а его основная деятельность , как представляется, как изомеразы , который катализирует превращение гидропероксогруппы ненасыщенных жирных кислот в их 1,5- эпоксид , гидроксильных производные.

Липоксигеназы обнаружены у эукариот (растений, грибов, животных, простейших); в то время как третий домен земной жизни, археи , обладает белками с небольшим (~ 20%) сходством аминокислотной последовательности с липоксигеназами, в этих белках отсутствуют железосвязывающие остатки, и поэтому предполагается, что они не обладают липоксигеназной активностью. [2]

Биохимия [ править ]

Основываясь на подробном анализе 15-липоксигеназы 1 и стабилизированной 5-липоксигеназы, структуры липоксигеназы состоят из N-концевого бочкообразного бета- домена 15 килодальтон , небольшого (например, ~ 0,6 килодальтона) линкерного междомена (см. № домена белка. ), и относительно большой C-концевой каталитический домен, который содержит негемовое железо, критическое для каталитической активности ферментов. [3] Большинство липоксигеназ (исключение, ALOXE3) катализируют реакцию Полиненасыщенная жирная кислота + O 2 → гидропероксид жирной кислоты в четыре этапа:

  • ограничивающая скорость стадия отрыва водорода от бисаллильного метиленового углерода с образованием радикала жирной кислоты на этом атоме углерода
  • перегруппировка радикала к другому углеродному центру
  • присоединение молекулярного кислорода (O 2 ) к перегруппированному углеродному радикальному центру, в результате чего образуется пероксирадикал (-OO ·), связанный с этим углеродом
  • восстановление пероксирадикала до соответствующего аниона (-OO - )

(-Со - ) остаток может быть затем протонированным с образованием гидропероксида группы (-OOH) и далее метаболизируется в липоксигеназах к примеру лейкотриен , hepoxilins , а также различным специализированному про-посредник решения , или уменьшить вездесущей клеточный глутатион пероксидазой к гидрокси группа, тем самым образуя гидроксилированные (-ОН) полиненасыщенные жирные кислоты, такие как гидроксиэйкозатетраеновые кислоты и HODE (т.е. гидроксиоктадекаеновые кислоты). [3]

Полиненасыщенные жирные кислоты, которые служат субстратами для одной или нескольких липоксигеназ, включают омега-6 жирные кислоты , арахидоновую кислоту , линолевую кислоту , дигомо-γ-линоленовую кислоту и адреновую кислоту ; омега-3 жирных кислот , эйкозапентаеновая кислота , докозагексаеновая кислота , а также альфа-линоленовая кислота ; и омега-9 жирная кислота , медовая кислота . [4]Некоторые типы липоксигеназ, например 15-липоксигеназа 1 человека и мыши, 12-липоксигеназа B и ALOXE3, способны метаболизировать субстраты жирных кислот, которые являются составными частями фосфолипидов, сложных эфиров холестерина или сложных липидов кожи. [3] Большинство липоксигеназ катализируют образование первоначально образованных гидропероксипродуктов, имеющих S- хиральность . Исключения из этого правила включают 12R-липоксигеназы человека и других млекопитающих (см. Ниже). [3] [4] [5]

Липоксигеназы зависят от доступности их субстратов полиненасыщенных жирных кислот, которые, особенно в клетках млекопитающих, обычно поддерживаются на чрезвычайно низком уровне. В общем, различные фосфолипазы А2 и диацилглицеринлипазы активируются во время стимуляции клеток, высвобождают эти жирные кислоты из мест их хранения и, таким образом, являются ключевыми регуляторами образования липоксигеназозависимых метаболитов. [3] Кроме того, клетки при такой активации могут передавать свои высвобожденные полиненасыщенные жирные кислоты соседним или соседним клеткам, которые затем метаболизируют их посредством липоксигеназных путей в процессе, называемом трансцеллюлярным метаболизмом или трансцеллюлярным биосинтезом. [6]

Биологическая функция и классификация [ править ]

Эти ферменты наиболее распространены в растениях, где они могут участвовать во многих различных аспектах физиологии растений, включая рост и развитие, устойчивость к вредителям и старение или реакцию на ранения. [7] У млекопитающих ряд изоферментов липоксигеназ участвует в метаболизме эйкозаноидов (таких как простагландины , лейкотриены и неклассические эйкозаноиды ). [8] Данные о последовательностях доступны для следующих липоксигеназ:

Липоксигеназы растений [ править ]

Растения экспрессируют множество цитозольных липоксигеназ ( EC 1.13.11.12 InterPro :  IPR001246 ), а также то, что кажется изоферментом хлоропластов. [9] Липоксигеназа растений в сочетании с гидропероксидлиазами ответственны за многие ароматы и другие сигнальные соединения. Одним из примеров является цис-3-гексеналь , запах свежескошенной травы.

Иллюстративная трансформация с участием гидропероксидлиазы. Здесь цис-3-гексеналь образуется из линоленовой кислоты в гидропероксид под действием липоксигеназы, а затем лиазы. [10]

Липоксигеназы человека [ править ]

За исключением гена 5-LOX, который расположен на хромосоме 10q11.2, все шесть генов LOX человека расположены на хромосоме 17.p13 и кодируют одноцепочечный белок размером 75–81 кДа, состоящий из 662–711 аминокислот. . Гены LOX млекопитающих содержат 14 (ALOX5, ALOX12, ALOX15, ALOX15B) или 15 (ALOX12B, ALOXE3) экзонов с границами экзон / интрон в высококонсервативном положении. [11] [12] Шесть липоксигеназ человека вместе с некоторыми из основных продуктов, которые они производят, а также некоторые их связи с генетическими заболеваниями, следующие: [11] [13] [14] [15] [16]]

  • Арахидонат-5-липоксигеназа (ALOX5) ( EC 1.13.11.34 InterPro :  IPR001885 ), также называемая 5-липоксигеназой, 5-LOX и 5-LO. Основные продукты: метаболизирует арахидоновую кислоту до 5-гидропероксиэйкостетраеновой кислоты (5-HpETE), которая превращается в 1) 5-гидроксикозатетраеновую кислоту (5-HETE), а затем в 5-оксо-эйкозатетраеновую кислоту (5-оксо-ETE). , 2) лейкотриен A4 (LTA4), который затем может быть преобразован в лейкотриен B4 (LTB4) или лейкотриен C4 (LTC4) (LTC4 может далее метаболизироваться до лейкотриена D4 [LTD4], а затем в лейкотриен E4.[LTE4]), или 3 действующие последовательно с ALOX15, к специализированным про-рассасывающим медиаторам , липоксинам A4 и B4. ALOX5 также метаболизирует эйкозапентаеновую кислоту до набора метаболитов, которые содержат 5 двойных связей (т.е. 5-HEPE, 5-оксо-EPE, LTB5, LTC5, LTD5 и LTE5) в отличие от 4 метаболитов арахидоновой кислоты, содержащих двойные связи. Фермент, действуя последовательно с другими ферментами липоксигеназы, циклооксигеназы или цитохрома P450 , способствует метаболизму эйкозапентаеновой кислоты до резолвинов E-серии (см. Resolvin # Resolvin Es ) и докозагексаеновой кислоты до резолвинов D-серии (см. Resolvin # Resolvin Ds.). Эти резолвины также классифицируются как специализированные медиаторы, способствующие разрешению .
  • Арахидонат-12-липоксигеназа (ALOX12) ( EC 1.13.11.31 InterPro :  IPR001885 ), также называемая 12-липоксигеназой, липоксигеназой тромбоцитов (или 12-липоксигеназой тромбоцитарного типа), 12-LOX и 12-LO. Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HETE) или различных гепоксилинов (также см. 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота ).
  • Арахидонат-15-липоксигеназа-1 (ALOX15) ( EC 1.13.11.33 InterPro :  IPR001885 ), также называемая 15-липоксигеназой-1, 15-липоксигеназой эритроцитарного типа (или 15-липоксигеназой, эритроцитарного типа), 15-липоксигеназой ретикулоцитарного типа (или 15 -липоксигеназа ретикулоцитарного типа), 15-LO-1 и 15-LOX-1. Он метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 1) 15-гидропероксиэйкатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксикозатетраеновой кислоты (15-HETE), но также и до гораздо меньших количеств 2) 12-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты и, возможно, гепоксилинов. ALOX15 фактически предпочитает линолевую кислоту арахидоновой кислоте, метаболизируя линолевую кислоту до 12-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE), которая далее метаболизируется до 13-гидроксиоктадекадиеновой кислоты (13-HODE). ALOX15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые эстерифицированы до фосфолипидов и / или до холестерина , то есть сложных эфиров холестерина , в липопротеинах . Это свойство вместе с его двойной специфичностью в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE сходны с таковыми у Alox15 мыши и привели к тому, что оба фермента получили название 12/15-липоксигеназ.
  • Арахидонат-15-липоксигеназа типа II ( ALOX15B ), также называемая 15-липоксигеназой-2, 15-LOX-2 и 15-LOX-2. [17] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 15-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксиикозатетраеновой кислоты . ALOX15B имеет небольшую способность или не имеет способности метаболизировать арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиокозатетраеновой кислоты (12- (HpETE) и лишь минимальную способность метаболизировать линолевую кислоту до 13-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE).
  • Арахидонат-12-липоксигеназа, тип 12R ( ALOX12B ), также называемая 12 R- липоксигеназой, 12 R- LOX и 12 R- LO. [18] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12 R -гидроксиэйкозатетраеновой кислоты, но делает это только с низкой каталитической активностью; его наиболее физиологически важным субстратом считается сфингозин, который содержит очень длинную (16-34 атомов углерода) омега-гидроксильную жирную кислоту, которая находится в амидной связи с sn-2- азотом сфингозина на его карбокси.конец и этерифицированный с линолевой кислотой на его омега-гидроксильном конце. В клетках эпидермиса кожи ALOX12B метаболизирует линолеат в этом этерифицированном омега-гидроксиацил-сфингозине (EOS) до его 9 R- гидроперокси-аналога. Инактивирующие мутации ALOX12B связаны с кожным заболеванием человека, аутосомно-рецессивной врожденной ихтиозиформной эритродермией (ARCI). [18] [19]
  • Липоксигеназа типа эпидермиса ( ALOXE3 ), также называемая eLOX3, и липоксигеназа типа эпидермиса. [20] В отличие от других липоксигеназ, ALOXE3 проявляет только скрытую диоксигеназную активность. Скорее, его основная активность проявляется как гидропероксид-изомераза, которая метаболизирует некоторые ненасыщенные гидроперокси-жирные кислоты до их соответствующих эпоксидных спиртов и эпоксикетопроизводных, и поэтому также классифицируется как гепоксилин- синтаза. Хотя он может метаболизировать 12 S -гидропероксиэйкозатетраеновую кислоту (12 S -HpETE) до стереоизомеров R гепоксилинов A3 и B3, ALOXE3 способствует метаболизму R гидроперокси ненасыщенных жирных кислот и эффективно превращает 9 ( R) -гидроперокси аналог EOS, полученный с помощью ALOX15B, к его аналогам 9 R (10 R ), 13 R -транс-эпокси-11 E , 13 R и 9-кето-10 E , 12 Z EOS. [19] Предполагается, что ALOXE3 действует с ALOX12B в эпидермисе кожи с образованием двух последних аналогов EOS; инактивационные мутации ALOX3, аналогичные инактивирующим мутациям в ALOX12B, связаны с аутосомно-рецессивной врожденной ихтиозиформной эритродермией у людей. [19] [20] Инактивирующие мутации в ALOX3 также связаны с заболеванием человека Ламеллярный ихтиоз, тип 5 (см. Ихтиоз # Типы # Генетическое заболевание с ихтиозом ).

Две липоксигеназы могут действовать последовательно с образованием дигидрокси- или три-гидрокси-продуктов, активность которых существенно отличается от активности продуктов любой из липоксиеназ. Этот последовательный метаболизм может происходить в разных типах клеток, которые экспрессируют только одну из двух липоксигеназ в процессе, называемом трансцеллюлярным метаболизмом. Например, ALOX5 и ALOX15 или, альтернативно, ALOX5 и ALOX12 могут действовать последовательно, метаболизируя арахидоновую кислоту в липоксины (см. 15-гидроксикозатетраеновая кислота # Дальнейший метаболизм 15 (S) -HpETE, 15 (S) -HETE, 15 (R) -HpETE, 15 (R) -HETE и 15-оксо-ETE и липоксин # биосинтез ), в то время как ALOX15 и, возможно, ALOX15B могут действовать вместе с ALOX5, метаболизируя эйкозапентаеновую кислоту с целью резолвина D (см. Раздел «Продукция резолвина » ).

Липоксигеназы мыши [ править ]

Мышь - обычная модель для изучения функции липоксигеназы. Однако есть некоторые ключевые различия между липоксигеназами у мышей и людей, которые затрудняют экстраполяцию исследований на мышах на людей. В отличие от 6 функциональных липоксигеназ у человека, мыши имеют 7 функциональных липоксигеназ, и некоторые из последних обладают метаболической активностью, отличной от их человеческих ортологов . [11] [19] [21] В частности, мышиный Alox15, в отличие от человеческого ALOX15, метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 12-HpETE, а мышиный Alox15b, в отличие от человеческого ALOX15b, в первую очередь представляет собой 8-липоксигеназу, метаболизирующую арахдионовую кислоту до 8- HpETE; у человека не существует сопоставимой липоксигеназы, образующей 8-HpETE. [22]

  • По- видимому, Alox5 аналогичен по функциям человеческому ALOX5.
  • Alox12 отличается от человеческого ALOX12, который предпочтительно метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-HpETE, но также и до значительных количеств 15-HpETE, тем, что метаболизирует арахидоновую кислоту почти исключительно до 12-HpETE.
  • Alox15 (также называемый 12-Lox, 12-Lox-1 и 12/15-Lox лейкоцитарного типа) отличается от человеческого ALOX15, который в стандартных условиях анализа метаболизирует арахидоновую кислоту до продуктов 15-HpETE и 12-HpETE в диапазоне от 89 до 11, метаболизирует арахидконовую кислоту до 15-HpETE и 12-HpETE в соотношении 1: 6, т.е. его основным метаболитом является 12-HpETE. Кроме того, человеческий ALOX15 предпочитает линолевую кислоту арахидоновой кислоте в качестве субстрата, метаболизируя ее до 13-HpODE, в то время как Alox15 имеет незначительную активность в отношении линолевой кислоты или не имеет ее. Alox15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые эстерифицированы до фосфолипидов и холестерина (т.е. эфиры холестерина.). Это свойство вместе с его двойной специфичностью в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE аналогичны свойствам человеческого ALOX15 и привели к тому, что оба фермента получили название 12/15-липоксигеназ.
  • Alox15b (также называемый 8-липоксигеназой, 8-lox и 15-липоксигеназой типа II), в отличие от ALOX15B, который метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 15-HpETE и в меньшей степени линолевую кислоту до 13-HpODE, метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 8 S- HpETE и линолевая кислота до 9-HpODE. Alox15b так же эффективен, как и ALOX5, в метаболизме 5-HpETE до лейкотриенов.
  • Alox12e (12-Lox-e, 12-Lox эпидермального типа) является ортологом гена ALOX12P человека, который претерпел повреждающие мутации и не экспрессируется. ALox12e предпочитает метиловые эфиры субстратам неэфирных полиненасыщенных жирных кислот, метаболизируя сложный эфир линолевой кислоты до его 13-гидропероксизамещенного аналога и, в меньшей степени, сложный эфир арахидоновой кислоты своему 12-гидроперокси-аналогу.
  • Alox12b (e-LOX2, Lox-12 эпидермиса), по-видимому, действует аналогично ALOX12B в метаболизме линолевой кислоты EOS до его 9 R -гидроперокси-аналога и тем самым способствует целостности кожи и водонепроницаемости; у мышей, истощенных по Alox12b, развивается серьезный кожный дефект, аналогичный врожденной ихтиозиформной эритродермии. В отличие от человеческого ALOX12B, который метаболизирует арахидоновую кислоту до 12 R -HETE с низкой скоростью, Alox12b не метаболизирует арахидоновую кислоту в виде свободной acd, а метаболизирует дозу метилового эфира арахидоновой кислоты до его 12 R- гидроперокси-аналога.
  • Aloxe3 (Lox-3 эпидермиса, eLox3), по-видимому, действует аналогично ALOXe3 в метаболизме 9 R -гидопероксилинолеатного производного EOS до его эпоксидных и кетопроизводных, а также участвует в поддержании целостности кожи и водонепроницаемости. Делеция AloxE3 приводит к дефекту, аналогичному врожденной ихтиозиформной эритродермии.
Кроличья 15-липоксигеназа (синий) с ингибитором (желтый), связанным в активном центре

3D-структура [ править ]

Известно несколько структур липоксигеназы, в том числе: липоксигеназа L1 и L3 соевых бобов, 8-липоксигеназа коралла, 5-липоксигеназа человека, 15-липоксигеназа кролика и каталитический домен 12-липоксигеназы лейкоцитов свиньи. Белок состоит из небольшого N-концевого домена PLAT и основного C-концевого каталитического домена (см. Ссылку на Pfam в этой статье), который содержит активный сайт.. Как в ферментах растений, так и в ферментах млекопитающих N-концевой домен содержит восьмицепочечный антипараллельный β-ствол, но в липоксигеназах сои этот домен значительно больше, чем в ферменте кролика. Липоксигеназы растений могут быть ферментативно расщеплены на два фрагмента, которые остаются прочно связанными, пока фермент остается активным; разделение двух доменов приводит к потере каталитической активности. С-концевой (каталитический) домен состоит из 18-22 спиралей и одного (у фермента кролика) или двух (у ферментов сои) антипараллельных β-листов на противоположном конце от N-концевого β-цилиндра.

Активный сайт [ править ]

Атом железа в липоксигеназах связан с четырьмя лигандами, три из которых являются остатками гистидина. [23] Шесть гистидинов консервативны во всех последовательностях липоксигеназы, пять из них находятся в кластере из 40 аминокислот. Эта область содержит два из трех цинк-лигандов; другие гистидины, как было показано [24], важны для активности липоксигеназ.

Две длинные центральные спирали пересекаются в активном центре; обе спирали включают внутренние участки π-спирали, которые обеспечивают три гистидиновых (His) лиганда для железа в активном центре. Две полости в основном домене липоксигеназы-1 сои (полости I и II) простираются от поверхности к активному центру. Воронкообразная полость I может функционировать как канал для кислорода; длинная узкая полость II предположительно является карманом для подложки. Более компактный фермент млекопитающих содержит только одну полость в форме ботинка (полость II). В липоксигеназе-3 соевых бобов есть третья полость, которая проходит от участка железа до поверхности раздела β-цилиндрического и каталитического доменов. Полость III, участок железа и полость II образуют непрерывный проход через молекулу белка.

Железо активного центра координируется N ε трех консервативных остатков His и одним кислородом C-концевой карбоксильной группы. Кроме того, в ферментах сои кислород боковой цепи аспарагина слабо связан с железом. В липоксигеназе кролика этот остаток Asn заменен на His, который координирует железо через атом N δ . Таким образом, координационное число железа равно пяти или шести, с гидроксильным или водным лигандом к гексакоординированному железу.

Детали об особенностях активного центра липоксигеназы были обнаружены в структуре комплекса каталитических доменов 12-липоксигеназы лейкоцитов свиней [23] [25]. В трехмерной структуре ингибитор аналог субстрата занимал U-образный канал, открытый рядом с сайтом железа. Этот канал может принимать арахидоновую кислоту без особых вычислений, определяя детали связывания субстрата для липоксигеназной реакции. Кроме того, вероятный канал доступа, который перехватывает канал связывания субстрата и распространяется до поверхности белка, можно считать для кислородного пути.

Биохимическая классификация [ править ]

EC 1.13.11.12липоксигеназа(линолеат: кислород-13-оксидоредуктаза)линолеат + O 2 = (9 Z , 11 E , 13 S ) -13-гидропероксиоктадека-9,11-диеноат
EC 1.13.11.31арахидонат-12-липоксигеназа(арахидонат: кислород-12-оксидоредуктаза)арахидонат + O 2 = (5 Z , 8 Z , 10 E , 12 S , 14 Z ) -12-гидропероксиикоса-5,8,10,14-тетраеноат
EC 1.13.11.33арахидонат-15-липоксигеназа(арахидонат: кислород-15-оксидоредуктаза)арахидонат + O 2 = (5 Z , 8 Z , 11 Z , 13 E , 15 S ) -15-гидропероксиикоса-5,8,11,13-тетраеноат
EC 1.13.11.34арахидонат-5-липоксигеназа(арахидонат: кислород-5-оксидоредуктаза)арахидонат + O 2 = лейкотриен A 4 + H 2
EC 1.13.11.40арахидонат-8-липоксигеназа(арахидонат: кислород-8-оксидоредуктаза)арахидонат + O 2 = (5 Z , 8 R , 9 E , 11 Z , 14 Z ) -8-гидропероксиикоса-5,9,11,14-тетраеноат

Липоксигеназа 1 сои демонстрирует наибольший кинетический изотопный эффект H / D (KIE) на kcat (kH / kD) (81 близкая к комнатной температуре), о котором сообщалось для биологической системы. Недавно чрезвычайно повышенный KIE от 540 до 730 был обнаружен у двойного мутанта соевой липоксигеназы 1. [26] Из-за большой величины KIE липоксигеназа сои 1 послужила прототипом для катализируемых ферментами реакций водородного туннелирования.

Белки человека, экспрессируемые из семейства липоксигеназ, включают ALOX12 , ALOX12B , ALOX15 , ALOX15B , ALOX5 и ALOXE3 . В то время как люди также обладают геном ALOX12P2 , который является ортологом хорошо экспрессируемого гена Alox12P у мышей, ген человека является псевдогеном ; следовательно, белок ALOX12P2 не обнаруживается у человека. [27]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Choi J, Chon JK, Kim S, Shin W (февраль 2008 г.). «Конформационная гибкость в 15S-липоксигеназе млекопитающих: переинтерпретация кристаллографических данных». Белки . 70 (3): 1023–32. DOI : 10.1002 / prot.21590 . PMID  17847087 .
  2. ^ Powell WS, Рокач J (2015). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 340–55. DOI : 10.1016 / j.bbalip.2014.10.008 . PMC 5710736 . PMID 25449650 .  
  3. ^ а б в г д Кун Х, Бантия С, ван Лейен К. (2015). «Липоксигеназы млекопитающих и их биологическое значение» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 308–30. DOI : 10.1016 / j.bbalip.2014.10.002 . PMC 4370320 . PMID 25316652 .  
  4. ^ a b Габбс М., Ленг С., Девасси Дж. Г., Монируджаман М., Аукема Н. М. (2015) «Достижения в нашем понимании оксилипинов, полученных из диетических ПНЖК» . Достижения в области питания (Bethesda, Мэриленд) . 6 (5): 513–40. DOI : 10,3945 / an.114.007732 . PMC 4561827 . PMID 26374175 .  
  5. ^ Mashima R, Окуяма Т (2015). «Роль липоксигеназ в патофизиологии; новые взгляды и перспективы на будущее» . Редокс-биология . 6 : 297–310. DOI : 10.1016 / j.redox.2015.08.006 . PMC 4556770 . PMID 26298204 .  
  6. ^ Капра В, Г. Е. Rovati, Мангано Р, Буччеллати С, Мерфи RC, Sala А (2015). «Трансцеллюлярный биосинтез эйкозаноидных липидных медиаторов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 377–82. DOI : 10.1016 / j.bbalip.2014.09.002 . PMID 25218301 . 
  7. Перейти ↑ Vick BA, Zimmerman DC (1987). «Окислительные системы для модификации жирных кислот: путь липоксигеназы». Окислительные системы для модификации жирных кислот: путь липоксигеназы . 9 . С. 53–90. DOI : 10.1016 / b978-0-12-675409-4.50009-5 . ISBN 9780126754094.
  8. ^ Needleman Р, Турка Дж, Jakschik Б. А., Моррисон Р., Lefkowith JB (1986). «Метаболизм арахидоновой кислоты». Анну. Rev. Biochem . 55 : 69–102. DOI : 10.1146 / annurev.bi.55.070186.000441 . PMID 3017195 . 
  9. ^ Танака К, Охты Н, Пэн Ю.Л., Shirano Y, Hibino Т, Шибата D (1994). «Новая липоксигеназа из риса. Первичная структура и специфическая экспрессия при несовместимой инфекции рисовым грибком». J. Biol. Chem . 269 (5): 3755–3761. PMID 7508918 . 
  10. ^ KenjiMatsui (2006). «Летучие вещества зеленых листьев: гидропероксидлиазный путь метаболизма оксилипина». Текущее мнение в биологии растений . 9 (3): 274–280. DOI : 10.1016 / j.pbi.2006.03.002 . PMID 16595187 . 
  11. ^ a b c Krieg, P; Фюрстенбергер, G (2014). «Роль липоксигеназ в эпидермисе». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (3): 390–400. DOI : 10.1016 / j.bbalip.2013.08.005 . PMID 23954555 . 
  12. ^ "Арахидонат-5-липоксигеназа ALOX5 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI" .
  13. ^ Haeggström, JZ; Функ, CD (2011). «Липоксигеназные и лейкотриеновые пути: биохимия, биология и роль в заболевании». Химические обзоры . 111 (10): 5866–98. DOI : 10.1021 / cr200246d . PMID 21936577 . 
  14. ^ Бардена AE, Mas E, Mori TA (2016). «Добавки n-3 жирных кислот и пролонгированные медиаторы воспаления» . Текущее мнение в липидологии . 27 (1): 26–32. DOI : 10,1097 / MOL.0000000000000262 . PMID 26655290 . 
  15. Перейти ↑ Qu Q, Xuan W, Fan GH (2015). «Роль резолвинов в разрешении острого воспаления». Cell Biology International . 39 (1): 3–22. DOI : 10.1002 / cbin.10345 . PMID 25052386 . 
  16. ^ Романо М, Чанчите Е, Ж Simiele, Recchiuti А (2015). «Липоксины и липоксины, вызываемые аспирином в разрешении воспаления». Европейский журнал фармакологии . 760 : 49–63. DOI : 10.1016 / j.ejphar.2015.03.083 . PMID 25895638 . 
  17. ^ "WikiGenes - Совместная публикация" . WikiGenes - Совместная публикация . Проверено 17 апреля 2018 года .
  18. ^ a b «WikiGenes - Совместная публикация» . WikiGenes - Совместная публикация . Проверено 17 апреля 2018 года .
  19. ^ a b c d Муньос-Гарсия, А; Томас, CP; Кини, DS; Чжэн, Y; Brash, AR (2014). «Важность пути липоксигеназа-гепоксилин в эпидермальном барьере млекопитающих» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (3): 401–8. DOI : 10.1016 / j.bbalip.2013.08.020 . PMC 4116325 . PMID 24021977 .  
  20. ^ a b «WikiGenes - Совместная публикация» . WikiGenes - Совместная публикация . Проверено 17 апреля 2018 года .
  21. ^ Тейлор, PR; Heydeck, D; Джонс, GW; Krönke, G; Функ, CD; Кнаппер, S; Адамс, Д.; Kühn, H; О'Доннелл, В. Б. (2012). «Развитие миелопролиферативного заболевания при дефиците 12/15-липоксигеназы» . Кровь . 119 (25): 6173–4, ответ автора 6174–5. DOI : 10.1182 / кровь-2012-02-410928 . PMC 3392071 . PMID 22730527 .  
  22. ^ Коул, BK; Либ, округ Колумбия; Добрян, А.Д .; Надлер, JL (2013). «12- и 15-липоксигеназы при воспалении жировой ткани» . Простагландины и другие липидные медиаторы . 104–105: 84–92. DOI : 10.1016 / j.prostaglandins.2012.07.004 . PMC 3526691 . PMID 22951339 .  
  23. ^ а б Бойингтон Дж. К., Гаффни Б. Дж., Амзель Л. М. (1993). «Трехмерная структура 15-липоксигеназы арахидоновой кислоты». Наука . 260 (5113): 1482–1486. Bibcode : 1993Sci ... 260.1482B . DOI : 10.1126 / science.8502991 . PMID 8502991 . 
  24. ^ Steczko Дж, Донох П., Клеменс JC, Диксон JE, Аксельрод В (1992). «Консервативные остатки гистидина в липоксигеназе сои: функциональные последствия их замены». Биохимия . 31 (16): 4053–4057. DOI : 10.1021 / bi00131a022 . PMID 1567851 . 
  25. ^ Xu, S .; Mueser TC; Marnett LJ; Функ М.О. (2012). «Кристаллическая структура комплекса каталитический домен 12-липоксигеназы-ингибитор идентифицирует канал связывания субстрата для катализа» . Структура . 20 (9): 1490–7. DOI : 10.1016 / j.str.2012.06.003 . PMC 5226221 . PMID 22795085 .  
  26. ^ Ху, S; Шарма, Южная Каролина; Scouras, AD; Судачков, А.В.; Карр, Калифорния; Hammes-Schiffer, S; Альбер, Т; Клинман, JP (2014). «Чрезвычайно повышенные кинетические изотопные эффекты при комнатной температуре позволяют количественно оценить критическую роль ширины барьера в ферментативной активации CH» . Журнал Американского химического общества . 136 (23): 8157–60. DOI : 10.1021 / ja502726s . PMC 4188422 . PMID 24884374 .  
  27. ^ "WikiGenes - Совместная публикация" . WikiGenes - Совместная публикация . Проверено 17 апреля 2018 года .

Внешние ссылки [ править ]

  • LOX-DB - База данных липоксигеназ
  • Железосвязывающая область липоксигеназы в PROSITE
  • PDB : 1YGE - структура липоксигеназы-1 сои ( Glycine max )
  • PDB : 1IK3 - структура липоксигеназы-3 сои в комплексе с (9 Z , 11 E , 13 S ) -13-гидропероксиоктадека-9,11-диеновой кислотой
  • PDB : 1LOX - структура кроличьей 15-липоксигеназы в комплексе с ингибитором
  • PDB : 3RDE - структура каталитического домена 12-липоксигеназы свиного лейкоцита с ингибитором
  • UMich Ориентация белков в мембранах семейства / суперсемейство-87 - липоксигеназы животных
  • Липоксигеназа в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Время бланширования и влияние сорта на качество замороженной и хранимой кукурузы и брокколи - инактивация липоксигеназы, пероксидазы, ферментов цистинлиазы при бланшировании
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001024