Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
N 6 -метиладенозин
N6-Methyladenosine.svg
Имена
Название ИЮПАК
N- метиладенозин
Другие имена
м 6 А
Идентификаторы
3D модель ( JSmol )
ЧЭБИ
ChemSpider
UNII
  • InChI = 1S / C11H15N5O4 / c1-12-9-6-10 (14-3-13-9) 16 (4-15-6) 11-8 (19) 7 (18) 5 (2-17) 20- 11 / h3-5,7-8,11,17-19H, 2H2,1H3, (H, 12,13,14) / t5-, 7-, 8-, 11- / м1 / с1
    Ключ: VQAYFKKCNSOZKM-IOSLPCCCSA-N
  • InChI = 1 / C11H15N5O4 / c1-12-9-6-10 (14-3-13-9) 16 (4-15-6) 11-8 (19) 7 (18) 5 (2-17) 20- 11 / h3-5,7-8,11,17-19H, 2H2,1H3, (H, 12,13,14) / t5-, 7-, 8-, 11- / м1 / с1
    Ключ: VQAYFKKCNSOZKM-IOSLPCCCBA
  • n2c1c (ncnc1NC) n (c2) [C @@ H] 3O [C @@ H] ([C @@ H] (O) [C @ H] 3O) CO
Характеристики
C 11 H 15 N 5 O 4
Молярная масса281,272  г · моль -1
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки на инфобоксы

N 6 -метиладенозин ( m 6 A ) был первоначально идентифицирован и частично охарактеризован в 1970-х годах [1] [2] [3] [4] и представляет собой обширную модификацию мРНК и ДНК. [5] Он содержится в некоторых вирусах [4] [3] и большинстве эукариот, включая млекопитающих, [2] [1] [6] [7] насекомых, [8] растениях [9] [10] [11] и дрожжи. [12] [13] Он также содержится в тРНК , рРНК и малой ядерной РНК.(мяРНК), а также несколько длинных некодирующих РНК , таких как Xist . [14] [15]

Метилирование из аденозина направлено большим м 6 А метилтрансферазы комплекс , содержащий METTL3 как СЭМ-связывающего подблок. [16] In vitro этот метилтрансферазный комплекс предпочтительно метилирует олигонуклеотиды РНК, содержащие GGACU [17], и аналогичное предпочтение было выявлено in vivo в картированных сайтах m 6 A в геномной РНК вируса саркомы Рауса [18] и в мРНК бычьего пролактина. [19] Более поздние исследования охарактеризовали другие ключевые компоненты m 6Комплекс метилтрансферазы у млекопитающих, включая METTL14, [20] [21] белок, ассоциированный с опухолью Вильмса 1 (WTAP), [20] [22] KIAA1429 [23] и METTL5. [24] После предположений 2010 года о том, что m 6 A в мРНК является динамичной и обратимой, [25] открытие первой m 6 A деметилазы, жировой массы и белка, связанного с ожирением (FTO) в 2011 году [26], подтвердило эту гипотезу и возродил интерес к изучению m 6 A. Второй гомолог m 6 A деметилазы alkB 5 (ALKBH5) позже был открыт также. [27]

Биологические функции m 6 A опосредуются группой РНК-связывающих белков, которые специфически распознают метилированный аденозин на РНК. Эти связывающие белки называют читателями m 6 A. Семейство белков домена гомологии YT521-B (YTH) ( YTHDF1 , YTHDF2 , YTHDF3 и YTHDC1 ) было охарактеризовано как прямые считыватели m 6 A и имеют консервативный карман для связывания m 6 A. [15] [28] [29] [30] [31] Инсулиноподобный фактор роста-2 мРНК-связывающие белки 1, 2 и 3 (IGF2BP1–3) описаны как новый класс считывателей m6A. [32]IGF2BP используют домены гомологии K (KH) для избирательного распознавания m6A-содержащих РНК и обеспечения их трансляции и стабильности. [32] Эти ридеры m 6 A вместе с метилтрансферазами m 6 A (писатели) и деметилазами (стиратели) устанавливают сложный механизм регуляции m 6 A, в котором писатели и стиратели определяют распределение m 6 A на РНК, тогда как ридеры опосредуют m 6 A-зависимые функции. Было также показано, что m 6 A является посредником в структурном переключателе, называемом переключателем m 6 A. [33]

Распространение видов [ править ]

Дрожжи [ править ]

У почкующихся дрожжей ( Sacharomyces дрожжей ), в гомолог из METTL3 , IME4 индуцируется в диплоидных клетках в ответ на азот и источник углерода голод брожению и необходим для мРНК метилирования и инициаций правильного мейоза и спорообразования. [12] [13] мРНК IME1 и IME2, ключевых ранних регуляторов мейоза , как известно, являются мишенями для метилирования , как и транскрипты самого IME4. [13]

Растения [ править ]

У растений большая часть m 6 A находится в пределах 150 нуклеотидов до начала поли (A) хвоста . [34]

Мутации MTA, гомолога METTL3 Arabidopsis thaliana , приводят к остановке эмбриона на глобулярной стадии. Снижение уровня m 6 A более чем на 90% в зрелых растениях приводит к резкому изменению структуры роста и аномалиям гомеоза цветов. [34]

Млекопитающие [ править ]

Картирование m 6 A в РНК человека и мыши выявило более 18 000 сайтов m 6 A в транскриптах более 7000 генов человека с согласованной последовательностью [G / A / U] [G> A] m 6 AC [U> A / C] [14] [15] [35] в соответствии с ранее идентифицированным мотивом. Локализация отдельных м 6 сайтов А во многих мРНК весьма похожи между человеком и мышью , [14] [15] и транскриптом -широкий анализ показывает , что т 6 А содержится в областях с высокой эволюционной консервации . [14] м 6A находится внутри длинных внутренних экзонов и предпочтительно обогащен в пределах 3 'UTR и вокруг стоп-кодонов . m 6 A в пределах 3 'UTR также ассоциируется с присутствием сайтов связывания микроРНК; примерно 2/3 мРНК, которые содержат сайт m 6 A в пределах их 3 'UTR, также имеют по крайней мере один сайт связывания микроРНК. [14] Путем интеграции всех данных секвенирования m 6 A новая база данных под названием RMBase выявила и предоставила ~ 200 000 сайтов в геномах человека и мыши, соответствующих N6-метиладенозинам (m 6 A) в РНК. [35]

Точное картирование m6A с помощью m6A-CLIP / IP [36] (кратко m6A- CLIP ) показало, что большая часть m6A располагается в последнем экзоне мРНК во многих тканях / культивируемых клетках мыши и человека [36], а также обогащение m6A вокруг Стоп-кодоны - это совпадение, что многие стоп-кодоны располагаются вокруг начала последних экзонов, где m6A действительно обогащен. [36] Большое присутствие m6A в последнем экзоне (> = 70%) делает возможной регуляцию 3'UTR, включая альтернативное полиаденилирование. [36] Исследование, объединяющее m6A-CLIP с биохимией строгого клеточного фракционирования, показывает, что модификации мРНК m6A депонируются в формирующейся пре-мРНК и не требуются для сплайсинга, но определяют цитоплазматический оборот. [37] [38]

m 6 A подвержен динамической регуляции как на протяжении всего развития, так и в ответ на клеточные стимулы. Анализ m 6 A в РНК мозга мышей показывает, что уровни m 6 A низкие во время эмбрионального развития и резко возрастают к взрослой жизни. [14] Кроме того, подавление активности метилтрансферазы m 6 A значительно влияет на экспрессию генов и альтернативные паттерны сплайсинга РНК , что приводит к модуляции сигнального пути p53 (также известного как TP53 ) и апоптозу . [15]

m 6 A также обнаруживается в компонентах РНК R-петель в клетках человека, где он участвует в регуляции стабильности гибридов РНК: ДНК. [39]

Недавно была продемонстрирована важность метилирования m 6 A для физиологических процессов. Ингибирование метилирования m 6 A посредством фармакологического ингибирования клеточного метилирования или, более конкретно, посредством siRNA-опосредованного подавления m 6 A метилазы Mettl3, приводило к удлинению циркадного периода. Напротив, сверхэкспрессия Mettl3 приводит к более короткому периоду. Циркадные часы млекопитающих , состоящие из петли обратной связи транскрипции, которая жестко регулируется и колеблется с периодом около 24 часов, поэтому чрезвычайно чувствительны к нарушениям m 6 A-зависимого процессинга РНК, вероятно, из-за присутствия m 6Сайты в транскриптах генов часов. [40] [41] Эффекты глобального ингибирования метилирования на циркадный период в клетках мыши можно предотвратить эктопической экспрессией фермента бактериального метаболизма метила. Клетки мыши, экспрессирующие этот бактериальный белок, были устойчивы к фармакологическому подавлению метильного метаболизма, не обнаруживая снижения метилирования мРНК m 6 A или метилирования белка . [42]

Клиническое значение [ править ]

Учитывая универсальные функции m 6 A в различных физиологических процессах, неудивительно, что обнаруживаются связи между m 6 A и многочисленными человеческими заболеваниями; многие из них возникли в результате мутаций или однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) родственных факторов m 6 A. Связь между m 6 A и многочисленными типами рака была указана в отчетах, которые включают рак желудка, рак простаты, рак груди, рак поджелудочной железы, рак почки. , мезотелиома, саркома и лейкемия. [43] [44] [45] [46] [47] [48] [49] [50] [51] [52] [53] [54] Удары м 6Вопрос о пролиферации раковых клеток может быть гораздо более глубоким по мере появления большего количества данных. Истощение METTL3, как известно, вызывает апоптоз раковых клеток и снижает инвазивность раковых клеток [55] [56], в то время как активация ALKBH5 гипоксией вызывает обогащение раковых стволовых клеток. [57] m 6 A также показан в регуляции энергетического гомеостаза и ожирения, поскольку FTO является ключевым регуляторным геном энергетического метаболизма и ожирения. Было показано, что SNP FTO связаны с индексом массы тела в популяциях людей и возникновением ожирения и диабета. [58] [59] [60] [61] [62]Было высказано предположение о влиянии FTO на дифференцировку преадипоцитов. [63] [64] [65] Связь между m 6 A и нейрональными расстройствами также изучалась. Например, на нейродегенеративные заболевания может влиять m 6 A, поскольку было показано, что передача сигналов родственного дофамина зависит от FTO и корректирует метилирование m 6 A в ключевых сигнальных транскриптах. [66] Известно, что мутации в HNRNPA2B1, потенциальном считывающем устройстве m 6 A, вызывают нейродегенерацию. [67] IGF2BP1–3, новый класс m 6Читатель имеет онкогенные функции. Нокдаун или нокаут IGF2BP1–3 снижает экспрессию белка MYC, пролиферацию клеток и образование колоний в линиях раковых клеток человека. [32] ZC3H13, член комплекса метилтрансферазы m6A, заметно ингибирует рост клеток колоректального рака при нокдауне. [68]

Кроме того, сообщалось , что m 6 A влияет на вирусные инфекции. Известно, что многие РНК-вирусы, включая SV40, аденовирус, вирус герпеса, вирус саркомы Рауса и вирус гриппа, содержат внутреннее метилирование m 6 A на вирусной геномной РНК. [69] Несколько более поздних исследований показали, что регуляторы m 6 A управляют эффективностью инфицирования и репликации РНК-вирусов, таких как вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), вирус гепатита С (HCV) и вирус Зика (ZIKV). [70] [71] [72] [73] [74] Эти результаты предполагают, что m 6 A и родственные ему факторы играют решающую роль в регуляции жизненных циклов вируса и взаимодействий между хозяином и вирусом.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Адамс JM, Кори S (май 1975). «Модифицированные нуклеозиды и причудливые 5'-концы в мРНК миеломы мыши». Природа . 255 (5503): 28–33. Bibcode : 1975Natur.255 ... 28А . DOI : 10.1038 / 255028a0 . PMID  1128665 .
  2. ^ a b Desrosiers R, Friderici K, Rottman F (октябрь 1974 г.). «Идентификация метилированных нуклеозидов в матричной РНК из клеток гепатомы Новикова» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 71 (10): 3971–5. Bibcode : 1974PNAS ... 71.3971D . DOI : 10.1073 / pnas.71.10.3971 . PMC 434308 . PMID 4372599 .  
  3. ^ а б Алони Ю., Дхар Р., Хури Г. (октябрь 1979 г.). «Метилирование 40 РНК ядерного обезьяньего вируса» . Журнал вирусологии . 32 (1): 52–60. DOI : 10,1128 / JVI.32.1.52-60.1979 . PMC 353526 . PMID 232187 .  
  4. ^ a b Бимон К., Кейт Дж. (июнь 1977 г.). «Локализация N6-метиладенозина в геноме вируса саркомы Рауса». Журнал молекулярной биологии . 113 (1): 165–79. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (77) 90047-X . PMID 196091 . 
  5. ^ Цзи, Пэнфэй; Ван, Ся; Се, Нина; Ли, Юйцзин (2018). «N6-Метиладенозин в РНК и ДНК: эпитранскриптомный и эпигенетический игрок, участвующий в определении судьбы стволовых клеток» . Стволовые клетки International . 2018 : 3256524. дои : 10,1155 / 2018/3256524 . PMC 6199872 . PMID 30405719 .  
  6. ^ Вэй CM, Gershowitz A, B Мосс (январь 1976). «5'-Концевые и внутренние метилированные нуклеотидные последовательности в мРНК клетки HeLa». Биохимия . 15 (2): 397–401. DOI : 10.1021 / bi00647a024 . PMID 174715 . 
  7. ^ Perry RP, Kelley DE, Friderici K, Rottman F (апрель 1975). «Метилированные компоненты матричной РНК L-клеток: свидетельство необычного кластера на 5'-конце» . Cell . 4 (4): 387–94. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (75) 90159-2 . PMID 1168101 . 
  8. ^ Levis R, Penman S (апрель 1978). «5'-концевые структуры поли (А) + цитоплазматической информационной РНК и поли (А) + и поли (А) - гетерогенных ядерных РНК клеток двукрылых Drosophila melanogaster». Журнал молекулярной биологии . 120 (4): 487–515. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (78) 90350-9 . PMID 418182 . 
  9. ^ Nichols JL (1979). «В поли (А) -содержащей РНК кукурузы». Письма о растениеводстве . 15 (4): 357–361. DOI : 10.1016 / 0304-4211 (79) 90141-X .
  10. Перейти ↑ Kennedy TD, Lane BG (июнь 1979). «Рибонуклеаты зародышей пшеницы. XIII. Метилзамещенные нуклеозидные составляющие и 5'-концевые динуклеотидные последовательности в основной массе поли (AR) -богатой РНК от набухающих зародышей пшеницы». Канадский журнал биохимии . 57 (6): 927–31. DOI : 10.1139 / o79-112 . PMID 476526 . 
  11. Перейти ↑ Zhong S, Li H, Bodi Z, Button J, Vespa L, Herzog M, Fray RG (май 2008 г.). «MTA представляет собой аденозинметилазу матричной РНК Arabidopsis, которая взаимодействует с гомологом фактора сплайсинга, специфичного для пола» . Растительная клетка . 20 (5): 1278–88. DOI : 10.1105 / tpc.108.058883 . PMC 2438467 . PMID 18505803 .  
  12. ^ a b Клэнси MJ, Shambaugh ME, Timpte CS, Bokar JA (октябрь 2002 г.). «Индукция споруляции у Saccharomyces cerevisiae приводит к образованию N6-метиладенозина в мРНК: потенциальный механизм активности гена IME4» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (20): 4509–18. DOI : 10.1093 / NAR / gkf573 . PMC 137137 . PMID 12384598 .  
  13. ^ a b c Боди З., Баттон Д. Д., Грирсон Д., Фрей Р. Г. (сентябрь 2010 г.). «Дрожжевые мишени для метилирования мРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (16): 5327–35. DOI : 10.1093 / NAR / gkq266 . PMC 2938207 . PMID 20421205 .  
  14. ^ Б с д е е Meyer KD, Saletore Y, Зумбо P, O, Elemento Mason CE, Jaffrey SR (июнь 2012). «Всесторонний анализ метилирования мРНК показывает обогащение 3 'UTRs и почти стоп-кодонами» . Cell . 149 (7): 1635–46. DOI : 10.1016 / j.cell.2012.05.003 . PMC 3383396 . PMID 22608085 .  
  15. ^ a b c d e Dominissini D, Moshitch-Moshkovitz S, Schwartz S, Salmon-Divon M, Ungar L, Osenberg S, Cesarkas K, Jacob-Hirsch J, Amariglio N, Kupiec M, Sorek R, Rechavi G (апрель 2012 г. ). «Топология метиломов РНК m6A человека и мыши, выявленная с помощью m6A-seq». Природа . 485 (7397): 201–6. Bibcode : 2012Natur.485..201D . DOI : 10.1038 / nature11112 . PMID 22575960 . 
  16. ^ Bokar JA, Шамбо ME, Polayes D, Матера AG, Rottman FM (ноябрь 1997). «Очистка и клонирование кДНК адоМет-связывающей субъединицы человеческой мРНК (N6-аденозин) -метилтрансферазы» . РНК . 3 (11): 1233–47. PMC 1369564 . PMID 9409616 .  
  17. ^ Harper JE, Miceli С.М., Roberts RJ, Manley JL (октябрь 1990). «Последовательность специфичности человеческой мРНК N6-аденозинметилазы in vitro» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (19): 5735–41. DOI : 10.1093 / NAR / 18.19.5735 . PMC 332308 . PMID 2216767 .  
  18. ^ Kane SE, Beemon K (сентябрь 1985). «Точная локализация m6A в РНК вируса саркомы Рауса выявляет кластеризацию сайтов метилирования: последствия для процессинга РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 5 (9): 2298–306. DOI : 10.1128 / mcb.5.9.2298 . PMC 366956 . PMID 3016525 .  
  19. ^ Horowitz S, Horowitz A, Нильсен TW, Munns TW, Rottman FM (сентябрь 1984). «Картирование остатков N6-метиладенозина в мРНК бычьего пролактина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 81 (18): 5667–71. Bibcode : 1984PNAS ... 81.5667H . DOI : 10.1073 / pnas.81.18.5667 . PMC 391771 . PMID 6592581 .  
  20. ^ а б Лю Дж, Юэ И, Хан Д, Ван Х, Фу И, Чжан Л, Цзя Г, Ю М, Лу З, Дэн Х, Дай Кью, Чен В, Хе Ц (февраль 2014 г.). «Комплекс METTL3-METTL14 опосредует метилирование N6-аденозина ядерной РНК млекопитающих» . Природа Химическая биология . 10 (2): 93–5. DOI : 10.1038 / nchembio.1432 . PMC 3911877 . PMID 24316715 .  
  21. ^ Ван Y, Li Y, Toth СО, Петроски MD, Zhang Z, Чжао JC (февраль 2014). «Модификация N6-метиладенозина дестабилизирует регуляторы развития в эмбриональных стволовых клетках» . Природа клеточной биологии . 16 (2): 191–8. DOI : 10.1038 / ncb2902 . PMC 4640932 . PMID 24394384 .  
  22. ↑ Ping XL, Sun BF, Wang L, Xiao W, Yang X, Wang WJ, Adhikari S, Shi Y, Lv Y, Chen YS, Zhao X, Li A, Yang Y, Dahal U, Lou XM, Liu X, Huang J, Yuan WP, Zhu XF, Cheng T, Zhao YL, Wang X, Rendtlew Danielsen JM, Liu F, Yang YG (февраль 2014 г.). «WTAP млекопитающих является регуляторной субъединицей РНК N6-метиладенозинметилтрансферазы» . Клеточные исследования . 24 (2): 177–89. DOI : 10.1038 / cr.2014.3 . PMC 3915904 . PMID 24407421 .  
  23. ^ Schwartz S, Mumbach MR, Jovanovic M, Wang T, Maciag K, Bushkin GG, Mertins P, Ter-Ovanesyan D, Habib N, Cacchiarelli D, Sanjana NE, Freinkman E, Pacold ME, Satija R, Mikkelsen TS, Hacohen N , Чжан Ф., Карр С.А., Лендер Э.С., Регев А. (июль 2014 г.). «Возмущение писателей m6A выявляет два различных класса метилирования мРНК на внутренних и 5'-сайтах» . Отчеты по ячейкам . 8 (1): 284–96. DOI : 10.1016 / j.celrep.2014.05.048 . PMC 4142486 . PMID 24981863 .  
  24. ^ Лафонтен, Денис LJ; Грайль, Марк; Jaffrey, Samie R .; Bohnsack, Markus T .; Bohnsack, Katherine E .; Хаккерт, Филипп; Ульрик, Натали; Зорбас, Кристиана; Хоули, Бен Р. (2019). «Человеческая 18S рРНК m6A метилтрансфераза METTL5 стабилизирована TRMT112» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (15): 7719–7733. DOI : 10.1093 / NAR / gkz619 . PMC 6735865 . PMID 31328227 .  
  25. ↑ He C (декабрь 2010 г.). «Большой комментарий: эпигенетика РНК?». Природа Химическая биология . 6 (12): 863–5. DOI : 10,1038 / nchembio.482 . PMID 21079590 . 
  26. ↑ Jia G, Fu Y, Zhao X, Dai Q, Zheng G, Yang Y, Yi C, Lindahl T, Pan T, Yang YG, He C (октябрь 2011). «N6-метиладенозин в ядерной РНК является основным субстратом FTO, связанного с ожирением» . Природа Химическая биология . 7 (12): 885–7. DOI : 10.1038 / nchembio.687 . PMC 3218240 . PMID 22002720 .  
  27. ^ Zheng G, Dahl JA, Niu Y, Fedorcsak P, Huang CM, Li CJ, Vågbø CB, Shi Y, Wang WL, Song SH, Lu Z, Bosmans RP, Dai Q, Hao YJ, Yang X, Zhao WM, Tong WM, Ван XJ, Богдан F, Furu K, Fu Y, Jia G, Zhao X, Liu J, Krokan HE, Klungland A, Yang YG, He C (январь 2013 г.). «ALKBH5 - это РНК-деметилаза млекопитающих, влияющая на метаболизм РНК и фертильность мышей» . Молекулярная клетка . 49 (1): 18–29. DOI : 10.1016 / j.molcel.2012.10.015 . PMC 3646334 . PMID 23177736 .  
  28. ↑ Ван X, Лу З., Гомес А., Хон ГК, Юэ И, Хан Д, Фу И, Паризиэн М, Дай Кью, Цзя Г, Рен Би, Пан Т, Хе С (январь 2014 г.). «N6-метиладенозин-зависимая регуляция стабильности информационной РНК» . Природа . 505 (7481): 117–20. Bibcode : 2014Natur.505..117W . DOI : 10,1038 / природа12730 . PMC 3877715 . PMID 24284625 .  
  29. ↑ Ван Х, Чжао Б.С., Раундтри И.А., Лу З., Хань Д., Ма Х, Вен Х, Чен К., Ши Х, Хе С. (июнь 2015 г.). «N (6) -метиладенозин модулирует эффективность трансляции матричной РНК» . Cell . 161 (6): 1388–99. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.05.014 . PMC 4825696 . PMID 26046440 .  
  30. ^ Сюй Ц, Ван Х, Лю К., Раундтри И.А., Темпель В, Ли И, Лу З, Хе Ц, Мин Дж (ноябрь 2014 г.). «Структурная основа для селективного связывания РНК m6A YTHDC1 YTH доменом». Природа Химическая биология . 10 (11): 927–9. DOI : 10.1038 / nchembio.1654 . PMID 25242552 . 
  31. ^ Xiao W, Adhikari S, Dahal U, Chen YS, Hao YJ, Sun BF и др. (Февраль 2016 г.). «Ядерный m (6) A-ридер YTHDC1 регулирует сплайсинг мРНК» . Молекулярная клетка . 61 (4): 507–519. DOI : 10.1016 / j.molcel.2016.01.012 . PMID 26876937 . 
  32. ^ а б в Хуанг Х, Вэн Х, Сунь В, Цинь Х, Ши Х, Ву Х и др. (Март 2018 г.). «6-метиладенозин белками IGF2BP повышает стабильность и трансляцию мРНК» . Природа клеточной биологии . 20 (3): 285–295. DOI : 10.1038 / s41556-018-0045-Z . PMC 5826585 . PMID 29476152 .  
  33. Перейти ↑ Liu N, Dai Q, Zheng G, He C, Parisien M, Pan T (февраль 2015 г.). «N (6) -метиладенозин-зависимые структурные переключатели РНК регулируют взаимодействия РНК-белок» . Природа . 518 (7540): 560–4. Bibcode : 2015Natur.518..560L . DOI : 10,1038 / природа14234 . PMC 4355918 . PMID 25719671 .  
  34. ^ a b Боди З, Чжун С., Мехра С., Сонг Дж., Грэм Н., Ли Х, Мэй С., Фрай Р.Г. (2012). «Метилирование аденозина в мРНК Arabidopsis связано с 3'-концом, а пониженные уровни вызывают дефекты развития» . Границы растениеводства . 3 : 48. DOI : 10.3389 / fpls.2012.00048 . PMC 3355605 . PMID 22639649 .  
  35. ^ a b Сунь У. Дж., Ли Дж. Х., Лю С., Ву Дж., Чжоу Х, Цюй Л. Х, Ян Дж. Х. (январь 2016 г.) «RMBase: ресурс для расшифровки ландшафта модификаций РНК из данных высокопроизводительного секвенирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (D1): D259–65. DOI : 10.1093 / NAR / gkv1036 . PMC 4702777 . PMID 26464443 .  
  36. ^ a b c d Ke S, Alemu EA, Мертенс C, Gantman EC, Fak JJ, Mele A, Haripal B, Zucker-Scharff I, Moore MJ, Park CY, Vågbø CB, Kusśnierczyk A, Klungland A, Darnell JE, Darnell РБ (октябрь 2015 г.). «Большинство остатков m6A находятся в последних экзонах, что делает возможной регуляцию 3 'UTR» . Гены и развитие . 29 (19): 2037–53. DOI : 10,1101 / gad.269415.115 . PMC 4604345 . PMID 26404942 .  
  37. ↑ Ke S, Pandya-Jones A, Saito Y, Fak JJ, Vågbø CB, Geula S, Hanna JH, Black DL, Darnell JE, Darnell RB (май 2017). «Модификации мРНК 6А депонируются в формирующейся пре-мРНК и не требуются для сплайсинга, но определяют цитоплазматический оборот» . Гены и развитие . 31 (10): 990–1006. DOI : 10,1101 / gad.301036.117 . PMC 5495127 . PMID 28637692 .  
  38. ↑ Rosa-Mercado NA, Withers JB, Steitz JA (май 2017 г.). «Дебаты 6А: метилирование зрелой мРНК не является динамичным, но ускоряет оборот» . Гены и развитие . 31 (10): 957–958. DOI : 10,1101 / gad.302695.117 . PMC 5495124 . PMID 28637691 .  
  39. ^ Abakir, Abdulkadir; Джайлз, Том С .; Кристини, Аньезе; Фостер, Джереми М .; Дай, Нан; Старчак, Марта; Рубио-Ролдан, Алехандро; Ли, Мяомяо; Элефтериу, Мария; Кратчли, Джеймс; Флетт, Люк; Янг, Лоррейн; Гаффни, Дэниел Дж .; Деннинг, Крис; Далхус, Бьёрн; Эмс, Ричард Д .; Гацковский, Даниэль; Corrêa, Ivan R .; Гарсия-Перес, Хосе Л .; Клунгланд, Арне; Громак Наталья; Рузов, Алексей (январь 2020). «N 6 -метиладенозин регулирует стабильность гибридов РНК: ДНК в клетках человека» . Генетика природы . 52 (1): 48–55. DOI : 10.1038 / s41588-019-0549-х . PMC 6974403 . PMID 31844323 .  
  40. ^ Fustin JM, Doi М, Yamaguchi Y, Хида Н, Нисимура S, Есида М, Isagawa Т, Мориока МС, Какейя Н, Манабэ я, Окамура Н (ноябрь 2013 г. ). «РНК-зависимая от метилирования обработка РНК контролирует скорость циркадных часов» . Cell . 155 (4): 793–806. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.10.026 . PMID 24209618 . 
  41. ↑ Hastings MH (ноябрь 2013 г.). «Метилирование мРНК m (6) A: новый задающий ритм циркадный ритм» . Cell . 155 (4): 740–1. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.10.028 . PMID 24209613 . 
  42. ^ Фастин, JM; Ye, S., Rakers, C .; Канеко, К .; Фукумото, К .; Yamano, M .; Versteven, M .; Grünewald, E .; Каргилл, SJ; Tamai, TK; Xu, Y .; Джаббур, ML; Kojima, R .; Ламберти, ML; Йошиока-Кобаяси, К .; Whitmore, D .; Tammam, S .; Howell, PL; Kageyama, R .; Matsuo, T .; Станевский, Р .; Голомбек Д.А.; Джонсон, Швейцария; Kakeya, H .; van Ooijen, G .; Окамура, Х. (2020). «Дефицит метилирования нарушает биологические ритмы от бактерий к человеку» . Биология коммуникации . 3 (211). DOI : 10.1038 / s42003-020-0942-0 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
  43. ^ Акилжанова А, Нуркина З., Момыналиев К., Раманкулов Е, Жумадилов З., Жумадилов З., Рахыпбеков Т., Хаяшида Н., Накашима М., Такамура Н. (сентябрь 2013 г.). «Генетический профиль и детерминанты уровня гомоцистеина у казахстанских больных раком груди». Противораковые исследования . 33 (9): 4049–59. PMID 24023349 . 
  44. ^ Reddy SM, Sadim M, Li J, Yi N, S Агарвал, Mantzoros CS, Kaklamani VG (август 2013). «Клинические и генетические предикторы увеличения веса у пациентов с диагнозом рака груди» (PDF) . Британский журнал рака . 109 (4): 872–81. DOI : 10.1038 / bjc.2013.441 . PMC 3749587 . PMID 23922112 .   
  45. ^ Heiliger KJ, Hess J, Vitagliano D, Salerno P, Braselmann H, Salvatore G, Ugolini C, Summerer I, Bogdanova T, Unger K, Thomas G, Santoro M, Zitzelsberger H (июнь 2012). «Новые гены-кандидаты опухолевого генеза щитовидной железы, идентифицированные у трансгенных мышей Trk-T1» . Эндокринный рак . 19 (3): 409–21. DOI : 10.1530 / ERC-11-0387 . PMID 22454401 . 
  46. ↑ Ortega A, Niksic M, Bachi A, Wilm M, Sánchez L, Hastie N, Valcárcel J (январь 2003 г.). «Биохимическая функция женского летального (2) D / опухолевого супрессора-1 Вильмса белков в альтернативном сплайсинге пре-мРНК» . Журнал биологической химии . 278 (5): 3040–7. DOI : 10.1074 / jbc.M210737200 . PMID 12444081 . 
  47. ↑ Jin DI, Lee SW, Han ME, Kim HJ, Seo SA, Hur GY, Jung S, Kim BS, Oh SO (декабрь 2012 г.). «Экспрессия и роли белка, ассоциированного с опухолью Вильмса 1 в глиобластоме» . Наука о раке . 103 (12): 2102–9. DOI : 10.1111 / cas.12022 . PMID 22957919 . 
  48. ↑ Lin Y, Ueda J, Yagyu K, Ishii H, Ueno M, Egawa N, Nakao H, Mori M, Matsuo K, Kikuchi S (июль 2013 г.). «Связь между вариациями в жировой массе и геном, связанным с ожирением, и риском рака поджелудочной железы: исследование случай-контроль в Японии» . BMC Рак . 13 : 337. DOI : 10.1186 / 1471-2407-13-337 . PMC 3716552 . PMID 23835106 .  
  49. ^ Casalegno-Garduño R, Schmitt A, Ван X, Сюй X, Schmitt M (октябрь 2010). «Опухоль Вильмса 1 как новая мишень для иммунотерапии лейкемии». Трансплантация . 42 (8): 3309–11. DOI : 10.1016 / j.transproceed.2010.07.034 . PMID 20970678 . 
  50. ^ Linnebacher МЫ, Wienck А, я Бук, Klar Е (2010-03-18). «Идентификация опухолевого эпитопа цитотоксических Т-клеток MSI-H, генерируемого рамкой (-1) U79260 (FTO)» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2010 : 841451. дои : 10,1155 / 2010/841451 . PMC 2842904 . PMID 20339516 .  
  51. ^ Machiela MJ, Lindström S, Allen NE, Haiman CA, Albanes D, Barricarte A, Berndt SI, Bueno-de-Mesquita HB, Chanock S, Gaziano JM, Gapstur SM, Giovannucci E, Henderson BE, Jacobs EJ, Kolonel LN, Krogh V, Ma J, Stampfer MJ, Stevens VL, Stram DO, Tjønneland A, Travis R, Willett WC, Hunter DJ, Le Marchand L, Kraft P (декабрь 2012 г.). «Ассоциация вариантов восприимчивости к диабету 2 типа с повышенным риском рака простаты в Консорциуме когорты рака груди и простаты» . Американский журнал эпидемиологии . 176 (12): 1121–9. DOI : 10.1093 / AJE / kws191 . PMC 3571230 . PMID 23193118 .  
  52. ↑ Long J, Zhang B, Signorello LB, Cai Q, Deming-Halverson S, Shrubsole MJ, Sanderson M, Dennis J, Michailidou K, Michailiou K, Easton DF, Shu XO, Blot WJ, Zheng W (2013-04-08 ). «Оценка выявленных в рамках общегеномного исследования вариантов риска рака груди у афроамериканских женщин» . PLOS One . 8 (4): e58350. Bibcode : 2013PLoSO ... 858350L . DOI : 10.1371 / journal.pone.0058350 . PMC 3620157 . PMID 23593120 .  
  53. ^ Kaklamani В, Yi N, Sadim М, Siziopikou К, Чжан К, Сюй Y, Tofilon S, S Агарвал, Pasche В, С Mantzoros (апрель 2011). «Роль гена, связанного с жировой массой и ожирением (FTO), в риске рака груди» . BMC Medical Genetics . 12 : 52. DOI : 10,1186 / 1471-2350-12-52 . PMC 3089782 . PMID 21489227 .  
  54. Перейти ↑ Pierce BL, Austin MA, Ahsan H (июнь 2011). «Ассоциативное исследование вариантов генетической предрасположенности к диабету 2 типа и риска рака поджелудочной железы: анализ данных PanScan-I» . Причины рака и борьба с ними . 22 (6): 877–83. DOI : 10.1007 / s10552-011-9760-5 . PMC 7043136 . PMID 21445555 .  
  55. ^ Bokar JA (2005-01-01). «Биосинтез и функциональные роли метилированных нуклеозидов в мРНК эукариот». В Grosjean H (ред.). Тонкая настройка функций РНК путем модификации и редактирования . Темы современной генетики. 12 . Springer Berlin Heidelberg. С. 141–177. DOI : 10.1007 / b106365 . ISBN 9783540244950.
  56. ↑ Lin S, Choe J, Du P, Triboulet R, Gregory RI (май 2016 г.). «Метилтрансфераза m (6) A METTL3 способствует трансляции в раковых клетках человека» . Молекулярная клетка . 62 (3): 335–345. DOI : 10.1016 / j.molcel.2016.03.021 . PMC 4860043 . PMID 27117702 .  
  57. ↑ Zhang C, Samanta D, Lu H, Bullen JW, Zhang H, Chen I, He X, Semenza GL (апрель 2016 г.). «Гипоксия индуцирует фенотип стволовых клеток рака молочной железы посредством HIF-зависимого и опосредованного ALKBH5 m⁶A-деметилирования мРНК NANOG» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (14): E2047–56. Bibcode : 2016PNAS..113E2047Z . DOI : 10.1073 / pnas.1602883113 . PMC 4833258 . PMID 27001847 .  
  58. ^ Лоос RJ, Yeo GS (январь 2014). «Общая картина FTO: первый ген ожирения, идентифицированный GWAS» . Обзоры природы. Эндокринология . 10 (1): 51–61. DOI : 10.1038 / nrendo.2013.227 . PMC 4188449 . PMID 24247219 .  
  59. ^ Frayling TM, Timpson NJ, Weedon MN, Zeggini E, Freathy RM, Lindgren CM, Perry JR, Elliott KS, Lango H, Rayner NW, Shields B, Harries LW, Barrett JC, Ellard S, Groves CJ, Knight B, Patch AM, Ness AR, Ebrahim S, Lawlor DA, Ring SM, Ben-Shlomo Y, Jarvelin MR, Sovio U, Bennett AJ, Melzer D, Ferrucci L, Loos RJ, Barroso I, Wareham NJ, Karpe F, Owen KR, Cardon Л. Р., Уокер М., Хитман Г. А., Палмер С. Н., Дони А. С., Моррис А. Д., Смит Г. Д., Хаттерсли А. Т., Маккарти М. И. (май 2007 г.). «Распространенный вариант гена FTO связан с индексом массы тела и предрасполагает к ожирению у детей и взрослых» . Наука . 316 (5826): 889–94. Bibcode : 2007Sci ... 316..889F . doi :10.1126 / science.1141634 . PMC  2646098 . PMID  17434869 .
  60. Перейти ↑ Wang L, Yu Q, Xiong Y, Liu L, Zhang X, Zhang Z, Wu J, Wang B (2013). «Вариант rs1421085 в гене FTO способствует детскому ожирению у китайских детей в возрасте 3-6 лет». Исследования и клиническая практика ожирения . 7 (1): e14–22. DOI : 10.1016 / j.orcp.2011.12.007 . PMID 24331679 . 
  61. ^ Калнина я, Захаренко л, Вайваде я, Rovite В, Никитина-Заке л, Peculis R, Fridmanis D, Geldnere К, Jacobsson JA, Алмен МС, Пирагс В, Schiöth НВ, Klovins J (сентябрь 2013 г. ). «Полиморфизмы в FTO и около TMEM18 связаны с диабетом 2 типа и предрасполагают к более молодому возрасту при диагностике диабета». Джин . 527 (2): 462–8. DOI : 10.1016 / j.gene.2013.06.079 . PMID 23860325 . 
  62. ^ Карр Е, O'Daly О.Г., Чоудхурьте А.И., Yousseif А, Millership S, Нири МТ, Скотт WR, Chandarana К, Мэннинг S, Гесс М, Ивакура Н, Akamizu Т, Q Просо, Gelegen С, Дрю М.Е., Рахман S , Emmanuel JJ, Williams SC, Rüther UU, Brüning JC, Withers DJ, Zelaya FO, Batterham RL (август 2013 г.). «Связь между FTO, грелином и нарушением мозговой реакции на пищевые сигналы» . Журнал клинических исследований . 123 (8): 3539–51. DOI : 10,1172 / jci44403 . PMC 3726147 . PMID 23867619 .  
  63. ^ Zhao X, Yang Y, Sun BF, Shi Y, Yang X, Xiao W, Hao YJ, Ping XL, Chen YS, Wang WJ, Jin KX, Wang X, Huang CM, Fu Y, Ge XM, Song SH, Jeong Х.С., Янагисава Х., Ню И, Цзя Г.Ф., Ву В., Тонг В.М., Окамото А., Хе С., Рендтлю Даниэльсен Дж. М., Ван XJ, Ян Ю.Г. (декабрь 2014 г.). «FTO-зависимое деметилирование N6-метиладенозина регулирует сплайсинг мРНК и необходимо для адипогенеза» . Клеточные исследования . 24 (12): 1403–19. DOI : 10.1038 / cr.2014.151 . PMC 4260349 . PMID 25412662 .  
  64. ^ Merkestein M, Laber S, МакМаррей F, Эндрю D, Sachse G, Sanderson J, Li M, S Usher, Sellayah D, Эшкрофт FM, Cox RD (апрель 2015). «FTO влияет на адипогенез, регулируя митотическую клональную экспансию» . Nature Communications . 6 : 6792. Bibcode : 2015NatCo ... 6.6792M . DOI : 10.1038 / ncomms7792 . PMC 4410642 . PMID 25881961 .  
  65. ↑ Zhang M, Zhang Y, Ma J, Guo F, Cao Q, Zhang Y, Zhou B, Chai J, Zhao W, Zhao R (2015-07-28). «Деметилазная активность FTO (белка, связанного с жировой массой и ожирением) необходима для дифференциации преадипоцитов» . PLOS One . 10 (7): e0133788. Bibcode : 2015PLoSO..1033788Z . DOI : 10.1371 / journal.pone.0133788 . PMC 4517749 . PMID 26218273 .  
  66. ^ Hess ME, Hess S, Meyer KD, Verhagen LA, Koch L, Brönneke HS, Dietrich MO, Jordan SD, Saletore Y, Elemento O, Belgardt BF, Franz T, Horvath TL, Rüther U, Jaffrey SR, Kloppenburg P, Brüning JC (август 2013 г.). «Ген, связанный с жировой массой и ожирением (Fto), регулирует активность дофаминергической схемы среднего мозга». Природа Неврологии . 16 (8): 1042–8. DOI : 10.1038 / nn.3449 . PMID 23817550 . 
  67. ↑ Kim HJ, Kim NC, Wang YD, Scarborough EA, Moore J, Diaz Z, MacLea KS, Freibaum B, Li S, Molliex A, Kanagaraj AP, Carter R, Boylan KB, Wojtas AM, Rademakers R, Pinkus JL, Greenberg С.А., Трояновский Дж. К., Трейнор Б. Дж., Смит Б. Н., Топп С., Гкази А. С., Миллер Дж., Шоу К. Э., Коттлорс М., Киршнер Дж., Пестронк А., Ли Ю. Р., Форд А. Ф., Гитлер А. Д., Бенатар М., Кинг О. Д., Кимонис В. Е., Росс ЭД, Вейл С.К., Короче Дж., Тейлор Дж. П. (март 2013 г.) «Мутации в прионоподобных доменах в hnRNPA2B1 и hnRNPA1 вызывают мультисистемную протеинопатию и БАС» . Природа . 495 (7442): 467–73. Bibcode : 2013Natur.495..467K . DOI : 10.1038 / nature11922 . PMC 3756911 . PMID  23455423 .
  68. ^ Ван, ZL; Ли, Б; Луо, YX; Lin, Q; Лю, SR; Чжан, XQ; Чжоу, H; Ян, JH; Qu, LH (2 января 2018 г.). «Комплексная геномная характеристика РНК-связывающих белков при раке человека» . Отчеты по ячейкам . 22 (1): 286–298. DOI : 10.1016 / j.celrep.2017.12.035 . PMID 29298429 . 
  69. ^ Нараян P, Rottman FM (1992-01-01). Nord FF (ред.). Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии . 65 . John Wiley & Sons, Inc., стр. 255–285. DOI : 10.1002 / 9780470123119.ch7 . ISBN 9780470123119. PMID  1315118 .
  70. ^ Кеннеди Е.М., Богерд HP, Kornepati А.В., Кан D, Ghoshal D, Маршалл JB, Полинг BC, Tsai K, Gokhale Н.С., Хорнер С.М., Каллен BR (май 2016). «Посттранскрипционное редактирование m (6) A мРНК ВИЧ-1 усиливает экспрессию вирусных генов» . Клеточный хозяин и микроб . 19 (5): 675–85. DOI : 10.1016 / j.chom.2016.04.002 . PMC 4867121 . PMID 27117054 .  
  71. ^ Tirumuru Н, Чжао Б.С., Л Вт, Л Z, он С, В л (июль 2016). «N (6) -метиладенозин РНК ВИЧ-1 регулирует вирусную инфекцию и экспрессию белка Gag ВИЧ-1» . eLife . 5 . DOI : 10.7554 / eLife.15528 . PMC 4961459 . PMID 27371828 .  
  72. ^ Lichinchi G, Гао S, Saletore Y, Гонсалес Г. М., Bansal В, Ван Да, Мейсон CE, Рана ТМ (февраль 2016). «Динамика метиломов m (6) A РНК человека и вируса при инфицировании Т-лимфоцитами ВИЧ-1» . Природная микробиология . 1 (4): 16011. DOI : 10.1038 / nmicrobiol.2016.11 . PMC 6053355 . PMID 27572442 .  
  73. ^ Lichinchi G, Чжао BS, Wu Y, Lu Z, Y Цинь, он C, Rana TM (ноябрь 2016). «Динамика метилирования человеческой и вирусной РНК при инфицировании вирусом Зика» . Клеточный хозяин и микроб . 20 (5): 666–673. DOI : 10.1016 / j.chom.2016.10.002 . PMC 5155635 . PMID 27773536 .  
  74. ^ Гокхале Н.С., Макинтайр А.Б., Макфэдден МДж, Родер А.Е., Кеннеди Е.М., Gandara JA, и др. (Ноябрь 2016 г.). «N6-Метиладенозин в геномах вирусной РНК Flaviviridae регулирует инфекцию» . Клеточный хозяин и микроб . 20 (5): 654–665. DOI : 10.1016 / j.chom.2016.09.015 . PMC 5123813 . PMID 27773535 .