Белок G представляет собой иммуноглобулин -связывающего белок экспрессируется в группе С и G стрептококковых бактерий так же, как белки А , но с различной специфичностью связывания. Это белок клеточной поверхности массой 65 кДа (G148 белок G) и 58 кДа (белок G C40) [1] , который нашел применение в очистке антител благодаря его связыванию с участками Fab и Fc . Нативная молекула также связывает альбумин , но поскольку сывороточный альбумин является основным загрязнителем источников антител, сайт связывания альбумина был удален из рекомбинантныхформы белка G. Этот рекомбинантный белок G, меченный флуорофором или одноцепочечной цепью ДНК, использовали в качестве замены вторичных антител при иммунофлуоресценции и визуализации сверхвысокого разрешения. [2]
Другие связывающие антитела белки
Помимо протеина G, для очистки, иммобилизации или обнаружения иммуноглобулинов обычно используются другие связывающие иммуноглобулины бактериальные протеины, такие как протеин A , протеин A / G и протеин L. Каждый из этих связывающих иммуноглобулин белков имеет различный профиль связывания антител с точки зрения распознаваемой части антитела, а также вида и типа антител, которые он будет связывать.
Сворачивание белка G, домена B1
Неэмпирические моделирования белкового домена G В1 показывает , что, как это было предложено ранее результаты, этот белок инициирует складные через нуклеации событие в гидрофобных основных остатков с последующим небольшими корректировками. [3] События сворачивания следующие:
- образуется β-шпилька , стабилизированная остатками W43, Y45 и F52.
- Остаточные контакты между остатком F30 в α-спирали и β-шпилькой усиливаются.
- Происходит зарождение β-слоя, начиная с остатков L5 и F52.
- Последний остаток нуклеации, Y3, помогает формировать центральную часть β-слоя, в результате чего образуется глобулярный белок .
Домен белка G B1 (он же GB1) часто используется как часть слитого белка для удержания других доменов в растворе во время экспериментов в растворе (например, ЯМР ). Многие ранее нерастворимые домены стали растворимыми в результате слияния домена GB1. [4] Домен состоит из 56 остатков (примерно 8 кДа) в длину. На гелях SDS-PAGE домен GB1 работает примерно с 13,5 кДа, несмотря на то, что он составляет всего 8 кДа. [5]
Рекомендации
- ^ Sjobring U, Bjorck L, Kastern W, et al. (1991). «Стрептококковый белок G. Структура гена и свойства связывания с белками» . J Biol Chem . 266 (1): 399–405. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 52448-0 . PMID 1985908 .
- ^ Schlichthaerle, Thomas; Ганджи, Махипал; Ауэр, Александр; Уэйд, Орсоля Кимбу; Юнгманн, Ральф (2018). «Связывающие антитела бактериального происхождения как небольшие адаптеры для микроскопии DNA-PAINT». ChemBioChem . 20 (8): 1032–1038. DOI : 10.1002 / cbic.201800743 . hdl : 21.11116 / 0000-0003-E68E-A . ISSN 1439-7633 . PMID 30589198 . S2CID 58547594 .
- ^ Kmiecik S, Kolinski A (февраль 2008 г.). «Путь сворачивания домена b1 белка G исследован с помощью многомасштабного моделирования» . Biophys J . 94 (3): 726–36. Bibcode : 2008BpJ .... 94..726K . DOI : 10.1529 / biophysj.107.116095 . PMC 2186257 . PMID 17890394 .
- ^ Ченг, Юань; Патель, Диншоу Дж. (2004). «Эффективная система для экспрессии и рефолдинга небольших белков» . Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 317 (2): 401–405. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2004.03.068 . PMC 4693640 . PMID 15063772 .
- ^ Хартл MJ, Mayr F, Rethwilm A, Wöhrl BM (2010). «Биофизические и ферментативные свойства обратной транскриптазы обезьян и прототипа пенистого вируса» . Ретровирология . 7 : 5. DOI : 10,1186 / 1742-4690-7-5 . PMC 2835651 . PMID 20113504 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )