Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Prp24 ( р recursor R Н. р rocessing, ген 24 ) представляет собой белка часть РНК предварительно мессенджер сплайсинга процесса и способствует связыванию U6 мяРНКа до U4 мяРНКа при образовании сплайсосомы . Обнаруженный у эукариот от дрожжей до E. coli , грибов и людей, Prp24 был первоначально обнаружен как важный элемент сплайсинга РНК в 1989 году. [1] [2] Мутации в Prp24 были позже обнаружены в 1991 году для подавления мутаций.в U4, что привело к появлению чувствительных к холоду штаммов дрожжей, что указывает на его участие в реформировании дуплекса U4 / U6 после каталитических стадий сплайсинга. [3]

Prp24 RRMs 1 и 2

Биологическая роль [ править ]

В процессе образования сплайсосом участвуют мяРНП U4 и U6, которые связываются и образуют ди- мяРНП в ядре клетки . Этот ди-snRNP затем рекрутирует другого члена ( U5 ), чтобы стать tri-snRNP. Затем U6 должен диссоциировать от U4, чтобы связать с U2 и стать каталитически активным. После завершения сплайсинга U6 должен отделиться от сплайсосомы и снова соединиться с U4, чтобы перезапустить цикл.

Было показано, что Prp24 способствует связыванию snRNP U4 и U6. Удаление Prp24 приводит к накоплению свободных U4 и U6, а последующее добавление Prp24 регенерирует U4 / U6 и уменьшает количество свободных U4 и U6. [4] Голая мяРНК U6 очень компактна и имеет мало места для образования пар оснований с другими РНК. Однако, когда U6 snRNP связывается с белками, такими как Prp24, структура становится намного более открытой, что облегчает связывание с U4. [5] Prp24 не присутствует в самом дуплексе U6 / U4, и было высказано предположение, что Prp24 должен покинуть комплекс для образования правильных пар оснований. [6] [7] Также было высказано предположение, что Prp24 может играть роль в дестабилизации U4 / U6, чтобы U6 мог спарить основания с U2.[8]

Структура [ править ]

Прп 24 РРМ 3

Prp24 имеет молекулярную массу 50 кДа и, как было показано, содержит четыре мотива узнавания РНК (RRM) и консервативную 12-аминокислотную последовательность на С-конце . [9] [10] Было показано, что RRM 1 и 2 важны для связывания с высоким сродством U6, тогда как RRM 3 и 4 связываются на сайтах с более низким сродством на U6. [11] Первые три RRM активно взаимодействуют друг с другом и содержат канонические складки, которые содержат четырехцепочечный бета-лист и две альфа-спирали . Электроположительная поверхность RRM 1 и 2 представляет собой отжиг РНК.домен, в то время как щель между RRM 1 и 2, включая поверхность бета-листа RRM2, представляет собой сайт связывания РНК, специфичный для последовательности. [1] С-концевой мотив необходим для ассоциации с белками LSm и способствует связыванию субстрата (U6), а не каталитической скорости сплайсинга. [10]

U6 snRNP с ассоциированными белками Prp24 и LSm

Взаимодействия [ править ]

Prp24 взаимодействует с мяРНК U6 через свои RRM. Испытания на химическую модификацию показали, что нуклеотиды 39–57 U6 (в частности, 40–43) [5] участвуют в связывании Prp24. [12]

Белки LSm находятся в согласованной конфигурации на РНК U6. [9] [ требуется пояснение ] Было высказано предположение, что белки LSm и Prp24 взаимодействуют как физически, так и функционально [6], и C-концевой мотив Prp24 важен для этого взаимодействия. [10] Связывание Prp24 с U6 усиливается связыванием белков Lsm с U6, как и связывание U4 и U6. [13] С помощью электронной микроскопии было обнаружено, что Prp24 может взаимодействовать с белковым кольцом LSm в LSm2. [9]

Гомологи [ править ]

Prp24 имеет человеческий гомолог , SART3 . SART3 является отторжение опухоли антиген (SART3 обозначает " с quamous клеточной карциномы ntigen г ecognized с помощью Т - клеток, ген 3 ). В RRMS 1 и 2 в дрожжах аналогичны RRMS в человеческой SART3. [1] [11] : C -концевой домен также высоко консервативен от дрожжей к человеку. [14] Этот белок, как Prp24, взаимодействует с белками LSm [9] [15] для рециклинга U6 в snRNP U4 / U6. Было высказано предположение, что SART3 нацелить U6 на тело Кахалаили ядерное включение как место сборки мяРНП U4 / U6. [15] SART3 расположен на хромосоме 12 , и мутация , вероятно, является причиной диссеминированного поверхностного актинического порокератоза . [16]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Bae, E .; и другие. (2007). «Структура и взаимодействия первых трех мотивов распознавания РНК фактора сплайсинга Prp24» . Журнал молекулярной биологии . 367 (5): 1447–1458. DOI : 10.1016 / j.jmb.2007.01.078 . PMC  1939982 . PMID  17320109 .
  2. ^ Vijayraghavan, U .; Компания, М .; Абельсон, Дж. (1989). «Выделение и характеристика мутантов сплайсинга пре-мРНК Saccharomyces cerevisiae » . Гены и развитие . 3 (8): 1206–1216. DOI : 10,1101 / gad.3.8.1206 . PMID 2676722 . 
  3. ^ Шеннон, кВт; Гатри, К. (1991). «Супрессоры мутации мяРНК U4 определяют новый белок мяРНП U6 с РНК-связывающими мотивами» . Гены и развитие . 5 (5): 773–785. DOI : 10,1101 / gad.5.5.773 . PMID 1827420 . 
  4. ^ Рагхунатан, PL; Гатри, Калифорния (1998). "Фактор рециклинга сплайсосом, который повторно отжигает U4 и U6 малые ядерные частицы рибонуклеопротеина". Наука . 279 (5352): 857–860. Bibcode : 1998Sci ... 279..857R . DOI : 10.1126 / science.279.5352.857 . PMID 9452384 . 
  5. ^ a b Карадуман, Р .; и другие. (2006). «Структура РНК и РНК-белковые взаимодействия в очищенных дрожжевых мяРНП U6». Журнал молекулярной биологии . 356 (5): 1248–1262. DOI : 10.1016 / j.jmb.2005.12.013 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0012-E5F7-6 . PMID 16410014 . 
  6. ^ а б Видаль В.П .; и другие. (1995). «Характеристика взаимодействий U6 snRNA-белок» . РНК . 5 (11): 1470–1481. DOI : 10.1017 / S1355838299991355 . PMC 1369868 . PMID 10580475 .  
  7. ^ Jandrositz, A .; Гатри, А. (1995). «Доказательства для сайта связывания Prp24 в мяРНК U6 и в предполагаемом промежуточном продукте при отжиге мяРНК U6 и U4» . Журнал EMBO . 14 (4): 820–832. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07060.x . PMC 398149 . PMID 7882985 .  
  8. ^ Видавер, РМ; Фортнер, DM; Лоос-Остин, LS; Бровь, Д.А. (1999). «Множественные функции белка сплайсинга Saccharomyces cerevisiae Prp24 в структурных перестройках U6 РНК» . Генетика . 153 (3): 1205–1218. PMC 1460831 . PMID 10545453 .  
  9. ^ a b c d Карадуман, Р .; и другие. (2008). «Структура дрожжевых snRNPs U6: расположение Prp24p и комплекса LSm, как выявлено с помощью электронной микроскопии» . РНК . 14 (12): 1–10. DOI : 10,1261 / rna.1369808 . PMC 2590955 . PMID 18971323 .  
  10. ^ a b c Рейдер, SD; Гатри, К. (2002). «Консервативный мотив Lsm-взаимодействия в Prp24, необходимый для эффективного образования ди-snRNP U4 / U6» . РНК . 8 (11): 1378–1392. DOI : 10.1017 / S1355838202020010 . PMC 1370345 . PMID 12458792 .  
  11. ^ а б Кван, СС; Бровь, Д.А. (2005). «Мотивы распознавания N- и C-концевой РНК фактора сплайсинга Prp24 выполняют различные функции в связывании РНК U6» . РНК . 11 (5): 808–820. DOI : 10,1261 / rna.2010905 . PMC 1370765 . PMID 15811912 .  
  12. ^ Гетти, А .; Компания, М .; Абельсон, Дж. (1995). «Специфичность связывания Prp24 с РНК: роль Prp24 в динамическом взаимодействии мяРНК U4 и U6» . РНК . 1 (2): 132–145. PMC 1369067 . PMID 7585243 .  
  13. ^ Райан, Германия; Стивенс, SW; Абельсон, Дж. (2002). «5 'и 3' домены дрожжевых белков мяРНК U6: Lsm способствуют связыванию белка Prp24 с областью телестемы U6» . РНК . 8 (8): 1011–1033. DOI : 10.1017 / S1355838202026092 . PMC 1370313 . PMID 12212846 .  
  14. ^ Белл, М .; и другие. (2002). «p110, новый белок snRNP U6 человека и фактор рециклинга snRNP U4 / U6» . Журнал EMBO . 21 (11): 2724–2735. DOI : 10.1093 / emboj / 21.11.2724 . PMC 126028 . PMID 12032085 .  
  15. ^ a b Stanek, D .; и другие. (2003). «Нацеливание фактора сборки малых ядерных RNP U4 / U6 SART3 / p110 на тельца Кахаля» . Журнал клеточной биологии . 160 (4): 505–516. DOI : 10,1083 / jcb.200210087 . PMC 2173746 . PMID 12578909 .  
  16. ^ «OMIM - ПОРОКЕРАТОЗ, РАСПРОСТРАНЕННЫЙ ПОВЕРХНОСТНЫЙ АКТИНИК, 1; DSAP1» . Проверено 5 апреля 2009 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Биологические науки в Ланкастерском университете Объяснение сплайсинга пре-мРНК