Rho ГТФ-активирующий белок 32 представляет собой белок , который у человека кодируется RICS гена . [5] RICS имеет две известные изоформы: RICS, которые экспрессируются в основном в конусах роста нейритов и на постсинаптических мембранах , и PX-RICS, которая более широко экспрессируется в эндоплазматическом ретикулуме , аппарате Гольджи и эндосомах . [6] Единственным известным доменом RICS является домен RhoGAP , в то время как PX-RICS имеет дополнительную гомологию Phox и домен SH3 .
ARHGAP32 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ARHGAP32 , GC-GAP, GRIT, PX-RICS, RICS, p200RhoGAP, p250GAP, Rho GTPase, активирующий белок 32 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 608541 MGI : 2450166 HomoloGene : 8812 GeneCards : ARHGAP32 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 11: 128.97 - 129.28 Мб | Chr 9: 32,12 - 32,27 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
RICS (также известный как GRIT / Arhgap32) представляет собой нейрон-ассоциированный белок, активирующий ГТФазу, который может регулировать морфологию и прочность дендритных шипов, модулируя активность ГТФазы Rho . [5] [6]
Изоформы
RICS
Эксперименты показали, что отключение RICS или просто отключение его GAP или C-концевого сайта связывания TrkA приводит к аномально разрастанию нейритов и блокирует регулируемый NGF разрастание. [7]
Известно, что активность GAP RICS регулируется двумя сайтами фосфорилирования, один из которых контролируется CaMKII, а другой - RPTPa . Когда CaMKII активируется проникновением Ca 2+ через рецепторы NMDA и инактивирует RICS посредством фосфорилирования , что, в свою очередь, увеличивает количество активных GTP-связанных форм Cdc42 и Rac1 . Таким образом, это может вызвать, например, ремоделирование дендритных шипов . Потому что это было показано в ряде экспериментов , что Cdc42 не влияет на позвоночник морфологию, в то время как другие показали , что Rac1 делает (через PAK1 , LIMK , CFL1 путь), наиболее вероятный путь является через Rac1. То, что RACS также связывается с β-катенином и N-кадгеринами in vivo в рамках PSD (с которой он связывается через PSD-95 и слабое связывание с субъединицами NR2), предполагает, что может быть другой путь для него, также изменяющий структуру позвоночника. . [6] Сайт контролируемого фосфорилирования RPTPa контролирует специфичность активности GAP посредством механизма, который, как полагают, включает перемещение c-концевой области RICS. В фосфорилированном состоянии RICS может влиять на Rac, Rho и Cdc42, но после дефосфорилирования с помощью RPTPa он может влиять только на Rac. Еще один сайт фосфорилирования, регулируемый FYN, контролирует связывание RPTPa с RICS. [8]
PX-RICS
PX-RICS - это доминирующая изоформа, экспрессирующаяся в процессе развития нервной системы. Известно, что он имеет гораздо более низкую активность GAP, чем RICS. Хотя он более широко выражен, чем RICS, все же известно, что он ингибирует удлинение нейронов. [9] В поддержку идеи о том, что это синаптически релевантная изоформа, является то, что известно, что она связывает NR2B и PSD95 in vivo.
Известно, что PX-RICS участвует в транспорте некоторых синаптических белков, которые лишены сигналов экспорта ER, из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи. Это было показано для β-catenin и N-cadherin, последний из которых лишен сигнала экспорта ER, а первый, который связывает более поздний внутри ER как необходимую, но недостаточную часть процесса его экспорта. Было обнаружено, что PX-RICS является необходимым компонентом для экспорта этого комплекса в Гольджи, а затем и далее на клеточную мембрану. Считается, что PX-RICS делает это, сначала локализуясь на мембране ER - это происходит путем связывания с GABARAP, который связывает ER, и через его домен гомологии Phox, который имеет высокую аффинность связывания с Pi4P, преобладающим фосфоинозитидом в эндоплазматический ретикулум и аппарат Гольджи. Считается, что PX-RICS связывает гетеродимер белков 14-3-3, кодируемых генами YWHAZ и YWHAQ . Сайт, в котором происходит это связывание, представляет собой сайт RSKSDP на c-конце PX-RICS, который фосфорилируется с помощью CAMKII, чтобы стимулировать связывание. [10] Также было показано, что на мембранный транспорт FGFR4, белка, связывающего N-кадгерин, влияет нокдаун PX-RICS. [11]
Взаимодействия
Было показано, что RICS (ген) взаимодействует с:
- BCAR1 , [7] [12]
- CDC42 , [7] [12] [13]
- CRK , [12] [14]
- CRKL , [7]
- FYN , [15]
- GAB2 , [12]
- GRIN2B , [13]
- NCK1 , [12]
- RAC1 , [12] [14]
- RHOA , [7] [13] [14]
- SHC3 , [7]
- Src , [14] и
- TrkA . [7]
Мир-132 микроРНК был описан как нацеливание мРНК из этого гена деградации; считается, что это важно для регуляции развития нейронов. [16]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134909 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041444 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ а б «Ген Entrez: белок, активирующий ГТФазу RICS Rho» . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ а б в Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Охвада С., Моришита Ю., Акияма Т. (март 2003 г.). «RICS, новый белок, активирующий GTPase для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторами бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата» . J. Biol. Chem . 278 (11): 9920–7. DOI : 10.1074 / jbc.M208872200 . PMID 12531901 .
- ^ Б с д е е г Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросе Э, Гото Н., Мори Х, Охта Й, Мори Н. (декабрь 2002 г.). «Grit, белок, активирующий GTPase для семейства Rho, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адапторными молекулами N-Shc и CrkL / Crk» . Мол. Клетка. Биол . 22 (24): 8721–34. DOI : 10.1128 / MCB.22.24.8721-8734.2002 . PMC 139861 . PMID 12446789 .
- ^ Chagnon MJ, Wu CL, Nakazawa T., Yamamoto T., Noda M, Blanchetot C, Tremblay ML (ноябрь 2010 г.). «Рецепторная тирозинфосфатаза сигма (RPTPσ) регулирует p250GAP, новый субстрат, который ослабляет передачу сигналов Rac». Клетка. Сигнал . 22 (11): 1626–33. DOI : 10.1016 / j.cellsig.2010.06.001 . PMID 20550964 .
- ^ Хаяси Т., Окабе Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Охвада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (август 2007 г.). «PX-RICS, новый вариант сплайсинга RICS, является основной изоформой, экспрессируемой во время нейрального развития» . Гены Клетки . 12 (8): 929–39. DOI : 10.1111 / j.1365-2443.2007.01101.x . PMID 17663722 . S2CID 22118853 .
- ^ Накамура Т., Хаяси Т., Мимори-Киёсуэ Й, Сакауэ Ф., Мацуура К., Иемура С., Нацумэ Т., Акияма Т. (май 2010 г.). «Комплекс PX-RICS-14-3-3zeta / theta соединяет N-кадгерин-бета-катенин с динеин-динактином, чтобы опосредовать его экспорт из эндоплазматического ретикулума» . J. Biol. Chem . 285 (21): 16145–54. DOI : 10.1074 / jbc.M109.081315 . PMC 2871483 . PMID 20308060 .
- ^ Накамура Т., Хаяси Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Моришита Ю., Окабе Т., Охвада С., Мацуура К., Акияма Т. (май 2008 г.). «PX-RICS опосредует транспорт комплекса N-кадгерин / бета-катенин из ER-в-Гольджи» . Genes Dev . 22 (9): 1244–56. DOI : 10,1101 / gad.1632308 . PMC 2335319 . PMID 18451111 .
- ^ а б в г д е Чжао Ч., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан З., Фэн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2» . J. Biol. Chem . 278 (36): 34641–53. DOI : 10.1074 / jbc.M304594200 . PMID 12819203 .
- ^ а б в Накадзава Т., Ватабэ А.М., Тэдзука Т., Ёсида Й., Ёкояма К., Умемори Х., Иноуэ А., Окабе С., Манабе Т., Ямамото Т. (июль 2003 г.). «p250GAP, новый обогащенный мозгом GTPase-активирующий белок для GTPases семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата» . Мол. Биол. Cell . 14 (7): 2921–34. DOI : 10.1091 / mbc.E02-09-0623 . PMC 165687 . PMID 12857875 .
- ^ а б в г Moon SY, Zang H, Zheng Y (февраль 2003 г.). «Характеристика специфического для мозга белка, активирующего ГТФазу Rho, p200RhoGAP» . J. Biol. Chem . 278 (6): 4151–9. DOI : 10.1074 / jbc.M207789200 . PMID 12454018 .
- ^ Танигучи С., Лю Х., Накадзава Т., Ёкояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (июнь 2003 г.). «p250GAP, нейральный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 306 (1): 151–5. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 00923-9 . PMID 12788081 .
- ^ Во Н., Клейн М.Е., Варламова О., Келлер Д.М., Ямамото Т., Гудман Р.Х., Импей С. (ноябрь 2005 г.). «МикроРНК, индуцированная связывающим белком элементом цАМФ-ответа, регулирует морфогенез нейронов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (45): 16426–31. DOI : 10.1073 / pnas.0508448102 . PMC 1283476 . PMID 16260724 .
дальнейшее чтение
- Хаяси Т., Окабе Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Охвада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (2007). «PX-RICS, новый вариант сплайсинга RICS, является основной изоформой, экспрессируемой во время нейрального развития» . Гены Клетки . 12 (8): 929–39. DOI : 10.1111 / j.1365-2443.2007.01101.x . PMID 17663722 . S2CID 22118853 .
- Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Cell . 125 (4): 801–14. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
- Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке» . Мол. Клетка. Протеомика . 4 (6): 785–95. DOI : 10.1074 / mcp.M500021-MCP200 . PMID 15778465 .
- Накадзава Т., Ватабе А.М., Тэдзука Т., Ёсида Ю., Ёкояма К., Умемори Н., Иноуэ А., Окабе С., Манабе Т., Ямамото Т. (2004). «p250GAP, новый обогащенный мозгом GTPase-активирующий белок для GTPases семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата» . Мол. Биол. Cell . 14 (7): 2921–34. DOI : 10.1091 / mbc.E02-09-0623 . PMC 165687 . PMID 12857875 .
- Чжао Ц., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан Ц., Фэн Г.С. (2003). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2» . J. Biol. Chem . 278 (36): 34641–53. DOI : 10.1074 / jbc.M304594200 . PMID 12819203 .
- Танигучи С., Лю Х., Накадзава Т., Ёкояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (2003). «p250GAP, нейральный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 306 (1): 151–5. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 00923-9 . PMID 12788081 .
- Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Охвада С., Моришита Ю., Акияма Т. (2003). «RICS, новый белок, активирующий GTPase для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторами бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата» . J. Biol. Chem . 278 (11): 9920–7. DOI : 10.1074 / jbc.M208872200 . PMID 12531901 .
- Гардинер Э.М., Пестонджамасп К.Н., Бол Б.П., Чемберлен С., Хан К.М., Бокоч Г.М. (2003). «Пространственный и временной анализ активации Rac при хемотаксисе живых нейтрофилов». Curr. Биол . 12 (23): 2029–34. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (02) 01334-9 . PMID 12477392 . S2CID 13589833 .
- Moon SY, Zang H, Zheng Y (2003). «Характеристика специфического для мозга белка, активирующего ГТФазу Rho, p200RhoGAP» . J. Biol. Chem . 278 (6): 4151–9. DOI : 10.1074 / jbc.M207789200 . PMID 12454018 .
- Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросе Э, Гото Н., Мори Х, Охта Й, Мори Н. (2003). «Grit, белок, активирующий GTPase для семейства Rho, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адапторными молекулами N-Shc и CrkL / Crk» . Мол. Клетка. Биол . 22 (24): 8721–34. DOI : 10.1128 / MCB.22.24.8721-8734.2002 . PMC 139861 . PMID 12446789 .
- Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Genome Res . 12 (11): 1773–84. DOI : 10.1101 / gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
- Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Res . 5 (5): 277–86. DOI : 10.1093 / dnares / 5.5.277 . PMID 9872452 .