Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с регуляторной РНК )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Лентивирусная доставка сконструированных shРНК и механизм РНК-интерференции в клетках млекопитающих.

РНК-интерференция ( РНКи ) - это биологический процесс, в котором молекулы РНК участвуют в специфическом для последовательности подавлении экспрессии генов двухцепочечной РНК посредством трансляции или репрессии транскрипции. Исторически РНКи были известны под другими названиями, включая совместное подавление , посттранскрипционное молчание генов (PTGS) и подавление . Детальное изучение каждого из этих, казалось бы, разных процессов выяснило, что идентичность этих явлений на самом деле была РНКи. Эндрю Файер и Крейг С. Мелло разделили Нобелевскую премию по физиологии и медицине 2006 года за свою работу по вмешательству РНК в нематоде.worm Caenorhabditis elegans , которую они опубликовали в 1998 году. С момента открытия РНКи и ее регуляторного потенциала стало очевидно, что РНКи обладает огромным потенциалом в подавлении желаемых генов. РНКи теперь известна как точная, эффективная, стабильная и лучшая, чем антисмысловая терапия для подавления генов. [1] Антисмысловая РНК, продуцируемая внутри клетки вектором экспрессии, может быть разработана и найти применение в качестве новых терапевтических агентов. [2]

Два типа малых молекул рибонуклеиновой кислоты (РНК) - микроРНК (миРНК) и малая интерферирующая РНК ( миРНК ) - играют центральную роль в РНК-интерференции. РНК являются прямыми продуктами генов, и эти малые РНК могут направлять ферментные комплексы на разрушение молекул информационной РНК (мРНК) и, таким образом, снижать их активность, предотвращая трансляцию, посредством посттранскрипционного молчания генов. Более того, транскрипция может быть ингибирована посредством механизма пре-транскрипционного сайленсинга РНК-интерференции, посредством которого ферментный комплекс катализирует метилирование ДНК в геномных положениях, комплементарных комплексной миРНК или миРНК. РНК-интерференция играет важную роль в защите клеток от паразитарных нуклеотидов.последовательности - вирусы и транспозоны . Это также влияет на развитие .

Путь РНКи обнаружен у многих эукариот , включая животных, и инициируется ферментом Дайсер , который расщепляет длинные молекулы двухцепочечной РНК (дцРНК) на короткие двухцепочечные фрагменты миРНК из ~ 21 нуклеотида . Каждая миРНК разматывается на две одноцепочечные РНК (оцРНК), пассажирскую цепь и направляющую цепь. Пассажирская цепь разрушается, а направляющая цепь включается в РНК-индуцированный комплекс сайленсинга (RISC). Наиболее хорошо изученным результатом является посттранскрипционное молчание гена, которое происходит, когда направляющая цепь соединяется с комплементарной последовательностью в молекуле матричной РНК и вызывает расщепление посредством Argonaute 2 (Ago2), каталитический компонент RISC . У некоторых организмов этот процесс распространяется системно, несмотря на изначально ограниченные молярные концентрации миРНК .

РНКи является ценным инструментом исследования как в культуре клеток, так и в живых организмах , потому что синтетическая дцРНК, введенная в клетки, может выборочно и надежно индуцировать подавление конкретных представляющих интерес генов. РНКи можно использовать для крупномасштабных экранов, которые систематически отключают каждый ген в клетке, что может помочь идентифицировать компоненты, необходимые для конкретного клеточного процесса или такого события, как деление клетки . Путь также используется в качестве практического инструмента в биотехнологии , медицине и инсектицидах . [3]

Сотовый механизм [ править ]

Dicer белок из Giardia интестиналиса , который катализирует расщепление дцРНКа к киРНКу. В РНКазы домены окрашены в зеленый цвет, домен ПАЗ желтый, домен платформы красный, а разъем спиралью синий. [4]

РНКи - это РНК-зависимый процесс сайленсинга генов, который контролируется РНК-индуцированным комплексом сайленсинга (RISC) и инициируется короткими двухцепочечными молекулами РНК в цитоплазме клетки, где они взаимодействуют с каталитическим компонентом RISC аргонавтом . [5] Когда дцРНК является экзогенной (возникшей в результате заражения вирусом с геномом РНК или лабораторных манипуляций), РНК импортируется непосредственно в цитоплазму и расщепляется на короткие фрагменты с помощью Dicer. Инициирующая дцРНК также может быть эндогенной (происходить из клетки), как в пре-микроРНК, экспрессируемых генами, кодирующими РНК, в геноме. Первичные транскрипты таких генов сначала обрабатываются с образованием характерной петли-стебля.структура пре-miRNA в ядре , затем экспортируется в цитоплазму. Таким образом, два пути дцРНК, экзогенный и эндогенный, сходятся в RISC. [6]

Экзогенная дцРНК инициирует РНКи путем активации рибонуклеазного белка Dicer [7], который связывает и расщепляет двухцепочечные РНК (дцРНК) в растениях или короткие шпильчатые РНК (кшРНК) у людей с образованием двухцепочечных фрагментов из 20-25 пар оснований. с 2-нуклеотидным выступом на 3'-конце. [8] Биоинформатические исследования геномов множества организмов показывают, что такая длина максимизирует специфичность целевого гена и сводит к минимуму неспецифические эффекты. [9] Эти короткие двухцепочечные фрагменты называются малыми интерферирующими РНК ( миРНК ). Эти миРНКзатем разделяются на отдельные нити и интегрируются в активный RISC с помощью RISC-Loading Complex (RLC). RLC включает Dicer-2 и R2D2 и имеет решающее значение для объединения Ago2 и RISC. [10] TATA-связывающий белок-ассоциированный фактор 11 (TAF11) собирает RLC, облегчая тетрамеризацию Dcr-2-R2D2, что увеличивает сродство связывания с siRNA в 10 раз. Ассоциация с TAF11 преобразует комплекс R2-D2-инициатор (RDI) в RLC. [11] R2D2 несет тандемные двухцепочечные РНК-связывающие домены для распознавания термодинамически стабильного конца миРНК.дуплексы, тогда как Дайсер-2 другая менее устойчивая конечность. Загрузка асимметрична: домен MID Ago2 распознает термодинамически стабильный конец siRNA. Следовательно, «пассажирская» (смысловая) цепь, 5'-конец которой отбрасывается MID, выбрасывается, в то время как сохраненная «направляющая» (антисмысловая) цепь взаимодействует с AGO с образованием RISC. [10]

После интеграции в RISC, миРНК соединяют пары оснований со своей целевой мРНК и расщепляют ее, тем самым предотвращая ее использование в качестве шаблона трансляции . [12] В отличие от siRNA , RISC-комплекс, нагруженный miRNA, сканирует цитоплазматические мРНК на предмет потенциальной комплементарности. Вместо деструктивного расщепления (с помощью Ago2) miRNAs скорее нацелены на 3'-нетранслируемые области (UTR) мРНК, где они обычно связываются с несовершенной комплементарностью, тем самым блокируя доступ рибосом для трансляции. [13]

Экзогенная дцРНК обнаруживается и связывается эффекторным белком, известным как RDE-4 у C. elegans и R2D2 у Drosophila , который стимулирует активность дайсера. [14] Механизм, обеспечивающий такую ​​специфичность длины, неизвестен, и этот белок связывает только длинные дцРНК. [14]

У C. elegans этот инициирующий ответ усиливается посредством синтеза популяции «вторичных» siRNAs, во время которого продуцируемые dicer инициирующие или «первичные» siRNAs используются в качестве матриц. [15] Этот вторичный «» миРНК структурно отличен от Dicer производства миРНКа и по всей видимости, получают с помощью РНК-зависимой РНК - полимеразы (RDRP). [16] [17]

МикроРНК [ править ]

Стволовые петля вторичная структура из предварительного микроРНКа из капуста огородного .
Основная статья: MicroRNA

MicroRNAs (миРНК) являются геномным кодируется некодирующим РНК , которые помогают регулировать экспрессию генов , в частности , в ходе развития . [18] Феномен РНК-интерференции, в широком смысле, включает в себя эндогенно индуцированные эффекты сайленсинга генов с помощью miRNA, а также сайленсинг, запускаемый чужеродной дцРНК. Зрелые miRNAs структурно подобны siRNAs, продуцируемым из экзогенной dsRNA, но перед достижением зрелости miRNA должны сначала подвергнуться обширной посттранскрипционной модификации . MiRNA экспрессируется из гораздо более длинного гена, кодирующего РНК, в виде первичного транскрипта, известного как pri-miRNA.который обрабатывается, в клеточном ядре , до 70 нуклеотидов в стволовой петлевой структуры , называемой предварительно микроРНК с помощью микропроцессорного комплекса . Этот комплекс состоит из фермента РНКазы III, называемого Дроша, и дцРНК-связывающего белка DGCR8 . Часть dsRNA этой пре-miRNA связывается и расщепляется Dicer с образованием зрелой молекулы miRNA, которая может быть интегрирована в комплекс RISC; таким образом, miRNA и siRNA разделяют один и тот же нижестоящий клеточный аппарат. [19] Во-первых, кодируемая вирусом miRNA была описана в вирусе Эпштейна-Барра (EBV). [20]После этого все большее количество микроРНК было описано в вирусах. VIRmiRNA - это полный каталог вирусных микроРНК, их мишеней и антивирусных miRNA [21] (см. Также ресурс VIRmiRNA: http://crdd.osdd.net/servers/virmirna/).

siRNA, полученные из длинных предшественников dsRNA, отличаются от miRNA тем, что miRNA, особенно у животных, обычно имеют неполное спаривание оснований с мишенью и ингибируют трансляцию многих различных мРНК со сходными последовательностями. Напротив, миРНК обычно образуют идеальные пары оснований и индуцируют расщепление мРНК только в одной конкретной мишени. [22] У Drosophila и C. elegans miRNA и siRNA процессируются отдельными белками argonaute и ферментами dicer. [23] [24]

Три первичных нетранслируемых региона и микроРНК [ править ]

Основная статья: Три основных непереведенных региона

Три первичных нетранслируемых области (3'UTR) информационных РНК (мРНК) часто содержат регуляторные последовательности, которые посттранскрипционно вызывают интерференцию РНК. Такие 3'-UTR часто содержат как сайты связывания для микроРНК (miRNA), так и для регуляторных белков. Связываясь со специфическими сайтами в 3'-UTR, miRNA могут снижать экспрессию генов различных мРНК, либо ингибируя трансляцию, либо напрямую вызывая деградацию транскрипта. 3'-UTR также может иметь области сайленсера, которые связывают репрессорные белки, которые ингибируют экспрессию мРНК.

3'-UTR часто содержат элементы ответа микроРНК (MRE) . MRE представляют собой последовательности, с которыми связываются миРНК. Это преобладающие мотивы в 3'-UTR. Среди всех регуляторных мотивов в 3'-UTR (например, включая области сайленсеров) MRE составляют около половины мотивов.

По состоянию на 2014 г. веб-сайт miRBase , [25] архив последовательностей и аннотаций miRNA , перечислил 28 645 записей о 233 биологических видах. Из них 1881 miRNA находились в аннотированных локусах miRNA человека. Предполагалось, что miRNA содержат в среднем около четырехсот целевых мРНК (влияющих на экспрессию нескольких сотен генов). [26] Фридман и др. [26] подсчитали, что> 45000 сайтов-мишеней miRNA в 3'UTR мРНК человека консервативны выше фоновых уровней, и более 60% генов, кодирующих человеческие белки, находились под селективным давлением для поддержания спаривания с miRNA.

Прямые эксперименты показывают, что одна миРНК может снизить стабильность сотен уникальных мРНК. [27] Другие эксперименты показывают, что одна miRNA может подавлять продукцию сотен белков, но эта репрессия часто бывает относительно мягкой (менее чем в 2 раза). [28] [29]

Эффекты нарушения регуляции экспрессии генов miRNA, по-видимому, важны при раке. [30] Например, при раке желудочно-кишечного тракта девять миРНК были идентифицированы как эпигенетически измененные и эффективные в подавлении регуляции ферментов репарации ДНК. [31]

Эффекты дисрегуляции экспрессии генов miRNA также, по-видимому, важны при нейропсихиатрических расстройствах, таких как шизофрения, биполярное расстройство, большая депрессия, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера и расстройства аутистического спектра. [32] [33] [34]

Активация и катализ RISC [ править ]

Экзогенная дцРНК обнаруживается и связывается эффекторным белком, известным как RDE-4 у C. elegans и R2D2 у Drosophila , который стимулирует активность дайсера. [14] Этот белок связывает только длинные дцРНК, но механизм, обеспечивающий специфичность этой длины, неизвестен. [14] Этот РНК-связывающий белок затем облегчает перенос расщепленных миРНК в комплекс RISC. [35]

У C. elegans этот инициирующий ответ усиливается посредством синтеза популяции «вторичных» siRNAs, во время которого продуцируемые dicer инициирующие или «первичные» siRNAs используются в качестве матриц. [15] Этот вторичный «» миРНК структурно отличен от Dicer производства миРНКа и по всей видимости, получают с помощью РНК-зависимой РНК - полимеразы (RDRP). [16] [17]

Биогенез малых РНК : первичные миРНК (при-миРНК) транскрибируются в ядре и складываются обратно в себя в виде шпилек, которые затем обрезаются в ядре микропроцессорным комплексом с образованием пре-РНК шпильки размером ~ 60-70 нт. Эта пре-миРНК транспортируется через комплекс ядерных пор (NPC) в цитоплазму, где Дайсер дополнительно урезает ее до дуплекса миРНК ~ 20nt (пре-миРНК также вступают в путь на этом этапе). Затем этот дуплекс загружается в Ago с образованием «пре-RISC (комплекс подавления, индуцированного РНК)», и цепь-пассажир высвобождается с образованием активного RISC .
Слева: полноразмерная Argonaute белок из археи видов Pyrococcus furiosus . Справа: PIWI домен из Argonaute белка в комплексе с двухцепочечной РНК .

Активными компонентами комплекса РНК-индуцированного сайленсинга (RISC) являются эндонуклеазы, называемые белками аргонаута, которые расщепляют цепь мРНК-мишени, комплементарную связанной с ними миРНК . [5] Поскольку фрагменты, продуцируемые дайсером, являются двухцепочечными, каждый из них теоретически может продуцировать функциональную миРНК . Однако только одна из двух цепей, известная как направляющая цепь , связывает белок аргонавта и направляет подавление гена. Другая антинаправляющая нить или пассажирская нить разрушается во время активации RISC. [36] Хотя сначала считалось, что АТФ- зависимая геликазаразделив эти две цепи [37], этот процесс оказался АТФ-независимым и осуществляется непосредственно белковыми компонентами RISC. [38] [39] Однако кинетический анализ РНКи in vitro в присутствии и в отсутствие АТФ показал, что АТФ может потребоваться для раскручивания и удаления расщепленной цепи мРНК из комплекса RISC после катализа. [40] Направляющая цепь имеет тенденцию быть той, у которой 5'-конец менее стабильно спарен с ее комплементом [41], но на выбор цепи не влияет направление, в котором дайсер расщепляет дцРНК перед включением RISC. [42]Вместо этого белок R2D2 может служить фактором дифференциации, связывая более стабильный 5'-конец цепи-пассажира. [43]

Структурную основу связывания РНК с белком аргонавта исследовали с помощью рентгеновской кристаллографии связывающего домена РНК-связанного белка аргонавта. Здесь фосфорилированный 5'-конец цепи РНК входит в консервативный основной поверхностный карман и устанавливает контакты через двухвалентный катион (атом с двумя положительными зарядами), такой как магний, и путем ароматической укладки (процесс, который позволяет более чем одному атому совместно использовать электрон, передавая его туда и обратно) между 5'-нуклеотидом в миРНК и консервативным тирозиномостаток. Считается, что этот сайт формирует сайт зародышеобразования для связывания миРНК с ее мРНК-мишенью. [44] Анализ ингибирующего действия несовпадений на 5'- или 3'-конце направляющей цепи показал, что 5'-конец направляющей цепи, вероятно, отвечает за сопоставление и связывание целевой мРНК, в то время как 3'-конец отвечает за физическое расположение мРНК-мишени в области RISC, благоприятной для расщепления. [40]

Неизвестно, как активированный комплекс RISC находит комплементарные мРНК внутри клетки. Хотя предполагалось, что процесс расщепления связан с трансляцией , трансляция мРНК-мишени не является существенной для опосредованной РНКи деградации. [45] Действительно, РНКи могут быть более эффективными против мишеней мРНК, которые не транслируются. [46] Белки Argonaute локализованы в определенных областях цитоплазмы, называемых P-тельцами (также цитоплазматическими тельцами или GW-тельцами), которые представляют собой области с высокой скоростью распада мРНК; [47] активность miRNA также сгруппирована в P-тельцах. [48]Нарушение Р-телец снижает эффективность РНК-интерференции, предполагая, что они являются критическим сайтом в процессе РНКи. [49]

Транскрипционное молчание [ править ]

Дайсер фермента обрезает двухцепочечную РНК с образованием малой интерферирующей РНК или микроРНК . Эти процессированные РНК включаются в комплекс РНК-индуцированного сайленсинга (RISC), который нацелен на информационную РНК для предотвращения трансляции . [50]

Компоненты пути РНКи используются у многих эукариот для поддержания организации и структуры их геномов . Модификация гистонов и связанная с ними индукция образования гетерохроматина служат для подавления пре- транскрипции генов ; [51] этот процесс называется РНК-индуцированным подавлением транскрипции (RITS) и осуществляется комплексом белков, называемым комплексом RITS. У делящихся дрожжей этот комплекс содержит аргонавт, хромодоменный белок Chp1 и белок Tas3 неизвестной функции. [52]Как следствие, для индукции и распространения гетерохроматиновых областей необходимы белки argonaute и RdRP. [53] Действительно, делеция этих генов в делящихся дрожжах S. pombe нарушает метилирование гистонов и образование центромеры , [54] вызывая медленную или остановленную анафазу во время деления клеток . [55] В некоторых случаях наблюдались сходные процессы, связанные с модификацией гистонов, с активацией транскрипции генов. [56]

Механизм, с помощью которого комплекс RITS индуцирует образование и организацию гетерохроматина, не совсем понятен. Большинство исследований было сосредоточено на области типа спаривания у делящихся дрожжей, которая не может быть репрезентативной для активности в других геномных регионах / организмах. Поддерживая существующие области гетерохроматина, RITS образует комплекс с миРНК, комплементарными локальным генам, и стабильно связывает локальные метилированные гистоны, действуя котранскрипционно, разрушая любые возникающие транскрипты пре-мРНК, которые инициируются РНК-полимеразой . Формирование такой области гетерохроматина, хотя и не ее поддержание, зависит от дайсера, предположительно потому, что дайсер необходим для генерации начального комплемента миРНК.которые нацелены на последующие стенограммы. [57] Поддержание гетерохроматина, как предполагается, функционирует как самоусиливающаяся петля обратной связи, поскольку новые siRNAs формируются из случайных возникающих транскриптов с помощью RdRP для включения в локальные комплексы RITS. [58] Актуальность наблюдений в областях спаривания делящихся дрожжей и центромер для млекопитающих неясна, т.к. поддержание гетерохроматина в клетках млекопитающих может быть независимым от компонентов пути RNAi. [59]

Перекрестные помехи при редактировании РНК [ править ]

Тип редактирования РНК, который наиболее распространен у высших эукариот, превращает аденозиновые нуклеотиды в инозин в дцРНК с помощью фермента аденозиндезаминазы (ADAR). [60] В 2000 году было первоначально предложено, что пути редактирования РНКи и A → I РНК могут конкурировать за общий субстрат дцРНК. [61] Некоторые пре-miRNAs действительно подвергаются редактированию A → I РНК [62] [63], и этот механизм может регулировать процессинг и экспрессию зрелых miRNAs. [63] Кроме того, по крайней мере один ADAR млекопитающих может изолировать миРНК от компонентов пути РНКи. [64]Дальнейшее подтверждение этой модели получено из исследований ADAR-нулевых штаммов C. elegans , показывающих, что редактирование РНК A → I может противодействовать РНКи сайленсингу эндогенных генов и трансгенов. [65]

Иллюстрация основных различий между подавлением генов растений и животных. Нативно экспрессируемая микроРНК или экзогенная малая интерферирующая РНК обрабатывается дайсером и интегрируется в комплекс RISC , который обеспечивает молчание генов. [66]

Различия между организмами [ править ]

Организмы различаются по своей способности захватывать чужеродную дцРНК и использовать ее в пути РНКи. Эффекты РНК-интерференции могут быть как системными, так и наследственными у растений и C. elegans , но не у дрозофилы или млекопитающих. Считается, что в растениях РНКи распространяется посредством переноса миРНК между клетками через плазмодесмы (каналы в клеточных стенках, которые обеспечивают связь и транспорт). [37] Наследственность обусловлена метилированием промоторов, на которые нацелены РНКи; новый паттерн метилирования копируется в каждом новом поколении клетки. [67]Широкое общее различие между растениями и животными заключается в нацеливании на эндогенно продуцируемые miRNAs; у растений miRNAs обычно полностью или почти идеально комплементарны своим генам-мишеням и индуцируют прямое расщепление мРНК с помощью RISC, тогда как miRNA животных имеют тенденцию быть более дивергентными по последовательности и индуцируют репрессию трансляции. [66] Этот трансляционный эффект может быть вызван ингибированием взаимодействий факторов инициации трансляции с полиадениновым хвостом информационной РНК . [68]

Некоторые простейшие эукариот, такие как Leishmania major и Trypanosoma cruzi, полностью лишены пути РНКи. [69] [70] Большинство или все компоненты отсутствуют у некоторых грибов , в первую очередь у модельного организма Saccharomyces cerevisiae . [71] Присутствие РНКи у других видов почкующихся дрожжей, таких как Saccharomyces castellii и Candida albicans , дополнительно демонстрирует, что индукция двух РНКи-родственных белков из S. castellii способствует РНКи в S. cerevisiae . [72] Некоторые аскомицетыи у базидиомицетов отсутствуют пути интерференции РНК, это указывает на то, что белки, необходимые для подавления РНК, были потеряны независимо от многих грибковых клонов , возможно, из-за эволюции нового пути со сходной функцией или из-за отсутствия избирательного преимущества в определенных нишах . [73]

Связанные прокариотические системы [ править ]

На экспрессию генов у прокариот влияет система, основанная на РНК, в некоторых отношениях сходная с РНКи. Здесь гены, кодирующие РНК, контролируют количество или трансляцию мРНК, производя комплементарную РНК, которая отжигается с мРНК. Однако эти регуляторные РНК обычно не считаются аналогами миРНК, потому что в этом не участвует фермент дайсера. [74] Было высказано предположение, что системы интерференции CRISPR в прокариотах аналогичны эукариотическим системам интерференции РНК, хотя ни один из белковых компонентов не является ортологичным . [75]

Биологические функции [ править ]

Иммунитет [ править ]

РНК-интерференция является жизненно важной частью иммунного ответа на вирусы и другой чужеродный генетический материал , особенно у растений, где она также может препятствовать самораспространению транспозонов. [76] Такие растения, как Arabidopsis thaliana, экспрессируют несколько гомологов дайсера , которые по-разному реагируют, когда растение подвергается воздействию различных вирусов. [77] Еще до того, как путь РНКи был полностью понят, было известно, что индуцированное молчание генов в растениях может распространяться по всему растению с системным эффектом и может передаваться от стада к привоям посредством прививки . [78]Этот феномен был с тех пор признан особенностью адаптивной иммунной системы растений и позволяет всему растению реагировать на вирус после первоначального локализованного контакта. [79] В ответ многие вирусы растений развили сложные механизмы для подавления ответа РНКи. [80] К ним относятся вирусные белки, которые связывают короткие двухцепочечные фрагменты РНК с одноцепочечными выступающими концами, например те, которые продуцируются дайсером. [81] Некоторые геномы растений также экспрессируют эндогенные миРНК в ответ на инфекцию, вызванную определенными типами бактерий . [82]Эти эффекты могут быть частью общей реакции на патогены, которая подавляет любой метаболический процесс в организме хозяина, который способствует процессу инфекции. [83]

Хотя животные обычно экспрессируют меньше вариантов фермента дайсера, чем растения, РНКи у некоторых животных вызывает противовирусный ответ. В обоих несовершеннолетних и взрослых дрозофилы , РНК - интерференция играет важную роль в противовирусной врожденного иммунитета и активен в отношении патогенных микроорганизмов , таких как вирус Drosophila X . [84] [85] Подобная роль в иммунитете может действовать и у C. elegans , поскольку белки аргонавта активируются в ответ на вирусы, а черви, избыточно экспрессирующие компоненты пути РНКи, устойчивы к вирусной инфекции. [86] [87]

Роль РНК-интерференции в врожденном иммунитете млекопитающих плохо изучена, и данных относительно мало. Однако существование вирусов, кодирующих гены, способные подавлять РНКи-ответ в клетках млекопитающих, может свидетельствовать в пользу РНКи-зависимого иммунного ответа млекопитающих [88] [89], хотя эта гипотеза была оспорена как плохо обоснованная. [90] Были представлены доказательства существования функционального пути противовирусной РНКи в клетках млекопитающих. [91] [92]

Существуют и другие функции РНКи в вирусах млекопитающих, такие как миРНК, экспрессируемые вирусом герпеса, которые могут действовать как триггеры организации гетерохроматина, опосредуя вирусную латентность. [93]

Подавление генов [ править ]

Эндогенно экспрессируемые miRNAs, включая как интронные, так и межгенные miRNAs, наиболее важны в репрессии трансляции [66] и в регуляции развития, особенно в отношении сроков морфогенеза и поддержания недифференцированных или неполностью дифференцированных типов клеток, таких как стволовые клетки . [94] Роль эндогенно экспрессируемой микроРНК в подавлении экспрессии генов была впервые описана у C. elegans в 1993 году. [95] У растений эта функция была обнаружена, когда «микроРНК JAW» Arabidopsisбыло показано, что он участвует в регуляции нескольких генов, контролирующих форму растений. [96] В растениях большинство генов, регулируемых miRNA, являются факторами транскрипции ; [97], таким образом, активность miRNA особенно обширна и регулирует целые генные сети во время развития, модулируя экспрессию ключевых регуляторных генов, включая факторы транскрипции, а также белки F-бокса . [98] У многих организмов, включая человека, миРНК связаны с образованием опухолей и нарушением регуляции клеточного цикла . Здесь miRNA могут функционировать как онкогены, так и как опухолевые супрессоры .[99]

Эволюция [ править ]

Основываясь на филогенетическом анализе на основе экономичности , самый недавний общий предок всех эукариот, скорее всего, уже обладал ранним путем РНК-интерференции; отсутствие этого пути у некоторых эукариот считается производной характеристикой. [100] Эта предковая система РНКи, вероятно, содержала по крайней мере один дайсер-подобный белок, один аргонавин, один белок PIWI и РНК-зависимую РНК-полимеразу, которая также могла играть другие клеточные роли. Крупномасштабное сравнительное исследование геномики также показывает, что эукариотическая коронная группауже обладали этими компонентами, которые затем могли иметь более тесные функциональные ассоциации с системами обобщенной деградации РНК, такими как экзосома . [101] Это исследование также предполагает , что РНК-связывающий Argonaute семейства белков, который является общим среди эукариот, большинство архебактерий, и по крайней мере некоторые бактерии (такие , как Aquifex aeolicus ), гомологичен и первоначально эволюционировали от компонентов инициации трансляции системы .

Приложения [ править ]

Нокдаун Джина [ править ]

Путь РНК-интерференции часто используется в экспериментальной биологии для изучения функции генов в культуре клеток и in vivo в модельных организмах . [5] Двухцепочечная РНК синтезируется с последовательностью, комплементарной интересующему гену, и вводится в клетку или организм, где она распознается как экзогенный генетический материал и активирует путь РНКи. Используя этот механизм, исследователи могут вызвать резкое снижение экспрессии целевого гена. Изучение эффектов этого снижения может показать физиологическую роль продукта гена. Поскольку РНКи не может полностью устранить экспрессию гена, этот метод иногда называют « нокдауном».", чтобы отличить его от процедур " нокаута ", при которых экспрессия гена полностью устраняется. [102] В недавнем исследовании, подтверждающем эффективность подавления РНКи с использованием данных массива генов, было показано, что частота неудач в 429 независимых экспериментах составляет 18,5%. [103]

Обширные усилия в вычислительной биологии были направлены на разработку успешных реагентов дцРНК, которые максимизируют нокдаун гена, но минимизируют «нецелевые» эффекты. Эффекты вне мишени возникают, когда введенная РНК имеет базовую последовательность, которая может сочетаться с несколькими генами и, таким образом, уменьшать экспрессию. Такие проблемы возникают чаще, когда дцРНК содержит повторяющиеся последовательности. Изучая геномы людей, C. elegans и S. pombe , было подсчитано, что около 10% возможных siРНК имеют существенные эффекты вне мишени. [9] Было разработано множество программных инструментов, реализующих алгоритмы для разработки общих [104] [105]Специфичные для млекопитающих [106] и вирус-специфичные [107] миРНК , которые автоматически проверяются на возможную перекрестную реактивность.

В зависимости от организма и экспериментальной системы экзогенная РНК может представлять собой длинную цепь, предназначенную для расщепления с помощью дисера, или короткие РНК, предназначенные для использования в качестве субстратов миРНК . В большинстве клеток млекопитающих используются более короткие РНК, потому что длинные двухцепочечные молекулы РНК индуцируют интерфероновый ответ млекопитающих , форму врожденного иммунитета, которая неспецифически реагирует на чужеродный генетический материал. [108] Ооциты мышей и клетки ранних эмбрионов мыши лишены этой реакции на экзогенную дцРНК и, следовательно, являются общей модельной системой для изучения эффектов нокдауна генов у млекопитающих. [109]Лабораторные методы Специализированные также были разработаны , чтобы улучшить полезность RNAi в системах млекопитающих, избегая прямого введения миРНК , например, путем стабильной трансфекции с плазмидой , кодирующей соответствующую последовательность , из которой миРНК могут быть расшифрованы, [110] , или более сложные лентивирусные векторные системы, позволяющие индуцибельную активацию или дезактивацию транскрипции, известную как условная РНКи . [111] [112]

Функциональная геномика [ править ]

Нормальная взрослая муха дрозофила , обычный модельный организм, используемый в экспериментах по РНКи.


Подходы к созданию полногеномных библиотек РНКи могут потребовать большей сложности, чем дизайн одиночной миРНК для определенного набора экспериментальных условий. Искусственные нейронные сети часто используются для создания библиотек siRNA [113] и для прогнозирования их вероятной эффективности при нокдауне генов. [114] Массовый геномный скрининг широко рассматривается как многообещающий метод аннотации генома и положил начало развитию высокопроизводительных методов скрининга, основанных на микроматрицах . [115] [116]Однако полезность этих скринингов и способность методов, разработанных на модельных организмах, распространяться даже на близкородственные виды, были поставлены под сомнение, например, от C. elegans до родственных паразитических нематод. [117] [118]

Медицина [ править ]

История использования РНКи в медицине

Хронология использования РНКи в медицине с 1996 по 2017 гг.

Первый случай молчания РНК у животных был задокументирован в 1996 году, когда Гуо и Кемфуэс наблюдали, что введение смысловой и антисмысловой РНК в мРНК par-1 у Caenorhabditis elegans вызывает деградацию сообщения par-1. [119] Считалось, что эта деградация запускается одноцепочечной РНК (оцРНК), но два года спустя, в 1998 году, Файер и Мелло обнаружили, что эта способность подавлять экспрессию гена par-1 на самом деле запускается двухцепочечной РНК. РНК (дцРНК). [119] В конечном итоге они разделили Нобелевскую премию по физиологии и медицине за это открытие. [120]Сразу после новаторского открытия Файра и Мелло Эльбашир и др. обнаружено, что с помощью синтетически созданной малой интерферирующей РНК (миРНК) стало возможно нацеливаться на подавление определенных последовательностей в гене, а не на подавление всего гена. [121] Только год спустя McCaffrey и его коллеги продемонстрировали, что это специфичное для последовательности молчание имеет терапевтическое применение, нацеленное на последовательность вируса гепатита C у трансгенных мышей. [122] С тех пор множество исследователей пытались расширить терапевтическое применение РНКи, в частности пытаясь воздействовать на гены, вызывающие различные типы рака . [123] [124]К 2006 году первые приложения, прошедшие клинические испытания, были для лечения дегенерации желтого пятна и респираторно-синцитиального вируса . [125] Четыре года спустя было начато первое клиническое испытание фазы I на людях с использованием системы доставки наночастиц для нацеливания на солидные опухоли . [126] Хотя в настоящее время в большинстве исследований изучается применение РНКи в лечении рака, список возможных применений обширен. РНКи потенциально могут быть использованы для лечения вирусов , [127] бактериальных заболеваний , [128] паразитов , [129] дезадаптивных генетические мутации , [130] контролируют потребление наркотиков , [131] обезболивают , [132] и даже регулируют сон. [133]

Терапевтические приложения [ править ]

Вирусная инфекция [ править ]

Противовирусное лечение - одно из первых предложенных медицинских приложений на основе РНКи, и были разработаны два различных типа. Первый тип направлен на вирусные РНК. Многие исследования показали, что нацеливание вирусных РНК может подавлять репликацию множества вирусов, включая ВИЧ , [134] ВПЧ , [135] гепатит А , [136] гепатит В , [137] вирус гриппа , [138] [139] [140 ]. ] [141] респираторно-синцитиальный вирус (RSV), [141] коронавирус SARS (SARS-CoV), [141] аденовирус [141] и вирус кори . [142]Другая стратегия состоит в том, чтобы заблокировать начальные проникновения вируса путем нацеливания на гены клетки-хозяина. [143] Например, подавление хемокиновых рецепторов ( CXCR4 и CCR5 ) на клетках-хозяевах может предотвратить проникновение вируса ВИЧ. [144]

Рак [ править ]

Хотя традиционная химиотерапия может эффективно убивать раковые клетки, отсутствие специфичности для различения нормальных и раковых клеток в этих методах лечения обычно вызывает серьезные побочные эффекты. Многочисленные исследования продемонстрировали, что РНКи может обеспечить более специфический подход к подавлению роста опухоли путем воздействия на гены, связанные с раком (например, онкоген ). [145] Также было высказано предположение, что РНКи могут повышать чувствительность раковых клеток к химиотерапевтическим агентам , обеспечивая комбинаторный терапевтический подход с химиотерапией. [146] Еще одно возможное лечение на основе РНКи - ингибирование клеточной инвазии и миграции . [147]

Неврологические заболевания [ править ]

Стратегии РНКи также показывают потенциал для лечения нейродегенеративных заболеваний . Исследования на клетках и на мышах показали, что специфическое воздействие РНКи на гены, продуцирующие бета- амилоид (например, BACE1 и APP), может значительно снизить количество пептида Aβ, которое коррелирует с причиной болезни Альцгеймера . [148] [149] [150] Кроме того, это глушение подходы , основанное также обеспечивают многообещающие результаты в лечении болезни Паркинсона и болезни полиглутаминовой . [151] [152] [153]

Трудности в терапевтическом применении [ править ]

Чтобы реализовать клинический потенциал РНКи, миРНК необходимо эффективно транспортировать к клеткам тканей-мишеней. Однако существуют различные препятствия, которые необходимо устранить, прежде чем его можно будет использовать в клинических условиях. Например, «голая» миРНК подвержена нескольким препятствиям, которые снижают ее терапевтическую эффективность. [154] Кроме того, как только миРНК попадает в кровоток, «голая» РНК может расщепляться нуклеазами сыворотки и стимулировать врожденную иммунную систему. [154] Из-за своего размера и сильно полианионной (содержащей отрицательные заряды в нескольких местах) природы немодифицированные молекулы миРНК не могут легко проникать в клетки через клеточную мембрану. Следовательно, искусственная миРНК или инкапсулированная наночастицамидолжен быть использован. Однако транспортировка siRNA через клеточную мембрану по-прежнему имеет свои уникальные проблемы. Если миРНК переносится через клеточную мембрану, может возникнуть непреднамеренная токсичность, если терапевтические дозы не оптимизированы, и миРНК могут проявлять нецелевые эффекты (например, непреднамеренное подавление генов с частичной комплементарностью последовательностей ). [155] Даже после попадания в клетки требуется повторное дозирование, поскольку их действие ослабляется при каждом делении клеток. Как описано ранее, части вектора, транспортирующие дцРНК, также могут иметь регуляторные эффекты. Поэтому следует учитывать и контролировать неспецифические побочные эффекты. [156]

Лечение рака [ править ]

По сравнению с химиотерапией или другими противораковыми препаратами у препарата миРНК есть много преимуществ. [157] SiRNA действует на посттранскрипционной стадии экспрессии генов, поэтому она не модифицирует и не изменяет ДНК, оказывая вредное воздействие. [157] SiRNA также может использоваться для получения определенного ответа определенным способом, например, путем снижения уровня подавления экспрессии генов. [157] В одной раковой клетке миРНК может вызвать резкое подавление экспрессии генов всего с несколькими копиями. [157] Это происходит путем подавления генов, способствующих развитию рака, с помощью РНКи, а также нацеливания на последовательность мРНК. [157]

РНКи-препараты лечат рак, подавляя определенные гены, способствующие развитию рака. [157] Это достигается путем дополнения раковых генов РНКи, например, сохранения последовательностей мРНК в соответствии с препаратом РНКи. [157] В идеале, РНКи следует вводить и / или химически модифицировать, чтобы РНКи могли более эффективно достигать раковых клеток. [157] Поглощение и регуляция РНКи контролируется почками. [157]

Стимуляция иммунного ответа [ править ]

Иммунная система человека делится на две отдельные ветви: врожденная иммунная система и адаптивная иммунная система. [158] Врожденная иммунная система является первой защитой от инфекции и реагирует на патогены обычным образом. [158] С другой стороны, адаптивная иммунная система, система, которая была развита позже, чем врожденная, состоит в основном из высокоспециализированных В- и Т-клеток, которые обучены реагировать на определенные части патогенных молекул. [158]

Проблема между старыми и новыми патогенами помогла создать систему защищенных клеток и частиц, которую называют безопасной структурой. [158] Эта структура дала людям армейские системы, которые ищут и уничтожают частицы-захватчики, такие как патогены, микроскопические организмы, паразиты и инфекции. [158] Безопасная структура для млекопитающих была разработана для включения миРНК в качестве инструмента для индикации вирусного заражения, что позволило миРНК создать интенсивный врожденный иммунный ответ. [158]

siRNA контролируется врожденной иммунной системой, которую можно разделить на острые воспалительные реакции и противовирусные реакции. [158] Воспалительный ответ создается с помощью сигналов от небольших сигнальных молекул или цитокинов. [158] К ним относятся интерлейкин-1 (IL-1), интерлейкин-6 (IL-6), интерлейкин-12 (IL-12) и фактор некроза опухоли α (TNF-α). [158] Врожденная иммунная система генерирует воспаление и противовирусные реакции, которые вызывают высвобождение рецепторов распознавания паттернов (PRR). [158] Эти рецепторы помогают определить, какие патогены являются вирусами, грибами или бактериями. [158]Более того, важность siRNA и врожденной иммунной системы состоит в том, чтобы включать больше PRR, чтобы помочь распознавать различные структуры РНК. [158] Это увеличивает вероятность того, что миРНК вызовет иммуностимулирующий ответ в случае патогена. [158]

Перспективы как лечебная методика [ править ]

Клинические исследования фаз I и II терапии миРНК, проведенные в период с 2015 по 2017 год, продемонстрировали мощный и стойкий нокдаун гена в печени с некоторыми признаками клинического улучшения и без неприемлемой токсичности. [155] В настоящее время проводятся два исследования фазы III по лечению семейных нейродегенеративных и сердечных синдромов, вызванных мутациями транстиретина (TTR). [155] Многочисленные публикации показали, что системы доставки in vivo очень перспективны и разнообразны по характеристикам, что позволяет использовать их в самых разных областях. Система доставки наночастиц является наиболее многообещающей, но этот метод создает дополнительные проблемы при масштабировании.производственного процесса, например, необходимость в строго контролируемых процессах смешивания для достижения стабильного качества лекарственного препарата. [154]

В таблице ниже показаны различные препараты, использующие РНК-интерференцию, а также их фазы и статус в клинических испытаниях по состоянию на 2013 год. [154]

ЛекарствоЦельСистема доставкиБолезньФазаСтатусКомпанияИдентификатор
ALN – VSP02KSP и VEGFLNPСолидные опухолияЗавершенныйAlnylam PharmaceuticalsNCT01158079
миРНК-EphA2-DOPCEphA2LNPПродвинутые формы ракаяРекрутингОнкологический центр доктора медицины АндерсонаNCT01591356
Atu027ПКН3LNPСолидные опухолияЗавершенныйБезмолвная терапияNCT00938574
ТКМ – 080301PLK1LNPРакяРекрутингTekmira PharmaceuticalNCT01262235
ТКМ – 100201VP24, VP35, L-полимераза Эболы ЗаираLNPЭбола-вирусная инфекцияяРекрутингTekmira PharmaceuticalNCT01518881
ALN – RSV01Нуклеокапсид RSVГолая миРНКРеспираторно-синцитиальные вирусные инфекцииIIЗавершенныйAlnylam PharmaceuticalsNCT00658086
PRO-040201ApoBLNPГиперхолестеринемияяПрекращеноTekmira PharmaceuticalNCT00927459
ALN – PCS02PCSK9LNPГиперхолестеринемияяЗавершенныйAlnylam PharmaceuticalsNCT01437059
ALN – TTR02TTRLNPТранстиретин-опосредованный амилоидозIIРекрутингAlnylam PharmaceuticalsNCT01617967
КАЛАА-01RRM2Циклодекстрин НПСолидные опухолияАктивныйCalando PharmaceuticalsNCT00689065
TD101K6a (мутация N171K)Голая миРНКВрожденная пахионихияяЗавершенныйPachyonychia Congenita ProjectNCT00716014
AGN211745VEGFR1Голая миРНКВозрастная дегенерация желтого пятна, хориоидальная неоваскуляризацияIIПрекращеноАллерганNCT00395057
QPI-1007CASP2Голая миРНКАтрофия зрительного нерва, неартеритическая передняя ишемическая оптическая нейропатияяЗавершенныйQuark PharmaceuticalsNCT01064505
I5NPp53Голая миРНКПоражение почек, острая почечная недостаточностьяЗавершенныйQuark PharmaceuticalsNCT00554359
Задержка функции трансплантата, осложнения трансплантации почкиI, IIРекрутингQuark PharmaceuticalsNCT00802347
ПФ-655 (ПФ-04523655)RTP801 (собственная цель)Голая миРНКНеоваскуляризация хориоидеи, диабетическая ретинопатия, диабетический макулярный отекIIАктивныйQuark PharmaceuticalsNCT01445899
siG12D LODERКРАСLODER полимерРак поджелудочной железыIIРекрутингМолчаниеNCT01676259
БевасиранибVEGFГолая миРНКДиабетический отек желтого пятна, дегенерация желтого пятнаIIЗавершенныйОпко ЗдоровьеNCT00306904
SYL1001TRPV1Голая миРНКГлазная боль, синдром сухого глазаI, IIРекрутингSylentisNCT01776658
SYL040012ADRB2Голая миРНКГлазная гипертензия, открытоугольная глаукомаIIРекрутингSylentisNCT01739244
CEQ508CTNNB1КшРНК, несущая Escherichia coliСемейный аденоматозный полипозI, IIРекрутингМарина БиотехНеизвестный
RXi-109CTGFСамодоставляющееся соединение РНКиПрофилактика рубцовых рубцовяРекрутингRXi PharmaceuticalsNCT01780077
ALN – TTRscTTRконъюгат миРНК-GalNAcТранстиретин-опосредованный амилоидозяРекрутингAlnylam PharmaceuticalsNCT01814839
ARC-520Консервативные области HBVЦОДHBVяРекрутингArrowhead ResearchNCT01872065

Биотехнология [ править ]

РНК-интерференция использовалась для приложений в биотехнологии и приближается к коммерциализации в других областях. RNAi привела к изобретению новых сельскохозяйственных культур, таких как безникотиновый табак, кофе без кофеина, растения, обогащенные питательными веществами, и гипоаллергенные культуры. Генетически модифицированные арктические яблоки получили одобрение FDA в 2015 году. [159] Яблоки были произведены путем подавления РНКи гена PPO (полифенолоксидазы), в результате чего сорта яблок не потемнели после нарезки. Яблоки с глухим PPO не могут превращать хлорогеновую кислоту в стандартный хиноновый продукт. [1]

Существует несколько возможностей применения РНКи в растениеводстве для ее улучшения, таких как устойчивость к стрессу и повышение уровня питательности. RNAi докажет свой потенциал ингибирования фотодыхания для повышения продуктивности растений C3. Это нокдаун технология может быть полезной в стимулировании раннего цветения, задержка созревания, задержка старение, нарушение покой, без напряжений растения, преодоление собственной стерильности и т.д. [1]

Еда [ править ]

РНКи использовались для генетической инженерии растений для производства более низких уровней естественных токсинов растений. Такие методы используют преимущества стабильного и наследуемого фенотипа РНКи в растительных стадах. Семена хлопка богаты диетическим белком, но, естественно, содержат токсичный терпеноидный продукт госсипол , что делает их непригодными для употребления в пищу человеком. РНКи использовалась для производства запасов хлопка, семена которых содержат пониженные уровни дельта-кадинен-синтазы , ключевого фермента в производстве госсипола, не влияя на производство фермента в других частях растения, где госсипол сам по себе важен для предотвращения повреждения от вредителей растений. [160]Аналогичные усилия были направлены на снижение содержания цианогенного природного продукта линамарина в растениях маниоки . [161]

Никакие растительные продукты, в которых используется генная инженерия на основе РНКи , еще не вышли из экспериментальной стадии. Усилия по разработке позволили успешно снизить уровень аллергенов в растениях томатов [162] и обогатить такие растения, как томаты, диетическими антиоксидантами . [163] Предыдущие коммерческие продукты, в том числе Flavr Savr томатным и двух сортов из кольцевой пятнистости резистентные папайи , были первоначально разработаны с использованием антисмысловой технологии , но вероятно эксплуатировали тропу RNAi. [164] [165] РНКи молчаниеАльфа-амилаза также использовалась для уменьшения роста грибков Aspergillus flavus кукурузы, которые в противном случае загрязнили бы зерна опасными афлатоксинами . [166] Подавление синтазы слезоточивого фактора в луке привело к образованию лука без слез, а РНКи была использована в генах BP1 в семенах рапса для улучшения фотосинтеза. [167] Гены SBEIIa и SBEIIb пшеницы нацелены на выработку более высоких уровней амилозы для улучшения функции кишечника. [168]

Другие культуры [ править ]

Еще одна попытка снизила количество предшественников вероятных канцерогенов в растениях табака . [169] Другие свойства растений, которые были разработаны в лаборатории, включают производство ненаркотических натуральных продуктов с помощью опийного мака [170] и устойчивость к распространенным вирусам растений. [171]

Инсектицид [ править ]

РНКи находится в стадии разработки как инсектицид , использующий несколько подходов, включая генную инженерию и местное применение. [3] Клетки средней кишки некоторых насекомых поглощают молекулы дцРНК в процессе, называемом РНКи окружающей среды. [172] У некоторых насекомых эффект носит системный характер, поскольку сигнал распространяется по телу насекомого (так называемая системная РНКи). [173]

Животные, подвергшиеся воздействию РНКи в дозах, в миллионы раз превышающих ожидаемые уровни воздействия на человека, не проявляют никаких побочных эффектов. [174]

РНКи по-разному влияет на разные виды чешуекрылых (бабочки и мотыльки). [175] Возможно, из-за того, что их слюна и кишечный сок лучше расщепляют РНК, хлопковая совка , свекольная совка и азиатский рисовый мотылек не чувствительны к РНКи при кормлении. [3]

Недавние данные свидетельствуют о том, что устойчивость к РНКи может иметь широкий спектр, что означает, что устойчивость к одной последовательности может придавать устойчивость к другим последовательностям дцРНК. В одной лабораторной популяции западного кукурузного корневого червя устойчивость возникла из-за недостаточного поглощения дцРНК DvSnf7 через кишечник. [176] Когда другие последовательности дцРНК были протестированы против DvSnf7, другие последовательности перестали быть эффективными, что предполагает, что управление устойчивостью будет более трудным, чем простое отключение последовательностей дцРНК. Сочетание нескольких стратегий, таких как конструирование белка Cry, полученного из бактерии Bacillus thuringiensis (Bt), и РНКи в одном растении задерживает возникновение устойчивости. [3] [177]

Трансгенные растения [ править ]

Трансгенные культуры были созданы для экспрессии дцРНК, тщательно подобранной, чтобы заставить замолчать важные гены у вредителей-мишеней. Эти дцРНК предназначены для воздействия только на насекомых, экспрессирующих определенные генные последовательности. В качестве доказательства принципа , в 2009 году исследование показало, что РНК могут убить любой из четырех видов плодовых мух, не нанося вреда другим трем. [3]

В 2012 году Syngenta купила бельгийскую компанию RNAi Devgen за 522 миллиона долларов, а Monsanto заплатила 29,2 миллиона долларов за эксклюзивные права на интеллектуальную собственность от Alnylam Pharmaceuticals . Международный центр картофеля в Лиме, Перу ищет гены к цели в батате долгоносике, жук , чьи личинки опустошать бататы во всем мире. Другие исследователи пытаются заставить замолчать гены муравьев, гусениц и пыльцевых жуков. Monsanto, вероятно, будет первой на рынке с трансгенными семенами кукурузы, которые экспрессируют дцРНК на основе гена Snf7 западного корневого червя кукурузы , жука , личинки котороготолько в Соединенных Штатах ежегодно наносят ущерб в один миллиард долларов. В статье 2012 года было показано, что подавление Snf7 останавливает рост личинок, убивая их в считанные дни. В 2013 году та же команда показала, что РНК влияет на очень немногие другие виды. [3]

Актуальные [ править ]

Альтернативно дцРНК может поставляться без генной инженерии. Один из подходов - добавить их в поливную воду. Молекулы всасываются в сосудистую систему растений и отравляют питающихся ими насекомых. Другой подход включает распыление дцРНК, как обычного пестицида. Это позволит быстрее адаптироваться к сопротивлению. Такие подходы потребуют недорогих источников дцРНК, которых в настоящее время не существует. [3]

Скрининг в масштабе генома [ править ]

Исследования РНКи в масштабе генома основаны на технологии высокопроизводительного скрининга (HTS). Технология RNAi HTS позволяет проводить скрининг потери функции по всему геному и широко используется для идентификации генов, связанных с конкретными фенотипами. Эта технология была провозглашена потенциальной второй волной геномики после первой волны геномики микрочипов экспрессии генов и платформ для обнаружения однонуклеотидного полиморфизма . [178]Одним из основных преимуществ скрининга РНКи на уровне генома является его способность одновременно опрашивать тысячи генов. Благодаря способности генерировать большой объем данных за эксперимент, скрининг РНКи в масштабе генома привел к взрывному росту скорости генерации данных. Использование таких больших наборов данных является фундаментальной проблемой, требующей подходящих методов статистики / биоинформатики. Основной процесс скрининга РНКи на основе клеток включает выбор библиотеки РНКи, надежных и стабильных типов клеток, трансфекцию агентами РНКи, обработку / инкубацию, обнаружение сигналов, анализ и идентификацию важных генов или терапевтических мишеней. [179]

История [ править ]

Примеры растений петунии, в которых гены пигментации подавляются РНКи. Левое растение - дикого типа ; правильные растения содержат трансгены, которые вызывают подавление экспрессии как трансгена, так и эндогенного гена, что приводит к появлению непигментированных белых участков цветка. [180]

Процесс РНКи упоминался как «совместное подавление» и «подавление», когда наблюдался до знания механизма, связанного с РНК. Открытию РНКи сначала предшествовали наблюдения за ингибированием транскрипции антисмысловой РНК, экспрессируемой в трансгенных растениях, [181] и, более конкретно, сообщениями о неожиданных результатах в экспериментах, проведенных учеными-растениями в США и Нидерландах в начале 1990-х. [182] В попытке изменить окраску цветков петуний , исследователи ввели дополнительные копии гена, кодирующего халкон-синтазу , ключевой фермент для цветков.пигментация в растения петунии обычно розового или фиолетового цвета. Ожидалось, что сверхэкспрессия гена приведет к появлению более темных цветов, но вместо этого у некоторых цветов будет менее заметный пурпурный пигмент, иногда в виде пестрого рисунка, что указывает на то, что активность халконсинтазы была существенно снижена или стала подавляться в зависимости от контекста. Позже это будет объяснено как результат вставки трансгена рядом с промоторами в противоположном направлении в различных положениях по всему геному некоторых трансформантов, что приводит к экспрессии антисмысловых транскриптов и подавлению гена, когда эти промоторы активны. Другое раннее наблюдение RNAi пришли из исследования гриба Neurospora сгазза , [183]хотя это не было сразу признано родственным. Дальнейшее исследование феномена у растений показало, что подавление происходило из-за посттранскрипционного ингибирования экспрессии генов за счет увеличения скорости деградации мРНК. [184] Это явление было названо совместным подавлением экспрессии генов , но молекулярный механизм остался неизвестным. [185]

Вскоре после этого вирусологи растений, работающие над повышением устойчивости растений к вирусным заболеваниям, обнаружили похожее неожиданное явление. Хотя было известно, что растения, экспрессирующие вирусспецифические белки, проявляют повышенную толерантность или устойчивость к вирусной инфекции, не ожидалось, что растения, несущие только короткие, некодирующие области последовательностей вирусной РНК, будут демонстрировать аналогичные уровни защиты. Исследователи полагали, что вирусная РНК, продуцируемая трансгенами, также может подавлять репликацию вируса. [186] Обратный эксперимент, в котором короткие последовательности генов растений были введены в вирусы, показал, что целевой ген подавлялся в инфицированном растении. [187]Это явление было названо «индуцированное вирусом сайленсинг генов» (VIGS), а совокупность таких явлений получила общее название посттранскрипционного сайленсинга генов. [188]

После этих первоначальных наблюдений на растениях лаборатории начали искать это явление у других организмов. [189] [190] В статье Крейга С. Мелло и Эндрю Файра в Nature 1998 года сообщается о мощном эффекте подавления генов после инъекции двухцепочечной РНК в C. elegans . [191] При исследовании регуляции выработки мышечного белка они обнаружили, что ни мРНК, ни инъекции антисмысловой РНК не влияли на продукцию белка, но двухцепочечная РНК успешно подавляла выработку целевого гена. В результате этой работы они придумали термин RNAi. Это открытие представляет собой первую идентификацию возбудителя этого явления. Файер и Мелло были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине 2006 года . [5]

См. Также [ править ]

  • ДНК-направленная интерференция РНК

Ссылки [ править ]

  1. ↑ a b c Саураб С., Видьярти А.С., Прасад Д. (март 2014 г.). «РНК-интерференция: концепция к реальности в улучшении урожая» . Planta . 239 (3): 543–64. DOI : 10.1007 / s00425-013-2019-5 . PMID  24402564 .
  2. Перейти ↑ Weiss B, Davidkova G, Zhou LW (март 1999). «Генная терапия антисмысловой РНК для изучения и модуляции биологических процессов». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 55 (3): 334–58. DOI : 10.1007 / s000180050296 . PMID 10228554 . S2CID 9448271 .  
  3. ^ Б с д е е г Kupferschmidt, K. (2013). «Смертельная доза РНК». Наука . 341 (6147): 732–3. Bibcode : 2013Sci ... 341..732K . DOI : 10.1126 / science.341.6147.732 . PMID 23950525 . 
  4. ^ Macrae IJ, Чжоу K, Li F, Repic A, Брукс А.Н., Cande WZ, Adams PD, Doudna JA (январь 2006). «Структурная основа процессинга двухцепочечной РНК с помощью Dicer» . Наука . 311 (5758): 195–8. Bibcode : 2006Sci ... 311..195M . DOI : 10.1126 / science.1121638 . PMID 16410517 . S2CID 23785494 .  
  5. ^ a b c d Данехолт Б. "Дополнительная информация: РНК-интерференция" . Нобелевская премия по физиологии и медицине 2006 года . Архивировано из оригинального 20 -го января 2007 года . Проверено 25 января 2007 года .
  6. ^ Bagasra O, Prilliman KR (август 2004). «РНК-интерференция: молекулярная иммунная система». Журнал молекулярной гистологии . 35 (6): 545–53. CiteSeerX 10.1.1.456.1701 . DOI : 10.1007 / s10735-004-2192-8 . PMID 15614608 . S2CID 2966105 .   
  7. ^ Bernstein E, Caudy А.А., Hammond С.М., Ханнон GJ (январь 2001). «Роль бидентатной рибонуклеазы на этапе инициации РНК-интерференции». Природа . 409 (6818): 363–6. Bibcode : 2001Natur.409..363B . DOI : 10.1038 / 35053110 . PMID 11201747 . S2CID 4371481 .  
  8. ^ Siomi H, Siomi MC (январь 2009). «На пути к чтению кода РНК-интерференции». Природа . 457 (7228): 396–404. Bibcode : 2009Natur.457..396S . DOI : 10,1038 / природа07754 . PMID 19158785 . S2CID 205215974 .  
    Заморе П.Д., Тушл Т., Шарп П.А., Бартель Д.П. (март 2000 г.). «РНКи: двухцепочечная РНК управляет АТФ-зависимым расщеплением мРНК с интервалами от 21 до 23 нуклеотидов» . Cell . 101 (1): 25–33. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80620-0 . PMID  10778853 .
    Вермёлен А., Белен Л., Рейнольдс А., Вольфсон А., Маршалл В.С., Карпилов Дж., Хворова А. (май 2005 г.). «Вклад структуры дцРНК в специфичность и эффективность Dicer» . РНК . 11 (5): 674–82. DOI : 10,1261 / rna.7272305 . PMC  1370754 . PMID  15811921 .
    Кастанотто Д., Росси Дж. Дж. (Январь 2009 г.). «Обещания и подводные камни терапии, основанной на РНК-интерференции» . Природа . 457 (7228): 426–33. Bibcode : 2009Natur.457..426C . DOI : 10,1038 / природа07758 . PMC  2702667 . PMID  19158789 .
  9. ^ Б Ей S, Адем СМ, Лейн Т (2005). «Вычислительное исследование нецелевых эффектов РНК-интерференции» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (6): 1834–47. DOI : 10.1093 / NAR / gki324 . PMC 1072799 . PMID 15800213 .  
  10. ^ a b Наканиши К. (сентябрь 2016 г.). «Анатомия RISC: как малые РНК и шапероны активируют белки Argonaute?» . Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК . 7 (5): 637–60. DOI : 10.1002 / wrna.1356 . PMC 5084781 . PMID 27184117 .  
  11. ^ Лян C, Ван Y, Murota Y, Лю X, Smith D, Siomi MC, Лю Q (сентябрь 2015). «TAF11 собирает комплекс загрузки RISC для повышения эффективности РНКи» . Молекулярная клетка . 59 (5): 807–18. DOI : 10.1016 / j.molcel.2015.07.006 . PMC 4560963 . PMID 26257286 .  
  12. ^ Ahlquist P (2002). «РНК-зависимые РНК-полимеразы, вирусы и сайленсинг РНК» . Наука . 296 (5571): 1270–3. Bibcode : 2002Sci ... 296.1270A . DOI : 10.1126 / science.1069132 . PMID 12016304 . S2CID 42526536 .  
  13. Перейти ↑ Roberts, TC (2015). «Механизм микроРНК». МикроРНК: фундаментальная наука . Успехи экспериментальной медицины и биологии . 887 . С. 15–30. DOI : 10.1007 / 978-3-319-22380-3_2 . ISBN 978-3-319-22379-7. PMID  26662984 .
  14. ^ a b c d Паркер G, Eckert D, Bass B (2006). «RDE-4 предпочтительно связывает длинную дцРНК, и ее димеризация необходима для расщепления дцРНК до миРНК» . РНК . 12 (5): 807–18. DOI : 10,1261 / rna.2338706 . PMC 1440910 . PMID 16603715 .  
  15. ^ a b Баулкомб округ Колумбия (январь 2007 г.). «Молекулярная биология. Усиленное молчание». Наука . 315 (5809): 199–200. DOI : 10.1126 / science.1138030 . PMID 17218517 . S2CID 46285020 .  
  16. ↑ a b Pak J, Fire A (январь 2007 г.). «Различные популяции первичных и вторичных эффекторов во время РНКи у C. elegans» . Наука . 315 (5809): 241–4. Bibcode : 2007Sci ... 315..241P . DOI : 10.1126 / science.1132839 . PMID 17124291 . S2CID 46620298 .  
  17. ^ a b Sijen T, Steiner FA, Thijssen KL, Plasterk RH (январь 2007 г.). «Вторичные миРНК возникают в результате синтеза непраймированной РНК и образуют отдельный класс». Наука . 315 (5809): 244–7. Bibcode : 2007Sci ... 315..244S . DOI : 10.1126 / science.1136699 . PMID 17158288 . S2CID 9483460 .  
  18. ^ Ван QL, Ли ZH (май 2007). «Функции микроРНК в растениях» . Границы биологических наук . 12 : 3975–82. DOI : 10,2741 / 2364 . PMC 2851543 . PMID 17485351 . S2CID 23014413 .   
    Чжао Ю., Шривастава Д. (апрель 2007 г.). «Взгляд на развитие функции микроРНК». Направления биохимических наук . 32 (4): 189–97. DOI : 10.1016 / j.tibs.2007.02.006 . PMID  17350266 .
  19. ^ Gregory Р.И., Chendrimada TP, Shiekhattar R (2006). «Биогенез микроРНК: выделение и характеристика микропроцессорного комплекса». Протоколы микроРНК . Методы молекулярной биологии. 342 . С. 33–47. DOI : 10.1385 / 1-59745-123-1: 33 . ISBN 978-1-59745-123-9. PMID  16957365 .
  20. ^ Пфеффер С., Заволан М., Грэссер Ф.А., Чиен М., Руссо Дж. Дж., Джу Дж., Джон Б., Энрайт А. Дж., Маркс Д., Сандер С., Тушл Т. (апрель 2004 г.). «Идентификация микроРНК, кодируемых вирусами» . Наука . 304 (5671): 734–6. Bibcode : 2004Sci ... 304..734P . DOI : 10.1126 / science.1096781 . PMID 15118162 . S2CID 25287167 .  
  21. Перейти ↑ Qureshi A, Thakur N, Monga I, Thakur A, Kumar M (1 января 2014 г.). «VIRmiRNA: исчерпывающий ресурс для экспериментально подтвержденных вирусных miRNA и их мишеней» . База данных . 2014 : bau103. DOI : 10,1093 / базы данных / bau103 . PMC 4224276 . PMID 25380780 .  
  22. ^ ПИЛЛАИ RS, Бхаттачариа С.Н., Филипович W (2007). «Подавление синтеза белка миРНК: сколько механизмов?». Trends Cell Biol . 17 (3): 118–26. DOI : 10.1016 / j.tcb.2006.12.007 . PMID 17197185 . 
  23. ^ Окамура К, Ишизука А, Siomi Н, Siomi М (2004). «Различная роль белков Argonaute в малых РНК-направленных путях расщепления РНК» . Genes Dev . 18 (14): 1655–66. DOI : 10,1101 / gad.1210204 . PMC 478188 . PMID 15231716 .  
  24. Перейти ↑ Lee Y, Nakahara K, Pham J, Kim K, He Z, Sontheimer E, Carthew R (2004). «Различная роль Drosophila Dicer-1 и Dicer-2 в путях сайленсинга siRNA / miRNA» . Cell . 117 (1): 69–81. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (04) 00261-2 . PMID 15066283 . 
  25. ^ miRBase.org
  26. ^ a b Friedman RC, Farh KK, Burge CB, Bartel DP (2009). «Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями для микроРНК» . Genome Res . 19 (1): 92–105. DOI : 10.1101 / gr.082701.108 . PMC 2612969 . PMID 18955434 .  
  27. ↑ Lim LP, Lau NC, Garrett-Engele P, Grimson A, Schelter JM, Castle J, Bartel DP, Linsley PS, Johnson JM (февраль 2005 г.). «Анализ микроматрицы показывает, что некоторые микроРНК подавляют большое количество целевых мРНК». Природа . 433 (7027): 769–73. Bibcode : 2005Natur.433..769L . DOI : 10,1038 / природа03315 . PMID 15685193 . S2CID 4430576 .  
  28. ^ Сельбы М, Schwanhäusser В, Тирфельдер N, Fang Z, R Ханин, Rajewsky N (сентябрь 2008 г.). «Широко распространенные изменения в синтезе белка, вызванные микроРНК». Природа . 455 (7209): 58–63. Bibcode : 2008Natur.455 ... 58S . DOI : 10,1038 / природа07228 . PMID 18668040 . S2CID 4429008 .  
  29. ^ Пэк D, Villen J, Shin C, Камарго FD, Gygi SP, Бартель DP (сентябрь 2008). «Влияние микроРНК на выход белка» . Природа . 455 (7209): 64–71. Bibcode : 2008Natur.455 ... 64В . DOI : 10,1038 / природа07242 . PMC 2745094 . PMID 18668037 .  
  30. ^ Palmero Е.И., де - Кампос С.Г., Campos М, де Соуза NC, Гиррейру ID, Carvalho А.Л., Marques М.М. (июль 2011 г.). «Механизмы и роль нарушения регуляции микроРНК в возникновении и прогрессировании рака» . Генетика и молекулярная биология . 34 (3): 363–70. DOI : 10.1590 / S1415-47572011000300001 . PMC 3168173 . PMID 21931505 .  
  31. Перейти ↑ Bernstein C, Bernstein H (май 2015 г.). «Эпигенетическое снижение репарации ДНК при прогрессировании рака желудочно-кишечного тракта» . Всемирный журнал онкологии желудочно-кишечного тракта . 7 (5): 30–46. DOI : 10,4251 / wjgo.v7.i5.30 . PMC 4434036 . PMID 25987950 .  
  32. ^ Maffioletti Е, Тардито Д, Gennarelli М, Bocchio-Chiavetto L (2014). «Микрошпионы от мозга к периферии: новые ключи к разгадке исследований микроРНК при нервно-психических расстройствах» . Границы клеточной неврологии . 8 : 75. DOI : 10,3389 / fncel.2014.00075 . PMC 3949217 . PMID 24653674 .  
  33. ^ Mellios N, M Sur (2012). «Растущая роль микроРНК в шизофрении и расстройствах аутистического спектра» . Границы в психиатрии . 3 : 39. DOI : 10,3389 / fpsyt.2012.00039 . PMC 3336189 . PMID 22539927 .  
  34. ^ Geaghan M, Cairns MJ (август 2015). «МикроРНК и посттранскрипционная дисрегуляция в психиатрии» . Биологическая психиатрия . 78 (4): 231–9. DOI : 10.1016 / j.biopsych.2014.12.009 . PMID 25636176 . 
  35. ↑ Лю Кью, Рэнд Т.А., Калидас С., Ду Ф, Ким ХЭ, Смит Д.П., Ван X (сентябрь 2003 г.). «R2D2, мост между инициирующей и эффекторной стадиями пути РНКи дрозофилы». Наука . 301 (5641): 1921–5. Bibcode : 2003Sci ... 301.1921L . DOI : 10.1126 / science.1088710 . PMID 14512631 . S2CID 41436233 .  
  36. ^ Грегори Р.И., Chendrimada Т.П., Кучи N, Shiekhattar R (ноябрь 2005 г.). «Человеческий RISC сочетает биогенез микроРНК и посттранскрипционное молчание генов» . Cell . 123 (4): 631–40. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.10.022 . PMID 16271387 . 
  37. ^ a b Лодиш Х, Берк А, Мацудаира П., Кайзер Калифорния, Кригер М., Скотт М.П., ​​Зипуркси С.Л., Дарнелл Дж. (2004). Молекулярная клеточная биология (5-е изд.). WH Freeman: Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. ISBN 978-0-7167-4366-8.
  38. ^ Матранг С, Томарями Y, Шины С, Бартел ДП, Zamore ПД (ноябрь 2005 г.). «Расщепление пассивной цепи облегчает сборку siRNA в Ago2-содержащие ферментные комплексы RNAi» . Cell . 123 (4): 607–20. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.08.044 . PMID 16271386 . 
  39. ^ Leuschner PJ, Амеры SL, Kueng S, J Martinez (март 2006). «Расщепление пассажирской цепи миРНК во время сборки RISC в человеческих клетках» . EMBO Reports . 7 (3): 314–20. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400637 . PMC 1456892 . PMID 16439995 .  
  40. ^ a b Хейли Б., Заморе PD (июль 2004 г.). «Кинетический анализ ферментного комплекса РНКи». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (7): 599–606. DOI : 10.1038 / nsmb780 . PMID 15170178 . S2CID 12400060 .  
  41. ^ Schwarz DS, Hutvágner G, Du T, Xu Z, Аронин N, Zamore PD (октябрь 2003). «Асимметрия в сборке ферментного комплекса РНКи» . Cell . 115 (2): 199–208. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00759-1 . PMID 14567917 . 
  42. ^ Preall JB, он Z, Gorra JM, Sontheimer EJ (март 2006). «Отбор короткой интерферирующей цепи РНК не зависит от полярности процессинга дцРНК во время РНКи у дрозофилы» . Текущая биология . 16 (5): 530–5. DOI : 10.1016 / j.cub.2006.01.061 . PMID 16527750 . 
  43. ^ Томари Y, Матранга С, Хейли В, Мартинес N, Zamore PD (ноябрь 2004 г.). «Белковый сенсор асимметрии миРНК». Наука . 306 (5700): 1377–80. Bibcode : 2004Sci ... 306.1377T . DOI : 10.1126 / science.1102755 . PMID 15550672 . S2CID 31558409 .  
  44. ^ Ма JB, Юань YR, Meister G, Pei Y, Tuschl T, Patel DJ (март 2005). «Структурная основа для 5'-конца специфического распознавания направляющей РНК белком A. fulgidus Piwi» . Природа . 434 (7033): 666–70. Bibcode : 2005Natur.434..666M . DOI : 10,1038 / природа03514 . PMC 4694588 . PMID 15800629 .  
  45. ^ Сен G, Wehrman Т, Н Блау (2005). «Трансляция мРНК не является предпосылкой для опосредованного малыми интерферирующими РНК расщепления мРНК». Дифференциация . 73 (6): 287–93. DOI : 10.1111 / j.1432-0436.2005.00029.x . PMID 16138829 . S2CID 41117614 .  
  46. Перейти ↑ Gu S, Rossi J (2005). «Отключение РНКи от активной трансляции в клетках млекопитающих» . РНК . 11 (1): 38–44. DOI : 10,1261 / rna.7158605 . PMC 1370689 . PMID 15574516 .  
  47. Перейти ↑ Sen G, Blau H (2005). «Argonaute 2 / RISC находится в сайтах распада мРНК млекопитающих, известных как цитоплазматические тельца». Nat Cell Biol . 7 (6): 633–6. DOI : 10.1038 / ncb1265 . PMID 15908945 . S2CID 6085169 .  
  48. ^ Lian S, Jakymiw A, Eystathioy T, Hamel J, Fritzler M, Chan E (2006). «Тельца GW, микроРНК и клеточный цикл» . Клеточный цикл . 5 (3): 242–5. DOI : 10.4161 / cc.5.3.2410 . PMID 16418578 . 
  49. ^ Jakymiw А, Lian S, Eystathioy Т, Ли С, Сато М, Хамель Дж, Fritzler М, Чан Е (2005). «Нарушение Р-телец нарушает интерференцию РНК млекопитающих». Nat Cell Biol . 7 (12): 1267–74. DOI : 10.1038 / ncb1334 . PMID 16284622 . S2CID 36630239 .  
  50. Перейти ↑ Hammond S, Bernstein E, Beach D, Hannon G (2000). «РНК-направленная нуклеаза опосредует посттранскрипционное молчание генов в клетках дрозофилы». Природа . 404 (6775): 293–6. Bibcode : 2000Natur.404..293H . DOI : 10.1038 / 35005107 . PMID 10749213 . S2CID 9091863 .  
  51. ^ Holmquist GP, Эшли T (2006). «Хромосомная организация и модификация хроматина: влияние на функцию и эволюцию генома». Цитогенетические и геномные исследования . 114 (2): 96–125. DOI : 10.1159 / 000093326 . PMID 16825762 . S2CID 29910065 .  
  52. ^ Verdel А, Цзя S, S Гербера, Сугияма Т, Gygi S, Греуол С.И., Moazed D (январь 2004 г.). «РНКи-опосредованное нацеливание на гетерохроматин комплексом RITS» . Наука . 303 (5658): 672–6. Bibcode : 2004Sci ... 303..672V . DOI : 10.1126 / science.1093686 . PMC 3244756 . PMID 14704433 .  
  53. ^ Irvine DV, Zaratiegui M, Толя NH, Goto DB, Chitwood DH, Vaughn МВт, Joshua-Тор L, Martienssen RA (август 2006). «Нарезка Argonaute требуется для гетерохроматического подавления и распространения» . Наука . 313 (5790): 1134–7. Bibcode : 2006Sci ... 313.1134I . DOI : 10.1126 / science.1128813 . PMID 16931764 . S2CID 42997104 .  
  54. ^ Volpe Т.А., Kidner C, зал IM, Тэн G, Греуол С.И., Martienssen Р.А. (сентябрь 2002). «Регулирование гетерохроматического сайленсинга и метилирования гистона H3 лизина-9 с помощью РНКи» . Наука . 297 (5588): 1833–7. Bibcode : 2002Sci ... 297.1833V . DOI : 10.1126 / science.1074973 . PMID 12193640 . S2CID 2613813 .  
  55. ^ Volpe T, Schramke V, Гамильтон Л., Белый SA, Тэн G, Martienssen RA, Allshire RC (2003). «РНК-интерференция необходима для нормальной функции центромеры у делящихся дрожжей». Хромосомные исследования . 11 (2): 137–46. DOI : 10,1023 / A: 1022815931524 . PMID 12733640 . S2CID 23813417 .  
  56. ^ Li LC, Okino ST, Zhao H, Pookot D, Place RF, Urakami S, Enokida H, Dahiya R (ноябрь 2006 г.). «Малые дцРНК вызывают активацию транскрипции в клетках человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (46): 17337–42. Bibcode : 2006PNAS..10317337L . DOI : 10.1073 / pnas.0607015103 . PMC 1859931 . PMID 17085592 .  
  57. ^ Noma K, Sugiyama T, Cam H, Verdel A, Zofall M, Jia S, Moazed D, Grewal SI (ноябрь 2004 г.). «RITS действует в цис-системе, способствуя опосредованному РНК-интерференцией транскрипционному и посттранскрипционному подавлению» . Генетика природы . 36 (11): 1174–80. DOI : 10.1038 / ng1452 . PMID 15475954 . 
  58. ^ Сугияма Т, Кулачковые Н, Verdel А, Д Moazed, Греуол С.И. (январь 2005). «РНК-зависимая РНК-полимераза является важным компонентом самоусиливающейся петли, связывающей сборку гетерохроматина с продукцией миРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (1): 152–7. Bibcode : 2005PNAS..102..152S . DOI : 10.1073 / pnas.0407641102 . PMC 544066 . PMID 15615848 .  
  59. Перейти ↑ Wang F, Koyama N, Nishida H, Haraguchi T, Reith W, Tsukamoto T (июнь 2006 г.). «Сборка и поддержание гетерохроматина, инициированное повторами трансгена, не зависит от пути интерференции РНК в клетках млекопитающих» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (11): 4028–40. DOI : 10.1128 / MCB.02189-05 . PMC 1489094 . PMID 16705157 .  
  60. Перейти ↑ Bass BL (2002). «Редактирование РНК аденозиндезаминазами, действующими на РНК» . Ежегодный обзор биохимии . 71 : 817–46. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135501 . PMC 1823043 . PMID 12045112 .  
  61. ↑ Bass BL (апрель 2000 г.). «Двухцепочечная РНК как матрица для сайленсинга генов» . Cell . 101 (3): 235–8. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 71133-1 . PMID 10847677 . 
  62. ↑ Лучано DJ, Мирский H, Vendetti NJ, Maas S (август 2004 г.). «Редактирование РНК предшественника миРНК» . РНК . 10 (8): 1174–7. DOI : 10,1261 / rna.7350304 . PMC 1370607 . PMID 15272117 .  
  63. ^ a b Ян В., Чендримада Т.П., Ван Кью, Хигучи М., Зеебург П.Х., Шихаттар Р., Нисикура К. (январь 2006 г.). «Модуляция процессинга и экспрессии микроРНК посредством редактирования РНК дезаминазами ADAR» . Структурная и молекулярная биология природы . 13 (1): 13–21. DOI : 10.1038 / nsmb1041 . PMC 2950615 . PMID 16369484 .  
  64. Перейти ↑ Yang W, Wang Q, Howell KL, Lee JT, Cho DS, Murray JM, Nishikura K (февраль 2005 г.). «ADAR1 РНК дезаминаза ограничивает эффективность короткой интерферирующей РНК в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 280 (5): 3946–53. DOI : 10.1074 / jbc.M407876200 . PMC 2947832 . PMID 15556947 .  
  65. ^ Nishikura K (декабрь 2006). «Редактор встречает глушитель: перекрестные помехи между редактированием РНК и вмешательством РНК» . Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 7 (12): 919–31. DOI : 10.1038 / nrm2061 . PMC 2953463 . PMID 17139332 .  
  66. ^ a b c Saumet A, Lecellier CH (2006). «Антивирусное подавление РНК: мы похожи на растения?» . Ретровирология . 3 (1): 3. DOI : 10,1186 / 1742-4690-3-3 . PMC 1363733 . PMID 16409629 .  
  67. ^ Джонс L, Ratcliff F, Baulcombe DC (май 2001). «РНК-направленное подавление транскрипционного гена в растениях может быть унаследовано независимо от триггера РНК и требует Met1 для поддержания». Текущая биология . 11 (10): 747–57. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00226-3 . PMID 11378384 . S2CID 16789197 .  
  68. ^ Хамфрис DT, Westman BJ, Мартин Д., Прейс T (ноябрь 2005). «МикроРНК контролируют инициацию трансляции, ингибируя эукариотический фактор инициации 4E / cap и функцию поли (A) хвоста» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (47): 16961–6. Bibcode : 2005PNAS..10216961H . DOI : 10.1073 / pnas.0506482102 . PMC 1287990 . PMID 16287976 .  
  69. ^ DaRocha WD, Оцу K, Тейшейра С.М., Донелсон JE (февраль 2004). «Тесты цитоплазматической РНК-интерференции (РНКи) и конструирование индуцируемой тетрациклином системы промотора Т7 в Trypanosoma cruzi». Молекулярная и биохимическая паразитология . 133 (2): 175–86. DOI : 10.1016 / j.molbiopara.2003.10.005 . PMID 14698430 . 
  70. ↑ Робинсон К.А., Беверли С.М. (май 2003 г.). «Повышение эффективности трансфекции и тестирование подходов к РНК-интерференции (РНКи) у простейших паразитов Leishmania». Молекулярная и биохимическая паразитология . 128 (2): 217–28. DOI : 10.1016 / S0166-6851 (03) 00079-3 . PMID 12742588 . 
  71. ^ Аравиндом L, Watanabe H, Липман DJ, Кунин EV (октябрь 2000). «Клон-специфическая потеря и дивергенция функционально связанных генов у эукариот» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (21): 11319–24. Bibcode : 2000PNAS ... 9711319A . DOI : 10.1073 / pnas.200346997 . PMC 17198 . PMID 11016957 .  
  72. ^ Drinnenberg И.А., Weinberg DE, Се KT, косилка JP Вулф KH, Финк GR, Бартель DP (октябрь 2009). «РНКи в почкующихся дрожжах» . Наука . 326 (5952): 544–550. Bibcode : 2009Sci ... 326..544D . DOI : 10.1126 / science.1176945 . PMC 3786161 . PMID 19745116 .  
  73. ^ Nakayashiki H, Kadotani N, Mayama S (июль 2006). «Эволюция и диверсификация белков, подавляющих РНК в грибах» (PDF) . Журнал молекулярной эволюции . 63 (1): 127–35. Bibcode : 2006JMolE..63..127N . DOI : 10.1007 / s00239-005-0257-2 . PMID 16786437 . S2CID 22639035 .   
  74. ^ Морита T, Мочизуки Y, Айба H (март 2006). «Репрессия трансляции достаточна для подавления гена малыми бактериальными некодирующими РНК в отсутствие разрушения мРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (13): 4858–63. Bibcode : 2006PNAS..103.4858M . DOI : 10.1073 / pnas.0509638103 . PMC 1458760 . PMID 16549791 .  
  75. ↑ Макарова К.С., Гришин Н.В., Шабалина С.А., Вольф Ю.И., Кунин Е.В. (март 2006 г.). «Предполагаемая иммунная система на основе РНК-интерференции у прокариот: компьютерный анализ предсказанного ферментативного механизма, функциональные аналогии с эукариотической РНКи и гипотетические механизмы действия» . Биология Директ . 1 : 7. DOI : 10.1186 / 1745-6150-1-7 . PMC 1462988 . PMID 16545108 .  
  76. ^ Stram Y, Kuzntzova L (июнь 2006). «Ингибирование вирусов с помощью РНК-интерференции» . Гены вирусов . 32 (3): 299–306. DOI : 10.1007 / s11262-005-6914-0 . PMC 7088519 . PMID 16732482 .  
  77. ^ Блевинс Т, Р Rajeswaran, Shivaprasad П.В., Beknazariants D, Si-Ammour А, Парк HS, Васкес F, D Робертсон, Meins Р, Т Хон, Pooggin М.М. (2006). «Четыре дайсера растений опосредуют биогенез вирусной малой РНК и подавление индуцированного ДНК вируса» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (21): 6233–46. DOI : 10.1093 / NAR / gkl886 . PMC 1669714 . PMID 17090584 .  
  78. ^ Palauqui JC, Elmayan Т, Pollien Ю.М., Vaucheret Н (август 1997 г.). «Системное приобретенное молчание: посттранскрипционное молчание, специфичное для трансгена, передается путем прививки от молчаливого стада к немолчавшему потомству» . Журнал EMBO . 16 (15): 4738–45. DOI : 10.1093 / emboj / 16.15.4738 . PMC 1170100 . PMID 9303318 .  
  79. ^ Voinnet O (август 2001). «РНК сайленсинг как иммунная система растений против вирусов». Тенденции в генетике . 17 (8): 449–59. DOI : 10.1016 / S0168-9525 (01) 02367-8 . PMID 11485817 . 
  80. ↑ Люси А.П., Го Х.С., Ли WX, Дин SW (апрель 2000 г.) «Подавление посттранскрипционного сайленсинга генов растительным вирусным белком, локализованным в ядре» . Журнал EMBO . 19 (7): 1672–80. DOI : 10.1093 / emboj / 19.7.1672 . PMC 310235 . PMID 10747034 .  
  81. ^ Mérai Z, Kerényi Z, Kertész S, Magna M, Lakatos L, Silhavy D (июнь 2006 г.). «Связывание двухцепочечной РНК может быть общей вирусной стратегией растительной РНК для подавления молчания РНК» . Журнал вирусологии . 80 (12): 5747–56. DOI : 10,1128 / JVI.01963-05 . PMC 1472586 . PMID 16731914 .  
  82. ^ Катияр-Агаруол S, Морган R, Dahlbeck D, Borsani О, Вильегаса А, Чжу Ю.К., Staskawicz BJ, Джин Н (ноябрь 2006 года). «Патоген-индуцируемая эндогенная миРНК в иммунитете растений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (47): 18002–7. Bibcode : 2006PNAS..10318002K . DOI : 10.1073 / pnas.0608258103 . PMC 1693862 . PMID 17071740 .  
  83. ↑ Fritz JH, Girardin SE, Philpott DJ (июнь 2006 г.). «Врожденная иммунная защита через вмешательство РНК». STKE науки . 2006 (339): pe27. DOI : 10.1126 / stke.3392006pe27 . PMID 16772641 . S2CID 33972766 .  
  84. ^ Zambon Р.А., Vakharia В.Н., Wu LP (май 2006). «РНКи представляет собой противовирусный иммунный ответ против вируса дцРНК у Drosophila melanogaster» . Клеточная микробиология . 8 (5): 880–9. DOI : 10.1111 / j.1462-5822.2006.00688.x . PMID 16611236 . S2CID 32439482 .  
  85. ^ Ван XH, Aliyari R, Li WX, Li HW, Kim K, Карть R, P Аткинсона, Дин SW (апрель 2006). «РНК-интерференция управляет врожденным иммунитетом против вирусов у взрослых дрозофил» . Наука . 312 (5772): 452–4. Bibcode : 2006Sci ... 312..452W . DOI : 10.1126 / science.1125694 . PMC 1509097 . PMID 16556799 .  
  86. ^ Лу Р, Мадуро М, Ли Ф, Ли Х.В., Бройтман-Мадуро Г, Ли У. X, Дин ЮЗ (август 2005). «Репликация вируса животных и РНКи-опосредованное противовирусное подавление у Caenorhabditis elegans» . Природа . 436 (7053): 1040–1043. Bibcode : 2005Natur.436.1040L . DOI : 10,1038 / природа03870 . PMC 1388260 . PMID 16107851 .  
  87. ^ Wilkins C, Dishongh R, Moore SC, Уитт MA, Chow M, Machaca K (август 2005). «РНК-интерференция - это механизм противовирусной защиты у Caenorhabditis elegans». Природа . 436 (7053): 1044–7. Bibcode : 2005Natur.436.1044W . DOI : 10,1038 / природа03957 . PMID 16107852 . S2CID 4431035 .  
  88. ^ Berkhout B, Haasnoot J (май 2006). «Взаимодействие между вирусной инфекцией и механизмом интерференции клеточной РНК» . Письма FEBS . 580 (12): 2896–902. DOI : 10.1016 / j.febslet.2006.02.070 . PMC 7094296 . PMID 16563388 .  
  89. ^ Шютц S, Сарнов P (январь 2006). «Взаимодействие вирусов с путём интерференции РНК млекопитающих» . Вирусология . 344 (1): 151–7. DOI : 10.1016 / j.virol.2005.09.034 . PMID 16364746 . 
  90. ↑ Cullen BR (июнь 2006 г.). «Участвует ли РНК-интерференция во внутреннем противовирусном иммунитете у млекопитающих?». Иммунология природы . 7 (6): 563–7. DOI : 10.1038 / ni1352 . PMID 16715068 . S2CID 23467688 .  
  91. ^ Майярд PV, Ciaudo C, Марше A, Li Y, Jay F, Дин SW, Voinnet O (октябрь 2013 г. ). «Противовирусная интерференция РНК в клетках млекопитающих» . Наука . 342 (6155): 235–8. Bibcode : 2013Sci ... 342..235M . DOI : 10.1126 / science.1241930 . PMC 3853215 . PMID 24115438 .  
  92. ↑ Li Y, Lu J, Han Y, Fan X, Ding SW (октябрь 2013 г.). «РНК-интерференция действует как механизм противовирусного иммунитета у млекопитающих» . Наука . 342 (6155): 231–4. Bibcode : 2013Sci ... 342..231L . DOI : 10.1126 / science.1241911 . PMC 3875315 . PMID 24115437 .  
  93. ↑ Li HW, Ding SW (октябрь 2005 г.). «Антивирусное подавление у животных» . Письма FEBS . 579 (26): 5965–73. DOI : 10.1016 / j.febslet.2005.08.034 . PMC 1350842 . PMID 16154568 .  
  94. ^ Каррингтон JC, Ambros V (июль 2003). «Роль микроРНК в развитии растений и животных» . Наука . 301 (5631): 336–8. Bibcode : 2003Sci ... 301..336C . DOI : 10.1126 / science.1085242 . PMID 12869753 . S2CID 43395657 .  
  95. ^ Ли RC, RL Feinbaum, Ambros V (декабрь 1993). «Гетерохронный ген lin-4 C. elegans кодирует малые РНК с антисмысловой комплементарностью lin-14» . Cell . 75 (5): 843–54. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (93) 90529-Y . PMID 8252621 . 
  96. ^ Палатник JF, Allen E, Wu X, Schommer C, Schwab R, Каррингтон JC, Вайгель D (сентябрь 2003). «Контроль морфогенеза листа с помощью микроРНК» . Природа . 425 (6955): 257–63. Bibcode : 2003Natur.425..257P . DOI : 10,1038 / природа01958 . PMID 12931144 . S2CID 992057 .  
  97. Перейти ↑ Zhang B, Pan X, Cobb GP, Anderson TA (январь 2006 г.). «Растительная микроРНК: небольшая регуляторная молекула с большим влиянием» . Биология развития . 289 (1): 3–16. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2005.10.036 . PMID 16325172 . 
  98. ^ Джонс-Роудс МВт, Бартель DP, Бартель B (2006). «MicroRNAS и их регуляторные роли в растениях» . Ежегодный обзор биологии растений . 57 : 19–53. DOI : 10.1146 / annurev.arplant.57.032905.105218 . PMID 16669754 . S2CID 13010154 .  
  99. Перейти ↑ Zhang B, Pan X, Cobb GP, Anderson TA (февраль 2007 г.). «МикроРНК как онкогены и супрессоры опухолей» . Биология развития . 302 (1): 1–12. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2006.08.028 . PMID 16989803 . 
  100. ^ Cerutti H, Касас-Mollano JA (август 2006). «О происхождении и функциях РНК-опосредованного сайленсинга: от протистов к человеку» . Текущая генетика . 50 (2): 81–99. DOI : 10.1007 / s00294-006-0078-х . PMC 2583075 . PMID 16691418 .  
  101. ^ Anantharaman V, Кунин Е.В., Аравиндом L (апрель 2002). «Сравнительная геномика и эволюция белков, участвующих в метаболизме РНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (7): 1427–64. DOI : 10.1093 / NAR / 30.7.1427 . PMC 101826 . PMID 11917006 .  
  102. ^ Voorhoeve PM, Agami R (январь 2003). «Нокдаун встает». Тенденции в биотехнологии . 21 (1): 2–4. DOI : 10.1016 / S0167-7799 (02) 00002-1 . PMID 12480342 . 
  103. ^ Мункачи G, Z Sztupinszki, Герман Р, Ban В, Pénzváltó Z, Сарваш N, Győrffy Б (сентябрь 2016). «Подтверждение эффективности подавления РНКи с использованием данных массива генов показывает 18,5% отказов в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия. Нуклеиновые кислоты . 5 (9): e366. DOI : 10.1038 / mtna.2016.66 . PMC 5056990 . PMID 27673562 .  
  104. ^ Найто Y, Ямада Т, Т Matsumiya, Ui-Тэй К, Сайго К, Моришита S (июль 2005 г.). «dsCheck: высокочувствительное программное обеспечение для поиска вне мишени для двухцепочечной РНК-опосредованной РНК-интерференции» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (выпуск веб-сервера): W589–91. DOI : 10.1093 / NAR / gki419 . PMC 1160180 . PMID 15980542 .  
  105. Перейти ↑ Henschel A, Buchholz F, Habermann B (июль 2004 г.). «DEQOR: веб-инструмент для разработки и контроля качества миРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (выпуск веб-сервера): W113–20. DOI : 10.1093 / NAR / gkh408 . PMC 441546 . PMID 15215362 .  
  106. Перейти ↑ Naito Y, Yamada T, Ui-Tei K, Morishita S, Saigo K (июль 2004 г.). «siDirect: высокоэффективное программное обеспечение для создания целевой siRNA для интерференции РНК млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (выпуск веб-сервера): W124–9. DOI : 10.1093 / NAR / gkh442 . PMC 441580 . PMID 15215364 .  
  107. Перейти ↑ Naito Y, Ui-Tei K, Nishikawa T, Takebe Y, Saigo K (июль 2006 г.). «siVirus: веб-программа для разработки антивирусных siRNA для сильно расходящихся вирусных последовательностей» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (выпуск веб-сервера): W448–50. DOI : 10.1093 / NAR / gkl214 . PMC 1538817 . PMID 16845046 .  
  108. ^ Рейнольдс А, Андерсон Е.М., Vermeulen А, Федоров Y, Robinson K, Лик D, J Karpilow, Маршалл WS, Хворова A (июнь 2006). «Индукция интерферонового ответа миРНК зависит от типа клетки и длины дуплекса» . РНК . 12 (6): 988–93. DOI : 10,1261 / rna.2340906 . PMC 1464853 . PMID 16611941 .  
  109. Перейти ↑ Stein P, Zeng F, Pan H, Schultz RM (октябрь 2005 г.). «Отсутствие неспецифических эффектов РНК-интерференции, вызванной длинной двухцепочечной РНК в ооцитах мышей» . Биология развития . 286 (2): 464–71. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2005.08.015 . PMID 16154556 . 
  110. ^ Brummelkamp TR, Бернардс R , R Агами (апрель 2002). «Система для стабильной экспрессии коротких интерферирующих РНК в клетках млекопитающих». Наука . 296 (5567): 550–3. Bibcode : 2002Sci ... 296..550B . DOI : 10.1126 / science.1068999 . hdl : 1874/15573 . PMID 11910072 . S2CID 18460980 .  
  111. ^ Тискорниа G, Tergaonkar V, Galimi F, Верма IM (май 2004). «Интерференция РНК, индуцируемая CRE-рекомбиназой, опосредованная лентивирусными векторами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (19): 7347–51. Bibcode : 2004PNAS..101.7347T . DOI : 10.1073 / pnas.0402107101 . PMC 409921 . PMID 15123829 .  
  112. ↑ Ventura A, Meissner A, Dillon CP, McManus M, Sharp PA, Van Parijs L, Jaenisch R, Jacks T (июль 2004 г.). «Cre-lox-регулируемая условная интерференция РНК трансгенов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (28): 10380–5. Bibcode : 2004PNAS..10110380V . DOI : 10.1073 / pnas.0403954101 . PMC 478580 . PMID 15240889 .  
  113. ^ Huesken D, Lange J, Mickanin C, Weiler J, Asselbergs F, Warner J, Meloon B, Engel S, Rosenberg A, Cohen D, Labow M, Reinhardt M, Natt F, Hall J (август 2005). «Дизайн библиотеки миРНК для всего генома с использованием искусственной нейронной сети». Природа Биотехнологии . 23 (8): 995–1001. DOI : 10.1038 / nbt1118 . PMID 16025102 . S2CID 11030533 .  
  114. ↑ Ge G, Wong GW, Luo B (октябрь 2005 г.). «Прогнозирование эффективности нокдауна siRNA с использованием моделей искусственной нейронной сети». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 336 (2): 723–8. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.08.147 . PMID 16153609 . 
  115. ^ Janitz M, Ванхекк D, Lehrach H (2006). «Высокопроизводительное вмешательство РНК в функциональной геномике». РНК к медицине . Справочник по экспериментальной фармакологии. 173 . С. 97–104. DOI : 10.1007 / 3-540-27262-3_5 . ISBN 978-3-540-27261-8. PMID  16594612 .
  116. ^ Ванхекк D, Janitz M (февраль 2005). «Функциональная геномика с использованием высокопроизводительной РНК-интерференции» . Открытие наркотиков сегодня . 10 (3): 205–12. DOI : 10.1016 / S1359-6446 (04) 03352-5 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0010-86E7-8 . PMID 15708535 . 
  117. ^ Гельдхоф P, Мюррей L, Couthier A, Gilleard JS, McLauchlan G, Нокс DP, Бриттон C (июнь 2006). «Проверка эффективности РНК-интерференции в Haemonchus contortus». Международный журнал паразитологии . 36 (7): 801–10. DOI : 10.1016 / j.ijpara.2005.12.004 . PMID 16469321 . 
  118. ^ Гельдхоф Р, Висер А, Д Кларк, Сондерс G, Бриттон С, Gilleard Дж, Berriman М, Нокс D (май 2007 г.). «РНК-интерференция у паразитических гельминтов: текущая ситуация, возможные подводные камни и перспективы на будущее». Паразитология . 134 (Pt 5): 609–19. DOI : 10.1017 / S0031182006002071 . PMID 17201997 . 
  119. ^ a b Sen GL, Blau HM (июль 2006 г.). «Краткая история RNAi: молчание генов». Журнал FASEB . 20 (9): 1293–9. DOI : 10,1096 / fj.06-6014rev . PMID 16816104 . S2CID 12917676 .  
  120. ^ Daneholt В (2 октября 2006). «Нобелевская премия по физиологии и медицине 2006 г.» . nobelprize.org . Проверено 30 октября 2017 года .
  121. ^ Эльбашир С, Харборт Дж, Лендекель В и др. (2001). «Дуплексы 21-нуклеотидной РНК опосредуют РНК-интерференцию в культивируемых клетках млекопитающих». Природа . 411 (6836): 494–498. Bibcode : 2001Natur.411..494E . DOI : 10.1038 / 35078107 . PMID 11373684 . S2CID 710341 .  
  122. ↑ McCaffrey AP, Meuse L, Pham TT, Conklin DS, Hannon GJ , Kay MA (июль 2002 г.). «РНК-интерференция у взрослых мышей». Природа . 418 (6893): 38–9. Bibcode : 2002Natur.418 ... 38М . DOI : 10.1038 / 418038a . PMID 12097900 . S2CID 4361399 .  
  123. ↑ Devi GR (сентябрь 2006 г.). «Подходы на основе миРНК в терапии рака» . Генная терапия рака . 13 (9): 819–29. DOI : 10.1038 / sj.cgt.7700931 . PMID 16424918 . 
  124. ↑ Wall NR, Shi Y (октябрь 2003 г.). «Малая РНК: можно ли использовать РНК-интерференцию в терапии?». Ланцет . 362 (9393): 1401–3. DOI : 10.1016 / s0140-6736 (03) 14637-5 . PMID 14585643 . S2CID 25034627 .  
  125. ^ С D (2006). «Терапевтический потенциал РНК-интерференции при неврологических расстройствах». Life Sci . 79 (19): 1773–80. DOI : 10.1016 / j.lfs.2006.06.011 . PMID 16815477 . 
  126. ^ Дэвис ME, Цукерман JE, Чой CH, Селигсон D, Толчер A, Алаби CA, Йен Y, Heidel JD, Ribas A (апрель 2010). «Доказательства наличия РНКи у людей из системно вводимых миРНК через нацеленные наночастицы» . Природа . 464 (7291): 1067–70. Bibcode : 2010Natur.464.1067D . DOI : 10,1038 / природа08956 . PMC 2855406 . PMID 20305636 .  
  127. ^ Escobar М.А., Civerolo Е.Л., Саммерфелт KR, Dandekar AM (ноябрь 2001). «РНКи-опосредованное подавление онкогенов придает устойчивость к онкогенезу коронного галла» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (23): 13437–42. Bibcode : 2001PNAS ... 9813437E . DOI : 10.1073 / pnas.241276898 . PMC 60889 . PMID 11687652 .  
  128. ^ Pereira TC, Паскуаль В.Д., Marchesini РБ, Maia И.Г., Магальяйнса Л.А., Zanotti-Магальяйнса Е.М., Lopes-Cendes I (апрель 2008). «Schistosoma mansoni: оценка лечения на основе РНКи, направленного на ген HGPRTase». Экспериментальная паразитология . 118 (4): 619–23. DOI : 10.1016 / j.exppara.2007.11.017 . PMID 18237732 . 
  129. ^ Рауля С, Аббас-Terki Т, Bensadoun JC, Гиллот S, Хаас G, J Шульца, Хендерсон CE, Aebischer Р (апрель 2005 г.). «Опосредованное лентивирусами подавление SOD1 посредством РНК-интерференции замедляет начало и прогрессирование заболевания в мышиной модели БАС». Природная медицина . 11 (4): 423–8. DOI : 10.1038 / nm1207 . PMID 15768028 . S2CID 25445264 .  
  130. ^ Ptasznik A, Наката Y, Kalota A, Emerson SG, Gewirtz AM (ноябрь 2004). «Короткая интерферирующая РНК (миРНК), нацеленная на Lyn киназу, индуцирует апоптоз в первичных и устойчивых к лекарствам клетках лейкемии BCR-ABL1 (+)». Природная медицина . 10 (11): 1187–9. DOI : 10.1038 / nm1127 . PMID 15502840 . S2CID 21770360 .  
  131. ↑ Kim SJ, Lee WI, Lee YS, Kim DH, Chang JW, Kim SW, Lee H (ноябрь 2009 г.). «Эффективное облегчение нейропатической боли за счет опосредованной аденоассоциированной вирусом экспрессии небольшой шпильочной РНК против GTP циклогидролазы 1» . Молекулярная боль . 5 : 1744–8069–5–67. DOI : 10.1186 / 1744-8069-5-67 . PMC 2785765 . PMID 19922668 .  
  132. ^ Chen L, McKenna JT, Bolortuya Y, Winston S, Thakkar MM, Башир R, Brown RE, Мак - Карли RW (ноябрь 2010). «Нокдаун рецептора орексина типа 1 в голубом пятне крысы увеличивает быстрый сон в темное время суток» . Европейский журнал нейробиологии . 32 (9): 1528–36. DOI : 10.1111 / j.1460-9568.2010.07401.x . PMC 3058252 . PMID 21089218 .  
  133. ^ Vargason JM, Szittya G, J Burgyán, зал ТМ (декабрь 2003). «Выборочное распознавание siRNA супрессором молчания РНК» . Cell . 115 (7): 799–811. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (03) 00984-х . PMID 14697199 . 
  134. ^ Berkhout B (апрель 2004). «РНК-интерференция как противовирусный подход: нацеливание на ВИЧ-1». Текущее мнение в области молекулярной терапии . 6 (2): 141–5. PMID 15195925 . 
  135. ↑ Jiang M, Milner J (сентябрь 2002 г.). «Селективное подавление экспрессии вирусных генов в ВПЧ-положительных клетках карциномы шейки матки человека, обработанных миРНК, праймером РНК-интерференции» . Онкоген . 21 (39): 6041–8. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205878 . PMID 12203116 . 
  136. ^ Кусы У, Канд Т, Palmenberg А, Sgro JY, Гаусс-Мюллер В (июне 2006 г.). «Подавление инфекции вируса гепатита А с помощью малых интерферирующих РНК» . Журнал вирусологии . 80 (11): 5599–610. DOI : 10.1128 / jvi.01773-05 . PMC 1472172 . PMID 16699041 .  
  137. ↑ Jia F, Zhang YZ, Liu CM (октябрь 2006 г.). «Система на основе ретровирусов, позволяющая стабильно заглушать гены вируса гепатита В посредством РНК-интерференции». Письма о биотехнологии . 28 (20): 1679–85. DOI : 10.1007 / s10529-006-9138-Z . PMID 16900331 . S2CID 34511611 .  
  138. ↑ Li YC, Kong LH, Cheng BZ, Li KS (декабрь 2005 г.). «Конструирование векторов экспрессии siRNA вируса гриппа и их ингибирующие эффекты на размножение вируса гриппа». Болезни птиц . 49 (4): 562–73. DOI : 10.1637 / 7365-041205R2.1 . PMID 16405000 . S2CID 86214047 .  
  139. Перейти ↑ Khanna M, Saxena L, Rajput R, Kumar B, Prasad R (2015). «Замалчивание генов: терапевтический подход к борьбе с вирусными инфекциями гриппа». Будущая микробиология . 10 (1): 131–40. DOI : 10.2217 / fmb.14.94 . PMID 25598342 . 
  140. ↑ Раджпут Р., Кханна М., Кумар П., Кумар Б., Шарма С., Гупта Н., Саксена Л. (декабрь 2012 г.). «Малая интерферирующая РНК, нацеленная на транскрипт неструктурного гена 1, ингибирует репликацию вируса гриппа А у экспериментальных мышей». Нуклеиновые кислоты . 22 (6): 414–22. DOI : 10.1089 / nat.2012.0359 . PMID 23062009 . 
  141. ^ а б в г Аша К., Кумар П., Саникас М., Месеко КА, Кханна М., Кумар Б. (декабрь 2018 г.). «Достижения в терапии на основе нуклеиновых кислот против респираторных вирусных инфекций» . Журнал клинической медицины . 8 (1): 6. DOI : 10,3390 / jcm8010006 . PMC 6351902 . PMID 30577479 .  
  142. ^ Ху Л., Ван З., Ху Ц., Лю X, Яо Л., Ли В, Ци Y (2005). «Ингибирование размножения вируса кори в культуре клеток путем РНК-интерференции». Acta Virologica . 49 (4): 227–34. PMID 16402679 . 
  143. Перейти ↑ Qureshi A, Thakur N, Monga I, Thakur A, Kumar M (2014). «VIRmiRNA: исчерпывающий ресурс для экспериментально подтвержденных вирусных miRNA и их мишеней» . База данных . 2014 . DOI : 10,1093 / базы данных / bau103 . PMC 4224276 . PMID 25380780 .  
  144. Перейти ↑ Crowe S (2003). «Подавление экспрессии хемокинового рецептора посредством РНК-интерференции позволяет ингибировать репликацию ВИЧ-1, Мартинес и др.». СПИД . 17 Дополнение 4: S103–5. PMID 15080188 . 
  145. ^ Fuchs U, Дамм-Велк C, Borkhardt A (август 2004). «Молчание генов, связанных с болезнью, с помощью малых интерферирующих РНК». Современная молекулярная медицина . 4 (5): 507–17. DOI : 10.2174 / 1566524043360492 . PMID 15267222 . 
  146. ^ Cioca DP, Aoki Y, Kiyosawa K (февраль 2003). «РНК-интерференция - это функциональный путь с терапевтическим потенциалом в клеточных линиях миелоидного лейкоза человека» . Генная терапия рака . 10 (2): 125–33. DOI : 10.1038 / sj.cgt.7700544 . PMID 12536201 . 
  147. ^ Лаптева N, Ян AG, Sanders DE, Strube RW, Чэнь SY (январь 2005). «Нокдаун CXCR4 малой интерферирующей РНК отменяет рост опухоли груди in vivo» . Генная терапия рака . 12 (1): 84–9. DOI : 10.1038 / sj.cgt.7700770 . PMID 15472715 . 
  148. ^ Singer О Марр Р., Rockenstein E Крюс L, Коуфал NG, Гейдж FH, Верма IM, Masliah E (октябрь 2005). «Нацеливание на BACE1 с помощью siRNA улучшает невропатологию болезни Альцгеймера в трансгенной модели». Природа Неврологии . 8 (10): 1343–9. DOI : 10.1038 / nn1531 . PMID 16136043 . S2CID 6978101 .  
  149. ^ Родригес-Леброн E, Гувьон CM, Moore SA, Davidson BL, Полсон HL (сентябрь 2009). «Аллель-специфическая РНКи смягчает фенотипическое прогрессирование в трансгенной модели болезни Альцгеймера» . Молекулярная терапия . 17 (9): 1563–73. DOI : 10.1038 / mt.2009.123 . PMC 2835271 . PMID 19532137 .  
  150. ^ Piedrahita D, Эрнандес I, Лопез-Тобон А, Федоров D, Obara B, Manjunath BS, Будр RL, Davidson B, F Лаферла, Галий-Гомес JC, Косик KS, Кардон-Гомес GP (октябрь 2010). «Выключение CDK5 уменьшает нейрофибриллярные клубки у трансгенных мышей с болезнью Альцгеймера» . Журнал неврологии . 30 (42): 13966–76. DOI : 10.1523 / jneurosci.3637-10.2010 . PMC 3003593 . PMID 20962218 .  
  151. ^ Raoul C, Баркер SD, Aebischer P (март 2006). «Вирусное моделирование и коррекция нейродегенеративных заболеваний с помощью РНК-интерференции» . Генная терапия . 13 (6): 487–95. DOI : 10.1038 / sj.gt.3302690 . PMID 16319945 . 
  152. ↑ Harper SQ, Staber PD, He X, Eliason SL, Martins IH, Mao Q, Yang L, Kotin RM, Paulson HL, Davidson BL (апрель 2005 г.). «РНК-интерференция улучшает моторные и нейропатологические аномалии на мышиной модели с болезнью Гентингтона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (16): 5820–5. Bibcode : 2005PNAS..102.5820H . DOI : 10.1073 / pnas.0501507102 . PMC 556303 . PMID 15811941 .  
  153. ^ Будро RL, Родригес-Леброн E, Davidson BL (апрель 2011). «РНКи-медицина для мозга: достижения и проблемы» . Молекулярная генетика человека . 20 (R1): R21–7. DOI : 10,1093 / HMG / ddr137 . PMC 3095054 . PMID 21459775 .  
  154. ^ Б с д Kanasty R, Доркин JR, Вегас А, Андерсон D (ноябрь 2013 г. ). «Материалы для доставки siRNA терапевтических средств». Материалы природы . 12 (11): 967–77. Bibcode : 2013NatMa..12..967K . DOI : 10.1038 / nmat3765 . PMID 24150415 . 
  155. ^ a b c Виттруп А., Либерман Дж. (сентябрь 2015 г.). «Заболевание с ног на голову: отчет о прогрессе в терапии миРНК» . Природа Обзоры Генетики . 16 (9): 543–52. DOI : 10.1038 / nrg3978 . PMC 4756474 . PMID 26281785 .  
  156. ^ Де-Соуза Е.А., Камара Х., Салгейро В.Г., Моро Р.П., Книттель Т.Л., Тонон Г. и др. (Май 2019 г.). «РНК-интерференция может привести к неожиданным фенотипам у Caenorhabditis elegans» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (8): 3957–3969. DOI : 10.1093 / NAR / gkz154 . PMC 6486631 . PMID 30838421 .  
  157. ^ Б с д е е г ч я Xu C, Wang J (1 февраля 2015). «Системы доставки для разработки лекарств siRNA в терапии рака» . Азиатский журнал фармацевтических наук . 10 (1): 1–12. DOI : 10.1016 / j.ajps.2014.08.011 .
  158. ^ Б с д е е г ч я J к л м Уайтхед К.А., Дальман JE, Langer RS, Андерсон Д. Г. (2011). «Молчание или стимуляция? SiRNA доставки и иммунной системы» . Ежегодный обзор химической и биомолекулярной инженерии . 2 : 77–96. DOI : 10,1146 / annurev-chembioeng-061010-114133 . PMID 22432611 . S2CID 28803811 .  
  159. ^ «FDA заключает, что арктические яблоки и врожденный картофель безопасны для употребления» . Проверено 29 сентября 2017 года .
  160. ^ Sunilkumar G, Кэмпбелл LM, Puckhaber L, Stipanovic RD, Rathore KS (ноябрь 2006). «Разработка семян хлопчатника для использования в питании человека путем тканеспецифического снижения токсичного госсипола» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (48): 18054–9. DOI : 10.1073 / pnas.0605389103 . PMC 1838705 . PMID 17110445 .  
  161. ^ Siritunga D, Сейр RT (июль 2003). «Создание трансгенной маниоки, не содержащей цианогена». Planta . 217 (3): 367–73. DOI : 10.1007 / s00425-003-1005-8 . PMID 14520563 . S2CID 13561249 .  
  162. ^ Le LQ, Лоренц Y, Scheurer S, Fötisch K, Enrique E, J Bartra, Biemelt S, Vieths S, Sonnewald U (март 2006). «Дизайн плодов томата с пониженной аллергенностью за счет dsRNAi-опосредованного ингибирования экспрессии ns-LTP (Lyc e 3)». Журнал биотехнологии растений . 4 (2): 231–42. DOI : 10.1111 / j.1467-7652.2005.00175.x . PMID 17177799 . 
  163. ^ Niggeweg R, Майкл AJ, Martin C (июнь 2004). «Инженерные установки с повышенным содержанием антиоксиданта хлорогеновой кислоты». Природа Биотехнологии . 22 (6): 746–54. DOI : 10.1038 / nbt966 . PMID 15107863 . S2CID 21588259 .  
  164. ^ Сандерс RA, Хайятт W (март 2005). «Структура трансгена томата и сайленсинг». Природа Биотехнологии . 23 (3): 287–9. DOI : 10.1038 / nbt0305-287b . PMID 15765076 . S2CID 21191589 .  
  165. Перейти ↑ Chiang CH, Wang JJ, Jan FJ, Yeh SD, Gonsalves D (ноябрь 2001 г.). «Сравнительные реакции рекомбинантных вирусов кольцевой пятнистости папайи с генами химерного белка оболочки (CP) и вирусов дикого типа на CP-трансгенных папайях» . Журнал общей вирусологии . 82 (Pt 11): 2827–36. DOI : 10.1099 / 0022-1317-82-11-2827 . PMID 11602796 . S2CID 25659570 .  
  166. ^ Gilbert М.К., Majumdar R, Rajasekaran K, Чен Зи, Вэй Q, Сиклер CM, Lebar MD, Cary JW, Frame BR, Ван K (июнь 2018). «Основанное на РНК-интерференции подавление гена альфа-амилазы (amy1) в Aspergillus flavus снижает рост грибов и продукцию афлатоксина в зернах кукурузы». Planta . 247 (6): 1465–1473. DOI : 10.1007 / s00425-018-2875-0 . PMID 29541880 . S2CID 3918937 .  
  167. ^ Katoch R, N Тхакур (март 2013). «РНК-интерференция: перспективный метод улучшения традиционных культур». Международный журнал пищевых наук и питания . 64 (2): 248–59. DOI : 10.3109 / 09637486.2012.713918 . PMID 22861122 . S2CID 45212581 .  
  168. ^ Katoch R, N Тхакур (март 2013). «Достижения в технологии интерференции РНК и ее влияние на улучшение питания, борьбу с болезнями и насекомыми у растений». Прикладная биохимия и биотехнология . 169 (5): 1579–605. DOI : 10.1007 / s12010-012-0046-5 . PMID 23322250 . S2CID 23733295 .  
  169. ^ Gavilano LB, Coleman NP, Бернли LE, Bowman ML, Kalengamaliro NE, Hayes A, Bush L, Siminszky B (ноябрь 2006). «Генная инженерия Nicotiana tabacum для снижения содержания норникотина». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 54 (24): 9071–8. DOI : 10.1021 / jf0610458 . PMID 17117792 . 
  170. ^ Allen RS, Millgate AG, Chitty JA, Thisleton J, Miller JA, Кулак AJ, Герлах WL, Ларкин PJ (декабрь 2004). «РНКи-опосредованная замена морфина ненаркотическим алкалоидом ретикулином в опийном маке». Природа Биотехнологии . 22 (12): 1559–66. DOI : 10.1038 / nbt1033 . PMID 15543134 . S2CID 8290821 .  
  171. ^ Заде AH, Фостер Д. (2004). «Трансгенная устойчивость к вирусу кольцевой пятнистости табака». Acta Virologica . 48 (3): 145–52. PMID 15595207 . 
  172. ^ Ивашута S, Чжан Y, Wiggins BE, Ramaseshadri P, Segers GC, Johnson S, Meyer SE, Kerstetter RA, McNulty BC, Bolognesi R, Heck GR (май 2015 г.). «Экологическая РНКи у травоядных насекомых» . РНК . 21 (5): 840–50. DOI : 10,1261 / rna.048116.114 . PMC 4408792 . PMID 25802407 .  
  173. ^ Miller SC, Miyata K, Brown SJ, Tomoyasu Y (2012). «Рассекающая системная интерференция РНК у красного мучного жука Tribolium castaneum: параметры, влияющие на эффективность РНКи» . PLOS ONE . 7 (10): e47431. Bibcode : 2012PLoSO ... 747431M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0047431 . PMC 3484993 . PMID 23133513 .  
  174. ^ Петрик Дж. С., Фридрих Г. Е., Карлтон С. М., Кессенич К. Р., Сильванович А., Чжан Ю., Кох М. С. (ноябрь 2016 г.). «Активная РНК корневого червя кукурузы DvSnf7: оценка пероральной токсикологии повторной дозы в поддержку безопасности человека и млекопитающих» . Нормативная токсикология и фармакология . 81 : 57–68. DOI : 10.1016 / j.yrtph.2016.07.009 . PMID 27436086 . 
  175. ^ Терениус О., Папаниколау А., Гарбутт Дж. С., Элефтерианос I, Хувенн Х, Кангинакудру С. и др. (Февраль 2011 г.). «РНК-интерференция в Lepidoptera: обзор успешных и неудачных исследований и значение для экспериментального дизайна» . Журнал физиологии насекомых . 57 (2): 231–45. DOI : 10.1016 / j.jinsphys.2010.11.006 . hdl : 1854 / LU-1101411 . PMID 21078327 . 
  176. ^ Khajuria С, Ivashuta S, Уиггинс Е, Flagel л, Moar Вт, Pleau М., и др. (14 мая 2018 г.). «Разработка и характеристика первой популяции dsRNA-устойчивых насекомых от западного кукурузного корневого червя, Diabrotica virgifera virgifera LeConte» . PLOS ONE . 13 (5): e0197059. Bibcode : 2018PLoSO..1397059K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0197059 . PMC 5951553 . PMID 29758046 .  
  177. ↑ Чжан, Сара (23 июня 2017 г.). «Новая технология генной инженерии Monsanto, одобренная Агентством по охране окружающей среды: впервые РНК-интерференция будет использована для уничтожения насекомых-вредителей» . Атлантика .
  178. Перейти ↑ Matson RS (2005). Применение технологий геномных и протеомных микрочипов в открытии лекарств . CRC Press. п. 6 . ISBN 978-0-8493-1469-8.
  179. ^ Чжан XHD (2011). Оптимальный высокопроизводительный скрининг: практический экспериментальный дизайн и анализ данных для исследования РНКи в масштабе генома . Издательство Кембриджского университета. стр. ix – xiii. ISBN 978-0-521-73444-8.
  180. ^ Матцке М.А., Матцке AJ (2004). «Посадка семян новой парадигмы» . PLOS Biol . 2 (5): e133. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020133 . PMC 406394 . PMID 15138502 .  
  181. ^ Экер JR, Davis RW (август 1986). «Ингибирование экспрессии генов в растительных клетках путем экспрессии антисмысловой РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (15): 5372–6. Bibcode : 1986PNAS ... 83.5372E . DOI : 10.1073 / pnas.83.15.5372 . PMC 386288 . PMID 16593734 .  
  182. Перейти ↑ Napoli C, Lemieux C, Jorgensen R (апрель 1990 г.). «Введение химерного гена халкон-синтазы в петунию приводит к обратимой совместной супрессии гомологичных генов в транс» . Растительная клетка . 2 (4): 279–289. DOI : 10.1105 / tpc.2.4.279 . PMC 159885 . PMID 12354959 .  
  183. ^ Romano N, Macino G (ноябрь 1992). «Подавление: временная инактивация экспрессии гена в Neurospora crassa путем трансформации гомологичными последовательностями». Молекулярная микробиология . 6 (22): 3343–53. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1992.tb02202.x . PMID 1484489 . S2CID 31234985 .  
  184. ^ Ван Блокланд R, Ван - дер - Geest N, Mol Ю.Н., Kooter JM (1994). «Опосредованное трансгеном подавление экспрессии халконсинтазы в Petunia hybrida является результатом увеличения оборота РНК». Завод Дж . 6 (6): 861–77. DOI : 10.1046 / j.1365-313X.1994.6060861.x .
  185. ^ Mol JN, ван - дер - Кроль AR (1991). Антисмысловые нуклеиновые кислоты и белки: основы и приложения . М. Деккер. С. 4, 136. ISBN 978-0-8247-8516-1.
  186. Перейти ↑ Covey S, Al-Kaff N, Lángara A, Turner D (1997). «Растения борются с инфекцией путем замалчивания генов». Природа . 385 (6619): 781–2. Bibcode : 1997Natur.385..781C . DOI : 10.1038 / 385781a0 . S2CID 43229760 . 
  187. ^ Кумагай МН, Donson Дж, делла-Cioppa и G, D Харви, Хэнли К, Гриль ЛК (февраль 1995). «Цитоплазматическое ингибирование биосинтеза каротиноидов с вирусной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (5): 1679–83. Bibcode : 1995PNAS ... 92.1679K . DOI : 10.1073 / pnas.92.5.1679 . PMC 42583 . PMID 7878039 .  
  188. Перейти ↑ Ratcliff F, Harrison BD, Baulcombe DC (июнь 1997). «Сходство между вирусной защитой и подавлением генов у растений». Наука . 276 (5318): 1558–60. DOI : 10.1126 / science.276.5318.1558 . PMID 18610513 . 
  189. ^ Го S, Kemphues KJ (май 1995). «par-1, ген, необходимый для установления полярности у эмбрионов C. elegans, кодирует предполагаемую киназу Ser / Thr, которая имеет асимметричное распределение» . Cell . 81 (4): 611–20. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90082-9 . PMID 7758115 . 
  190. ^ Pal-Bhadra M, Bhadra U, Birchler JA (август 1997). «Косупрессия у Drosophila: подавление гена алкогольдегидрогеназы белыми трансгенами Adh зависит от Polycomb» . Cell . 90 (3): 479–90. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80508-5 . PMID 9267028 . 
  191. ↑ Fire A, Xu S, Montgomery MK, Kostas SA, Driver SE, Mello CC (февраль 1998 г.). «Сильное и специфическое генетическое вмешательство двухцепочечной РНК в Caenorhabditis elegans». Природа . 391 (6669): 806–11. Bibcode : 1998Natur.391..806F . DOI : 10.1038 / 35888 . PMID 9486653 . S2CID 4355692 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор процесса RNAi , от The Naked Scientists Кембриджского университета
  • Анимация процесса RNAi из Природы
  • NOVA scienceNOW объясняет RNAi  - 15-минутное видео трансляции Nova, которое транслировалось по PBS , 26 июля 2005 г.
  • Silencing Genomes Эксперименты по вмешательству РНК (RNAi) и биоинформатика в C. elegans для образования. Из Центра изучения ДНК Долана лаборатории Колд-Спринг-Харбор.
  • Скрининг РНКи в C. elegans в 96-луночном жидком формате и их применение для систематической идентификации генетических взаимодействий (протокол)
  • 2. Американские "люди-червяки" получили Нобелевскую премию за работу в области РНК от NY Times
  • Веб-фокус « Молекулярная терапия» : «Разработка РНКи как терапевтической стратегии» , сборник бесплатных статей о РНКи как терапевтической стратегии.
  • GenomeRNAi : база данных фенотипов из экспериментов по скринингу РНК-интерференции у Drosophila melanogaster и Homo sapians
  • Инструменты RNAi Предварительно разработанные и настраиваемые инструменты RNA Interference