Цис -regulatory элементов ( CRES ) или Cis -regulatory модулей ( МРС ) являются областями некодирующей ДНК , которые регулируют на транскрипцию соседних генов . CRE являются жизненно важными компонентами генетических регуляторных сетей , которые, в свою очередь, контролируют морфогенез , развитие анатомии и другие аспекты эмбрионального развития , изучаемые в эволюционной биологии развития .
CRE находятся рядом с генами, которые они регулируют. CRE обычно регулируют транскрипцию генов путем связывания с факторами транскрипции . Один фактор транскрипции может связываться со многими CRE и, следовательно, контролировать экспрессию многих генов ( плейотропию ). Латинский префикс цис означает «на этой стороне», то есть на той же молекуле ДНК, что и ген (ы) для транскрипции.
CRM представляют собой участки ДНК , обычно длиной 100–1000 пар оснований ДНК [1], где ряд факторов транскрипции может связывать и регулировать экспрессию близлежащих генов и регулировать скорость их транскрипции. Они обозначены как цис, потому что они обычно расположены на той же цепи ДНК, что и гены, которые они контролируют, в отличие от транс , что относится к эффектам на гены, расположенные не на той же цепи или дальше, например, факторы транскрипции. [1] Один цис- регуляторный элемент может регулировать несколько генов, [2] и наоборот, один ген может иметь несколько цис- регуляторных модулей. [3] Цис- регуляторные модули выполняют свою функцию, интегрируя активные факторы транскрипции и связанные с ними кофакторы в определенное время и в определенном месте клетки, откуда эта информация считывается и выдается результат. [4]
CRE часто, но не всегда, располагаются перед сайтом транскрипции. CRE контрастируют с трансрегуляторными элементами (TRE) . Код TRE для факторов транскрипции. [ необходима цитата ]
Обзор
Генома организма содержит в любом месте от нескольких сот до нескольких тысяч различных генов, все кодирующего сингулярного продукт или более. По многим причинам, включая поддержание организации, сохранение энергии и создание фенотипической вариативности, важно, чтобы гены экспрессировались только тогда, когда они необходимы. Наиболее эффективный способ для организма регулировать экспрессию генов - на уровне транскрипции. CRE контролируют транскрипцию, действуя рядом с геном или внутри него. Наиболее хорошо охарактеризованными типами CRE являются энхансеры и промоторы . Оба эти элемента последовательности являются структурными областями ДНК, которые служат регуляторами транскрипции . [ необходима цитата ]
Цис- регуляторные модули являются одним из нескольких типов функциональных регуляторных элементов . Регуляторные элементы представляют собой сайты связывания факторов транскрипции, которые участвуют в регуляции генов. [1] Цис- регулятивные модули выполняют большой объем обработки информации о развитии. [1] Цис- регуляторные модули представляют собой неслучайные кластеры в их определенном целевом сайте, которые содержат сайты связывания факторов транскрипции. [1]
Первоначальное определение представляло цис-регуляторные модули как энхансеры цис-действующей ДНК, которые увеличивали скорость транскрипции со связанного промотора . [4] Однако это определение было изменено, чтобы определить цис- регуляторные модули как последовательность ДНК с сайтами связывания факторов транскрипции, которые сгруппированы в модульные структуры, включая - но не ограничиваясь ими - области контроля локуса, промоторы, энхансеры, сайленсеры, пограничный контроль. элементы и другие модуляторы. [4]
Модули цис- регулирования можно разделить на три класса; энхансеры , которые положительно регулируют экспрессию генов; [1] изоляторы , которые работают косвенно, взаимодействуя с другими близлежащими цис- регулирующими модулями; и [1] сайленсеры, которые выключают экспрессию генов. [1]
Дизайн цис- регуляторных модулей таков, что факторы транскрипции и эпигенетические модификации служат в качестве входных данных, а выходом модуля является команда, отдаваемая аппарату транскрипции, который, в свою очередь, определяет скорость транскрипции гена или то, включен ли он или выкл . [1] Существует два типа входных факторов транскрипции: те, которые определяют, когда должен быть экспрессирован целевой ген, и те, которые служат функциональными драйверами , которые вступают в игру только в определенных ситуациях во время развития. [1] Эти входные данные могут поступать из разных временных точек, могут представлять разные сигнальные лиганды или могут исходить из разных доменов или клонов клеток. Однако многое еще остается неизвестным. [ необходима цитата ]
Кроме того, регуляция структуры хроматина и ядерной организации также играет роль в определении и контроле функции цис-регуляторных модулей. [4] Таким образом, функции регуляции генов (GRF) обеспечивают уникальную характеристику цис-регуляторного модуля (CRM), связывая концентрации факторов транскрипции (вход) с активностью промотора (выход). Задача состоит в том, чтобы предсказать GRF. Эта проблема до сих пор остается нерешенной. В общем случае , функции гена-регулирование не используют булеву логику , [2] , хотя в некоторых случаях приближение булевой логики все еще очень полезно. [ необходима цитата ]
Предположение булевой логики
В рамках предположения булевой логики принципы, регулирующие работу этих модулей, включают в себя дизайн модуля, который определяет регулирующую функцию. Что касается разработки, эти модули могут генерировать как положительные, так и отрицательные результаты. Выходные данные каждого модуля являются результатом различных операций, выполняемых над ним. Общие операции включают в себя вентиль ИЛИ - эта конструкция указывает, что в выходном сигнале будет задан любой вход [3], и вентиль И - в этой схеме необходимы два различных регулирующих фактора, чтобы гарантировать, что результат будет положительным. [1] «Тумблеры» - эта конструкция возникает, когда сигнальный лиганд отсутствует, а фактор транскрипции присутствует; этот фактор транскрипции в конечном итоге действует как доминирующий репрессор. Однако, как только сигнальный лиганд присутствует, роль фактора транскрипции как репрессора устраняется, и может происходить транскрипция. [1]
Могут происходить и другие логические операции, такие как специфичные для последовательности репрессоры транскрипции, которые, когда они связываются с модулем цис- регуляции, приводят к нулю на выходе. Кроме того, помимо влияния различных логических операций, на выход модуля регулирования «цис» также будут влиять предшествующие события. [1] 4) Цис- регуляторные модули должны взаимодействовать с другими регуляторными элементами. По большей части, даже при наличии функционального перекрытия между цис- регуляторными модулями гена, входы и выходы модулей имеют тенденцию не совпадать. [1]
Хотя предположение о булевой логике важно для системной биологии , подробные исследования показывают, что в целом логика регуляции генов не является булевой. [2] Это означает, например, что в случае цис- регуляторного модуля, регулируемого двумя факторами транскрипции, экспериментально определенные функции генной регуляции не могут быть описаны с помощью 16 возможных булевых функций двух переменных. Для исправления этой проблемы были предложены небулевы расширения логики регуляции генов. [2]
Классификация
Цис- регуляторные модули можно охарактеризовать обработкой информации, которую они кодируют, и организацией их сайтов связывания факторов транскрипции. Кроме того, цис- регуляторные модули также характеризуются тем, как они влияют на вероятность, пропорцию и скорость транскрипции. [4] Высоко кооперативные и скоординированные цис- регуляторные модули классифицируются как энхансомы . [4] Архитектура и расположение сайтов связывания факторов транскрипции имеют решающее значение, потому что нарушение их расположения может свести на нет функцию. [4] Функциональные гибкие модули цис- регулирования называются рекламными щитами. Их транскрипционный выход является суммирующим эффектом связанных факторов транскрипции. [4] Энхансеры влияют на вероятность активации гена, но практически не влияют на скорость. [4] Модель двоичного ответа действует как переключатель включения / выключения транскрипции. Эта модель увеличивает или уменьшает количество клеток, транскрибирующих ген, но не влияет на скорость транскрипции. [4] Модель реостатического ответа описывает цис-регуляторные модули как регуляторы скорости инициации транскрипции связанного с ним гена. [4]
Промоутер
Промоторы представляют собой CRE, состоящие из относительно коротких последовательностей ДНК, которые включают сайт, в котором инициируется транскрипция, и область, расположенную примерно на 35 п.н. выше или ниже сайта инициации (п.о.). [5] У эукариот промоторы обычно имеют следующие четыре компонента: блок TATA , сайт узнавания TFIIB , инициатор и нижележащий основной промоторный элемент . [5] Было обнаружено, что один ген может содержать несколько промоторных сайтов. [6] Чтобы инициировать транскрипцию нижележащего гена, хозяин ДНК-связывающих белков, называемых факторами транскрипции (TF), должен последовательно связываться с этой областью. [5] Только после того, как эта область была связана с соответствующим набором TF и в надлежащем порядке, РНК-полимераза может связываться и начать транскрибировать ген.
Усилители
Энхансеры - это CRE, которые влияют (усиливают) транскрипцию генов на одной и той же молекуле ДНК и могут быть обнаружены выше, ниже по течению, внутри интронов или даже относительно далеко от гена, который они регулируют. Несколько энхансеров могут действовать согласованно, регулируя транскрипцию одного гена. [7] Ряд проектов по секвенированию генома показал, что энхансеры часто транскрибируются в длинную некодирующую РНК (днРНК) или энхансерную РНК (эРНК), изменения в уровнях которых часто коррелируют с изменениями уровня мРНК целевого гена. [8]
Глушители
Глушители - это CRE, которые могут связывать факторы (белки) регуляции транскрипции, называемые репрессорами , тем самым предотвращая транскрипцию гена. Термин «сайленсер» может также относиться к области в 3'-нетранслируемой области информационной РНК, которая связывает белки, подавляющие трансляцию этой молекулы мРНК, но это использование отличается от его использования при описании CRE. [ необходима цитата ]
Операторы
Операторы - это CRE у прокариот и некоторых эукариот, которые существуют внутри оперонов , где они могут связывать белки, называемые репрессорами, чтобы влиять на транскрипцию. [ необходима цитата ]
Эволюционная роль
CRE играют важную эволюционную роль. Кодирующие области генов часто хорошо законсервированы среди организмов; тем не менее, разные организмы демонстрируют заметное фенотипическое разнообразие. Было обнаружено, что полиморфизмы, встречающиеся в некодирующих последовательностях, оказывают сильное влияние на фенотип, изменяя экспрессию генов . [7] Мутации, возникающие внутри CRE, могут генерировать дисперсию экспрессии, изменяя способ связывания TF. Более плотное или слабое связывание регуляторных белков приведет к усилению или понижению регуляции транскрипции.
Цис- регуляторный модуль в сети регуляции генов
Функция сети регуляции генов зависит от архитектуры узлов , функция которых зависит от множества модулей цис- регуляции. [1] Компоновка цис- регуляторных модулей может предоставить достаточно информации для генерации пространственных и временных паттернов экспрессии генов. [1] Во время развития каждый домен, где каждый домен представляет разные пространственные области эмбриона, экспрессии генов будет находиться под контролем разных цис- регуляторных модулей. [1] Дизайн регуляторных модулей помогает в создании петель обратной связи , прямой связи и перекрестного регулирования. [9]
Способ действия
Цис- регуляторные модули могут регулировать свои гены-мишени на больших расстояниях. Было предложено несколько моделей для описания способа, которым эти модули могут связываться с промотором своего целевого гена. [4] К ним относятся модель сканирования ДНК, модель петли последовательности ДНК и упрощенная модель отслеживания. В модели сканирования ДНК комплекс фактора транскрипции и кофактора формируется в цис- регуляторном модуле, а затем продолжает двигаться по последовательности ДНК, пока не найдет промотор гена-мишени. [4] В модели образования петель фактор транскрипции связывается с цис- регуляторным модулем, который затем вызывает образование петли последовательности ДНК и обеспечивает взаимодействие с промотором целевого гена. Комплекс фактора транскрипции с цис- регуляторным модулем вызывает медленное образование петли последовательности ДНК по направлению к промотору-мишени и формирует стабильную петлевую конфигурацию. [4] Модель упрощенного отслеживания объединяет части двух предыдущих моделей.
Идентификация и вычислительное предсказание
Помимо экспериментального определения CRM, существуют различные алгоритмы биоинформатики для их прогнозирования. Большинство алгоритмов пытаются найти значимые комбинации сайтов связывания факторов транскрипции ( сайтов связывания ДНК ) в промоторных последовательностях коэкспрессируемых генов. [10] Более продвинутые методы сочетают поиск значимых мотивов с корреляцией в наборах данных по экспрессии генов между факторами транскрипции и генами-мишенями. [11] Оба метода были реализованы, например, в ModuleMaster . К другим программам, созданным для выявления и прогнозирования модулей цис- регулирования, относятся:
INSECT 2.0 [12] - это веб-сервер, позволяющий осуществлять поиск Цис-регуляторных модулей по всему геному. Программа основывается на определении строгих ограничений среди сайтов связывания факторов транскрипции (TFBS), составляющих модуль, с целью уменьшения количества ложных срабатываний. INSECT разработан так, чтобы быть удобным для пользователя, поскольку он позволяет автоматически извлекать последовательности и несколько визуализаций и ссылок на сторонние инструменты, чтобы помочь пользователям найти те экземпляры, которые с большей вероятностью могут быть настоящими нормативными сайтами. Алгоритм INSECT 2.0 был ранее опубликован, а алгоритм и теория, лежащие в его основе, объяснены в [13].
Стубб использует скрытые марковские модели для выявления статистически значимых кластеров комбинаций факторов транскрипции. Он также использует второй связанный геном для повышения точности прогноза модели. [14]
Байесовские сети используют алгоритм, который объединяет предсказания сайтов и данные тканеспецифической экспрессии факторов транскрипции и целевых генов, представляющих интерес. Эта модель также использует деревья регрессии, чтобы отобразить взаимосвязь между идентифицированным цис- регуляторным модулем и возможным набором связывания факторов транскрипции. [15]
CRÈME исследует кластеры сайтов-мишеней на предмет интересующих факторов транскрипции. Эта программа использует базу данных подтвержденных сайтов связывания факторов транскрипции, которые были аннотированы по всему геному человека . Алгоритм поиска применяется к набору данных для выявления возможных комбинаций факторов транскрипции, сайты связывания которых расположены близко к промотору интересующего набора генов. Затем возможные цис-регуляторные модули анализируются статистически, а значимые комбинации представляются графически [16].
Активные цис- регуляторные модули в геномной последовательности трудно идентифицировать. Проблемы с идентификацией возникают из-за того, что часто ученые сталкиваются с небольшим набором известных факторов транскрипции, что затрудняет идентификацию статистически значимых кластеров сайтов связывания факторов транскрипции. [14] Кроме того, высокая стоимость ограничивает использование больших массивов листов целого генома . [15]
Примеры
Примером цис-действующей регуляторной последовательности является оператор в lac-опероне . Эта последовательность ДНК связана с lac-репрессором , который, в свою очередь, предотвращает транскрипцию соседних генов на одной и той же молекуле ДНК. Таким образом, считается, что lac-оператор «действует in cis» на регуляцию близлежащих генов. Сам оператор не кодирует какой-либо белок или РНК .
Напротив, трансрегуляторные элементы представляют собой диффундирующие факторы, обычно белки, которые могут изменять экспрессию генов, далеких от гена, который был первоначально транскрибирован для их создания. Например, фактор транскрипции, который регулирует ген на хромосоме 6, сам мог быть транскрибирован с гена на хромосоме 11 . Термин « трансрегуляторный» образован от латинского корня « транс» , что означает «напротив».
Различают цис-регуляторные и трансрегуляторные элементы. Цис-регуляторные элементы часто являются сайтами связывания для одного или нескольких транс-действующих факторов.
Подводя итог, можно сказать, что цис-регуляторные элементы присутствуют в той же молекуле ДНК, что и ген, который они регулируют, тогда как транс-регуляторные элементы могут регулировать гены, далекие от гена, из которого они были транскрибированы.
Примеры в РНК
Тип | Сокр. | Функция | Распределение | Ref. |
---|---|---|---|---|
Элемент Frameshift | Регулирует альтернативное использование фреймов с РНК-мессенджерами | Археи , бактерии , эукариоты , РНК-вирусы | [17] [18] [19] | |
Внутренний сайт входа рибосомы | IRES | Инициирует трансляцию в середине РНК-мессенджера | РНК-вирус , Eukaryota | [20] |
Железный ответный элемент | IRE | Регулирует экспрессию генов, связанных с железом | Эукариоты | [21] |
Лидер пептид | Регулирует транскрипцию ассоциированных генов и / или оперонов | Бактерии | [22] | |
Рибопереключатель | Генная регуляция | Бактерии , Эукариоты | [23] | |
Термометр РНК | Генная регуляция | Бактерии | [24] | |
Последовательность вставки селеноцистеина | SECIS | Направляет клетку на перевод стоп-кодонов UGA как селеноцистеина | Metazoa | [25] |
Смотрите также
- ДНК
- Коробка ТАТА
- Прибновый ящик
- Коробка SOS
- Коробка CAAT
- Коробка CCAAT
- Оператор (биология)
- Последовательность активации в восходящем направлении
- РНК
- Список цис-регуляторных элементов РНК
- Сигналы полиаденилирования , мРНК
- AU-богатый элемент , мРНК
- Другой
- Регулирование экспрессии генов
- Цис-транс-изомерия
- Сеть регулирования генов
- Оперон
- Промоутер
- Транс-действующий фактор
- Рфам
- Transterm
Рекомендации
- ^ Б с д е е г ч я J к л м п о р д Davidson EH (2006). Регуляторный геном: регуляторные сети генов в развитии и эволюции . Эльзевир. С. 1–86.
- ^ а б в г Тейф В.Б. (2010). «Прогнозирование функций регуляции генов: уроки умеренных бактериофагов» . Биофизический журнал . 98 (7): 1247–56. DOI : 10.1016 / j.bpj.2009.11.046 . PMC 2849075 . PMID 20371324 .
- ^ Бен-Табу де-Леон С., Дэвидсон Э. Х. (2007). «Генная регуляция: сеть контроля генов в разработке» (PDF) . Annu Rev Biophys Biomol Struct . 36 : 191–212. DOI : 10.1146 / annurev.biophys.35.040405.102002 . PMID 17291181 .
- ^ Б с д е е г ч я J к л м н Езёрска Д.М., Джордан К.В., Вэнс К.В. (2009). «Подход системной биологии к пониманию функции цис-регуляторного модуля». Семин. Cell Dev. Биол . 20 (7): 856–862. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2009.07.007 .
- ^ а б в Батлер Дж. Э., Кадонага Дж. Т. (октябрь 2002 г.). «Основной промотор РНК-полимеразы II: ключевой компонент в регуляции экспрессии генов» . Гены и развитие . 16 (20): 2583–2592. DOI : 10,1101 / gad.1026202 . PMID 12381658 .
- ^ Чой С. (17 мая 2008 г.). Введение в системную биологию . Springer Science & Business Media. п. 78. ISBN 978-1-59745-531-2.
- ^ а б Витткопп П.Дж., Калай Г. (декабрь 2011 г.). «Цис-регуляторные элементы: молекулярные механизмы и эволюционные процессы, лежащие в основе дивергенции». Природа Обзоры Генетики . 13 (1): 59–69. DOI : 10.1038 / nrg3095 . PMID 22143240 .
- ^ Меламед П., Йосефзун Ю. и др. (2 марта 2016 г.). «Усилители транскрипции: транскрипция, функция и гибкость» . Транскрипция . 7 (1): 26–31. DOI : 10.1080 / 21541264.2015.1128517 . PMC 4802784 . PMID 26934309 .
- ^ Ли Э., Дэвидсон Э.Х. (2009). «Построение регуляторных сетей развития генов» . Врожденные дефекты Res . 87 (2): 123–130. DOI : 10.1002 / bdrc.20152 . PMC 2747644 . PMID 19530131 .
- ^ Aerts, S .; и другие. (2003). «Вычислительное обнаружение цис-регуляторных модулей» . Биоинформатика . 19 Дополнение 2: ii5–14. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btg1052 . PMID 14534164 .
- ^ Wrzodek, Clemens; Шредер, Адриан; Dräger, Андреас; Ванке, Дирк; Berendzen, Kenneth W .; Кронфельд, Марсель; Хартер, Клаус; Зелл, Андреас (2010). «ModuleMaster: новый инструмент для расшифровки сетей регуляции транскрипции». Биосистемы . Ирландия: Эльзевир. 99 (1): 79–81. DOI : 10.1016 / j.biosystems.2009.09.005 . ISSN 0303-2647 . PMID 19819296 .
- ^ Парра Р., Рор CO, Койле Д., Перес-Кастро С., Янкилевич П. (2015). «INSECT 2.0: веб-сервер для полногеномного предсказания цис-регуляторных модулей» . Биоинформатика . 32 (8): 1229–31. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btv726 . PMID 26656931 .
- ^ Рор КО, Парра Р., Янкилевич П., Перес-Кастро С. (2013). «НАСЕКОМЫЕ: IN-silico ПОИСК на наличие сопутствующих факторов транскрипции» . Биоинформатика . 29 (22): 2852–8. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btt506 . PMID 24008418 .
- ^ а б Синха С., Лян И, Сиггиа Э (2006). «Stubb: программа для обнаружения и анализа цис-регуляторных модулей» . Nucleic Acids Res . 34 (выпуск веб-сервера): W555 – W559. DOI : 10.1093 / NAR / gkl224 . PMC 1538799 . PMID 16845069 .
- ^ а б Чен Х, Бланшетт М (2007). «Сравнение последовательностей без использования выравниваний: применение к подтипам ВИЧ / SIV» . BMC Bioinformatics . 8 : 1–17. DOI : 10.1186 / 1471-2105-8-1 . PMC 1766362 . PMID 17199892 .
- ^ Шаран Р., Бен-Гур А., Лутс Г. Г., Овчаренко И. (2004). «CREME: Cis-Regulatory Module Explorer для генома человека» . Nucleic Acids Res . 32 (выпуск веб-сервера): W253 – W256. DOI : 10.1093 / NAR / gkh385 . PMC 441523 . PMID 15215390 .
- ^ Bekaert M, Firth AE, Zhang Y, Gladyshev VN, Atkins JF, Baranov PV (январь 2010 г.). «Recode-2: новый дизайн, новые инструменты поиска и многое другое» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (выпуск базы данных): D69–74. DOI : 10.1093 / NAR / gkp788 . PMC 2808893 . PMID 19783826 .
- ^ Чанг Б., Ферт А. Э., Аткинс Дж. Ф. (март 2010 г.). «Фреймшифтинг в альфавирусах: разнообразие 3 'стимулирующих структур». Журнал молекулярной биологии . 397 (2): 448–456. DOI : 10.1016 / j.jmb.2010.01.044 . PMID 20114053 .
- ^ Гедрок Д.П., Корнуолл П.В. (февраль 2009 г.). «Псевдоузлы РНК с изменением кадра: структура и механизм» . Вирусные исследования . 139 (2): 193–208. DOI : 10.1016 / j.virusres.2008.06.008 . PMC 2670756 . PMID 18621088 .
- ^ Мокрейс М., Вопаленский В., Коленаты О., Масек Т., Фекетова З., Секырова П., Скалудова Б., Криз В., Посписек М. (январь 2006 г.). «IRESite: база данных экспериментально проверенных структур IRES (www.iresite.org)» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Выпуск базы данных): D125–130. DOI : 10.1093 / NAR / gkj081 . PMC 1347444 . PMID 16381829 .
- ^ Hentze MW, Kühn LC (август 1996 г.). «Молекулярный контроль метаболизма железа у позвоночных: регуляторные цепи на основе мРНК, управляемые железом, оксидом азота и окислительным стрессом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (16): 8175–8182. DOI : 10.1073 / pnas.93.16.8175 . PMC 38642 . PMID 8710843 .
- ^ Платт Т. (1986). «Прерывание транскрипции и регуляция экспрессии генов». Ежегодный обзор биохимии . 55 : 339–372. DOI : 10.1146 / annurev.bi.55.070186.002011 . PMID 3527045 .
- ^ Breaker RR (март 2008 г.). «Сложные рибопереключатели». Наука . 319 (5871): 1795–1797. DOI : 10.1126 / science.1152621 . PMID 18369140 .
- ^ Kortmann J, Narberhaus F (март 2012 г.). «Бактериальные РНК-термометры: молекулярные молнии и переключатели». Обзоры природы. Микробиология . 10 (4): 255–265. DOI : 10.1038 / nrmicro2730 . PMID 22421878 .
- ^ Валчак Р., Вестхоф Е., Карбон П., Крол А. (апрель 1996 г.). «Новый структурный мотив РНК в элементе вставки селеноцистеина мРНК эукариотических селенопротеинов» . РНК . 2 (4): 367–379. PMC 1369379 . PMID 8634917 .
дальнейшее чтение
- Wray GA (март 2007 г.). «Эволюционное значение цис-регуляторных мутаций». Природа Обзоры Генетики . 8 (3): 206–216. DOI : 10.1038 / nrg2063 . PMID 17304246 .
- Гомпель Н., Прюдом Б., Витткопп П.Дж., Касснер В.А., Кэрролл С.Б. (февраль 2005 г.). «Случай, пойманный на крыле: цис-регуляторная эволюция и происхождение пигментных паттернов у дрозофилы». Природа . 433 (7025): 481–487. DOI : 10,1038 / природа03235 . PMID 15690032 .
- Прюдом Б., Гомпель Н., Рокас А., Касснер В.А., Уильямс Т.М., Йе С.Д., Истин-Дж. Р., Кэрролл С.Б. (апрель 2006 г.). «Повторяющаяся морфологическая эволюция через цис-регуляторные изменения в плейотропном гене». Природа . 440 (7087): 1050–1053. DOI : 10,1038 / природа04597 . PMID 16625197 .
- Стерн Д.Л. (август 2000 г.). «Эволюционная биология развития и проблема вариации» . Эволюция; Международный журнал органической эволюции . 54 (4): 1079–1091. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2000.tb00544.x . PMID 11005278 .
- Уэтерби С.Д., Кэрролл С.Б., Гренье Дж. К. (2004). От ДНК к разнообразию: молекулярная генетика и эволюция дизайна животных . Кембридж, Массачусетс: издательство Blackwell Publishers. ISBN 978-1-4051-1950-4.
Внешние ссылки
- Информация о регуляции генов - вручную составленные списки ресурсов, обзоры, обсуждения в сообществе
- Клеточный дарвинизм
- Регулирование экспрессии генов в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)