Дигоксигенин

Дигоксигенин
Имена

Название ИЮПАК 3 - [(3 S , 5 R , 8 R , 9 S , 10 S , 12 R , 13 S , 14 S , 17 R ) -3,12,14-тригидрокси-10,13-диметил-1,2, 3,4,5,6,7,8,9,11,12,15,16,17-tetradecahydrocyclopenta [ ] фенантрен-17-ил] -2 Н фуран-5-он
Идентификаторы
Количество CAS	1672-46-4^Y
ЧЭБИ	ЧЕБИ: 42098^Y
ЧЭМБЛ	ChEMBL1153^Y
ChemSpider	14728^Y
ECHA InfoCard	100.015.279
PubChem CID	15478
UNII	NQ1SX9LNAU^Y
CompTox Dashboard ( EPA )	DTXSID6051778
ИнЧИ InChI = 1S / C23H34O5 / c1-21-7-5-15 (24) 10-14 (21) 3-4-17-18 (21) 11-19 (25) 22 (2) 16 (6-8- 23 (17,22) 27) 13-9-20 (26) 28-12-13 / ч9,14-19,24-25,27H, 3-8,10-12H2,1-2H3 / t14-, 15 +, 16-, 17-, 18 +, 19-, 21 +, 22 +, 23 + / m1 / s1^Y Ключ: SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N^Y InChI = 1 / C23H34O5 / c1-21-7-5-15 (24) 10-14 (21) 3-4-17-18 (21) 11-19 (25) 22 (2) 16 (6-8- 23 (17,22) 27) 13-9-20 (26) 28-12-13 / ч9,14-19,24-25,27H, 3-8,10-12H2,1-2H3 / t14-, 15 +, 16-, 17-, 18 +, 19-, 21 +, 22 +, 23 + / m1 / s1 Ключ: SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNEBN
Характеристики
Химическая формула	С ₂₃ Н ₃₄ О ₅
Молярная масса	390,51 г / моль
журнал P	2,57510 ^[1]
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Y проверить ( что есть ?)^YN
Ссылки на инфобоксы

Дигоксигенин (DIG) - это стероид, содержащийся исключительно в цветках и листьях растений Digitalis purpurea , Digitalis orientalis и Digitalis lanata (наперстянка), где он присоединяется к сахарам с образованием гликозидов (например, ланатозида C ). ^[2]

Использование в биотехнологии [ править ]

Дигоксигенин является гаптеном , небольшая молекула с высокой антигенностью , который используется во многих приложениях молекулярной биологии аналогична другие популярных гаптены , таких как 2,4-динитрофенол , биотин и флуоресцеин . Обычно дигоксигенин вводится химическим путем ( конъюгация ) в биомолекулы (белки, нуклеиновые кислоты) для обнаружения в дальнейших анализах.

DIG-связывающие белки . Тинберг и др. разработали искусственные белки, связывающие DIG. Их лучшим связующим веществом, DIG10.3, был белок из 141 аминокислоты, который связывал DIG с константой диссоциации (K _d ) 541 (+/- 193) пМ. ^[3]

Антитела к дигоксигенину с высокой аффинностью и специфичностью используются в различных биологических иммуноанализах (например, ELISA ). Антитела метят красителями, ферментами или флуоресценцией напрямую или вторично для визуализации и обнаружения.

Таким образом, дигоксигенин является универсальной иммуно-меткой и, в частности, стандартным иммуногистохимическим маркером для гибридизации in situ . ^[4]^[5] В этом случае он конъюгирован с одним видом РНК- нуклеозидтрифосфата (обычно уридином ), который затем включается в РНК (« рибозонд ») по мере того, как он синтезируется клеточными механизмами.

Это позволяет производить:

чувствительные нерадиоактивные зонды гибридизации in situ для обнаружения нуклеиновых кислот в растениях, способные обнаруживать 1 мкг плазмидной ДНК. ^[6]
конъюгаты пептид-DIG, т.е. анализ брадикинина с помощью очень чувствительных хемилюминесцентных иммуноанализов. ^[7]
флуоресцентные и DIG-меченных трассеры для конкурентного иммуноанализа, то есть предела обнаружения дигоксин, препарат , используемый для лечения сердечной аритмии, вплоть до 0,2 нг мл ^-1 . ^[8]
Дигоксигенин можно конъюгировать с сахарами для изучения событий гликозилирования ^[9] даже в биологических системах.

Ссылки [ править ]

^ «Дигоксигенин» . Паспорт безопасности материала . ChemSrc.
Перейти ↑ Polya G (2003). Биохимические мишени растительных биоактивных соединений . Нью-Йорк: CRC Press. ISBN 978-0415308298.
^ Tinberg CE, Кхар SD, Доу Дж, Дойл л, Нельсон JW, Schena А, Янковский Вт, Kalodimos CG, Йонссон К, Стоддарду Б.Л., Бейкер Д (сентябрь 2013 г. ). «Вычислительный дизайн лиганд-связывающих белков с высоким сродством и селективностью» . Природа . 501 (7466): 212–216. DOI : 10,1038 / природа12443 . PMC 3898436 . PMID 24005320 .
^ Eisel D, Грюневальд-Janho S, Krushen В, Eds. (2002). Руководство по применению DIG для нерадиоактивной гибридизации на месте (3-е изд.). Пенцберг: Рош Диагностика.
↑ Hauptmann G, Gerster T (август 1994). «Двухцветная цельная гибридизация in situ с эмбрионами позвоночных и дрозофилы». Тенденции в генетике . 10 (8): 266. DOI : 10.1016 / 0168-9525 (90) 90008-Т . PMID 7940754 .
Перейти ↑ Hart SM, Basu C (апрель 2009 г.). «Оптимизация системы иммуноанализа на основе дигоксигенина для обнаружения генов у Arabidopsis thaliana» (pdf) . Журнал биомолекулярных методов . 20 (2): 96–100. PMC 2685603 . PMID 19503620 .
^ Decarie А, Drapeau G, J Closset, Кутюр R, Адам А (1994). «Разработка пептида, меченного дигоксигенином: применение в хемилюминоферментном иммуноанализе брадикинина в воспаленных тканях». Пептиды . 15 (3): 511–8. DOI : 10.1016 / 0196-9781 (94) 90214-3 . PMID 7937327 .
^ Mayilo S, Элерса В, Вундерлич М, Klar Т.А., Josel HP, Heindl D, Nichtl А, Kürzinger К, Фельдман J (июль 2009 г.). «Конкурентный гомогенный иммуноферментный анализ дигоксигенина на основе тушения флуоресценции наночастицами золота». Analytica Chimica Acta . 646 (1–2): 119–22. DOI : 10.1016 / j.aca.2009.05.023 . PMID 19523564 .
^ Goodarzi MT, Рафик M, Turner G (май 1995). «Улучшенный многолуночный иммуноанализ с использованием дигоксигенин-меченых лектинов для изучения гликозилирования очищенных гликопротеинов». Сделки Биохимического Общества . 23 (2): 168С. DOI : 10.1042 / bst023168s . PMID 7672194 .

См. Также [ править ]

Иммуноокрашивание

[chemsrc-1] «Дигоксигенин» . Паспорт безопасности материала . ChemSrc.

[2] Перейти ↑ Polya G (2003). Биохимические мишени растительных биоактивных соединений . Нью-Йорк: CRC Press. ISBN 978-0415308298.

[3] Tinberg CE, Кхар SD, Доу Дж, Дойл л, Нельсон JW, Schena А, Янковский Вт, Kalodimos CG, Йонссон К, Стоддарду Б.Л., Бейкер Д (сентябрь 2013 г. ). «Вычислительный дизайн лиганд-связывающих белков с высоким сродством и селективностью» . Природа . 501 (7466): 212–216. DOI : 10,1038 / природа12443 . PMC 3898436 . PMID 24005320 .

[4] Eisel D, Грюневальд-Janho S, Krushen В, Eds. (2002). Руководство по применению DIG для нерадиоактивной гибридизации на месте (3-е изд.). Пенцберг: Рош Диагностика.

[5] Hauptmann G, Gerster T (август 1994). «Двухцветная цельная гибридизация in situ с эмбрионами позвоночных и дрозофилы». Тенденции в генетике . 10 (8): 266. DOI : 10.1016 / 0168-9525 (90) 90008-Т . PMID 7940754 .

[6] Перейти ↑ Hart SM, Basu C (апрель 2009 г.). «Оптимизация системы иммуноанализа на основе дигоксигенина для обнаружения генов у Arabidopsis thaliana» (pdf) . Журнал биомолекулярных методов . 20 (2): 96–100. PMC 2685603 . PMID 19503620 .

[7] Decarie А, Drapeau G, J Closset, Кутюр R, Адам А (1994). «Разработка пептида, меченного дигоксигенином: применение в хемилюминоферментном иммуноанализе брадикинина в воспаленных тканях». Пептиды . 15 (3): 511–8. DOI : 10.1016 / 0196-9781 (94) 90214-3 . PMID 7937327 .

[8] Mayilo S, Элерса В, Вундерлич М, Klar Т.А., Josel HP, Heindl D, Nichtl А, Kürzinger К, Фельдман J (июль 2009 г.). «Конкурентный гомогенный иммуноферментный анализ дигоксигенина на основе тушения флуоресценции наночастицами золота». Analytica Chimica Acta . 646 (1–2): 119–22. DOI : 10.1016 / j.aca.2009.05.023 . PMID 19523564 .

[9] Goodarzi MT, Рафик M, Turner G (май 1995). «Улучшенный многолуночный иммуноанализ с использованием дигоксигенин-меченых лектинов для изучения гликозилирования очищенных гликопротеинов». Сделки Биохимического Общества . 23 (2): 168С. DOI : 10.1042 / bst023168s . PMID 7672194 .

[1]