Генетическая примесь - это присутствие ДНК у человека из отдаленно связанной популяции или вида в результате скрещивания между популяциями или видами, которые были генетически изолированы и создали уникальные генофонды. [1] [2] Добавление приводит к появлению новых генетических линий в популяции.
Примеры
Климатические циклы способствуют генетическому смешиванию в холодные периоды и генетическому разнообразию в теплые периоды. [3] Естественные наводнения могут вызвать генетическое смешение популяций мигрирующих видов рыб. [4] Генетическая примесь может сыграть важную роль в успехе популяций, которые колонизируют новую территорию и скрещиваются с представителями местных популяций. [5]
Картография
Составное картирование - это метод картирования генов, в котором используется популяция смешанного происхождения (смешанная популяция) для поиска генетических локусов, которые способствуют различиям в заболеваниях или других фенотипах, обнаруживаемых между различными предковыми популяциями. Метод лучше всего применять для населения с недавней смесью из двух популяций , которые ранее были генетически изолированы в течение десятков тысяч лет, такие , как афро - американцы и американцы европейского происхождение ( с примесью африканских и европейских популяций). Этот метод пытается сопоставить степень происхождения около генетического локуса с интересующим фенотипом или заболеванием. Генетические маркеры, которые различаются по частоте между предковыми популяциями, необходимы по всему геному. [6]
Картирование примесей основано на предположении, что различия в уровне заболеваемости или фенотипах частично обусловлены различиями в частотах вызывающих заболевания или вызывающих фенотип генетических вариантов между популяциями. В смешанной популяции эти причинные варианты чаще встречаются на хромосомных сегментах, унаследованных от той или иной предковой популяции. Первые сканы примесей были опубликованы в 2005 году, и с тех пор были выявлены генетические факторы, способствующие множеству заболеваний и различий в признаках. [7] К ним относятся гипертония , рассеянный склероз , ИМТ и рак простаты у афроамериканцев. К 2010 году картографические панели с высокой плотностью карт были созданы для афроамериканцев, латиноамериканцев / выходцев из Латинской Америки и уйгуров .
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Риус, М. и Дарлинг, JA (2014). «Насколько важна внутривидовая генетическая примесь для успеха колонизации популяций?». Тенденции в экологии и эволюции . 29 (4): 233–242. DOI : 10.1016 / j.tree.2014.02.003 . PMID 24636862 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Ян, Мелинда А .; Фу, Цяомей (март 2018 г.). «Взгляд на предысторию современного человека с использованием древних геномов». Тенденции в генетике . 34 (3): 184–196 6лет. DOI : 10.1016 / j.tig.2017.11.008 . PMID 29395378 .⅝
- ^ Лв, X., Ченг, Дж., Мэн, Й., Чанг, Й., Ся, Л., Вэнь, З., Ге, Д., Лю, С. и Ян, К. (2018). «Разъединенное распространение и отчетливая внутривидовая диверсификация Eothenomys melanogaster в Южном Китае» . BMC Evolutionary Biology . 18 (1): 50. DOI : 10,1186 / s12862-018-1168-3 . PMC 5894153 . PMID 29636000 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Джайсук, К. и Сенанан, В. (2018). «Влияние особенностей ландшафта на генетическую изменчивость популяций тропической речной рыбы, каменного гольяна, Garra cambodgiensis , в верхнем водосборном бассейне реки Нан на севере Таиланда» . PeerJ . 6 : e4487. DOI : 10,7717 / peerj.4487 . PMC 5845392 . PMID 29568710 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Кольбе, Дж. Дж., Ларсон, А., Лосос, Дж. Б. и де Кейрос, К. (2008). «Примесь определяет генетическое разнообразие и дифференциацию популяций при биологическом вторжении вида ящериц» . Письма о биологии . 4 (4): 434−437. DOI : 10.1098 / RSBL.2008.0205 . PMC 2610154 . PMID 18492644 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Шрайвер, доктор медицины; и другие. (Апрель 2003 г.). «Пигментация кожи, биогеографическое происхождение и составление карты примесей». Генетика человека . 112 (4): 387–99. DOI : 10.1007 / s00439-002-0896-у . PMID 12579416 . S2CID 7877572 .
- ^ Винклер, Калифорния; Нельсон, GW; Смит, MW (2010). «Картографирование примесей достигает зрелости» . Анну Рев Геном Хум Генет . 11 : 65–89. DOI : 10.1146 / annurev-genom-082509-141523 . PMC 7454031 . PMID 20594047 .
дальнейшее чтение
- Лысеющий (2007). «Глоссарий генетических терминов» . Справочник по статистической генетике, Том 1 . ISBN 978-0-470-05830-5.
- Фоулкс (28 апреля 2009 г.). «Словарь терминов» . Прикладная статистическая генетика с R: для популяционных исследований ассоциации . п. 250. ISBN 978-0-387-89553-6.
- Камень; и другие. (2007). «Словарь терминов» . Гены, культура и эволюция человека: синтез . ISBN 978-1-4051-5089-7.
- Кольбе JJ, Glor RE, Schettino LR, Lara AC, Losos AL, Losos JB (2004) Увеличение генетической изменчивости во время биологического вторжения кубинской ящерицы . Природа 431: 171-181
- Ленорман Т. (2002). Поток генов и пределы естественного отбора . Тенденции в экологии и эволюции. 17: 183-189
- Shriner 2013, "Обзор составления карт примесей"