Трансформирующий фактор роста бета 1 или TGF- 1 является членом полипептид данного фактора роста бета надсемейства трансформирующего из цитокинов . Это представляет собой секретируемый белок , который выполняет многие клеточные функции, в том числе контроль клеточного роста , пролиферации клеток , дифференциации клеток и апоптоз . У людей, TGF-β1 кодируется TGFB1 гена . [5] [6]
TGFB1 |
---|
|
Доступные конструкции |
---|
PDB | Ортолог поиск: PDBe RCSB |
---|
Список идентификационных кодов PDB |
---|
1КЛА , 1КЛК , 1КЛД , 3КФД , 4КВ5 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | TGFB1 , CED, DPD1, LAP, TGFB, TGFbeta, трансформирующий фактор роста бета 1, IBDIMDE, TGF-beta1 |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM : 190180 MGI : 98725 HomoloGene : 540 GeneCards : TGFB1 |
---|
Расположение гена ( человек ) |
---|
| Chr. | Хромосома 19 (человека) [1] |
---|
| Группа | 19q13.2 | Начинать | 41 301 587 п.н. [1] |
---|
Конец | 41 353 922 п.н. [1] |
---|
|
Расположение гена ( Мышь ) |
---|
| Chr. | Хромосома 7 (мышь) [2] |
---|
| Группа | 7 A3 | 7 13,98 см | Начинать | 25 687 002 б.п. [2] |
---|
Конец | 25 705 077 п.н. [2] |
---|
|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | • связывание с бета-рецептором трансформирующего фактора роста типа II • связывание с N-концом белка • цитокиновая активность • связывание с ферментом • активность фактора роста • связывание антигена GO: 0003823 • связывание с бета-рецептором трансформирующего фактора роста I типа • активность гомодимеризации белков • протеин-серин / треониновая киназа активаторная активность • Связывание с белками GO: 0001948 • активность гетеродимеризации белков • связывание с бета-рецептором трансформирующего фактора роста типа III • связывание с бета-рецептором трансформирующего фактора роста • идентичное связывание с белками
|
---|
Сотовый компонент | • цитоплазма • внеклеточная область • ядро • микроворсинка • поверхность клетки • микрочастица крови • плазматическая мембрана • секреторная гранула • аксон • тело нейрональной клетки • просвет Гольджи • просвет альфа-гранулы тромбоцитов • внеклеточный матрикс GO: 0005578 • внеклеточное пространство
|
---|
Биологический процесс | • позитивная регуляция деацетилирования гистонов • позитивная регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции • развитие зачатка мочеточника • индукция толерантности к аутоантигену • позитивная регуляция фосфорилирования белка • развитие энтодермы • ответ на холестерин • позитивная регуляция активности киназы MAP • регуляция ионов натрия транспорт • ответ на прогестерон • негативная регуляция клеточного цикла • реакция на органическое вещество • развитие молочных желез • гомеостаз Т-клеток • негативная регуляция оссификации • негативная регуляция процесса биосинтеза гиалуронана • фосфорилирование белков • дифференцировка Т-клеток • позитивная регуляция проницаемости сосудов • регенерация органов животных • позитивная регуляция миграции эндотелиальных клеток кровеносных сосудов • негативная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • регуляция связывания • развитие внутреннего уха • миелинизация • негативная регуляция продукции цитокинов макрофагами • пролиферация клеточной популяции • tr сигнальный путь бета-рецептора анформирующего фактора роста • морфогенез лица • негативная регуляция пролиферации клеточной популяции • позитивная регуляция кластеризации рецепторов • регуляция апоптотического процесса • позитивная регуляция процесса биосинтеза коллагена • клеточный ответ на стимул трансформирующего бета-фактора роста • белок SMAD с ограничением пути фосфорилирование • регуляция связывания ДНК • регуляция реорганизации актинового цитоскелета • негативная регуляция дифференцировки жировых клеток • позитивная регуляция процесса метаболизма клеточных белков • организация межклеточного соединения • негативная регуляция дифференцировки миобластов • позитивная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • общие- партнерское фосфорилирование белка SMAD • позитивная регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника • передача сигнала белка SMAD • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • дифференцировка пенистых клеток, происходящая из макрофагов • негативная регуляция кровеносных сосудов en миграция dothelial клетки • положительная регуляция белка дефосфорилирование • внешнего апоптического сигнального путь • отрицательного регулирования внеклеточного матрикса разборки • митотических сигнализации контрольной точки клеточного цикла • положительная регуляция пролиферации фибробластов • отрицательное регулирование дифференциации клеток • регулирования ветвления участвует в молочной железы протока морфогенез • положительная регуляция выхода из митоза • негативная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста • негативная регуляция экспрессии генов • морфогенез ветвящейся структуры • регуляция передачи сигнала белка SMAD • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • активация клетки • негативная регуляция пролиферации нейробластов • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • рост клеток • негативная регуляция пролиферации Т-клеток • реакция на ранение • негативная регуляция роста клеток • позитивная регуляция хемотаксиса • экспорт белка из nu клетка • регуляция импорта белка в ядро • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина • позитивная регуляция импорта протеина в ядро • позитивная регуляция дифференцировки клеток сердечной мышцы • развитие олигодендроцитов • позитивная регуляция продукции интерлейкина-17 • воспалительный ответ • негативная регуляция выработки интерлейкина-17 • развитие лимфатических узлов • активация Т-клеток • сигнальный путь Notch • негативная регуляция фосфорилирования белков • регуляция ремоделирования кровеносных сосудов • сборка белкового комплекса SMAD • регуляция развития поперечно-полосатой мышечной ткани • ответ на витамин D • хондроциты дифференциация • регуляторных Т - клеточная дифференцировка • регулирование развития хрящевой • ветвь элонгация участвует в молочной железа канал разветвление • положительного регулирование минерализации костей • положительного регулирование пролиферации эпителиальной клеток • женская беременность • клеточного ответ на органическое циклическое соединение • положительного регулирования сборка внеклеточного матрикса • клеточный гомеостаз ионов кальция • заживление ран • отрицательная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • ответ на глюкозу • положительная регуляция перехода эпителия в мезенхиму • клеточный ответ на стимул дексаметазона • отрицательное регулирование продукции включение miRNAs, участвующих в подавлении генов с помощью miRNA • ослабление защиты хозяина вирусом • дифференциация клеток хрусталика • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • сборка внеклеточного матрикса • процесс биосинтеза АТФ • дифференцировка гематопоэтических клеток-предшественников • регуляция интерлейкина-23 продукция • положительная регуляция секреции белка • морфогенез фронтального шва • переход эпителия в мезенхиму • процесс метаболизма фосфатсодержащих соединений • регуляция экспрессии генов • адаптивный иммунный ответ, основанный на соматической рекомбинации иммунных рецепторов, построенных из доменов суперсемейства иммуноглобулинов • негативная регуляция высвобождения секвестрированный ион кальция в цитозоль • ответ на облучение • пролиферация мононуклеарных клеток • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция активации Т-клеток • позитивная регуляция одонтогенеза • липополисахаридный сигнальный путь • позитивная регуляция протеинов n локализация в ядре • реакция на эстрадиол • регуляция миграции клеток • реакция на гипоксию • катаболический процесс гиалуроновой кислоты • негативная регуляция фагоцитоза • ответ на органическое циклическое соединение • позитивная регуляция сборки протеинсодержащего комплекса • передача сигналов протеинкиназы B • негативная регуляция межклеточная адгезия • негативная регуляция молчания генов с помощью miRNA • позитивная регуляция дифференцировки регуляторных Т-клеток • клеточный ответ на стимул фактора роста • позитивная регуляция ограниченного путями фосфорилирования белка SMAD • ветвление молочной железы, участвующее в телархе • ответ на сдвиг ламинарной жидкости стресс • старение • регуляция дифференцировки регуляторных Т-лимфоцитов • дегрануляция тромбоцитов • негативная регуляция репликации ДНК • дифференцировка миелоидных дендритных клеток • морфогенез слюнных желез • катаболический процесс рецептора • каскад MAPK • позитивная регуляция ацетилирования гистонов • регуляция трансформирующего фактора роста бета рецепто r сигнальный путь • позитивная регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы • негативная регуляция локализации белка на плазматической мембране • позитивная регуляция активности NAD + ADP-рибозилтрансферазы • негативная регуляция иммунного ответа • регуляция пролиферации клеточной популяции • негативная регуляция развития ткани скелетных мышц • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • позитивная регуляция дифференцировки гладкомышечных клеток • позитивная регуляция переключения изотипа на изотипы IgA • замещение соединительной ткани, участвующее в заживлении воспалительной реакции • оссификация, участвующая в ремоделировании костей • позитивная регуляция апоптотического процесса • позитивная регуляция производства фактора роста эндотелия сосудов • положительная регуляция образования супероксид-анионов • развитие пищеварительного тракта • миграция клеток • позитивная регуляция миграции фибробластов • позитивная регуляция деления клеток • реакция на лекарство • миграция зародышевых клеток • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • негативная регуляция митотического клеточного цикла • позитивная регуляция передачи сигнала белка SMAD • позитивная регуляция транскрипции pri-miRNA с помощью РНК-полимеразы II • позитивная регуляция экспрессии генов • позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции • регенерация печени • регуляция перехода эпителия в мезенхиму, участвующего в формировании эндокардиальной подушки • позитивная регуляция миграции мононуклеарных клеток • клеточный ответ на стимул инсулиноподобного фактора роста • позитивная регуляция миграции клеток • ответ на иммобилизационный стресс • клеточный ответ на механический стимул • клеточный ответ на ионизирующее излучение • васкулогенез • нейронные замыкающей трубки • сердечный клапан морфогенез • развитие сердца • развитие нервной трубки • мембранный белок внутриклеточный домен протеолиз • миграцию лейкоцитов • желудочков сердца мышечной ткани морфогенез • положительное регулирование ERK1 и ERK2 каскада • сигнальный путь бета-рецептора трансформирующего фактора роста, участвующий в развитии сердца • развитие эмбриональной печени • сигнальный путь BMP • развитие клеток • апоптотический процесс • регуляция транскрипции pri-miRNA с помощью РНК-полимеразы II • позитивная регуляция продукции miRNAs, участвующих в подавлении генов с помощью miRNA • регуляция активности сигнальных рецепторов
|
---|
Источники: Amigo / QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Разновидность | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ансамбль | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Расположение (UCSC) | Chr 19: 41,3 - 41,35 Мб | Chr 7: 25.69 - 25.71 Мб |
---|
PubMed поиск | [3] | [4] |
---|
Викиданные |
Просмотр / редактирование человека | Просмотр / редактирование мыши |
|
TGF-β - это многофункциональный набор пептидов, который контролирует пролиферацию , дифференцировку и другие функции во многих типах клеток. TGF-β действует синергетически с трансформирующим фактором роста-альфа (TGF-α), индуцируя трансформацию . Он также действует как негативный аутокринный фактор роста . Нарушение регуляции активации и передачи сигналов TGF-β может привести к апоптозу . Многие клетки синтезируют TGF-β, и почти все они имеют специфические рецепторы для этого пептида. TGF-β1, TGF-β2 и TGF-β3 функционируют через одни и те же рецепторные сигнальные системы. [7]
TGF-β1 был впервые идентифицирован в тромбоцитах человека как белок с молекулярной массой 25 килодальтон, потенциально играющий роль в заживлении ран . [8] Позже он был охарактеризован как большой предшественник белка (содержащий 390 аминокислот ), который был протеолитически обработан с образованием зрелого пептида из 112 аминокислот. [9]
TGF-β1 играет важную роль в контроле иммунной системы и проявляет различную активность в отношении разных типов клеток или клеток на разных стадиях развития. Большинство иммунных клеток (или лейкоцитов ) секретируют TGF-β1. [10]
Т-клетки
Некоторые Т-клетки (например, регуляторные Т-клетки ) высвобождают TGF-β1 для подавления действий других Т-клеток. Интерлейкин-1- и интерлейкин-2- зависимая пролиферация активированных Т-клеток [11] [12], а активация покоящихся хелперных Т-клеток и цитотоксических Т-клеток предотвращается активностью TGF-β1. [13] [14] Точно так же TGF-β1 может ингибировать секрецию и активность многих других цитокинов, включая интерферон-γ , фактор некроза опухоли-альфа (TNF-α) и различные интерлейкины . Он также может снижать уровни экспрессии рецепторов цитокинов, таких как рецептор IL-2, для подавления активности иммунных клеток. Однако TGF-β1 может также увеличивать экспрессию определенных цитокинов в Т-клетках и способствовать их пролиферации [15], особенно если клетки незрелые. [10]
В-клетки
TGF-β1 оказывает аналогичное действие на В-клетки, которое также варьируется в зависимости от состояния дифференцировки клетки. Он подавляет пролиферацию и стимулирует апоптоз B-клеток [16] и играет роль в контроле экспрессии антител , трансферрина и белков класса II MHC на незрелых и зрелых B-клетках. [10] [16]
Миелоидные клетки
Эффект TGF-β1 на макрофаги и моноциты преимущественно супрессивный; этот цитокин может ингибировать пролиферацию этих клеток и предотвращать выработку ими реактивного кислорода (например, супероксида (O 2 - ) ) и азота (например, оксида азота (NO) ). Однако, как и в случае с другими типами клеток, TGF-β1 также может оказывать противоположное действие на клетки миелоидного происхождения. Например, TGF-β1 действует как хемоаттрактант , направляя иммунный ответ на некоторые патогены ; макрофаги и моноциты реагируют на низкие уровни TGF-β1 хемотаксическим образом. Кроме того, экспрессия моноцитарных цитокинов (включая интерлейкин-1 (ИЛ-1) -альфа, ИЛ-1-бета и TNF-α ) [14] и уничтожение фагоцитов макрофагами может быть увеличено действием TGF-β1. . [10]
TGF-β1 снижает эффективность MHC II в астроцитах и дендритных клетках , что, в свою очередь, снижает активацию соответствующих популяций хелперных Т-клеток . [17] [18]
Было показано, что TGF beta 1 взаимодействует с:
- Декорин , [19] [20] [21]
- EIF3I [22]
- LTBP1 , [23]
- Бета-рецептор TGF 1 , [24] [25] и
- YWHAE . [26]