Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Эта статья о лигандах в биохимии. О лигандах в неорганической химии см. Лиганд . Для использования в других целях, см Лиганд (значения) .
Миоглобин (синий) со связанным лигандом- гемом (оранжевый). На основании PDB : 1MBO

В биохимии и фармакологии , A - лиганд представляет собой вещество , которое образует комплекс с биомолекулы , чтобы служить биологической цели. Этимология происходит от слова ligare , что означает «связывать». При связывании белок-лиганд лиганд обычно представляет собой молекулу, которая вырабатывает сигнал путем связывания с сайтом на целевом белке . Связывание обычно приводит к изменению конформационной изомерии (конформации) целевого белка. В исследованиях связывания ДНК с лигандом лиганд может быть небольшой молекулой, ионом [1] или белком.[2], который связывается с двойной спиралью ДНК . Отношения между лигандом и партнером по связыванию зависят от заряда, гидрофобности и молекулярной структуры. Пример связывания происходит в бесконечно малом диапазоне времени и пространства, поэтому константа скорости обычно является очень малым числом.

Связывание происходит за счет межмолекулярных сил , таких как ионные связи , водородные связи и силы Ван-дер-Ваальса . Ассоциация или стыковка на самом деле обратимы через диссоциацию. Измеримая необратимая ковалентная связь между лигандом и молекулой-мишенью нетипична в биологических системах. В отличие от определения лиганда в металлоорганической и неорганической химии , в биохимии неясно, связывается ли лиганд в основном на участке металла , как в случае с гемоглобином.. В общем, интерпретация лиганда зависит от контекста, в зависимости от того, какой тип связывания наблюдается.

Связывание лиганда с рецепторным белком изменяет конформацию, влияя на ориентацию трехмерной формы. Конформация рецепторного белка составляет функциональное состояние. Лиганды включают субстраты , ингибиторы , активаторы , сигнальные липиды и нейротрансмиттеры . Скорость связывания называется аффинностью , и это измерение характеризует тенденцию или силу эффекта. Аффинность связывания актуализируется не только взаимодействиями хозяин-гость , но также эффектами растворителя, которые могут играть доминирующую стерическую роль, которая управляет нековалентным связыванием в растворе. [3] Растворитель обеспечивает химическую среду для адаптации лиганда и рецептора и, таким образом, принимать или отвергать друг друга как партнеров.

Радиолиганды - это меченые радиоизотопами соединения, используемые in vivo в качестве индикаторов в исследованиях ПЭТ и исследованиях связывания in vitro .

Аффинность связывания рецептора / лиганда [ править ]

Взаимодействие лигандов с их сайтами связывания можно охарактеризовать с точки зрения аффинности связывания. В общем, связывание лиганда с высокой аффинностью является результатом большей силы притяжения между лигандом и его рецептором, тогда как связывание лиганда с низким сродством включает меньшую силу притяжения. В общем, связывание с высокой аффинностью приводит к более высокой занятости рецептора его лигандом, чем в случае связывания с низким сродством; время пребывания ( время жизни комплекса рецептор-лиганд) не коррелирует. Связывание лигандов с рецепторами с высоким сродством часто является физиологически важным, когда некоторая энергия связывания может быть использована для того, чтобы вызвать конформационные изменения в рецепторе, приводящие к изменению поведения, например, связанного ионного канала или фермента .

Лиганд, который может связываться с рецептором и изменять его функцию, вызывающую физиологический ответ, называется агонистом рецептора . Лиганды, которые связываются с рецептором, но не могут активировать физиологический ответ, являются антагонистами рецептора .

Два агониста с одинаковой аффинностью связывания

Связывание агониста с рецептором можно охарактеризовать как с точки зрения того, насколько физиологический ответ может быть вызван (то есть эффективность ), так и с точки зрения концентрации агониста, необходимой для получения физиологического ответа (часто измеряется как EC 50 , концентрация, необходимая для получения полумаксимального ответа). Связывание лиганда с высоким сродством подразумевает, что относительно низкая концентрация лиганда достаточна для того, чтобы максимально занять лиганд-связывающий сайт и вызвать физиологический ответ. Сродство рецептора измеряется константой ингибирования или значением K i , концентрация, необходимая для занятия 50% рецептора. Сродство лигандов чаще всего измеряется косвенно как IC50 значение из эксперимента по конкурентному связыванию, в котором определяется концентрация лиганда, необходимая для замещения 50% фиксированной концентрации эталонного лиганда. Значение K i можно оценить из IC 50 с помощью уравнения Ченга Прусоффа . Сродство лигандов можно также измерить непосредственно как константу диссоциации (K d ) с использованием таких методов, как тушение флуоресценции , калориметрия изотермического титрования или поверхностный плазмонный резонанс . [4]

Низкоаффинное связывание (высокий уровень K i ) означает, что требуется относительно высокая концентрация лиганда, прежде чем сайт связывания будет максимально занят и будет достигнут максимальный физиологический ответ на лиганд. В примере, показанном справа, два разных лиганда связываются с одним и тем же сайтом связывания рецептора. Только один из показанных агонистов может максимально стимулировать рецептор и, таким образом, может быть определен как полный агонист . Агонист, который может только частично активировать физиологический ответ, называется частичным агонистом . В этом примере концентрация, при которой полный агонист (красная кривая) может наполовину максимально активировать рецептор, составляет примерно 5 x 10 -9 моль (нм = наномоль ).

Два лиганда с разным сродством связывания с рецептором.

Аффинность связывания чаще всего определяют с использованием радиоактивно меченного лиганда, известного как меченый лиганд. Эксперименты по гомологичному конкурентному связыванию включают конкуренцию связывания между меченым лигандом и немаркированным лигандом. [5] Методы, основанные на реальном времени, которые часто не содержат меток, такие как поверхностный плазмонный резонанс , двухполяризационная интерферометрия и многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс.(MP-SPR) может не только количественно оценить сродство с помощью анализов на основе концентрации; но также из кинетики ассоциации и диссоциации, а в более поздних случаях конформационного изменения, индуцированного при связывании. MP-SPR также позволяет проводить измерения в буферах диссоциации с высоким содержанием физиологического раствора благодаря уникальной оптической настройке. Был разработан термофорез на микромасштабах (MST), метод без иммобилизации [6] . Этот метод позволяет определять аффинность связывания без ограничения молекулярной массы лиганда. [7]

Для использования статистической механики в количественном исследовании аффинности связывания лиганд-рецептор см. Подробную статью [8] о функции распределения конфигурации .

Эффективность лекарства и сродство к связыванию [ править ]

Сами по себе данные о сродстве связывания не определяют общую эффективность лекарственного средства. Эффективность является результатом сложного взаимодействия как сродства связывания, так и эффективности лиганда. Эффективность лиганда относится к способности лиганда вызывать биологический ответ при связывании с рецептором-мишенью и количественной величине этого ответа. Этот ответ может быть агонистом , антагонистом или обратным агонистом , в зависимости от продуцируемого физиологического ответа. [9]

Селективный и неизбирательный [ править ]

Основная статья: Селективность привязки

Селективные лиганды имеют тенденцию связываться с очень ограниченными типами рецепторов, тогда как неселективные лиганды связываются с несколькими типами рецепторов. Это играет важную роль в фармакологии , где неселективные лекарственные средства имеют тенденцию иметь более неблагоприятные эффекты , потому что они связываются с несколькими другими рецепторами в дополнение к рецептору, вызывающему желаемый эффект.

Гидрофобные лиганды [ править ]

Для гидрофобных лигандов (например, PIP2) в комплексе с гидрофобным белком (например, липид-зависимые ионные каналы ) определение сродства осложняется неспецифическими гидрофобными взаимодействиями. Неспецифические гидрофобные взаимодействия можно преодолеть, если сродство лиганда высокое. [10] Например, PIP2 связывается с высоким сродством с ионными каналами, управляемыми PIP2.

Двухвалентный лиганд [ править ]

Двухвалентные лиганды состоят из двух лекарственных молекул (фармакофоров или лигандов), соединенных инертным линкером. Существуют различные виды двухвалентных лигандов, и их часто классифицируют в зависимости от того, на что нацелены фармакофоры. Гомобивалентные лиганды нацелены на два рецептора одного и того же типа. Гетеробивалентные лиганды нацелены на два разных типа рецепторов. [11] Битопические лиганды нацелены на ортостерические сайты связывания и аллостерические сайты связывания на одном и том же рецепторе. [12]

В научных исследованиях двухвалентные лиганды использовались для изучения димеров рецепторов и изучения их свойств. Этот класс лигандов был впервые предложен Филипом С. Портогезе и его сотрудниками при изучении системы опиоидных рецепторов. [13] [14] [15] О двухвалентных лигандах также сообщалось ранее Майклом Конном и его коллегами для рецептора гонадотропин-рилизинг-гормона. [16] [17] Со времени этих ранних сообщений было описано много бивалентных лигандов для различных систем рецепторов, связанных с G-белком (GPCR), включая каннабиноид, [18] серотонин, [19] [20] окситоцин, [21]и системы рецепторов меланокортина, [22] [23] [24] и для систем GPCR - LIC ( рецепторы D2 и nACh ). [11]

Бивалентные лиганды обычно больше, чем их одновалентные аналоги, и, следовательно, не «подобны лекарствам». (См. Правило пяти Липинского .) Многие считают, что это ограничивает их применимость в клинических условиях. [25] [26] Несмотря на эти убеждения, было много лигандов, которые сообщили об успешных доклинических исследованиях на животных. [23] [24] [21] [27] [28] [29] Учитывая, что некоторые двухвалентные лиганды могут иметь много преимуществ по сравнению с их моновалентными аналогами (например, тканевая селективность, повышенная аффинность связывания и повышенная активность или эффективность), биваленты может также иметь некоторые клинические преимущества.

Моно- и полидесмические лиганды [ править ]

Лиганды белков можно охарактеризовать также по количеству связываемых ими белковых цепей. «Монодесмические» лиганды (μόνος: одиночный, δεσμός: связывание) представляют собой лиганды, которые связывают одну белковую цепь, в то время как «полидесмические» лиганды (πολοί: многие) [30] часто встречаются в белковых комплексах и являются лигандами, связывающими более одного белка цепи, как правило, в границах раздела белков или рядом с ними. Недавние исследования показали, что тип лигандов и структура сайта связывания имеют серьезные последствия для эволюции, функции, аллостерии и фолдинга белковых комплексов. [31] [32]

Привилегированный эшафот [ править ]

Привилегированный каркас [33] представляет собой молекулярный каркас или химический фрагмент, который статистически повторяется среди известных лекарств или среди определенного набора биологически активных соединений. Эти привилегированные элементы [34] могут быть использованы в качестве основы для разработки новых активных биологических соединений или библиотек соединений.

Методы, используемые для изучения связывания [ править ]

Основными методами изучения взаимодействий белок-лиганд являются основные гидродинамические и калориметрические методы, а также основные спектроскопические и структурные методы, такие как

  • Спектроскопия с преобразованием Фурье
  • Рамановская спектроскопия
  • Флуоресцентная спектроскопия
  • Круговой дихроизм
  • Ядерный магнитный резонанс
  • Масс-спектрометрии
  • Атомно-силовой микроскоп
  • Парамагнитные зонды
  • Двойная поляризационная интерферометрия
  • Многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс
  • Анализ связывания лиганда и анализ связывания радиолиганда

Другие методы включают: интенсивность флуоресценции, бимолекулярную комплементацию флуоресценции, FRET (перенос энергии флуоресцентного резонанса) / FRET , подавляющий поверхностный плазмонный резонанс , биослойную интерферометрию , непрямой ИФА с коиммунопрециптацией, равновесный диализ, гель-электрофорез, дальний вестерн-блот, анизотропия поляризации флуоресценции, электронный парамагнитный резонанс, термофорез на микромасштабах

Резко возросшая вычислительная мощность суперкомпьютеров и персональных компьютеров позволила изучать взаимодействия белок-лиганд также с помощью вычислительной химии . Например, всемирная сеть из более чем миллиона обычных ПК была задействована для исследований рака в проекте grid.org , который завершился в апреле 2007 года. На смену Grid.org пришли аналогичные проекты, такие как World Community Grid , Human Proteome Folding Project. , Compute Against Cancer and Folding @ Home .

См. Также [ править ]

  • Агонист
  • Регресс Шильда
  • Аллостерическая регуляция
  • База данных Ki
  • Док-станция @ Home
  • GPUGRID.net
  • ДНК-связывающий лиганд
  • BindingDB
  • SAMPL Challenge

Ссылки [ править ]

  1. ^ Teif VB (октябрь 2005). «Лиганд-индуцированная конденсация ДНК: выбор модели» . Биофизический журнал . 89 (4): 2574–87. Bibcode : 2005BpJ .... 89.2574T . DOI : 10.1529 / biophysj.105.063909 . PMC  1366757 . PMID  16085765 .
  2. ^ Teif VB, Rippe K (октябрь 2010). «Статистико-механические решетчатые модели связывания белок-ДНК в хроматине». Журнал физики: конденсированное вещество . 22 (41): 414105. arXiv : 1004.5514 . Bibcode : 2010JPCM ... 22O4105T . DOI : 10.1088 / 0953-8984 / 22/41/414105 . PMID 21386588 . S2CID 103345 .  
  3. ^ Baron R, Setny P, McCammon JA (сентябрь 2010). «Вода в полости - распознавание лиганда» . Журнал Американского химического общества . 132 (34): 12091–7. DOI : 10.1021 / ja1050082 . PMC 2933114 . PMID 20695475 .  
  4. ^ «Разница между значениями K i , K d , IC 50 и EC 50 » . Научная улитка . 31 декабря 2019.
  5. ^ См. Кривые гомологичного конкурентного связывания. Архивировано 19 декабря 2007 г.на Wayback Machine , Полное руководство по нелинейной регрессии, curvefit.com.
  6. ^ Baaske P, Wienken CJ, Reineck P, S Duhr, Braun D (март 2010). «Оптический термофорез для количественной оценки буферной зависимости связывания аптамера». Angewandte Chemie . 49 (12): 2238–41. DOI : 10.1002 / anie.200903998 . PMID 20186894 . Краткое содержание - Phsy.org (24 февраля 2010 г.). 
  7. ^ Wienken CJ, Baaske P, U Rothbauer, Braun D, Duhr S (октябрь 2010). «Анализы связывания белков в биологических жидкостях с использованием термофореза на микроуровне» . Nature Communications . 1 (7): 100. Bibcode : 2010NatCo ... 1..100W . DOI : 10.1038 / ncomms1093 . PMID 20981028 . 
  8. ^ Ву-Куок, Л., Интеграл конфигурации (статистическая механика) , 2008. этот вики-сайт не работает; см эту статью в веб - архиве на 2012 28 апреля .
  9. ^ Kenakin TP (ноябрь 2006). Учебник по фармакологии: теория, приложения и методы . Академическая пресса . п. 79. ISBN 978-0-12-370599-0.
  10. ^ Cabanos, C; Ван, М; Хан, X; Хансен, SB (8 августа 2017 г.). «Анализ растворимого флуоресцентного связывания выявляет антагонизм PIP 2 каналов TREK-1» . Сотовые отчеты . 20 (6): 1287–1294. DOI : 10.1016 / j.celrep.2017.07.034 . PMC 5586213 . PMID 28793254 .  
  11. ^ a b Матера, Карло; Пуччи, Лука; Фиорентини, Кьяра; Фучиле, Серджио; Миссейл, Кристина; Грациозо, Джованни; Клементи, Франческо; Золи, Микеле; Де Амичи, Марко (28 августа 2015 г.). «Бифункциональные соединения, нацеленные как на D2, так и на не-α7 nACh рецепторы: дизайн, синтез и фармакологическая характеристика». Европейский журнал медицинской химии . 101 : 367–383. DOI : 10.1016 / j.ejmech.2015.06.039 . PMID 26164842 . 
  12. ^ Матера, Карло; Фламмини, Лиза; Куадри, Марта; Виво, Валентина; Баллабени, Виджилио; Хольцграбе, Ульрике; Мор, Клаус; Де Амичи, Марко; Барочелли, Элизабетта (21 марта 2014 г.). «Бис (аммонио) алкановые агонисты мускариновых рецепторов ацетилхолина: синтез, функциональная характеристика in vitro и оценка их анальгетической активности in vivo». Европейский журнал медицинской химии . 75 : 222–232. DOI : 10.1016 / j.ejmech.2014.01.032 . PMID 24534538 . 
  13. ^ Эрез M, Takemori А.Е., Portoghese PS (июль 1982). «Наркотическая антагонистическая сила двухвалентных лигандов, содержащих бета-налтрексамин. Доказательства образования мостиков между проксимальными сайтами узнавания». Журнал медицинской химии . 25 (7): 847–9. DOI : 10.1021 / jm00349a016 . PMID 7108900 . 
  14. ^ Portoghese PS, Ronsisvalle G, Larson DL, Иим CB, Сейр LM, Takemori AE (1982). «Опиоидные агонисты и антагонисты двухвалентных лигандов в качестве рецепторных зондов». Науки о жизни . 31 (12–13): 1283–6. DOI : 10.1016 / 0024-3205 (82) 90362-9 . PMID 6292615 . 
  15. ^ Portoghese PS, Akgün E, Lunzer MM (январь 2017). "Индукция гетеромера: подход к уникальной фармакологии?" . ACS Chemical Neuroscience . 8 (3): 426–428. DOI : 10.1021 / acschemneuro.7b00002 . PMID 28139906 . 
  16. ^ Blum JJ, Conn PM (декабрь 1982). «Стимуляция высвобождения лютеинизирующего гормона гонадотропин-рилизинг-гормоном: модель лиганд-рецептор-эффектор» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 79 (23): 7307–11. Bibcode : 1982PNAS ... 79.7307B . DOI : 10.1073 / pnas.79.23.7307 . JSTOR 13076 . PMC 347328 . PMID 6296828 .   
  17. ^ Conn PM, Rogers DC, Stewart JM, Niedel J, Sheffield T (апрель 1982). «Превращение антагониста гонадотропин-рилизинг-гормона в агонист». Природа . 296 (5858): 653–5. Bibcode : 1982Natur.296..653C . DOI : 10.1038 / 296653a0 . PMID 6280058 . S2CID 4303982 .  
  18. ^ Nimczick МЫ, Pemp D, Даррас FH, Чен Х, Гайлман Дж, Деккер М (август 2014). «Синтез и биологическая оценка лигандов двухвалентных каннабиноидных рецепторов на основе бензимидазолов, селективных к hCB₂R, обнаруживают неожиданные внутренние свойства». Биоорганическая и медицинская химия . 22 (15): 3938–46. DOI : 10.1016 / j.bmc.2014.06.008 . PMID 24984935 . 
  19. ^ Russo O, Berthouze M, Гинер M, Солье JL, Rivail L, Sicsic S, Lezoualc'h F, Jockers R, Berque-Bestel I (сентябрь 2007). «Синтез специфических двухвалентных зондов, которые функционально взаимодействуют с димерами 5-HT (4) рецептора». Журнал медицинской химии . 50 (18): 4482–92. DOI : 10.1021 / jm070552t . PMID 17676726 . 
  20. ^ Сулье ДЛ, Руссо О, Гинер М, Rivail л, Berthouze М, Ongeri S, Мегрэ В, Fischmeister Р, Р Lezoualc'h, Sicsic S, Berque-Bestel I (октябрь 2005 г.). «Дизайн и синтез специфических зондов для исследований димеризации человеческого рецептора 5-HT4». Журнал медицинской химии . 48 (20): 6220–8. DOI : 10.1021 / jm050234z . PMID 16190749 . 
  21. ^ a b Busnelli M, Kleinau G, Muttenthaler M, Stoev S, Manning M, Bibic L, Howell LA, McCormick PJ, Di Lascio S, Braida D, Sala M, Rovati GE, Bellini T, Chini B (август 2016). «Дизайн и характеристика суперпотентных бивалентных лигандов, нацеленных на димеры рецептора окситоцина через канально-подобную структуру» . Журнал медицинской химии . 59 (15): 7152–66. DOI : 10.1021 / acs.jmedchem.6b00564 . PMID 27420737 . 
  22. ^ Lensing CJ, Adank DN, Wilber SL, Freeman KT, Schnell SM, Speth RC, Zarth AT, Haskell-Luevano C (февраль 2017 г.). "Прямое сравнение in vivo моновалентного агониста меланокортина Ac-His-DPhe-Arg-Trp-NH2 с двухвалентным агонистом Ac-His-DPhe-Arg-Trp-PEDG20-His-DPhe-Arg-Trp-NH2: двухвалентный Преимущество » . ACS Chemical Neuroscience . 8 (6): 1262–1278. DOI : 10.1021 / acschemneuro.6b00399 . PMC 5679024 . PMID 28128928 .  
  23. ^ а б Сюй Л., Джосан Дж. С., Вагнер Дж., Каплан М. Р., Хруби В. Дж., Маш Е. А., Линч Р. М., Морс Д. Л., Гиллис Р. Дж. (декабрь 2012 г.). «Гетеробивалентные лиганды нацелены на комбинации рецепторов клеточной поверхности in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (52): 21295–300. Bibcode : 2012PNAS..10921295X . DOI : 10.1073 / pnas.1211762109 . JSTOR 42553664 . PMC 3535626 . PMID 23236171 .   
  24. ^ a b Lensing CJ, Freeman KT, Schnell SM, Adank DN, Speth RC, Haskell-Luevano C (апрель 2016 г.). «Исследование in vitro и in vivo бивалентных лигандов, которые демонстрируют предпочтительное связывание и функциональную активность для различных гомодимеров рецепторов меланокортина» . Журнал медицинской химии . 59 (7): 3112–28. DOI : 10.1021 / acs.jmedchem.5b01894 . PMC 5679017 . PMID 26959173 .  
  25. ^ Shonberg J, Scammells PJ, Капуано B (июнь 2011). «Стратегии дизайна для двухвалентных лигандов, нацеленных на GPCR». ChemMedChem . 6 (6): 963–74. DOI : 10.1002 / cmdc.201100101 . PMID 21520422 . S2CID 10561038 .  
  26. ^ Berque-Bestel I, Lezoualc'h F, Jockers R (декабрь 2008 г.). «Бивалентные лиганды как специфические фармакологические инструменты для димеров рецепторов, связанных с G-белком». Современные технологии открытия лекарств . 5 (4): 312–8. DOI : 10.2174 / 157016308786733591 . PMID 19075611 . 
  27. ^ Akgün E, Джавед М.И., Lunzer М.М., Пауэрс MD, Sham YY, Watanabe Y, Portoghese PS (ноябрь 2015). «Ингибирование воспалительной и невропатической боли путем нацеливания на опиоидный рецептор Mu / хемокиновый рецептор5 гетеромер (MOR-CCR5)» . Журнал медицинской химии . 58 (21): 8647–57. DOI : 10.1021 / acs.jmedchem.5b01245 . PMC 5055304 . PMID 26451468 .  
  28. ↑ Daniels DJ, Lenard NR, Etienne CL, Law PY, Roerig SC, Portoghese PS (декабрь 2005 г.). «Индуцированная опиоидами толерантность и зависимость у мышей модулируется расстоянием между фармакофорами в серии двухвалентных лигандов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (52): 19208–13. Bibcode : 2005PNAS..10219208D . DOI : 10.1073 / pnas.0506627102 . JSTOR 4152590 . PMC 1323165 . PMID 16365317 .   
  29. ^ Smeester Б.А., Lunzer М.М., Akgün E, Beitz AJ, Portoghese PS (ноябрь 2014). «Нацеливание на предполагаемые гетеромеры мю-опиоидного / метаботропного глутаматного рецептора-5 приводит к сильной антиноцицепции в модели хронического рака кости у мышей» . Европейский журнал фармакологии . 743 : 48–52. DOI : 10.1016 / j.ejphar.2014.09.008 . PMC 4259840 . PMID 25239072 .  
  30. ^ Abrusan G, Marsh JA (2019). «Сворачивание, сборка и деградация гомомерных белковых комплексов структур сайта связывания лиганда» . Журнал молекулярной биологии . 431 (19): 3871–3888. DOI : 10.1016 / j.jmb.2019.07.014 . PMC 6739599 . PMID 31306664 .  
  31. ^ Abrusan G, Marsh JA (2018). «Структура сайта связывания лиганда влияет на эволюцию функции и топологии белкового комплекса» . Сотовые отчеты . 22 (12): 3265–3276. DOI : 10.1016 / j.celrep.2018.02.085 . PMC 5873459 . PMID 29562182 .  
  32. ^ Abrusan G, Marsh JA (2019). «Структура лиганд-связывающего сайта формирует аллостерическую передачу сигнала и эволюцию аллостерии в белковых комплексах» . Молекулярная биология и эволюция . 36 (8): 1711–1727. DOI : 10.1093 / molbev / msz093 . PMC 6657754 . PMID 31004156 .  
  33. ^ Вельш ME, Снайдер SA, Стокуэлл BR (июнь 2010). «Привилегированные эшафоты для дизайна библиотеки и открытия лекарств» . Текущее мнение в химической биологии . 14 (3): 347–61. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2010.02.018 . PMC 2908274 . PMID 20303320 .  
  34. ↑ Комбаров Р., Алтьери А., Генис Д., Кирпиченок М., Кочубей В., Ракитина Н., Титаренко З. (февраль 2010 г.). «BioCores: идентификация привилегированного структурного мотива на основе лекарственного средства / натурального продукта для открытия низкомолекулярного свинца». Молекулярное разнообразие . 14 (1): 193–200. DOI : 10.1007 / s11030-009-9157-5 . PMID 19468851 . S2CID 23331540 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • BindingDB , общедоступная база данных измеренных аффинностей связывания белок-лиганд.
  • BioLiP , обширная база данных по взаимодействиям лиганд-белок.