Лизидин (нуклеозид)

Лизидин (нуклеозид)
Имена

Название ИЮПАК 2-амино-6- [4-амино-1- (3,4-дигидрокси-5-hydroxymethyloxolan-2-ил) -1 - Н -пиримидин-2-илиденамино] капроновой кислоты
Другие имена 4-амино-2- (N (6) -лизино) -1-рибофуранозилпиримидин
Идентификаторы
Количество CAS	144796-96-3^Y
3D модель ( JSmol )	Интерактивное изображение
ChemSpider	24604124^N
PubChem CID	44124149
CompTox Dashboard ( EPA )	DTXSID20657499
ИнЧИ InChI = 1S / C15H25N5O6 / c16-8 (14 (24) 25) 3-1-2-5-18-15-19-10 (17) 4-6-20 (15) 13-12 (23) 11 ( 22) 9 (7-21) 26-13 / ч 4,6,8-9,11-13,21-23H, 1-3,5,7,16H2, (H, 24,25) (H2,17, 18,19) / t8-, 9 +, 11 +, 12 +, 13 + / m0 / s1 Ключ: MDWUIKMWKDMPDE-IINAIABHSA-N
Улыбки OC [C @ H] 1O [C @@ H] (N2C = CC (N) = N / C2 = N \ CCCC [C @ H] (N) C (O) = O) [C @ H] (O ) [C @@ H] 1O
Характеристики
Химическая формула	C ₁₅ H ₂₅ N ₅ O ₆
Молярная масса	371,39 г / моль
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
N проверить ( что есть ?)^YN
Ссылки на инфобоксы

Лизидин - необычный нуклеозид , редко встречающийся вне тРНК . Это производное цитидина, в котором карбонил заменен аминокислотой лизином . Третью позицию в анти-кодоне в изолейцине-специфическом тРНК, как правило , изменяется от цитидина , который бы с парным гуанозином к lysidine , который будет пара оснований с аденозином . Уридин не может быть использован в этом положении, даже если он является обычным партнером аденозина, поскольку он также будет « колебать пару оснований » с гуанозином. Таким образом, лизидин обеспечивает лучшую точность перевода. ^[1]^[2]

Пары оснований лизидина с аденозином в контексте пары оснований цитидин-гуанозин. R = рибоза. Стрелки указывают водородные связи, идущие от водорода к акцептору связи. Обозначение лизидина, L , приведено выше.

Ссылки [ править ]

^ Наканиши К., Фукаи С., Икеучи Ю. и др. (Май 2005 г.). «Структурная основа образования лизидина АТФ-пирофосфатазой в сопровождении лизин-специфической петли и домена распознавания тРНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (21): 7487–7492. DOI : 10.1073 / pnas.0501003102 . PMC 1140429 . PMID 15894617 .
^ Salowe С.П., Wiltsie Дж, Хокинс JC, Sonatore Л.М. (10 апреля 2009). «Каталитическая гибкость тРНКил-лизидинсинтетазы может генерировать альтернативные субстраты тРНК для изолейцил-тРНК синтетазы» . J Biol Chem . 284 (15): 9656–9662. DOI : 10.1074 / jbc.M809013200 . PMC 2665086 . PMID 19233850 .

[1] Наканиши К., Фукаи С., Икеучи Ю. и др. (Май 2005 г.). «Структурная основа образования лизидина АТФ-пирофосфатазой в сопровождении лизин-специфической петли и домена распознавания тРНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (21): 7487–7492. DOI : 10.1073 / pnas.0501003102 . PMC 1140429 . PMID 15894617 .

[2] Salowe С.П., Wiltsie Дж, Хокинс JC, Sonatore Л.М. (10 апреля 2009). «Каталитическая гибкость тРНКил-лизидинсинтетазы может генерировать альтернативные субстраты тРНК для изолейцил-тРНК синтетазы» . J Biol Chem . 284 (15): 9656–9662. DOI : 10.1074 / jbc.M809013200 . PMC 2665086 . PMID 19233850 .

[1]