Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Часть серии по
Микробиомы
Растение microbiota.png
Микробиомы растений
Морские микробиомы
Микробиомы человека
Другие микробиомы
Микробиота
Голобионты
  • Родолит
  • Гологеномика
  • Гологеномная теория эволюции
Связанный
  • Дисбактериоз
  • Гнотобиоз
  • Фитобиом
  • Проверка кворума
  • Биологическая темная материя
  • Биология микробной популяции
  • Микробное сотрудничество
  • Метагеномика
    • популярный
  • Метатранскриптомика
  • Метаболомика
  • Пангеном
  • Суперорганизм
  • Симбиогенез
Проекты
  • Проект человеческого микробиома
  • Проект "Микробиом Земли"
  • v
  • т
  • е

Все животные на Земле образуют ассоциации с микроорганизмами, включая протистов, бактерии, археи, грибы и вирусы. В океане взаимоотношения животных и микробов исторически изучались в системах с одним хозяином и симбионтом. Тем не менее, новые исследования разнообразия микроорганизмов, связанных с различными морскими животными-хозяевами, продвигают область исследований, направленных на взаимодействие между животным-хозяином и более многомерным микробиомом. Возможность микробиомов влиять на здоровье, физиологию, поведение и экологию морских животных может изменить текущие представления о том, как морские животные адаптируются к изменениям, и особенно к растущим изменениям, связанным с климатом и антропогенным воздействием, уже влияющим на океанскую среду. [1]

Фон [ править ]

В условиях огромного биологического разнообразия, которое населяет мировые океаны, было бы сложно найти эукариотический организм , который не жил бы в тесных отношениях с микробным партнером . [2] Такие симбиозы , т. Е. Постоянные взаимодействия между хозяином и микробом, при которых ни один из партнеров не получает вреда и хотя бы один из них получает пользу, распространены повсеместно от мелководных рифов до глубоководных гидротермальных жерл . Исследования на кораллах , [3] губки , [4] и моллюски  [5] [6] [7]выявили некоторые из чрезвычайно важных симбиотических ролей, которые микробы играют в жизни своих хозяев. Однако в этих исследованиях основное внимание уделялось небольшому количеству конкретных таксонов микробов. Напротив, большинство хозяев сохраняют группы из многих сотен различных микробов (например, микробиом , [8] [9], который сам по себе может изменяться на протяжении онтогенеза хозяина и в результате нарушений окружающей среды. [10] [11] [ 12]В отличие от микробов, связанных с хозяином, которые функционируют независимо, сложные микробиомы, состоящие из нескольких групп, оказывают большое влияние на приспособленность и функции своих хозяев. Изучение этих сложных взаимодействий и биологических результатов является трудным, но для понимания происхождения и эволюции организмов и популяций, а также структуры и функции сообществ и экосистем необходимо углубить понимание симбиозов в системах хозяин – микробиом. [13] [14] [2]

Взаимоотношения между хозяином и микробиомом морских животных
Обычно считается, что отношения существуют в симбиотическом состоянии и обычно подвергаются воздействию факторов окружающей среды и специфических для животных факторов, которые могут вызывать естественные вариации. Некоторые события могут превратить отношения в функционирующее, но измененное симбиотическое состояние, тогда как экстремальные стрессовые события могут вызвать дисбактериоз или разрыв отношений и взаимодействий. [1]

Есть много нерешенных вопросов в области экологии и эволюции, которые можно было бы решить, расширив филогенетический и экологический диапазон исследований микробиома, связанного с хозяином, включая все возможные взаимодействия в микробиоме. Существуют убедительные эмпирические данные и новый консенсус в отношении того, что биоразнообразие (то есть богатство видов и их взаимодействия) повсеместно влияет на функционирование экосистем Земли, включая продуктивность экосистем. [15] [16] Однако это исследование было сосредоточено почти исключительно на макроорганизмах. Поскольку микробные симбионты являются неотъемлемой частью большинства живых организмов [11] [17], понимание того, как микробные симбионты вносят вклад в производительность и адаптивность хозяина, нуждается в расширении. [2]

Основы продуктивных экосистем [ править ]

Инженеры экосистем , такие как многие виды кораллов, глубоководные мидии и трубчатые черви гидротермальных источников , вносят свой вклад в первичную продуктивность и создают структурные среды обитания и питательные ресурсы, которые являются основой их соответствующих экосистем. [18] Все эти таксоны вступают в мутуалистический пищевой симбиоз с микробами. Существует множество примеров морских питательных мутуализмов, в которых микробы позволяют хозяевам использовать ресурсы или субстраты, которые в противном случае недоступны одному хозяину. Такие симбиозы были подробно описаны в восстановленных и бескислородных отложениях (например, lucinid моллюсков , stilbonematid нематод и безвольнойoligochaetes ) и гидротермальные источники (например, гигантский трубчатый червь или глубоководные мидии ). [19] Более того, многие основные виды морских макроводорослей являются витаминными ауксотрофами (например, половина из более чем 300 исследованных видов были неспособны синтезировать кобаламин ), и их продуктивность зависит от снабжения их эпифитными бактериями. [20] Рифы часто состоят из каменных кораллов , что является одним из самых известных примеров мутуалистического симбиоза, в котором динофлагеллятная водоросль Symbiodiniaceae снабжает коралл глюкозой., глицерин и аминокислоты , в то время как коралл обеспечивает водоросли защищенной средой и ограничивающими соединениями (например, видами азота), необходимыми для фотосинтеза. Однако это классический пример мутуалистического симбиоза, чувствительного к нарушениям окружающей среды, которые могут нарушить хрупкие взаимодействия между хозяином и микробом. Когда рифы становятся теплыми и эвтрофными, мутуалистические Symbiodiniaceae могут вызвать повреждение клеток хозяина и / или секвестировать больше ресурсов для собственного роста, тем самым нанося вред своим хозяевам и паразитируя их. [21] [22] Рифовые рыбы , которые ищут пристанище на коралловых рифах., важны для восстановления кораллов после беспокойства. Бактерии Epulopiscium в кишечнике рыб-хирургов вырабатывают ферменты, которые позволяют их хозяевам переваривать сложные полисахариды , позволяя рыбе-хозяину питаться жесткими кожистыми красными и коричневыми макроводорослями. [23] Это трофическое нововведение способствовало диверсификации ниши среди травоядных коралловых рифов . Рыбы-хирурги имеют решающее значение для функционирования коралловых рифов Индо-Тихоокеанского региона, поскольку они являются одними из немногих рыб, способных поедать крупные макроводоросли, цветущие после нарушения экосистемы и препятствующие восстановлению кораллов. [24] [2]

Глубоководный гидротермальный источник
Глубоководная мидия Bathymodiolus childressi зависит от внутриклеточных метанотрофных бактерий в жабрах как источника углерода.
Бездонный червь Olavius ​​algarvensis зависит от симбиотических бактерий, живущих под его кутикулой, в качестве источника пищи. Бактерии ответственны за ярко-белый вид червей.
Возможная динамика в симбиозе с водными инфузориями в качестве хозяина
Черный круг: макронуклеус, белый большой круг: пищевые вакуоли, зеленые круги: фототрофы, коричневые круги: хемоавтотрофы, желтые овалы: гетеротрофные прокариоты

Наряду с более стандартными примерами пищевого симбиоза у животных, недавние достижения в технологии секвенирования генома привели к открытию многих эндосимбиотических ассоциаций у морских протистов (протист - это общий термин, обозначающий немонофилетическую коллекцию одноклеточных эукариот , которые не являются грибов или в группе Plantae ) .Это иллюстрирует включение эндосимбионтами различных новых биохимических функций, таких как фотосинтез, фиксация и рециркуляция азота, а также метаногенез в протистных хозяевах. [25]Эндосимбиоз у протистов широко распространен и представляет собой важный источник инноваций. Неизвестные ранее метаболические инновации морских микробных симбиозов, которые имеют экологически важное значение, обнаруживаются регулярно. [26] Например, Candidatus Kentron (клада Gammaproteobacteria, обнаруженная в ассоциации с инфузориями ) питает своих реснитчатых хозяев из рода Kentrophoros и перерабатывает ацетат и пропионат , которые представляют собой малоценные продукты клеточного отхода от их хозяев, в биомассу . [27] Другой пример - анаэробная морская инфузория Strombidium purpureum .[28] Инфузории живут в анаэробных условиях исодержатэндосимбиотические пурпурные несерные бактерии , содержащие как бактериохлорофилл а, так и спириллоксантин. Эндосимбионты фотосинтетически активны; следовательно, этот симбиоз представляет собой эволюционный переход от аэробного организма к анаэробному с включением органелл . [2]

Размножение и развитие хозяина [ править ]

Помимо пищевых симбиозов, микробные симбионты могут изменять воспроизводство, развитие и рост своих хозяев. Конкретные бактериальные штаммы в морских биопленках часто напрямую контролируют пополнение планктонных личинок и пропагул, либо подавляя оседание, либо выступая в качестве сигнала для заселения. [29] [30] Например, оседание зооспор зеленой водоросли Ulva Кишечник на биопленках определенных бактерий опосредуется их притяжением к молекуле, чувствительной к кворуму, ацил-гомосериновому лактону, секретируемому бактериями. [31] Классические примеры зависимости развития морских хозяев от микробов включают наблюдение, что культуры водорослей, выращенные изолированно, демонстрируют аномальную морфологию  [32]и последующее открытие соединений, индуцирующих морфогенез, таких как таллузин, секретируемых эпифитными бактериальными симбионтами. [33] Также известно, что бактерии влияют на рост морских растений, макроводорослей и фитопланктона, секретируя фитогормоны, такие как индолуксусная кислота и гормоны цитокининового типа. [34] [35] [36] У морской хоанофлагелляты Salpingoeca rosetta и многоклеточность, и размножение запускаются определенными бактериальными сигналами, что дает представление об истоках бактериального контроля над развитием животных (обзор Woznica и King). [37]В свою очередь, выгода для бактерий заключается в том, что они получают физическое пространство для колонизации в определенных точках водной толщи, обычно доступных только для планктонных микробов. Возможно, наиболее изученным примером интимных взаимодействий хозяина и микробов, контролирующих развитие животных, являются сколопы гавайского бобтейла Euprymna. [38] Он живет в мутуалистическом симбиозе с биолюминесцентными бактериями Aliivibrio fischeri. Бактерии кормят хозяином раствором сахаров и аминокислот и, в свою очередь, обеспечивают биолюминесценцию для противодействия затенению и избеганию хищников. [7]Такое взаимопонимание с микробами обеспечивает селективное преимущество кальмаров во взаимодействиях хищник-жертва. Другой пример беспозвоночных может быть обнаружен у трубочников, у которых метаморфоз Hydroides elegans опосредуется бактериальным индуктором и передачей сигналов митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK) в биопленках. [39] [2]

Биообрастание и собрание сообщества микробов [ править ]

Некоторые микробы, связанные с хозяином, производят соединения, которые предотвращают биообрастание и регулируют сборку и поддержание микробиома у многих морских организмов, включая губки, макроводоросли и кораллы. [40] [41] Например, тропические кораллы содержат в своем поверхностном слое слизи различные бактерии, которые продуцируют кворум-чувствительные ингибиторы и другие антибактериальные соединения в качестве защиты от колонизации и заражения потенциальными микробными патогенами. [3] Эпифитные бактерии морских макроводорослей выделяют разнообразный химический арсенал, способный избирательно формировать дальнейшую бактериальную колонизацию и сдерживать расселение морских беспозвоночных, образующихся при биообрастании, таких как мшанки. [34] [42]Как и в случае кораллов, эти разнообразные микробно-секретируемые соединения включают не только бактерицидные и бактериостатические антибиотики, но также такие соединения, как галогенированные фураноны, циклические дипептиды и имитаторы лактона ацил-гомосерина, которые нарушают восприятие кворума бактерий и ингибируют образование биопленок. [43] Бактерии, вероятно, способны использовать богатый углеродом экссудат своих хозяев. [44] [45] Например, в случае гигантских водорослей водоросли выделяют примерно 20% первичной продукции в виде растворенного органического углерода. [45]Принимая во внимание, что эти предыдущие примеры иллюстрируют, как микробиомы могут защитить хозяев от поверхностной колонизации, аналогичное явление также наблюдалось внутри судового червя Bankia setacea, при котором симбионты продуцируют боронированный антибиотик тартролон, который, как считается, защищает переваривающую древесину слепую кишку от бактериальных загрязнителей. [46] Производя противомикробные соединения, эти микробы могут защищать свою нишу, чтобы другие организмы не вытеснили их. [2]

Биогеохимический цикл [ править ]

Часть серии обзоров по
морская жизнь
  • Морские места обитания
  • Морские микроорганизмы
  • Морские микробиомы
  • Морские вирусы
  • Морские прокариоты
  • Морские протисты
  • Морские грибы
  • Морские беспозвоночные
  • Морские позвоночные
  • Морское первичное производство
  • Морская пищевая сеть
  • Морской угольный насос
  • Морские биогеохимические циклы
  • Влияние человека на морскую жизнь
  • Сохранение морской среды
  • Морская биология
 Портал морской жизни
  • v
  • т
  • е

Связанные с хозяином микробиомы также влияют на биогеохимический круговорот внутри экосистем, оказывая каскадное воздействие на биоразнообразие и экосистемные процессы. Например, микробные симбионты составляют до 40% биомассы своих губок-хозяев. [47] Посредством процесса, называемого «петля губки», они превращают растворенный органический углерод, выделяемый рифовыми организмами, в органический углерод в виде частиц, который может потребляться гетеротрофными организмами. [4]Наряду с мутуализмом кораллов и Symbiodiniaceae, этот симбиоз губок и бактерий помогает объяснить парадокс Дарвина, то есть, насколько высокопродуктивные экосистемы коралловых рифов существуют в пределах олиготрофных тропических морей. Некоторые симбионты губок играют значительную роль в круговороте морского фосфора, связывая питательные вещества в форме гранул полифосфата в тканях своего хозяина  [48] и циркулируя азотом, например, посредством нитрификации, денитрификации и окисления аммиака. [4] [41] ]. Многие бактерии, ассоциированные с макроводорослями, специально адаптированы для разложения сложных полисахаридов водорослей (например, фукоидана, порфирана и ламинарина {{hsp]} [49] [50] ) и изменения как качества, так и количества органического углерода, поступающего в экосистему.[44] [51] Окисляющие серу эндосимбионты жабр люцинидных моллюсков способствуют первичной продуктивности посредством хемосинтеза и способствуют росту морских трав (важных видов-оснований) за счет снижения концентрации сульфидов в тропических отложениях. [52] Гаммапротеобактериальные симбионты моллюсков-люцинидов и нематод стильбонематид также недавно показали способность к азотфиксации (геномы бактериальных симбионтов кодируют и экспрессируют гены нитрогеназ [53], что подчеркивает роль симбиотических микробов в круговороте питательных веществ в мелководных морских системах [2]. ]

Эти примеры демонстрируют важность микробных симбиозов для функционирования океанских экосистем. Понимание симбиозов с таким же уровнем детализации в контексте сложных сообществ (то есть целых микробиомов) еще созрело для исследования и, действительно, требует более интегрированной структуры из областей микробиологии, эволюционной биологии, экологии сообществ и океанографии. Отдельные таксоны в микробиоме могут помочь хозяевам противостоять широкому спектру условий окружающей среды, в том числе прогнозируемым в сценариях изменения климата. Затем мы исследуем два разных пути того, как междисциплинарное сотрудничество может продвинуть это направление исследований. [2]

Примеры [ править ]

Отношения между кораллами и их микробными симбионтами [54]

Микробиомы различных морских животных в настоящее время изучаются, от простых организмов, включая губки [55] и гребневики [56], до более сложных организмов, таких как морские сквирты [57] и акулы. [58] [1]

Отношения между гавайским кальмаром бобтейл и биолюминесцентной бактерией Aliivibrio fischeri - одно из наиболее изученных симбиотических взаимоотношений в море и система выбора для общих исследований симбиоза. Эта взаимосвязь дала представление о фундаментальных процессах симбиоза животных и микробов, и особенно о биохимических взаимодействиях и передаче сигналов между хозяином и бактерией. [59] [60] [1]

Еще один относительно хорошо изученный морской хозяин микробов - это кишечный морской олигохетный червь Olavius ​​algarvensis . Эти трехсантиметровые черви обитают в мелководных морских отложениях Средиземного моря. Черви не содержат ротовой полости, пищеварительной или выделительной системы, а вместо этого питаются с помощью набора внеклеточных бактериальных эндосимбионтов, которые живут при скоординированном использовании серы, присутствующей в окружающей среде. [61] В этой системе используются одни из самых сложных инструментов визуализации и омики. [62] Например, зондирование с несколькими метками улучшило визуализацию микробиома [63]транскриптомика и протеомика применялись для изучения взаимодействий хозяин-микробиом, включая передачу энергии между хозяином и микробами [64] и распознавание консорциума врожденной иммунной системой червя. [65] Основная сила этой системы заключается в том, что она предлагает возможность изучать взаимодействия хозяина и микробиома с микробным консорциумом с низким разнообразием, а также предлагает ряд ресурсов генома хозяина и микробов [62] [66] [1]

Кораллы [ править ]

Кораллы - один из наиболее распространенных примеров животных-хозяев, чей симбиоз с микроводорослями может перерасти в дисбактериоз, что заметно проявляется как обесцвечивание. Микробиомы кораллов были изучены в различных исследованиях, которые демонстрируют, как изменения в окружающей среде океана, особенно температура, свет и неорганические питательные вещества, влияют на численность и производительность симбионтов микроводорослей, а также на кальцификацию и физиологию хозяина. [67] [68]Исследования также показали, что резидентные бактерии, археи и грибы дополнительно способствуют круговороту питательных и органических веществ в коралле, при этом вирусы также, возможно, играют роль в структурировании состава этих членов, тем самым давая одно из первых взглядов на множественные процессы. симбиоз морских животных домена. [69] гамма-протеобактерии Endozoicomonas становится центральным членом микробиомом в коралла, с гибкостью в ее жизни. [70] [71] Учитывая недавнее массовое обесцвечивание рифов, [72] кораллы, вероятно, останутся полезной и популярной системой для исследования симбиоза и дисбиоза. [1]

Губки [ править ]

Губки являются обычными членами разнообразных бентосных местообитаний океана, и их изобилие и способность фильтровать большие объемы морской воды привели к осознанию того, что эти организмы играют решающую роль в влиянии на бентические и пелагические процессы в океане. [73] Это одна из старейших линий животных, и у них относительно простое строение тела, которое обычно ассоциируется с бактериями, архей, простейшими водорослями, грибами и вирусами. [4] Микробиомы губок состоят из специалистов и специалистов широкого профиля, и сложность их микробиома, по-видимому, определяется филогенией хозяина. [74] Исследования показали, что микробиом губок способствует круговороту азота в океанах, особенно за счет окисления аммиака архей и бактерий.[75] [76] Совсем недавно было показано, что микробные симбионты тропических губок производят и хранят гранулы полифосфата, [77], возможно, позволяя хозяину пережить периоды истощения фосфатов в олиготрофной морской среде. [78] Микробиомы некоторых видов губок, по-видимому, изменяются в структуре сообщества в ответ на изменение условий окружающей среды, включая температуру [79] и закисление океана, [80] [81], а также синергетические воздействия. [82]

Морские холобионты [ править ]

Дополнительная информация: Holobiont

Кораллы-строители рифов - это холобионты, которые включают в себя сам коралл (эукариотическое беспозвоночное в классе Anthozoa ), фотосинтетические динофлагелляты, называемые зооксантеллами ( Symbiodinium ), и связанные с ними бактерии и вирусы. [83] Модели коэволюции существуют для сообществ коралловых микробов и филогении кораллов. [84]

  • Коралловый холобионт [85]

  • Холобионт из водорослей [86]

  • Губка холобионт [41]

  • Изменение климата и родолит-холобионт [87]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d e f Апприл, А. (2017) «Микробиомы морских животных: к пониманию взаимодействий между хозяином и микробиомом в меняющемся океане». Frontiers в области морских наук , 4 : 222. DOI : 10,3389 / fmars.2017.00222 . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  2. ^ a b c d e f g h i Wilkins, Laetitia GE; Лере, Матье; о'Ди, Аарон; Юэн, Бенедикт; Peixoto, Raquel S .; Pereira, Tiago J .; Бик, Холли М .; Катушка, Дэвид А .; Даффи, Дж. Эммет; Эрре, Эдвард Аллен; Lessios, Harilaos A .; Люси, Ноэль М .; Mejia, Luis C .; Рашер, Дуглас Б.; Sharp, Koty H .; Согин, Эмилия М .; Такер, Роберт В .; Вега Тербер, Ребекка; Wcislo, William T .; Уилбанкс, Элизабет Дж .; Эйзен, Джонатан А. (2019). «Связанные с хозяином микробиомы управляют структурой и функцией морских экосистем» . PLOS Биология . 17 (11): e3000533. DOI : 10.1371 / journal.pbio.3000533 . ЧВК 6874084 . PMID  31710600 . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  3. ^ a b Krediet, Cory J .; Ричи, Ким Б.; Пол, Валери Дж .; Теплицкий, Макс (2013). «Связанные с кораллами микроорганизмы и их роль в укреплении здоровья кораллов и предотвращении болезней» . Труды Королевского общества B: биологические науки . 280 (1755). DOI : 10.1098 / rspb.2012.2328 . PMC 3574386 . PMID 23363627 .  
  4. ^ a b c d Вебстер, Николь С .; Томас, Торстен (2016). «Гологеном Губки» . mBio . 7 (2): e00135-16. DOI : 10,1128 / mBio.00135-16 . PMC 4850255 . PMID 27103626 .  
  5. ^ Дистел, DL; Делонг, Э.Ф .; Уотербери, Дж. Б. (1991). «Филогенетическая характеристика и локализация in situ бактериального симбионта корабельных червей (Teredinidae: Bivalvia) с использованием анализа последовательности 16S рРНК и гибридизации олигодезоксинуклеотидного зонда» . Прикладная и экологическая микробиология . 57 (8): 2376–2382. DOI : 10,1128 / AEM.57.8.2376-2382.1991 . PMC 183578 . PMID 1722662 .  
  6. ^ Рюланд, Кэролайн; Blazejak, Анна; Лотт, Кристиан; Лой, Александр; Эрсеус, Кристер; Дубилье, Николь (2008). «Множественные бактериальные симбионты двух видов одновременно встречающихся кишечных червей-олигохет из донных отложений средиземноморских морских трав». Экологическая микробиология . 10 (12): 3404–3416. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2008.01728.x . PMID 18764872 . 
  7. ^ a b Nyholm, Spencer V .; Макфолл-Нгай, Маргарет (2004). «Рассеивание: установление симбиоза кальмаров и вибрионов». Обзоры природы микробиологии . 2 (8): 632–642. DOI : 10.1038 / nrmicro957 . PMID 15263898 . S2CID 21583331 .  
  8. ^ Хаммер, Тобин Дж .; Сандерс, Джон Дж .; Фирер, Ной (2019). «Не всем животным нужен микробиом». Письма о микробиологии FEMS . 366 (10). DOI : 10.1093 / femsle / fnz117 . PMID 31132110 . 
  9. ^ Типтон, Лаура; Дарси, Джон Л .; Хинсон, Николь А. (2019). «Развивающийся симбиоз: возможность перекрестного общения между экологами и учеными-микробиомами» . Границы микробиологии . 10 : 292. DOI : 10,3389 / fmicb.2019.00292 . PMC 6391321 . PMID 30842763 .  
  10. ^ Април, Эми (2017). «Микробиомы морских животных: к пониманию взаимодействия хозяина и микробиома в меняющемся океане». Границы морских наук . 4 . DOI : 10.3389 / fmars.2017.00222 . S2CID 9729436 . 
  11. ^ а б Макфолл-Нгай, Маргарет; Хэдфилд, Майкл Дж .; Bosch, Thomas CG; Кэри, Ханна В .; Домазет-Лошо, Томислав; Дуглас, Анджела Э .; Дубилье, Николь; Эберл, Жерар; Фуками, Тадаши; Гилберт, Скотт Ф .; Hentschel, Ute; Король, Николь; Кьеллеберг, Стаффан; Knoll, Andrew H .; Кремер, Наташа; Мазманян, Саркис К .; Меткалф, Джессика Л .; Нилсон, Кеннет; Пирс, Наоми Э .; Ролз, Джон Ф .; Рид, Энн; Руби, Эдвард Дж .; Румфо, Мэри; Сандерс, Джон Дж .; Тауц, Дитхард; Вернегрин, Дженнифер Дж. (2013). «Животные в бактериальном мире - новый императив для наук о жизни» . Труды Национальной академии наук . 110 (9): 3229–3236. Bibcode : 2013PNAS..110.3229M . Дои: 10.1073 / pnas.1218525110 . PMC  3587249 . PMID  23391737 .
  12. ^ Вебстер, Николь S .; Тейлор, Майкл В. (2012). «Морские губки и их микробные симбионты: Любовь и другие отношения». Экологическая микробиология . 14 (2): 335–346. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2011.02460.x . PMID 21443739 . 
  13. ^ Азам, Ф .; Уорден, Аризона (2004). «ОКЕАНОГРАФИЯ: микробы, молекулы и морские экосистемы». Наука . 303 (5664): 1622–1624. DOI : 10.1126 / science.1093892 . PMID 15016987 . S2CID 10101482 .  
  14. ^ Кавиккиоли, Рикардо; и другие. (2019). «Предупреждение ученых человечеству: микроорганизмы и изменение климата» . Обзоры природы микробиологии . 17 (9): 569–586. DOI : 10.1038 / s41579-019-0222-5 . PMC 7136171 . PMID 31213707 .  
  15. ^ Даффи, Дж. Эмметт; Годвин, Кейси М .; Кардинале, Брэдли Дж. (2017). «Воздействие на биоразнообразие в дикой природе является обычным явлением и столь же сильным, как и ключевые факторы производительности». Природа . 549 (7671): 261–264. Bibcode : 2017Natur.549..261D . DOI : 10.1038 / nature23886 . PMID 28869964 . S2CID 4459856 .  
  16. ^ Кардинале, Брэдли Дж .; Даффи, Дж. Эммет; Гонсалес, Эндрю; Хупер, Дэвид У .; Перрингс, Чарльз; Венейл, Патрик; Нарвани, Анита; Булава, Джорджина М .; Тилман, Дэвид; Уордл, Дэвид А .; Kinzig, Ann P .; Daily, Gretchen C .; Лоро, Мишель; Грейс, Джеймс Б.; Ларигодери, Энн; Srivastava, Diane S .; Наим, Шахид (2012). «Утрата биоразнообразия и ее влияние на человечество» (PDF) . Природа . 486 (7401): 59–67. Bibcode : 2012Natur.486 ... 59С . DOI : 10.1038 / nature11148 . PMID 22678280 . S2CID 4333166 .   
  17. ^ Гулд, Элисон L .; Чжан, Вивиан; Ламберти, Лиза; Джонс, Эрик В .; Обадиа, Бенджамин; Корасидис, Николаос; Гаврюшкин Алексей; Карлсон, Жан М .; Беренвинкель, Нико; Лудингтон, Уильям Б. (2018). «Микробиом взаимодействий формы хозяин фитнес» . Труды Национальной академии наук . 115 (51): E11951 – E11960. DOI : 10.1073 / pnas.1809349115 . PMC 6304949 . PMID 30510004 .  
  18. ^ Seemann, Янина; Ингст, Александра; Стюарт-Смит, Рик Д .; Эдгар, Грэм Дж .; Альтиери, Эндрю Х. (2018). «Важность губок и мангровых зарослей в поддержке рыбных сообществ деградированных коралловых рифов в Карибском бассейне Панама» . PeerJ . 6 : e4455. DOI : 10,7717 / peerj.4455 . PMC 5878927 . PMID 29610704 .  
  19. ^ о'Брайен, Пол А .; Вебстер, Николь С .; Миллер, Дэвид Дж .; Борн, Дэвид Г. (2019). "Коэволюция микробов-хозяев: применение данных модельных систем к сложным морским беспозвоночным голобионтам" . mBio . 10 (1). DOI : 10,1128 / mBio.02241-18 . PMC 6428750 . PMID 30723123 .  
  20. ^ Крофт, Мартин Т .; Лоуренс, Эндрю Д .; Раук-Дири, Эвелин; Уоррен, Мартин Дж .; Смит, Элисон Г. (2005). «Водоросли приобретают витамин B12 в результате симбиотических отношений с бактериями». Природа . 438 (7064): 90–93. Bibcode : 2005Natur.438 ... 90С . DOI : 10,1038 / природа04056 . PMID 16267554 . S2CID 4328049 .  
  21. ^ Куигли, км; Залив, ЛК; Уиллис, Б.Л. (2018). «Использование новых знаний о регулировании сообщества Symbiodinium в кораллах для сохранения и восстановления рифов». Серия «Прогресс морской экологии» . 600 : 245–253. Bibcode : 2018MEPS..600..245Q . DOI : 10,3354 / meps12652 .
  22. ^ Бейкер, Дэвид М .; Фриман, Кристофер Дж .; Вонг, Джейн CY; Фогель, Мэрилин Л .; Ноултон, Нэнси (2018). «Изменение климата способствует паразитизму в коралловом симбиозе» . Журнал ISME . 12 (3): 921–930. DOI : 10.1038 / s41396-018-0046-8 . PMC 5864192 . PMID 29379177 .  
  23. ^ Нгуги, Дэвид Каманда; Мияке, Соу; Кэхилл, Мэтт; Вину, Маникандан; Хакманн, Тимоти Дж .; Блом, Йохен; Tietbohl, Matthew D .; Берумен, Майкл Л .; Стингл, Ульрих (2017). «Геномная диверсификация гигантских кишечных симбионтов отражает образ жизни хозяина» . Труды Национальной академии наук . 114 (36): E7592 – E7601. DOI : 10.1073 / pnas.1703070114 . PMC 5594648 . PMID 28835538 .  
  24. ^ Хоуи, Эндрю S .; Беллвуд, Дэвид Р. (2009). «Ограниченная функциональная избыточность в системе с большим разнообразием: один вид доминирует в ключевом экологическом процессе на коралловых рифах». Экосистемы . 12 (8): 1316–1328. DOI : 10.1007 / s10021-009-9291-Z . S2CID 42138428 . 
  25. ^ Новак, Ева CM; Мелконян, Майкл (2010). «Эндосимбиотические ассоциации в простейших» . Философские труды Королевского общества B: биологические науки . 365 (1541): 699–712. DOI : 10.1098 / rstb.2009.0188 . PMC 2817226 . PMID 20124339 .  
  26. ^ Хиггс, Николас Д .; Ньютон, Джейсон; Аттрилл, Мартин Дж. (2016). «Карибский промысел колючих омаров поддерживается трофическими субсидиями от первичного хемосинтетического производства». Текущая биология . 26 (24): 3393–3398. DOI : 10.1016 / j.cub.2016.10.034 . PMID 27939312 . S2CID 14401680 .  
  27. ^ Сеа, Брэндон КБ; Антоний, Чаккиат Пол; Хюттель, Бруно; Зажицкий, Ян; Шада фон Боржисковски, Леннарт; Эрб, Тобиас Дж .; Курис, Анджела; Кляйнер, Мануэль; Либеке, Мануэль; Дубилье, Николь; Грубер-Водичка, Харальд Р. (2019). «Сероокисляющие симбионты без канонических генов для автотрофной фиксации CO2» . mBio . 10 (3). DOI : 10,1128 / mBio.01112-19 . PMC 6593406 . PMID 31239380 .  
  28. ^ Гаст, Ребекка Дж .; Сандерс, Роберт В .; Кэрон, Дэвид А. (2009). «Экологические стратегии протистов и их симбиотические отношения с прокариотическими микробами». Тенденции в микробиологии . 17 (12): 563–569. DOI : 10.1016 / j.tim.2009.09.001 . PMID 19828317 . 
  29. ^ Хуанг, Инь; Каллахан, Шон; Хэдфилд, Майкл Г. (2012). «Пополнение в море: бактериальные гены, необходимые для индукции поселения личинок у многощетинкового червя». Научные отчеты . 2 : 228. Bibcode : 2012NatSR ... 2E.228H . DOI : 10.1038 / srep00228 . S2CID 14731587 . 
  30. ^ Delannoy, Сабина; Чавес, Байрон Д .; Исон, Сара А .; Уэбб, Хэтти Э .; Беутин, Лотар; Делаваль, Хосе; Билле, Изабель; Фах, Патрик (2016). «Пересмотр подхода к тестированию STEC: использование espK и espV для повышения надежности обнаружения энтерогеморрагической кишечной палочки (EHEC) в говядине» . Границы микробиологии . 7 : 1. DOI : 10,3389 / fmicb.2016.00001 . PMC 4722105 . PMID 26834723 .  
  31. ^ Уиллер, Глен Л .; Тейт, Карен; Тейлор, Элисон; Браунли, Колин; Совместное, IAN (2006). «Лактоны ацил-гомосерина модулируют скорость оседания зооспор морской водоросли Ulva Кишечник с помощью нового хемокинетического механизма». Растение, клетка и окружающая среда . 29 (4): 608–618. DOI : 10.1111 / j.1365-3040.2005.01440.x . PMID 17080611 . 
  32. ^ Провасоли, Луиджи; Пинтнер, Ирма Дж. (1980). «Бактерии индуцированный полиморфизм в аксеническом лабораторном штамме Ulva Lactuca (Chlorophyceae) 1». Журнал психологии . 16 (2): 196–201. DOI : 10.1111 / j.1529-8817.1980.tb03019.x . S2CID 85817449 . 
  33. ^ Мацуо, Й .; Imagawa, H .; Nishizawa, M .; Шизури, Ю. (2005). «Выделение индуктора морфогенеза водорослей из морской бактерии». Наука . 307 (5715): 1598. DOI : 10.1126 / science.1105486 . PMID 15761147 . S2CID 28850526 .  
  34. ^ a b Goecke, F .; Labes, A .; Wiese, J .; Имхофф, Дж. Ф. (2010). «Химические взаимодействия между морскими макроводорослями и бактериями». Серия «Прогресс морской экологии» . 409 : 267–299. Bibcode : 2010MEPS..409..267G . DOI : 10,3354 / meps08607 .
  35. ^ Амин, SA; Хмело, ЛР; Ван Тол, HM; Дарем, ВР; Карлсон, LT; Heal, KR; Моралес, Р.Л .; Berthiaume, CT; Паркер, MS; Джунаеди, Б .; Ingalls, AE; Parsek, MR; Моран, Массачусетс; Армбраст, Э.В. (2015). «Взаимодействие и передача сигналов между космополитическим фитопланктоном и ассоциированными бактериями». Природа . 522 (7554): 98–101. Bibcode : 2015Natur.522 ... 98А . DOI : 10,1038 / природа14488 . PMID 26017307 . S2CID 4462055 .  
  36. ^ Celdrán, D .; Espinosa, E .; Sánchez-Amat, A .; Марин, А. (2012). «Влияние эпибиотических бактерий на рост листьев и эпифиты морских водорослей Posidonia oceanica». Серия «Прогресс морской экологии» . 456 : 21–27. Bibcode : 2012MEPS..456 ... 21С . DOI : 10,3354 / meps09672 .
  37. ^ Возница, Ариэль; Король, Николь (2018). «Уроки простых морских моделей по бактериальной регуляции развития эукариот» . Текущее мнение в микробиологии . 43 : 108–116. DOI : 10.1016 / j.mib.2017.12.013 . PMC 6051772 . PMID 29331767 .  
  38. ^ Макфолл-Нгаи, Маргарет Дж (2014). «Важность микробов в развитии животных: уроки симбиоза кальмаров и вибрионов» . Ежегодный обзор микробиологии . 68 : 177–194. DOI : 10.1146 / annurev-micro-091313-103654 . PMC 6281398 . PMID 24995875 .  
  39. ^ Шикума, Николас Дж .; Антошечкин Игорь; Medeiros, João M .; Пильхофер, Мартин; Ньюман, Дайан К. (2016). «Поэтапный метаморфоз трубочника Hydroides elegansis, опосредованный бактериальным индуктором и передачей сигналов MAPK». Труды Национальной академии наук . 113 (36): 10097–10102. DOI : 10.1073 / pnas.1603142113 . S2CID 23501584 . 
  40. ^ Krediet, Кори Дж .; Карпиноне, Эмили М .; Ричи, Ким Б.; Теплицкий, Макс (2013). «Характеристика gacA-зависимой поверхности и колонизации коралловой слизи условно-патогенным микроорганизмом кораллов Serratia marcescensPDL100». FEMS Microbiology Ecology . 84 (2): 290–301. DOI : 10.1111 / 1574-6941.12064 . PMID 23278392 . 
  41. ^ a b c Pita L, Rix L, Slaby BM, Franke A, Hentschel U (март 2018 г.). «Губчатый холобионт в меняющемся океане: от микробов до экосистем» . Микробиом . 6 (1): 46. DOI : 10,1186 / s40168-018-0428-1 . PMC 5845141 . PMID 29523192 .   Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  42. ^ Стейнберг, Питер Д .; Де Нис, Рокки (2002). «Химическое посредничество колонизации поверхности водорослей1». Журнал психологии . 38 (4): 621–629. DOI : 10.1046 / j.1529-8817.2002.02042.x . S2CID 83963124 . 
  43. ^ Добрецов, Сергей; Abed, Raeid MM; Теплицкий, Макс (2013). «Мини-обзор: Подавление биообрастания морскими микроорганизмами». Биообрастание . 29 (4): 423–441. DOI : 10.1080 / 08927014.2013.776042 . PMID 23574279 . S2CID 34459128 .  
  44. ^ a b Рид, Дэниел С .; Карлсон, Крейг А .; Halewood, Elisa R .; Нельсон, Дж. Клинтон; Харрер, Шеннон Л .; Рассвайлер, Эндрю; Миллер, Роберт Дж. (2015). "Модели и контроль производства растворенного органического углерода в масштабе рифов гигантскими водорослями M acrocystis pyrifera". Лимнология и океанография . 60 (6): 1996–2008. Bibcode : 2015LimOc..60.1996R . DOI : 10.1002 / lno.10154 .
  45. ^ a b Воллмерс, Джон; Виганд, Сандра; Кастер, Энн-Кристин (2017). «Сравнение и оценка инструментов для сборки метагенома с точки зрения микробиолога - важен не только размер!» . PLOS ONE . 12 (1): e0169662. Bibcode : 2017PLoSO..1269662V . DOI : 10.1371 / journal.pone.0169662 . PMC 5242441 . PMID 28099457 .  
  46. ^ Эльшави, Шериф I .; Trindade-Silva, Amaro E .; Ханора, Амро; Хан, Эндрю В .; Flores, Malem S .; Виццони, Виниций; Schrago, Carlos G .; Соареш, Карлос А .; Concepcion, Gisela P .; Дистел, Дэн Л .; Шмидт, Эрик У .; Хейгуд, Марго Г. (2013). «Боронированный антибиотик тартролон, продуцируемый симбиотическими бактериями, разрушающими целлюлозу, в жабрах корабельных червей» . Труды Национальной академии наук . 110 (4): E295 – E304. DOI : 10.1073 / pnas.1213892110 . PMC 3557025 . PMID 23288898 .  
  47. ^ Де Гоэйдж, Джаспер М .; Ван Овелен, Дик; Vermeij, Mark JA; Осинга, Рональд; Мидделбург, Джек Дж .; Де Гой, Антон ФПМ; Адмираал, Вим (2013). «Выживание в морской пустыне: петля губки удерживает ресурсы в коралловых рифах». Наука . 342 (6154): 108–110. Bibcode : 2013Sci ... 342..108D . DOI : 10.1126 / science.1241981 . PMID 24092742 . S2CID 6720678 .  
  48. ^ Колман, Альберт С. (2015). «Губчатые симбионты и морской цикл P» . Труды Национальной академии наук . 112 (14): 4191–4192. Bibcode : 2015PNAS..112.4191C . DOI : 10.1073 / pnas.1502763112 . PMC 4394276 . PMID 25825737 .  
  49. ^ Corzett, Кристофер Х .; Эльшербини, Джозеф; Chien, Diana M .; Хехеманн, Ян-Хендрик; Хеншель, Андреас; Preheim, Сара П .; Юй Сяоцянь; Альм, Эрик Дж .; Польз, Мартин Ф. (2018). «Эволюция вегетарианского вибриона: метаболическая специализация Vibrio breoganii на субстратах макроводорослей». Журнал бактериологии . 200 (15). DOI : 10.1128 / JB.00020-18 . PMID 29632094 . 
  50. ^ Бенгтссон, ММ; Sjøtun, K .; Storesund, JE; Овреос, Дж. (2011). «Использование источников углерода, полученных из ламинарии, бактериями, связанными с поверхностью ламинарии». Экология водных микробов . 62 (2): 191–199. DOI : 10,3354 / ame01477 .
  51. ^ Пфистер, Кэтрин А .; Altabet, Mark A .; Вайгель, Брук Л. (2019). «Кровати водорослей и их локальное влияние на химический состав морской воды, продуктивность и микробные сообщества». Экология . 100 (10): e02798. DOI : 10.1002 / ecy.2798 . PMID 31233610 . 
  52. ^ Ван дер Хайде, Т .; Говерс, LL; De Fouw, J .; Olff, H .; Van Der Geest, M .; Ван Катвейк, ММ; Piersma, T .; Van De Koppel, J .; Силлиман, BR; Smolders, AJP; Ван Гилс, Дж. А. (2012). «Трехступенчатый симбиоз составляет основу экосистем морских водорослей» . Наука . 336 (6087): 1432–1434. Bibcode : 2012Sci ... 336.1432V . DOI : 10.1126 / science.1219973 . PMID 22700927 . S2CID 27806510 .  
  53. ^ Петерсен, Джиллиан М .; Кемпер, Анна; Грубер-Водичка, Харальд; Кардини, Улисс; Ван дер Гест, Маттейс; Кляйнер, Мануэль; Булгереси, Сильвия; Мусманн, Марк; Гербольд, Крейг; Сеа, Брэндон КБ; Антоний, Чаккиат Пол; Лю, Дан; Белиц, Александра; Вебер, Мириам (2017). «Хемосинтетические симбионты морских беспозвоночных животных способны к азотфиксации» . Природная микробиология . 2 : 16195. дои : 10.1038 / nmicrobiol.2016.195 . PMC 6872982 . PMID 27775707 .  
  54. ^ Peixoto, RS, Rosado, PM, Leite, DCDA, Rosado, AS и Bourne, DG (2017) «Полезные микроорганизмы для кораллов (BMC): предлагаемые механизмы для здоровья и устойчивости кораллов». Frontiers в микробиологии , 8 : 341. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.00341 .
  55. ↑ Webster, NS, Negri, AP, Botté, ES, Laffy, PW, Flores, F., Noonan, S., Schmidt, C. и Uthicke, S. (2016) «Связанные с хозяином микробы коралловых рифов реагируют на совокупное давление потепления и закисления океана ". Научные доклады , 6 : 19324. DOI : 10.1038 / srep19324 .
  56. ^ Дэниэлс, К. и Брейтбарт, М. (2012) "Бактериальные сообщества, связанные с гребневиками Mnemiopsis leidyi и Beroe ovata ". FEMS Microbiology Ecology , 82 (1): 90–101. DOI : 10.1111 / j.1574-6941.2012.01409.x .
  57. ^ Blasiak, LC, Zinder, SH, Buckley, DH и Hill, RT (2014) «Бактериальное разнообразие, связанное с оболочкой хордовой модели Ciona Кишечник ». Журнал ISME , 8 (2): 309–320. DOI : 10.1038 / ismej.2013.156 .
  58. ^ Гивенс, CE, Рэнсом, Б., Бано, Н. и Холлибо, JT (2015) «Сравнение микробиомов кишечника 12 костистых рыб и 3 видов акул». Серия «Прогресс морской экологии» , 518 : 209–223. DOI : 10,3354 / meps11034 .
  59. ^ Макфол-Нгай, MJ (2000) «Переговоры между животными и бактериями: свойство«diplomacy'of кальмар-вибрион симбиоз». Сравнительная биохимия и физиология , Часть A: Молекулярная и интегративная физиология , 126 (4): 471–480. DOI : 10.1016 / S1095-6433 (00) 00233-6 .
  60. ^ Макфол-Нгай, М. (2014) «Пророчество сути симбиоза: идеи из модели кальмаров вибриона». PLoS Biology , 12 (2): e1001783. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1001783 .
  61. ^ Dubilier, Н., Mulders, К., Ferdelman, Т., де Пиво, Д., Pernthaler, А., Клейн, М., Вагнер, М., Erséus, К., Тирманн Ф., Krieger, J . и Giere, О. (2001) "Эндосимбиотические сульфатредуцирующие и сульфидокисляющие бактерии у олигохетического червя". Природа , 411 (6835): 298–302. DOI : 10.1038 / 35077067 .
  62. ^ a b Войк, Т., Тилинг, Х., Иванова, Н.Н., Хантеман, М., Рихтер, М., Глёкнер, Ф.О., Боффелли, Д., Андерсон, Эй-Джей, Барри, К.У., Шапиро, Х.Дж. и Сзето E. (2006) «Понимание симбиоза посредством метагеномного анализа микробного консорциума». Природа , 443 (7114): 950–955. DOI : 10,1038 / природа05192 .
  63. ^ Schimak, MP, Kleiner, M., Wetzel, S., Liebeke, M., Dubilier, N. и Fuchs, BM (2016) «MiL-FISH: многомеченные олигонуклеотиды для флуоресцентной гибридизации in situ улучшают визуализацию бактериальных клеток». Прикладная и экологическая микробиология , 82 (1): 62–70. DOI : 10,1128 / AEM.02776-15 .
  64. ^ Клейнер, М., Wentrup, К., Лотт, К., Teeling, H., Ветцель С., Янг, Дж, Чанг, YJ, Шах, М., VerBerkmoes, NC, Zarzycki, J. и Фукса , G. (2012) «Метапротеомика безжизненного морского червя и его симбиотического микробного сообщества обнаруживает необычные пути использования углерода и энергии». Труды Национальной академии наук , 109 (19): E1173 – E1182. DOI : 10.1073 / pnas.1121198109 .
  65. ^ Wippler J., Клейнер, М., Лотты, К., Gruhl, А., Авраам, ПЭ, Джаннон, разъем RJ, Янг, JC, Hettich, RL и Dubilier, Н. (2016) «транскриптомная и протеомические идеи в врожденный иммунитет и приспособления к симбиотическому образу жизни у бесплодного морского червя Olavius ​​algarvensis ». BMC Genomics , 17 (1): 942. DOI : 10,1186 / s12864-016-3293-у .
  66. ^ Ruehland, К., Blazejak, А., LOTT, C., Loy, A., Erséus С., Dubilier, N. (2008) «Несколько бактериальные симбионты у двух видов сопутствующих безвольных олигохет червей из средиземноморского моря отложения травы ». Экологическая микробиология , 10 (12): 3404–3416. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2008.01728.x .
  67. ^ Dubinsky, Z. и Jokiel, PL (1994) "Соотношение потоков энергии и питательных веществ регулирует симбиоз между зооксантеллами и кораллами". Тихоокеанская наука , 48 (3): 313–324.
  68. ^ Энтони, KR, Клайн, Д.И., Диас-Пулидо, Г., Дав, С. и Хуг-Гулдберг, О. (2008) «Закисление океана вызывает обесцвечивание и потерю продуктивности у строителей коралловых рифов». Слушания Национальной академии наук , 105 (45): 17442–17446. DOI : 10.1073 / pnas.0804478105 .
  69. ^ Bourne, DG, Morrow, KM и Webster, NS (2016) «Взгляд на микробиом кораллов: обеспечение здоровья и устойчивости рифовых экосистем». Ежегодный обзор микробиологии , 70 : 317–340. DOI : 10.1146 / annurev-micro-102215-095440 .
  70. ^ Neave, MJ, Apprill, A., Ferrier-Pagès, C. и Voolstra, CR (2016) "Разнообразие и функции распространенных симбиотических морских бактерий в роду Endozoicomonas ". Прикладная микробиология и биотехнология , 100 (19): 8315–8324. DOI : 10.1007 / s00253-016-7777-0 .
  71. ^ Нив, МДж, Мичелла, КТ, Apprill, А. и Voolstra, CR (2017) «Endozoicomonas геном выявить функциональную адаптацию и пластичность в бактериальных штаммах симбиозсвязанных с различными морскими хостами». Научные доклады , 7 : 40579. DOI : 10.1038 / srep40579 .
  72. ^ Хьюз, Т.П., Керри, Дж. Т., Альварес-Норьега, М., Альварес-Ромеро, Дж. Г., Андерсон, К. Д., Бэрд, А. Х., Бэбкок, Р. К., Бегер, М., Беллвуд, Д. Р., Беркельманс, Р. и Бридж, ТК (2017) «Глобальное потепление и периодическое массовое обесцвечивание кораллов». Природа , 543 (7645): 373–377. DOI : 10,1038 / природа21707 .
  73. ^ Белл, JJ (2008) "Функциональные роли морских губок". Estuarine, прибрежные и шельфовые науки , 79 (3): 341–353. DOI : 10.1016 / j.ecss.2008.05.002 .
  74. ^ Томас, Т., Moitinho-Сильва, Л., Lurgi, М., Бьорк, JR, Easson, К., Астудильо-Гарсиа, С., Олсон, JB, Эрвин, П. М., Лопес-Legentil, С., Luter , Х. и Чавес-Фоннегра, А. (2016) "Разнообразие, структура и конвергентная эволюция глобального микробиома губок". Nature Communications , 7 (1): 1-12. DOI : 10.1038 / ncomms11870 .
  75. ^ Байер, К., Шмитт, С. и Хентшель, У. (2008) «Физиология, филогения и доказательства in situ бактериальных и архейных нитрификаторов в морской губке Aplysina aerophoba ». Экологическая микробиология , 10 (11): 2942–2955. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2008.01582.x .
  76. ^ Radax, Р., Хоффман, Ф., Раппы, ХТЫ, Лейнингер, С. и Schleper, С. (2012) «Аммиак-окислительные археикачестве основных драйверов нитрификации в холодной воде губке». Экологическая микробиология , 14 (4): 909_923. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2011.02661.x .
  77. ^ Zhang, F., Blasiak, LC, Karolin, JO, Powell, RJ, Geddes, CD и Hill, RT (2015) «Секвестрация фосфора в форме полифосфата микробными симбионтами в морских губках». Слушания Национальной академии наук , 112 (14): 4381–4386. DOI : 10.1073 / pnas.1423768112 .
  78. ^ Колман, А.С. (2015) «Губки-симбионты и морской цикл P». Слушания Национальной академии наук , 112 (14): 4191–4192. DOI : 10.1073 / pnas.1502763112 .
  79. ^ Симистер Р., Тейлор, MW, Цай, П., Вентилятор, Л., Bruxner, TJ, Crowe, ML и Webster, Н. (2012) «Тепловые реакциистресс в бактериальную биосфере губки Большой Барьерный риф, Rhopaloeides odorabile . Environmental Microbiology , 14 (12): 3232-3246. DOI : 10.1111 / 1462-2920.12010 .
  80. ↑ Morrow, KM, Bourne, DG, Humphrey, C., Botté, ES, Laffy, P., Zaneveld, J., Uthicke, S., Fabricius, KE и Webster, NS (2015) «Выявлены выходы природного вулканического CO 2. будущие траектории для ассоциаций хозяев и микробов у кораллов и губок ». Журнал ISME , 9 (4): 894–908. DOI : 10.1038 / ismej.2014.188 .
  81. ↑ Ribes, M., Calvo, E., Movilla, J., Logares, R., Coma, R. и Pelejero, C. (2016) «Реструктуризация микробиома губок способствует устойчивости к закислению океана . Экологические отчеты микробиологии , 8 (4):. 536-544 DOI : 10.1111 / 1758-2229.12430 .
  82. ^ Lesser, MP, Fiore, C., Slattery, M. и Zaneveld, J. (2016) «Стрессоры изменения климата дестабилизируют микробиом карибской губки, Xestospongia muta ». Журнал экспериментальной морской биологии и экологии , 475 : 11–18. DOI : 10.1016 / j.jembe.2015.11.004 .
  83. ^ Knowlton N, Ровер F (октябрь 2003). «Многовидовые микробные мутуализмы на коралловых рифах: хозяин как среда обитания». Американский натуралист . 162 (4 доп.): S51–62. DOI : 10.1086 / 378684 . PMID 14583857 . S2CID 24127308 .  
  84. ^ Pollock FJ, McMinds R, Smith S, Bourne DG, Willis BL, Medina M и др. (Ноябрь 2018 г.). «Связанные с кораллами бактерии демонстрируют филосимбиоз и кофилогению» . Nature Communications . 9 (1): 4921. DOI : 10.1038 / s41467-018-07275-х . PMC 6250698 . PMID 30467310 .  
  85. ^ Томпсон JR, Rivera HE, Closek CJ, Medina M (2014). «Микробы в коралловом холобионте: партнеры в эволюции, развитии и экологических взаимодействиях» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 4 : 176. DOI : 10.3389 / fcimb.2014.00176 . PMC 4286716 . PMID 25621279 .  
  86. ^ Ugarelli K, S Чакрабарти, Laas P, Stingl U (декабрь 2017). «Морской холобионт и его микробиом» . Микроорганизмы . 5 (4): 81. DOI : 10.3390 / microorganisms5040081 . PMC 5748590 . PMID 29244764 .   Материал был скопирован из этого источника, который доступен по [ https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0
  87. ↑ Cavalcanti GS, Shukla P, Morris M, Ribeiro B, Foley M, Doane MP, Thompson CC, Edwards MS, Dinsdale EA, Thompson FL (сентябрь 2018 г.). «Голобионты родолитов в меняющемся океане: взаимодействия хозяина и микробов опосредуют устойчивость коралловых водорослей к подкислению океана» . BMC Genomics . 19 (1): 701. DOI : 10,1186 / s12864-018-5064-4 . PMC 6154897 . PMID 30249182 .   Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

Дальнейшие ссылки [ править ]

  • Сталь, Л.Дж. и Кретою, М.С. (ред.) (2016) Морской микробиом: неиспользованный источник биоразнообразия и биотехнологического потенциала Springer. ISBN 9783319330006 .