Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Часть серии по
Микробиомы
Растение microbiota.png
Микробиомы растений
Морские микробиомы
Микробиомы человека
Другие микробиомы
Микробиота
Голобионты
  • Родолит
  • Гологеномика
  • Гологеномная теория эволюции
Связанный
  • Дисбактериоз
  • Гнотобиоз
  • Фитобиом
  • Проверка кворума
  • Биологическая темная материя
  • Биология микробной популяции
  • Микробное сотрудничество
  • Метагеномика
    • популярный
  • Метатранскриптомика
  • Метаболомика
  • Пангеном
  • Суперорганизм
  • Симбиогенез
Проекты
  • Проект человеческого микробиома
  • Проект "Микробиом Земли"
  • v
  • т
  • е

Микробиом растений играет роль в здоровье и продуктивности растений и получил значительное внимание в последние года. [1] [2] микробиом был определен как «характерное микробное сообщество , занимающим достаточно хорошо определенной среду обитания , которая имеет различные физико-химические свойства. Термин , таким образом , относится не только к микроорганизмам , участвующим , но также охватывает их театр деятельности» . [3] [4]

Растения живут в ассоциации с разнообразными микробными консорциумами . Эти микробы, называемые микробиотой растений , живут как внутри (эндосфера), так и вне (эписфера) тканей растения и играют важную роль в экологии и физиологии растений. [5] «Основной микробиом растения, как полагают, включает ключевые таксоны микробов, которые важны для приспособленности растений и установлены посредством эволюционных механизмов отбора и обогащения микробных таксонов, содержащих гены основных функций приспособленности холобионта растения». [6]

Микробиомы растений формируются как факторами, связанными с самим растением, такими как генотип, орган, виды и состояние здоровья, так и факторами, связанными с окружающей средой растения, такими как управление, землепользование и климат. [7] В некоторых исследованиях сообщалось, что состояние здоровья растения отражается или связано с его микробиомом. [8] [1] [9] [2]

Обзор [ править ]

Микробиом в растительной экосистеме
Схема растений и связанной с ними микробиоты, колонизирующей различные ниши на тканях растений и внутри них. Все надземные части растений вместе, называемые филлосферой, представляют собой постоянно развивающуюся среду обитания из-за ультрафиолетового (УФ) излучения и меняющихся климатических условий. Он в основном состоит из листьев. Подземные части растений, в основном корни, обычно зависят от свойств почвы. Вредные взаимодействия влияют на рост растений из-за патогенной активности некоторых членов микробиоты (слева). С другой стороны, полезные микробные взаимодействия способствуют росту растений (справа). [10]

Изучение ассоциации растений с микроорганизмами предшествует изучению микробиомов животных и человека, в частности, изучению роли микробов в поглощении азота и фосфора. Наиболее яркими примерами являются корень растений - арбускулярный микоризный (AM) и бобово-ризобиальный симбиоз , оба из которых сильно влияют на способность корней поглощать различные питательные вещества из почвы. Некоторые из этих микробов не могут выжить в отсутствие растения-хозяина ( облигатные симбионты включают вирусы, некоторые бактерии и грибы), который обеспечивает микроорганизмам пространство, кислород, белки и углеводы. Связь AM-грибов с растениями известна с 1842 г., и обнаружено, что с ними связано более 80% наземных растений. [11]Считается, что грибы AM помогли приручить растения. [12] [5]

В этой анимации корневой клубень заселяется арбускулярным микоризным грибком (AMF).

Традиционно исследования взаимодействия растений и микробов ограничивались культивируемыми микробами . Многочисленные микробы, которые невозможно культивировать, остались неисследованными, поэтому знание их роли в значительной степени неизвестно. [5] Возможности раскрытия типов и результатов этих взаимодействий растений и микробов вызвали значительный интерес среди экологов, эволюционных биологов, биологов растений и агрономов. [13] [14] [1] Недавние разработки в области мультиомики и создание больших коллекций микроорганизмов резко расширили знания о составе и разнообразии микробиома растений. Последовательность из маркерных геновцелых микробных сообществ, называемая метагеномикой , проливает свет на филогенетическое разнообразие микробиомов растений. Это также расширяет знания об основных биотических и абиотических факторах, ответственных за формирование сообществ микробиомных сообществ растений . [14] [5]

Основное внимание в исследованиях микробиома растений уделялось модельным растениям, таким как Arabidopsis thaliana , а также важным видам хозяйственных культур, включая ячмень (Hordeum vulgare), кукурузу (Zea mays), рис (Oryza sativa), сою (Glycine max), пшеница (Triticum aestivum), тогда как фруктовым культурам и древесным породам уделялось меньше внимания. [15] [2]

Микробиота растений [ править ]

Разнообразные микробные сообщества характерной микробиоты являются частью микробиомов растений и обнаруживаются на внешних поверхностях и во внутренних тканях растения-хозяина, а также в окружающей почве. [5]

Микробиом ризосферы [ править ]

Связи в ризосфере между корнями растений,
микробами и корневыми экссудатами  [16]
Смотрите также: корневой микробиом и ризосфера

Ризосфера содержит 1-10 мм зону почвы непосредственно вокруг корней , который находится под влиянием завода через его осаждение корневых экссудатов , слизь и мертвые клетки растений. [17] Разнообразные организмы специализируются на жизни в ризосфере, включая бактерии , грибы , оомицеты , нематоды , водоросли , простейшие , вирусы и археи . [18]

"Экспериментальные данные подчеркивают важность корневого микробиома для здоровья растений, и становится все более очевидным, что растение способно контролировать состав своего микробиома. Само собой разумеется, что те растения, которые управляют своим микробиомом таким образом, чтобы это было полезно для их репродуктивный успех будет благоприятствовать во время эволюционного отбора. Похоже, что такое давление отбора вызвало множество специфических взаимодействий между растениями и микробами, и накапливаются доказательства того, что растения в случае необходимости требуют помощи микробов ».

- Berendsen et al, 2012  [19].

Консорциумы микроорганизмов естественным образом образуются
на корнях Arabidopsis thaliana.
Изображения поверхности корней естественных популяций A. thaliana, полученные с помощью сканирующей электронной микроскопии, демонстрируют сложные микробные сети, сформированные на корнях.
а) Обзор корня A. thaliana (первичный корень) с многочисленными корневыми волосками. б) Биопленкообразующие бактерии. в) Гифы грибов или оомицетов, окружающие поверхность корня. г) Первичный корень густо покрыт спорами и простейшими . д, е) Протисты , скорее всего, принадлежащие к классу Bacillariophyceae . ж) Бактерии и бактериальные волокна. з, i) Различные бактериальные особи, демонстрирующие большое разнообразие форм и морфологических особенностей. [20]

Микоризные грибы являются многочисленными членами ризосферного сообщества и были обнаружены у более чем 200 000 видов растений и, по оценкам, ассоциируются с более чем 80% всех растений. [21] Ассоциации микоризы и корня играют важную роль в наземных экосистемах, регулируя круговороты питательных веществ и углерода . Микориза является неотъемлемой частью здоровья растений, поскольку обеспечивает до 80% потребности в азоте и фосфоре. Взамен грибы получают углеводы и липиды от растений-хозяев. [22] Недавние исследования арбускулярных микоризных грибов с использованием технологий секвенирования показывают большее межвидовое и внутривидовое разнообразие, чем это было известно ранее. [23] [5]

Наиболее часто изучаемыми полезными ризосферными организмами являются микоризы , ризобиальные бактерии , ризобактерии , способствующие росту растений (PGPR), и микробы для биоконтроля . Предполагалось, что один грамм почвы может содержать более одного миллиона различных бактериальных геномов [24], а в ризосфере картофеля было обнаружено более 50 000 OTU ( операционных таксономических единиц ). [25] Среди прокариот в ризосфере наиболее частыми бактериями являются ацидобактерии , протеобактерии , планктомицеты , актинобактерии ,Bacteroidetes и Firmicutes . [26] [27] В некоторых исследованиях не сообщалось о существенных различиях в составе микробного сообщества между основной массой почвы (почва, не прикрепленная к корню растения) и ризосферной почвой. [28] [29] Определенные группы бактерий (например, актинобактерии, Xanthomonadaceae ) менее многочисленны в ризосфере, чем в близлежащей насыпной почве. [26] [5]

Микробиом филлосферы [ править ]

Смотрите также: Филлосфера
Лист здорового растения арабидопсис (слева) и лист растения-мутанта по дисбактериозу (справа) [30]

Воздушная поверхность растения (стебель, лист, цветок, плод) называется филлосферой и считается относительно бедной питательными веществами по сравнению с ризосферой и эндосферой. Среда в филлосфере более динамична, чем среды ризосферы и эндосферы. Колонизаторы микробов подвергаются суточным и сезонным колебаниям температуры, влажности и радиации. Кроме того, эти элементы окружающей среды влияют на физиологию растений (например, фотосинтез, дыхание, поглощение воды и т. Д.) И косвенно влияют на состав микробиома. [5] Дождь и ветер также вызывают временные изменения микробиома филлосферы. [31]

Взаимодействия между растениями и связанными с ними микроорганизмами во многих из этих микробиомов могут играть решающую роль в здоровье, функционировании и эволюции растений-хозяев . [32] Поверхность листа или филлосфера содержит микробиом, состоящий из различных сообществ бактерий, грибов, водорослей, архей и вирусов. [33] [34] Взаимодействие между растением-хозяином и бактериями филлосферы может влиять на различные аспекты физиологии растения-хозяина. [35] [36] [37] Однако по состоянию на 2020 г. знания об этих бактериальных ассоциациях в филлосфере остаются относительно скромными, и существует потребность в углублении фундаментальных знаний о динамике микробиома филлосферы. [38][39]

В целом в филлосферных сообществах сохраняется высокое видовое богатство. Сообщества грибов очень разнообразны в филлосфере умеренных регионов и более разнообразны, чем в тропических регионах. [40] На поверхности листьев растений может присутствовать до 107 микробов на квадратный сантиметр, а бактериальная популяция филлосферы в глобальном масштабе оценивается в 10 26 клеток. [41] Размер популяции грибной филлосферы, вероятно, будет меньше. [42]

Микробы филлосферы из разных растений кажутся в некоторой степени похожими на высоких уровнях таксонов, но на более низких уровнях таксонов остаются существенные различия. Это указывает на то, что микроорганизмам может потребоваться тонкая регулировка метаболизма, чтобы выжить в филлосфере. [40] Протеобактерии, по- видимому, являются доминирующими колонизаторами, при этом в филлосферах преобладают Bacteroidetes и Actinobacteria . [43] Хотя есть сходства между ризосферными и почвенными микробными сообществами, очень мало сходства было обнаружено между филлосферными сообществами и микроорганизмами, плавающими в открытом воздухе ( аэропланктон ). [44] [5]

Сборка микробиома филлосферы, которую можно строго определить как сообщества эпифитных бактерий на поверхности листа, может формироваться микробными сообществами, присутствующими в окружающей среде (т. Е. Стохастическая колонизация ) и растением-хозяином (т. Е. Биотическим отбором). [33] [45] [39] Однако, хотя поверхность листа обычно считается отдельной средой обитания микробов, [46] [47]нет единого мнения о доминирующем двигателе собрания сообщества в микробиомах филлосферы. Например, сообщалось о специфических для хозяина бактериальных сообществах в филлосфере сопутствующих видов растений, что свидетельствует о доминирующей роли отбора хозяев. [47] [48] [49] [39]

Напротив, микробиомы окружающей среды также считаются основным фактором, определяющим состав филлосферного сообщества. [46] [50] [51] [52] В результате процессы, которые управляют сборкой филлосферных сообществ, недостаточно изучены, но вряд ли будут универсальными для всех видов растений. Однако существующие данные указывают на то, что микробиомы филлосферы, проявляющие специфические для хозяина ассоциации, с большей вероятностью взаимодействуют с хозяином, чем микробиомы, в первую очередь рекрутированные из окружающей среды. [35] [53] [54] [55] [39]

Поиск основного микробиома в микробных сообществах, связанных с хозяином, является полезным первым шагом в попытке понять взаимодействия, которые могут происходить между хозяином и его микробиомом. [56] [57] Преобладающая концепция основного микробиома построена на представлении о том, что устойчивость таксона через пространственно-временные границы экологической ниши напрямую отражает его функциональное значение в той нише, которую он занимает; поэтому он обеспечивает основу для идентификации функционально важных микроорганизмов, которые постоянно ассоциируются с видами-хозяевами. [56] [58] [59] [39]

Различные определения «основного микробиома» возникли в научной литературе, при этом исследователи по-разному идентифицируют «основные таксоны» как таксоны, устойчивые в разных микробиомах хозяев  [60] [61] и даже у разных видов. [49] [53] Учитывая функциональную дивергенцию микроорганизмов в разных видах хозяев  [49] и микробиоме обитания [62], определение основных таксонов sensu stricto как устойчивых на широких географических расстояниях внутри тканевых и видоспецифичных микробиомов хозяев представляет наибольшее значение. биологически и экологически приемлемое применение этой концептуальной основы. [63] [39]Тканевые и видоспецифические основные микробиомы в популяциях хозяев, разделенных значительными географическими расстояниями, не были широко представлены для филлосферы с использованием строгого определения, установленного Руиненом. [36] [39]

Пример: филосфера манука [ править ]

Относительное обилие основных таксонов филлосферы в мануке
Манука - это цветущий куст. На диаграмме показано распределение численности-занятости, идентифицирующее основные таксоны филлосферы в наборах данных не разреженных (зеленый) и разреженных (фиолетовый). Каждая точка представляет таксон, построенный по его средней логарифмической относительной численности и занятости. Таксоны (розовые) с заполнением 1 (т. Е. Обнаружены во всех 89 образцах филлосферы) считались членами основного микробиома. [39]

Цветущее чайное дерево, широко известное как манука, происходит из Новой Зеландии. [64] Мед манука , производимый из нектара цветов манука, известен своими неперекисными антибактериальными свойствами. [65] [66] Эти неперекисные антибактериальные свойства были в основном связаны с накоплением трехуглеродного дигидроксиацетона сахара (DHA) в нектаре цветка манука, который подвергается химическому превращению в метилглиоксаль (MGO) в зрелом меде. . [67] [68] [69]Однако концентрация DHA в нектаре цветов манука, как известно, варьируется, и, следовательно, антимикробная эффективность меда манука варьируется от региона к региону и из года в год. [70] [71] [72] Несмотря на обширные исследования, не было выявлено надежной корреляции между производством DHA и климатическими, [73] эдафическими , [74] или генетическими факторами хозяина. [75] [39]

{A} Тепловая карта слева показывает, как состав OTU в филлосфере манука и связанных с ней почвенных сообществах значительно различается. Основной почвенный микробиом обнаружен не был.
(B) На диаграмме справа показано, как ОТЕ в филлосфере и связанных почвенных сообществах различались по относительной численности. [39]

Микроорганизмы изучались в ризосфере и эндосфере манука. [76] [77] [78] Более ранние исследования в основном были сосредоточены на грибах, а исследование 2016 года представило первое исследование эндофитных бактериальных сообществ из трех географически и экологически различных популяций мануки с использованием методов снятия отпечатков пальцев и выявило тканеспецифические основные эндомикробиомы. [79] [39]Исследование 2020 года выявило специфичный для среды обитания и относительно обильный основной микробиом в филлосфере манука, который сохранялся во всех образцах. Напротив, неосновные микроорганизмы филлосферы демонстрировали значительные различия между отдельными деревьями-хозяевами и популяциями, что в значительной степени определялось экологическими и пространственными факторами. Результаты продемонстрировали существование доминирующего и повсеместного основного микробиома в филлосфере мануки. [39]

Микробиом эндосферы [ править ]

Некоторые микроорганизмы, такие как эндофиты , проникают во внутренние ткани растений и занимают их, образуя эндосферный микробиом. Арбускулярные микоризные и другие эндофитные грибы являются доминирующими колонизаторами эндосферы. [80] Бактерии и до некоторой степени археи являются важными членами эндосферных сообществ. Некоторые из этих эндофитных микробов взаимодействуют со своим хозяином и приносят растениям очевидную пользу. [26] [81] [82]В отличие от ризосферы и ризоплана, в эндосферах обитают высокоспецифичные микробные сообщества. Сообщество корневых эндофитов может сильно отличаться от сообщества прилегающих почв. В целом разнообразие эндофитного сообщества ниже, чем разнообразие микробного сообщества вне растения. [29] Идентичность и разнообразие эндофитного микробиома надземных и подземных тканей также могут различаться внутри растения. [83] [80] [5]

Микробиом семян [ править ]

Отдельные семена обладали высоким микробным разнообразием, которое в зародышах было выше, чем в околоплоднике. Семена растений могут служить естественными переносчиками вертикальной передачи полезных эндофитов, которые придают устойчивость к болезням. [84] Доказательства передачи микроорганизмов от семян к развивающимся проросткам были обнаружены в экспериментальных и естественных условиях. [85] Также кажется, что передача новому растению происходит через определенные механизмы, когда определенные микроорганизмы мигрируют из семян в листья растений, а другие - в корни растений. [86]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Тернер, Томас Р .; Джеймс, Юан К .; Пул, Филип С. (2013). «Микробиом растений» . Геномная биология . 14 (6): 209. DOI : 10,1186 / GB-2013-14-6-209 . PMC  3706808 . PMID  23805896 .
  2. ^ a b c Purahong, Witoon; Орро, Луиджи; Донати, Ирэн; Перпетуини, Джорджия; Челлини, Антонио; Ламонтанара, Антонелла; Микелотти, Ваня; Таккони, Джанни; Спинелли, Франческо (2018). «Микробиом растений и его связь со здоровьем растений: виды-хозяева, органы и Pseudomonas syringae pv. Инфекция актинидиями, формирующая сообщества бактериальной филлосферы растений киви» . Границы растениеводства . 9 : 1563. DOI : 10.3389 / fpls.2018.01563 . PMC 6234494 . PMID 30464766 .  . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  3. ^ Whipps J., Льюис К. и Кук Р. (1988) "Микопаразитизм и борьба с болезнями растений". В: Burge M (Ed.) Fungi in Biological Control Systems , Manchester University Press, стр. 161–187. ISBN 9780719019791 . 
  4. ^ Берг, Габриэле ; Дарья Рыбакова, Дорин Фишер, Томислав Чернава, Мари-Кристин Шампомье Верже, Тревор Чарльз, Сяоюлонг Чен, Лука Коколин, Келли Эверсол, Хема Эрреро Корраль, Мария Казу, Линда Кинкель, Лене Ланге, Нельсон Лима, Александр Лой, Джеймс А. Маклин , Эммануэль Магуин, Тим Мочлин, Райан МакКлюр, Биргит Миттер, Мэтью Райан, Инга Саранд, Хауке Смидт, Беттина Шелкле, Хьюго Роум, Дж. Сегал Киран, Джозеф Селвин, Рафаэль Соарес Корреа де Соуза, Лео ван Овербек, Бражеш К. , Майкл Вагнер, Аарон Уолш, Анджела Сессич и Майкл Шлотер (2020) «Повторное посещение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы». Микробиом , 8 (103): 1-22. DOI : 10,1186 / s40168-020-00875-0 .Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  5. ^ a b c d e f g h i j Дастогер, К. М., Тумпа, Ф. Х., Султана, А., Актер, М. А. и Чакраборти, А. (2020) «Микробиом растений - отчет о факторах, которые формируют состав и разнообразие сообщества. ". Текущие биологии растений : 100161. дои : 10.1016 / j.cpb.2020.100161 . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  6. ^ Compant, S., Samad, A., Faist, H. и Sessitsch, A. (2019) «Обзор микробиома растений: экология, функции и новые тенденции в применении микробов». Журнал перспективных исследований , 19 : 29_37. DOI : 10.1016 / j.jare.2019.03.004 .
  7. ^ Bringel, Franã§Oise; Couã © e, Иван (2015). «Основные роли филлосферных микроорганизмов на стыке между функционированием растений и атмосферной газовой динамикой» . Границы микробиологии . 06 : 486. DOI : 10,3389 / fmicb.2015.00486 . PMC 4440916 . PMID 26052316 .  
  8. ^ Berendsen, Roeland L .; Питерс, Корне MJ; Баккер, Питер AHM (2012). «Микробиом ризосферы и здоровье растений». Тенденции в растениеводстве . 17 (8): 478–486. DOI : 10.1016 / j.tplants.2012.04.001 . hdl : 1874/255269 . PMID 22564542 . 
  9. ^ Берг, Габриэле; Grube, M .; Schloter, M .; Смолла, К. (2014). «Микробиом растений и его значение для здоровья растений и человека» . Границы микробиологии . 5 : 491. DOI : 10,3389 / fmicb.2014.00491 . PMC 4166366 . PMID 25278934 .  
  10. ^ Shelake, RM, Pramanik, D. и Kim, JY (2019) «Исследование взаимодействия растений и микробов для устойчивого сельского хозяйства в эпоху CRISPR». Микроорганизмы , 7 (8): 269. DOI : 10.3390 / microorganisms7080269 . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  11. ^ Koide, Роджер Т .; Моссе, Барбара (2004). «История исследования арбускулярной микоризы». Микориза . 14 (3): 145–163. DOI : 10.1007 / s00572-004-0307-4 . PMID 15088135 . S2CID 1809402 .  
  12. ^ Heckman, DS (2001). «Молекулярные доказательства ранней колонизации земли грибами и растениями». Наука . 293 (5532): 1129–1133. DOI : 10.1126 / science.1061457 . PMID 11498589 . S2CID 10127810 .  
  13. ^ Berendsen, Roeland L .; Питерс, Корне MJ; Баккер, Питер AHM (2012). «Микробиом ризосферы и здоровье растений». Тенденции в растениеводстве . 17 (8): 478–486. DOI : 10.1016 / j.tplants.2012.04.001 . hdl : 1874/255269 . PMID 22564542 . 
  14. ^ a b Булгарелли, Давиде; Шлаеппи, Клаус; Spaepen, Stijn; Ван Темаат, Эмиэль Вер Лорен; Шульце-Леферт, Пауль (2013). «Структура и функции бактериальной микробиоты растений». Ежегодный обзор биологии растений . 64 : 807–838. DOI : 10,1146 / annurev-arplant-050312-120106 . PMID 23373698 . 
  15. ^ Басби, Пози Э .; Соман, Чинмай; Вагнер, Мэгги Р .; Friesen, Maren L .; Кремер, Джеймс; Беннетт, Элисон; Морси, Мустафа; Eisen, Jonathan A .; Лич, Ян Э .; Дангл, Джеффри Л. (2017). «Приоритеты исследований для использования микробиомов растений в устойчивом сельском хозяйстве» . PLOS Биология . 15 (3): e2001793. DOI : 10.1371 / journal.pbio.2001793 . PMC 5370116 . PMID 28350798 . S2CID 6434145 .   
  16. ^ Вишвакарма, Канчан; Кумар, Нитин; Шандилья, Читракши; Мохапатра, Свати; Бхайана, Сахил; Варма, Аджит (2020). «Пересмотр взаимодействия растений и микробов и применение микробных консорциумов для улучшения устойчивого сельского хозяйства: обзор» . Границы микробиологии . 11 : 560406. дои : 10,3389 / fmicb.2020.560406 . PMC 7779480 . PMID 33408698 .   Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  17. ^ Hinsinger, Филипп; Bengough, A. Glyn; Веттерлейн, Дорис; Янг, Иэн М. (2009). «Ризосфера: биофизика, биогеохимия и экологическая значимость». Растение и почва . 321 (1–2): 117–152. DOI : 10.1007 / s11104-008-9885-9 . S2CID 8997382 . 
  18. ^ Бонковски, Майкл; Вилленав, Сесиль; Гриффитс, Брайан (2009). «Ризосферная фауна: функциональное и структурное разнообразие тесных взаимодействий почвенной фауны с корнями растений». Растение и почва . 321 (1–2): 213–233. DOI : 10.1007 / s11104-009-0013-2 . S2CID 35701713 . 
  19. ^ Берендсен, Р.Л., Питерс, С.М. и Баккер, П.А. (2012) «Микробиом ризосферы и здоровье растений». Тенденции в растениеводстве , 17 (8): 478–486. DOI : 10.1016 / j.tplants.2012.04.001 .
  20. ^ Хассани, М.А., Дуран, П. и Хаккард, С. (2018) "Микробные взаимодействия внутри холобионта растения". Микробиом , 6 (1): 58. DOI : 10,1186 / s40168-018-0445-0 . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  21. ^ Ван Дер Хейден, Марсель GA; Мартин, Фрэнсис М .; Селосс, Марк-Андре; Сандерс, Ян Р. (2015). «Микоризная экология и эволюция: прошлое, настоящее и будущее» . Новый фитолог . 205 (4): 1406–1423. DOI : 10.1111 / nph.13288 . PMID 25639293 . 
  22. ^ Рич, Мелани К .; Нури, Ева; Courty, Пьер-Эммануэль; Рейнхардт, Дидье (2017). "Диета арбускулярных микоризных грибов: хлеб и масло?" (PDF) . Тенденции в растениеводстве . 22 (8): 652–660. DOI : 10.1016 / j.tplants.2017.05.008 . PMID 28622919 .  
  23. ↑ Ли, Ын-Хва; Эо, Джу Кён; Ка, Кан Хён; Эом, Ан-Хеум (2013). «Разнообразие арбускулярных микоризных грибов и их роль в экосистемах» . Микобиология . 41 (3): 121–125. DOI : 10.5941 / MYCO.2013.41.3.121 . PMC 3817225 . PMID 24198665 .  
  24. ^ Gans, J .; Волинский, М .; Данбар, Дж. (2005). «Вычислительные улучшения показывают большое разнообразие бактерий и высокую токсичность металлов в почве». Наука . 309 (5739): 1387–1390. DOI : 10.1126 / science.1112665 . PMID 16123304 . S2CID 130269020 .  
  25. ^ i̇Nceolu, Озгюль; Ас-Суд, Валид Абу; Саллес, Жоана Фалькао; Семенов, Александр В .; Ван Эльзас, Ян Дирк (2011). «Сравнительный анализ бактериальных сообществ на картофельном поле, как определено пиросеквенированием» . PLOS ONE . 6 (8): e23321. DOI : 10.1371 / journal.pone.0023321 . PMC 3158761 . PMID 21886785 .  
  26. ^ a b c Булгарелли, Давиде; Ротт, Матиас; Шлаеппи, Клаус; Вер Лорен Ван Темат, Эмиэль; Ахмадинежад, Нахаль; Ассенца, Федерика; Рауф, Филипп; Хюттель, Бруно; Райнхардт, Ричард; Шмельцер, Элмон; Пеплис, Йорг; Глёкнер, Фрэнк Оливер; Аманн, Рудольф; Эйкхорст, Тило; Шульце-Леферт, Пауль (2012). «Выявление структуры и сборочных сигналов для бактериальной микробиоты, обитающей в корнях Arabidopsis». Природа . 488 (7409): 91–95. DOI : 10.1038 / nature11336 . PMID 22859207 . S2CID 4393146 .  
  27. ^ Уроз, Стефан; Буэ, Марк; Мюрат, Клод; Фрей-Клетт, Паскаль; Мартин, Фрэнсис (2010). «Пиросеквенирование показывает контрастное бактериальное разнообразие между ризосферой дуба и окружающей почвой». Отчеты по микробиологии окружающей среды . 2 (2): 281–288. DOI : 10.1111 / j.1758-2229.2009.00117.x . PMID 23766079 . 
  28. ^ Лундберг, Дерек С .; Lebeis, Sarah L .; Паредес, Сур Эррера; Юристоун, Скотт; Геринг, Джейс; Малфатти, Стефани; Трембле, Жюльен; Энгельбректсон, Анна; Кунин Виктор; Рио, Тихана Главина дель; Эдгар, Роберт С .; Эйкхорст, Тило; Ley, Ruth E .; Гугенгольц, Филипп; Триндж, Сюзанна Грин; Дангл, Джеффри Л. (2012). «Определение основного микробиома корня Arabidopsis thaliana» . Природа . 488 (7409): 86–90. DOI : 10.1038 / nature11237 . PMC 4074413 . PMID 22859206 .  
  29. ^ a b Schlaeppi, K .; Домбровский, Н .; Oter, RG; Ver Loren Van Themaat, E .; Шульце-Леферт, П. (2014). «Количественное расхождение микробиоты бактериальных корней у родственников Arabidopsis thaliana» . Труды Национальной академии наук . 111 (2): 585–592. DOI : 10.1073 / pnas.1321597111 . PMC 3896156 . PMID 24379374 . S2CID 13806811 .   
  30. ↑ He, Sheng Yang (2020). Когда растения и их микробы не синхронизированы, результаты могут быть катастрофическими. The Conversation , 28 августа 2020 года.
  31. ^ Линдоу, Стивен Э. (1996). «Роль иммиграции и других процессов в определении эпифитных бактериальных популяций». Воздушная микробиология поверхности растений . С. 155–168. DOI : 10.1007 / 978-0-585-34164-4_10 . ISBN 978-0-306-45382-3.
  32. ^ Friesen, Maren L .; Портер, Стефани С .; Старк, Скотт С.; фон Веттберг, Эрик Дж .; Sachs, Joel L .; Мартинес-Ромеро, Эсперанса (2011). «Функциональные признаки растений, опосредованные микробами». Ежегодный обзор экологии, эволюции и систематики . 42 : 23–46. DOI : 10,1146 / annurev-ecolsys-102710-145039 .
  33. ^ a b Лево, Йохан HJ (2019). «Краткое изложение: последнее исследование, которое поможет нам понять микробиом филлосферы». Текущее мнение в микробиологии . 49 : 41–49. DOI : 10.1016 / j.mib.2019.10.002 . PMID 31707206 . 
  34. ^ Ruinen, J. (1956) "Встречаемость видов Beijerinckia в" филлосфере "". Природа , 177 (4501): 220–221.
  35. ^ a b Фогель, Кристина; Боденхаузен, Наташа; Груиссем, Вильгельм; Ворхольт, Джулия А. (2016). «Транскриптом листьев арабидопсиса выявляет различные, но также перекрывающиеся реакции на колонизацию комменсалами филлосферы и инфекцию патогенами, оказывающую влияние на здоровье растений» (PDF) . Новый фитолог . 212 : 192–207. DOI : 10.1111 / nph.14036 .
  36. ^ a b Сид, Фернанда П .; Маруяма, Фумито; Мурасе, Кадзунори; Graether, Steffen P .; Ларама, Джованни; Браво, Леон А .; Хоркера, Милко А. (2018). «Проект геномных последовательностей бактерий, выделенных из филлосферы Deschampsia antarctica». Экстремофилы . 22 (3): 537–552. DOI : 10.1007 / s00792-018-1015-х . PMID 29492666 . S2CID 4320165 .  
  37. ^ Kumaravel, Sowmya; Танкаппан, Сугита; Рагхупати, Шридар; Утанди, Сивакумар (2018). «Проект последовательности генома растений, способствующих росту и устойчивых к засухе Bacillus altitudinis FD48, выделенных из филлопланы риса» . Анонсы генома . 6 (9). DOI : 10,1128 / genomeA.00019-18 . PMC 5834328 . PMID 29496824 .  
  38. ^ Laforest-Lapointe, Isabelle; Уитакер, Бриана К. (2019). «Расшифровка микробиоты филлосферы: успехи и проблемы» . Американский журнал ботаники . 106 (2): 171–173. DOI : 10.1002 / ajb2.1229 . PMID 30726571 . 
  39. ^ a b c d e f g h i j k l Благородный, Аня С .; Ноэ, Стиви; Клируотер, Майкл Дж .; Ли, Чарльз К. (2020). «Основной микробиом филлосферы существует в отдаленных популяциях древесных пород, произрастающих в Новой Зеландии» . PLOS ONE . 15 (8): e0237079. Bibcode : 2020PLoSO..1537079N . DOI : 10.1371 / journal.pone.0237079 . PMC 7425925 . PMID 32790769 .   Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 . Материал был скопирован из этого источника, доступного по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  40. ^ а б Финкель, Омри М .; Burch, Adrien Y .; Линдоу, Стивен Э .; Пост, Антон Ф .; Белкин, Шимшон (2011). «Географическое положение определяет структуру популяции филлосферных микробных сообществ солевого дерева пустыни» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (21): 7647–7655. DOI : 10,1128 / AEM.05565-11 . PMC 3209174 . PMID 21926212 .  
  41. ^ Vorholt, Julia A. (2012). «Микробная жизнь в филлосфере». Обзоры природы микробиологии . 10 (12): 828–840. DOI : 10.1038 / nrmicro2910 . PMID 23154261 . S2CID 10447146 .  
  42. ^ Линдоу, Стивен Э .; Брандл, Мария Т. (2003). «Микробиология филлосферы» . Прикладная и экологическая микробиология . 69 (4): 1875–1883. DOI : 10,1128 / AEM.69.4.1875-1883.2003 . PMC 154815 . PMID 12676659 . S2CID 2304379 .   
  43. ^ Боденхаузен, Наташа; Хортон, Мэтью В .; Бергельсон, Джой (2013). «Бактериальные сообщества, связанные с листьями и корнями Arabidopsis thaliana» . PLOS ONE . 8 (2): e56329. DOI : 10.1371 / journal.pone.0056329 . PMC 3574144 . PMID 23457551 .  
  44. ^ Vokou, Деспоина; Варели, Катерина; Зарали, Екатерина; Караманоли, Катерина; Constantinidou, Helen-Isis A .; Монокрусос, Николаос; Галлей, Джон М .; Сайнис, Иоаннис (2012). «Изучение биоразнообразия в бактериальном сообществе филлосферы Средиземноморья и его взаимосвязи с переносимыми по воздуху бактериями». Микробная экология . 64 (3): 714–724. DOI : 10.1007 / s00248-012-0053-7 . PMID 22544345 . S2CID 17291303 .  
  45. ^ Vorholt, Julia A. (2012). «Микробная жизнь в филлосфере». Обзоры природы микробиологии . 10 (12): 828–840. DOI : 10.1038 / nrmicro2910 . PMID 23154261 . S2CID 10447146 .  
  46. ^ a b Стоун, Брэм WG; Джексон, Колин Р. (2016). «Биогеографические закономерности между сообществами бактериальной филлосферы южной магнолии (Magnolia grandiflora) в небольшом лесу». Микробная экология . 71 (4): 954–961. DOI : 10.1007 / s00248-016-0738-4 . PMID 26883131 . S2CID 17292307 .  
  47. ^ a b Редфорд, Аманда Дж .; Бауэрс, Роберт М .; Рыцарь, Роб; Линхарт, Ян; Фирер, Ной (2010). «Экология филлосферы: географическая и филогенетическая изменчивость в распространении бактерий на листьях деревьев» . Экологическая микробиология . 12 (11): 2885–2893. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2010.02258.x . PMC 3156554 . PMID 20545741 .  
  48. ^ Vokou, Деспоина; Варели, Катерина; Зарали, Екатерина; Караманоли, Катерина; Constantinidou, Helen-Isis A .; Монокрусос, Николаос; Галлей, Джон М .; Сайнис, Иоаннис (2012). «Изучение биоразнообразия в бактериальном сообществе филлосферы Средиземноморья и его взаимосвязи с переносимыми по воздуху бактериями». Микробная экология . 64 (3): 714–724. DOI : 10.1007 / s00248-012-0053-7 . PMID 22544345 . S2CID 17291303 .  
  49. ^ a b c Лафорест-Лапуант, Изабель; Мессье, Кристиан; Кембель, Стивен В. (2016). «Идентичность видов хозяев, место и время определяют структуру бактериального сообщества древесной филлосферы умеренного климата» . Микробиом . 4 (1): 27. DOI : 10,1186 / s40168-016-0174-1 . PMC 4912770 . PMID 27316353 .  
  50. ^ Zarraonaindia, Iratxe; Оуэнс, Сара М .; Вайзенхорн, Памела; Уэст, Кристин; Хэмптон-Марселл, Джаррад; Лакс, Саймон; Бокулич, Николай А .; Миллс, Дэвид А .; Мартин, Жиль; Тагави, Сафийх; Ван дер Лели, Даниэль; Гилберт, Джек А. (2015). «Почвенный микробиом влияет на микробиоту, связанную с виноградной лозой» . mBio . 6 (2). DOI : 10,1128 / mBio.02527-14 . PMC 4453523 . PMID 25805735 .  
  51. ^ Финкель, Омри М .; Burch, Adrien Y .; Линдоу, Стивен Э .; Пост, Антон Ф .; Белкин, Шимшон (2011). «Географическое положение определяет структуру популяции филлосферных микробных сообществ солевого дерева пустыни» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (21): 7647–7655. DOI : 10,1128 / AEM.05565-11 . PMC 3209174 . PMID 21926212 .  
  52. ^ Финкель, Омри М .; Burch, Adrien Y .; Элад, Тал; Huse, Susan M .; Линдоу, Стивен Э .; Пост, Антон Ф .; Белкин, Шимшон (2012). «Отношения расстояния-распада частично определяют паттерны разнообразия филлосферных бактерий на деревьях Tamrix через пустыню Сонора» . Прикладная и экологическая микробиология . 78 (17): 6187–6193. DOI : 10,1128 / AEM.00888-12 . PMC 3416633 . PMID 22752165 .  
  53. ^ а б Кембель, ЮЗ; О'Коннор, ТК; Арнольд, Гонконг; Хаббелл, ИП; Райт, SJ; Грин, JL (2014). «Взаимосвязь между филлосферными бактериальными сообществами и функциональными особенностями растений в неотропическом лесу» . Труды Национальной академии наук . 111 (38): 13715–13720. Bibcode : 2014PNAS..11113715K . DOI : 10.1073 / pnas.1216057111 . S2CID 852584 . 
  54. ^ Иннеребнер, Герд; Книф, Клаудиа; Ворхольт, Джулия А. (2011). «Защита Arabidopsis thaliana от листопатогенных Pseudomonas syringae штаммами Sphingomonas в контролируемой модельной системе» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (10): 3202–3210. DOI : 10,1128 / AEM.00133-11 . PMC 3126462 . PMID 21421777 .  
  55. ^ Lajoie, Женевьева; Маглионе, Реми; Кембель, Стивен В. (2020). «Адаптивное соответствие между филлосферными бактериями и их древесными хозяевами в неотропическом лесу» . Микробиом . 8 (1): 70. DOI : 10,1186 / s40168-020-00844-7 . PMC 7243311 . PMID 32438916 .  
  56. ^ a b Тень, Эшли; Хандельсман, Джо (2012). «За пределами диаграммы Венна: охота за основным микробиомом» . Экологическая микробиология . 14 (1): 4–12. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2011.02585.x . PMID 22004523 . 
  57. ^ Берг, Габриэле; Рыбакова, Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Вержес, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюйлун; Cocolin, Лука; Эверсол, Келли; Корраль, Хема Эрреро; Казоу, Мария; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Лима, Нельсон; Лой, Александр; МакКлин, Джеймс А .; Магуин, Эммануэль; Mauchline, Тим; МакКлюр, Райан; Миттер, Биргит; Райан, Мэтью; Саранд, Инга; Смидт, Хауке; Шелкле, Беттина; Рум, Хьюго; Киран, Г. Сегал; Селвин, Джозеф; Соуза, Рафаэль Соарес Корреа де; Ван Овербек, Лео; и другие. (2020). «Повторное посещение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы» . Микробиом . 8 (1): 103. DOI : 10,1186 / s40168-020-00875-0 . PMC 7329523 . PMID  32605663 .
  58. ^ Тернбо, Питер Дж .; Хамади, Мика; Яцуненко, Таня; Cantarel, Brandi L .; Дункан, Алексис; Ley, Ruth E .; Sogin, Mitchell L .; Джонс, Уильям Дж .; Роу, Брюс А .; Affourtit, Джейсон П .; Эгхольм, Майкл; Хенриссат, Бернар; Хит, Эндрю С .; Рыцарь, Роб; Гордон, Джеффри И. (2009). «Основной микробиом кишечника у тучных и худых близнецов» . Природа . 457 (7228): 480–484. Bibcode : 2009Natur.457..480T . DOI : 10,1038 / природа07540 . PMC 2677729 . PMID 19043404 .  
  59. ^ Лундберг, Дерек С .; Lebeis, Sarah L .; Паредес, Сур Эррера; Юристоун, Скотт; Геринг, Джейс; Малфатти, Стефани; Трембле, Жюльен; Энгельбректсон, Анна; Кунин Виктор; Рио, Тихана Главина дель; Эдгар, Роберт С .; Эйкхорст, Тило; Ley, Ruth E .; Гугенгольц, Филипп; Триндж, Сюзанна Грин; Дангл, Джеффри Л. (2012). «Определение основного микробиома корня Arabidopsis thaliana» . Природа . 488 (7409): 86–90. Bibcode : 2012Natur.488 ... 86L . DOI : 10.1038 / nature11237 . PMC 4074413 . PMID 22859206 .  
  60. ^ Хамонц, Келли; Триведи, Панкай; Гарг, Аншу; Яниц, Кэролайн; Гриньер, Жасмин; Холфорд, Пол; Botha, Frederik C .; Андерсон, Ян С .; Сингх, Браджеш К. (2018). «Полевое исследование выявляет микробиоту основных растений и относительную важность их движущих сил» . Экологическая микробиология . 20 (1): 124–140. DOI : 10.1111 / 1462-2920.14031 . PMID 29266641 . S2CID 10650949 .  
  61. ^ Чернава, Томислав; Эрлахер, Армин; Сох, Юнг; Sensen, Christoph W .; Грубе, Мартин; Берг, Габриэле (2019). «Энтеробактерии доминируют в ядре микробиома и вносят свой вклад в устойчивость рукколы (Eruca sativa Mill.)» . Микробиом . 7 (1): 13. DOI : 10,1186 / s40168-019-0624-7 . PMC 6352427 . PMID 30696492 .  
  62. ^ Лефф, Джонатан В .; Дель Тредичи, Питер; Фридман, Уильям Э .; Фирер, Ноа (2015). «Пространственное структурирование бактериальных сообществ в пределах индивидуальных билобатонов гинкго ». Экологическая микробиология . 17 (7): 2352–2361. DOI : 10.1111 / 1462-2920.12695 . PMID 25367625 . 
  63. ^ Эрнандес-Агреда, Алехандра; Гейтс, Рут Д .; Эйнсворт, Трейси Д. (2017). «Определение основного микробиома в микробном супе кораллов». Тенденции в микробиологии . 25 (2): 125–140. DOI : 10.1016 / j.tim.2016.11.003 . PMID 27919551 . 
  64. ^ Стивенс, JMC; Молан, ПК; Кларксон, Б.Д. (2005). «Обзор Leptospermum scoparium (Myrtaceae) в Новой Зеландии». Новозеландский журнал ботаники . 43 (2): 431–449. DOI : 10.1080 / 0028825X.2005.9512966 . S2CID 53515334 . 
  65. ^ Купер, РА; Молан, ПК; Хардинг, KG (2002). «Чувствительность к меду грамположительных кокков клинического значения, выделенных из ран» . Журнал прикладной микробиологии . 93 (5): 857–863. DOI : 10.1046 / j.1365-2672.2002.01761.x . PMID 12392533 . S2CID 24517001 .  
  66. ^ Rabie, Erika; Серем, Джун Чепту; Оберхольцер, Хестер Магдалена; Гаспар, Анабелла Регина Маркес; Бестер, Меган Джин (2016). «Как метилглиоксаль убивает бактерии: ультраструктурное исследование». Ультраструктурная патология . 40 (2): 107–111. DOI : 10.3109 / 01913123.2016.1154914 . ЛВП : 2263/52156 . PMID 26986806 . S2CID 13372064 .  
  67. ^ Адамс, Кристофер Дж .; Мэнли-Харрис, Мэрилин; Молан, Питер С. (2009). «Происхождение метилглиоксаля в меде новозеландской мануки (Leptospermum scoparium)». Исследование углеводов . 344 (8): 1050–1053. DOI : 10.1016 / j.carres.2009.03.020 . PMID 19368902 . 
  68. ^ Atrott, Джулия; Хаберлау, Штеффи; Хенле, Томас (2012). «Исследования образования метилглиоксаля из дигидроксиацетона в меде манука (Leptospermum scoparium)». Исследование углеводов . 361 : 7–11. DOI : 10.1016 / j.carres.2012.07.025 . PMID 22960208 . 
  69. ^ Маврик, Эльвира; Виттманн, Сильвия; Барт, Джеральд; Хенле, Томас (2008). «Идентификация и количественное определение метилглиоксаля как основного антибактериального компонента меда манука (Leptospermum scoparium) из Новой Зеландии». Молекулярное питание и пищевые исследования . 52 (4): 483–489. DOI : 10.1002 / mnfr.200700282 .
  70. ^ Гамильтон, Г., Миллнер, Дж., Робертсон, А. и Стивенс, Дж. (2013) «Оценка происхождения мануки для производства меда с высоким« уникальным фактором мануки »». Агрономия Новой Зеландии , 43 : 139–144.
  71. ^ Уильямс, Саймон; Кинг, Джессика; Ревелл, Мария; Мэнли-Харрис, Мэрилин; Балкс, Меган; Януш, Франциска; Кифер, Майкл; Клируотер, Майкл; Брукс, Питер; Доусон, Мюррей (2014). «Региональные, годовые и индивидуальные вариации содержания дигидроксиацетона в нектаре Ma̅nuka (Leptospermum scoparium) в Новой Зеландии». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 62 (42): 10332–10340. DOI : 10.1021 / jf5045958 . PMID 25277074 . 
  72. ^ Стивенс, JMC (2006) «Факторы, ответственные за различные уровни UMF® в меде манука ( Leptospermum scoparium )», докторская диссертация, Университет Вайкато.
  73. ^ Ной, Стиви; Мэнли-Харрис, Мэрилин; Клируотер, Майкл Дж. (2019). «Цветочный нектар дикой мануки (Leptospermum scoparium) варьируется между растениями больше, чем между участками». Новозеландский журнал растениеводства и садоводства . 47 (4): 282–296. DOI : 10.1080 / 01140671.2019.1670681 . S2CID 204143940 . 
  74. ^ Nickless, Элизабет М .; Андерсон, Кристофер WN; Гамильтон, Джорджи; Стивенс, Джонатан М .; Уорджент, Джейсон (2017). «Почва влияет на рост растений, густоту цветков и урожай нектара у трех сортов манука (Leptospermum scoparium)». Новозеландский журнал ботаники . 55 (2): 100–117. DOI : 10.1080 / 0028825X.2016.1247732 . S2CID 88657399 . 
  75. ^ Клируотер, Майкл Дж .; Ревелл, Мария; Ноэ, Стиви; Мэнли-Харрис, Мерилин (2018). «Влияние генотипа, стадии цветения и водного стресса на урожай цветочного нектара и состав мануки (Leptospermum scoparium)» . Летопись ботаники . 121 (3): 501–512. DOI : 10.1093 / Aob / mcx183 . PMC 5838834 . PMID 29300875 .  
  76. ^ Джонстон, Питер Р. (1998). «Эндофиты листьев мануки (Leptospermum scoparium)». Микологические исследования . 102 (8): 1009–1016. DOI : 10.1017 / S0953756297005765 .
  77. ^ Маккензи, EHC; Джонстон, PR; Бьюкенен, ПК (2006). «Контрольный список грибов на дереве (виды Kunzea и Leptospermums ) в Новой Зеландии» . Новозеландский журнал ботаники . 44 (3): 293–335. DOI : 10.1080 / 0028825X.2006.9513025 . S2CID 84538904 . 
  78. ^ Викаксоно, Вишну Ади; Sansom, Catherine E .; Eirian Jones, E .; Перри, Найджел Б.; Монах, Яна; Риджуэй, Хейли Дж. (2018). «Арбускулярные микоризные грибы, связанные с Leptospermum scoparium (Mānuka): влияние на рост растений и содержание эфирных масел». Симбиоз . 75 : 39–50. DOI : 10.1007 / s13199-017-0506-3 . S2CID 4819178 . 
  79. ^ Викаксоно, Вишну Ади; Джонс, Э. Эйриан; Монах, Яна; Риджуэй, Хейли Дж. (2016). «Бактериальная сигнатура Leptospermum scoparium (Mānuka) выявляет основные и дополнительные сообщества с биоактивными свойствами» . PLOS ONE . 11 (9): e0163717. Bibcode : 2016PLoSO..1163717W . DOI : 10.1371 / journal.pone.0163717 . PMC 5038978 . PMID 27676607 .  
  80. ^ a b Воку, Деспойна; Варели, Катерина; Зарали, Екатерина; Караманоли, Катерина; Constantinidou, Helen-Isis A .; Монокрусос, Николаос; Галлей, Джон М .; Сайнис, Иоаннис (2012). «Изучение биоразнообразия в бактериальном сообществе филлосферы Средиземноморья и его взаимосвязи с переносимыми по воздуху бактериями». Микробная экология . 64 (3): 714–724. DOI : 10.1007 / s00248-012-0053-7 . PMID 22544345 . S2CID 17291303 .  
  81. ^ Dastogeer, Khondoker MG; Ли, Хуа; Шиваситхампарам, Кришнапиллай; Джонс, Майкл Г.К .; Ду, Синь; Рен, Юнлинь; Уайли, Стивен Дж. (2017). «Метаболические реакции эндофитных растений Nicotiana benthamiana, испытывающих водный стресс» . Экологическая и экспериментальная ботаника . 143 : 59–71. DOI : 10.1016 / j.envexpbot.2017.08.008 .
  82. ^ Родригес, RJ; Уайт-младший, JF; Арнольд, AE; Редман, RS (2009). «Грибковые эндофиты: разнообразие и функциональные роли» . Новый фитолог . 182 (2): 314–330. DOI : 10.1111 / j.1469-8137.2009.02773.x . PMID 19236579 . 
  83. ^ «Экспериментальные доказательства микробного наследования в растениях и пути передачи от семян к филлосфере и корням» . 2020-05-14. DOI : 10.21203 / rs.3.rs-27656 / v1 . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  84. ^ Мацумото Х, Фан Х, Ван И, Кусстатчер П., Дуан Дж, Ву С. и др. (Январь 2021 г.). «Бактериальный эндофит семян формирует устойчивость риса к болезням». Природа Растения . 7 : 60–72. DOI : 10.1038 / s41477-020-00826-5 .
  85. ^ «Семена передают свои микробы следующему поколению» . EurekAlert! . Проверено 21 января 2021 .
  86. ^ Абдельфаттах, Ахмед; Вишневски, Майкл; Шена, Леонардо; Tack, Ayco JM «Экспериментальные доказательства микробной наследственности в растениях и путей передачи от семян к филлосфере и корням» . Экологическая микробиология . н / д (н / д). DOI : 10.1111 / 1462-2920.15392 . ISSN 1462-2920 . 

Справочники [ править ]

  • Салим М. (2015) Экология сообщества микробиома: основы и приложения Springer. ISBN 9783319116655 . 
  • Кумар В., Прасад Р., Кумар М. и Чоудхари Д. К. (2019) Микробиом в здоровье и болезнях растений: проблемы и возможности Springer. ISBN 9789811384950 . 
  • Кумар, Вивек; Прасад, Рам; Кумар, Манодж; Чоудхари, Девендра К. (10 августа 2019 г.). Микробиом в здоровье и болезнях растений: проблемы и возможности . ISBN 9789811384950.
  • Грубе, Мартин; Шлотер, Майкл; Смолла, Корнелия; Берг, Габриэле (22 января 2015 г.). Микробиом растений и его значение для здоровья растений и человека . ISBN 9782889193783. PMID  25278934 .
  • Эгамбердиева, Дильфуза; Ахмад, Парваиз (6 февраля 2018 г.). Микробиом растений: реакция на стресс . ISBN 9789811055140.
  • Кастильоне, Стефано; Чикателли, Анджела; Феррол, Нурия; Розпадек, Петр (22 августа 2019 г.). Влияние взаимодействий растений и микробиома на способность к фито- и биовосстановлению . ISBN 9782889459322.
  • Кастильоне, Стефано; Чикателли, Анджела; Феррол, Нурия; Розпадек, Петр (22 августа 2019 г.). Влияние взаимодействий растений и микробиома на способность к фито- и биовосстановлению . ISBN 9782889459322.
  • Carvalhais, Lilia C .; Деннис, Пол Г. (30 декабря 2020 г.). Микробиом растений: методы и протоколы . ISBN 9781071610398.
  • Кумар, Вивек; Прасад, Рам; Кумар, Манодж; Чоудхари, Девендра К. (10 августа 2019 г.). Микробиом в здоровье и болезнях растений: проблемы и возможности . ISBN 9789811384950.
  • Соланки, Манодж Кумар; Кашьяп, Прем Лал; Ансари, Ризван Али; Кумари, Бэби (28 августа 2020 г.). Микробиомы и здоровье растений: защита и их применение . ISBN 9780128226018.
  • Ядав, Аджар Нат (2020). Достижения в области микробиома растений и устойчивого сельского хозяйства: разнообразие и биотехнологические применения . ISBN 9789811532085.
  • Варма, Аджит. Парадигма микробиома растений . ISBN 9783030503956.
  • Доти, Шэрон Лафферти (21 сентября 2017 г.). Функциональное значение микробиома растений: последствия для сельского хозяйства, лесного хозяйства и биоэнергетики . ISBN 9783319658971.
  • Ядав (2020). Достижения в области микробиома растений и устойчивого сельского хозяйства . ISBN 9789811532047.
  • Antwis, Rachael E .; Харрисон, Ксавье А .; Кокс, Майкл Дж. (12 марта 2020 г.). Микробиомы почв, растений и животных: комплексный подход . ISBN 9781108473712.
  • Варма, Аджит; Трипати, Свати; Прасад, Рам (20 октября 2020 г.). Парадигма микробиома растений . ISBN 9783030503949.
  • Розенберг, Евгений; Зильбер-Розенберг, Илана (31 января 2014 г.). Концепция гологенома: микробиота человека, животных и растений . ISBN 9783319042411.
  • Ядав, Аджар Натх; Сингх, Джогиндер; Растегари Али Асгар; Ядав, Нилам (6 марта 2020 г.). Микробиомы растений для устойчивого ведения сельского хозяйства . ISBN 9783030384531.