 | Эта статья требует дополнительных ссылок для проверки . ( январь 2014 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
Метаболическая сеть представляет собой полный набор метаболических и физических процессов , которые определяют физиологические и биохимические свойства клетки . Таким образом, эти сети включают химические реакции метаболизма , метаболические пути , а также регуляторные взаимодействия, которые направляют эти реакции.
С секвенированием полных геномов теперь возможно реконструировать сеть биохимических реакций во многих организмах, от бактерий до человека. Некоторые из этих сетей доступны в Интернете: Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG), [1] EcoCyc, [2] BioCyc [3] и metaTIGER. [4] Метаболические сети - мощные инструменты для изучения и моделирования метаболизма.
 Одиночные линии: пути, общие для большинства форм жизни. Двойные линии: пути не у человека (встречаются, например, в растениях, грибах, прокариотах).  Оранжевые узлы: углеводный обмен .  Фиолетовые узлы: фотосинтез .  Красные узлы: клеточное дыхание .  Розовые узлы: сигнализация клеток .  Синие узлы: метаболизм аминокислот .  Серые узлы: метаболизм витаминов и кофакторов .  Коричневые узлы: нуклеотиди белковый обмен.  Зеленые узлы: липидный обмен . |
Использует [ редактировать ]
Метаболические сети могут использоваться для выявления моделей коморбидности у больных. [5] Некоторые заболевания, такие как ожирение и диабет, могут присутствовать у одного и того же человека одновременно, иногда одно заболевание является значительным фактором риска для другого заболевания. [6] Сами фенотипы болезни обычно являются следствием неспособности клетки к распаду или выработке необходимого субстрата. Однако дефект фермента в одной реакции может повлиять на потоки других последующих реакций. Эти каскадные эффекты сочетают метаболические заболевания, связанные с последующими реакциями, приводящими к коморбидным эффектам. Таким образом, сети метаболических заболеваний могут использоваться для определения того, связаны ли два расстройства из-за их коррелированных реакций. [5]
См. Также [ править ]
- Моделирование метаболической сети
- Метаболический путь
Ссылки [ править ]
- ^ "GenomeNet" . www.genome.ad.jp . Архивировано из оригинала на 2009-02-24 . Проверено 1 апреля 2020 .
- ^ "EcoCyc: Энциклопедия генов и метаболических путей E. coli" . www.ecocyc.org .
- ^ "BioCyc Pathway / Коллекция базы данных генома" . biocyc.org .
- ^ "metaTIGER - Дом" . www.bioinformatics.leeds.ac.uk . Архивировано из оригинала на 2012-03-04 . Проверено 9 июня 2010 .
- ^ a b Lee, D.- S .; Park, J .; Kay, KA; Кристакис, штат Северная Каролина; Олтвай, ЗН; Барабаши, А.-Л. (2008). «Влияние топологии метаболической сети человека на сопутствующие заболевания» . Труды Национальной академии наук . 105 (29): 9880–9885. DOI : 10.1073 / pnas.0802208105 . PMC 2481357 . PMID 18599447 .
- ^ Росс, R .; Dagnone, D .; Джонс, П.Дж.; Smith, H .; Paddags, A .; Hudson, R .; Янссен, И. (2000). «Снижение ожирения и связанных с ним сопутствующих состояний после снижения веса, вызванного диетой или снижения веса в результате физических упражнений, у мужчин. Рандомизированное контролируемое исследование» . Анналы внутренней медицины . 133 (2): 92–103. DOI : 10.7326 / 0003-4819-133-2-200007180-00008 . PMID 10896648 . S2CID 13415272 .
