Панель линий раковых клеток NCI-60 представляет собой группу из 60 линий раковых клеток человека, используемых Национальным институтом рака (NCI) для скрининга соединений для выявления потенциальной противораковой активности. [1]
Цель [ править ]
Процедура скрининга называется «Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60» и является одной из услуг по открытию и развитию программы терапевтического развития NCI (DTP). [2] [3] [4] Показатели скрининга для каждой клеточной линии цитостатического и цитотоксического воздействия тестируемых веществ. [2]
Из-за разнообразия клеточных линий можно сравнивать тестируемые соединения по их паттернам воздействия, высокая корреляция потенциально соответствует сходным механизмам воздействия. [2] Автоматическое сравнение с базой данных, содержащей более 88 000 чистых соединений и более 34 000 сырых экстрактов (по состоянию на 6 января 2017 г. [Обновить]), обеспечивается инструментом COMPARE , который показывает список веществ, ранжированных по коэффициентам корреляции Пирсона для данного тестовое вещество. [5]
Та же панель используется в программе Molecular Target Program для характеристики молекулярных мишеней. Измерения включают уровни белка, измерения РНК, статус мутации и уровни активности ферментов . [6]
Cell Lines [ править ]
Панель содержит клеточные линии, представляющие лейкоз , меланому , немелкоклеточный рак легкого и рак мозга , яичников , груди , толстой кишки , почек и простаты . [1] [2]
13 дополнительных клеточных линий оцениваются для использования в программе скрининга, среди них две линии, происходящие от пока еще не представленной мелкоклеточной карциномы легкого . [1]
Все линии клеток, кроме одной (по состоянию на 6 января 2017 г. [Обновить]), доступны другим лабораториям, включая дополнительные линии клеток. [1]
Неправильная идентификация и неправильная классификация [ править ]
Примерно на рубеже тысячелетий было обнаружено, что несколько клеточных линий были неправильно идентифицированы или неправильно классифицированы во время расследования или ранее: [7] [8] [9]
MDA-MB-435 , первоначально классифицированный как линия клеток рака груди, был идентифицирован как линия клеток меланомы. [7] При дальнейшем исследовании выяснилось, что текущий MDA-MB-435 произошел от того же человека, что и клеточная линия M14 . [7] Исследование клонов показало, что смешение с M14 произошло очень рано в истории MDA-MB-435, еще до того, как оно было введено в Программу развивающей терапии. [7]
NCI / ADR-RES , первоначально классифицированная как линия клеток рака молочной железы, была идентифицирована как линия клеток опухоли яичника. [8] NCI / ADR-RES, по-видимому, был получен в определенный момент времени из клеточной линии OVCAR-8 . [8] Первоначально клеточная линия была названа MCF-7 / ADR-RES ; он был переименован вместе с изменением классификации. [8]
Было обнаружено, что две линии клеток рака мозга, SNB-19 и U251 , принадлежат одному и тому же человеку. [9] Это делает возможной путаницу.
Было подтверждено, что 61-я линия клеток, MDA-N , произошла от неправильно классифицированной линии клеток MDA-MB-435. [7] Таким образом, она также ошибочно классифицирована, поскольку на самом деле является линией клеток меланомы, но по состоянию на 6 января 2018 года [Обновить]на официальном сайте она все еще числится как линия клеток рака груди. [1] Эта клеточная линия недоступна с 6 января 2018 года [Обновить]. [1]
International Cell Line Комитет аутентификации поддерживает список зараженных клеточных линий . [10] Он включает в себя указанные выше клеточные линии, хотя, как правило, даты и статьи отчета значительно позже первых дат и статей, вызывающих особую озабоченность в отношении соответствующей клеточной линии. [10] [7] [8] [9]
Продолжение использования неправильной классификации [ править ]
По состоянию на 2014 год в [Обновить]сотнях научных исследований MDA-MB-435 все еще используется в качестве модели рака груди, даже после того, как в 2007 году он был официально объявлен линией клеток меланомы, и даже в международных рецензируемых журналах с самым высоким рейтингом. [11] То же верно и для других неправильно идентифицированных клеточных линий. [11]
Список линий клеток NCI-60 [ править ]
Клеточная линия | Классификация опухолей | (Возможно) неверно идентифицирован | Исходная классификация | Недоступен | Время удвоения (часы) | Плотность посева | Идентификатор целлозавра и ссылка |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CCRF-CEM | Лейкемия | 26,7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID: CVCL_0207) | |||
HL-60 (ТБ) | Лейкемия | 28,6 | 40000 | HL-60 (TB) (RRID: CVCL_A794) | |||
К-562 | Лейкемия | 19,6 | 5000 | К-562 (RRID: CVCL_0004) | |||
МОЛТ-4 | Лейкемия | 27,9 | 30000 | МОЛТ-4 (RRID: CVCL_0013) | |||
RPMI-8226 | Лейкемия | 33,5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID: CVCL_0014) | |||
SR | Лейкемия | 28,7 | 20000 | SR (RRID: CVCL_1711) | |||
A549 / ATCC | Немелкоклеточное легкое | 22,9 | 7500 | A-549 (RRID: CVCL_0023) | |||
EKVX | Немелкоклеточное легкое | 43,6 | 20000 | EKVX (RRID: CVCL_1195) | |||
HOP-62 | Немелкоклеточное легкое | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID: CVCL_1285) | |||
HOP-92 | Немелкоклеточное легкое | 79,5 | 20000 | HOP-92 (RRID: CVCL_1286) | |||
NCI-H226 | Немелкоклеточное легкое | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID: CVCL_1544) | |||
NCI-H23 | Немелкоклеточное легкое | 33,4 | 20000 | NCI-H23 (RRID: CVCL_1547) | |||
NCI-H322M | Немелкоклеточное легкое | 35,3 | 20000 | NCI-H322M (RRID: CVCL_1557) | |||
NCI-H460 | Немелкоклеточное легкое | 17,8 | 7500 | NCI-H460 (RRID: CVCL_0459) | |||
NCI-H522 | Немелкоклеточное легкое | 38,2 | 20000 | NCI-H522 (RRID: CVCL_1567) | |||
ЦВЕТ 205 | Двоеточие | 23,8 | 15000 | COLO 205 (RRID: CVCL_0218) | |||
HCC-2998 | Двоеточие | 31,5 | 15000 | HCC2998 (RRID: CVCL_1266) | |||
HCT116 | Двоеточие | 17,4 | 5000 | HCT 116 (RRID: CVCL_0291) | |||
HCT-15 | Двоеточие | 20,6 | 10000 | HCT 15 (RRID: CVCL_0292) | |||
HT-29 | Двоеточие | 19,5 | 5000 | HT-29 (RRID: CVCL_0320) | |||
KM12 | Двоеточие | 23,7 | 15000 | KM12 (RRID: CVCL_1331) | |||
SW-620 | Двоеточие | 20,4 | 10000 | SW620 (RRID: CVCL_0547) | |||
SF-268 | ЦНС | 33,1 | 15000 | SF268 (RRID: CVCL_1689) | |||
SF-295 | ЦНС | 29,5 | 10000 | SF295 (RRID: CVCL_1690) | |||
SF-539 | ЦНС | 35,4 | 15000 | SF539 (RRID: CVCL_1691) | |||
СНБ-19 | ЦНС | да | ЦНС | 34,6 | 15000 | СНБ-19 (РРИД: CVCL_0535) | |
СНБ-75 | ЦНС | 62,8 | 20000 | СНБ-75 (RRID: CVCL_1706) | |||
U251 | ЦНС | да | ЦНС | 23,8 | 7500 | U-251MG (RRID: CVCL_0021) | |
LOX IMVI | Меланома | 20,5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID: CVCL_1381) | |||
МАЛЬМ-3М | Меланома | 46,2 | 20000 | Мальме-3М (RRID: CVCL_1438) | |||
M14 | Меланома | 26,3 | 15000 | M14 (RRID: CVCL_1395) | |||
MDA-MB-435 | Меланома | да | Грудь | 25,8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID: CVCL_0417) | |
СК-МЭЛ-2 | Меланома | 45,5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID: CVCL_0069) | |||
СК-МЭЛ-28 | Меланома | 35,1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID: CVCL_0526) | |||
СК-МЭЛ-5 | Меланома | 25,2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID: CVCL_0527) | |||
UACC-257 | Меланома | 38,5 | 20000 | UACC-257 (RRID: CVCL_1779) | |||
UACC-62 | Меланома | 31,3 | 10000 | UACC-62 (RRID: CVCL_1780) | |||
ИГР-ОВ1 | Яичников | 31 год | 10000 | ИГРОВ-1 (RRID: CVCL_1304) | |||
ОВКАР-3 | Яичников | 34,7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID: CVCL_0465) | |||
ОВКАР-4 | Яичников | 41,4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID: CVCL_1627) | |||
ОВКАР-5 | Яичников | 48,8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID: CVCL_1628) | |||
OVCAR-8 | Яичников | 26,1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID: CVCL_1629) | |||
NCI / ADR-RES (первоначально MCF-7 / ADR-RES) | Яичников | да | Грудь | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID: CVCL_1452) | |
СК-ОВ-3 | Яичников | 48,7 | 20000 | СК-ОВ-3 (RRID: CVCL_0532) | |||
786-О | Почечный | 22,4 | 10000 | 786-O (RRID: CVCL_1051) | |||
A498 | Почечный | 66,8 | 25000 | A-498 (RRID: CVCL_1056) | |||
ACHN | Почечный | 27,5 | 10000 | ACHN (RRID: CVCL_1067) | |||
CAKI-1 | Почечный | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID: CVCL_0234) | |||
RXF 393 | Почечный | 62,9 | 15000 | RXF 393L (RRID: CVCL_1673) | |||
SN12C | Почечный | 29,5 | 15000 | SN12C (RRID: CVCL_1705) | |||
ТК-10 | Почечный | 51,3 | 15000 | ТК-10 (RRID: CVCL_1773) | |||
UO-31 | Почечный | 41,7 | 15000 | UO-31 (RRID: CVCL_1911) | |||
ПК-3 | Предстательная железа | 27,1 | 7500 | PC-3 (RRID: CVCL_0035) | |||
ДУ-145 | Предстательная железа | 32,3 | 10000 | DU145 (RRID: CVCL_0105) | |||
MCF7 | Грудь | 25,4 | 10000 | MCF-7 (RRID: CVCL_0031) | |||
MDA-MB-231 / ATCC | Грудь | 41,9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID: CVCL_0062) | |||
MDA-MB-468 | Грудь | 62 | 2000 г. | MDA-MB-468 (RRID: CVCL_0419) | |||
HS 578T | Грудь | 53,8 | 20000 | HS 578T (RRID: CVCL_0332) | |||
МДА-Н | Меланома | да | Грудь | недоступен | 22,5 | 15000 | MDA-N (RRID: CVCL_1910) |
БТ-549 | Грудь | 53,9 | 20000 | BT-549 (RRID: CVCL_1092) | |||
Т-47Д | Грудь | 45,5 | 20000 | Т-47Д (RRID: CVCL_0553) |
Список дополнительных линий ячеек [ править ]
Клеточная линия | Классификация опухолей | Разновидность | Плотность посева | Идентификатор целлозавра и ссылка |
---|---|---|---|---|
LXFL 529 | Немелкоклеточное легкое | человек | 10000 | LXFL 529L (RRID: CVCL_D085) |
DMS 114 | Мелкоклеточное легкое | человек | 20000 | DMS 114 (RRID: CVCL_1174) |
ШП-77 | Мелкоклеточное легкое | человек | 40000 | ШП-77 (RRID: CVCL_1693) |
DLD-1 | Двоеточие | человек | 50000 | DLD-1 (RRID: CVCL_0248) |
КМ20Л2 | Двоеточие | человек | 10000 | KM20L2 (RRID: CVCL_D889) |
СНБ-78 | ЦНС | человек | 20000 | СНБ-78 (RRID: CVCL_B321) |
XF 498 | ЦНС | человек | 20000 | XF 498 (RRID: CVCL_8928) |
RPMI-7951 | Меланома | человек | 20000 | RPMI-7951 (RRID: CVCL_1666) |
M19-MEL | Меланома | человек | 10000 | M19-MEL (RRID: CVCL_B415) |
RXF-631 | Почечный | человек | 10000 | RXF 631L (RRID: CVCL_A780) |
SN12K1 | Почечный | человек | 10000 | SN12K1 (RRID: CVCL_D106) |
P388 | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 (RRID: CVCL_7222) |
P388 / ADR | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 / ADR (RRID: CVCL_IZ75) |
Ссылки [ править ]
- ^ a b c d e f g h «Линии клеток на экране in vitro» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ a b c d «Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 26 августа 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ «Услуги по открытию и развитию» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 26 августа 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ «Добро пожаловать в Программу развивающей терапии» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . Проверено 6 января 2018 .
- ^ «СРАВНИТЬ анализ» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 11 августа 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ «Молекулярные мишени» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака. 12 мая 2015 . Проверено 7 января 2018 .
- ^ a b c d e f «MDA-MB-435 и его производное MDA-N являются линиями клеток меланомы, а не линиями клеток рака груди» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ a b c d e «Клеточная линия NCI / ADR-RES - это линия опухолевых клеток яичников, а не линия груди» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ a b c «Клеточные линии ЦНС SNB-19 и U251 происходят от одного и того же человека» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 . Проверено 6 января 2018 .
- ^ a b База данных перекрестно загрязненных или неправильно идентифицированных клеточных линий (PDF) , 8.0, Международный комитет по аутентификации клеточных линий (ICLAC), 1 декабря 2016 г. , получено 6 января 2018 г.
- ^ a b Прасад, Vidudala VTS; Гопалан, Рампрасад О.Г. (2 июня 2015 г.). «Продолжение использования MDA-MB-435, линии клеток меланомы, в качестве модели рака груди человека даже в 2014 году» . NPJ рака груди . 1 : 15002–. DOI : 10.1038 / npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196 . PMID 28721362 .
- ^ a b «Результат поиска Cellosaurus: 61 результат для« Панель линии раковых клеток NCI60 » » . Целлозавр . Швейцарский институт биоинформатики . Проверено 7 января 2018 .Ссылка включает в себя список связанных страниц в результатах поиска.
- ^ «Целлозавр - ресурс знаний о клеточных линиях» . Целлозавр . Швейцарский институт биоинформатики . Проверено 17 января 2018 .Ссылка включает страницы, найденные путем поиска с соответствующими именами строк ячеек, как указано в Списке дополнительных строк ячеек .