Фосфодиэфирная связь возникает , когда именно две из гидроксильных групп в фосфорных кислотах реагируют с гидроксильными группами на других молекулах с образованием двух эфирных связей. «Связь» включает эту связь CO-PO 2 - -OC. [1] При обсуждении фосфодиэфиров доминирует их преобладание в ДНК и РНК , но фосфодиэфиры встречаются в других биомолекулах, например, в белках-носителях ацила .
Фосфодиэфирные связи составляют основу ДНК и РНК. В частности, фосфодиэфирная связь связывает 3'-атом углерода одной молекулы сахара и 5'-атом углерода другой. Эти сахаридные группы происходят из дезоксирибозы в ДНК и рибозы в РНК. Фосфодиэфиры имеют отрицательный заряд при pH 7. [2] Отталкивание между этими отрицательными зарядами влияет на конформацию полинуклеиновых кислот. Отрицательный заряд притягивает гистоны , катионы металлов, таких как магний , и полиамины .
Для образования фосфодиэфирной связи и соединения нуклеотидов трифосфатные или дифосфатные формы нуклеотидных строительных блоков разрушаются, чтобы выделять энергию, необходимую для запуска реакции, катализируемой ферментами . [3]
Гидролиз фосфодиэфирных связей катализируется фосфодиэстеразами , которые участвуют в восстановлении последовательностей ДНК. [4]
Фосфодиэфирная связь между двумя рибонуклеотидами может быть разорвана щелочным гидролизом , тогда как связь между двумя дезоксирибонуклеотидами в этих условиях более стабильна. Относительная легкость гидролиза РНК является результатом присутствия 2'- гидроксильной группы .
Ферментная активность [ править ]
Фосфодиэстераза - это фермент, который катализирует гидролиз фосфодиэфирных связей, например, связи в молекуле циклического AMP или циклического GMP .
Фермент, который играет важную роль в восстановлении окислительного повреждения ДНК, - это 3'-фосфодиэстераза.
Во время репликации ДНК, есть отверстие между фосфатами в основной цепи , оставленной ДНК - полимераза I . ДНК-лигаза способна образовывать фосфодиэфирную связь между нуклеотидами.
См. Также [ править ]
- Фосфодиэстераза
- Ингибитор фосфодиэстеразы
- Репликация ДНК , ДНК , АТФ
- Тейхоевая кислота , ДНКаза I
- PDE5
- Ник (ДНК)
Ссылки [ править ]
- ^ "Фосфодиэфирная связь" . Школа биомедицинских наук вики .
- ^ Plaisance, Лаплас (2007). Фундаментальная биохимия (3-е изд.). McGraf Educational. С. 331–334.
- ^ Кулкарни; и другие. (2008). Биохимия . Книги Прагати. С. 57–60.
- ^ Альбертс; и другие. (2017). Молекулярная биология клетки (6 изд.). Наука о гирляндах. п. 240.
