Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Дезоксирибоза , или, точнее, 2-дезоксирибоза , представляет собой моносахарид с идеализированной формулой H- (C = O) - (CH 2 ) - (CHOH) 3 -H. Его название указывает на то, что это дезоксисахар , что означает, что он получен из сахарной рибозы путем потери атома кислорода . Дезоксирибоза наиболее известна своим присутствием в ДНК . Поскольку пентозные сахара арабиноза и рибоза различаются только стереохимией на C2 ', 2-дезоксирибоза и 2-дезоксиарабиноза эквивалентны, хотя последний термин используется редко, поскольку предшественником дезоксирибозы является рибоза, а не арабиноза.

История [ править ]

Дезоксирибоза была открыта в 1929 году Фебусом Левеном . [2]

Структура [ править ]

Существует несколько изомеров с формулой H- (C = O) - (CH 2 ) - (CHOH) 3 -H, но в дезоксирибозе все гидроксильные группы находятся на одной стороне в проекции Фишера . Термин «2-дезоксирибоза» может относиться к любому из двух энантиомеров : биологически важной d -2-дезоксирибозе и редко встречающейся зеркально отраженной 1-2-дезоксирибозе . [3] d -2-дезоксирибоза является предшественником ДНК нуклеиновой кислоты . 2-дезоксирибоза представляет собой альдопентозу , то есть моносахарид с пятью атомами углерода и альдегидом. функциональная группа .

В водном растворе дезоксирибоза в основном существует в виде смеси трех структур: линейной формы H- (C = O) - (CH 2 ) - (CHOH) 3 -H и двух кольцевых форм дезоксирибофуранозы («C3'-эндо»). , с пятичленным кольцом и дезоксирибопираноза («C2'-эндо») с шестичленным кольцом. Последняя форма является преобладающей (тогда как C3'-эндо-форма предпочтительна для рибозы).

Химическое равновесие дезоксирибозы в растворе

Биологическое значение [ править ]

Как компонент ДНК, производные 2-дезоксирибозы играют важную роль в биологии. [4] Молекула ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота), которая является основным хранилищем генетической информации в жизни, состоит из длинной цепи дезоксирибозосодержащих единиц, называемых нуклеотидами , связанных через фосфатные группы. В стандартной номенклатуре нуклеиновых кислот нуклеотид ДНК состоит из молекулы дезоксирибозы с органическим основанием (обычно аденином , тимином , гуанином или цитозином ), присоединенным к 1 'атому углерода рибозы. 5'-гидроксил каждого дезоксирибозного звена заменен нафосфат (образующий нуклеотид ), который присоединен к 3 'атому углерода дезоксирибозы в предыдущем звене.

Отсутствие 2'- гидроксильной группы в дезоксирибозе, по-видимому, ответственно за повышенную механическую гибкость ДНК по сравнению с РНК, что позволяет ей принимать конформацию двойной спирали, а также (у эукариот ) компактно свертываться в маленькой клетке. ядро . Молекулы двухцепочечной ДНК также обычно намного длиннее, чем молекулы РНК. Основа РНК и ДНК структурно схожи, но РНК одноцепочечная и состоит из рибозы, а не из дезоксирибозы.

Другие биологически важные производные дезоксирибозы включают моно-, ди- и трифосфаты, а также 3'-5 'циклические монофосфаты.

Биосинтез [ править ]

Дезоксирибоза образуется из рибозо-5-фосфата ферментами, называемыми рибонуклеотидредуктазами . Эти ферменты катализируют процесс деоксигенации.

Ссылки [ править ]

  1. ^ The Merck Index: Энциклопедия химикатов, лекарств и биологических препаратов (11-е изд.), Merck, 1989, ISBN 091191028X, 2890
  2. ^ «Всеобъемлющая хронология биологических открытий» (PDF) . Проверено 31 июля 2017 года .
  3. ^ C Бернелот-Моенс и Б. Демпл (1989), Множественная активность репарации ДНК для 3'-дезоксирибозных фрагментов в Escherichia coli . Nucleic Acids Research, Volume 17, issue 2, p. 587–600.
  4. ^ C.Michael Хоган. 2010. Дезоксирибонуклеиновая кислота . Энциклопедия Земли. Национальный совет по науке и окружающей среде. ред. С. Драгган и К. Кливленд. Вашингтон