Сериновые гидролазы - один из крупнейших известных классов ферментов, включающий примерно ~ 200 ферментов или 1% генов протеома человека. [1] Отличительной особенностью этих ферментов является наличие нуклеофильного серина в их активном участке , который используется для гидролиза из субстратов . Катализ протекает путем образования промежуточного ацил-фермента через этот серин с последующим омылением промежуточного продукта, вызванным водой / гидроксидом, и регенерацией фермента. В отличие от других некаталитических серинов, нуклеофильный серин этих гидролаз обычно активируетсяреле протона, включающее каталитическую триаду, состоящую из серина, кислотного остатка (например, аспартата или глутамата ) и основного остатка (обычно гистидина ), хотя существуют варианты этого механизма.
Суперсемейство сериновых гидролаз включает:
- Сериновые протеазы , включая трипсин , химотрипсин и субтилизин.
- Внеклеточные липазы , в том числе липазы поджелудочной железы , печени , липазы , желудочная липаза , эндотелиальной липазы , и липопротеинлипазы
- Внутриклеточные липазы , включая гормоночувствительную липазу , моноацилглицеринлипазу , жировую триглицеридлипазу и диацилглицеринлипазу
- Холинэстеразы , включая ацетилхолинэстеразу и бутирилхолинэстеразу
- Малые молекулы тиоэстеразы , в том числе жирной кислоты синтазы и ацил-КоА - тиоэстеразы
- Некоторые фосфолипазы , включая фосфолипазу А2 и ацетилгидролазу фактора активации тромбоцитов.
- Протеиновые и гликановые гидролазы, включая протеинфосфатметилэстеразу 1, ацилоксиацилгидролазу и ацетилэстеразу сиаловой кислоты
- Некоторые амидазы , в том числе амидгидролаза жирных кислот
- Некоторые пептидазы, включая дипептидилпептидазу 4 , белок активации фибробластов и пролилендопептидазу.
Смотрите также
- Протеомика, основанная на деятельности
- Альфа / бета гидролазная складка
- Амид
- Фермент
- Сложный эфир
- Список ферментов
- Тиоэфир
Рекомендации
- ^ Simon GM, Cravatt BF (апрель 2010). «Протеомика на основе активности суперсемейств ферментов: сериновые гидролазы в качестве примера» . J. Biol. Chem . 285 (15): 11051–5. DOI : 10.1074 / jbc.R109.097600 . PMC 2856978 . PMID 20147750 .