3C -подобная протеаза ( 3CL pro ) или основная протеаза ( M pro ), формально известная как эндопептидаза C30 или 3-химотрипсиноподобная протеаза , [2] является основной протеазой, обнаруженной у коронавирусов . Он расщепляет полипротеин коронавируса в одиннадцати консервативных участках. Это цистеиновая протеаза , член клана протеаз PA . Он имеет каталитическую диаду цистеин-гистидин в своем активном центре и расщепляет пептидную связь Gln –( Ser / Ala / Gly ) .
Комиссия по ферментам называет это семейство основной протеиназой коронавируса SARS ( M pro ; EC 3.4.22.69 ). Протеаза 3CL соответствует неструктурному белку 5 коронавируса (nsp5). «3C» в общем названии относится к протеазе 3C (3C pro ), которая является гомологичной протеазой, обнаруженной в пикорнавирусах .
3C-подобная протеаза способна каталитически расщеплять пептидную связь между глютамином в положении P1 и небольшой аминокислотой ( серином , аланином или глицином ) в положении P1'. Коронавирус SARS 3CLpro может, например, самостоятельно расщеплять следующие пептиды : [3] [4] [5]
TSAVL Q - S GFRK-NH2 и SGVTF Q - G KFKK представляют собой два пептида, соответствующие двум сайтам саморасщепления SARS 3C-подобной протеиназы.
Протеаза играет важную роль в процессинге полипротеина репликазы коронавируса ( P0C6U8 ). Это основная протеаза коронавирусов, она соответствует неструктурному белку 5 (nsp5). [6] Он расщепляет полипротеин коронавируса в 11 консервативных участках. Протеаза 3CL имеет в активном центре каталитическую диаду цистеин-гистидин . [4] Сера цистеина действует как нуклеофил , а имидазольное кольцо гистидина — как основное основание . [7]
Альтернативные названия, предоставленные ЕС, включают 3CLpro , 3C-подобную протеазу , коронавирус 3C-подобную протеазу , Mpro , SARS 3C-подобную протеазу , 3CL-протеазу коронавируса SARS , основную пептидазу коронавируса SARS , основную протеазу коронавируса SARS , фермент SARS-CoV 3CLpro , SARS -Основная протеаза CoV , Mpro SARS-CoV и основная протеаза коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома .