Actinobacteria представляют собой тип главным образом грамположительных бактерий . Они могут быть наземными или водными . [3] Они имеют большое экономическое значение для людей, потому что сельское хозяйство и леса зависят от их вклада в почвенные системы. В почве они помогают разложить на органические вещества мертвых организмов , так что молекулы могут быть рассмотрены заново растениями . Хотя эту роль также играют грибы , актинобактерии намного меньше и, вероятно, не занимают ту же экологическую нишу . В этой ролиВ колониях часто растет обширный мицелий , как это делают грибы, и название важного отряда этого типа, Actinomycetales (актиномицеты), отражает то, что они долгое время считались грибами. Некоторые почвенные актинобактерии (например, Frankia ) живут в симбиозе с растениями, корни которых пронизывают почву, фиксируя азот для растений в обмен на доступ к некоторым сахаридам растений . Другие виды, такие как многие представители рода Mycobacterium , являются важными патогенами .
Актинобактерии (тип) | |
---|---|
Сканирующего электронного микроскопа из Actinomyces israelii . | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
(без рейтинга): | Террабактерии |
Тип: | Актинобактерии Goodfellow 2012 [1] |
Классы [2] | |
| |
Синонимы | |
|
Помимо большого интереса к актинобактериям из- за их роли в почве, о них еще многое предстоит узнать. Хотя в настоящее время они рассматриваются в первую очередь как почвенные бактерии, они могут быть более многочисленны в пресных водах. [4] Актинобактерии являются одним из доминирующих видов бактерий и содержат один из самых крупных родов бактерий, Streptomyces . [5] Streptomyces и другие актинобактерии вносят основной вклад в биологическую буферность почвы. [6] Они также являются источником многих антибиотиков .
Actinobateria рода Bifidobacterium является наиболее распространенными бактерий в микробиоме человеческих младенцев. [7] Хотя у взрослых бифидобактерий меньше, кишечные бифидобактерии помогают поддерживать слизистый барьер и снижают содержание липополисахаридов в кишечнике. [8]
Хотя некоторые из самых крупных и сложных бактериальных клеток принадлежат к актинобактериям, группа морских Actinomarinales была описана как обладающая самыми маленькими свободноживущими прокариотическими клетками. [9]
Некоторые сибирские или антарктические актинобактерии считаются древнейшими живыми организмами на Земле, замороженными в вечной мерзлоте около полумиллиона лет назад. [10] [11] Симптомы жизни были обнаружены CO.
2выпуск из мерзлоты пробы 640 тыс. лет назад и моложе. [12]
Общий
Большинство актинобактерий, имеющих медицинское или экономическое значение, относятся к подклассу Actinobacteridae и относятся к отряду Actinomycetales . Хотя многие из них вызывают заболевания у людей, Streptomyces известен как источник антибиотиков . [ необходима цитата ]
Из тех актинобактерий, которых нет в Actinomycetales, Gardnerella - одна из наиболее изученных. Классификация Gardnerella противоречива, и MeSH относит ее как к грамположительным, так и грамотрицательным организмам. [13]
Актинобактерии, особенно Streptomyces spp., Признаны продуцентами многих биоактивных метаболитов, полезных для человека в медицине, таких как антибактериальные [14] противогрибковые, [15] противовирусные, антитромботические, иммуномодификаторы, противоопухолевые препараты и ингибиторы ферментов; и в сельском хозяйстве, включая инсектициды, гербициды, фунгициды и вещества, способствующие росту растений и животных. [16] [17] Антибиотики, полученные из актинобактерий, которые имеют важное значение в медицине, включают аминогликозиды, антрациклины, хлорамфеникол, макролиды, тетрациклины и т. Д.
Актинобактерии имеют высокое содержание гуанина и цитозина в ДНК . [18] Содержание G + C в актинобактериях может достигать 70%, хотя некоторые из них могут иметь низкое содержание G + C. [19]
Анализ последовательности глутамин синтетазы был предложен для филогенетического анализа актинобактерий . [20]
Филогения
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке имен прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). [2] Филогения основана на полногеномном анализе. [21]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Смотрите также
- Список микробиоты бактериального вагиноза
Рекомендации
- ^ Гудфеллоу М. (2012). "Тип XXVI. Actinobacteria phyl. Nov.". В Goodfellow M, Kämpfer P, H.-J. Б., Трухильо М.Э, Сузуки К., Людвиг В., Уитман В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . т. 5 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. С. 33–34.
|volume=
имеет дополнительный текст ( справка )CS1 maint: множественные имена: список редакторов ( ссылка ) - ^ а б Euzéby JP, Parte AC. « Актинобактерии » . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) . Проверено 7 июня 2021 года .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Сервин Дж. А., Гербольд К. В., Скопхаммер Р. Г., Озеро Дж. А (январь 2008 г.). «Доказательства, исключающие корень древа жизни из актинобактерий» . Мол. Биол. Evol . 25 (1): 1–4. DOI : 10.1093 / molbev / msm249 . PMID 18003601 .
- ^ Гай Р., Родригес-Валера Ф., МакМахон К.Д. и др. (2011). Лопес-Гарсия П. (ред.). «Метагеномика водной толщи в нетронутом верхнем течении реки Амазонки» . PLOS ONE . 6 (8): e23785. Bibcode : 2011PLoSO ... 623785G . DOI : 10.1371 / journal.pone.0023785 . PMC 3158796 . PMID 21915244 .
- ^ С. Майкл Хоган .. 2010. Бактерии . Энциклопедия Земли. ред. Сидни Драгган и С.Дж. Кливленд, Национальный совет по науке и окружающей среде, Вашингтон, округ Колумбия. Архивировано 11 мая 2011 г. в Wayback Machine.
- ^ Ningthoujam, Debananda S .; Санасам, Сучитра; Tamreihao, K; Нимайчанд, Салам (ноябрь 2009 г.). «Антагонистическая активность местных изолятов актиномицетов против грибковых патогенов риса». Африканский журнал исследований микробиологии . 3 (11): 737–742.
- ^ Туррони Ф, Пеано К., Пасс Д.А., Форони Э, Севернини М., Клаэссон М.Дж., Керр К., Хурихейн Дж., Мюррей Д., Фулиньи Ф., Геймонд М., Марголлес А., Де Беллис Дж., О'Тул П.В., ван Синдерен Д., Марчези Дж. Р., Вентура М. (11 мая 2012 г.). «Разнообразие бифидобактерий в микробиоте кишечника младенца» . PLOS ONE . 7 (5): e36957. Bibcode : 2012PLoSO ... 736957T . DOI : 10.1371 / journal.pone.0036957 . PMC 3350489 . PMID 22606315 .
- ^ Pinzone MR, Celesia BM, Di Rosa M, Cacopardo B, Nunnari G (2012). «Микробная транслокация при хронических заболеваниях печени» . Международный журнал микробиологии . 2012 : 694629. дои : 10,1155 / 2012/694629 . PMC 3405644 . PMID 22848224 .
- ^ Гай Р., Мизуно С.М., Пиказо А., Камачо А., Родригес-Валера Ф (2013). «Метагеномика открывает новую группу актинобактерий с низким содержанием GC и сверхмалых морских актинобактерий » . Научные отчеты . 3 : 2471. Bibcode : 2013NatSR ... 3E2471G . DOI : 10.1038 / srep02471 . PMC 3747508 . PMID 23959135 .
- ^ Сассмен: Старые растения , The Guardian , 2 мая 2010
- ^ «Быть умным - это нормально • самые старые живые существа в мире: они» . Архивировано из оригинала на 2018-07-13 . Проверено 13 июля 2018 .
- ^ Джонсон, СС; Хебсгаард, МБ; Кристенсен, TR; Мастепанов, М .; Nielsen, R .; Munch, K .; Бренд, Т .; Гилберт, MTP; Zuber, MT; Bunce, M .; Ronn, R .; Гиличинский, Д .; Froese, D .; Виллерслев, Э. (2007). «Древние бактерии демонстрируют доказательства восстановления ДНК» . Труды Национальной академии наук . 104 (36): 14401–14405. Bibcode : 2007PNAS..10414401J . DOI : 10.1073 / pnas.0706787104 . PMC 1958816 . PMID 17728401 .
- ^ Gardnerella в США Национальной библиотеке медицина Медицинской предметных рубрик (MeSH)
- ^ Махаджан, Великобритания (2012). «Антибактериальные средства от актиномицетов - обзор». Границы биологических наук . 4 : 240–53. DOI : 10.2741 / E373 .
- ^ Gupte, M .; Kulkarni, P .; Гангули, Б.Н. (2002). «Противогрибковые антибиотики». Прил. Microbiol. Biotechnol . 58 (1): 46–57. DOI : 10.1007 / s002530100822 . PMID 11831475 . S2CID 8015426 .
- ^ Брессан, W (2003). «Биологический контроль патогенных грибов семян кукурузы с помощью актиномицетов». Биоконтроль . 48 (2): 233–240. DOI : 10.1023 / а: 1022673226324 . S2CID 29320215 .
- ^ Атта, Массачусетс (2009). "Биосинтез антибиотика антимицина-А, продуцируемого Streptomyces Sp. AZ-AR-262: систематика, ферментация, очистка и биологическая активность". Austral. J. Basic и Appl. Sci . 3 : 126–135.
- ^ Ventura, M .; Canchaya, C .; Tauch, A .; Chandra, G .; Фитцджеральд, Г. Ф.; Chater, KF; ван Зиндерен, Д. (5 сентября 2007 г.). «Геномика актинобактерий: прослеживание эволюционной истории древнего типа» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 71 (3): 495–548. DOI : 10.1128 / MMBR.00005-07 . hdl : 11381/1721088 . PMC 2168647 . PMID 17804669 .
- ^ Гай Р., МакМахон К.Д., Родригес-Валера Ф (2012). «Нарушение парадигмы: космополитичные и многочисленные пресноводные актинобактерии имеют низкий GC». Отчеты по микробиологии окружающей среды . 4 (1): 29–35. DOI : 10.1111 / j.1758-2229.2011.00274.x . PMID 23757226 .
- ^ Hayward D, van Helden PD, Wiid IJ (2009). «Эволюция последовательности глутаминсинтетазы в микобактериях и их использование в качестве молекулярных маркеров для видообразования актинобактерий » . BMC Evol. Биол . 9 : 48. DOI : 10.1186 / 1471-2148-9-48 . PMC 2667176 . PMID 19245690 .
- ^ Нуиуи И., Карро Л., Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Дж. П., Войке Т., Кирпидес, Северная Каролина, Пукалл Р., Кленк Х. П., Гудфеллоу М., Маркус Гёкер М. (2018). "Основанная на геноме таксономическая классификация филума актинобактерий " . Фронт. Microbiol . 9 : 2007 DOI : 10,3389 / fmicb.2018.02007 . PMC 6113628 . PMID 30186281 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
дальнейшее чтение
- Панди, Б .; Ghimire, P .; Агравал, В. П. (12–15 января 2004 г.). Исследования антибактериальной активности актиномицетов, выделенных из региона Кхумбу в Непале (PDF) . Международная конференция по Великим Гималаям: климат, здоровье, экология, управление и сохранение. Катманду. Архивировано из оригинального (PDF) 10 августа 2013 года.
- Бальц, Р.Х. (2005). «Открытие антибиотиков из актиномицетов : последует ли за упадком и падением ренессанс?». Новости SIM . 55 : 186–196.
- Бальц, Р.Х. (2007). «Противомикробные препараты от актиномицетов : назад в будущее» . Микроб . 2 (3): 125–131. Архивировано из оригинала на 2013-12-31.
Внешние ссылки
- База данных генома актиномицетов