Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Внутри- и межцепочечное сшивание ДНК

В генетике , сшивающие ДНК происходит , когда различные экзогенные или эндогенные агенты реагируют с двумя нуклеотидами в ДНК , образуя ковалентную связь между ними. Это поперечное сшивание может происходить внутри одной и той же цепи (внутрицепочечная) или между противоположными цепями двухцепочечной ДНК (межцепочечная). Эти аддукты мешают клеточному метаболизму, например репликации и транскрипции ДНК , вызывая гибель клеток . Однако эти перекрестные связи можно восстановить путем удаления или рекомбинации.

ДНК сшивки также имеет полезную заслугу в химиотерапии и ориентация раковых клеток для апоптоза , [1] , а также в понимании того, как белки взаимодействуют с ДНК.

Сшивающие агенты [ править ]

Многие охарактеризованные сшивающие агенты имеют две независимо реакционноспособные группы в одной и той же молекуле, каждая из которых способна связываться с нуклеотидным остатком ДНК. Эти агенты разделены на основе их источника происхождения и помечены как экзогенные или эндогенные. Экзогенные сшивающие агенты представляют собой химические вещества и соединения, как натуральные, так и синтетические, которые возникают в результате воздействия окружающей среды, такого как фармацевтические препараты, сигаретный дым или автомобильные выхлопные газы. Эндогенные сшивающие агенты представляют собой соединения и метаболиты, которые вводятся клеточными или биохимическими путями внутри клетки или организма.

Экзогенные агенты [ править ]

  • Азотные иприты представляют собой экзогенные алкилирующие агенты, которые реагируют с положением N 7 гуанина. Эти соединения имеют структуру ядра бис- (2-этилхлор) амина с переменной R -группой, при этом две реакционноспособные функциональные группы служат для алкилирования азотистых оснований и образования сшивки. Эти агенты наиболее предпочтительно образуют сшивку между нитями 1,3 5'-d (GNC). Введение этого агента немного изгибает дуплекс ДНК, чтобы приспособиться к присутствию агента внутри спирали. [2] Эти агенты часто вводятся в качестве фармацевтических препаратов и используются в цитотоксической химиотерапии . [3]
  • Цисплатин (цис-диамминдихлороплатина (II)) и его производные в основном действуют на соседние гуанины в их положениях N 7 . Плоское соединение связывается с азотистыми основаниями посредством замещения водой одной или обеих его хлоридных групп, позволяя цисплатину образовывать моноаддукты к ДНК или РНК, межцепочечные поперечные связи ДНК, межцепочечные поперечные связи ДНК и поперечные связи ДНК-белок. [4] Когда цисплатин образует поперечные связи ДНК, он чаще образует 1,2-внутрицепочечные поперечные связи (5'-GG), но также образует 1,3-внутрицепочечные поперечные связи (5-GNG) с меньшим процентом. [5] [6]Когда цисплатин образует межцепочечные сшивки (5'-GC), происходит серьезное искажение спирали ДНК из-за укороченного расстояния между гуанинами на противоположных цепях и цитозином, который выворачивается из спирали в результате взаимодействия GG. [7] Подобно азотистым ипритам, цисплатин часто используется при химиотерапевтическом лечении, особенно при раке яичек и яичников. [8]
  • Хлорэтилнитрозомочевина (CENU), в частности кармустин (BCNU), представляют собой сшивающие агенты, которые широко используются в химиотерапии, особенно при опухолях головного мозга. Эти агенты отличаются от других сшивающих агентов, поскольку они алкилируют O 6 гуанина с образованием O 6 -этаногуанина. Это промежуточное соединение затем приводит к межцепочечной перекрестной связи между парой оснований GC. Эти сшивающие агенты приводят только к небольшим искажениям спирали ДНК из-за меньшего размера молекул.
  • Псоралены - это природные соединения (фурокумарины), присутствующие в растениях. Эти соединения интеркалируют в ДНК в сайтах последовательности 5'-AT и образуют тимидиновые аддукты при активации в присутствии ультрафиолетовых лучей A (УФ-A) . [9] Эти ковалентные аддукты образуются путем связывания 3, 4 ( пирон ) или 4 ', 5' ( фуран ) края псоралена с 5, 6 двойной связью тимина . Псоралены могут образовывать два типа моноаддуктов и один диаддукт (межнитевое поперечное сшивание) с тимином . [10]Эти аддукты приводят к локальным искажениям ДНК в месте интеркаляции. Псоралены используются при лечении кожных заболеваний, таких как псориаз и витилиго .
  • Митомицин C (MMC) относится к классу антибиотиков, которые широко используются в химиотерапии, часто при раке желудочно-кишечного тракта. Митомицин C может действовать как сшивающий агент, только если нуклеотид ДНК восстановился до своего хинонового кольца. Когда два dG были перегруппированы и метилированы таким образом, 5'-GC межцепочечная сшивка может быть образована с экзоаминами каждого азотистого основания. Митомицин также обладает способностью образовывать моноаддукты и внутрицепочечные сшивки с ДНК. Межцепочечные сшивки Митомицина С образуются в малой бороздке ДНК, вызывая умеренное расширение или растяжение спирали ДНК, чтобы приспособиться к присутствию молекулы внутри двух цепей.

Эндогенные агенты [ править ]

  • Азотистая кислота образуется в желудке как побочный продукт из пищевых источников нитритов и может привести к повреждению поперечных связей в ДНК за счет преобразования аминогрупп ДНК в карбонилы. Этот тип поражения чаще всего возникает между двумя гуанозинами, причем 1 из 4 дезаминированных гуанозинов приводит к межцепочечному сшиванию. [11] Он индуцирует образование межцепочечных сшивок ДНК в аминогруппе экзоциклического N 2 гуанина в 5'-CG последовательностях. Это поражение слегка искажает двойную спираль.
  • Бифункциональные альдегиды представляют собой реактивные химические вещества, которые образуются эндогенно в результате перекисного окисления липидов и биосинтеза простогландинов . [12] Они создают этеноаддукты, образованные альдегидом, которые подвергаются перегруппировке с образованием поперечных связей на противоположных цепях ДНК. Малоновый диальдегид является типичным примером, который может сшивать ДНК через две экзоциклические аминогруппы гуанина. [13] Другие альдегиды, такие как формальдегид и ацетилальдегид., могут вводить поперечные связи между нитями и часто действуют как экзогенные агенты, поскольку они содержатся во многих обработанных пищевых продуктах. Α, β-ненасыщенные альдегиды, такие как акролеин и кротоновый альдегид, которые часто встречаются в пестицидах, табачном дыме и автомобильных выхлопах, являются дополнительными экзогенными агентами, которые могут вызывать перекрестные связи ДНК. В отличие от других сшивающих агентов сшивание, индуцированное альдегидом, по сути является обратимым процессом. Структура ЯМР этих типов агентов в виде межцепочечных сшивок показывает, что аддукт 5'-GC приводит к незначительному искажению ДНК, однако аддукт 5'-CG дестабилизирует спираль и вызывает изгиб и скручивание ДНК. [14]
  • Повреждения, связанные с перекрестным связыванием ДНК, также могут образовываться в условиях окислительного стресса, когда свободные радикалы кислорода генерируют реактивные промежуточные соединения в ДНК, и эти поражения участвуют в старении и раке. Тандемные повреждения ДНК с большой частотой образуются под действием ионизирующего излучения и катализируемых металлами реакций H 2 O 2 . В бескислородных условиях преобладающим поражением с двойным основанием является вид, у которого C8 гуанина связан с 5-метильной группой соседнего 3'-тимина (G [8,5-Me] T), образуя внутрицепочечные поражения. [15] [16]

Сводная таблица сшивающих агентов [ править ]

Сшивающий агентАлкилирующий агентСтруктура сшивкиПредпочтительная целевая последовательность
Азотная горчица
Intrastrand; 5'-GC
Цисплатин
Intrastrand; 5'-GC

Interstrand; 5'-GNG

Кармустин (BNCU)
Межстенд; Базовая пара GC
Митомицин С
Interstrand; 5'-GC
Псорален
Межстенд; 5'-ТА
Малоновый диальдегид
Interstrand; 5'-GC, 5'-CG
Окислительный стресс (и радиация)
Intrastrand; d (ГПТ)
Азотистая кислота
Interstrand; 5'-CG

Ремонт перекрестных связей ДНК [ править ]

Сшитая ДНК репарируется в клетках комбинацией ферментов и других факторов пути эксцизионной репарации нуклеотидов (NER), гомологичной рекомбинации и пути эксцизионной репарации оснований (BER). Для восстановления межцепочечных сшивок у эукариот 3' -створчатая эндонуклеаза из NER, XPF-ERCC1 , привлекается к сшитой ДНК, где она помогает «расцеплять» ДНК, расщепляя 3'-цепь в месте сшивки. Затем 5'-цепь расщепляется либо XPF-ERCC1, либо другой эндонуклеазой , образуя двухцепочечный разрыв (DSB), который затем может быть репарирован путем гомологичной рекомбинации . [17]

Сшивки ДНК обычно вызывают потерю информации о перекрывающихся последовательностях двух цепей ДНК. Следовательно, точное восстановление повреждения зависит от восстановления потерянной информации из неповрежденной гомологичной хромосомы в той же клетке. Извлечение может происходить путем спаривания с сестринской хромосомой, полученной во время предыдущего цикла репликации. В диплоидных клетках извлечение также может происходить путем спаривания с несестринской гомологичной хромосомой , что происходит особенно во время мейоза . [ необходима цитата ] После того, как произошло спаривание, перекрестная связь может быть удалена и исправленная информация введена в поврежденную хромосому посредством гомологичной рекомбинации.

Расщепление связи между дезоксирибозным сахаром в сахарно-фосфатном остове ДНК и связанным с ним азотистым основанием оставляет основной сайт в двухцепочечной ДНК. Эти базовые участки часто образуются как промежуточные, а затем восстанавливаются при эксцизионной репарации основания. Однако, если этим сайтам позволить сохраняться, они могут ингибировать репликацию и транскрипцию ДНК. [18] Абазовые сайты могут реагировать с аминогруппами белков с образованием перекрестных связей ДНК-белок или с экзоциклическими аминами других азотистых оснований с образованием межцепочечных перекрестных связей. Чтобы предотвратить межцепочечные или ДНК-белковые сшивки, ферменты пути BER плотно связывают абазический сайт и изолируют его от близлежащих реактивных групп, как показано на примере человеческой алкиладенин-ДНК-гликозилазы (AAG) и 3-метиладенин-ДНК-гликозилазы II (AlkA) E. coli. .[19] in vitro доказательство продемонстрировало, что межстандартные перекрестные связи, индуцированные абазическим сайтом (DOB-ICL), являются повреждениями, блокирующими репликацию и сильно ошибочно кодирующими. По сравнению с несколькими другими исследованными TLS pols, pol η, вероятно, вносит вклад в TLS-опосредованную репарацию DOB-ICL in vivo . [20] С использованием O 6 -2'-дезоксигуанозин-бутилен-O 6-2'-дезоксигуанозин (O6-dG-C4-O6-dG) повреждения ДНК, который представляет собой химически стабильную структуру, была исследована обходная активность нескольких ДНК-полимераз, и результаты показали, что pol η проявляет наивысшую обходную активность; однако 70% продуктов обхода были мутагенными, содержащими замены или делеции. Увеличение размера незакрепленных промежуточных продуктов репарации увеличивает частоту делеционных мутаций. [21]

Лечение кишечной палочки с псорален -plus-УФ - свет ( ПУВА ) производит interstrand сшивок в ДНК клеток. Cole et al. [22] и Sinden и Cole [23] представили доказательства того, что процесс гомологичной рекомбинационной репарации, требующий продуктов генов uvrA , uvrB и recA, может удалить эти перекрестные связи в E. coli . Этот процесс кажется достаточно эффективным. Даже если одной или двух нерепарированных поперечных связей достаточно для инактивации клетки, бактериальная клетка дикого типа может восстанавливать и, следовательно, восстанавливать от 53 до 71 поперечных связей псоралена. Эукариотическийдрожжевые клетки также инактивируются одной оставшейся поперечной связью, но дрожжевые клетки дикого типа могут восстанавливать от 120 до 200 поперечных связей. [24]

Приложения [ править ]

Сшивание ДНК и белка [ править ]

Методы биохимического взаимодействия [ править ]

Сшивание ДНК с белками может быть вызвано рядом химических и физических агентов, включая переходные металлы, ионизирующее излучение и эндогенные альдегиды, в дополнение к химиотерапевтическим агентам . [25] Подобно сшиванию ДНК, сшивка ДНК-белок - это повреждения в клетках, которые часто повреждаются УФ-излучением. Эффект ультрафиолета может привести к реактивным взаимодействиям и вызвать сшивание ДНК и белков, которые с ней контактируют. Эти поперечные сшивки представляют собой очень объемные и сложные поражения. В первую очередь они возникают в областях хромосом, которые подвергаются репликации ДНК и мешают клеточным процессам.

Прогресс в методах идентификации структуры прогрессировал, и добавление возможности измерения взаимодействий между ДНК и белком является требованием для полного понимания биохимических процессов. Структуру комплексов ДНК-белок можно картировать с помощью фотошивки , которая представляет собой фотоиндуцированное образование ковалентной связи между двумя макромолекулами или между двумя различными частями одной макромолекулы. Методология включает ковалентное связывание ДНК-связывающего участка ДНК-связывающего белка, специфичного к целевой последовательности, с фотоактивируемым сшивающим агентом, способным реагировать с нуклеотидами ДНК при воздействии УФ. Этот метод предоставляет информацию о взаимодействии между ДНК и белком в поперечной сшивке. [26]

Клинические методы лечения [ править ]

Пути репарации ДНК могут привести к образованию опухолевых клеток . Были разработаны методы лечения рака с использованием сшивающих агентов ДНК для взаимодействия с азотистыми основаниями ДНК для блокирования репликации ДНК. Эти перекрестно-сшивающие агенты обладают способностью действовать как терапия с одним агентом, нацеливая и разрушая определенные нуклеотиды в раковых клетках. Этот результат останавливает цикл и рост раковых клеток; Поскольку он подавляет специфические пути репарации ДНК, этот подход имеет потенциальное преимущество в виде меньшего количества побочных эффектов. [27]

У людей основной причиной смерти от рака во всем мире является рак легких, в том числе немелкоклеточная карцинома легких (НМРЛ), на которую приходится 85% всех случаев рака легких в Соединенных Штатах. [28] Людей с НМРЛ часто лечат терапевтическими соединениями платины (например, цисплатином, карбоплатином или оксалиплатином) (см. Химиотерапия рака легких ), которые вызывают межцепочечные сшивки ДНК. Среди людей с NSLC низкая экспрессия гена рака груди 1 ( BRCA1 ) в первичной опухоли коррелировала с улучшением выживаемости после химиотерапии, содержащей платину. [29] [30] Эта корреляция подразумевает, что низкий уровень BRCA1 в раке и, как следствие, низкий уровень репарации ДНК, вызывают уязвимость рака для лечения с помощью сшивающих агентов ДНК. Высокий уровень BRCA1 может защищать раковые клетки, действуя по пути гомологичной рекомбинационной репарации, который устраняет повреждения ДНК, вызванные препаратами платины. Уровень экспрессии BRCA1 потенциально является важным инструментом для настройки химиотерапии при лечении рака легких. [29] [30]

Клинические химиотерапевтические препараты могут вызывать ферментативные и неферментативные перекрестные связи ДНК-белок. Примером такой индукции являются производные платины, такие как цисплатин и оксалиплатин. Они создают неферментативные перекрестные связи ДНК-белок за счет неспецифического перекрестного сшивания белков, взаимодействующих с хроматином, с ДНК. Сшивание также возможно в других терапевтических средствах либо путем стабилизации промежуточных продуктов ковалентной ДНК-белковой реакции, либо путем создания псевдосубстрата, который захватывает фермент на ДНК. Производные камптотецина, такие как иринотекан и топотекан, нацелены и улавливают специфическую ДНК- топоизомеразу1 (TOP1) путем внедрения в интерфейс фермент-ДНК. Поскольку токсичность этих препаратов зависит от захвата TOP1, клеточная чувствительность к этим соединениям напрямую зависит от уровней экспрессии TOP1. В результате функция этих препаратов заключается в том, чтобы служить в качестве ферментных ядов, а не ингибиторов. Это может быть применено для лечения опухолевых клеток с помощью ферментных ядов TOP 2. [31]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Динс, AJ; Запад, Южная Каролина (24 июня 2011 г.). «Восстановление межцепочечных сшивок ДНК и рак» . Обзоры природы. Рак . 11 (7): 467–80. DOI : 10.1038 / nrc3088 . PMC  3560328 . PMID  21701511 .
  2. ^ Guainazzi, Angelo; Шерер, Орландо Д. (01.11.2010). «Использование синтетических межцепочечных сшивок ДНК для выяснения путей репарации и определения новых терапевтических целей для химиотерапии рака» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 67 (21): 3683–3697. DOI : 10.1007 / s00018-010-0492-6 . ISSN 1420-682X . PMC 3732395 . PMID 20730555 .   
  3. ^ Рак, Клиника Кливленда. «Азотная горчица - химиотерапевтические препараты - Chemocare» . chemocare.com . Проверено 9 октября 2017 .
  4. ^ Джеймисон, ER; Липпард, SJ (1999-09-08). «Структура, распознавание и процессинг аддуктов цисплатин-ДНК». Химические обзоры . 99 (9): 2467–2498. DOI : 10.1021 / cr980421n . ISSN 1520-6890 . PMID 11749487 .  
  5. ^ Poklar N, Пилч DS, Липпард SJ, Реддинг Е.А., Dunham SU, Breslauer KJ (июль 1996). «Влияние внутрицепочечного сшивания цисплатина на конформацию, термостабильность и энергетику 20-мерного дуплекса ДНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (15): 7606–11. DOI : 10.1073 / pnas.93.15.7606 . PMC 38793 . PMID 8755522 .  
  6. ^ Rudd Г.Н., Хартли JA, Souhami RL (1995). «Стойкость цисплатин-индуцированного межцепочечного сшивания ДНК в мононуклеарных клетках периферической крови пожилых и молодых людей». Рак-химиотерапия. Pharmacol . 35 (4): 323–6. DOI : 10.1007 / BF00689452 . PMID 7828275 . 
  7. ^ Косте, Ф .; Малинг, JM; Serre, L .; Shepard, W .; Roth, M .; Ленг, М .; Зелвер, К. (1999-04-15). «Кристаллическая структура двухцепочечной ДНК, содержащей межцепочечную перекрестную связь цисплатина с разрешением 1,63 A: гидратация на платинированном сайте» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (8): 1837–1846. DOI : 10.1093 / NAR / 27.8.1837 . ISSN 0305-1048 . PMC 148391 . PMID 10101191 .   
  8. ^ "Цисплатин" . Национальный институт рака . 2007-03-02 . Проверено 9 октября 2017 .
  9. ^ Чимино, GD; Гампер, HB; Айзекс, ST; Херст, JE (1985). «Псоралены как фотоактивные зонды структуры и функции нуклеиновых кислот: органическая химия, фотохимия и биохимия». Ежегодный обзор биохимии . 54 : 1151–1193. DOI : 10.1146 / annurev.bi.54.070185.005443 . ISSN 0066-4154 . PMID 2411210 .  
  10. ^ Ци Ву, Лаура А. Кристенсен, Рэнди Дж. Легерски и Карен М. Васкес, Восстановление несоответствия участвует в безошибочной обработке межцепочечных перекрестных связей ДНК в клетках человека, EMBO Reports 6, 6, 551–557 (2005).
  11. ^ Киршнер, Джеймс Дж .; Sigurdsson, Snorri T .; Хопкинс, Пол Б. (1992-05-01). «Межцепочечное сшивание дуплекса ДНК азотистой кислотой: ковалентная структура сшивки dG-dG в последовательности 5'-CG». Журнал Американского химического общества . 114 (11): 4021–4027. DOI : 10.1021 / ja00037a001 . ISSN 0002-7863 . 
  12. ^ Стоун, Майкл П .; Чо, Ён-Джин; Хуанг, Хай; Ким, Хе Ён; Козеков Иван Д .; Козекова, Албена; Ван, Хао; Минько, Ирина Григорьевна; Ллойд, Р. Стивен (1 июля 2008 г.). «Межцепочечные перекрестные связи ДНК, индуцированные α, β-ненасыщенными альдегидами, полученными в результате перекисного окисления липидов и источников окружающей среды» . Счета химических исследований . 41 (7): 793–804. DOI : 10.1021 / ar700246x . ISSN 0001-4842 . PMC 2785109 . PMID 18500830 .   
  13. ^ Niedernhofer, Laura J .; Дэниэлс, Дж. Скотт; Рузер, Кэрол А .; Грин, Рэйчел Э .; Марнетт, Лоуренс Дж. (2003-08-15). «Малоновый диальдегид, продукт перекисного окисления липидов, является мутагеном в клетках человека» . Журнал биологической химии . 278 (33): 31426–31433. DOI : 10,1074 / jbc.m212549200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12775726 .  
  14. ^ Дули, Патриция А .; Чжан, Минчжоу; Корбель, Грегори А .; Нечев, Любомир В .; Харрис, Констанс М .; Stone, Michael P .; Харрис, Томас М. (2008-01-08). «ЯМР-определение конформации триметиленовой межцепочечной сшивки в олигодезоксинуклеотидном дуплексе, содержащем мотив 5'-d (GpC)». Журнал Американского химического общества . 125 (1): 62–72. DOI : 10.1021 / ja0207798 . ISSN 0002-7863 . PMID 12515507 .  
  15. ^ LC Colis; П. Райчаудхури; А.К. Басу (2008). «Мутационная специфичность индуцированных гамма-излучением гуанин-тимина и тимин-гуанина внутрицепочечных сшивок в клетках млекопитающих и трансфузионный синтез за пределы гуанин-тиминового повреждения ДНК-полимеразой человека эта» . Биохимия . 47 (6): 8070–8079. DOI : 10.1021 / bi800529f . PMC 2646719 . PMID 18616294 .  
  16. ^ Коробка, Гарольд С .; Будзинский, Эдвин Э .; Давидзик, Жан Д .; Уоллес, Джон С .; Evans, Marianne S .; Гоби, Джейсон С. (1996). «Радиационно-индуцированное образование сшивки между основными фрагментами дезоксигуанозина и тимидина в дезоксигенированных растворах d (CpGpTpA)». Радиационные исследования . 145 (5): 641–643. DOI : 10.2307 / 3579285 . JSTOR 3579285 . 
  17. ^ Klein Douwel, Daisy; Боонен, Рик ACM; Лонг, Дэвид Т .; Шиповская, Анна А .; Рэшле, Маркус; Вальтер, Йоханнес С.; Книпшер, Пак (2014). «XPF-ERCC1 действует в расцеплении межцепочечных сшивок ДНК в сотрудничестве с FANCD2 и FANCP / SLX4» . Молекулярная клетка . 54 (3): 460–471. DOI : 10.1016 / j.molcel.2014.03.015 . PMC 5067070 . PMID 24726325 .  
  18. ^ Ремонт ДНК и мутагенез . Фридберг, Эррол К., Фридберг, Эррол К. (2-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. 2006. ISBN 9781555813192. OCLC  59360087 .CS1 maint: другие ( ссылка )
  19. ^ Admiraal, Сюзанна Дж .; О'Брайен, Патрик Дж. (10 марта 2015 г.). «Базовые ферменты эксцизионной репарации защищают абазовые участки в дуплексной ДНК от межцепочечных перекрестных связей» . Биохимия . 54 (9): 1849–1857. DOI : 10.1021 / bi501491z . ISSN 0006-2960 . PMC 4404639 . PMID 25679877 .   
  20. ^ Чжао, Линьлинь; Сюй, Вэньянь (02.12.2015). «Мутагенный обход аналога межцепочечной перекрестной связи ДНК, индуцированного окисленным абазическим повреждением, с помощью ДНК-полимераз человеческого синтеза» . Биохимия . 54 (50): 7409–7422. DOI : 10.1021 / acs.biochem.5b01027 . PMC 4700817 . PMID 26626537 .  
  21. ^ Чжао, Линьлинь; Сюй, Вэньянь (21.10.2016). "O 6 -2'-дезоксигуанозин-бутилен-O 6 -2'- дезоксигуанозин ДНК Interstrand Перекрестные ссылки Replication-Блокирующие и мутагенного ДНК Поражения" . Chem. Res. Toxicol . 29 (11): 1872–1882. DOI : 10.1021 / acs.chemrestox.6b00278 . PMC 5665164 . PMID 27768841 .  
  22. Перейти ↑ Cole RS, Levitan D, Sinden RR (1976). «Удаление сшивок между нитями псоралена из ДНК Escherichia coli: механизм и генетический контроль». J. Mol. Биол . 103 (1): 39–59. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (76) 90051-6 . PMID 785009 . 
  23. Перейти ↑ Sinden RR, Cole RS (1978). «Ремонт поперечно-сшитой ДНК и выживание Escherichia coli, обработанных псораленом и светом: эффекты мутаций, влияющих на генетическую рекомбинацию и метаболизм ДНК» . J. Bacteriol . 136 (2): 538–47. PMC 218577 . PMID 361714 .  
  24. Перейти ↑ Noll DM, Mason TM, Miller PS (2006). «Формирование и восстановление межцепочечных сшивок в ДНК» . Chem. Ред . 106 (2): 277–301. DOI : 10.1021 / cr040478b . PMC 2505341 . PMID 16464006 .  
  25. ^ Третьякова, Наталья; Грёлер, Арнольд; Цзи, Шаофэй (2015). «Сшивки ДНК-белок: формирование, структурные идентичности и биологические результаты» . Acc Chem Res . 48 (6): 1631–44. DOI : 10.1021 / acs.accounts.5b00056 . PMC 4704791 . PMID 26032357 .  
  26. ^ Pendergrast, P .; Чен, Ян; Эбрайт, Йон; Эбрайт, Ричард. «Определение ориентации ДНК-связывающего мотива в комплексе белок-ДНК путем фотоперекрестного связывания» (PDF) . Proc. Natl. Акад. Sci. США . DOI : 10.1073 / pnas.89.21.10287 . PMC 50323 . PMID 1332042 .   
  27. ^ Смит, Кендрик; Мартин, Шетлар. «ДНК-БЕЛКОВЫЕ ПЕРЕСЕЧЕНИЯ» . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  28. ^ Молина JR, Ян P, Cassivi SD, Шильд SE, Adjei AA (2008). «Немелкоклеточный рак легкого: эпидемиология, факторы риска, лечение и выживаемость» . Mayo Clin. Proc . 83 (5): 584–94. DOI : 10.4065 / 83.5.584 . PMC 2718421 . PMID 18452692 .  
  29. ^ а б Тарон М., Роселл Р., Фелип Э, Мендес П., Суглакос Дж., Ронко М.С., Керальт С., Майо Дж., Санчес Дж. М., Санчес Дж. Дж., Маэстре Дж. (2004). «Уровни экспрессии мРНК BRCA1 как индикатор химиорезистентности при раке легких» . Гм. Мол. Genet . 13 (20): 2443–9. DOI : 10,1093 / HMG / ddh260 . PMID 15317748 . 
  30. ^ a b Пападаки С., Сфакианаки М., Иоаннидис Г., Лагудаки Е., Трипаки М., Трифонидис К., Маврудис Д., Статопулос Е., Георгулиас В., Суглакос Дж. (2012). «Уровни экспрессии мРНК ERCC1 и BRAC1 в первичной опухоли могут предсказать эффективность химиотерапии на основе цисплатина второй линии у предварительно пролеченных пациентов с метастатическим немелкоклеточным раком легкого» . J Thorac Oncol . 7 (4): 663–71. DOI : 10.1097 / JTO.0b013e318244bdd4 . PMID 22425915 . 
  31. ^ Стингеле, Джулиан; Беллелли, Роберто; Бултон, Саймон (сентябрь 2017 г.). «Механизмы репарации ДНК-белковых сшивок». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 18 (9): 563–573. DOI : 10.1038 / nrm.2017.56 . PMID 28655905 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • PDB : 1AIO - Интерактивная структура для образования аддукта цисплатина и ДНК
  • PDB : 204D - Интерактивная структура для псоралена и сшитой ДНК
  • Псорален ультрафиолетовый свет