Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Коронавирус человека OC43
ТЕМ коронавируса OC43.jpg
Просвечивающая электронная микрофотография коронавируса человека OC43
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Семья:Coronaviridae
Род:Бетакоронавирус
Разновидность:
Бетакоронавирус 1
Напряжение:
Коронавирус человека OC43

Коронавирус человека OC43 [1] ( HCoV-OC43 ) является представителем вида Betacoronavirus 1 , который поражает людей и крупный рогатый скот. [2] [3] Инфицирующий коронавирус является оболочкой , положительным смысле , одноцепочечной РНК - вирус , который вступает в клетку - хозяина путем связывания с N-ацетил-9-О-ацетилнейраминовой рецептора кислоты . [4] OC43 - один из семи известных коронавирусов, заражающих людей. Это один из вирусов, вызывающих простуду . [5] [6] Он, как и другие коронавирусы из этого рода, имеетБетакоронавирус , подрод Embecovirus , дополнительный более короткий белок-шип, называемый гемагглютининэстеразой (HE). [7] [2]

Вирусология [ править ]

Было идентифицировано четыре генотипа HCoV-OC43 (от A до D), причем генотип D, скорее всего, возник в результате генетической рекомбинации . Полное секвенирование генома генотипов C и D и bootscan показывает анализ событий рекомбинации между генотипами В и С в генерации генотип D. из 29 вариантов вируса идентифицирован, не принадлежит ни более древним генотипа А. часы Molecular анализу с использованием шипа и нуклеокапсидой генов датирует самого недавнего общего предкавсех генотипов до 1950-х гг. Генотипы B и C относятся к 1980-м годам. Генотип B до 1990-х годов и генотип C до конца 1990-х - начала 2000-х годов. Варианты рекомбинантного генотипа D были обнаружены еще в 2004 г. [5]

Сравнение HCoV-OC43 с наиболее близким штаммом вида Betacoronavirus 1, бычьим коронавирусом BCoV, показало, что у них был самый общий недавний предок в конце 19 века, причем несколько методов дали наиболее вероятные даты около 1890 года, что заставило авторов предположить, что введение бывшего штамма к популяции человека могло вызвать 1889-1890 пандемии , которая, как правило , приписывает грипп . [8] COVID-19 пандемии принесла еще одним свидетельством ссылки, как 1889-1890 пандемии , производимых симптомов ближе к те , которые связаны с COVID-19 (инфекции , вызванной SARS-COV-2бета-коронавируса), чем гриппа. [9]

Происхождение HCoV-OC43 не известно, но считается, что он, возможно, возник от грызунов, а затем передался через крупный рогатый скот в качестве промежуточных хозяев. [10] Делеция от BCoV до HCoV-OC43 могла иметь место при межвидовой передаче от крупного рогатого скота человеку. [8]

HCoV-OC43 - один из семи известных коронавирусов, заражающих людей. Остальные шесть: [11]

  • Коронавирус человека 229E (HCoV-229E)
  • Коронавирус человека NL63 (HCoV-NL63)
  • Коронавирус человека HKU1 (HCoV-HKU1)
  • Коронавирус, связанный с ближневосточным респираторным синдромом (БВРС-КоВ)
  • Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-1)
  • Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2)

Патогенез [ править ]

Наряду с HCoV-229E , разновидностью рода Alphacoronavirus , HCoV-OC43 входит в число известных вирусов, вызывающих простуду . Оба вируса могут вызывать тяжелые инфекции нижних дыхательных путей , включая пневмонию у младенцев, пожилых людей и лиц с ослабленным иммунитетом, таких как те, кто проходит химиотерапию, и люди с ВИЧ / СПИДом . [12] [13] [14]

Эпидемиология [ править ]

Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая 10–15% случаев простуды (вирус, чаще всего вызывающий простуду, - это риновирус , который обнаруживается в 30–50% случаев). [15] Инфекции имеют сезонный характер, причем большинство случаев происходит в зимние месяцы. [16] [15] [17]

См. Также [ править ]

  • РНК-вирус
  • Коронавирус человека HKU1
  • 1889–1890 пандемия

Ссылки [ править ]

  1. ^ Ли, Пол. Молекулярная эпидемиология коронавируса человека OC43 в Гонконге (Диссертация). Библиотеки Гонконгского университета. DOI : 10.5353 / th_b4501128 . hdl : 10722/131538 .
  2. ^ a b «Браузер таксономии (Бетакоронавирус 1)» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 29 февраля 2020 .
  3. ^ Лим, Ивонн Синьи; Нг, Ян Линь; Tam, James P .; Лю, Дин Сян (25.07.2016). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса с хозяином» . Болезни . 4 (3): 26. DOI : 10.3390 / болезни 4030026 . PMC 5456285 . PMID 28933406 . См. Таблицу 1.  
  4. ^ Ли, Фанг (2016-09-29). «Структура, функция и эволюция шипованных белков коронавируса» . Ежегодный обзор вирусологии . 3 (1): 237–261. DOI : 10.1146 / annurev-virology-110615-042301 . PMC 5457962 . PMID 27578435 . BCoV S1-NTD не распознает галактозу в отличие от галектинов. Вместо этого он распознает 5-N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовую кислоту (Neu5,9Ac2) (30, 43). Тот же сахарный рецептор распознается коронавирусом человека OC43 (43, 99). OC43 и BCoV тесно связаны генетически, и OC43 мог возникнуть в результате зоонозного распространения BCoV (100, 101).  
  5. ^ а б Лау, Сусанна КП; Ли, Пол; Цанг, Алан К.Л .; Ип, Кирилл CY; Це, Герман; Ли, Родни А .; Итак, Лок-Йи; Lau, Y.-L .; Чан, Квок-Хунг; Ву, Патрик CY; Юэн, Квок-Юнг (2011). «Молекулярная эпидемиология человеческого коронавируса OC43 выявляет эволюцию различных генотипов с течением времени и недавнее появление нового генотипа из-за естественной рекомбинации» . Журнал вирусологии . 85 (21): 11325–37. DOI : 10,1128 / JVI.05512-11 . PMC 3194943 . PMID 21849456 .  
  6. ^ Гаунт, ER; Hardie, A .; Claas, ECJ; Simmonds, P .; Темплтон, KE (2010). «Эпидемиология и клинические проявления четырех человеческих коронавирусов 229E, HKU1, NL63 и OC43, обнаруженных в течение 3 лет с использованием нового метода мультиплексной ПЦР в реальном времени» . J Clin Microbiol . 48 (8): 2940–7. DOI : 10.1128 / JCM.00636-10 . PMC 2916580 . PMID 20554810 .  
  7. ^ Ву, Патрик CY; Хуанг, Йи; Лау, Сусанна КП; Юэнь, Квок-Юнг (24.08.2010). «Геномика и биоинформатический анализ коронавирусов» . Вирусы . 2 (8): 1804–20. DOI : 10,3390 / v2081803 . PMC 3185738 . PMID 21994708 . У всех представителей подгруппы А бетакоронавируса ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с нейраминат-O-ацетил-эстеразной активностью и активным сайтом FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (рис. 1).  
  8. ^ a b Виджген, Лин; Кейартс, Эльс; Моэс, Эльен; Толлен, Инге; Волланц, Эльке; Лемей, Филипп; Вандамм, Анн-Мике; Ван Ранст, Марк (2005). «Полная геномная последовательность человеческого коронавируса OC43: анализ молекулярных часов предполагает относительно недавнее событие передачи зоонозного коронавируса» . Журнал вирусологии . 79 (3): 1595–1604. DOI : 10,1128 / JVI.79.3.1595-1604.2005 . PMC 544107 . PMID 15650185 .  
  9. ^ Кнудсен, Jeppe Kyhne (13 августа 2020). "Overraskende opdagelse: Coronavirus har tidligere lagt verden ned" [Удивительное открытие: Коронавирус ранее обрушился на мир]. DR (на датском) . Дата обращения 13 августа 2020 . Датские исследования показывают, что предполагаемая пандемия гриппа в 1889 году на самом деле была вызвана коронавирусом.
  10. ^ Форни, Диего; Калиани, Рашель; Клеричи, Марио; Сирони, Мануэла (2017). «Молекулярная эволюция геномов коронавируса человека» . Тенденции в микробиологии . 25 (1): 35, 37. DOI : 10.1016 / j.tim.2016.09.001 . ISSN 0966-842X . 
  11. ^ Люнг, Дэниел. «Коронавирусы (включая ОРВИ)» . Советник по инфекционным заболеваниям . Поддержка принятия решений в медицине, ООО . Дата обращения 1 августа 2020 .
  12. ^ Wevers, Brigitte A .; Ван дер Хук, Лия (2009). «Недавно обнаруженные коронавирусы человека» . Клиники лабораторной медицины . 29 (4): 715–724. DOI : 10.1016 / j.cll.2009.07.007 . PMC 7131583 . PMID 19892230 .  
  13. ^ Махони, Джеймс Б. (2007). "Коронавирусы". В Мюррее, Патрик Р .; Барон, Эллен Джо; Йоргенсен, Джеймс Н .; Ландри, Мария Луиза; Пфаллер, Майкл А. (ред.). Руководство по клинической микробиологии (9-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. С. 1414–23. ISBN 978-1-55581-371-0.
  14. ^ Pyrc, K .; Беркхоут, Б .; Ван дер Хук, Л. (2007). «Антивирусные стратегии против коронавирусов человека». Цели лекарств от инфекционных заболеваний . 7 (1): 59–66. DOI : 10.2174 / 187152607780090757 . PMID 17346212 . 
  15. ^ а б Уот, Деннис (2004). «Простуда: обзор литературы» . Европейский журнал внутренней медицины . 15 (2): 79–88. DOI : 10.1016 / j.ejim.2004.01.006 . PMC 7125703 . PMID 15172021 .  
  16. ^ Van Der Хук, L (2007). «Коронавирусы человека: что они вызывают?» . Противовирусная терапия . 12 (4 Pt B): 651–8. PMID 17944272 . 
  17. ^ Kissler, Стивен М. (14 апреля 2020). «Прогнозирование динамики передачи SARS-CoV-2 в постпандемический период» . Наука : eabb5793. DOI : 10.1126 / science.abb5793 . PMC 7164482 . PMID 32291278 .  CS1 maint: date and year (link)

Внешние ссылки [ править ]

  • CDC
  • Вирусология онлайн
  • Коронавирусы
  • Viralzone: Бетакоронавирус
  • Ресурс базы данных и анализа вирусных патогенов (ViPR): Coronaviridae