Внутренний транскрибируемый спейсер ( ITS ) представляет собой спейсерную ДНК , расположенную между генами малой субъединицы рибосомальной РНК (рРНК) и большой субъединицы рРНК в хромосоме или соответствующей транскрибируемой областью в полицистронном транскрипте-предшественнике рРНК.
У бактерий и архей имеется единственная ITS, расположенная между генами 16S и 23S рРНК. И наоборот, у эукариот есть два ITS : ITS1 расположен между генами 18S и 5,8S рРНК, а ITS2 находится между генами 5,8S и 28S (у опистоконтов или 25S у растений) рРНК. ITS1 соответствует ITS у бактерий и архей, тогда как ITS2 возник как вставка, которая прервала предковый ген 23S рРНК. [1] [2]
У бактерий и архей ITS встречается в количестве от одной до нескольких копий, как и фланкирующие гены 16S и 23S . Когда имеется несколько копий, они не располагаются рядом друг с другом. Скорее, они встречаются в отдельных местах кольцевой хромосомы. Бактерии нередко несут гены тРНК в ITS. [3] [4]
У эукариот гены, кодирующие рибосомальную РНК и спейсеры, встречаются в тандемных повторах длиной в тысячи копий, каждый из которых разделен областями нетранскрибируемой ДНК, называемыми межгенными спейсерами (IGS) или нетранскрибируемыми спейсерами (NTS).
Каждый эукариотический рибосомальный кластер содержит 5'- внешний транскрибируемый спейсер (5'-ETS), ген 18S рРНК , ITS1 , ген 5,8S рРНК , ITS2 , ген 26S или 28S рРНК и, наконец, 3'-ETS. [5]
Во время созревания рРНК части ETS и ITS вырезаются. Будучи нефункциональными побочными продуктами этого созревания, они быстро разлагаются. [6]