Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

В биологии , маркерный ген может иметь несколько значений. В ядерной биологии и молекулярной биологии маркерный ген - это ген, используемый для определения того, была ли последовательность нуклеиновой кислоты успешно вставлена ​​в ДНК организма . В частности, существует два подтипа этих маркерных генов: селектируемый маркер и маркер для скрининга . В метагеномика и филогенетике , А ген - маркер представляет собой ортолог ген группа , которая может быть использована для разграничения между таксономическими линиями. [1]

Выбираемый маркер [ править ]

Основная статья: Выбираемый маркер

Селективный маркер защищает организм от селективного агента , который обычно убивает его или предотвращает его рост. В реакции трансформации, в зависимости от эффективности трансформации , только одна из нескольких миллионов или миллиардов клеток может поглощать ДНК. Вместо того, чтобы проверять каждую клетку, ученые используют селективный агент, чтобы убить все клетки, не содержащие чужеродную ДНК, оставляя только желаемые.

Антибиотики - наиболее распространенные селективные агенты. В бактериях почти исключительно используются антибиотики. В растениях также часто используются антибиотики, убивающие хлоропласты , хотя толерантность к солям и гормонам, подавляющим рост, становится все более популярной. У млекопитающих устойчивость к антибиотикам, убивающим митохондрии , используется в качестве селектируемого маркера.

Маркер для проверки [ править ]

Маркер для скрининга изменит внешний вид клеток, содержащих ген. Обычно используются три типа скрининга:

  • Зеленый флуоресцентный белок заставляет клетки светиться зеленым в УФ-свете. Чтобы увидеть отдельные клетки, необходим специализированный микроскоп. Также доступны желтая и красная версии, поэтому ученые могут рассматривать сразу несколько генов. Обычно он используется для измерения экспрессии генов . [2]
  • Анализ GUS (с использованием β-глюкуронидазы ) - отличный метод для обнаружения отдельной клетки путем окрашивания ее в синий цвет без использования какого-либо сложного оборудования. Недостатком является то, что клетки погибают в процессе. Это особенно распространено в растениеводстве.
  • Синий белый экран используется как в бактериях, так и в эукариотических клетках. Бактериальный ген lacZ кодирует фермент бета-галактозидазу . Когда среда, содержащая определенные галактозиды (например, X-gal ), клетки, экспрессирующие фермент, превращают X-gal в синий продукт, что можно увидеть невооруженным глазом. Таким образом, стратегия состоит в том, чтобы интегрировать вставку ДНК в ген lacZ и выбрать колонии белого цвета, при условии, что они будут правильно интегрировать вставку. С другой стороны, синие колонии будут способны преобразовывать X-gal и давать синий осадок, потому что вставка ДНК либо вообще не интегрировалась, либо находится не в правильном месте внутри плазмиды .

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Ren R, Sun Y, Zhao Y, Geiser D, Ma H, Zhou X (2016). «Филогенетическое разрешение глубоких эукариотических и грибковых отношений с использованием высококонсервативных низкокопийных ядерных генов» . Genome Biol Evol . 8 (9): 2683–701. DOI : 10.1093 / GbE / evw196 . PMC  5631032 . PMID  27604879 .
  2. ^ Чалфи, Мартин и др. «Зеленый флуоресцентный белок как маркер экспрессии генов». Science 263.5148 (1994): 802-805.

См. Также [ править ]