Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с Proteosome )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Карикатура изображения протеасомы. Его активные центры скрыты внутри трубки (синего цвета). Колпачки (красные; в данном случае регуляторные частицы 11S) на концах регулируют вход в камеру разрушения, где белок разрушается.
Вид сверху на протеасому.

Протеасомы - это белковые комплексы, которые разрушают ненужные или поврежденные белки в результате протеолиза , химической реакции, которая разрывает пептидные связи . Ферменты, которые помогают таким реакциям, называются протеазами .

Протеасомы являются частью основного механизма, с помощью которого клетки регулируют концентрацию определенных белков и разрушают неправильно свернутые белки . Белки помечаются на предмет деградации небольшим белком, называемым убиквитином . Реакция мечения катализируется ферментами, называемыми убиквитинлигазами . Как только белок помечен одной молекулой убиквитина, это сигнал другим лигазам присоединить дополнительные молекулы убиквитина. В результате получается цепь полиубиквитина, которая связывается протеасомой, что позволяет ей расщеплять меченый белок. [1] Процесс разложения дает пептиды, содержащие от семи до восьми аминокислот.long, которые затем можно расщепить на более короткие аминокислотные последовательности и использовать для синтеза новых белков. [1]

Протеасомы находятся внутри всех эукариот и архей , а также у некоторых бактерий . У эукариот протеасомы расположены как в ядре, так и в цитоплазме . [2]

По своей структуре протеасома представляет собой цилиндрический комплекс, содержащий «ядро» из четырех уложенных друг на друга колец, образующих центральную пору. Каждое кольцо состоит из семи отдельных белков. Два внутренних кольца состоят из семи субъединиц β, которые содержат от трех до семи активных сайтов протеазы . Эти сайты расположены на внутренней поверхности колец, поэтому целевой белок должен войти в центральную пору, прежде чем он распадется. Каждое из двух внешних колец содержит по семь α-субъединиц , функция которых заключается в поддержании «ворот», через которые белки попадают в ствол. Эти субъединицы α контролируются путем связывания с «кэп-структурами» или регуляторными частицами.которые распознают полиубиквитиновые метки, прикрепленные к белковым субстратам, и инициируют процесс деградации. Общая система убиквитинирования и протеасомной деградации известна как убиквитин-протеасомная система . [3]

Путь протеасомной деградации важен для многих клеточных процессов, включая клеточный цикл , регуляцию экспрессии генов и ответы на окислительный стресс . Важность протеолитической деградации внутри клеток и роль убиквитина в протеолитическом пути были признана в награде 2004 Нобелевской премии по химии в Чехановер , Гершко~d и Ирвин Роуз . [4]

Открытие [ править ]

До открытия убиквитин-протеасомной системы считалось, что деградация белков в клетках в основном зависит от лизосом , мембраносвязанных органелл с кислотными и наполненными протеазами внутренностями, которые могут деградировать и затем повторно использовать экзогенные белки и состарившиеся или поврежденные органеллы. [1] Однако работа Джозефа Этлингера и Альфреда Голдберга в 1977 г. по АТФ-зависимой деградации белков в ретикулоцитах , в которых отсутствуют лизосомы, предполагает наличие второго механизма внутриклеточной деградации. [5] В 1978 году было показано, что он состоит из нескольких отдельных белковых цепей, что в то время было новинкой среди протеаз. [6]Более поздняя работа по модификации гистонов привела к идентификации неожиданной ковалентной модификации гистонового белка за счет связи между лизиновой боковой цепью гистона и С-концевым остатком глицина убиквитина , белка, функция которого неизвестна. [7] Затем было обнаружено, что ранее идентифицированный белок, связанный с протеолитической деградацией, известный как АТФ-зависимый фактор протеолиза 1 (APF-1), был тем же белком, что и убиквитин. [8] Протеолитическая активность этой системы была выделена в виде мультибелкового комплекса, первоначально названного Шервином Уилком и Марион Орловски мульти-каталитическим протеиназным комплексом.[9] Позже был открыт АТФ- зависимый протеолитический комплекс, который отвечает за убиквитин-зависимую деградацию белка, и был назван 26S протеасомой. [10] [11]

Большая часть ранних работ, приведших к открытию протеасомной системы убиквитина, произошла в конце 1970-х - начале 1980-х годов в Технионе в лаборатории Аврама Хершко , где Аарон Цехановер работал аспирантом. Годовой творческий отпуск Хершко в лаборатории Ирвина Роуза в онкологическом центре Fox Chase дал ключевые концептуальные идеи, хотя позже Роуз преуменьшил свою роль в открытии. [12] Все трое разделили Нобелевскую премию по химии 2004 года за их работу по открытию этой системы. [4]

Хотя данные электронной микроскопии, показывающие многослойную кольцевую структуру протеасомы, стали доступны в середине 1980-х годов, [13] первая структура коровой частицы протеасомы не была решена с помощью рентгеновской кристаллографии до 1994 года. [14] В 2018 году исследование Первые атомные структуры голофермента протеасомы 26S человека в комплексе с полиубиквитилированным белковым субстратом были решены с помощью криогенной электронной микроскопии, выявив механизмы, с помощью которых субстрат распознается, деубиквитилируется, разворачивается и разрушается протеасомой 26S человека. [15]

Структура и организация [ править ]

Схематическая диаграмма коровой частицы протеасомы 20S, вид с одной стороны. Субъединицы α, которые составляют два внешних кольца, показаны зеленым, а субъединицы β, которые составляют два внутренних кольца, показаны синим.

Подкомпоненты протеасомы часто называют их коэффициентом седиментации Сведберга (обозначается S ). Протеасома, наиболее широко используемая у млекопитающих, - это цитозольная 26S протеасома, молекулярная масса которой составляет около 2000 килодальтон (кДа), содержащая одну субъединицу 20S белка и две субъединицы регуляторной крышки 19S. Ядро является полым и представляет собой замкнутую полость, в которой разрушаются белки; отверстия на двух концах ядра позволяют входить целевому белку. Каждый конец коровой частицы связан с регуляторной субъединицей 19S, которая содержит несколько активных сайтов АТФазы. и сайты связывания убиквитина; именно эта структура распознает полиубиквитинированные белки и переносит их на каталитическое ядро. [15] Альтернативная форма регуляторной субъединицы, называемая частица 11S, может связываться с ядром по существу таким же образом, как и частица 19S; 11S может играть роль в деградации чужеродных пептидов, таких как пептиды, продуцируемые после заражения вирусом . [16]

20S основная частица [ править ]

«20S» перенаправляется сюда. Для использования в других целях, см '20-е (значения) .

Число и разнообразие субъединиц, содержащихся в основной частице 20S, зависит от организма; количество отдельных и специализированных субъединиц больше у многоклеточных, чем у одноклеточных организмов, и больше у эукариот, чем у прокариот. Все частицы 20S состоят из четырех уложенных друг на друга гептамерных кольцевых структур, которые сами состоят из двух различных типов субъединиц; Субъединицы α имеют структурную природу, тогда как субъединицы β являются преимущественно каталитическими . Субъединицы α представляют собой псевдоферменты, гомологичные субъединицам β. Они собраны так, что их N-конец примыкает к концам β-субъединиц. [17] Два внешних кольца в стопке состоят из семи α-субъединиц каждое, которые служат в качестве стыковочных доменов для регуляторных частиц и α-субъединиц с N-концом (Pfam PF10584 ) образуют заслонку, которая блокирует нерегулируемый доступ подложек во внутреннюю полость. [18] Каждое из двух внутренних колец состоит из семи субъединиц β и на своих N-концах содержит активные сайты протеазы, которые осуществляют реакции протеолиза. [19] Три различных каталитических активности были идентифицированы в очищенном комплексе: химотрипсиноподобный, трипсиноподобный и пептидилглутамилпептидный гидролиз. [20] Размер протеасомы относительно консервативен и составляет около 150 ангстрем (Å) на 115 Å. Внутренняя камера имеет ширину не более 53 Å, хотя вход может иметь ширину до 13 Å, что позволяет предположить, что субстратные белки должны быть, по крайней мере, частично развернуты, чтобы войти. [21]

У архей, таких как Thermoplasma acidophilum , все α и все β субъединицы идентичны, тогда как эукариотические протеасомы, такие как протеасомы дрожжей, содержат семь различных типов каждой субъединицы. У млекопитающих субъединицы β1, β2 и β5 являются каталитическими; хотя они имеют общий механизм, они обладают тремя различными субстратными специфичностями, которые считаются химотрипсиноподобным , трипсиноподобным и пептидилглутамилпептидным гидролизом (PHGH). [22] Альтернативные формы β, обозначенные β1i, β2i и β5i, могут экспрессироваться в гемопоэтических клетках в ответ на воздействие провоспалительных сигналов.такие как цитокины , в частности, интерферон гамма . Протеасома, собранная с этими альтернативными субъединицами, известна как иммунопротеасома , субстратная специфичность которой изменена по сравнению с нормальной протеасомой. [21] Недавно в клетках человека была идентифицирована альтернативная протеасома, в которой отсутствует коровая субъединица α3. [23] Эти протеасомы (известные как протеасомы α4-α4) вместо отсутствующей субъединицы α3 образуют 20S ядерные частицы, содержащие дополнительную субъединицу α4. Ранее было известно, что эти альтернативные протеасомы α4-α4 существуют в дрожжах. [24]Хотя точная функция этих изоформ протеасом все еще в значительной степени неизвестна, клетки, экспрессирующие эти протеасомы, демонстрируют повышенную устойчивость к токсичности, вызванной ионами металлов, такими как кадмий. [23] [25]

Регулирующая частица 19S [ править ]

Частица 19S у эукариот состоит из 19 отдельных белков и делится на две части: основание из 9 субъединиц, которое непосредственно связывается с α-кольцом ядерной частицы 20S, и крышка из 10 субъединиц. Шесть из девяти основных белков представляют собой субъединицы АТФазы из семейства ААА, и эволюционный гомолог этих АТФаз существует в архее, называемый PAN (нуклеотидаза, активирующая протеасомы). [26]Ассоциация частиц 19S и 20S требует связывания АТФ с субъединицами 19S АТФазы, и гидролиз АТФ необходим для собранного комплекса для разрушения свернутых и убиквитинированных белков. Обратите внимание, что только этап развертывания субстрата требует энергии от гидролиза АТФ, в то время как только связывание АТФ может поддерживать все другие этапы, необходимые для деградации белка (например, сборка комплекса, открытие ворот, транслокация и протеолиз). [27] [28] Фактически, связывание АТФ с АТФазами само по себе поддерживает быструю деградацию развернутых белков. Однако, хотя гидролиз АТФ требуется только для разворачивания, еще не ясно, может ли эта энергия использоваться для сочетания некоторых из этих стадий. [28] [29]

Мультяшное изображение протеасомы 26S. [30]

В 2012 году две независимые попытки выяснили молекулярную архитектуру протеасомы 26S с помощью одночастичной электронной микроскопии . [31] [32] В 2016 году три независимых исследования определили первую структуру близкого к атомному разрешению протеасомы 26S человека в отсутствие субстратов с помощью крио-ЭМ. [33] [34] [35] В 2018 году была проведена большая работа по выяснению подробных механизмов деубиквитилирования, инициации транслокации и процессивного разворачивания субстратов путем одновременного определения семи атомных структур вовлеченной в субстрат 26S протеасомы. [15] В основе 19S, непосредственно примыкающих к 20S, находятся AAA-ATPases ( белки AAA), которые собираются в гетерогексамерное кольцо порядка Rpt1 / Rpt2 / Rpt6 / Rpt3 / Rpt4 / Rpt5. Это кольцо представляет собой тример димеров: Rpt1 / Rpt2, Rpt6 / Rpt3 и Rpt4 / Rpt5 димеризуются через свои N-концевые спиральные спирали. Эти спиральные катушки выступают из гексамерного кольца. Самые большие регуляторные частицы, не являющиеся АТФазами, Rpn1 и Rpn2, связываются с кончиками Rpt1 / 2 и Rpt6 / 3 соответственно. Рецептор убиквитина Rpn13 связывается с Rpn2 и завершает базовый куб-комплекс. Крышка покрывает половину гексамера ААА-АТФазы (Rpt6 / Rpt3 / Rpt4) и, неожиданно, напрямую контактирует с 20S через Rpn6 и, в меньшей степени, через Rpn5. Субъединицы Rpn9, Rpn5, Rpn6, Rpn7, Rpn3 и Rpn12, которые структурно связаны между собой и с субъединицами комплекса COP9 и eIF3(отсюда и называемые субъединицы PCI) собираются в подковообразную структуру, включающую гетеродимер Rpn8 / Rpn11. Rpn11, деубиквитинирующий фермент , помещается в устье гексамера ААА-АТФазы, что идеально подходит для удаления фрагментов убиквитина непосредственно перед транслокацией субстратов в 20S. Второй идентифицированный на сегодняшний день рецептор убиквитина, Rpn10, расположен на периферии века, рядом с субъединицами Rpn8 и Rpn9.

Конформационные изменения 19S [ править ]

Регуляторная частица 19S в составе голофермента протеасомы 26S на сегодняшний день обнаружена в шести сильно различающихся конформационных состояниях в отсутствие субстратов. [36] [37] Отличительной чертой конфигурации ААА-АТФазы в этом преобладающем низкоэнергетическом состоянии является расположение ААА-доменов, похожее на лестницу или шайбу. [30] [31] В присутствии АТФ, но при отсутствии субстрата принимаются три альтернативные, менее многочисленные конформации 19S, в первую очередь отличающиеся расположением крышки по отношению к модулю ААА-АТФазы. [33] [37] В присутствии АТФ-γS или субстрата наблюдалось значительно больше конформаций, демонстрирующих драматические структурные изменения модуля ААА-АТФазы.[15] [36] [38] [39] Некоторые конформации, связанные с субстратом, имеют большое сходство с конформациями без субстрата, но они не полностью идентичны, особенно в модуле AAA-ATPase. [15] [36] До сборки 26S регуляторная частица 19S в свободной форме также наблюдалась в семи конформационных состояниях. [40] Примечательно, что все эти конформеры несколько отличаются и имеют отличные особенности. Таким образом, регуляторная частица 19S может отбирать по меньшей мере 20 конформационных состояний в различных физиологических условиях.

Три различных конформационных состояния протеасомы 26S. [37] Предполагается, что конформации ответственны за рекрутирование субстрата, его необратимую приверженность и, наконец, процессинг и транслокацию в коровую частицу, где происходит разложение.

Регулирование 20S от 19S [ править ]

Регуляторная частица 19S отвечает за стимуляцию 20S к расщеплению белков. Основная функция 19S регуляторных АТФаз - открывать ворота в 20S, которые блокируют вход субстратов в камеру деградации. [41] Механизм, с помощью которого протеасомная АТФаза открывает эти ворота, был недавно выяснен. [18] Открытие 20S ворот и, таким образом, деградация субстрата требует C-концов протеасомных АТФаз, которые содержат специфический мотив.(т.е. мотив HbYX). С-концы АТФаз связываются с карманами в верхней части 20S и привязывают комплекс АТФазы к протеолитическому комплексу 20S, таким образом соединяя оборудование для разворачивания субстрата с механизмом деградации 20S. Связывание этих С-концов в эти карманы 20S само по себе стимулирует открытие ворот в 20S во многом так же, как «ключ в замке» открывает дверь. [18] Точный механизм, с помощью которого функционирует этот механизм «ключ-в-замке», был структурно выяснен в контексте протеасомы 26S человека при почти атомном разрешении, что позволяет предположить, что вставка пяти С-концов субъединиц АТФазы Rpt1 / 2/3/5/6 в поверхностные карманы 20S необходимы для полного открытия затвора 20S. [36] [15] [33]

Другие регуляторные частицы [ править ]

«11S» перенаправляется сюда. Не следует путать с S11 или 11 (множественное число) .

Протеасомы 20S могут также связываться со вторым типом регуляторных частиц, регуляторными частицами 11S, гептамерной структурой, которая не содержит никаких АТФаз и может способствовать деградации коротких пептидов, но не полных белков. Предполагается, что это связано с тем, что комплекс не может разворачивать более крупные субстраты. Эта структура также известна как PA28, REG или PA26. [17] Механизмы, с помощью которых он связывается с коровой частицей через С-концевые хвосты своих субъединиц и индуцирует конформационные изменения α-кольца, чтобы открыть ворота 20S, предполагают аналогичный механизм для частицы 19S. [42]Экспрессия частицы 11S индуцируется гамма-интерфероном и отвечает, вместе с β-субъединицами иммунопротеасомы, за образование пептидов, которые связываются с основным комплексом гистосовместимости . [16]

Еще одним типом частиц, не регулирующих АТФазу, является Blm10 (дрожжи) или PA200 / PSME4 (человек). Он открывает только одну α-субъединицу в воротах 20S и сам сворачивается в купол с очень маленькой порой над ним. [17]

Сборка [ править ]

Сборка протеасомы - сложный процесс из-за количества субъединиц, которые должны ассоциироваться, чтобы сформировать активный комплекс. Субъединицы β синтезируются с N-концевыми «пропептидами», которые посттрансляционно модифицируются во время сборки 20S-частицы для экспонирования протеолитического активного сайта. Частица 20S собирается из двух полупротеасом, каждая из которых состоит из семичленного про-β-кольца, присоединенного к семичленному α-кольцу. Объединение β-колец двух полупротеасом запускает треонин- зависимый автолиз пропептидов, чтобы обнажить активный сайт. Эти β-взаимодействия опосредуются в основном солевыми мостиками и гидрофобными связями.взаимодействия между консервативными альфа-спиралями , нарушение которых в результате мутации нарушает способность протеасомы к сборке. [43] Сборка полупротеасом, в свою очередь, инициируется сборкой α-субъединиц в их гептамерное кольцо, формируя матрицу для ассоциации соответствующего про-β-кольца. Сборка субъединиц α не охарактеризована. [44]

Только недавно процесс сборки 19S регуляторной частицы был в значительной степени выяснен. Регуляторная частица 19S состоит из двух отдельных субкомпонентов: основания и крышки. Сборке базового комплекса способствуют четыре шаперона сборки , Hsm3 / S5b, Nas2 / p27, Rpn14 / PAAF1 и Nas6 / ганкирин (названия дрожжей / млекопитающих). [45] Эти шапероны сборки связываются с субъединицами AAA- ATPase, и их основная функция, по-видимому, заключается в обеспечении правильной сборки гетерогексамерной AAA- ATPase.звенеть. На сегодняшний день все еще ведутся дискуссии о том, собирается ли базовый комплекс отдельно, является ли сборка шаблоном ядерной частицы 20S или существуют альтернативные пути сборки. Помимо четырех шаперонов сборки, деубиквитинирующий фермент Ubp6 / Usp14 также способствует сборке оснований, но это не существенно. [46] Крышка собирается отдельно в определенном порядке и не требует сборочных шаперонов. [47]

Процесс распада белка [ править ]

Лента диаграмма , из убиквитина , высоко консервативного белка , который служит в качестве молекулярного таргетинга тега белков для деградации протеасомы

Убиквитинирование и таргетинг [ править ]

Дополнительная информация: Убиквитин § Убиквитинирование

Белки нацелены на деградацию протеасомой с ковалентной модификацией остатка лизина, которая требует скоординированных реакций трех ферментов . На первом этапе фермент, активирующий убиквитин (известный как E1), гидролизует АТФ и аденилилирует молекулу убиквитина . Затем он переносится на остаток цистеина в активном центре E1 вместе с аденилилированием второго убиквитина. [48] Этот аденилилированный убиквитин затем переносится в цистеин второго фермента, убиквитин-конъюгированного фермента (E2). На последнем этапе член очень разнообразного класса ферментов, известных как убиквитинлигазы(E3) распознает конкретный белок, который должен быть убиквитинирован, и катализирует перенос убиквитина от E2 к этому белку-мишени. Целевой белок должен быть помечен как минимум четырьмя мономерами убиквитина (в форме полиубиквитиновой цепи), прежде чем он будет распознан крышкой протеасомы. [49] Следовательно, именно E3 придает субстратную специфичность этой системе. [50] Количество экспрессируемых белков E1, E2 и E3 зависит от организма и типа клеток, но у человека присутствует множество различных ферментов E3, что указывает на огромное количество мишеней для протеасомной системы убиквитина.

Механизм, с помощью которого полиубиквитинированный белок нацелен на протеасому, полностью не изучен. Несколько снимков с высоким разрешением протеасомы, связанной с полиубиквитинированным белком, предполагают, что рецепторы убиквитина могут быть скоординированы с деубиквитиназой Rpn11 для начального нацеливания на субстрат и взаимодействия. [15] Белки-рецепторы убиквитина имеют N-концевой убиквитин-подобный (UBL) домен и один или несколько убиквитин-ассоциированных (UBA) доменов. Домены UBL распознаются крышками протеасомы 19S, а домены UBA связывают убиквитин посредством трехспиральных пучков . Эти рецепторные белки могут сопровождать полиубиквитинированные белки в протеасому, хотя специфика этого взаимодействия и его регуляция неясны. [51]

Сам белок убиквитин состоит из 76 аминокислот и был назван из-за его повсеместной природы, поскольку он имеет высококонсервативную последовательность и обнаружен во всех известных эукариотических организмах. [52] Гены, кодирующие убиквитин у эукариот , расположены в тандемных повторах , возможно, из-за высокой транскрипционной потребности этих генов в выработке достаточного количества убиквитина для клетки. Было высказано предположение, что убиквитин является самым медленно эволюционирующим белком, идентифицированным на сегодняшний день. [53] Убиквитин содержит семь остатков лизина, с которыми может быть лигирован другой убиквитин, что приводит к различным типам полиубиквитиновых цепей. [54]Цепи, в которых каждый дополнительный убиквитин связан с лизином 48 предыдущего убиквитина, играют роль в нацеливании на протеасомы, тогда как другие типы цепей могут участвовать в других процессах. [55] [56]

Убиквитинирование путь

Разворачивание и перемещение [ править ]

После того, как белок убиквитинирован, он распознается регуляторной частицей 19S на стадии АТФ-зависимого связывания. [15] [28] Затем белок-субстрат должен войти внутрь частицы 20S, чтобы войти в контакт с протеолитическими активными центрами. Поскольку центральный канал частицы 20S является узким и закрывается N-концевыми хвостами субъединиц α кольца, субстраты должны быть, по крайней мере, частично развернуты, прежде чем они войдут в ядро. [15] Переход развернутого субстрата в ядро ​​называется транслокацией и обязательно происходит после деубиквитинирования. [15] [28] Однако порядок, в котором субстраты деубиквитинируются и разворачиваются, еще не ясен. [57]Какой из этих процессов является лимитирующей стадией в общей реакции протеолиза, зависит от конкретного субстрата; для некоторых белков процесс разворачивания ограничивает скорость, в то время как деубиквитинирование является самым медленным шагом для других белков. [27] Предполагается, что степень, в которой субстраты должны быть развернуты перед транслокацией, составляет около 20 аминокислотных остатков из-за атомной структуры вовлеченной в субстрат 26S протеасомы в состоянии, совместимом с деубиквитилированием, [15] но существенной третичной структурой и определенных нелокальных взаимодействий, таких как дисульфидные связи , достаточно для подавления разложения. [58] Наличие изначально неупорядоченного белка.сегменты достаточного размера, либо на конце белка, либо внутри, также были предложены для облегчения эффективного инициирования деградации. [59] [60]

Гейт, образованный субъединицами α, предотвращает попадание пептидов длиной более четырех остатков внутрь частицы 20S. Молекулы АТФ, связанные до начальной стадии узнавания, гидролизуются перед транслокацией. Хотя энергия необходима для развертывания субстрата, она не требуется для перемещения. [27] [28] Собранная протеасома 26S может расщеплять развернутые белки в присутствии негидролизуемого аналога АТФ , но не может расщеплять свернутые белки, что указывает на то, что энергия гидролиза АТФ используется для развертывания субстрата. [27] Прохождение развернутого субстрата через открытые ворота происходит за счет облегченной диффузии, если кэп 19S находится в АТФ-связанном состоянии. [61]

Механизм разворачивания глобулярных белков обязательно общий, но отчасти зависит от аминокислотной последовательности . Было показано, что длинные последовательности чередующихся глицина и аланина ингибируют развертывание субстрата, снижая эффективность протеасомной деградации; это приводит к высвобождению частично разложившихся побочных продуктов, возможно, из-за разделения стадий гидролиза и разворачивания АТФ. [62] Такие глицин-аланиновые повторы также встречаются в природе, например, в фиброине шелка ; в частности, определенные продукты гена вируса Эпштейна-Барра , несущие эту последовательность, могут задерживать протеасому, помогая вирусу размножаться, предотвращая презентацию антигенапо главному комплексу гистосовместимости. [63]

Частичный разрез коровой частицы протеасомы 20S, иллюстрирующий расположение активных сайтов . Субъединицы α представлены в виде зеленых сфер, а субъединицы β - в виде белковых скелетов, окрашенных индивидуальной полипептидной цепью . Маленькие розовые сферы представляют расположение остатка треонина активного сайта в каждой субъединице. Голубые химические структуры - это ингибитор бортезомиба, связанный с активными центрами.

Протеолиз [ править ]

Смотрите также: механизм треониновой протеазы §

Протеасома действует как эндопротеаза . [64] [65] [66] [67] Механизм протеолиза β-субъединицами ядер 20S-частицы осуществляется через треонин-зависимую нуклеофильную атаку . Этот механизм может зависеть от ассоциированной молекулы воды для депротонирования реакционноспособного гидроксила треонина.. Деградация происходит в центральной камере, образованной объединением двух β-колец, и обычно не высвобождает частично разрушенные продукты, вместо этого восстанавливая субстрат до коротких полипептидов, обычно длиной 7–9 остатков, хотя они могут варьироваться от 4 до 25 остатков, в зависимости от организм и субстрат. Биохимический механизм, определяющий длину продукта, полностью не охарактеризован. [68]Хотя три каталитических β-субъединицы имеют общий механизм, они имеют немного разные субстратные специфичности, которые считаются химотрипсиноподобными, трипсиноподобными и пептидилглутамилпептидными (PHGH) -подобными. Эти вариации специфичности являются результатом межатомных контактов с локальными остатками рядом с активными сайтами каждой субъединицы. Каждая каталитическая β-субъединица также имеет консервативный остаток лизина, необходимый для протеолиза. [22]

Хотя протеасома обычно продуцирует очень короткие пептидные фрагменты, в некоторых случаях эти продукты сами по себе являются биологически активными и функциональными молекулами. Определенные факторы транскрипции, регулирующие экспрессию определенных генов, включая один компонент комплекса млекопитающих NF-κB , синтезируются как неактивные предшественники, убиквитинирование которых и последующая протеасомная деградация превращает их в активную форму. Такая активность требует, чтобы протеасома расщепляла субстратный белок внутри, а не процессивно разрушала его с одного конца. Было высказано предположение, что длинные петли на поверхности этих белков служат субстратами протеасомы и проникают в центральную полость, в то время как большая часть белка остается снаружи. [69]Подобные эффекты наблюдались в дрожжевых белках; этот механизм избирательной деградации известен как регулируемый убиквитин / протеасомозависимый процессинг (RUP). [70]

Убиквитин-независимая деградация [ править ]

Хотя большинство протеасомных субстратов должно быть убиквитинировано перед деградацией, есть некоторые исключения из этого общего правила, особенно когда протеасома играет нормальную роль в посттрансляционном процессинге белка. Одним из основных примеров является протеасомная активация NF-κB путем преобразования p105 в p50 посредством внутреннего протеолиза. [69] Некоторые белки, которые предположительно нестабильны из-за изначально неструктурированных областей, [71] разлагаются убиквитин-независимым образом. Наиболее известным примером убиквитиннезависимого субстрата протеасомы является фермент орнитиндекарбоксилаза . [72] Убиквитин-независимые механизмы нацеливания на ключТакже сообщалось о регуляторах клеточного цикла, таких как p53 , хотя p53 также подвержен убиквитин-зависимой деградации. [73] Наконец, структурно аномальные, неправильно свернутые или сильно окисленные белки также подвержены убиквитин-независимой и 19S-независимой деградации в условиях клеточного стресса. [74]

Эволюция [ править ]

Собранный комплекс hslV (синий) и hslU (красный) из E. coli . Считается, что этот комплекс белков теплового шока напоминает предка современной протеасомы.

Протеасома 20S встречается повсеместно и незаменима у эукариот и архей. Бактериальная порядок Actinomycetales , также разделяют гомологи 20S протеасомы, тогда как большинство бактерий обладают тепловым шоком генов hslV и hslU , у которого ген продукты являются мультимерным протеазы расположен в двухслойном кольце и АТФазе. [75] Было высказано предположение, что белок hslV напоминает вероятного предка протеасомы 20S. [76] В целом, HslV не важен для бактерий, и не все бактерии обладают им, тогда как некоторые простейшие обладают как 20S, так и hslV системами. [75]Многие бактерии также обладают другими гомологами протеасомы и ассоциированной АТФазы, в первую очередь ClpP и ClpX . Эта избыточность объясняет, почему система HslUV не важна.

Анализ последовательности предполагает, что каталитические β-субъединицы расходились раньше в эволюции, чем преимущественно структурные α-субъединицы. У бактерий, которые экспрессируют протеасому 20S, субъединицы β имеют высокую идентичность последовательностей с субъединицами β архей и эукариот, тогда как идентичность последовательностей α намного ниже. Присутствие протеасом 20S в бактериях может быть результатом латерального переноса генов , тогда как диверсификация субъединиц среди эукариот приписывается множественным событиям дупликации генов . [75]

Контроль клеточного цикла [ править ]

Прогрессии клеточного цикла регулируется заказанной действием циклин-зависимых киназ (CDKS), активируется специфическими циклинов , которые разграничивают фазы клеточного цикла . Митотические циклины, которые сохраняются в клетке всего несколько минут, имеют один из самых коротких периодов жизни среди всех внутриклеточных белков. [1] После того, как комплекс CDK-циклин выполняет свою функцию, связанный циклин полиубиквитинируется и разрушается протеасомой, что обеспечивает направленность клеточного цикла. В частности, выход из митоза требует протеасомно-зависимой диссоциации регуляторного компонента циклина B от комплекса факторов, способствующих митозу . [77]В клетках позвоночных "проскальзывание" через митотическую контрольную точку, ведущее к преждевременному выходу из М фазы, может происходить, несмотря на задержку этого выхода контрольной точкой веретена . [78]

Более ранние контрольные точки клеточного цикла , такие как пост- ограничение точки проверка между G 1 фазой и S фазой аналогично включают протеасомную деградацию циклина А , чье убиквитинирование способствуют в анафазе способствующей сложный (APC), Е3 убиквитин лигазы . [79] APC и белковый комплекс Skp1 / Cul1 / F-бокс ( комплекс SCF ) являются двумя ключевыми регуляторами деградации циклина и контроля контрольных точек; сам SCF регулируется APC посредством убиквитинирования адапторного белка Skp2, который предотвращает активность SCF перед переходом G1-S. [80]

Отдельные компоненты частицы 19S имеют свои собственные регулирующие роли. Ганкирин , недавно идентифицированный онкобелок , является одним из подкомпонентов 19S, который также прочно связывает циклин-зависимую киназу CDK4 и играет ключевую роль в распознавании убиквитинированного р53 благодаря его сродству к убиквитинлигазе MDM2 . Ганкирин является антиапоптотическим средством, и было показано, что он сверхэкспрессируется в некоторых типах опухолевых клеток, таких как гепатоцеллюлярная карцинома . [81]

Подобно эукариотам, некоторые археи также используют протеасомы для контроля клеточного цикла, в частности, контролируя деление клеток, опосредованное ESCRT- III. [82]

Регулирование роста растений [ править ]

У растений передача сигналов с помощью ауксинов или фитогормонов, которые определяют направление и тропизм роста растений, индуцирует нацеливание на класс репрессоров факторов транскрипции, известных как белки Aux / IAA, для протеасомной деградации. Эти белки убиквитинируются SCFTIR1 или SCF в комплексе с рецептором ауксина TIR1. Деградация белков Aux / IAA дерепрессирует факторы транскрипции в семействе факторов ауксинового ответа (ARF) и индуцирует ARF-направленную экспрессию генов. [83]Клеточные последствия активации ARF зависят от типа растения и стадии развития, но участвуют в управлении ростом корней и жилок листа. Считается, что специфический ответ на дерепрессию ARF опосредуется специфичностью сочетания отдельных белков ARF и Aux / IAA. [84]

Апоптоз [ править ]

Как внутренние, так и внешние сигналы могут привести к индукции апоптоза или запрограммированной гибели клеток. Результирующая деконструкция клеточных компонентов в первую очередь осуществляется специализированными протеазами, известными как каспазы , но протеасома также играет важную и разнообразную роль в процессе апоптоза. На участие протеасомы в этом процессе указывает как увеличение убиквитинирования белка, так и ферментов E1, E2 и E3, которое наблюдается задолго до апоптоза. [85] [86] [87] Во время апоптоза протеасомы, локализованные в ядре, также перемещаются в пузырьки внешней мембраны, характерные для апоптоза. [88]

Ингибирование протеасом по-разному влияет на индукцию апоптоза в разных типах клеток. В общем, протеасома не требуется для апоптоза, хотя ее ингибирование проапоптозно для большинства типов клеток, которые были изучены. Апоптоз опосредуется нарушением регулируемой деградации белков клеточного цикла, способствующих росту. [89] Тем не менее, некоторые клеточные линии , - в частности, первичные культуры из покоящихся и дифференцированных клеток , таких как тимоциты и нейроны - предотвращаются апоптоз под воздействием ингибиторов протеасом. Механизм этого эффекта не ясен, но предполагается, что он специфичен для клеток в состоянии покоя или является результатом дифференциальной активности проапоптотической киназы JNK . [90] Способность ингибиторов протеасом , чтобы индуцировать апоптоз в быстро делящихся клеток была использована в нескольких недавно разработанных химиотерапевтических агентов , таких как бортезомиба и salinosporamide A .

Ответ на клеточный стресс [ править ]

В ответ на клеточные напряжения - такие , как инфекции , тепловой шок или окислительные повреждение  - белки шока тепла , которые идентифицируют неправильно свернутые или развернутые белки и нацелены на их деградацию протеосомной выражены. И Hsp27, и Hsp90 - белки- шапероны участвуют в повышении активности убиквитин-протеасомной системы, хотя они не являются прямыми участниками этого процесса. [91] Hsp70 , с другой стороны, связывает открытые гидрофобные участки на поверхности неправильно свернутых белков и привлекает убиквитинлигазы E3, такие как CHIP, для маркировки белков для протеасомной деградации.[92] Белок CHIP (карбоксильный конец белка, взаимодействующего с Hsp70) сам регулируется посредством ингибирования взаимодействий между ферментом E3 CHIP и его партнером по связыванию E2. [93]

Существуют аналогичные механизмы, способствующие деградации белков, поврежденных окислением, через протеасомную систему. В частности, протеасомы, локализованные в ядре, регулируются PARP и активно разрушают неправильно окисленные гистоны . [94] Окисленные белки, которые часто образуют большие аморфные агрегаты в клетке, могут быть разложены непосредственно ядром 20S-частицы без регуляторного колпачка 19S и не требуют гидролиза АТФ или мечения убиквитином. [74] Однако высокий уровень окислительного повреждения увеличивает степень сшивки между фрагментами белка, делая агрегаты устойчивыми к протеолизу. Большее количество и размер таких сильно окисленных агрегатов связаны сстарение . [95]

Нарушение регуляции протеасомной системы убиквитина может способствовать возникновению нескольких нервных заболеваний. Это может привести к опухолям головного мозга, таким как астроцитомы . [96] При некоторых нейродегенеративных заболеваниях с поздним началом, которые имеют общую агрегацию неправильно свернутых белков, таких как болезнь Паркинсона и болезнь Альцгеймера , могут образовываться большие нерастворимые агрегаты неправильно свернутых белков, которые затем приводят к нейротоксичности через механизмы, которые не являются пока что хорошо понято. Сниженная активность протеасом была предложена как причина агрегации и образования телец Леви при болезни Паркинсона. [97] Эта гипотеза подтверждается наблюдением, чтодрожжевые модели болезни Паркинсона более чувствительны к токсичности α-синуклеина , основного белкового компонента телец Леви, в условиях низкой протеасомной активности. [98] Нарушение протеасомной активности может лежать в основе когнитивных расстройств, таких как расстройства аутистического спектра , а также мышечных и нервных заболеваний, таких как миопатия с тельцами включения . [96]

Роль в иммунной системе [ править ]

Протеасома играет прямую, но важную роль в функции адаптивной иммунной системы . Пептидные антигены отображаются белками класса I главного комплекса гистосовместимости (MHC) на поверхности антигенпрезентирующих клеток . Эти пептиды являются продуктами протеасомной деградации белков, вызванных вторжением патогена . Хотя конститутивно экспрессируемые протеасомы могут участвовать в этом процессе, специализированный комплекс, состоящий из белков, экспрессия которых индуцируется гамма-интерфероном., являются основными продуцентами пептидов, оптимальных по размеру и составу для связывания MHC. Эти белки, экспрессия которых увеличивается во время иммунного ответа, включают регуляторную частицу 11S, основная известная биологическая роль которой регулирует продукцию лигандов MHC, и специализированные субъединицы β, называемые β1i, β2i и β5i, с измененной субстратной специфичностью. Комплекс, образованный специализированными субъединицами β, известен как иммунопротеасома . [16] Другая субъединица варианта β5i, β5t, экспрессируется в тимусе, что приводит к образованию специфической для тимуса «тимопротеасомы», функция которой пока неясна. [99]

Сила связывания лиганда MHC класса I зависит от состава С-конца лиганда , поскольку пептиды связываются за счет водородных связей и за счет тесных контактов с областью, называемой «B-карманом» на поверхности MHC. Многие аллели MHC класса I предпочитают гидрофобные С-концевые остатки, и иммунопротеасомный комплекс с большей вероятностью генерирует гидрофобные С-концы. [100]

Благодаря своей роли в генерации активированной формы NF-κB , антиапоптотического и провоспалительного регулятора экспрессии цитокинов , протеасомная активность связана с воспалительными и аутоиммунными заболеваниями . Повышенные уровни протеасомной активности коррелируют с активностью заболевания и связаны с аутоиммунными заболеваниями, включая системную красную волчанку и ревматоидный артрит . [16]

Протеасома также участвует во внутриклеточном протеолизе связанных с антителами вирионов, опосредованном антителами. В этом пути нейтрализации TRIM21 (белок из семейства трехчастных мотивов) связывается с иммуноглобулином G, направляя вирион в протеасому, где он разрушается. [101]

Ингибиторы протеасомы [ править ]

Основная статья: ингибитор протеасомы
Химическая структура бортезомиба (боронированная форма MG132), ингибитора протеасом, используемого в химиотерапии, который особенно эффективен против множественной миеломы
Бортезомиб связан с коровой частицей протеасомы дрожжей . Молекула бортезомиба находится в центре, окрашенном в зависимости от типа атома ( углерод = розовый, азот = синий, кислород = красный, бор = желтый), окруженная локальной поверхностью белка. Синий участок - это каталитический остаток треонина , активность которого блокируется присутствием бортезомиба.

Ингибиторы протеасомы имеют эффективную анти- опухолевой активности в культуре клеток , индуцируя апоптоз путем разрушения регулируемой деградации белков клеточного цикла про-рост. [89] Этот подход селективной индукции апоптоза в опухолевых клетках доказал свою эффективность на животных моделях и в испытаниях на людях.

Лактацистин , природный продукт, синтезируемый бактериями Streptomyces , был первым обнаруженным непептидным ингибитором протеасом [102] и широко используется в качестве инструмента исследования в биохимии и клеточной биологии. Лицензия на производство лактацистина была передана компании Myogenics / Proscript, которая была приобретена компанией Millennium Pharmaceuticals , теперь входящей в состав Takeda Pharmaceuticals . Лактацистин ковалентно модифицирует амино-концевой треонин каталитических β-субъединиц протеасомы, особенно β5-субъединицу, отвечающую за химотрипсиноподобную активность протеасомы. Это открытие помогло установить протеасому как новый с точки зрения механизмов класс протеаз: амино-концевую треониновую протеазу .

Бортезомиб (Boronated MG132), молекула, разработанная Millennium Pharmaceuticals и продаваемая как Velcade, является первым ингибитором протеасом, который получил клиническое применение в качестве химиотерапевтического агента. [103] Бортезомиб используется при лечении множественной миеломы . [104] В частности, наблюдалось, что множественная миелома приводит к увеличению уровней пептидов, производных от протеасом, в сыворотке крови, которые снижаются до нормальных уровней в ответ на успешную химиотерапию. [105] Исследования на животных показали, что бортезомиб также может иметь клинически значимые эффекты при раке поджелудочной железы . [106] [107]Были начаты доклинические и ранние клинические исследования для изучения эффективности бортезомиба при лечении других В-клеточных форм рака [108], особенно некоторых типов неходжкинской лимфомы . [109] Клинические результаты, кажется, также оправдывают использование ингибитора протеасом в сочетании с химиотерапией при В-клеточном остром лимфобластном лейкозе. [110] Ингибиторы протеасом могут убивать некоторые типы культивируемых лейкозных клеток, устойчивых к глюкокортикоидам. [111]

Молекула ритонавира , продаваемая как норвир, была разработана как ингибитор протеазы и использовалась для борьбы с ВИЧ- инфекцией. Однако было показано, что он ингибирует протеасомы, а также свободные протеазы; а именно, химотрипсиноподобная активность протеасомы ингибируется ритонавиром, в то время как трипсиноподобная активность несколько усиливается. [112] Исследования на животных моделях показывают, что ритонавир может оказывать ингибирующее действие на рост клеток глиомы . [113]

Ингибиторы протеасом также показали себя многообещающими при лечении аутоиммунных заболеваний на животных моделях. Например, исследования на мышах, несущих трансплантаты кожи человека, показали уменьшение размеров поражений от псориаза после лечения ингибитором протеасом. [114] Ингибиторы также показывают положительный эффект на моделях астмы на грызунах . [115]

Мечение и ингибирование протеасомы также представляет интерес в лабораторных условиях для исследования протеасомной активности в клетках как in vitro, так и in vivo . Наиболее часто используемые лабораторные ингибиторы - это лактацистин и пептидный альдегид MG132, первоначально разработанные лабораторией Голдберга. Флуоресцентные ингибиторы также были разработаны для специфической маркировки активных сайтов собранной протеасомы. [116]

Клиническое значение [ править ]

Протеасома и ее субъединицы имеют клиническое значение по крайней мере по двум причинам: (1) нарушенная комплексная сборка или дисфункциональная протеасома может быть связана с патофизиологией конкретных заболеваний, и (2) они могут использоваться в качестве мишеней для лекарств для терапевтических целей. вмешательства. Совсем недавно были предприняты дополнительные усилия по рассмотрению протеасомы для разработки новых диагностических маркеров и стратегий. Улучшенное и всестороннее понимание патофизиологии протеасомы должно привести к клиническому применению в будущем.

Протеасомы образуют ключевой компонент убиквитин-протеасомной системы (UPS) [117] и соответствующего клеточного контроля качества белка (PQC). Убиквитинирование белков и последующий протеолиз и деградация протеасомами являются важными механизмами регуляции клеточного цикла , роста и дифференцировки клеток , транскрипции генов, передачи сигнала и апоптоза . [118]Впоследствии нарушение сборки и функции протеасомного комплекса ведет к снижению протеолитической активности и накоплению поврежденных или неправильно свернутых белков. Такое накопление белка может способствовать патогенезу и фенотипическим характеристикам нейродегенеративных заболеваний, [119] [120] сердечно-сосудистых заболеваний, [121] [122] [123] воспалительных реакций и аутоиммунных заболеваний [124], а также ответов системного повреждения ДНК, ведущих к злокачественным новообразованиям. . [125]

Некоторые экспериментальные и клинические исследования показали , что аберраций и дерегулирования от ИБП участвовать в патогенезе ряда нейродегенеративных и myodegenerative расстройств, включая болезнь Альцгеймера , [126] Болезнь Паркинсона [127] и болезнь Пика , [128] боковой амиотрофический склероз (БАС) , [128] болезнь Хантингтона , [127] болезнь Крейтцфельдта – Якоба , [129] и болезни двигательных нейронов, полиглутаминовые (PolyQ) заболевания, мышечные дистрофии [130] и несколько редких форм нейродегенеративных заболеваний, связанных с деменцией.. [131] Как часть убиквитин-протеасомной системы (UPS), протеасома поддерживает гомеостаз сердечного белка и, таким образом, играет важную роль в ишемическом повреждении сердца , [132] гипертрофии желудочков [133] и сердечной недостаточности . [134] Кроме того, накапливаются доказательства того, что UPS играет важную роль в злокачественной трансформации. Протеолиз UPS играет важную роль в ответах раковых клеток на стимулирующие сигналы, которые имеют решающее значение для развития рака. Соответственно, экспрессия генов за счет деградации факторов транскрипции , таких как p53 , c-jun , c-Fos , NF-κB, c-Myc , HIF-1α, MATα2, STAT3 , стерол-регулируемые связывающие элементы белки и рецепторы андрогенов контролируются UPS и, таким образом, участвуют в развитии различных злокачественных новообразований. [135] Кроме того, UPS регулирует деградацию продуктов гена-супрессора опухоли, таких как аденоматозный полипоз кишечной палочки (APC) при колоректальном раке, ретинобластоме (Rb). и опухолевый супрессор фон Хиппеля – Линдау (VHL), а также ряд протоонкогенов ( Raf , Myc , Myb , Rel , Src , Mos ,ABL ). UPS также участвует в регуляции воспалительных реакций. Эта активность обычно объясняется ролью протеасом в активации NF-κB, который дополнительно регулирует экспрессию провоспалительных цитокинов, таких как TNF-α , IL-β, IL-8 , молекул адгезии ( ICAM-1 , VCAM-1 , P-селектин ) и простагландины и оксид азота (NO). [124] Кроме того, UPS также играет роль в воспалительных реакциях в качестве регуляторов пролиферации лейкоцитов, в основном за счет протеолиза циклинов и деградации ингибиторов CDK .[136] Наконец, у пациентов с аутоиммунными заболеваниями с СКВ , синдромом Шегрена и ревматоидным артритом (РА) преимущественно обнаруживаются циркулирующие протеасомы, которые можно использовать в качестве клинических биомаркеров. [137]

См. Также [ править ]

  • Карта протеолиза
  • Экзосомный комплекс
  • Расщепление белков, связанное с эндоплазматическим ретикулумом
  • JUNQ и IPOD

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d Лодиш Х, Берк А., Мацудаира П., Кайзер Калифорния, Кригер М., Скотт М. П., Зипурски С. Л., Дарнелл Дж. (2004). «3» . Молекулярная клеточная биология (5-е изд.). Нью-Йорк: WH Freeman and CO. Pp.  66–72 . ISBN 978-0-7167-4366-8.
  2. ^ Peters JM, Franke WW, Kleinschmidt JA (март 1994). «Отличительные 19 S и 20 S субкомплексы 26 S протеасомы и их распределение в ядре и цитоплазме» . Журнал биологической химии . 269 (10): 7709–18. PMID 8125997 . Архивировано из оригинального 24 февраля 2020 года . Проверено 5 октября 2008 года . 
  3. ^ Nassif, Николас D .; Cambray, Samantha E .; Краут, Даниэль А. (май 2014 г.). «Скольжение: частичная деградация субстрата АТФ-зависимыми протеазами» . IUBMB Life . 66 (5): 309–317. DOI : 10.1002 / iub.1271 . PMID 24823973 . S2CID 29860298 .  
  4. ^ a b Нобелевский комитет (2004). «Лауреаты Нобелевской премии по химии 2004 г.» . Проверено 11 декабря 2006 года .
  5. ^ Etlinger JD, Голдберг AL (январь 1977). «Растворимая АТФ-зависимая протеолитическая система, ответственная за деградацию аномальных белков в ретикулоцитах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (1): 54–8. Bibcode : 1977PNAS ... 74 ... 54E . DOI : 10.1073 / pnas.74.1.54 . PMC 393195 . PMID 264694 .  
  6. ^ Ciehanover A, Од Y, Хершко A (апрель 1978). «Термостойкий полипептидный компонент АТФ-зависимой протеолитической системы ретикулоцитов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 81 (4): 1100–5. DOI : 10.1016 / 0006-291X (78) 91249-4 . PMID 666810 . 
  7. ^ Goldknopf IL, Busch H (март 1977). «Изопептидная связь между негистоновым полипептидом и полипептидом гистона 2А хромосомного конъюгата-протеина А24» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (3): 864–8. Bibcode : 1977PNAS ... 74..864G . DOI : 10.1073 / pnas.74.3.864 . PMC 430507 . PMID 265581 .  
  8. ↑ Ciechanover A (сентябрь 2005 г.). «Ранняя работа над системой убиквитиновых протеасом, интервью с Аароном Цехановером. Интервью CDD» . Смерть и дифференциация клеток . 12 (9): 1167–77. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401691 . PMID 16094393 . 
  9. ^ Wilk S, Орловский M (ноябрь 1980). «Катион-чувствительная нейтральная эндопептидаза: выделение и специфичность фермента гипофиза крупного рогатого скота». Журнал нейрохимии . 35 (5): 1172–82. DOI : 10.1111 / j.1471-4159.1980.tb07873.x . PMID 6778972 . S2CID 9028201 .  
  10. Перейти ↑ Arrigo AP, Tanaka, K, Goldberg F, Welch WJ (1988). «Идентичность частицы просомы 19S с большим многофункциональным протеазным комплексом клеток млекопитающих». Природа . 331 (6152): 192–94. DOI : 10.1038 / 331192a0 . PMID 3277060 . S2CID 97688 .  Танака К., Ваксман Л., Гольдберг А.Л. (июнь 1983 г.). «АТФ выполняет две разные роли в деградации белка в ретикулоцитах: одна требует убиквитина, а другая независима» . Журнал клеточной биологии . 96 (6): 1580–5. DOI : 10,1083 / jcb.96.6.1580 . PMC  2112434 . PMID  6304111 .
  11. Перейти ↑ Hough R, Pratt G, Rechsteiner M (июнь 1987). «Очистка двух высокомолекулярных протеаз из лизата ретикулоцитов кролика» . Журнал биологической химии . 262 (17): 8303–13. PMID 3298229 . 
  12. ^ Хершко A (сентябрь 2005). «Ранняя работа над системой убиквитиновых протеасом, интервью с Аврамом Хершко. Интервью CDD» . Смерть и дифференциация клеток . 12 (9): 1158–61. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401709 . PMID 16094391 . 
  13. ^ Копп Р, Р Штайнер, Дальманн В, Кюн л, Reinauer Н (август 1986 г.). «Размер и форма мультикаталитической протеиназы из скелетных мышц крысы». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 872 (3): 253–60. DOI : 10.1016 / 0167-4838 (86) 90278-5 . PMID 3524688 . 
  14. ^ Лёв J, D со, Jap В, Zwickl Р, Баумейстер Вт, Huber R (апрель 1995 г.). «Кристаллическая структура протеасомы 20S из архей T. acidophilum при разрешении 3,4 A». Наука . 268 (5210): 533–9. DOI : 10.1126 / science.7725097 . PMID 7725097 . 
  15. ^ a b c d e f g h i j k Dong Y, Zhang S, Wu Z, Li X, Wang WL, Zhu Y, Stoilova-McPhie S, Lu Y, Finley D, Mao Y (ноябрь 2018 г.). «Крио-ЭМ структуры и динамика субстрат-задействованных протеасом человека 26S» . Природа . 565 (7737): 49–55. DOI : 10.1038 / s41586-018-0736-4 . PMC 6370054 . PMID 30479383 .  
  16. ^ a b c d Ван Дж, Мальдонадо, Массачусетс (август 2006 г.). «Убиквитин-протеасомная система и ее роль в воспалительных и аутоиммунных заболеваниях». Клеточная и молекулярная иммунология . 3 (4): 255–61. PMID 16978533 . 
  17. ^ a b c Stadtmueller, BM; Хилл, КП (7 января 2011 г.). «Активаторы протеасом» . Молекулярная клетка . 41 (1): 8–19. DOI : 10.1016 / j.molcel.2010.12.020 . PMC 3040445 . PMID 21211719 .  
  18. ^ a b c Смит Д.М., Чанг С.К., Парк С., Финли Д., Ченг Й., Голдберг А. Л. (сентябрь 2007 г.). «Стыковка карбоксильных концов протеасомных АТФаз в альфа-кольце протеасомы 20S открывает ворота для входа в субстрат» . Молекулярная клетка . 27 (5): 731–44. DOI : 10.1016 / j.molcel.2007.06.033 . PMC 2083707 . PMID 17803938 .  
  19. ^ "Семья MEROPS T1" . EMBL-EBI . Проверено 16 февраля 2019 .
  20. ^ Wilk S, M Орловский (март 1983). «Доказательства того, что нейтральная эндопептидаза, чувствительная к катионам гипофиза, представляет собой многокаталитический протеазный комплекс». Журнал нейрохимии . 40 (3): 842–9. DOI : 10.1111 / j.1471-4159.1983.tb08056.x . PMID 6338156 . S2CID 23508675 .  
  21. ^ a b Нанди Д., Тахилиани П., Кумар А., Чанду Д. (март 2006 г.). «Убиквитин-протеасомная система» (PDF) . Журнал биологических наук . 31 (1): 137–55. DOI : 10.1007 / BF02705243 . PMID 16595883 . S2CID 21603835 .   
  22. ^ a b Heinemeyer W, Fischer M, Krimmer T, Stachon U, Wolf DH (октябрь 1997 г.). «Активные сайты эукариотической протеасомы 20 S и их участие в процессинге субъединиц-предшественников» . Журнал биологической химии . 272 (40): 25200–9. DOI : 10.1074 / jbc.272.40.25200 . PMID 9312134 . 
  23. ^ a b Padmanabhan A, Vuong SA, Hochstrasser M (март 2016 г.). «Сборка эволюционно консервативной альтернативной изоформы протеасомы в клетках человека» . Отчеты по ячейкам . 14 (12): 2962–74. DOI : 10.1016 / j.celrep.2016.02.068 . PMC 4828729 . PMID 26997268 .  
  24. ^ Velichutina I, Connerly PL, Арендт CS, Ли X, Хохштрассер M (февраль 2004). «Пластичность в сборке 20S протеасомного кольца эукариот, выявленная делецией субъединицы в дрожжах» . Журнал EMBO . 23 (3): 500–10. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600059 . PMC 1271798 . PMID 14739934 .  
  25. ^ Kusmierczyk AR, Kunjappu MJ, Фунакоши M, Хохштрассер M (март 2008). «Мультимерный фактор сборки контролирует образование альтернативных протеасом 20S». Структурная и молекулярная биология природы . 15 (3): 237–44. DOI : 10.1038 / nsmb.1389 . PMID 18278055 . S2CID 21181637 .  
  26. ^ Zwickl P, D Ng, Woo KM, Klenk HP, Голдберг AL (сентябрь 1999). «Архебактериальная АТФаза, гомологичная АТФазам в эукариотической протеасоме 26 S, активирует расщепление белка 20 S протеасомами» . Журнал биологической химии . 274 (37): 26008–14. DOI : 10.1074 / jbc.274.37.26008 . PMID 10473546 . 
  27. ^ a b c d Smith DM, Kafri G, Cheng Y, Ng D, Walz T, Goldberg AL (декабрь 2005 г.). «Связывание АТФ с PAN или 26S АТФазами вызывает ассоциацию с протеасомой 20S, открытие ворот и транслокацию развернутых белков». Молекулярная клетка . 20 (5): 687–98. DOI : 10.1016 / j.molcel.2005.10.019 . PMID 16337593 . 
  28. ^ a b c d e Лю Ч.В., Ли Х, Томпсон Д., Вудинг К., Чанг Т.Л., Тан З., Ю Х., Томас П.Дж., ДеМартино Г.Н. (октябрь 2006 г.). «Связывание АТФ и гидролиз АТФ играют разные роли в функции протеасомы 26S» . Молекулярная клетка . 24 (1): 39–50. DOI : 10.1016 / j.molcel.2006.08.025 . PMC 3951175 . PMID 17018291 .  
  29. ^ Лам Ю.А., Лоусон Т.Г., Велаютам М., Цвейер Дж.Л., Пикарт С.М. (апрель 2002 г.). «Субъединица протеасомной АТФазы распознает сигнал деградации полиубиквитина». Природа . 416 (6882): 763–7. Bibcode : 2002Natur.416..763L . DOI : 10.1038 / 416763a . PMID 11961560 . S2CID 4421764 .  
  30. ^ a b Beck F, Unverdorben P, Bohn S, Schweitzer A, Pfeifer G, Sakata E, Nickell S, Plitzko JM, Villa E, Baumeister W, Förster F (сентябрь 2012 г.). «Структурная модель 26S протеасомы дрожжей с близким к атомному разрешению» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (37): 14870–5. Bibcode : 2012PNAS..10914870B . DOI : 10.1073 / pnas.1213333109 . PMC 3443124 . PMID 22927375 .  
  31. ^ a b Lander GC, Estrin E, Matyskiela ME, Bashore C, Nogales E, Martin A (февраль 2012 г.). «Полная субъединичная архитектура регуляторной частицы протеасомы» . Природа . 482 (7384): 186–91. Bibcode : 2012Natur.482..186L . DOI : 10,1038 / природа10774 . PMC 3285539 . PMID 22237024 .  
  32. ^ Lasker K, Förster F, Bohn S, Walzthoeni T, Villa E, Unverdorben P, Beck F, Aebersold R, Sali A, Baumeister W (январь 2012). «Молекулярная архитектура голокомплекса 26S протеасомы определяется интегративным подходом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (5): 1380–7. DOI : 10.1073 / pnas.1120559109 . PMC 3277140 . PMID 22307589 .  
  33. ^ a b c Chen S, Wu J, Lu Y, Ma YB, Lee BH, Yu Z, Ouyang Q, Finley DJ, Kirschner MW, Mao Y (ноябрь 2016 г.). «Структурные основы динамической регуляции протеасомы 26S человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (46): 12991–12996. DOI : 10.1073 / pnas.1614614113 . PMC 5135334 . PMID 27791164 .  
  34. ↑ Хуан X, Луан Б., Ву Дж, Ши Y (сентябрь 2016 г.). «Атомная структура протеасомы человека 26S». Структурная и молекулярная биология природы . 23 (9): 778–785. DOI : 10.1038 / nsmb.3273 . PMID 27428775 . S2CID 21909333 .  
  35. ^ Швейцер А, Aufderheide А, Т Rudack, Бек F, G Пфайфер, Plitzko Ю.М., Саката Е, Шультен К, Р Ферстер, Баумейстер Вт (июль 2016). «Структура протеасомы 26S человека с разрешением 3,9 Å» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (28): 7816–7821. DOI : 10.1073 / pnas.1614614113 . PMC 5135334 . PMID 27791164 .  
  36. ^ а б в г Чжу И, Ван В.Л., Ю Д, Оуян Ц., Лу И, Мао И (апрель 2018 г.). «Структурный механизм регулируемого нуклеотидами ремоделирования разворачивания ААА-АТФазы в активированной протеасоме 26S человека» . Nature Communications . 9 (1): 1360. Bibcode : 2018NatCo ... 9.1360Z . DOI : 10.1038 / s41467-018-03785-ш . PMC 5893597 . PMID 29636472 .  
  37. ^ a b c Унвердорбен П., Бек Ф., Жледо П., Швейцер А., Пфайфер Г., Плитцко Дж. М., Баумейстер В., Фёрстер Ф. (апрель 2014 г.). «Глубокая классификация большого набора крио-ЭМ данных определяет конформационный ландшафт протеасомы 26S» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (15): 5544–9. Bibcode : 2014PNAS..111.5544U . DOI : 10.1073 / pnas.1403409111 . PMC 3992697 . PMID 24706844 .  
  38. ^ Ledź P, Unverdorben P, Beck F, Pfeifer G, Schweitzer A, Förster F, Baumeister W (апрель 2013 г.). «Структура протеасомы 26S со связанным АТФ-γS дает представление о механизме нуклеотид-зависимой транслокации субстрата» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (18): 7264–7269. Bibcode : 2013PNAS..110.7264S . DOI : 10.1073 / pnas.1305782110 . PMC 3645540 . PMID 23589842 .  
  39. ^ Matyskiela ME, Lander GC, Martin A (июль 2013). «Конформационное переключение протеасомы 26S делает возможной деградацию субстрата» . Структурная и молекулярная биология природы . 20 (7): 781–788. DOI : 10.1038 / nsmb.2616 . PMC 3712289 . PMID 23770819 .  
  40. ↑ Lu Y, Wu J, Dong Y, Chen S, Sun S, Ma YB, Ouyang Q, Finley D, Kirschner MW, Mao Y (июль 2017 г.). «Конформационный ландшафт p28-связанной частицы, регулирующей протеасомы человека» . Молекулярная клетка . 67 (2): 322–333.e6. DOI : 10.1016 / j.molcel.2017.06.007 . PMC 5580496 . PMID 28689658 .  
  41. ^ Келер А, Кассио P, Leggett DS, Woo KM, Голдберг AL, Финли D (июнь 2001). «Осевой канал коровой частицы протеасомы контролируется АТФазой Rpt2 и контролирует как поступление субстрата, так и высвобождение продукта». Молекулярная клетка . 7 (6): 1143–52. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00274-X . PMID 11430818 . 
  42. ↑ Förster A, Masters EI, Whitby FG, Robinson H, Hill CP (май 2005 г.). «Структура 1.9 A комплекса активатора протеасомы-11S и значение для взаимодействий протеасома-PAN / PA700». Молекулярная клетка . 18 (5): 589–99. DOI : 10.1016 / j.molcel.2005.04.016 . PMID 15916965 . 
  43. ^ Витт С., Квон Ю. Д., Шарон М., Фельдерер К., Бейттлер М., Робинсон CV, Баумейстер В., Японский Б. К. (июль 2006 г.). «Сборка протеасомы запускает переключатель, необходимый для созревания активного сайта» . Структура . 14 (7): 1179–88. DOI : 10.1016 / j.str.2006.05.019 . PMID 16843899 . 
  44. ^ Крюгер E, Kloetzel PM, Enenkel C (2001). «Биогенез 20S протеасомы». Биохимия . 83 (3–4): 289–93. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (01) 01241-X . PMID 11295488 . 
  45. ^ Murata S, Yashiroda H, Tanaka K (февраль 2009). «Молекулярные механизмы сборки протеасом». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 10 (2): 104–115. DOI : 10.1038 / nrm2630 . PMID 19165213 . S2CID 21263837 .  
  46. ^ Саката Э, Стенгель Ф, Фукунага К., Чжоу М., Саэки Й, Фёрстер Ф, Баумейстер В., Танака К., Робинсон CV (июнь 2011 г.). «Каталитическая активность Ubp6 увеличивает созревание протеасомной регуляторной частицы». Молекулярная клетка . 42 (5): 637–649. DOI : 10.1016 / j.molcel.2011.04.021 . PMID 21658604 . 
  47. ^ Фукунага K, Кудо T, Toh-е A, Танака К, Саеки Y (июнь 2010). «Рассечение пути сборки крышки протеасомы в Saccharomyces cerevisiae». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 396 (4): 1048–1053. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2010.05.061 . PMID 20471955 . 
  48. ↑ Haas AL, Warms JV, Hershko A, Rose IA (март 1982). «Убиквитин-активирующий фермент. Механизм и роль в конъюгации белок-убиквитин». Журнал биологической химии . 257 (5): 2543–8. PMID 6277905 . 
  49. ^ Метатель JS, Хоффман L, M Rechsteiner, Pickart CM (январь 2000). «Распознавание протеолитического сигнала полиубиквитина» . Журнал EMBO . 19 (1): 94–102. DOI : 10.1093 / emboj / 19.1.94 . PMC 1171781 . PMID 10619848 .  
  50. ^ Risseeuw EP, Daskalchuk TE, Банки TW, Лю Е, Cotelesage J, Hellmann H, Estelle M, Somers DE, Кросби WL (июнь 2003). «Анализ белкового взаимодействия субъединиц SCF убиквитин E3 лигазы из Arabidopsis» . Заводской журнал . 34 (6): 753–67. DOI : 10.1046 / j.1365-313X.2003.01768.x . PMID 12795696 . 
  51. ^ Эльзассер S, Финли D (август 2005). «Доставка убиквитинированных субстратов в машины для разворачивания белков». Природа клеточной биологии . 7 (8): 742–9. DOI : 10.1038 / ncb0805-742 . PMID 16056265 . S2CID 21069699 .  
  52. ^ Sadanandom А, Бейли М, Р Ewan, Ли Дж, Nelis S (октябрь 2012 г.). «Убиквитин-протеасомная система: центральный модификатор передачи сигналов растений» . Новый фитолог . 196 (1): 13–28. DOI : 10.1111 / j.1469-8137.2012.04266.x . PMID 22897362 . 
  53. Перейти ↑ Sharp PM, Li WH (1987). «Гены убиквитина как парадигма согласованной эволюции тандемных повторов». Журнал молекулярной эволюции . 25 (1): 58–64. Bibcode : 1987JMolE..25 ... 58S . DOI : 10.1007 / BF02100041 . PMID 3041010 . S2CID 7929162 .  
  54. ^ Pickart CM, Fushman D (декабрь 2004). «Цепи полиубиквитина: сигналы полимерных белков». Текущее мнение в химической биологии . 8 (6): 610–16. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2004.09.009 . PMID 15556404 . 
  55. ↑ Xu P, Duong DM, Seyfried NT, Cheng D, Xie Y, Robert J, Rush J, Hochstrasser M, Finley D, Peng J (апрель 2009 г.). «Количественная протеомика показывает функцию нетрадиционных цепей убиквитина в протеасомной деградации» . Cell . 137 (1): 133–45. DOI : 10.1016 / j.cell.2009.01.041 . PMC 2668214 . PMID 19345192 .  
  56. ^ Pickart CM (ноябрь 2000). «Убиквитин в цепочках». Направления биохимических наук . 25 (11): 544–8. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (00) 01681-9 . PMID 11084366 . 
  57. ↑ Zhu Q, Wani G, Wang QE, El-mahdy M, Snapka RM, Wani AA (июль 2005 г.). «Деубиквитинирование протеасомами координируется с транслокацией субстрата для протеолиза in vivo». Экспериментальные исследования клеток . 307 (2): 436–51. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2005.03.031 . PMID 15950624 . 
  58. Перейти ↑ Wenzel T, Baumeister W (март 1995). «Конформационные ограничения в деградации белка протеасомой 20S». Структурная биология природы . 2 (3): 199–204. DOI : 10.1038 / nsb0395-199 . PMID 7773788 . S2CID 41599619 .  
  59. ^ Inobe T, Fishbain S, S Пракаш, Matouschek A (март 2011). «Определение геометрии двухкомпонентного протеасомного дегрона» . Природа Химическая биология . 7 (3): 161–7. DOI : 10,1038 / nchembio.521 . PMC 3129032 . PMID 21278740 .  
  60. ↑ van der Lee R, Lang B, Kruse K, Gsponer J, Sánchez de Groot N, Huynen MA, Matouschek A, Fuxreiter M, Babu MM (сентябрь 2014 г.). «Внутренне неупорядоченные сегменты влияют на период полужизни белка в клетке и во время эволюции» . Отчеты по ячейкам . 8 (6): 1832–44. DOI : 10.1016 / j.celrep.2014.07.055 . PMC 4358326 . PMID 25220455 .  
  61. ^ Smith DM, Benaroudj N Голдберг A (октябрь 2006). «Протеасомы и связанные с ними АТФазы: деструктивная комбинация». Журнал структурной биологии . 156 (1): 72–83. DOI : 10.1016 / j.jsb.2006.04.012 . PMID 16919475 . 
  62. ^ Хойт MA, Zich J, Takeuchi J, Zhang M, Govaerts C, Coffino P (апрель 2006). «Глицин-аланинские повторы нарушают правильное разворачивание субстрата протеасомой» . Журнал EMBO . 25 (8): 1720–9. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601058 . PMC 1440830 . PMID 16601692 .  
  63. ^ Zhang M, Coffino P (март 2004). «Повторяющаяся последовательность кодируемого вирусом Эпштейна-Барра ядерного белка антигена 1 прерывает процессинг протеасомного субстрата» . Журнал биологической химии . 279 (10): 8635–41. DOI : 10.1074 / jbc.M310449200 . PMID 14688254 . 
  64. ^ Seemüller E, Lupas A, Stock D, Löwe J, Huber R, Baumeister W (апрель 1995 г.). «Протеасома из Thermoplasma acidophilum: треониновая протеаза». Наука . 268 (5210): 579–82. Bibcode : 1995Sci ... 268..579S . DOI : 10.1126 / science.7725107 . PMID 7725107 . 
  65. ^ Coux О, Танака К, Голдберг Л. (1996). «Структура и функции протеасом 20S и 26S». Ежегодный обзор биохимии . 65 : 801–47. DOI : 10.1146 / annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 . 
  66. ^ Гролл М, Ditzel л, Лёве Дж, сток D, Bochtler М, Bartunik HD, Huber R (апрель 1997 г.). «Структура протеасомы 20S дрожжей при разрешении 2,4 А». Природа . 386 (6624): 463–71. DOI : 10.1038 / 386463a0 . PMID 9087403 . S2CID 4261663 .  
  67. ^ Дик Т.П., Нуссбаум А.К., Диг М., Хейнемейер В., Гролл М., Ширле М., Кейлхольц В., Стеванович С., Вольф Д.Х., Хубер Р., Раммензее Х.Г., Шильд Н. (октябрь 1998 г.). «Вклад протеасомных бета-субъединиц в расщепление пептидных субстратов, анализируемых с дрожжевыми мутантами» . Журнал биологической химии . 273 (40): 25637–46. DOI : 10.1074 / jbc.273.40.25637 . PMID 9748229 . 
  68. ^ Фогес D, Zwickl Р, Баумейстер Вт (1999). «Протеасома 26S: молекулярная машина, разработанная для контролируемого протеолиза». Ежегодный обзор биохимии . 68 (1): 1015–68. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.68.1.1015 . PMID 10872471 . 
  69. ^ a b Rape M, Jentsch S (май 2002 г.). «Откусить: процессинг протеасомного белка». Природа клеточной биологии . 4 (5): E113–6. DOI : 10.1038 / ncb0502-E113 . PMID 11988749 . S2CID 7126477 .  
  70. ↑ Rape M, Jentsch S (ноябрь 2004 г.). «Продуктивная RUPture: активация факторов транскрипции протеасомным процессингом» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1695 (1–3): 209–13. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2004.09.022 . PMID 15571816 . 
  71. Перейти ↑ Asher G, Reuven N, Shaul Y (август 2006). «20S протеасомы и деградация белков« по умолчанию » ». BioEssays . 28 (8): 844–9. DOI : 10.1002 / bies.20447 . PMID 16927316 . 
  72. ^ Zhang M, Pickart CM, Coffino P (апрель 2003). «Детерминанты распознавания протеасомами орнитиндекарбоксилазы, убиквитин-независимого субстрата» . Журнал EMBO . 22 (7): 1488–96. DOI : 10,1093 / emboj / cdg158 . PMC 152902 . PMID 12660156 .  
  73. Перейти ↑ Asher G, Shaul Y (август 2005 г.). «Протеасомная деградация p53: полиубиквитинирование - это еще не все» . Клеточный цикл . 4 (8): 1015–8. DOI : 10.4161 / cc.4.8.1900 . PMID 16082197 . 
  74. ^ a b Shringarpure R, Grune T, Mehlhase J, Davies KJ (январь 2003 г.). «Конъюгация убиквитина не требуется для расщепления окисленных белков протеасомами» . Журнал биологической химии . 278 (1): 311–8. DOI : 10.1074 / jbc.M206279200 . PMID 12401807 . 
  75. ^ a b c Gille C, Goede A, Schlöetelburg C, Preissner R, Kloetzel PM, Göbel UB, Frömmel C (март 2003 г.). «Комплексный взгляд на протеасомные последовательности: значение для эволюции протеасомы». Журнал молекулярной биологии . 326 (5): 1437–48. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (02) 01470-5 . PMID 12595256 . 
  76. ^ Bochtler МЫ, Ditzel л, Гролл М, Хартманн С, Huber R (1999). «Протеасома». Ежегодный обзор биофизики и структуры биомолекул . 28 (1): 295–317. DOI : 10.1146 / annurev.biophys.28.1.295 . PMID 10410804 . 
  77. ^ Chesnel F, Bazile F, Pascal A, Kubiak JZ (август 2006). «Диссоциация циклина B от CDK1 предшествует его деградации при инактивации MPF в митотических экстрактах эмбрионов Xenopus laevis» . Клеточный цикл . 5 (15): 1687–98. DOI : 10.4161 / cc.5.15.3123 . PMID 16921258 . 
  78. Перейти ↑ Brito DA, Rieder CL (июнь 2006 г.). «Проскальзывание митотической контрольной точки у людей происходит за счет разрушения циклина B в присутствии активной контрольной точки» . Текущая биология . 16 (12): 1194–200. DOI : 10.1016 / j.cub.2006.04.043 . PMC 2749311 . PMID 16782009 .  
  79. ^ Пристани CG, Ho A, Йошиока N, Dowdy SF (июнь 2006). «Регулирование позднего фазового перехода G1 / S и APC Cdh1 с помощью активных форм кислорода» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (12): 4701–11. DOI : 10.1128 / MCB.00303-06 . PMC 1489138 . PMID 16738333 .  
  80. ^ Башир Т, Dorrello Н.В., Амадор В, Guardavaccaro Д, М Пагано (март 2004 г.). «Контроль убиквитинлигазы SCF (Skp2-Cks1) с помощью убиквитинлигазы APC / C (Cdh1)». Природа . 428 (6979): 190–3. DOI : 10,1038 / природа02330 . PMID 15014502 . S2CID 4401971 .  
  81. ^ Higashitsuji Н, Лю У, Майер RJ, Фуджита J (октябрь 2005 г.). «Онкопротеин ганкирин негативно регулирует как p53, так и RB, усиливая протеасомную деградацию» . Клеточный цикл . 4 (10): 1335–7. DOI : 10.4161 / cc.4.10.2107 . PMID 16177571 . 
  82. ^ Таррасон Риса, Габриэль; Хуртиг, Фредрик; Брей, Сиан; Хафнер, Энн Э .; Харкер-Киршнек, Лена; Фаулл, Питер; Дэвис, Колин; Папациаму, Димитра; Мутавчиев, Делян Р .; Вентилятор, Екатерина; Менегелло, Летисия; Араширо Пульшен, Андре; Дей, Гаутам; Калли, Сиан; Килкенни, Майри; Souza, Diorge P .; Пеллегрини, Лука; де Бруэн, Робертус AM; Энрикес, Рикардо; Snijders, Ambrosius P .; Шарич, Анжела; Линдас, Анн-Кристин; Робинсон, Николас П .; Баум, Базз (7 августа 2020 г.). «Протеасома контролирует ESCRT-III-опосредованное деление клеток в архее» . Наука . 369 (6504): eaaz2532. DOI : 10.1126 / science.aaz2532 .
  83. ^ Dharmasiri S, M Эстель (2002). «Роль регулируемой деградации белка в ответе на ауксин». Молекулярная биология растений . 49 (3–4): 401–9. DOI : 10,1023 / A: 1015203013208 . PMID 12036263 . S2CID 7669386 .  
  84. ^ Вейерс Д, Е Беньково, Ягер К.Е., Schlereth А, Т Hamann, Kientz М, Wilmoth JC, Рид JW, Юргенс G (май 2005 г.). «Специфичность развития ауксинового ответа парами регуляторов транскрипции ARF и Aux / IAA» . Журнал EMBO . 24 (10): 1874–85. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600659 . PMC 1142592 . PMID 15889151 .  
  85. ↑ Haas AL, Baboshina O, Williams B, Schwartz LM (апрель 1995 г.). «Скоординированная индукция пути конъюгации убиквитина сопровождает запрограммированную в процессе развития смерть скелетных мышц насекомых» . Журнал биологической химии . 270 (16): 9407–12. DOI : 10.1074 / jbc.270.16.9407 . PMID 7721865 . 
  86. ^ Шварц Л.М., Майер А, Kosz л, Энгельштейн М, Майер С (октябрь 1990 г.). «Активация экспрессии гена полиубиквитина во время программируемой гибели клеток». Нейрон . 5 (4): 411–9. DOI : 10.1016 / 0896-6273 (90) 90080-Y . PMID 2169771 . S2CID 33829749 .  
  87. ^ Л P, K Bussell, Dawson С.П., Billett М.А., Mayer RJ Рейнольдс SE (январь 1997). «Экспрессия субъединицы АТФазы 26S протеасомы, MS73, в мышцах, которые подвергаются программируемой гибели клеток, и ее контроль экдистероидными гормонами у насекомого Manduca sexta». Письма FEBS . 400 (3): 345–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (96) 01413-5 . PMID 9009228 . S2CID 10873052 .  
  88. ^ Питцер Р, Дантес А, Т Фукса, Баумейстер Вт, Амстердам (сентябрь 1996). «Удаление протеасом из ядра и их накопление в апоптотических пузырьках во время запрограммированной гибели клеток». Письма FEBS . 394 (1): 47–50. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (96) 00920-9 . PMID 8925925 . S2CID 29256092 .  
  89. ^ a b Адамс Дж., Паломбелла В.Дж., Сосвилл Е.А., Джонсон Дж., Дестри А., Лазарус Д.Д., Маас Дж., Пьен С.С., Пракаш С., Эллиотт П.Дж. (июнь 1999 г.). «Ингибиторы протеасом: новый класс сильнодействующих и эффективных противоопухолевых агентов». Исследования рака . 59 (11): 2615–22. PMID 10363983 . 
  90. ^ Орловский RZ (апрель 1999). «Роль убиквитин-протеасомного пути в апоптозе» . Смерть и дифференциация клеток . 6 (4): 303–13. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400505 . PMID 10381632 . 
  91. ^ Гарридо C, Брюне M, Дидло C, Zermati Y, Schmitt E, G Кремер (ноябрь 2006). «Белки теплового шока 27 и 70: антиапоптотические белки с канцерогенными свойствами» . Клеточный цикл . 5 (22): 2592–601. DOI : 10.4161 / cc.5.22.3448 . PMID 17106261 . 
  92. ^ Парк SH, Bolender N, Айзеле F, Костова Z, Takeuchi J, Coffino P, Wolf DH (январь 2007). «Цитоплазматический аппарат шаперона Hsp70 подвергает неправильно свернутые и некомпетентные к импорту эндоплазматического ретикулума белки деградации через систему убиквитин-протеасома» . Молекулярная биология клетки . 18 (1): 153–65. DOI : 10,1091 / mbc.E06-04-0338 . PMC 1751312 . PMID 17065559 .  
  93. ↑ Dai Q, Qian SB, Li HH, McDonough H, Borchers C, Huang D, Takayama S, Younger JM, Ren HY, Cyr DM, Patterson C (ноябрь 2005 г.). «Регулирование пути деградации белков контроля качества цитоплазмы с помощью BAG2» . Журнал биологической химии . 280 (46): 38673–81. DOI : 10.1074 / jbc.M507986200 . PMID 16169850 . 
  94. Перейти ↑ Bader N, Grune T (2006). «Окисление и протеолиз белков». Биологическая химия . 387 (10–11): 1351–5. DOI : 10.1515 / BC.2006.169 . PMID 17081106 . S2CID 30385354 .  
  95. ^ Дэвис KJ (2003). «Расщепление окисленных белков протеасомой 20S». Биохимия . 83 (3–4): 301–10. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (01) 01250-0 . PMID 11295490 . 
  96. ^ a b Lehman NL (сентябрь 2009 г.). «Убиквитиновая протеасомная система в невропатологии» . Acta Neuropathologica . 118 (3): 329–47. DOI : 10.1007 / s00401-009-0560-х . PMC 2716447 . PMID 19597829 .  
  97. ^ Макнот KS, Джексон T, JnoBaptiste R, Капустин A, Olanow CW (май 2006). «Протеасомная дисфункция при спорадической болезни Паркинсона» . Неврология . 66 (10 Suppl 4): S37–49. DOI : 10.1212 / 01.wnl.0000221745.58886.2e . PMID 16717251 . 
  98. ^ Шарма N, Брэндис К.А., Herrera СК, Джонсон BE, Вайдья Т, Р Шреста, Debburman СК (2006). «Модель почкующихся альфа-синуклеиновых дрожжей: токсичность усиливается за счет нарушения протеасомы и окислительного стресса». Журнал молекулярной неврологии . 28 (2): 161–78. DOI : 10,1385 / JMN: 28: 2: 161 . PMID 16679556 . 
  99. Перейти ↑ Murata S, Sasaki K, Kishimoto T, Niwa S, Hayashi H, Takahama Y, Tanaka K (июнь 2007). «Регулирование развития CD8 + Т-клеток с помощью протеасом, специфичных для тимуса». Наука . 316 (5829): 1349–53. Bibcode : 2007Sci ... 316.1349M . DOI : 10.1126 / science.1141915 . PMID 17540904 . S2CID 37185716 .  
  100. ^ Cascio P, Hilton C, Киселёв А. Ф., Рок KL, Голдберг AL (май 2001). «26S протеасомы и иммунопротеасомы продуцируют в основном N-удлиненные версии антигенного пептида» . Журнал EMBO . 20 (10): 2357–66. DOI : 10.1093 / emboj / 20.10.2357 . PMC 125470 . PMID 11350924 .  
  101. ^ Маллери DL, Макьюэн WA, Bidgood SR, Towers GJ, Johnson CM, James LC (ноябрь 2010 г.). «Антитела опосредуют внутриклеточный иммунитет через трехкомпонентный мотив 21 (TRIM21)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (46): 19985–19990. Bibcode : 2010PNAS..10719985M . DOI : 10.1073 / pnas.1014074107 . PMC 2993423 . PMID 21045130 .  
  102. ^ Fenteany G, Standaert РФ, Lane WS, Choi S, Corey EJ, Schreiber SL (май 1995). «Ингибирование активности протеасом и субъединично-специфической модификации амино-концевого треонина с помощью лактацистина». Наука . 268 (5211): 726–31. Bibcode : 1995Sci ... 268..726F . DOI : 10.1126 / science.7732382 . PMID 7732382 . S2CID 37779687 .  
  103. ^ Пресс-релиз Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. Архивировано 19 февраля 2007 г. на Wayback Machine 13 мая 2003 г. Дата доступа 29 декабря 2006 г. См. Также информационную страницу FDA Velcade .
  104. ↑ Fisher RI, Bernstein SH, Kahl BS, Djulbegovic B, Robertson MJ, de Vos S, Epner E, Krishnan A, Leonard JP, Lonial S, Stadtmauer EA, O'Connor OA, Shi H, Boral AL, Goy A (октябрь 2006 г.). «Многоцентровое исследование фазы II бортезомиба у пациентов с рецидивирующей или рефрактерной лимфомой из мантийных клеток». Журнал клинической онкологии . 24 (30): 4867–74. DOI : 10.1200 / JCO.2006.07.9665 . PMID 17001068 . 
  105. ^ Якоба С, Эгерером К, Liebisch Р, Türkmen S, Zavrski я, Kuckelkorn U, Хайдер U, Kaiser М, Флейснер С, Sterz Дж, Kleeberg л, Собачонка Е, Бурместер ГР, Kloetzel ПМ, А.Сезер О (март 2007 г.). «Уровни циркулирующих протеасом являются независимым прогностическим фактором выживания при множественной миеломе» . Кровь . 109 (5): 2100–5. DOI : 10.1182 / кровь-2006-04-016360 . PMID 17095627 . 
  106. ^ Шах С.А., Поттер М.В., Макдейд Т.П., Риккарди Р., Перуджини Р.А., Эллиотт П.Дж., Адамс Дж., Каллери МП (2001). «Ингибирование протеасомы 26S вызывает апоптоз и ограничивает рост рака поджелудочной железы человека». Журнал клеточной биохимии . 82 (1): 110–22. DOI : 10.1002 / jcb.1150 . PMID 11400168 . S2CID 21223980 .  
  107. ^ Навроцки СТ, Суини-Gotsch В, Takamori R, МакКонки ди - джей (январь 2004). «Ингибитор протеасом бортезомиб усиливает активность доцетаксела в ксенотрансплантатах ортотопической опухоли поджелудочной железы человека». Молекулярная терапия рака . 3 (1): 59–70. PMID 14749476 . 
  108. ^ Schenkein D (июнь 2002). «Ингибиторы протеасом в лечении злокачественных новообразований B-клеток». Клиническая лимфома . 3 (1): 49–55. DOI : 10.3816 / CLM.2002.n.011 . PMID 12141956 . 
  109. ↑ О'Коннор О.А., Райт Дж., Московиц С., Маззи Дж., МакГрегор-Кортелли Б., Стабблфилд М., Штраус Д., Портлок С., Хэмлин П., Чой Э, Думетреску О, Эсселтин Д., Треху Е., Адамс Дж., Шенкейн Д., Зеленец А.Д. (февраль 2005 г.). «Фаза II клинического опыта с новым ингибитором протеасом бортезомибом у пациентов с вялотекущей неходжкинской лимфомой и лимфомой из клеток мантии». Журнал клинической онкологии . 23 (4): 676–84. DOI : 10.1200 / JCO.2005.02.050 . PMID 15613699 . 
  110. ^ Мессингер YH, Gaynon П.С., Sposto Р, ван - дер - Giessen, J Eckroth E, J, Малвар Бострома до н.э. (июль 2012 года ). «Бортезомиб с химиотерапией очень активен при запущенном остром лимфобластном лейкозе, являющемся предшественником группы B: исследование терапевтических достижений в области детской лейкемии и лимфомы (TACL)» . Кровь . 120 (2): 285–90. DOI : 10.1182 / кровь-2012-04-418640 . PMID 22653976 . 
  111. ^ Ламбру GI, Papadimitriou L, Chrousos GP, Vlahopoulos SA (апрель 2012). «Влияние глюкокортикоидов и ингибиторов протеасом на лейкозный лимфобласт: множественные, разнообразные сигналы, сходящиеся на нескольких ключевых нижестоящих регуляторах». Молекулярная и клеточная эндокринология . 351 (2): 142–51. DOI : 10.1016 / j.mce.2012.01.003 . PMID 22273806 . S2CID 28749125 .  
  112. ^ Schmidtke G, Holzhütter HG, Bogyo M, N Kairies, Groll М, Де Жюли R, S Emch, Groettrup M (декабрь 1999). «Как ингибитор протеазы ВИЧ-1 модулирует активность протеасом» . Журнал биологической химии . 274 (50): 35734–40. DOI : 10.1074 / jbc.274.50.35734 . PMID 10585454 . 
  113. ^ Лоран Н, де Bouard S, Guillamo JS, Christov C, R, Zini Jouault H, P, Андре Lotteau V, Пещански M (февраль 2004 г.). «Влияние ингибитора протеасом ритонавира на рост глиомы in vitro и in vivo». Молекулярная терапия рака . 3 (2): 129–36. PMID 14985453 . 
  114. ^ Zollner TM, Podda M, Pien C, Elliott PJ, Kaufmann R, Boehncke WH (март 2002). «Ингибирование протеасом снижает опосредованную суперантигеном активацию Т-клеток и тяжесть псориаза в модели SCID-hu» . Журнал клинических исследований . 109 (5): 671–9. DOI : 10.1172 / JCI12736 . PMC 150886 . PMID 11877475 .  
  115. ^ Эллиот PJ, Pien CS, Маккормак Т.А., Чапмен И.Д., Адамс Дж (август 1999 г.). «Ингибирование протеасом: новый механизм борьбы с астмой». Журнал аллергии и клинической иммунологии . 104 (2 Pt 1): 294–300. DOI : 10.1016 / S0091-6749 (99) 70369-6 . PMID 10452747 . 
  116. ^ Verdoes М, Флоря Б. И., Менендес-Бенито В, Мейнард CJ, Витте MD, ван - дер - Linden WA, ван ден Nieuwendijk AM, Hofmann T, Berkers CR, ван Leeuwen FW, Groothuis Т.А., Leeuwenburgh М.А., оваа H, Neefjes JJ, Филиппов Д.В., ван дер Марель Г.А., Дантума Н.П., Overkleeft HS (ноябрь 2006 г.). «Флуоресцентный ингибитор протеасом широкого спектра действия для мечения протеасом in vitro и in vivo» . Химия и биология . 13 (11): 1217–26. DOI : 10.1016 / j.chembiol.2006.09.013 . PMID 17114003 . 
  117. ^ Kleiger G, мэр T (июнь 2014). «Опасное путешествие: экскурсия по убиквитин-протеасомной системе» . Тенденции в клеточной биологии . 24 (6): 352–9. DOI : 10.1016 / j.tcb.2013.12.003 . PMC 4037451 . PMID 24457024 .  
  118. ↑ Goldberg AL, Stein R, Adams J (август 1995). «Новое понимание функции протеасом: от архебактерий до разработки лекарств» . Химия и биология . 2 (8): 503–8. DOI : 10.1016 / 1074-5521 (95) 90182-5 . PMID 9383453 . 
  119. ^ Sulistio Ю.А., Heese K (январь 2015). «Убиквитин-протеасомная система и дерегуляция молекулярных шаперонов при болезни Альцгеймера». Молекулярная нейробиология . 53 (2): 905–31. DOI : 10.1007 / s12035-014-9063-4 . PMID 25561438 . S2CID 14103185 .  
  120. Перейти ↑ Ortega Z, Lucas JJ (2014). «Участие убиквитин-протеасомной системы в болезни Хантингтона» . Границы молекулярной неврологии . 7 : 77. DOI : 10,3389 / fnmol.2014.00077 . PMC 4179678 . PMID 25324717 .  
  121. ^ Сандри М, J Robbins (июнь 2014). «Протеотоксичность: недооцененная патология при сердечных заболеваниях» . Журнал молекулярной и клеточной кардиологии . 71 : 3–10. DOI : 10.1016 / j.yjmcc.2013.12.015 . PMC 4011959 . PMID 24380730 .  
  122. ^ Drews O, Taegtmeyer H (декабрь 2014). «Нацеливание на убиквитин-протеасомную систему при сердечных заболеваниях: основа для новых терапевтических стратегий» . Антиоксиданты и редокс-сигналы . 21 (17): 2322–43. DOI : 10.1089 / ars.2013.5823 . PMC 4241867 . PMID 25133688 .  
  123. ^ Ван З.В., Hill JA (февраль 2015). «Контроль качества белков и метаболизм: двунаправленный контроль в сердце» . Клеточный метаболизм . 21 (2): 215–26. DOI : 10.1016 / j.cmet.2015.01.016 . PMC 4317573 . PMID 25651176 .  
  124. ^ a b Карин М., Дельхас М. (февраль 2000 г.). «Киназа I каппа B (IKK) и NF-каппа B: ключевые элементы провоспалительной передачи сигналов». Семинары по иммунологии . 12 (1): 85–98. DOI : 10.1006 / smim.2000.0210 . PMID 10723801 . 
  125. ^ Ермолаева М.А., Dakhovnik A, B Schumacher (январь 2015). «Механизмы контроля качества в ответах на клеточные и системные повреждения ДНК» . Обзоры исследований старения . 23 (Pt A): 3–11. DOI : 10.1016 / j.arr.2014.12.009 . PMC 4886828 . PMID 25560147 .  
  126. ^ Checler Р, СА да Коста, Ancolio К, Шевалье N, Лопес-Перес Е, Р Marambaud (июль 2000 г.). «Роль протеасомы в болезни Альцгеймера». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни . 1502 (1): 133–8. DOI : 10.1016 / s0925-4439 (00) 00039-9 . PMID 10899438 . 
  127. ^ a b Чунг К.К., Доусон В.Л., Доусон TM (ноябрь 2001 г.). «Роль убиквитин-протеасомного пути в болезни Паркинсона и других нейродегенеративных расстройствах». Тенденции в неврологии . 24 (11 Suppl): S7–14. DOI : 10.1016 / s0166-2236 (00) 01998-6 . PMID 11881748 . S2CID 2211658 .  
  128. ^ а б Икеда К., Акияма Х, Араи Т., Уэно Х., Цучия К., Косака К. (июль 2002 г.). «Морфометрическая переоценка системы двигательных нейронов болезни Пика и бокового амиотрофического склероза с деменцией». Acta Neuropathologica . 104 (1): 21–8. DOI : 10.1007 / s00401-001-0513-5 . PMID 12070660 . S2CID 22396490 .  
  129. ^ Манак Н, Като Т, Курит К, Т Katagiri, Shikama Y, Kujirai К, Т Kawanami, Suzuki Y, Nihei К, Sasaki Н (май 1992 г.). «Заметное увеличение убиквитина в спинномозговой жидкости при болезни Крейтцфельдта – Якоба». Письма неврологии . 139 (1): 47–9. DOI : 10.1016 / 0304-3940 (92) 90854-Z . PMID 1328965 . S2CID 28190967 .  
  130. Перейти ↑ Mathews KD, Moore SA (январь 2003 г.). «Конечностно-поясная мышечная дистрофия». Текущие отчеты по неврологии и неврологии . 3 (1): 78–85. DOI : 10.1007 / s11910-003-0042-9 . PMID 12507416 . S2CID 5780576 .  
  131. ^ Mayer RJ (март 2003). «От нейродегенерации к нейрогомеостазу: роль убиквитина». Новости и перспективы наркотиков . 16 (2): 103–8. DOI : 10.1358 / dnp.2003.16.2.829327 . PMID 12792671 . 
  132. ^ Calise Дж, Пауэлл SR (февраль 2013 г. ). «Убиквитиновая протеасомная система и ишемия миокарда» . Американский журнал физиологии. Сердце и физиология кровообращения . 304 (3): H337–49. DOI : 10.1152 / ajpheart.00604.2012 . PMC 3774499 . PMID 23220331 .  
  133. ^ Predmore JM, Ван P, F Davis, Bartolone S, Уэстфолл М.В., Dyke DB, Pagani F, Powell SR, День SM (март 2010). «Убиквитиновая протеасомная дисфункция при гипертрофических и дилатационных кардиомиопатиях» . Тираж . 121 (8): 997–1004. DOI : 10.1161 / CIRCULATIONAHA.109.904557 . PMC 2857348 . PMID 20159828 .  
  134. ^ Пауэлл SR (июль 2006 г.). «Убиквитин-протеасомная система в физиологии и патологии сердца». Американский журнал физиологии. Сердце и физиология кровообращения . 291 (1): H1 – H19. DOI : 10.1152 / ajpheart.00062.2006 . PMID 16501026 . 
  135. Перейти ↑ Adams J (апрель 2003 г.). «Возможности ингибирования протеасом при лечении рака». Открытие наркотиков сегодня . 8 (7): 307–15. DOI : 10.1016 / s1359-6446 (03) 02647-3 . PMID 12654543 . 
  136. ↑ Ben-Neriah Y (январь 2002 г.). «Регуляторные функции убиквитинирования в иммунной системе». Иммунология природы . 3 (1): 20–6. DOI : 10.1038 / ni0102-20 . PMID 11753406 . S2CID 26973319 .  
  137. ^ Эгерером K, Kuckelkorn U, Rudolph PE, Рюкерт JC, Dörner T, Burmester GR, Kloetzel PM, Собачонка E (октябрь 2002). «Циркулирующие протеасомы являются маркерами повреждения клеток и иммунологической активности при аутоиммунных заболеваниях». Журнал ревматологии . 29 (10): 2045–52. PMID 12375310 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Гликман М. Х., Адир Н. (январь 2004 г.). «Протеасома и тонкий баланс между разрушением и спасением» . PLOS Биология . 2 (1): e13. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020013 . PMC  314468 . PMID  14737189 .
  • Протеасома дрожжей 26S со списком субъединиц и изображениями
  • Цехановер А (сентябрь 2005 г.). «Ранняя работа над системой убиквитиновых протеасом, интервью с Аароном Цехановером. Интервью CDD» . Смерть и дифференциация клеток . 12 (9): 1167–77. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401691 . PMID  16094393 .
  • Гершко А. (сентябрь 2005 г.). «Ранняя работа над системой убиквитиновых протеасом, интервью с Аврамом Хершко. Интервью CDD» . Смерть и дифференциация клеток . 12 (9): 1158–61. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401709 . PMID  16094391 .
  • Роза I (сентябрь 2005 г.). «Ранняя работа над системой убиквитиновых протеасом, интервью с Ирвином Роузом. Интервью CDD» . Смерть и дифференциация клеток . 12 (9): 1162–6. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401700 . PMID  16094392 .
  • Цвек Б., Дворжак З. (2007). «Нацеливание ядерного фактора-каппаВ и протеасомы дитиокарбаматными комплексами с металлами» . Текущий фармацевтический дизайн . 13 (30): 3155–67. DOI : 10,2174 / 138161207782110390 . PMID  17979756 . Архивировано из оригинального 29 июля 2012 года.

Внешние ссылки [ править ]

  • Номенклатура субъединиц протеасом
  • Трехмерные протеасомные структуры в банке данных EM (EMDB)
  • Ключевые моменты функции протеасомы