Replisome представляет собой сложную молекулярную машину , которая осуществляет репликацию в ДНК . Реплисома сначала раскручивает двухцепочечную ДНК на две одноцепочечные. Для каждой из полученных одиночных цепей синтезируется новая комплементарная последовательность ДНК. Конечный результат - образование двух новых двухцепочечных последовательностей ДНК, которые являются точными копиями исходной двухцепочечной последовательности ДНК. [1]
С точки зрения структуры реплисома состоит из двух репликативных полимеразных комплексов, один из которых синтезирует ведущую цепь , а другой - отстающую . Реплисома состоит из ряда белков, включая геликазу , RFC , PCNA , гиразу / топоизомеразу , SSB / RPA , примазу , ДНК-полимеразу III , РНКазу H и лигазу .
Обзор процесса репликации прокариотической ДНК
Для прокариот каждый делящийся нуклеоид (область, содержащая генетический материал, не являющийся ядром) требует двух реплисом для двунаправленной репликации . Две реплисомы продолжают репликацию на обеих вилках в середине клетки. Наконец, когда сайт терминации реплицируется, две реплисомы отделяются от ДНК. Реплисома остается в фиксированном месте в середине клетки, прикрепляется к мембране , и матричная ДНК пронизывает ее. ДНК подается через неподвижную пару реплисом, расположенных на клеточной мембране.
Обзор процесса репликации эукариотической ДНК
У эукариот многочисленные репликационные пузыри образуются в точках начала репликации по всей хромосоме . Как и в случае с прокариотами, требуются две реплисомы, по одной на каждой вилке репликации, расположенной на конце пузыря репликации. Из-за значительных различий в размере хромосом и связанных с этим сложностей высококонденсированных хромосом различные аспекты процесса репликации ДНК у эукариот, включая терминальные фазы, менее хорошо изучены, чем у прокариот.
Проблемы репликации ДНК
Реплисома - это система, в которой различные факторы работают вместе, чтобы решить структурные и химические проблемы репликации ДНК. Размер и структура хромосом у разных организмов различаются, но поскольку молекулы ДНК являются резервуаром генетической информации для всех форм жизни, многие проблемы репликации и решения одинаковы для разных организмов. В результате факторы репликации, которые решают эти проблемы, являются высоко консервативными с точки зрения структуры, химического состава, функциональности или последовательности. Общие структурные и химические проблемы включают следующее:
- Эффективная сборка реплисом в ориджинах репликации (комплексы распознавания ориджина или специфические последовательности ориджина репликации у некоторых организмов)
- Разделение дуплекса на ведущую и отстающую нити шаблона ( геликазы )
- Защита ведущих и отстающих нитей от повреждений после разделения дуплекса (факторы SSB и RPA)
- Праймирование ведущей и отстающей цепей матрицы (праймаза или ДНК-полимераза альфа)
- Обеспечение процессивности (факторы нагрузки зажима, белки зажима кольцевой формы, протеины связывания цепи)
- Высокоточная репликация ДНК (ДНК-полимераза III, ДНК-полимераза дельта, ДНК-полимераза эпсилон. Все они имеют низкую частоту ошибок из-за своей структуры и химического состава).
- Исправление ошибок (ошибки распознавания активных сайтов репликативной полимеразы; 3-5 ' экзонуклеазные домены репликативных полимераз исправляют ошибки)
- Синхронизированная полимеризация ведущих и отстающих цепей, несмотря на антипараллельную структуру (структура репликационной вилки, димеризация репликативных полимераз)
- Удаление праймера (ДНК-полимераза I, РНКаза H, эндонуклеазы лоскута, такие как FEN1 , или другие факторы репарации ДНК)
- Образование фосфодиэфирных связей в промежутках между фрагментами Окадзаки (лигаза)
В общем, проблемы репликации ДНК связаны со структурой молекул, химией молекул и, с системной точки зрения, лежащими в основе отношениями между структурой и химией.
Решение проблем репликации ДНК
Многие структурные и химические проблемы, связанные с репликацией ДНК, решаются с помощью молекулярного механизма, который хорошо сохраняется у организмов. В этом разделе обсуждается, как реплисомные факторы решают структурные и химические проблемы репликации ДНК.
Реплисомная сборка
Репликация ДНК начинается в сайтах, называемых точками репликации. У организмов с небольшими геномами и простой структурой хромосом, таких как бактерии, на каждой хромосоме может быть только несколько источников репликации. У организмов с большими геномами и сложной структурой хромосом, таких как люди, могут быть сотни или даже тысячи источников репликации, распределенных по множеству хромосом.
Структура ДНК изменяется во времени, пространстве и последовательности, и считается, что эти вариации, помимо их роли в экспрессии генов, также играют активную роль в сборке реплисом во время синтеза ДНК. Сборка реплисом в ориджине репликации примерно разделяется на три фазы.
Для прокариот:
- Формирование пререпликационного комплекса. DnaA связывается с комплексом распознавания происхождения и разделяет дуплекс. Это привлекает геликазу DnaB и DnaC , которые поддерживают пузырь репликации.
- Формирование предпускового комплекса. SSB связывается с одиночной нитью, а затем гамма (коэффициент нагрузки зажима) связывается с SSB.
- Формирование инициирующего комплекса. Гамма накладывает скользящий зажим (бета) и привлекает ДНК-полимеразу III.
Для эукариот:
- Формирование пререпликационного комплекса. Факторы MCM связываются с комплексом распознавания ориджина и разделяют дуплекс, образуя репликационный пузырь.
- Формирование предпускового комплекса. Белок репликации А (RPA) связывается с одноцепочечной ДНК, а затем RFC (фактор нагрузки зажима) связывается с RPA.
- Формирование инициирующего комплекса. RFC накладывает скользящий зажим ( PCNA ) и привлекает ДНК-полимеразы, такие как альфа (α), дельта (δ), эпсилон (ε).
И для прокариот, и для эукариот следующую стадию обычно называют «удлинением», и именно на этой стадии происходит большая часть синтеза ДНК.
Разделение дуплекса
ДНК представляет собой дуплекс, образованный двумя антипараллельными цепями. Согласно Meselson-Stahl , процесс репликации ДНК является полуконсервативным, посредством чего во время репликации исходный дуплекс ДНК разделяется на две дочерние цепи (называемые матрицами ведущей и отстающей цепи). Каждая дочерняя цепь становится частью нового дуплекса ДНК. Факторы, обычно называемые геликазами, раскручивают дуплекс.
Геликасы
Геликаза - это фермент, который разрывает водородные связи между парами оснований в середине дуплекса ДНК. Его структура, напоминающая пончик, обвивает ДНК и разделяет нити перед синтезом ДНК. У эукариот комплекс Mcm2-7 действует как геликаза, хотя не совсем ясно, какие субъединицы необходимы для активности геликазы. [2] Эта геликаза перемещается в том же направлении, что и ДНК-полимераза (от 3 'до 5' относительно цепи-матрицы). У прокариотических организмов геликазы лучше идентифицируются и включают dnaB , который перемещается с 5 'на 3' на цепи, противоположной ДНК-полимеразе.
Размотка суперспиралей и декатенация
Когда геликаза раскручивает двойную спираль, топологические изменения, вызванные вращательным движением геликазы, приводят к образованию суперспирали перед геликазой (аналогично тому, что происходит, когда вы скручиваете кусок нити).
Гираза и топоизомеразы
Гираза (форма топоизомеразы ) расслабляет и устраняет суперспирализацию, вызванную геликазой. Он делает это, разрезая нити ДНК, позволяя ей вращаться и высвобождая суперспираль, а затем снова соединяя нити. Гираза чаще всего находится перед вилкой репликации, где образуются суперспирали.
Защита ведущих и отстающих прядей
Одноцепочечная ДНК очень нестабильна и может образовывать водородные связи с собой, которые называются «шпильками» (или одна цепь может неправильно связываться с другой одноцепочечной цепью). Чтобы противодействовать этой нестабильности, одноцепочечные связывающие белки (SSB у прокариот и белок репликации A у эукариот) связываются с открытыми основаниями, чтобы предотвратить неправильное лигирование.
Если рассматривать каждую прядь как «динамическую эластичную струну», структурный потенциал неправильного лигирования должен быть очевиден.
Отстающая нить без связывающих белков. |
---|
|
Расширенная схема раскрывает основную химию проблемы: возможность образования водородной связи между неродственными парами оснований.
Схематическое изображение недавно разделенных цепей ДНК без белков, связывающих цепочку. |
---|
|
Связывающие белки стабилизируют одиночную нить и защищают нить от повреждений, вызванных нелицензированными химическими реакциями.
Отстающая нить покрыта связывающими белками (*), предотвращающими неправильное лигирование. |
---|
|
Комбинация одиночной цепи и ее связывающих белков служит лучшим субстратом для репликативных полимераз, чем голая одиночная цепь (связывающие белки обеспечивают дополнительную термодинамическую движущую силу для реакции полимеризации). Белки, связывающие нити, удаляются репликативными полимеразами.
Грунтование ведущих и отстающих прядей
Как со структурной, так и с химической точки зрения, отдельная цепь ДНК сама по себе (и связанные с ней связывающие белки с одной цепью) не подходят для полимеризации. Это связано с тем, что химические реакции, катализируемые репликативными полимеразами, требуют свободного 3 'ОН, чтобы инициировать удлинение нуклеотидной цепи. С точки зрения структуры, конформация активных сайтов репликативной полимеразы (которая в значительной степени связана с присущей репликативной полимераз точностью) означает, что эти факторы не могут начать удлинение цепи без уже существующей цепи нуклеотидов, потому что никакая известная репликативная полимераза не может начать удлинение цепи. de novo.
Прайминговые ферменты (которые представляют собой ДНК-зависимые РНК-полимеразы ) решают эту проблему, создавая РНК-праймер на ведущей и отстающей цепях. Ведущую цепь праймируют один раз, а отстающей цепи праймируют примерно через каждые 1000 (+/- 200) пар оснований (один праймер для каждого фрагмента Окадзаки на отстающей цепи). Каждый праймер РНК имеет длину примерно 10 оснований.
Однонить ДНК с белками, связывающими нить (*), и праймером РНК, добавленными при помощи ферментов (UAGCUAUAUAUA). |
---|
|
Интерфейс в (A *) содержит свободный 3 'OH, который химически подходит для реакции, катализируемой репликативными полимеразами, а конфигурация «выступа» структурно подходит для удлинения цепи репликативной полимеразой. Таким образом, репликативные полимеразы могут начинать удлинение цепи в точке (A *).
Primase
У прокариот прайма создает праймер РНК в начале недавно разделенных ведущей и отстающей цепей.
ДНК-полимераза альфа
У эукариот ДНК-полимераза альфа создает праймер РНК в начале недавно разделенных ведущей и отстающей цепей, и, в отличие от примазы, ДНК-полимераза альфа также синтезирует короткую цепь дезоксинуклеотидов после создания праймера.
Обеспечение процессивности и синхронизации
Процессивность относится как к скорости, так и к непрерывности репликации ДНК, а высокая процессивность является требованием для своевременной репликации. Высокая процессивность частично обеспечивается кольцевыми белками, называемыми «зажимами», которые помогают репликативным полимеразам оставаться связанными с ведущими и отстающими цепями. Есть и другие переменные: с химической точки зрения белки, связывающие нити, стимулируют полимеризацию и обеспечивают дополнительную термодинамическую энергию для реакции. С системной точки зрения структура и химический состав многих факторов реплисомы (таких как особенности ААА + АТФазы отдельных субъединиц нагрузки зажима вместе со спиральной конформацией, которую они принимают), а также связи между факторами нагрузки зажима и другими дополнительными факторами, также увеличивает процессивность.
К этому моменту, согласно исследованиям Kuriyan et al. [3], из-за их роли в привлечении и связывании других факторов, таких как прайминговые ферменты и репликативные полимеразы, зажимные устройства и скользящие зажимы находятся в центре реплисомного механизма. Исследования показали, что нагрузка зажима и факторы скользящего зажима абсолютно необходимы для воспроизведения, что объясняет высокую степень структурной консервации, наблюдаемую для нагрузки зажима и факторов скользящего зажима. Эта архитектурная и структурная консервация наблюдается у таких разнообразных организмов, как бактерии, фаги, дрожжи и люди. То, что такая значительная степень структурной консервации наблюдается без гомологии последовательностей, еще больше подчеркивает важность этих структурных решений для проблем репликации.
Зажимный погрузчик
Зажимной загрузчик - это общий термин, который относится к факторам репликации, называемым гамма (прокариоты) или RFC (эукариоты). Комбинация матричной ДНК и праймерной РНК называется « ДНК А-формы », и считается, что белки репликации с зажимной нагрузкой (спиральные гетеропентамеры) хотят связываться с ДНК А-формы из-за ее формы (структуры основных / малая бороздка) и химия (образцы доноров и акцепторов водородных связей ). [3] [4] Таким образом, загрузочные белки зажима связываются с праймированной областью цепи, что вызывает гидролиз АТФ и обеспечивает энергию для открытия зажима и прикрепления его к цепи. [3] [4]
Скользящий зажим
Скользящий зажим - это общий термин, который относится к кольцевым факторам репликации, называемым бета (прокариоты) или PCNA (эукариоты). Зажимные белки привлекают и связывают репликативные полимеразы, такие как ДНК-полимераза III, для увеличения количества времени, в течение которого репликативная полимераза остается связанной с цепью. С химической точки зрения, зажим имеет слегка положительный заряд в центре, который почти идеально соответствует слегка отрицательному заряду цепи ДНК.
У некоторых организмов зажим представляет собой димер, а у других организмов зажим представляет собой тример. Несмотря на это, сохраненная кольцевая архитектура позволяет зажиму закрывать прядь.
Димеризация репликативных полимераз
Репликативные полимеразы образуют асимметричный димер на вилке репликации, связываясь с субъединицами фактора загрузки зажима. Эта асимметричная конформация способна одновременно реплицировать ведущую и отстающую нити, и совокупность факторов, включающая репликативные полимеразы, обычно называется холоферментом . Однако остаются серьезные проблемы: ведущие и отстающие нити антипараллельны. Это означает, что синтез нуклеотидов на ведущей цепи естественным образом происходит в направлении от 5 'к 3'. Однако отстающая цепь проходит в противоположном направлении, и это представляет собой серьезную проблему, поскольку никакие известные репликативные полимеразы не могут синтезировать ДНК в направлении от 3 'до 5'.
Димеризация репликативных полимераз решает проблемы, связанные с эффективной синхронизацией синтеза ведущей и отстающей цепи на репликационной вилке, но тесное пространственно-структурное связывание репликативных полимераз, решая сложную проблему синхронизации, создает еще одну проблему: димеризация Репликативные полимеразы на репликационной вилке означают, что синтез нуклеотидов для обеих цепей должен происходить в одном и том же пространственном местоположении, несмотря на тот факт, что отстающая цепь должна синтезироваться в обратном направлении относительно ведущей цепи. Синтез отстающей нити происходит после того, как геликаза размотала достаточное количество отстающей нити, и это «достаточное количество отстающей нити» полимеризуется в дискретных нуклеотидных цепях, называемых фрагментами Окадзаки.
Примите во внимание следующее: геликаза непрерывно раскручивает родительский дуплекс, но отстающая нить должна полимеризоваться в противоположном направлении. Это означает, что в то время как полимеризация ведущей цепи продолжается, полимеризация отстающей цепи происходит только после того, как достаточное количество отстающей цепи будет размотано геликазой. В этот момент репликативная полимераза отстающей цепи связывается с зажимом и праймером, чтобы начать полимеризацию. Во время синтеза отстающей нити репликативная полимераза отправляет отстающую нить обратно к репликационной вилке. Репликативная полимераза диссоциирует, когда достигает праймера РНК. Геликаза продолжает раскручивать родительский дуплекс, праймирующий фермент прикрепляет другой праймер, а репликативная полимераза повторно связывается с зажимом и праймером, когда разматывается достаточное количество отстающей цепи.
В совокупности синтез ведущей и отстающей цепи называется «полунепрерывным».
Репликация ДНК с высокой точностью
Прокариотические и эукариотические организмы используют множество репликативных полимераз, некоторые из которых хорошо охарактеризованы:
- ДНК-полимераза III
- ДНК-полимераза дельта
- ДНК-полимераза эпсилон
ДНК-полимераза III
Эта полимераза синтезирует ведущую и отстающую цепь ДНК у прокариот.
ДНК-полимераза дельта
Эта полимераза синтезирует отстающую цепь ДНК у эукариот. [5] (Предполагалось, что с ДНК-полимеразой эпсилон образуется асимметричный димер.) [6]
ДНК-полимераза эпсилон
Эта полимераза синтезирует ведущую цепь ДНК у эукариот. [7] (Предполагается, что образует асимметричный димер с ДНК-полимеразой дельта.) [5]
Корректура и исправление ошибок
Хотя и редко, но полимеризация с неправильным спариванием оснований все же происходит во время удлинения цепи. (Структура и химический состав репликативных полимераз означают, что ошибки маловероятны, но они все же возникают.) Многие репликативные полимеразы содержат механизм «исправления ошибок» в виде экзонуклеазного домена от 3 'до 5', который способен удалять пары оснований из открытый 3 'конец растущей цепи. Исправление ошибок возможно, потому что ошибки пары оснований искажают положение ионов магния в субблоке полимеризации, а структурно-химическое искажение блока полимеризации эффективно тормозит процесс полимеризации, замедляя реакцию. [8] Впоследствии химическая реакция в экзонуклеазной единице берет верх и удаляет нуклеотиды с открытого 3'-конца растущей цепи. [9] После устранения ошибки структура и химический состав блока полимеризации возвращаются к норме, и репликация ДНК продолжается. Работая вместе таким образом, активный центр полимеризации можно рассматривать как «корректор», поскольку он обнаруживает несоответствия, а экзонуклеаза является «редактором», поскольку он исправляет ошибки.
Ошибки пары оснований искажают активный сайт полимеразы на 4-6 нуклеотидов, что означает, что в зависимости от типа несоответствия существует до шести шансов на исправление ошибки. [8] Чувствительная ошибок и коррекция ошибок функция, в сочетании с присущей точностью , которая возникает из структуры и химии репликативных полимераз, способствуют частотам ошибок приблизительно 1 базовому несовпадения пар в 10 8 до 10 10 пар оснований.
Схематическое изображение правильных пар оснований, за которыми следуют 8 возможных несовпадений пар оснований. [10] |
---|
|
Ошибки можно разделить на три категории: несовпадения пурин-пурин, несовпадения пиримидин-пиримидин и несовпадения пиримидин-пурин. Химический состав каждого несоответствия варьируется, как и поведение репликативной полимеразы в отношении ее активности по распознаванию несоответствия.
Репликация ДНК бактериофага Т4 при заражении E. coli является хорошо изученной системой репликации ДНК. В период экспоненциального увеличения ДНК при 37 ° C скорость удлинения составляет 749 нуклеотидов в секунду. [11] Частота мутаций во время репликации составляет 1,7 мутации на 10 8 пар оснований. [12] Таким образом, репликация ДНК в этой системе происходит очень быстро и с высокой точностью.
Удаление праймера и лигирование порезов
После синтеза ведущей и отстающей цепи возникают две проблемы: РНК остается в дуплексе, и между каждым фрагментом Окадзаки в отстающем дуплексе есть зазоры. Эти проблемы решаются множеством ферментов репарации ДНК, которые различаются в зависимости от организма, включая ДНК-полимеразу I, ДНК-полимеразу бета, РНКазу H, лигазу и ДНК2. Этот процесс хорошо охарактеризован у прокариот и гораздо менее хорошо охарактеризован у многих эукариот.
В общем, ферменты репарации ДНК дополняют фрагменты Окадзаки различными способами, включая: вырезание пар оснований и экзонуклеазную активность от 5 'до 3', которая удаляет химически нестабильные рибонуклеотиды из отстающего дуплекса и заменяет их стабильными дезоксинуклеотидами. Этот процесс называется «созреванием фрагментов Окадзаки», и лигаза (см. Ниже) завершает последний этап процесса созревания.
Дуплекс РНК-ДНК с рибонуклеотидами, добавленными праймирующим ферментом (-), и дезоксинуклеотидами, добавленными репликативной полимеразой (+). |
---|
|
Удаление праймера и лигирование разрывов можно рассматривать как процессы репарации ДНК, в результате которых образуется химически стабильный безошибочный дуплекс. К этому моменту, что касается химии дуплекса РНК-ДНК, помимо присутствия урацила в дуплексе, присутствие рибозы (которая имеет реактивный 2'-ОН) имеет тенденцию делать дуплекс гораздо менее химически стабильным. чем дуплекс, содержащий только дезоксирибозу (которая имеет нереактивный 2 'H).
ДНК-полимераза I
ДНК-полимераза I - это фермент, восстанавливающий ДНК.
РНКаза H
РНКаза H - это фермент, который удаляет РНК из дуплекса РНК-ДНК.
Лигаза
После того, как факторы репарации ДНК заменяют рибонуклеотиды праймера дезоксинуклеотидами, в сахарофосфатном остове остается один разрыв между каждым фрагментом Окадзаки в отстающем дуплексе. Фермент, называемый ДНК-лигазой, соединяет разрыв в основной цепи, образуя фосфодиэфирную связь между каждым разрывом, разделяющим фрагменты Окадзаки. Структурные и химические аспекты этого процесса, обычно называемого «ник-переводом», выходят за рамки данной статьи.
Схематическое изображение нового дуплекса дочерней ДНК с отстающей цепью показано ниже вместе с сахарно-фосфатным остовом. |
---|
|
Готовый дуплекс: |
---|
|
Репликационный стресс
Напряжение репликации может привести к остановке репликационной вилки. Один тип репликативного стресса возникает в результате повреждения ДНК, такого как межцепочечные перекрестные связи (ICL). ICL может блокировать развитие репликативной вилки из-за нарушения разделения цепей ДНК. В клетках позвоночных репликация ICL-содержащей матрицы хроматина запускает рекрутирование более 90 факторов репарации ДНК и поддержания генома . [13] Эти факторы включают белки, которые выполняют последовательные разрезы и гомологичную рекомбинацию .
История
Кэтрин Лемон и Алан Гроссман показали с помощью Bacillus subtilis, что реплисомы не движутся, как поезда по рельсам, а ДНК фактически проходит через неподвижную пару реплисом, расположенных на клеточной мембране. В их эксперименте реплисомы в B. subtilis были помечены зеленым флуоресцентным белком, и местоположение комплекса контролировали в реплицирующихся клетках с помощью флуоресцентной микроскопии . Если бы реплисомы двигались, как поезд по рельсам, белок полимераза-GFP находился бы в разных положениях в каждой клетке. Однако вместо этого в каждой реплицирующейся клетке реплисомы наблюдались как отдельные флуоресцентные фокусы, расположенные в средней клетке или рядом с ней. Клеточная ДНК, окрашенная синим флуоресцентным красителем (DAPI), явно занимала большую часть цитоплазматического пространства. [14]
Рекомендации
- ^ Яо, Нина Ю .; О'Доннелл, Майк (2010). «Снимок: Ответ» . Cell . Elsevier BV. 141 (6): 1088–1088.e1. DOI : 10.1016 / j.cell.2010.05.042 . ISSN 0092-8674 . PMC 4007198 . PMID 20550941 .
- ^ Бохман М.Л., Швача А. (июль 2008 г.). «Комплекс Mcm2-7 обладает геликазной активностью in vitro». Мол. Cell . 31 (2): 287–93. DOI : 10.1016 / j.molcel.2008.05.020 . PMID 18657510 .
- ^ а б в Келч Б.А., Макино Д.Л., О'Доннелл М., Куриян Дж. (2012). «Зажим загрузчик АТФазы и эволюция механизма репликации ДНК» . BMC Biol . 10 : 34. DOI : 10.1186 / 1741-7007-10-34 . PMC 3331839 . PMID 22520345 .
- ^ а б Bowman GD, O'Donnell M, Kuriyan J (июнь 2004 г.). «Структурный анализ эукариотического скользящего загрузочного комплекса ДНК с зажимом-зажимом». Природа . 429 (6993): 724–30. DOI : 10,1038 / природа02585 . PMID 15201901 .
- ^ а б Swan MK, Johnson RE, Prakash L, Prakash S, Aggarwal AK (сентябрь 2009 г.). «Структурные основы высокоточного синтеза ДНК дрожжевой ДНК-полимеразой дельта» . Nat. Struct. Мол. Биол . 16 (9): 979–86. DOI : 10.1038 / nsmb.1663 . PMC 3055789 . PMID 19718023 .
- ^ Миябе И., Кункель Т.А., Карр А.М. (декабрь 2011 г.). «Основные роли ДНК-полимераз эпсилон и дельта в вилке репликации эукариот являются эволюционно законсервированными» . PLOS Genet . 7 (12): e1002407. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1002407 . PMC 3228825 . PMID 22144917 .
- ^ Pursell ZF, Isoz I, Lundström EB, Johansson E, Kunkel TA (июль 2007 г.). «Дрожжевая ДНК-полимераза эпсилон участвует в репликации ведущей цепи ДНК» . Наука . 317 (5834): 127–30. DOI : 10.1126 / science.1144067 . PMC 2233713 . PMID 17615360 .
- ^ а б Джонсон С.Дж., Биз Л.С. (март 2004 г.). «Структуры ошибок несовпадения репликации, наблюдаемые в ДНК-полимеразе». Cell . 116 (6): 803–16. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (04) 00252-1 . PMID 15035983 .
- ^ Jiricny J (март 2004 г.). «Неверная ДНК-полимераза поймана с поличным» (PDF) . Мол. Cell . 13 (6): 768–9. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (04) 00149-2 . PMID 15053870 .
- ^ «Мутагенез и репарация ДНК» . ATDBio Ltd.
- ^ Маккарти Д., Миннер С., Бернштейн Х, Бернштейн С. (1976). «Скорость удлинения ДНК и распределение точек роста фага Т4 дикого типа и янтарного мутанта с задержкой ДНК». J. Mol. Биол . 106 (4): 963–81. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (76) 90346-6 . PMID 789903 .
- ^ Дрейк JW (1970) Молекулярная основа мутации. Холден-Дэй, Сан-Франциско ISBN 0816224501ISBN 978-0816224500
- ^ Räschle M, Smeenk G, Hansen RK, Temu T, Oka Y, Hein MY, Nagaraj N, Long DT, Walter JC, Hofmann K, Storchova Z, Cox J, Bekker-Jensen S, Mailand N, Mann M (2015). «Реставрация ДНК. Протеомика выявляет динамическую сборку репарационных комплексов при обходе поперечных связей ДНК» . Наука . 348 (6234): 1253671. DOI : 10.1126 / science.1253671 . PMC 5331883 . PMID 25931565 .
- ^ Фостер JB, Slonczewski J (2010). Микробиология: развивающаяся наука (второе изд.). Нью-Йорк: WW Norton & Company. ISBN 978-0-393-93447-2.
дальнейшее чтение
- Померанц RT, О'Доннелл М. (апрель 2007 г.). «Реплисомная механика: взгляд на двойную ДНК-полимеразную машину». Trends Microbiol . 15 (4): 156–64. DOI : 10.1016 / j.tim.2007.02.007 . PMID 17350265 .
Внешние ссылки
- ДНК + реплисома в предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)