В биохимии и фармакологии , A - лиганд представляет собой вещество , которое образует комплекс с биомолекулы , чтобы служить биологической цели. Этимология происходит от слова ligare , что означает «связывать». При связывании белок-лиганд лиганд обычно представляет собой молекулу, которая вырабатывает сигнал путем связывания с сайтом на целевом белке . Связывание обычно приводит к изменению конформационной изомерии (конформации) целевого белка. В исследованиях связывания ДНК с лигандом лиганд может быть небольшой молекулой, ионом [1] или белком.[2], который связывается с двойной спиралью ДНК . Отношения между лигандом и партнером по связыванию зависят от заряда, гидрофобности и молекулярной структуры. Пример связывания происходит в бесконечно малом диапазоне времени и пространства, поэтому константа скорости обычно является очень малым числом.
Связывание происходит за счет межмолекулярных сил , таких как ионные связи , водородные связи и силы Ван-дер-Ваальса . Ассоциация или стыковка на самом деле обратимы через диссоциацию. Измеримая необратимая ковалентная связь между лигандом и молекулой-мишенью нетипична в биологических системах. В отличие от определения лиганда в металлоорганической и неорганической химии , в биохимии неоднозначно, связывается ли лиганд в основном с участком металла , как в случае с гемоглобином . В общем, интерпретация лиганда зависит от контекста, в зависимости от того, какой тип связывания наблюдается.
Связывание лиганда с рецепторным белком изменяет конформацию, влияя на ориентацию трехмерной формы. Конформация рецепторного белка составляет функциональное состояние. Лиганды включают субстраты , ингибиторы , активаторы , сигнальные липиды и нейротрансмиттеры . Скорость связывания называется аффинностью , и это измерение характеризует тенденцию или силу эффекта. Аффинность связывания актуализируется не только взаимодействиями хозяин-гость , но также эффектами растворителя, которые могут играть доминирующую стерическую роль, которая управляет нековалентным связыванием в растворе. [3] Растворитель обеспечивает химическую среду, в которой лиганд и рецептор могут адаптироваться и, таким образом, принимать или отвергать друг друга в качестве партнеров.
Радиолиганды - это меченые радиоизотопами соединения, используемые in vivo в качестве индикаторов в исследованиях ПЭТ и исследованиях связывания in vitro .
Аффинность связывания рецептора / лиганда
Взаимодействие лигандов с их сайтами связывания можно охарактеризовать с точки зрения аффинности связывания. В общем, связывание лиганда с высоким сродством является результатом большей силы притяжения между лигандом и его рецептором, тогда как связывание лиганда с низким сродством включает меньшую силу притяжения. В общем, связывание с высоким сродством приводит к более высокой занятости рецептора его лигандом, чем в случае связывания с низким сродством; время пребывания ( время жизни комплекса рецептор-лиганд) не коррелирует. Связывание лигандов с рецепторами с высоким сродством часто является физиологически важным, когда некоторая часть энергии связывания может использоваться для того, чтобы вызвать конформационное изменение рецептора, что приводит к изменению поведения, например, связанного ионного канала или фермента .
Лиганд, который может связываться с рецептором и изменять его функцию, вызывающую физиологический ответ, называется агонистом рецептора . Лиганды, которые связываются с рецептором, но не могут активировать физиологический ответ, являются антагонистами рецептора .
Связывание агониста с рецептором можно охарактеризовать как с точки зрения того, насколько физиологический ответ может быть вызван (то есть, эффективность ), так и с точки зрения концентрации агониста, необходимой для получения физиологического ответа (часто измеряемой как EC 50 , концентрация, необходимая для получения полумаксимального ответа). Связывание лиганда с высоким сродством подразумевает, что относительно низкая концентрация лиганда достаточна для максимального занятия лиганд-связывающего сайта и запуска физиологического ответа. Сродство рецептора измеряется константой ингибирования или значением K i , концентрация, необходимая для занятия 50% рецептора. Аффинность лиганда чаще всего измеряют косвенно как значение IC 50 в эксперименте по конкурентному связыванию, в котором определяют концентрацию лиганда, необходимую для замещения 50% фиксированной концентрации эталонного лиганда. Значение K i можно оценить из IC 50 с помощью уравнения Ченга Прусоффа . Аффинность лигандов также может быть измерена непосредственно как константа диссоциации (K d ) с использованием таких методов, как тушение флуоресценции , калориметрия изотермического титрования или поверхностный плазмонный резонанс . [4]
Низкоаффинное связывание (высокий уровень K i ) означает, что требуется относительно высокая концентрация лиганда, прежде чем сайт связывания будет максимально занят и будет достигнут максимальный физиологический ответ на лиганд. В примере, показанном справа, два разных лиганда связываются с одним и тем же сайтом связывания рецептора. Только один из показанных агонистов может максимально стимулировать рецептор и, таким образом, может быть определен как полный агонист . Агонист, который может только частично активировать физиологический ответ, называется частичным агонистом . В этом примере концентрация, при которой полный агонист (красная кривая) может наполовину максимально активировать рецептор, составляет примерно 5 x 10 -9 моль (нм = наномоль ).
Аффинность связывания чаще всего определяют с использованием радиоактивно меченного лиганда, известного как меченый лиганд. Эксперименты по гомологичному конкурентному связыванию включают конкуренцию связывания между меченым лигандом и немаркированным лигандом. [5] Методы, основанные на реальном времени, которые часто не содержат меток, такие как поверхностный плазмонный резонанс , двухполяризационная интерферометрия и многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс (MP-SPR), могут не только количественно оценить аффинность на основе анализов на основе концентрации; но также из кинетики ассоциации и диссоциации, а в более поздних случаях конформационного изменения, индуцированного при связывании. MP-SPR также позволяет проводить измерения в буферах диссоциации с высоким содержанием физиологического раствора благодаря уникальной оптической настройке. Был разработан метод микромасштабного термофореза (MST) без иммобилизации [6] . Этот метод позволяет определять аффинность связывания без ограничения молекулярной массы лиганда. [7]
Для использования статистической механики в количественном исследовании аффинности связывания лиганд-рецептор см. Исчерпывающую статью [8] о функции распределения конфигурации .
Эффективность лекарственного средства и сродство к связыванию
Сами по себе данные о сродстве связывания не определяют общую эффективность лекарственного средства. Эффективность является результатом сложного взаимодействия как аффинности связывания, так и эффективности лиганда. Эффективность лиганда относится к способности лиганда вызывать биологический ответ при связывании с рецептором-мишенью и количественной величине этого ответа. Этот ответ может быть агонистом , антагонистом или обратным агонистом , в зависимости от продуцируемого физиологического ответа. [9]
Селективный и неизбирательный
Селективные лиганды имеют тенденцию связываться с очень ограниченными типами рецепторов, тогда как неселективные лиганды связываются с несколькими типами рецепторов. Это играет важную роль в фармакологии , где неселективные лекарственные средства , как правило, имеют более неблагоприятные эффекты , потому что они связываются с несколькими другими рецепторами в дополнение к рецептору, вызывающему желаемый эффект.
Гидрофобные лиганды
Для гидрофобных лигандов (например, PIP2) в комплексе с гидрофобным белком (например, липидно-зависимые ионные каналы ) определение сродства осложняется неспецифическими гидрофобными взаимодействиями. Неспецифические гидрофобные взаимодействия можно преодолеть, если сродство лиганда высокое. [10] Например, PIP2 с высоким сродством связывается с ионными каналами, управляемыми PIP2.
Двухвалентный лиганд
Двухвалентные лиганды состоят из двух лекарственных молекул (фармакофоров или лигандов), соединенных инертным линкером. Существуют различные виды двухвалентных лигандов, и их часто классифицируют в зависимости от того, на что нацелены фармакофоры. Гомобивалентные лиганды нацелены на два рецептора одного и того же типа. Гетеробивалентные лиганды нацелены на два разных типа рецепторов. [11] Битопические лиганды нацелены на ортостерические сайты связывания и аллостерические сайты связывания на одном и том же рецепторе. [12]
В научных исследованиях двухвалентные лиганды использовались для изучения димеров рецепторов и изучения их свойств. Этот класс лигандов был впервые предложен Филипом С. Портогезе и его сотрудниками при изучении системы опиоидных рецепторов. [13] [14] [15] О двухвалентных лигандах также сообщалось ранее Майклом Конном и его сотрудниками для рецептора гонадотропин-рилизинг-гормона. [16] [17] Со времени этих ранних отчетов было описано много бивалентных лигандов для различных систем рецепторов, связанных с G-белком (GPCR), включая каннабиноид, [18] серотонин, [19] [20] окситоцин, [21] и меланокортин. рецепторные системы, [22] [23] [24] и для систем GPCR - LIC ( рецепторы D2 и nACh ). [11]
Бивалентные лиганды обычно больше, чем их одновалентные аналоги, и поэтому не «подобны лекарствам». (См. Правило пяти Липинского .) Многие считают, что это ограничивает их применимость в клинических условиях. [25] [26] Несмотря на эти убеждения, было много лигандов, которые сообщили об успешных доклинических исследованиях на животных. [23] [24] [21] [27] [28] [29] Учитывая, что некоторые двухвалентные лиганды могут иметь много преимуществ по сравнению с их моновалентными аналогами (например, тканевая селективность, повышенная аффинность связывания и повышенная активность или эффективность), биваленты может также иметь некоторые клинические преимущества.
Моно- и полидесмические лиганды
Лиганды белков можно охарактеризовать также по количеству связываемых ими белковых цепей. «Монодесмические» лиганды (μόνος: одиночный, δεσμός: связывание) представляют собой лиганды, которые связывают одну белковую цепь, в то время как «полидесмические» лиганды (πολοί: многие) [30] часто встречаются в белковых комплексах и являются лигандами, связывающими более одного белка. цепи, как правило, в границах раздела белков или рядом с ними. Недавние исследования показали, что тип лигандов и структура сайта связывания имеют глубокие последствия для эволюции, функции, аллостерии и фолдинга белковых комплексов. [31] [32]
Привилегированный эшафот
Привилегированный каркас [33] представляет собой молекулярный каркас или химический фрагмент, который статистически повторяется среди известных лекарств или среди определенного набора биологически активных соединений. Эти привилегированные элементы [34] могут быть использованы в качестве основы для разработки новых активных биологических соединений или библиотек соединений.
Методы, используемые для изучения связывания
Основными методами изучения взаимодействий белок-лиганд являются основные гидродинамические и калориметрические методы, а также основные спектроскопические и структурные методы, такие как
- Спектроскопия с преобразованием Фурье
- Рамановская спектроскопия
- Флуоресцентная спектроскопия
- Круговой дихроизм
- Ядерный магнитный резонанс
- Масс-спектрометрии
- Атомно-силовой микроскоп
- Парамагнитные зонды
- Двойная поляризационная интерферометрия
- Многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс
- Анализ связывания лиганда и анализ связывания радиолиганда
Другие методы включают в себя: интенсивность флуоресценции, бимолекулярную комплементацию флуоресценции, FRET (флуоресцентный резонансный перенос энергии) / FRET , подавляющий поверхностный плазмонный резонанс , биослойную интерферометрию , непрямой ИФА с коиммунопрециптацией, равновесный диализ, гель-электрофорез, дальний вестерн-блот, анизотропия поляризации флуоресценции, электронный парамагнитный резонанс, термофорез на микромасштабах
Резко возросшая вычислительная мощность суперкомпьютеров и персональных компьютеров позволила изучать взаимодействия белок-лиганд также с помощью вычислительной химии . Например, всемирная сеть из более чем миллиона обычных ПК была задействована для исследований рака в проекте grid.org , который завершился в апреле 2007 года. На смену Grid.org пришли аналогичные проекты, такие как World Community Grid , Human Proteome Folding Project. , Compute Against Cancer and Folding @ Home .
Смотрите также
- Агонист
- Регресс Шильда
- Аллостерическая регуляция
- База данных Ki
- Док-станция @ Home
- GPUGRID.net
- ДНК-связывающий лиганд
- BindingDB
- SAMPL Challenge
Рекомендации
- ^ Teif VB (октябрь 2005). «Лиганд-индуцированная конденсация ДНК: выбор модели» . Биофизический журнал . 89 (4): 2574–87. Bibcode : 2005BpJ .... 89.2574T . DOI : 10.1529 / biophysj.105.063909 . PMC 1366757 . PMID 16085765 .
- ^ Тейф В.Б., Риппе К. (октябрь 2010 г.). «Статистико-механические решетчатые модели связывания белок-ДНК в хроматине». Журнал физики: конденсированное вещество . 22 (41): 414105. arXiv : 1004.5514 . Bibcode : 2010JPCM ... 22O4105T . DOI : 10.1088 / 0953-8984 / 22/41/414105 . PMID 21386588 . S2CID 103345 .
- ^ Барон Р., Сетни П., Маккаммон Дж. А. (сентябрь 2010 г.). «Вода в полости - распознавание лигандов» . Журнал Американского химического общества . 132 (34): 12091–7. DOI : 10.1021 / ja1050082 . PMC 2933114 . PMID 20695475 .
- ^ «Разница между значениями K i , K d , IC 50 и EC 50 » . Научная улитка . 31 декабря 2019 г.
- ^ См. Кривые гомологичного конкурентного связывания. Архивировано 19 декабря 2007 г.на Wayback Machine , Полное руководство по нелинейной регрессии, curvefit.com.
- ^ Baaske P, Wienken CJ, Reineck P, Duhr S, Braun D (март 2010 г.). «Оптический термофорез для количественной оценки буферной зависимости связывания аптамера». Angewandte Chemie . 49 (12): 2238–41. DOI : 10.1002 / anie.200903998 . PMID 20186894 . Краткое содержание - Phsy.org (24 февраля 2010 г.).
- ^ Винкен CJ, Baaske P, Rothbauer U, Braun D, Duhr S (октябрь 2010 г.). «Анализы связывания белков в биологических жидкостях с использованием термофореза на микроуровне» . Nature Communications . 1 (7): 100. Bibcode : 2010NatCo ... 1..100W . DOI : 10.1038 / ncomms1093 . PMID 20981028 .
- ^ Ву-Куок, Л., Интеграл конфигурации (статистическая механика) , 2008. этот вики-сайт не работает; см эту статью в веб - архиве на 2012 28 апреля .
- ^ Кенакин Т.П. (ноябрь 2006 г.). Учебник по фармакологии: теория, приложения и методы . Академическая пресса . п. 79. ISBN 978-0-12-370599-0.
- ^ Cabanos, C; Ван, М; Хан, X; Хансен, SB (8 августа 2017 г.). «Анализ растворимого флуоресцентного связывания выявляет антагонизм PIP 2 каналов TREK-1» . Отчеты по ячейкам . 20 (6): 1287–1294. DOI : 10.1016 / j.celrep.2017.07.034 . PMC 5586213 . PMID 28793254 .
- ^ а б Матера, Карло; Пуччи, Лука; Фиорентини, Кьяра; Фучиле, Серджио; Миссейл, Кристина; Грациозо, Джованни; Клементи, Франческо; Золи, Микеле; Де Амичи, Марко (28 августа 2015 г.). «Бифункциональные соединения, нацеленные как на D2, так и на не-α7 nACh рецепторы: дизайн, синтез и фармакологическая характеристика». Европейский журнал медицинской химии . 101 : 367–383. DOI : 10.1016 / j.ejmech.2015.06.039 . PMID 26164842 .
- ^ Матера, Карло; Фламмини, Лиза; Куадри, Марта; Виво, Валентина; Баллабени, Виджилио; Хольцграбе, Ульрике; Мор, Клаус; Де Амичи, Марко; Барочелли, Элизабетта (21 марта 2014 г.). «Бис (аммонио) алкановые агонисты мускариновых рецепторов ацетилхолина: синтез, функциональная характеристика in vitro и оценка их анальгетической активности in vivo». Европейский журнал медицинской химии . 75 : 222–232. DOI : 10.1016 / j.ejmech.2014.01.032 . PMID 24534538 .
- ^ Эрез М., Такемори А.Е., Портогезе П.С. (июль 1982 г.). «Наркотическая антагонистическая сила двухвалентных лигандов, содержащих бета-налтрексамин. Доказательства образования мостиков между проксимальными сайтами узнавания». Журнал медицинской химии . 25 (7): 847–9. DOI : 10.1021 / jm00349a016 . PMID 7108900 .
- ^ Портогезе PS, Ronsisvalle G, Larson DL, Yim CB, Sayre LM, Takemori AE (1982). «Опиоидные агонисты и антагонисты двухвалентных лигандов в качестве рецепторных зондов». Науки о жизни . 31 (12–13): 1283–6. DOI : 10.1016 / 0024-3205 (82) 90362-9 . PMID 6292615 .
- ^ Портогезе П.С., Акгюн Э., Лунцер М.М. (январь 2017 г.). "Индукция гетеромера: подход к уникальной фармакологии?" . ACS Chemical Neuroscience . 8 (3): 426–428. DOI : 10.1021 / acschemneuro.7b00002 . PMID 28139906 .
- ^ Блюм Дж. Дж., Конн. П.М. (декабрь 1982 г.). «Стимуляция высвобождения лютеинизирующего гормона гонадотропин-рилизинг-гормоном: модель лиганд-рецептор-эффектор» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 79 (23): 7307–11. Bibcode : 1982PNAS ... 79.7307B . DOI : 10.1073 / pnas.79.23.7307 . JSTOR 13076 . PMC 347328 . PMID 6296828 .
- ^ Конн ПМ, Роджерс, округ Колумбия, Стюарт Дж. М., Нидель Дж., Шеффилд Т. (апрель 1982 г.). «Превращение антагониста гонадотропин-рилизинг-гормона в агонист». Природа . 296 (5858): 653–5. Bibcode : 1982Natur.296..653C . DOI : 10.1038 / 296653a0 . PMID 6280058 . S2CID 4303982 .
- ^ Nimczick M, Pemp D, Darras FH, Chen X, Heilmann J, Decker M (август 2014 г.). «Синтез и биологическая оценка лигандов двухвалентных каннабиноидных рецепторов на основе бензимидазолов, селективных к hCB₂R, выявляют неожиданные внутренние свойства». Биоорганическая и медицинская химия . 22 (15): 3938–46. DOI : 10.1016 / j.bmc.2014.06.008 . PMID 24984935 .
- ^ Руссо О., Бертуз М., Гинер М., Сулье Дж. Л., Ривейл Л., Сиксик С., Лезуальч Ф., Джокерс Р., Берк-Бестель I (сентябрь 2007 г.). «Синтез конкретных двухвалентных зондов, которые функционально взаимодействуют с димерами 5-HT (4) рецептора». Журнал медицинской химии . 50 (18): 4482–92. DOI : 10.1021 / jm070552t . PMID 17676726 .
- ^ Сулье Дж. Л., Руссо О., Гинер М., Ривейл Л., Бертуз М., Онгери С., Мегре Б., Фишмайстер Р., Лезуальч Ф., Сиксик С., Берк-Бестель I. (октябрь 2005 г.). «Дизайн и синтез специфических зондов для исследований димеризации рецептора 5-HT4 человека». Журнал медицинской химии . 48 (20): 6220–8. DOI : 10.1021 / jm050234z . PMID 16190749 .
- ^ а б Busnelli M, Kleinau G, Muttenthaler M, Stoev S, Manning M, Bibic L, Howell LA, McCormick PJ, Di Lascio S, Braida D, Sala M, Rovati GE, Bellini T, Chini B (август 2016 г.). «Дизайн и характеристика суперпотентных бивалентных лигандов, нацеленных на димеры рецептора окситоцина через канально-подобную структуру» . Журнал медицинской химии . 59 (15): 7152–66. DOI : 10.1021 / acs.jmedchem.6b00564 . PMID 27420737 .
- ^ Lensing CJ, Adank DN, Wilber SL, Freeman KT, Schnell SM, Speth RC, Zarth AT, Haskell-Luevano C (февраль 2017 г.). "Прямое сравнение in vivo моновалентного агониста меланокортина Ac-His-DPhe-Arg-Trp-NH2 с двухвалентным агонистом Ac-His-DPhe-Arg-Trp-PEDG20-His-DPhe-Arg-Trp-NH2: двухвалентный Преимущество » . ACS Chemical Neuroscience . 8 (6): 1262–1278. DOI : 10.1021 / acschemneuro.6b00399 . PMC 5679024 . PMID 28128928 .
- ^ а б Xu L, Josan JS, Vagner J, Caplan MR, Hruby VJ, Mash EA, Lynch RM, Morse DL, Gillies RJ (декабрь 2012 г.). «Гетеробивалентные лиганды нацелены на комбинации рецепторов клеточной поверхности in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (52): 21295–300. Bibcode : 2012PNAS..10921295X . DOI : 10.1073 / pnas.1211762109 . JSTOR 42553664 . PMC 3535626 . PMID 23236171 .
- ^ а б Lensing CJ, Freeman KT, Schnell SM, Adank DN, Speth RC, Haskell-Luevano C (апрель 2016 г.). «Исследование in vitro и in vivo бивалентных лигандов, которые демонстрируют предпочтительное связывание и функциональную активность для различных гомодимеров рецепторов меланокортина» . Журнал медицинской химии . 59 (7): 3112–28. DOI : 10.1021 / acs.jmedchem.5b01894 . PMC 5679017 . PMID 26959173 .
- ^ Шонберг Дж., Скаммеллс П. Дж., Капуано Б. (июнь 2011 г.). «Стратегии дизайна для двухвалентных лигандов, нацеленных на GPCR». ChemMedChem . 6 (6): 963–74. DOI : 10.1002 / cmdc.201100101 . PMID 21520422 . S2CID 10561038 .
- ^ Berque-Bestel I, Lezoualc'h F, Jockers R (декабрь 2008 г.). «Бивалентные лиганды как специфические фармакологические инструменты для димеров рецепторов, связанных с G-белком». Текущие технологии открытия лекарств . 5 (4): 312–8. DOI : 10.2174 / 157016308786733591 . PMID 19075611 .
- ^ Акгюн Э., Джавед М.И., Лунцер М.М., Пауэрс М.Д., Шам Й.Й., Ватанабе Й., Портогезе П.С. (ноябрь 2015 г.). «Ингибирование воспалительной и невропатической боли путем нацеливания на опиоидный рецептор Mu / гетеромер хемокинового рецептора5 (MOR-CCR5)» . Журнал медицинской химии . 58 (21): 8647–57. DOI : 10.1021 / acs.jmedchem.5b01245 . PMC 5055304 . PMID 26451468 .
- ^ Дэниэлс DJ, Ленард Н.Р., Этьен С.Л., Ло П.Й., Рериг С.К., Портогезе П.С. (декабрь 2005 г.). «Индуцированная опиоидами толерантность и зависимость у мышей модулируется расстоянием между фармакофорами в серии двухвалентных лигандов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (52): 19208–13. Bibcode : 2005PNAS..10219208D . DOI : 10.1073 / pnas.0506627102 . JSTOR 4152590 . PMC 1323165 . PMID 16365317 .
- ^ Смейстер Б.А., Лунцер М.М., Акгюн Э., Бейтц А.Дж., Портогезе П.С. (ноябрь 2014 г.). «Нацеливание на предполагаемые гетеромеры мю-опиоидного / метаботропного рецептора глутамата-5 вызывает сильную антиноцицепцию в модели хронического рака костей у мышей» . Европейский журнал фармакологии . 743 : 48–52. DOI : 10.1016 / j.ejphar.2014.09.008 . PMC 4259840 . PMID 25239072 .
- ^ Абрусан Дж., Марш Дж. А. (2019). "Лиганд-связывающий сайт структуры форм складывания, сборки и деградации гомомерных белковых комплексов" . Журнал молекулярной биологии . 431 (19): 3871–3888. DOI : 10.1016 / j.jmb.2019.07.014 . PMC 6739599 . PMID 31306664 .
- ^ Абрусан Дж., Марш Дж. А. (2018). «Структура сайта связывания лиганда влияет на эволюцию функции и топологии белкового комплекса» . Отчеты по ячейкам . 22 (12): 3265–3276. DOI : 10.1016 / j.celrep.2018.02.085 . PMC 5873459 . PMID 29562182 .
- ^ Абрусан Дж., Марш Дж. А. (2019). "Структура сайта связывания лиганда формирует передачу аллостерического сигнала и эволюция аллостерии в белковых комплексах" . Молекулярная биология и эволюция . 36 (8): 1711–1727. DOI : 10.1093 / molbev / msz093 . PMC 6657754 . PMID 31004156 .
- ^ Велш М.Э., Снайдер С.А., Стоквелл Б.Р. (июнь 2010 г.). «Привилегированные эшафоты для дизайна библиотеки и открытия лекарств» . Текущее мнение в химической биологии . 14 (3): 347–61. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2010.02.018 . PMC 2908274 . PMID 20303320 .
- ^ Комбаров Р., Алтиери А., Генис Д., Кирпиченок М., Кочубей В., Ракитина Н., Титаренко З. (февраль 2010 г.). «BioCores: идентификация привилегированного структурного мотива, основанного на лекарстве / натуральном продукте, для открытия низкомолекулярного свинца». Молекулярное разнообразие . 14 (1): 193–200. DOI : 10.1007 / s11030-009-9157-5 . PMID 19468851 . S2CID 23331540 .
Внешние ссылки
- BindingDB , общедоступная база данных измеренных аффинностей связывания белок-лиганд.
- BioLiP , обширная база данных по взаимодействиям лиганд-белок.