Актина является семьей из глобулярных многофункциональных белков , которые образуют микрофиламенты в цитоскелете , а также тонкие нити в мышечных волокнах . Он обнаружен практически во всех эукариотических клетках , где он может присутствовать в концентрации более 100 мкМ ; его масса составляет примерно 42 кДа , а диаметр - от 4 до 7 нм.
| Актин | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ленточная диаграмма G-актина. Выделены АДФ, связанный с активным сайтом актина (многоцветные палочки в центре рисунка), а также сложный дикатион кальция (зеленая сфера). [1] | ||||||||
| Идентификаторы | ||||||||
| Символ | Актин | |||||||
| Pfam | PF00022 | |||||||
| ИнтерПро | IPR004000 | |||||||
| ПРОФИЛЬ | PDOC00340 | |||||||
| SCOP2 | 2btf / SCOPe / SUPFAM | |||||||
| ||||||||
Белок актина является мономерной субъединицей двух типов волокон в клетках: микрофиламентов , одного из трех основных компонентов цитоскелета, и тонких волокон, составляющих сократительный аппарат в мышечных клетках. Он может присутствовать либо в виде свободного мономера, называемого G-актином (глобулярный), либо как часть линейного полимерного микрофиламента, называемого F-актином (нитчатый), оба из которых необходимы для таких важных клеточных функций, как подвижность и сокращение клеток во время деление клеток .
Актин участвует во многих важных клеточных процессах, включая сокращение мышц , подвижность клеток, деление клеток и цитокинез , движение пузырьков и органелл , передачу сигналов между клетками , а также создание и поддержание клеточных соединений и формы клеток. Многие из этих процессов опосредуются обширными и тесными взаимодействиями актина с клеточными мембранами . [2] У позвоночных были идентифицированы три основные группы изоформ актина : альфа , бета и гамма . Альфа-актины, обнаруженные в мышечных тканях, являются основной составляющей сократительного аппарата. Бета- и гамма-актины сосуществуют в большинстве типов клеток как компоненты цитоскелета и как медиаторы внутренней подвижности клеток . Считается, что широкий спектр структур, образованных актином, позволяющих ему выполнять такой широкий спектр функций, регулируется путем связывания тропомиозина вдоль нитей. [3]
Способность клетки динамически формировать микрофиламенты обеспечивает основу, которая позволяет ей быстро реконструировать себя в ответ на окружающую среду или внутренние сигналы организма , например, для увеличения абсорбции клеточной мембраны или увеличения клеточной адгезии для формирования клеточной ткани . К этому каркасу могут быть прикреплены другие ферменты или органеллы, такие как реснички , чтобы контролировать деформацию внешней клеточной мембраны , что делает возможным эндоцитоз и цитокинез . Он также может производить движение самостоятельно или с помощью молекулярных двигателей . Таким образом, актин участвует в таких процессах, как внутриклеточный транспорт везикул и органелл, а также в мышечное сокращение и миграцию клеток . Следовательно, он играет важную роль в эмбриогенезе , заживлении ран и инвазивности раковых клеток. Эволюционное происхождение актина можно проследить до прокариотических клеток , которые имеют эквивалентные белки. [4] Гомологи актина от прокариот и архей полимеризуются в различные спиральные или линейные филаменты, состоящие из одной или нескольких нитей. Однако внутрицепочечные контакты и сайты связывания нуклеотидов сохраняются у прокариот и архей. [5] Наконец, актин играет важную роль в контроле экспрессии генов .
Большое число заболеваний и заболеваний , вызванных мутациями в аллелями этих генов , которые регулируют выработку актина или его ассоциированных белков. Производство актина также является ключом к процессу заражения некоторыми патогенными микроорганизмами . Мутации в различных генах, регулирующих выработку актина у людей, могут вызывать мышечные заболевания , изменения размеров и функций сердца, а также глухоту . Состав цитоскелета также связан с патогенностью внутриклеточных бактерий и вирусов , особенно в процессах, связанных с уклонением от действий иммунной системы . [6]
Открытие и раннее расследование
Впервые актин был обнаружен экспериментально в 1887 году У. Д. Халлибертоном , который извлек из мышцы белок, который «коагулировал» препараты миозина, которые он назвал «миозиновый фермент». [7] Однако компания Halliburton не смогла уточнить свои открытия, и открытие актина приписывается Бруно Ференцу Штраубу , молодому биохимику, работающему в лаборатории Альберта Сент-Дьерди в Институте медицинской химии при Университете Сегеда. , Венгрия .
Вслед за открытием Илоной Банга и Сент-Дьёрдьи в 1941 году того факта, что коагуляция происходит только в некоторых экстрактах мизозина и обращалась вспять при добавлении АТФ [8], Штрауб идентифицировал и очищал актин из тех препаратов миозина, которые действительно коагулировали. Основываясь на оригинальном методе экстракции Банги, он разработал новую технику экстракции мышечного белка, которая позволила ему выделить значительные количества относительно чистого актина, опубликованная в 1942 году. [9] Метод Штрауба по сути тот же, что используется в лабораториях сегодня. Поскольку белок Штрауба был необходим для активации свертывания миозина, его назвали актином . [8] [10] Понимая, что препараты коагулирующего миозина Банги также содержат актин, Сент-Дьёрдьи назвал смесь обоих белков актомиозином . [11]
Военные действия Второй мировой войны привели к тому, что Сент-Дьердь не смог опубликовать результаты своей лаборатории в западных научных журналах . Таким образом, актин стал хорошо известен на Западе только в 1945 году, когда их статья была опубликована в качестве дополнения к Acta Physiologica Scandinavica . [12] ШТРАУБ продолжал работать над актина, а в 1950 году сообщалось , что актина содержит связанный АТФ [13] и что во время полимеризации белка в микрофиламентов , то нуклеотид является гидролизованный к АДФ и неорганического фосфата (которые остаются связанной с микрофиламентов) . Штрауб предположил, что преобразование АТФ-связанного актина в АДФ-связанный актин играет роль в мышечном сокращении. Фактически, это верно только для гладких мышц и не подтверждалось экспериментами до 2001 года. [13] [14]
Аминокислотная последовательность актина была завершена М. Элзинга и сотрудниками в 1973 г. [15] кристаллическая структура из G-актина была решена в 1990 году Kabsch и коллегами. [16] В том же году Холмс и его коллеги предложили модель F-актина после экспериментов по совместной кристаллизации с различными белками. [17] Процедура сокристаллизации с различными белками неоднократно использовалась в течение следующих лет, пока в 2001 году изолированный белок не кристаллизовался вместе с АДФ. Однако до сих пор нет рентгеновской структуры F-актина с высоким разрешением. Кристаллизация F-актина стала возможной благодаря использованию конъюгата родамина, который препятствует полимеризации, блокируя аминокислоту cys-374 . [1] Кристин Ориол-Аудит умерла в том же году, когда актин был впервые кристаллизован, но она была исследователем, который в 1977 году впервые кристаллизовал актин в отсутствие актин-связывающих белков (ABP). Однако полученные кристаллы были слишком маленькими для доступных технологий того времени. [18]
Хотя в настоящее время не существует модели нитевидной формы актина с высоким разрешением, в 2008 году команда Савая смогла создать более точную модель ее структуры, основанную на нескольких кристаллах димеров актина, которые связываются в разных местах. [19] Эта модель была впоследствии усовершенствована Савайей и Лоренцем. Другие подходы, такие как использование криоэлектронной микроскопии и синхротронного излучения , недавно позволили повысить разрешение и лучше понять природу взаимодействий и конформационных изменений, вовлеченных в образование актиновых филаментов. [20] [21] [22]
Состав
Актин в аминокислотной последовательность является одним из наиболее высоко консервативных белков , как это мало изменилось в течение эволюции , отличающееся не более чем на 20% в видов , как разнообразно , как водоросль и люди . [23] Поэтому считается, что он имеет оптимизированную структуру . [4] Он имеет две отличительные особенности: это фермент, который медленно гидролизует АТФ , «универсальную энергетическую валюту» биологических процессов. Однако для сохранения структурной целостности требуется АТФ. Его эффективная структура образована практически уникальным процессом складывания . Кроме того, он способен выполнять больше взаимодействий, чем любой другой белок, что позволяет ему выполнять более широкий спектр функций, чем другие белки, практически на всех уровнях клеточной жизни. [4] Миозин - это пример белка, который связывается с актином. Другой пример - виллин , который может сплетать актин в пучки или разрезать волокна в зависимости от концентрации катионов кальция в окружающей среде. [24]
Актин - один из наиболее распространенных белков у эукариот , где он обнаружен по всей цитоплазме. [24] Фактически, в мышечных волокнах он составляет 20% от общего клеточного белка по весу и от 1% до 5% в других клетках. Однако существует не только один тип актина; эти гены , которые кодируют актин определяется как семейства генов (семьи , что у растений содержит более 60 элементов, в том числе генов и псевдогенов и у людей более 30 элементов). [4] [25] Это означает, что генетическая информация каждого человека содержит инструкции, которые генерируют варианты актина (называемые изоформами ), которые обладают немного разными функциями. Это, в свою очередь, означает, что эукариотические организмы экспрессируют разные гены, дающие начало: α-актину, который находится в сократительных структурах; β-актин, обнаруженный на расширяющейся границе клеток, которые используют выступ своих клеточных структур в качестве средства передвижения; и γ-актин, который содержится в филаментах стресс-волокон . [26] В дополнение к сходству, которое существует между изоформами организма, существует также эволюционная консервация в структуре и функциях даже между организмами, содержащимися в разных эукариотических доменах . У бактерий был идентифицирован гомолог актина MreB , который представляет собой белок, способный полимеризоваться в микрофиламенты; [4] [21] а у архей гомолог Ta0583 даже больше похож на эукариотические актины. [27]
Клеточный актин имеет две формы: мономерные глобулы, называемые G-актином, и полимерные филаменты, называемые F-актином (то есть филаменты, состоящие из многих мономеров G-актина). F-актин также можно описать как микрофиламент. Две параллельные нити F-актина должны повернуться на 166 градусов, чтобы правильно лежать друг на друге. Это создает двойную спиральную структуру микрофиламентов цитоскелета. Микроволокна имеют диаметр примерно 7 нм, спираль повторяется каждые 37 нм. Каждая молекула актина связана с молекулой аденозинтрифосфата (АТФ) или аденозиндифосфата (АДФ), которая связана с катионом Mg 2+ . Наиболее часто встречающиеся формы актина по сравнению со всеми возможными комбинациями - это АТФ-G-актин и АДФ-F-актин. [28] [29]
G-актин
Изображения, полученные с помощью сканирующего электронного микроскопа, показывают, что G-актин имеет глобулярную структуру; однако рентгеновская кристаллография показывает, что каждая из этих глобул состоит из двух долей, разделенных щелью. Эта структура представляет собой «складку АТФазы», которая является центром ферментативного катализа, который связывает АТФ и Mg 2+ и гидролизует первый до АДФ плюс фосфат . Эта складка является консервативным структурным мотивом, который также встречается в других белках, которые взаимодействуют с трифосфатными нуклеотидами, такими как гексокиназа (фермент, используемый в энергетическом метаболизме ) или в белках Hsp70 (семейство белков, играющих важную роль в укладке белков). [30] G-актин функционирует только тогда, когда он содержит АДФ или АТФ в своей щели, но форма, связанная с АТФ, преобладает в клетках, когда актин присутствует в свободном состоянии. [28]
Рентгеновская кристаллография модель актина , что было произведено Kabsch из поперечно - полосатой мышечной ткани из кроликов является наиболее широко используется в структурных исследованиях , как это было первым , чтобы быть очищен . G-актин, кристаллизованный Кабшем, имеет размер приблизительно 67 x 40 x 37 Å , молекулярную массу 41 785 Да и расчетную изоэлектрическую точку 4,8. Его чистый заряд при pH = 7 составляет -7. [15] [31]
- Первичная структура
Эльзинга и его сотрудники впервые определили полную пептидную последовательность для этого типа актина в 1973 году, а более поздняя работа того же автора добавила дополнительные детали к модели. Он содержит 374 аминокислотных остатка. Его N-конец очень кислый и начинается с ацетилированного аспартата в его аминогруппе. В то время как его C-конец является щелочным и образован фенилаланином, которому предшествует цистеин , который имеет определенную степень функционального значения. Обе крайности находятся в непосредственной близости в пределах I-подобласти. Аномальный N τ -метилгистидин находится в положении 73. [31]
- Третичная структура - домены
Третичная структура образована двумя доменами , известных как большой и малый, которые отделены друг от друга расщелины вокруг местоположения связи с АТФ - АДФ + P я . Ниже находится более глубокая выемка, называемая «канавкой». В родном состоянии , несмотря на названия, оба имеют сопоставимую глубину. [15]
Обычное соглашение в топологических исследованиях означает, что белок показан с наибольшим доменом слева и наименьшим доменом справа. В этом положении меньший домен, в свою очередь, делится на два: субдомен I (нижнее положение, остатки 1–32, 70–144 и 338–374) и субдомен II (верхнее положение, остатки 33–69). Более крупный домен также делится на два: субдомен III (нижний, остатки 145–180 и 270–337) и субдомен IV (верхний, остатки 181–269). Открытые области субдоменов I и III называются "зазубренными" концами, тогда как открытые области доменов II и IV называются "заостренными" концами. Эта номенклатура относится к тому факту, что из-за небольшой массы субдомена Актин II полярен; важность этого будет обсуждаться ниже при обсуждении динамики сборки. Некоторые авторы называют субдомены Ia, Ib, IIa и IIb соответственно. [32]
- Другие важные сооружения
Наиболее примечательной супервторичной структурой является пятицепочечный бета-лист, который состоит из β-меандра и блока β-α-β по часовой стрелке. Он присутствует в обоих доменах, что позволяет предположить, что белок возник в результате дупликации гена. [16]
- Сайт связывания аденозиновых нуклеотидов расположен между двумя структурами в форме шпильки бета, относящимися к доменам I и III. Вовлеченные остатки представляют собой Asp11-Lys18 и Asp154-His161 соответственно.
- Сайт связывания двухвалентного катиона расположен чуть ниже, чем у аденозинового нуклеотида. In vivo он чаще всего образован Mg 2+ или Ca 2+, тогда как in vitro он образован хелатирующей структурой, состоящей из Lys18 и двух атомов кислорода из α- и β- фосфатов нуклеотидов . Этот кальций координирован с шестью молекулами воды, которые удерживаются аминокислотами Asp11 , Asp154 и Gln137 . Они образуют комплекс с нуклеотидом, который ограничивает движения так называемой «шарнирной» области, расположенной между остатками 137 и 144. Это поддерживает нативную форму белка до тех пор, пока его удаление не денатурирует мономер актина. Эта область также важна, потому что она определяет, находится ли расщелина белка в «открытой» или «закрытой» конформации. [1] [32]
- Весьма вероятно, что есть по крайней мере три других центра с меньшим сродством (промежуточное звено) и еще другие с низким сродством к двухвалентным катионам. Было высказано предположение, что эти центры могут играть роль в полимеризации актина, действуя на стадии активации. [32]
- В субдомене 2 есть структура, которая называется «D-петлей», потому что она связывается с ДНКазой I и расположена между остатками His40 и Gly48 . Он имеет вид неупорядоченного элемента в большинстве кристаллов, но он выглядит как β-лист, когда он находится в комплексе с ДНКазой I. Было высказано предположение, что ключевым событием полимеризации, вероятно, является распространение конформационных изменений из центр связи с нуклеотидом к этому домену, который изменяется от петли к спирали. [1] Однако эта гипотеза была опровергнута другими исследованиями. [33]
F-актин
Классическое описание F-актина утверждает, что он имеет нитевидную структуру, которую можно рассматривать как одноцепочечную левовращающую спираль с вращением на 166 ° вокруг спиральной оси и осевое перемещение 27,5 Å , или одноцепочечную правовращающую спираль с расстояние между кроссоверами 350–380 Å, с каждым актином, окруженным еще четырьмя. [34] Симметрия актинового полимера на уровне 2,17 субъединиц на оборот спирали несовместима с образованием кристаллов , что возможно только при симметрии точно в 2, 3, 4 или 6 субъединиц на оборот. Следовательно, необходимо построить модели , объясняющие эти аномалии, используя данные электронной микроскопии , криоэлектронной микроскопии , кристаллизации димеров в различных положениях и дифракции рентгеновских лучей . [21] [22] Следует отметить, что неправильно говорить о «структуре» молекулы, столь же динамичной, как актиновый филамент. На самом деле мы говорим о различных структурных состояниях, в которых измерение осевой трансляции остается постоянным на уровне 27,5 Å, в то время как данные о вращении субъединицы демонстрируют значительную изменчивость с обычно наблюдаемыми смещениями до 10% от ее оптимального положения. Некоторые белки, такие как кофилин, по- видимому, увеличивают угол поворота, но опять же это можно интерпретировать как установление различных структурных состояний. Они могут быть важны в процессе полимеризации. [35]
Меньшее согласие наблюдается в отношении измерений радиуса витка и толщины волокна: в то время как первые модели приписывали длину 25 Å, текущие данные дифракции рентгеновских лучей, подтвержденные криоэлектронной микроскопией, предполагают длину 23,7 Å. Эти исследования показали точные точки контакта между мономерами. Некоторые из них состоят из звеньев одной и той же цепи между «зазубренным» концом одного мономера и «заостренным» концом следующего. В то время как мономеры в соседних цепях образуют боковой контакт через выступы субдомена IV, причем наиболее важными выступами являются выступы, образованные С-концом и гидрофобной связью, образованной тремя телами, включающими остатки 39–42, 201–203 и 286. Это Модель предполагает, что филамент образован мономерами в виде «листовой» формации, в которой субдомены поворачиваются вокруг себя; эта форма также обнаруживается в бактериальном гомологе актина MreB . [21]
Считается, что полимер F-актина имеет структурную полярность из-за того, что все субъединицы микрофиламента указывают на один и тот же конец. Это приводит к соглашению об именах: конец, который содержит субъединицу актина, у которой открыт сайт связывания АТФ, называется «(-) концом», тогда как противоположный конец, где щель направлена на другой соседний мономер, называется « (+) конец ». [26] Термины «заостренный» и «зазубренный», относящиеся к двум концам микрофиламентов, происходят от их внешнего вида под просвечивающей электронной микроскопией, когда образцы исследуются в соответствии с техникой подготовки, называемой «украшение». Этот метод заключается в добавлении фрагментов миозина S1 к ткани, фиксированной дубильной кислотой . Этот миозин образует полярные связи с мономерами актина, создавая конфигурацию, которая выглядит как стрелы с оперением пера вдоль его стержня, где стержень - актин, а оперение - миозин. Следуя этой логике, конец микрофиламента, на котором нет выступающего миозина, называется острием стрелки (- конец), а другой конец - зазубренным концом (+ конец). [36] Фрагмент S1 состоит из головного и шейного доменов миозина II . В физиологических условиях G-актин ( мономерная форма) превращается в F-актин ( полимерная форма) под действием АТФ, где роль АТФ важна. [37]
Спиральная нить F-актина, обнаруженная в мышцах, также содержит молекулу тропомиозина , которая представляет собой белок длиной 40 нанометров , обернутый вокруг спирали F-актина. [22] Во время фазы покоя тропомиозин покрывает активные участки актина, так что взаимодействие актин-миозин не может иметь место и вызывать сокращение мышц. Есть и другие белковые молекулы , св занных с тропомиозин нити, эти тропонин , которые имеют три полимеров: тропонин I , тропонин Т и тропонин C . [38]
Складной
Актин может самопроизвольно приобретать большую часть своей третичной структуры . [40] Однако способ получения полностью функциональной формы из вновь синтезированной нативной формы является особенным и почти уникальным в химии белков. Причиной этого особого пути может быть необходимость избежать присутствия неправильно свернутых мономеров актина, которые могут быть токсичными, поскольку они могут действовать как неэффективные терминаторы полимеризации. Тем не менее, это ключ к установлению стабильности цитоскелета, и, кроме того, это важный процесс для координации клеточного цикла . [41] [42]
CCT требуется для обеспечения правильного складывания. CCT - это шаперонин группы II, большой белковый комплекс, который помогает в сворачивании других белков. CCT состоит из двойного кольца из восьми различных субъединиц (гетерооктамерных), и он отличается от шаперонинов группы I, таких как GroEL , который содержится в эубактериях и эукариотических органеллах, поскольку не требует, чтобы ко-шаперон действовал как крышка. над центральной каталитической полостью. Субстраты связываются с CCT через определенные домены. Первоначально считалось, что он связывается только с актином и тубулином , хотя недавние исследования иммунопреципитации показали, что он взаимодействует с большим количеством полипептидов , которые, возможно, действуют как субстраты . Он действует через АТФ-зависимые конформационные изменения, которые иногда требуют нескольких раундов высвобождения и катализа для завершения реакции. [43]
Чтобы успешно завершить свое сворачивание, и актин, и тубулин должны взаимодействовать с другим белком, называемым префолдин , который представляет собой гетерогексамерный комплекс (образованный шестью отдельными субъединицами), во взаимодействии, которое настолько специфично, что молекулы коэволюционировали вместе [ ссылка ] . Актин объединяется с префолдином, пока он все еще формируется, когда он составляет примерно 145 аминокислот , особенно на N-конце. [44]
Для актина или тубулина используются разные субъединицы распознавания, хотя есть некоторые совпадения. В актине субъединицы, которые связываются с префолдином, вероятно, представляют собой PFD3 и PFD4, которые связываются в двух местах: одно между остатками 60–79 и другое между остатками 170–198. Актин распознается, загружается и доставляется к цитозольному шаперонину (CCT) в открытой конформации внутренним концом «щупалец» префолдина (см. Изображение и примечание). [40] Контакт при доставке актина настолько краток, что не образуется третичный комплекс, сразу высвобождая префолдин. [39]
Затем CCT вызывает последовательное сворачивание актина, образуя связи с его субъединицами, а не просто заключая его в свою полость. [45] Вот почему он обладает специфическими участками узнавания в апикальном β-домене. Первый этап сворачивания состоит из распознавания остатков 245–249. Затем другие детерминанты устанавливают контакт. [46] И актин, и тубулин связываются с CCT в открытых конформациях в отсутствие АТФ. В случае актина две субъединицы связываются во время каждого конформационного изменения, тогда как в случае тубулина связывание происходит с четырьмя субъединицами. Актин имеет специфические связывающие последовательности, которые взаимодействуют с субъединицами δ и β-CCT или с δ-CCT и ε-CCT. После связывания AMP-PNP с CCT субстраты перемещаются в полости шаперонина. Также кажется, что в случае актина белок CAP необходим как возможный кофактор в конечных состояниях фолдинга актина. [42]
Точный способ, которым регулируется этот процесс, до сих пор полностью не изучен, но известно, что белок PhLP3 (белок, подобный фосдуцину ) ингибирует его активность за счет образования третичного комплекса. [43]
Каталитический механизм АТФазы
Актин - это АТФаза , что означает, что это фермент , гидролизующий АТФ. Эта группа ферментов отличается медленной скоростью реакции. Известно, что эта АТФаза «активна», то есть ее скорость увеличивается примерно в 40 000 раз, когда актин образует часть филамента. [35] Контрольное значение этой скорости гидролиза в идеальных условиях составляет около 0,3 с -1 . Затем P i остается связанным с актином рядом с ADP в течение долгого времени, пока он совместно не высвобождается из внутренней части филамента. [47] [48]
Точные молекулярные детали каталитического механизма до сих пор полностью не изучены. Хотя по этому поводу ведется много споров, очевидно, что для гидролиза АТФ требуется «закрытая» конформация, и считается, что остатки, которые участвуют в процессе, перемещаются на соответствующее расстояние. [35] глутаминовая кислота Glu137 является одним из ключевых остатков, который находится в подобласти 1. Его функция заключается в связывании молекулы воды , которая производит нуклеофильную атаку на γ-фосфат в АТФ связи , в то время как нуклеотид сильно связана с субдоменами 3 и 4. Медленность каталитического процесса обусловлена большим расстоянием и перекосом положения молекулы воды по отношению к реагенту. Весьма вероятно, что конформационные изменения, вызываемые вращением доменов между формами G и F актина, перемещают Glu137 ближе, обеспечивая его гидролиз. Эта модель предполагает, что полимеризация и функция АТФазы будут разделены сразу. [21] [22] Преобразование «открытое» в «закрытое» между формами G и F и его влияние на относительное движение нескольких ключевых остатков и образование водяных нитей были охарактеризованы в молекулярной динамике и моделировании QM / MM . [49] [50]
Генетика
Актин был одним из наиболее консервативных белков на протяжении всей эволюции, поскольку он взаимодействует с большим количеством других белков. Он имеет 80,2% -ную консервацию последовательности на уровне гена между Homo sapiens и Saccharomyces cerevisiae (разновидность дрожжей) и 95% -ную консервацию первичной структуры белкового продукта. [4]
Хотя у большинства дрожжей есть только один ген актина, высшие эукариоты , как правило, экспрессируют несколько изоформ актина, кодируемых семейством родственных генов. У млекопитающих есть по крайней мере шесть изоформ актина, кодируемых отдельными генами [51], которые делятся на три класса (альфа, бета и гамма) в соответствии с их изоэлектрическими точками . Как правило, альфа-актины обнаруживаются в мышцах (α-скелет, α-гладкая аорта, α-сердечная), тогда как бета- и гамма-изоформы заметны в немышечных клетках (β-цитоплазматические, γ1-цитоплазматические, γ2-кишечные гладкие). . Хотя аминокислотные последовательности и свойства изоформ in vitro очень похожи, эти изоформы не могут полностью заменять друг друга in vivo . [52]
Типичный ген актина имеет приблизительно 100-нуклеотидную 5'-UTR , 1200-нуклеотидную транслируемую область и 200-нуклеотидную 3'-UTR . Большинство генов актина прерваны интронами , до шести интронов в любом из 19 хорошо охарактеризованных мест. Высокая сохранность семейства делает актин предпочтительной моделью для исследований, сравнивающих интрон-раннюю и интрон-позднюю модели эволюции интрона.
Все несферические прокариоты, по- видимому, обладают такими генами, как MreB , которые кодируют гомологи актина; эти гены необходимы для сохранения формы клетки. Плазмиду -derived ген кодирует PARM актина-подобный белок, полимеризует форма динамически неустойчив , и , как представляется , разделить плазмидную ДНК в свои дочерние клетки при делении клеток по механизму , аналогичным способу, применяемых микротрубочками в эукариотическом митозе . [53] Актин содержится как в гладкой, так и в шероховатой эндоплазматической сети.
Динамика сборки
Зарождение зародышей и полимеризация
Факторы зародышеобразования необходимы для стимуляции полимеризации актина. Одним из таких факторов зародышеобразования является комплекс Arp2 / 3 , который имитирует димер G-актина, чтобы стимулировать зародышеобразование (или образование первого тримера) мономерного G-актина. Комплекс Arp2 / 3 связывается с актиновых филаментов на 70 градусов , чтобы сформировать новые актиновые ветви с существующей актиновых филаментов. Arp2 / 3-опосредованная нуклеация необходима для направленной миграции клеток. [54] Кроме того, актиновые филаменты сами связывают АТФ, и гидролиз этого АТФ стимулирует дестабилизацию полимера.
Рост актиновых филаментов может регулироваться тимозином и профилином . Тимозин связывается с G-актином, чтобы буферизовать процесс полимеризации, в то время как профилин связывается с G-актином, чтобы обменивать АДФ на АТФ , способствуя присоединению мономера к зазубренным плюс концам филаментов F-актина.
F-актин одновременно силен и динамичен. В отличие от других полимеров , таких как ДНК , составляющие элементы которой связаны ковалентными связями , мономеры актиновых филаментов собираются более слабыми связями. [55] Боковые связи с соседними мономерами разрешают эту аномалию, которая теоретически должна ослабить структуру, поскольку они могут быть разрушены при тепловом перемешивании. Кроме того, слабые связи дают то преимущество, что концы волокон могут легко высвобождать или включать мономеры. Это означает, что филаменты могут быстро перестраиваться и изменять клеточную структуру в ответ на раздражитель окружающей среды. Что, наряду с биохимическим механизмом, с помощью которого это происходит, известно как «динамика сборки». [6]
- В пробирке исследования
Исследования, посвященные накоплению и потере субъединиц микрофиламентами, проводятся in vitro (то есть в лаборатории, а не в клеточных системах), поскольку в результате полимеризации образующегося актина образуется тот же F-актин, который продуцируется in vivo . Процесс in vivo контролируется множеством белков, чтобы заставить его реагировать на потребности клеток, что затрудняет соблюдение его основных условий. [56]
Производство in vitro происходит последовательно: сначала идет «фаза активации», когда связывание и обмен двухвалентных катионов происходит в определенных местах на G-актине, который связан с АТФ. Это вызывает конформационное изменение, иногда называемое мономером G * -актина или F-актина, поскольку оно очень похоже на единицы, расположенные на филаменте. [32] Это подготавливает его к «фазе зародышеобразования», в которой G-актин дает начало небольшим нестабильным фрагментам F-актина, которые способны полимеризоваться. Первоначально образуются нестабильные димеры и тримеры. «Фаза удлинения» начинается, когда имеется достаточно большое количество этих коротких полимеров. В этой фазе филамент формируется и быстро растет за счет обратимого добавления новых мономеров на обоих крайних участках. [57] Наконец, стационарное равновесие достигается, когда мономеры G-актина обмениваются на обоих концах микрофиламента без какого-либо изменения его общей длины. [24] На этой последней фазе «критическая концентрация C c » определяется как отношение между константой сборки и константой диссоциации для G-актина, где динамика добавления и удаления димеров и тримеров не приводит к изменению длина микрофиламента. В условиях in vitro C c составляет 0,1 мкМ [58], что означает, что при более высоких значениях происходит полимеризация, а при более низких значениях - деполимеризация. [59]
- Роль гидролиза АТФ
Как указано выше, хотя актин гидролизует АТФ, все указывает на тот факт, что АТФ не требуется для сборки актина, учитывая, что, с одной стороны, гидролиз в основном происходит внутри филамента, а с другой стороны, АДФ также может вызвать полимеризацию. Это ставит вопрос о том, какой термодинамически неблагоприятный процесс требует таких огромных затрат энергии . Цикл актина, который связывает гидролиз АТФ с полимеризацией актина, состоит из предпочтительного добавления мономеров G-актин-АТФ к зазубренному концу филамента и одновременной разборки мономеров F-актин-АДФ на заостренном конце, где впоследствии находится АДФ. превратился в АТФ, тем самым замкнув цикл. Этот аспект образования актиновых филаментов известен как «беговая дорожка».
АТФ относительно быстро гидролизуется сразу после добавления мономера G-актина к филаменту. Есть две гипотезы относительно того, как это происходит; стохастическая , который предполагает , что гидролиз случайным образом происходит таким способом , который каким - либо образом под влиянием соседних молекул; и векторный, который предполагает, что гидролиз происходит только рядом с другими молекулами, АТФ которых уже гидролизован. В любом случае результирующий P i не высвобождается; он остается в течение некоторого времени нековалентно связанным с АДФ актина. Таким образом, в филаменте есть три вида актина: АТФ-актин, АДФ + Р i -актин и АДФ-актин. [47] [60] Количество каждого из этих видов, присутствующих в филаменте, зависит от его длины и состояния: когда начинается удлинение, филамент имеет примерно равное количество актиновых мономеров, связанных с АТФ и АДФ + P i, и небольшое количество АДФ-актина на (-) конце. Когда достигается стационарное состояние, ситуация меняется на противоположную: АДФ присутствует вдоль большей части филамента и только в области, ближайшей к (+) концу, содержащей АДФ + Р i, а АТФ присутствует только на конце. [61]
Если мы сравним филаменты, которые содержат только АДФ-актин, с филаментами, содержащими АТФ, в первом случае критические константы одинаковы на обоих концах, в то время как C c для двух других нуклеотидов отличается: на (+) конце Cc + = 0,1 мкМ, а на (-) конце Cc - = 0,8 мкМ, что приводит к следующим ситуациям: [26]
- При концентрациях G-актин-АТФ ниже Cc + удлинение нити не происходит.
- Для концентраций G-актин-АТФ меньше, чем Cc -, но больше, чем Cc +, элонгация происходит на (+) конце.
- Для концентрации G-актин-АТФ больше , чем Cc - микрофиламенты растут на обоих концах.
Следовательно, можно сделать вывод, что энергия, производимая гидролизом, используется для создания истинного «стационарного состояния», то есть потока, вместо простого равновесия, которое является динамическим, полярным и прикрепленным к нити. Это оправдывает затраты энергии, так как способствует важным биологическим функциям. [47] Кроме того, конфигурация различных типов мономеров определяется актин-связывающими белками, которые также контролируют этот динамизм, как будет описано в следующем разделе.
Было обнаружено, что образование микрофиламентов при беговой дорожке нетипично для стереоцилий . В этом случае контроль размера структуры полностью апикальный и каким-то образом контролируется экспрессией генов, то есть общим количеством белкового мономера, синтезируемого в любой данный момент. [62]
Связанные белки
Актиновый цитоскелет in vivo состоит не только из актина, для его образования, поддержания и функционирования необходимы другие белки. Эти белки называются актин-связывающими белками (ABP), и они участвуют в полимеризации актина, деполимеризации, стабильности, организации в пучки или сети, фрагментации и разрушении. [24] Разнообразие этих белков таково, что актин считается белком, который принимает участие в наибольшем количестве белок-белковых взаимодействий . [64] Например, существуют секвестрирующие G-актин элементы, которые препятствуют его включению в микрофиламенты. Есть также белки, которые стимулируют его полимеризацию или усложняют синтезирующие сети. [26]
- Тимозин β-4 представляет собой белок 5 кДа, который может связываться с G-актин-АТФ в стехиометрии 1: 1 ; Это означает, что одна единица тимозина β-4 связывается с одной единицей G-актина. Его роль состоит в том, чтобы препятствовать включению мономеров в растущий полимер. [65]
- Профилин представляет собой цитозольный белок с молекулярной массой 15 кДа, который также связывается с G-актин-АТФ или -АДФ со стехиометрией 1: 1, но он выполняет другую функцию, поскольку способствует замене нуклеотидов АДФ на АТФ. . Он также участвует в других клеточных функциях, таких как связывание повторов пролина в других белках или липидов, которые действуют как вторичные мессенджеры . [66] [67]
Другие белки, которые связываются с актином, регулируют длину микрофиламентов, разрезая их, что дает начало новым активным концам для полимеризации. Например, если двухконечную микрофиламент разрезать дважды, получится три новых микрофиламента с шестью концами. Эта новая ситуация способствует динамике сборки и разборки. Наиболее заметными из этих белков являются гельсолин и кофилин . Эти белки сначала достигают разреза путем связывания с мономером актина, находящимся в полимере, затем они изменяют конформацию мономера актина, оставаясь связанными с вновь образованным (+) концом. Это препятствует добавлению или обмену новых субъединиц G-актина. Деполимеризация приветствуется, поскольку (-) концы не связаны с какой-либо другой молекулой. [70]
Другие белки, которые связываются с актином, покрывают концы F-актина, чтобы стабилизировать их, но они не могут их разрушить. Примерами этого типа белка являются CapZ , который связывает (+) концы в зависимости от уровня Ca 2+ / кальмодулина в клетке . Эти уровни зависят от внутренних и внешних сигналов клетки и участвуют в регуляции ее биологических функций). [71] Другой пример - тропомодулин (связывающийся с (-) концом). Тропомодулин в основном действует для стабилизации F-актина, присутствующего в миофибриллах, присутствующих в мышечных саркомерах , структурах, характеризующихся большой стабильностью. [72]
Комплекс Arp2 / 3 широко встречаются во всех эукариотических организмах. [74] Он состоит из семи субъединиц, некоторые из которых обладают топологией, которая явно связана с их биологической функцией: две субъединицы, ARP2 и ARP3, имеют структуру, аналогичную структуре мономеров актина. Эта гомология позволяет обеим единицам действовать как агенты зародышеобразования при полимеризации G-актина и F-актина. Этот комплекс также необходим в более сложных процессах, таких как создание дендритных структур, а также при анастомозе (повторное соединение двух ветвящихся структур, которые были ранее соединены, например, в кровеносных сосудах). [75]
Химические ингибиторы
Существует ряд токсинов, которые влияют на динамику актина, предотвращая его полимеризацию ( латрункулин и цитохалазин D ) или стабилизируя его ( фаллоидин ):
- Латрункулин - это токсин, вырабатываемый губками . Он связывается с G-актином, предотвращая его связывание с микрофиламентами. [76]
- Цитохалазин D - это алкалоид, продуцируемый грибами , который связывается с (+) концом F-актина, предотвращая добавление новых мономеров. [77] Было обнаружено, что цитохалазин D нарушает динамику актина, активируя белок p53 у животных. [78]
- Фаллоидин - это токсин, который был выделен из грибка «смертельная шапка» Amanita phalloides . Он связывается с поверхностью раздела между соседними мономерами актина в полимере F-актина, предотвращая его деполимеризацию. [77]
Функции и расположение
Актин образует филаменты («F-актин» или микрофиламенты ) - важные элементы цитоскелета эукариот , способные претерпевать очень быструю динамику полимеризации и деполимеризации. В большинстве клеток актиновые филаменты образуют крупномасштабные сети, которые необходимы для многих ключевых функций клетки: [79]
- Различные типы актиновых сетей (состоящие из актиновых нитей) обеспечивают механическую поддержку клеткам и обеспечивают маршруты транспортировки через цитоплазму, чтобы способствовать передаче сигнала.
- Быстрая сборка и разборка актиновой сети позволяет клеткам мигрировать ( миграция клеток ).
- В мышечных клетках многоклеточных животных быть каркасом, на котором белки миозина генерируют силу для поддержки сокращения мышц.
- В немышечных клетках - путь для грузовых транспортных миозинов (нетрадиционных миозинов), таких как миозин V и VI. Нетрадиционные миозины используют гидролиз АТФ для транспортировки грузов, таких как везикулы и органеллы, направленным образом, намного быстрее, чем диффузия. Миозин V идет к зазубренному концу актиновых волокон, а миозин VI идет к заостренному концу. Большинство актиновых филаментов расположены зазубренным концом в направлении клеточной мембраны, а заостренным концом - внутрь клетки. Такое расположение позволяет миозину V быть эффективным двигателем для экспорта грузов, а миозину VI - эффективным двигателем для импорта.
Белок актин находится как в цитоплазме, так и в ядре клетки . [80] Его расположение регулируется путями передачи сигнала клеточной мембраны, которые интегрируют стимулы, которые клетка получает, стимулируя реструктуризацию актиновых сетей в ответ. У Dictyostelium было обнаружено , что фосфолипаза D вмешивается в инозитолфосфатные пути. [81] Актиновые нити особенно стабильны и многочисленны в мышечных волокнах . В саркомере (основная морфологическая и физиологическая единица мышечных волокон) актин присутствует как в I, так и в A-полосах; миозин также присутствует в последнем. [82]
Цитоскелет
Микрофиламенты участвуют в движении всех мобильных клеток, включая немышечные типы [83] [84], и лекарства, которые нарушают организацию F-актина (например, цитохалазины ), влияют на активность этих клеток. Актин составляет 2% от общего количества белков в гепатоцитах , 10% в фибробластах , 15% в амебах и до 50–80% в активированных тромбоцитах . [85] Существует ряд различных типов актина с немного разными структурами и функциями. Это означает, что α-актин находится исключительно в мышечных волокнах , тогда как типы β и γ обнаруживаются в других клетках. Кроме того, поскольку последние типы имеют высокую текучесть кадров, большинство из них находится за пределами постоянных построек. Это означает, что микрофиламенты, обнаруженные в клетках, отличных от мышечных, представлены в трех формах: [86]
- Микрофиламентных сети - клетки животных обычно имеют корку клеток под клеточной мембраной , которая содержит большое количество микрофиламентов, что исключает наличие органелл . Эта сеть связана с многочисленными рецепторными клетками, которые передают сигналы за пределы клетки.
- Пучки микрофиламентов - эти чрезвычайно длинные микрофиламенты расположены в сетях и, в сочетании с сократительными белками, такими как немышечный миозин , они участвуют в перемещении веществ на внутриклеточном уровне.
- Периодические актиновые кольца. Недавно было обнаружено, что периодическая структура, состоящая из равномерно расположенных актиновых колец, специфически существует в аксонах (не в дендритах ). [87] В этой структуре кольца актина вместе с тетрамерами спектрина, которые связывают соседние кольца актина, образуют сплоченный цитоскелет, который поддерживает мембрану аксона. Периодичность структуры может также регулировать каналы ионов натрия в аксонах.
Дрожжи
Цитоскелет актина играет ключевую роль в процессах эндоцитоза , цитокинеза , определения полярности клеток и морфогенеза у дрожжей . Помимо опоры на актин, в эти процессы вовлечены 20 или 30 ассоциированных белков, которые все обладают высокой степенью эволюционной консервативности, наряду со многими сигнальными молекулами. Вместе эти элементы обеспечивают пространственно и временно модулированную сборку, которая определяет реакцию клетки как на внутренние, так и на внешние раздражители. [88]
Дрожжи содержат три основных элемента, связанных с актином: пятна, кабели и кольца, которые, несмотря на то, что не присутствуют в течение длительного времени, находятся в состоянии динамического равновесия из-за непрерывной полимеризации и деполимеризации. Они обладают рядом дополнительных белков, включая ADF / кофилин, который имеет молекулярную массу 16 кДа и кодируется одним геном, называемым COF1 ; Aip1, кофактор кофилина, который способствует разборке микрофиламентов; Srv2 / CAP, регулятор процесса, связанный с белками аденилатциклазы ; профилин с молекулярной массой приблизительно 14 кДа, родственный / связанный с мономерами актина; и твинфилин, белок 40 кДа, участвующий в организации пятен. [88]
Растения
Исследования генома растений выявили существование изовариантов белков в семействе генов актина. Внутри Arabidopsis thaliana , двудольного растения, используемого в качестве модельного организма , существует десять типов актина, девять типов α-тубулинов, шесть β-тубулинов, шесть профилинов и десятки миозинов. Это разнообразие объясняется эволюционной необходимостью обладать вариантами, немного различающимися по своему временному и пространственному выражению. [4] Большинство этих белков совместно экспрессировались в анализируемой ткани . Актиновые сети распределены по цитоплазме клеток, культивированных in vitro . Существует концентрация сети вокруг ядра, которая соединена спицами с клеточной корой, эта сеть очень динамична, с непрерывной полимеризацией и деполимеризацией. [89]
Несмотря на то, что у большинства растительных клеток есть клеточная стенка, которая определяет их морфологию и препятствует их движению, их микрофиламенты могут генерировать достаточную силу для достижения ряда клеточных действий, таких как цитоплазматические токи, генерируемые микрофиламентами и миозином. Актин также участвует в движении органелл и клеточном морфогенезе, который включает деление клеток, а также удлинение и дифференцировку клетки. [91]
Наиболее известные белки, связанные с актиновым цитоскелетом у растений, включают: [91] виллин , который принадлежит к тому же семейству, что и гельсолин / северин, и способен разрезать микрофиламенты и связывать мономеры актина в присутствии катионов кальция; фимбрин , который способен распознавать и объединять мономеры актина и который участвует в образовании сетей (посредством процесса регуляции, отличного от такового у животных и дрожжей); [92] формины , которые способны действовать как зародышеобразователь полимеризации F-актина; миозин , типичный молекулярный мотор, который специфичен для эукариот и который у Arabidopsis thaliana кодируется 17 генами двух различных классов; CHUP1, который может связывать актин и участвует в пространственном распределении хлоропластов в клетке; KAM1 / MUR3, которые определяют морфологию аппарата Гольджи, а также состав ксилоглюканов в клеточной стенке; NtWLIM1, который способствует появлению актиновых клеточных структур; и ERD10, который участвует в ассоциации органелл внутри мембран и микрофиламентов и, по-видимому, играет роль, которая участвует в реакции организма на стресс .
Ядерный актин
Ядерный актин был впервые замечен и описан в 1977 году Кларком и Мерриамом. [93] Авторы описывают белок, присутствующий в ядерной фракции, полученной из ооцитов Xenopus laevis , который проявляет те же свойства, что и актин скелетных мышц. С того времени появилось множество научных отчетов о структуре и функциях актина в ядре (см. Обзор: Hofmann 2009. [94] ). Контролируемый уровень актина в ядре, его взаимодействие с актин-связывающими белками (ABP). а присутствие различных изоформ позволяет актину играть важную роль во многих важных ядерных процессах. [95]
Транспорт актина через ядерную мембрану
Последовательность актина не содержит сигнала ядерной локализации. Небольшой размер актина (около 43 кДа) позволяет ему проникать в ядро путем пассивной диффузии. [96] Однако актин перемещается между цитоплазмой и ядром довольно быстро, что указывает на наличие активного транспорта. Импорту актина в ядро (вероятно, в комплексе с кофилином) способствует импортируемый белок импортин 9. [97]
Низкий уровень актина в ядре кажется очень важным, потому что актин имеет два сигнала экспорта из ядра (NES) в своей последовательности. Микроинъектированный актин быстро выводится из ядра в цитоплазму. Актин экспортируется, по крайней мере, двумя способами: через экспорт 1 (EXP1) и экспорт 6 (Exp6). [98] [99]
Конкретные модификации, такие как SUMOylation, позволяют удерживать ядерный актин. Было продемонстрировано, что мутация, предотвращающая SUMOylation, вызывает быстрый экспорт бета-актина из ядра. [100]
На основании экспериментальных результатов можно предложить общий механизм ядерного транспорта актина: [100] [101]
- В цитоплазме кофилин связывает мономеры АДФ-актина. Этот комплекс активно импортируется в ядро.
- Более высокая концентрация АТФ в ядре (по сравнению с цитоплазмой) способствует обмену АДФ на АТФ в комплексе актин-кофилин. Это ослабляет силу связывания этих двух белков.
- Комплекс кофилин-актин окончательно диссоциирует после фосфорилирования кофилина ядерной киназой LIM.
- Актин СУМОилирован и в этой форме сохраняется внутри ядра.
- Актин может образовывать комплексы с профилином и покидать ядро через экспортин 6.
Организация ядерного актина
Ядерный актин существует в основном в виде мономера, но также может образовывать динамические олигомеры и короткие полимеры. [102] [103] [104] Ядерная организация актина варьируется в разных типах клеток. Например, в ооцитах Xenopus (с более высоким уровнем ядерного актина по сравнению с соматическими клетками) актин образует филаменты, которые стабилизируют архитектуру ядра. Эти нити можно наблюдать под микроскопом благодаря окрашиванию фаллоидином, конъюгированным с флуорофором. [93] [96]
Однако в ядрах соматических клеток актиновые филаменты нельзя наблюдать с помощью этой техники. [105] Анализ ингибирования ДНКазы I, пока единственный тест, позволяющий количественно определять полимеризованный актин непосредственно в биологических образцах, показал, что эндогенный ядерный актин действительно существует в основном в мономерной форме. [104]
Точно контролируемый уровень актина в ядре клетки, более низкий, чем в цитоплазме, предотвращает образование нитей. Полимеризация также снижается из-за ограниченного доступа к мономерам актина, которые связаны в комплексы с ABP, в основном с кофилином. [101]
Изоформы актина в ядре клетки
Изоформам актина уделяется мало внимания; однако было показано, что в ядре клетки присутствуют разные изоформы актина. Изоформы актина, несмотря на большое сходство последовательностей, обладают разными биохимическими свойствами, такими как кинетика полимеризации и деполимеризации. [106] Они также показывают различную локализацию и функции.
Уровень изоформ актина как в цитоплазме, так и в ядре может изменяться, например, в ответ на стимуляцию роста клеток или остановку пролиферации и транскрипционной активности. [107]
Исследования ядерного актина обычно сосредоточены на бета-изоформе. [108] [109] [110] [111] Однако использование антител, направленных против различных изоформ актина, позволяет идентифицировать не только цитоплазматический бета в ядре клетки, но также:
- гамма-актин в ядрах клеток меланомы человека, [104]
- альфа-актин скелетных мышц в ядрах миобластов мыши, [112]
- цитоплазматический гамма-актин, а также альфа-актин гладких мышц в ядре фибробласта эмбриональной мыши [113]
Присутствие различных изоформ актина может существенно влиять на его функцию в ядерных процессах, особенно потому, что уровень отдельных изоформ можно контролировать независимо. [104]
Ядерные функции актина
Функции актина в ядре связаны с его способностью к полимеризации и взаимодействию с различными ABP и структурными элементами ядра. Ядерный актин участвует в:
- Архитектура ядра. Взаимодействие актина с альфа II-спектрином и другими белками важно для поддержания правильной формы ядра. [114] [115]
- Транскрипция - Актин участвует в реорганизации хроматина, инициации транскрипции [80] [108] [116] [117] и взаимодействии с комплексом транскрипции. [118] Актин участвует в регуляции структуры хроматина, [119] [120] [121] взаимодействуя с РНК-полимеразой I, [111] II [109] и III. [110] При транскрипции Pol I актин и миозин ( MYO1C , который связывает ДНК) действуют как молекулярный двигатель . Для транскрипции Pol II β-актин необходим для образования преинициативного комплекса. Pol III содержит β-актин в качестве субъединицы. Актин также может быть компонентом комплексов ремоделирования хроматина, а также частиц пре-мРНП (т. Е. Предшественников матричной РНК, связанной с белками), и участвует в ядерном экспорте РНК и белков. [122]
- Регуляция активности генов - Актин связывается с регуляторными областями различных типов генов. [123] [124] [125] [126] Способность актина регулировать активность генов используется в методе молекулярного репрограммирования, который позволяет дифференцированным клеткам возвращаться в их эмбриональное состояние. [125] [127]
- Транслокация активированного фрагмента хромосомы из-под мембраны в эухроматин, где начинается транскрипция. Это движение требует взаимодействия актина и миозина. [128] [129]
- Интеграция разных клеточных компартментов . Актин - это молекула, которая объединяет пути передачи цитоплазматических и ядерных сигналов. [130] Примером может служить активация транскрипции в ответ на сывороточную стимуляцию клеток in vitro . [131] [132] [133]
- Иммунный ответ - ядерный актин полимеризуется при стимуляции Т-клеточного рецептора и необходим для экспрессии цитокинов и продукции антител in vivo . [134]
Благодаря своей способности претерпевать конформационные изменения и взаимодействовать со многими белками, актин действует как регулятор образования и активности белковых комплексов, таких как транскрипционный комплекс. [118]
Сокращение мышц
Очертание мышечного сокращения
В мышечных клетках миофибриллы актомиозина составляют большую часть цитоплазматического материала. Эти миофибриллы состоят из тонких нитей актина (обычно диаметром около 7 нм) и толстых нитей моторного белка миозина (обычно диаметром около 15 нм). [135] Эти миофибриллы используют энергию АТФ для создания движений клеток, таких как сокращение мышц . [135] Используя гидролиз АТФ для получения энергии, миозиновые головки проходят цикл, в течение которого они прикрепляются к тонким нитям, создают напряжение, а затем, в зависимости от нагрузки, выполняют силовой удар, который заставляет тонкие волокна скользить мимо, укорачивая мышца.
В сократительных пучках связывающий актин белок альфа- актинин разделяет каждую тонкую нить на ≈35 нм. Это увеличение расстояния позволяет толстым нитям вставляться между ними и взаимодействовать, обеспечивая деформацию или сжатие. При деформации один конец миозина связан с плазматической мембраной , в то время как другой конец «идет» к положительному концу актиновой нити. Это придает мембране форму, отличную от формы коры клетки . Для сокращения молекула миозина обычно связана с двумя отдельными филаментами, и оба конца одновременно «идут» к плюсовому концу своей филамента, сдвигая актиновые филаменты ближе друг к другу. Это приводит к укорачиванию или сокращению актинового пучка (но не филамента). Этот механизм отвечает за сокращение мышц и цитокинез - деление одной клетки на две.
Роль актина в сокращении мышц
Спиральная нить F-актина, обнаруженная в мышцах, также содержит молекулу тропомиозина , 40- нанометровый белок, который обернут вокруг спирали F-актина. Во время фазы покоя тропомиозин покрывает активные участки актина, так что взаимодействие актин-миозин не может происходить и вызывать мышечное сокращение (взаимодействие вызывает движение между двумя белками, которое, поскольку оно повторяется много раз, вызывает сокращение) . Есть и другие белковые молекулы , св занных с тропомиозином нити, они включают тропонин , которые имеют три полимеров: тропонин I , тропонин Т и тропонин C . [38] Регуляторная функция тропомиозина зависит от его взаимодействия с тропонином в присутствии ионов Са 2+ . [136]
И актин, и миозин участвуют в сокращении и расслаблении мышц и составляют 90% мышечного белка. [137] Общий процесс инициируется внешним сигналом, обычно через потенциал действия, стимулирующий мышцу, которая содержит специализированные клетки, внутренняя часть которых богата актиновыми и миозиновыми филаментами. Цикл сокращения-расслабления состоит из следующих этапов: [82]
- Деполяризация сарколеммы и передача потенциала действия через Т-канальцы .
- Открытие саркоплазматического ретикулума «ы Ca 2+ каналов.
- Увеличение цитозольных Ca 2+ концентрации и взаимодействие этих катионов с тропониным вызывая конформационные изменения в его структуре . Это, в свою очередь, изменяет структуру тропомиозина, который покрывает активный центр актина, позволяя формировать перекрестные связи миозин-актин (последние представлены в виде тонких нитей). [38]
- Движение миозиновых головок по тонким филаментам может происходить либо с участием АТФ, либо независимо от АТФ. Первый механизм, опосредованный активностью АТФазы в головках миозина, вызывает движение актиновых филаментов к Z-диску .
- Захват Ca 2+ саркоплазматической сетью, вызывая новое конформационное изменение тропомиозина, которое ингибирует взаимодействие актин-миозин. [137]
Другие биологические процессы
Традиционный образ функции актина связывает его с поддержанием цитоскелета и, следовательно, с организацией и движением органелл, а также с определением формы клетки. [86] Однако актин играет более широкую роль в физиологии эукариотических клеток, помимо аналогичных функций у прокариот .
- Цитокинез . Деление клеток животных и дрожжей обычно включает разделение родительской клетки на две дочерние клетки посредством сужения центральной окружности. В этом процессе участвует сжимающееся кольцо, состоящее из актина, миозина и α-актинина . [138] У делящихся дрожжей Schizosaccharomyces pombe актин активно образуется в сужающем кольце с участием Arp3 , формина Cdc12, профилина и WASp , а также предварительно сформированных микрофиламентов. Как только кольцо построено, структура поддерживается за счет непрерывной сборки и разборки, которая при помощи комплекса Arp2 / 3 и форминов является ключом к одному из центральных процессов цитокинеза. [139] Совокупность сократительного кольца, веретенообразного аппарата , микротрубочек и плотного периферического материала называется «телом Флеминга» или «промежуточным телом». [86]
- Апоптоз . Во время запрограммированной гибели клеток семейство протеаз ICE / ced-3 (одна из протеаз-конвертеров интерлейкин-1β) расщепляет актин на два фрагмента in vivo ; один из фрагментов имеет вес 15 кДа, а другой - 31 кДа. Это представляет собой один из механизмов, участвующих в разрушении жизнеспособности клеток, лежащих в основе апоптоза. [140] Также было показано, что протеаза кальпаин участвует в этом типе разрушения клеток; [141], так же как было показано, что использование ингибиторов кальпаина снижает протеолиз актина и деградацию ДНК (еще один из характерных элементов апоптоза). [142] С другой стороны, вызванный стрессом запуск апоптоза вызывает реорганизацию актинового цитоскелета (которая также включает его полимеризацию), приводя к образованию структур, называемых стрессовыми волокнами ; это активируется киназным путем MAP . [143]
- Клеточная адгезия и развитие . Адгезия между клетками - это характеристика многоклеточных организмов, которая делает возможной специализацию тканей и, следовательно, увеличивает сложность клеток. Адгезия клеточного эпителия включает актиновый цитоскелет в каждой из соединенных клеток, а также кадгерины, действующие как внеклеточные элементы, причем связь между ними опосредуется катенинами . [144] Вмешательство в динамику актина имеет последствия для развития организма, на самом деле актин является настолько важным элементом, что доступны системы избыточных генов . Например, если у Dictyostelium был удален ген α-актинина или фактора гелеобразования, у индивидов Dictyostelium не наблюдается аномального фенотипа, возможно, из-за того, что каждый из белков может выполнять функцию другого. Однако это влияет на развитие двойных мутаций , в которых отсутствуют оба типа генов. [145]
- Модуляция экспрессии генов . Состояние полимеризации актина влияет на характер экспрессии генов . В 1997 году было обнаружено, что опосредованная цитокалазином D деполимеризация в шванновских клетках вызывает специфический паттерн экспрессии генов, участвующих в миелинизации нервных клеток этого типа . [146] Было показано, что F-актин модифицирует транскриптом на некоторых стадиях жизни одноклеточных организмов, таких как гриб Candida albicans . [147] Кроме того, белки, подобные актину, играют регулирующую роль во время сперматогенеза у мышей [148], а у дрожжей актин-подобные белки, как полагают, играют роль в регуляции экспрессии генов . [149] Фактически, актин способен действовать как инициатор транскрипции, когда он реагирует с ядерным миозином, который взаимодействует с РНК-полимеразами и другими ферментами, участвующими в процессе транскрипции. [80]
- Динамика стереоцилий . Некоторые клетки развиваются мелкие filliform выростов на их поверхности , которые имеют механосенсорную функцию. Например, этот тип органелл присутствует в кортиевом органе , который расположен в ухе . Основная характеристика этих конструкций - возможность изменения их длины. [150] Молекулярная архитектура стереоцилий включает паракристаллическое актиновое ядро, находящееся в динамическом равновесии с мономерами, присутствующими в соседнем цитозоле. Миозины типа VI и VIIa присутствуют по всему ядру, тогда как миозин XVa присутствует в его конечностях в количествах, пропорциональных длине стереоцилий. [151]
- Внутренняя хиральность . Актомиозиновые сети участвуют в создании внутренней хиральности в индивидуальных клетках. [152] Клетки, выросшие на хиральных поверхностях, могут демонстрировать направленное смещение влево / вправо, которое зависит от актомиозина. [153] [154]
Молекулярная патология
Большинство млекопитающих обладают шестью различными генами актина . Из них два кода для цитоскелета ( ACTB и ACTG1 ) , а остальные четыре участвует в скелетной поперечнополосатой мышце ( ACTA1 ), гладкая мышечная ткань ( ACTA2 ), кишечные мышцы ( ACTG2 ) и сердечной мышце ( ACTC1 ). Актин цитоскелета участвует в патогенетических механизмах многих инфекционных агентов , включая ВИЧ . Подавляющее большинство мутаций , влияющих на актин, являются точечными мутациями, которые имеют доминирующий эффект , за исключением шести мутаций, связанных с миопатией немалина . Это связано с тем, что во многих случаях мутант мономера актина действует как «кэп», предотвращая удлинение F-актина. [32]
Патология, связанная с ACTA1
ACTA1 - это ген, кодирующий α- изоформу актина, преобладающую в скелетно-полосатых мышцах человека , хотя он также экспрессируется в сердечной мышце и щитовидной железе . [155] Его последовательность ДНК состоит из семи экзонов, которые производят пять известных транскриптов . [156] Большинство из них состоят из точечных мутаций, вызывающих замену аминокислот . Мутации во многих случаях связаны с фенотипом, который определяет тяжесть и течение болезни. [32] [156]
Мутация изменяет структуру и функцию скелетных мышц, вызывая одну из трех форм миопатии : немалиновую миопатию 3 типа , врожденную миопатию с избытком тонких миофиламентов (CM) и врожденную миопатию с диспропорцией типов волокон (CMFTD). Также были обнаружены мутации, вызывающие сердечные миопатии . [158] Хотя их фенотипы схожи, в дополнение к типичной немалиновой миопатии некоторые специалисты выделяют другой тип миопатии, называемый актинической немалиновой миопатией. В первом случае вместо обычных палочек образуются скопления актина. Важно отметить, что пациент может показать более одного из этих фенотипов при биопсии . [159] Наиболее распространенные симптомы состоят из типичной морфологии лица (миопатии фаций ), мышечной слабости, задержки в развитии двигательной и дыхательной трудности. Течение болезни, ее тяжесть и возраст, в котором она проявляется, являются вариабельными, также обнаруживаются частично совпадающие формы миопатии. Симптомом немалиновой миопатии является то, что «немалиновые стержни» появляются в разных местах мышечных волокон 1 типа. Эти стержни представляют собой непатогномоничные структуры, которые по составу аналогичны Z-дискам саркомера . [160]
Патогенез этого миопатии очень разнообразен. Многие мутации происходят в области вдавливания актина рядом с его сайтами связывания нуклеотидов , в то время как другие происходят в Домене 2 или в областях, где происходит взаимодействие с ассоциированными белками. Это каким-то образом объясняет большое разнообразие сгустков, которые образуются в этих случаях, таких как немалин, внутриядерные тела или тела зебры. [32] При немалиновой миопатии происходят изменения в складывании актина, а также изменения в его агрегации, а также изменения в экспрессии других ассоциированных белков. В некоторых вариантах, где обнаруживаются внутриядерные тельца, изменения в сворачивании маскируют сигнал экспорта белка ядра, так что в ядре клетки происходит накопление мутированной формы актина . [161] С другой стороны, мутации ACTA1, которые вызывают CFTDM, оказывают большее влияние на саркомерную функцию, чем на его структуру. [162] Недавние исследования попытались понять этот очевидный парадокс, который предполагает, что нет четкой корреляции между количеством стержней и мышечной слабостью. Похоже, что некоторые мутации могут вызывать более высокую скорость апоптоза в мышечных волокнах типа II. [41]
В гладких мышцах
Есть две изоформы, которые кодируют актины в гладкой мышечной ткани :
ACTG2 кодирует самую большую изоформу актина, которая имеет девять экзонов , один из которых, расположенный на 5'-конце, не транслируется . [163] Это γ-актин, который экспрессируется в гладких мышцах кишечника. Не было обнаружено мутаций этого гена, соответствующих патологиям, хотя микроматрицы показали, что этот белок чаще экспрессируется в случаях, устойчивых к химиотерапии с использованием цисплатина . [164]
ACTA2 кодирует α-актин, расположенный в гладких мышцах, а также в гладких мышцах сосудов. Было отмечено, что мутация MYH11 может быть причиной по крайней мере 14% наследственных аневризм грудной аорты, особенно типа 6. Это связано с тем, что мутированный вариант вызывает неправильную филаментарную сборку и пониженную способность к сокращению гладких мышц сосудов. Уэтих людей было зарегистрировано разрушение среды аорты с участками дезорганизации и гиперплазии, а также стенозом vasa vasorum аорты. [165] Число болезней, в которые вовлечен этот ген, увеличивается. Это было связано с болезнью Моямоя, и вполне вероятно, что определенные мутации в гетерозиготном состоянии могут вызывать предрасположенность ко многим сосудистым патологиям, таким как аневризма грудной аорты и ишемическая болезнь сердца . [166] α-актин, обнаруженный в гладких мышцах, также является интересным маркером для оценки развития цирроза печени . [167]
В сердечной мышце
Ген ACTC1 кодирует изоформу α-актина, присутствующую в сердечной мышце. Впервые он был секвенирован Хамадой и сотрудниками в 1982 году, когда было обнаружено, что он прерывается пятью интронами. [168] Это был первый из шести генов, в которых были обнаружены аллели, вовлеченные в патологические процессы. [169]
Описан ряд структурных нарушений, связанных с точечными мутациями этого гена, которые вызывают нарушение работы сердца, таких как дилатационная кардиомиопатия типа 1R и гипертрофическая кардиомиопатия типа 11 . Недавно были описаны некоторые дефекты межпредсердной перегородки , которые также могут быть связаны с этими мутациями. [171] [172]
Были изучены два случая дилатационной кардиомиопатии с заменой высококонсервативных аминокислот, принадлежащих белковым доменам, которые связываются и пересекаются с Z-дисками . Это привело к теории, что дилатация вызвана дефектом передачи сократительной силы в миоцитах . [34] [169]
Мутации в ACTC1 ответственны как минимум за 5% гипертрофических кардиомиопатий. [173] Также было обнаружено существование ряда точечных мутаций: [174]
- Мутация E101K: изменение чистого заряда и образование слабой электростатической связи в сайте связывания актомиозина.
- P166A: зона взаимодействия между мономерами актина.
- A333P: зона взаимодействия актин-миозин.
Патогенез, по-видимому, включает компенсаторный механизм: мутировавшие белки действуют как токсины с доминирующим эффектом, снижая способность сердца сокращаться, вызывая аномальное механическое поведение, так что гипертрофия, которая обычно задерживается, является следствием нормальной реакции сердечной мышцы на стресс. . [175]
Недавние исследования обнаружили ACTC1 мутации, которые вовлечены в двух других патологических процессах: инфантильные идиопатический рестриктивной кардиомиопатии , [176] и Некомпактный левый желудочек миокарда . [177]
В цитоплазматических актинах
ACTB - очень сложный локус . Существует ряд псевдогенов , которые распределены по всему геному , и его последовательность содержит шесть экзонов, которые могут вызывать до 21 различных транскрипций путем альтернативного сплайсинга , которые известны как β-актины. В соответствии с этой сложностью, его продукты также обнаруживаются в нескольких местах и являются частью широкого спектра процессов ( цитоскелет , гистон- ацилтрансферазный комплекс NuA4, клеточное ядро ), и, кроме того, они связаны с механизмами большого числа патологических процессов ( карциномы , ювенильная дистония , механизмы инфекции,пороки развития нервной системы и опухолевые инвазии и др.). [178] Была открыта новая форма актина, каппа-актин, который, по-видимому, заменяет β-актин в процессах, связанных с опухолями . [179]
К настоящему времени обнаружены три патологических процесса, вызванных прямым изменением последовательности генов:
- Гемангиоперицитый с т (7; 12) (p22; q13) -translocations является редким недуг, в котором translocational мутация вызывает слияние ACTB гена над Gli1 в хромосоме 12 . [181]
- Юношеский дистония является редким дегенеративным заболеванием , которое влияет на центральную нервную систему ; в частности, поражаются участки неокортекса и таламуса , где образуются палочковидные эозинофильные включения. Пораженные люди представляют собой фенотип с деформациями по средней линии, сенсорной потерей слуха и дистонией. Это вызвано точечной мутацией, при которой аминокислота триптофан заменяет аргинин в положении 183. Это изменяет взаимодействие актина с системой ADF / кофилин , которая регулирует динамику формирования цитоскелета нервных клеток . [182]
- Также была обнаружена доминантная точечная мутация, которая вызывает дисфункцию нейтрофильных гранулоцитов и рецидивирующие инфекции . Похоже, что мутация модифицирует домен, ответственный за связывание профилина с другими регуляторными белками. Сродство актина к профилину у этого аллеля значительно снижено. [183]
В ACTG1 локус кодирует белок γ цитозольного-актин , который отвечает за формирование цитоскелета микрофиламентов . Он содержит шесть экзонов , дающих начало 22 различным мРНК , которые производят четыре полные изоформы , форма экспрессии которых, вероятно, зависит от типа ткани, в которой они обнаружены. Он также имеет два разных промотора ДНК . [184] Было отмечено, что последовательности, транслируемые из этого локуса и из локуса β-актина, очень похожи на предсказанные, что указывает на общую предковую последовательность, которая подверглась дупликации и генетической конверсии. [185]
Что касается патологии, это связано с такими процессами, как амилоидоз , пигментный ретинит , механизмы инфекции, заболевания почек и различные типы врожденной потери слуха. [184]
Было обнаружено, что шесть аутосомно-доминантных точечных мутаций в последовательности вызывают различные типы потери слуха, особенно нейросенсорную тугоухость, связанную с локусом DFNA 20/26. Похоже, что они влияют на стереоцилии реснитчатых клеток, присутствующих в кортиевом органе внутреннего уха . β-актин - самый распространенный белок, обнаруживаемый в тканях человека, но его не так много в реснитчатых клетках, что объясняет локализацию патологии. С другой стороны, похоже, что большинство этих мутаций затрагивают области, участвующие в связывании с другими белками, особенно с актомиозином. [32] Некоторые эксперименты показали, что патологический механизм этого типа потери слуха связан с тем, что F-актин в мутациях более чувствителен к кофилину, чем обычно. [186]
Однако, хотя нет данных о каких-либо случаях, известно, что γ-актин также экспрессируется в скелетных мышцах, и, хотя он присутствует в небольших количествах, модельные организмы показали, что его отсутствие может вызывать миопатии. [187]
Другие патологические механизмы
Некоторые инфекционные агенты используют актин, особенно цитоплазматический актин, в своем жизненном цикле . У бактерий присутствуют две основные формы :
- Listeria monocytogenes , некоторые виды Rickettsia , Shigella flexneri и другие внутриклеточные микробы выходят из фагоцитарных вакуолей, покрывая себя капсулой из актиновых нитей. L. monocytogenes и S. flexneri образуют хвост в форме «кометного хвоста», который придает им подвижность. У каждого вида есть небольшие различия в механизме молекулярной полимеризации их «кометных хвостов». Различные скорости смещения наблюдались, например, у Listeria и Shigella, которые оказались самыми быстрыми. [188] Многие эксперименты продемонстрировали этот механизм in vitro . Это указывает на то, что бактерии не используют миозиноподобный белковый мотор, и похоже, что их движение достигается за счет давления, оказываемого полимеризацией, которая происходит рядом с клеточной стенкой микроорганизма. Бактерии ранее были окружены ABP от хозяина, и как минимум покрытие содержит комплекс Arp2 / 3 , белки Ena / VASP , кофилин, буферный белок и промоторы нуклеации, такие каккомплекс винкулина . Благодаря этим движениям они образуют выступы, которые достигают соседних клеток, заражая и их, так что иммунная система может бороться с инфекцией только через клеточный иммунитет. Движение могло быть вызвано изменением кривой и расщеплением волокон. [189] Другие виды, такие как Mycobacterium marinum и Burkholderia pseudomallei , также способны к локальной полимеризации клеточного актина, чтобы способствовать их перемещению посредством механизма, который сосредоточен на комплексе Arp2 / 3. Кроме того, вакцинный вирус осповакцины также использует элементы актинового цитоскелета для своего распространения. [190]
- Pseudomonas aeruginosa способна образовывать защитную биопленку , чтобы избежатьзащиты организма-хозяина , особенно лейкоцитов и антибиотиков . Биопленка построена с использованиемнитей ДНК и актина организма-хозяина. [191]
В дополнение к ранее процитированному примеру, полимеризация актина стимулируется на начальных этапах интернализации некоторых вирусов, особенно ВИЧ , например, путем инактивации комплекса кофилина. [192]
Роль, которую актин играет в процессе инвазии раковых клеток, до сих пор не определена. [193]
Эволюция
Эукариотический цитоскелет организмов всех таксономических групп имеет компоненты, сходные с актином и тубулином. Например, белок, кодируемый геном ACTG2 у человека, полностью эквивалентен гомологам, присутствующим у крыс и мышей, хотя на уровне нуклеотидов сходство снижается до 92%. [163] Однако есть серьезные различия с эквивалентами в прокариотах ( FtsZ и MreB ), где сходство между нуклеотидными последовательностями составляет 40-50% среди различных видов бактерий и архей . Некоторые авторы предполагают, что предковый белок, который дал начало модельному эукариотическому актину, напоминает белки, присутствующие в современных бактериальных цитоскелетах. [4] [194]
Некоторые авторы отмечают, что поведение актина, тубулина и гистона , белка, участвующего в стабилизации и регуляции ДНК, сходно по их способности связывать нуклеотиды и по их способности использовать броуновское движение . Также было высказано предположение, что все они имеют общего предка. [195] Таким образом, эволюционные процессы привели к диверсификации предковых белков в разновидности, присутствующие сегодня, сохраняя, среди прочего, актины как эффективные молекулы, которые были способны решать важные наследственные биологические процессы, такие как эндоцитоз . [196]
Эквиваленты в бактериях
Бактериального цитоскелета не может быть столь же сложным , как найти в эукариот ; однако он содержит белки, которые очень похожи на мономеры и полимеры актина. Бактериальный белок MreB полимеризуется в тонкие неспиральные филаменты и иногда в спиральные структуры, подобные F-актину. [21] [197] Кроме того, его кристаллическая структура очень похожа на структуру G-actin (с точки зрения его трехмерной конформации), есть даже сходства между протофиламентами MreB и F-actin. Бактериальный цитоскелет также содержит белки FtsZ , похожие на тубулин . [198]
Таким образом, бактерии обладают цитоскелетом с элементами, гомологичными актину (например, MreB, AlfA, ParM , FtsA и MamK), даже несмотря на то, что аминокислотная последовательность этих белков отличается от последовательности, присутствующей в клетках животных. Однако такие белки имеют высокую степень структурного сходства с эукариотическим актином. Высокодинамичные микрофиламенты, образованные агрегацией MreB и ParM, важны для жизнеспособности клеток и участвуют в морфогенезе клеток, сегрегации хромосом и полярности клеток. ParM является гомологом актина, который кодируется в плазмиде и участвует в регуляции плазмидной ДНК. [4] [199] ParM из разных бактериальных плазмид может образовывать удивительно разнообразные спиральные структуры, содержащие две [200] [201] или четыре [202] цепи, чтобы поддерживать точное наследование плазмид.
Приложения
Актин используется в научных и технологических лабораториях как трек для молекулярных моторов, таких как миозин (в мышечной ткани или вне ее), и как необходимый компонент для функционирования клеток. Его также можно использовать как диагностический инструмент, так как несколько его аномальных вариантов связаны с появлением конкретных патологий.
- Нанотехнологии . Актин-миозиновые системы действуют как молекулярные двигатели, которые позволяют транспортировать везикулы и органеллы по цитоплазме. Возможно, что актин может быть применен в нанотехнологиях, поскольку его динамические способности использовались в ряде экспериментов, в том числе в бесклеточных системах. Основная идея состоит в том, чтобы использовать микрофиламенты в качестве направляющих для молекулярных моторов, которые могут переносить заданную нагрузку. То есть актин может быть использован для определения цепи, по которой груз может транспортироваться более или менее управляемым и направленным образом. С точки зрения общих приложений, его можно было бы использовать для направленного транспорта молекул для осаждения в определенных местах, что позволило бы осуществлять контролируемую сборку наноструктур. [203] Эти атрибуты могут быть применены к лабораторным процессам, таким как лаборатория на кристалле , в механике нанокомпонентов и в нанотрансформаторах, которые преобразуют механическую энергию в электрическую. [204]
- Актин используется в качестве внутреннего контроля в вестерн-блоттинге, чтобы убедиться, что равные количества белка были загружены на каждую дорожку геля. В примере блоттинга, показанном слева, в каждую лунку загружали 75 мкг общего белка. Блот подвергался реакции с антителом против β-актина (другие подробности блоттинга см. В ссылке [205] ).
Использование актина в качестве внутреннего контроля основано на предположении, что его экспрессия практически постоянна и не зависит от условий эксперимента. Сравнивая экспрессию интересующего гена с экспрессией актина, можно получить относительную величину, которую можно сравнивать в разных экспериментах [206], когда экспрессия последнего постоянна. Стоит отметить, что актин не всегда имеет желаемую стабильность в экспрессии генов . [207]
- Здоровье. Некоторые аллели актина вызывают заболевания; по этой причине были разработаны методы их обнаружения. Кроме того, актин можно использовать в качестве косвенного маркера хирургической патологии: можно использовать вариации в характере его распределения в ткани в качестве маркера инвазии при неоплазии , васкулите и других состояниях. [208] Кроме того, из-за тесной связи актина с аппаратом мышечного сокращения его уровни в скелетных мышцах снижаются, когда эти ткани атрофируются , поэтому его можно использовать в качестве маркера этого физиологического процесса. [209]
- Пищевая технология . Можно определить качество некоторых обработанных пищевых продуктов, таких как колбасы , путем количественной оценки количества актина, присутствующего в составном мясе. Традиционно использовался метод, основанный на обнаружении 3-метилгистидина в гидролизованных образцах этих продуктов, поскольку это соединение присутствует в тяжелой цепи актина и F-миозина (оба являются основными компонентами мышц). Поколение этого соединения в плоти происходит от метилирования из гистидина остатков присутствует в обоих белков. [210] [211]
Гены
Гены человека, кодирующие белки актина, включают:
- ACTA1 - альфа-актин 1, скелетная мышца
- ACTA2 - альфа-актин 2, гладкие мышцы, аорта
- ACTB - бета-актин
- ACTC1 - актин, альфа, сердечная мышца 1
- ACTG1 - гамма-актин 1
- ACTG2 - гамма-актин 2, гладкая мускулатура, кишечная
Смотрите также
- Ремоделирование актина - влияние на структуру и форму клеток
- Актин-связывающий белок
- Активное вещество
- Arp2 / 3
- Филоподии
- FtsZ
- Промежуточная нить
- Ламеллиподиум
- Моторный белок - преобразует химическую энергию в механическую работу.
- MreB - один из гомологов актина у бактерий
- Нейрон
- Фаллотоксин
Рекомендации
- ^ а б в г д PDB : 1J6Z ; Otterbein LR, Graceffa P, Dominguez R (июль 2001 г.). «Кристаллическая структура несложного актина в состоянии АДФ». Наука . 293 (5530): 708–711. DOI : 10.1126 / science.1059700 . PMID 11474115 . S2CID 12030018 .
- ^ Доэрти Г.Дж., МакМахон ХТ (2008). «Посредничество, модуляция и последствия взаимодействий мембрана-цитоскелет». Ежегодный обзор биофизики . 37 (1): 65–95. DOI : 10.1146 / annurev.biophys.37.032807.125912 . PMID 18573073 . S2CID 17352662 .
- ^ Виндин Х., Ганнинг П. (август 2013 г.). «Цитоскелетные тропомиозины: хореографы функционального разнообразия актиновых филаментов» . Журнал исследований мышц и подвижности клеток . 34 (3–4): 261–274. DOI : 10.1007 / s10974-013-9355-8 . PMC 3843815 . PMID 23904035 .
- ^ Б с д е е г ч I Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых филаментов» . Журнал клеточной науки . 128 (11): 2009–2019. DOI : 10,1242 / jcs.165563 . PMID 25788699 .
- ^ Ghoshdastider U, Jiang S, Popp D, Robinson RC (июль 2015 г.). «В поисках первозданной актиновой нити» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (30): 9150–9151. DOI : 10.1073 / pnas.1511568112 . PMC 4522752 . PMID 26178194 .
- ^ а б Альбертс Б., Джонсон А., Льюис Дж, Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2002). «Глава 16: Цитоскелет» . Молекулярная биология клетки . Нью-Йорк: Наука о гирляндах. С. 907–982. ISBN 978-0-8153-3218-3.
- ^ Halliburton WD (август 1887 г.). «О мышечной плазме» . Журнал физиологии . 8 (3–4): 133–202. DOI : 10.1113 / jphysiol.1887.sp000252 . PMC 1485127 . PMID 16991477 .
- ^ а б Банга, Илона (1942). Сент-Дьёрдьи, Альберт (ред.). «Приготовление и свойства миозина А и В.» Исследования Института медицинской химии Сегедского университета. 1941-1942 гг . I : 5–15.
- ^ Штрауб, Бруно Ф. (1942). Сент-Дьёрдьи, Альберт (ред.). «Актин» . Исследования Института медицинской химии Сегедского университета. 1942 . II : 3–15.
- ^ Бугьи, Бета; Келлермайер, Миклош (март 2020 г.). «Открытие актина:« видеть то, что видели все, и думать о том, о чем никто не думал » » . Журнал исследований мышц и подвижности клеток . 41 (1): 3–9. DOI : 10.1007 / s10974-019-09515-Z . PMC 7109165 . PMID 31093826 .
- ^ Сент-Дьёрдьи, Альберт (1942). Сент-Дьёрдьи, Альберт (ред.). «Обсуждение» . Исследования Института медицинской химии Сегедского университета. 1941-1942 гг . I : 67–71.
- ^ Сент-Дьердь А (1945). «Исследования на мышцах». Acta Physiol Scandinav . 9 (Дополнение): 25.
- ^ а б Штрауб Ф. Б., Фойер Г. (1989). «Аденозинтрифосфат. Функциональная группа актина. 1950». Biochimica et Biophysica Acta . 1000 : 180–195. DOI : 10.1016 / 0006-3002 (50) 90052-7 . PMID 2673365 .
- ^ Барани М., Бэррон Дж. Т., Гу Л., Барани К. (декабрь 2001 г.). «Обмен связанного с актином нуклеотида в неповрежденной гладкой мускулатуре артерий» . Журнал биологической химии . 276 (51): 48398–48403. DOI : 10.1074 / jbc.M106227200 . PMID 11602582 .
- ^ а б в Эльзинга М., Коллинза Дж. Х., Кюля В. М., Адельштейна Р. С. (сентябрь 1973 г.). «Полная аминокислотная последовательность актина скелетных мышц кролика» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 70 (9): 2687–2691. Bibcode : 1973PNAS ... 70.2687E . DOI : 10.1073 / pnas.70.9.2687 . PMC 427084 . PMID 4517681 .
- ^ а б Kabsch W, Mannherz HG, Suck D, Pai EF, Holmes KC (сентябрь 1990 г.). «Атомная структура комплекса актин: ДНКаза I». Природа . 347 (6288): 37–44. Bibcode : 1990Natur.347 ... 37K . DOI : 10.1038 / 347037a0 . PMID 2395459 . S2CID 925337 .
- ^ а б Холмс К.С., Попп Д., Гебхард В., Кабш В. (сентябрь 1990 г.). «Атомная модель актинового филамента». Природа . 347 (6288): 44–49. Bibcode : 1990Natur.347 ... 44H . DOI : 10.1038 / 347044a0 . PMID 2395461 . S2CID 4317981 .
- ^ Ориол С., Даборд С., Лэндон Ф. (январь 1977 г.). «Кристаллизация нативного актина поперечно-полосатых мышц» . Письма FEBS . 73 (1): 89–91. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (77) 80022-7 . PMID 320040 . S2CID 5142918 .
- ^ Савая М.Р., Кудряшов Д.С., Пашков И., Адисетийо Х., Рейслер Э., Йейтс Т.О. (апрель 2008 г.). «Множественные кристаллические структуры димеров актина и их значение для взаимодействия в филаменте актина» . Acta Crystallographica Раздел D . 64 (Pt 4): 454–465. DOI : 10.1107 / S0907444908003351 . PMC 2631129 . PMID 18391412 .
- ^ Нарита А., Такеда С., Ямасита А., Маеда Y (ноябрь 2006 г.). «Структурная основа покрытия актиновых филаментов на зазубренном конце: исследование с помощью криоэлектронной микроскопии» . Журнал EMBO . 25 (23): 5626–5633. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601395 . PMC 1679762 . PMID 17110933 .
- ^ а б в г д е Ода Т., Иваса М., Айхара Т., Маеда Ю., Нарита А. (январь 2009 г.). «Природа перехода от глобулярного к фиброзному актину». Природа . 457 (7228): 441–445. Bibcode : 2009Natur.457..441O . DOI : 10,1038 / природа07685 . PMID 19158791 . S2CID 4317892 .
- ^ а б в г фон дер Экен Дж., Мюллер М., Леман В., Манштейн Д. Д., Пенчек П. А., Раунсер С. (май 2015 г.). «Структура комплекса F-актин-тропомиозин» . Природа . 519 (7541): 114–117. Bibcode : 2015Natur.519..114V . DOI : 10,1038 / природа14033 . PMC 4477711 . PMID 25470062 .
- ^ Ханукоглу И., Танезе Н., Фукс Э. (февраль 1983 г.). «Комплементарная последовательность ДНК цитоплазматического актина человека. Межвидовая дивергенция 3'-некодирующих областей». Журнал молекулярной биологии . 163 (4): 673–678. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (83) 90117-1 . PMID 6842590 .
- ^ а б в г Biología celular (на испанском языке). Elsevier España. 2002. с. 132. ISBN 978-84-458-1105-4.
- ^ Понте П., Ганнинг П., Блау Х, Кедес Л. (октябрь 1983 г.). «Гены актина человека являются единственной копией для альфа-скелетного и альфа-сердечного актина, но множественными копиями для генов бета- и гамма-цитоскелета: 3'-нетранслируемые области являются изотип-специфичными, но сохраняются в процессе эволюции» . Молекулярная и клеточная биология . 3 (10): 1783–1791. DOI : 10,1128 / MCB.3.10.1783 . PMC 370040 . PMID 6646124 .
- ^ а б в г Скотт М.П., Лодиш Х.Ф., Берк А, Кайзер С, Кригер М, Бретчер А, Плоег Х, Амон А (2012). Молекулярная клеточная биология . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 978-1-4292-3413-9.
- ^ Hara F, Yamashiro K, Nemoto N, Ohta Y, Yokobori S, Yasunaga T, Hisanaga S, Yamagishi A (март 2007 г.). «Гомолог актина археи Thermoplasma acidophilum, который сохраняет древние характеристики эукариотического актина» . Журнал бактериологии . 189 (5): 2039–2045. DOI : 10.1128 / JB.01454-06 . PMC 1855749 . PMID 17189356 .
- ^ а б Graceffa P, Dominguez R (сентябрь 2003 г.). «Кристаллическая структура мономерного актина в состоянии АТФ. Структурные основы нуклеотид-зависимой динамики актина» . Журнал биологической химии . 278 (36): 34172–34180. DOI : 10.1074 / jbc.M303689200 . PMID 12813032 .
- ^ Рейслер Э (февраль 1993 г.). «Молекулярная структура и функция актина». Текущее мнение в клеточной биологии . 5 (1): 41–47. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (05) 80006-7 . PMID 8448029 .
- ^ «cd00012: ACTIN» . Сохраненная база данных домена . Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI). Архивировано 05 декабря 2017 года.
- ^ а б Коллинз Дж. Х., Эльзинга М. (август 1975 г.). «Первичная структура актина из скелетных мышц кролика. Завершение и анализ аминокислотной последовательности». Журнал биологической химии . 250 (15): 5915–5920. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 41139-3 . PMID 1150665 .
- ^ Б с д е е г ч Dos Remedios CG, Chhabra D (2008). Актин-связывающие белки и болезнь . Springer. ISBN 978-0-387-71747-0.
- ^ Рулд М.А., Ван К., Джоэл ПБ, Лоуи С., Трибус К.М. (октябрь 2006 г.). «Кристаллические структуры экспрессированного неполимеризуемого мономерного актина в состояниях АДФ и АТФ» . Журнал биологической химии . 281 (42): 31909–31919. DOI : 10.1074 / jbc.M601973200 . PMID 16920713 .
- ^ а б Девлин TM (2006). Bioquimica . Барселона: Реверте. ISBN 978-84-291-7208-9.
- ^ а б в Reisler E, Egelman EH (декабрь 2007 г.). «Структура и функции актина: чего мы до сих пор не понимаем» . Журнал биологической химии . 282 (50): 36133–36137. DOI : 10.1074 / jbc.R700030200 . PMID 17965017 .
- ^ Бегг Д.А., Родевальд Р., Ребхун Л.И. (декабрь 1978 г.). «Визуализация полярности актиновых филаментов в тонких срезах. Доказательства однородной полярности мембранных филаментов» . Журнал клеточной биологии . 79 (3): 846–852. DOI : 10,1083 / jcb.79.3.846 . PMC 2110270 . PMID 569662 .
- ^ Дженезер Ф (1981). Histologi . Мунксгаард. п. 105. ISBN 978-87-16-08418-7.
- ^ а б в Холл JE, Guyton AC (2006). Учебник медицинской физиологии . Сент-Луис, Миссури: Elsevier Saunders. п. 76 . ISBN 978-0-7216-0240-0.
- ^ а б Саймонс CT, Стаес А., Роммелер Х., Амп С, Льюис С.А., Коуэн, штат Нью-Джерси (февраль 2004 г.) «Избирательный вклад эукариотических субъединиц префолдина в связывание актина и тубулина» . Журнал биологической химии . 279 (6): 4196–4203. DOI : 10.1074 / jbc.M306053200 . PMID 14634002 .
- ^ а б Мартин-Бенито Дж., Боскович Дж., Гомес-Пуэртас П., Карраскоса Дж. Л., Саймонс К. Т., Льюис С. А., Бартолини Ф., Коуэн Н. Дж., Валпуэста Дж. М. (декабрь 2002 г.). «Структура эукариотического префолдина и его комплексов с развернутым актином и цитозольным шаперонином CCT» . Журнал EMBO . 21 (23): 6377–6386. DOI : 10,1093 / emboj / cdf640 . PMC 136944 . PMID 12456645 .
- ^ а б Vandamme D, Lambert E, Waterschoot D, Cognard C, Vandekerckhove J, Ampe C, Constantin B, Rommelaere H (июль 2009 г.). «Мутанты альфа-актина немалиновой миопатии скелетных мышц вызывают гибель клеток в культивируемых мышечных клетках». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1793 (7): 1259–1271. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2009.04.004 . PMID 19393268 .
- ^ а б Брэкли К.И., Грэнтэм Дж. (Январь 2009 г.). «Активность шаперонина, содержащего TCP-1 (CCT): последствия для развития клеточного цикла и организации цитоскелета» . Клеточный стресс и шапероны . 14 (1): 23–31. DOI : 10.1007 / s12192-008-0057-х . PMC 2673901 . PMID 18595008 .
- ^ а б Stirling PC, Cuéllar J, Alfaro GA, El Khadali F, Beh CT, Valpuesta JM, Melki R, Leroux MR (март 2006 г.). «PhLP3 модулирует CCT-опосредованное сворачивание актина и тубулина посредством тройных комплексов с субстратами» . Журнал биологической химии . 281 (11): 7012–7021. DOI : 10.1074 / jbc.M513235200 . PMID 16415341 .
- ^ Хансен WJ, Коуэн NJ, Велч WJ (апрель 1999). «Комплексы префолдин-растущая цепь в сворачивании белков цитоскелета» . Журнал клеточной биологии . 145 (2): 265–277. DOI : 10,1083 / jcb.145.2.265 . PMC 2133115 . PMID 10209023 .
- ^ Мартин-Бенито Дж., Грантам Дж., Боскович Дж., Брэкли К.И., Карраскоса Дж. Л., Уиллисон К. Р., Валпуэста Дж. М. (март 2007 г.). «Межкольцевое расположение цитозольного шаперонина CCT» . EMBO Reports . 8 (3): 252–257. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400894 . PMC 1808031 . PMID 17304242 .
- ^ Neirynck K, Waterschoot D, Vandekerckhove J, Ampe C, Rommelaere H (январь 2006 г.). «Актин взаимодействует с CCT через дискретные сайты связывания: модель перехода связывания-высвобождения для CCT-опосредованного сворачивания актина». Журнал молекулярной биологии . 355 (1): 124–138. DOI : 10.1016 / j.jmb.2005.10.051 . PMID 16300788 .
- ^ а б в Вавилонис Д., Ян К., О'Шонесси Б. (июнь 2005 г.). «Кинетика полимеризации актина, структура кэпа и колебания» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (24): 8543–8548. arXiv : q-bio / 0404004 . Bibcode : 2005PNAS..102.8543V . DOI : 10.1073 / pnas.0501435102 . PMC 1150824 . PMID 15939882 .
- ^ Katkar HH, Davtyan A, Durumeric AE, Hocky GM, Schramm A, Enrique M, Voth GA (сентябрь 2018 г.). «Понимание кооперативного характера гидролиза АТФ в актиновых филаментах» . Биофизический журнал . 115 (8): 1589–1602. Bibcode : 2018BpJ ... 115.1589K . DOI : 10.1016 / j.bpj.2018.08.034 . PMC 6260209 . PMID 30249402 .
- ^ McCullagh M, Saunders MG, Voth GA (сентябрь 2014 г.). «Раскрытие тайны гидролиза АТФ в актиновых филаментах» . Журнал Американского химического общества . 136 (37): 13053–13058. DOI : 10.1021 / ja507169f . PMC 4183606 . PMID 25181471 .
- ^ Сондерс М.Г., Вот Г.А. (октябрь 2011 г.). «Молекулы воды в нуклеотидсвязывающей щели актина: влияние на конформацию субъединицы и последствия для гидролиза АТФ». Журнал молекулярной биологии . 413 (1): 279–291. DOI : 10.1016 / j.jmb.2011.07.068 . PMID 21856312 .
- ^ Vandekerckhove J, Weber K (декабрь 1978 г.). «По крайней мере, шесть различных актинов экспрессируются у высших млекопитающих: анализ, основанный на аминокислотной последовательности аминоконцевого триптического пептида». Журнал молекулярной биологии . 126 (4): 783–802. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (78) 90020-7 . PMID 745245 .
- ^ Хайтлина С.Ю. (2001). Функциональная специфичность изоформ актина . Международный обзор цитологии. 202 . С. 35–98. DOI : 10.1016 / S0074-7696 (01) 02003-4 . ISBN 9780123646064. PMID 11061563 .
- ^ Гарнер ЕС, Кэмпбелл С.С., Вейбель Д.Б., Маллинс Р.Д. (март 2007 г.) «Восстановление расщепления ДНК, вызванное сборкой прокариотического гомолога актина» . Наука . 315 (5816): 1270–1274. Bibcode : 2007Sci ... 315.1270G . DOI : 10.1126 / science.1138527 . PMC 2851738 . PMID 17332412 .
- ^ Суранени, Правин; Фогельсон, Бен; Рубинштейн, Борис; Ногера, Филипп; Фолькманн, Нильс; Ханейн, Дорит; Могильнер, Алекс; Ли, Ронг (2015). «Механизм выступа передней кромки в отсутствие комплекса Arp2 / 3» . Молекулярная биология клетки . 26 (5): 901–912. DOI : 10,1091 / mbc.E14-07-1250 . PMC 4342026 . PMID 25568333 .
- ^ Альбертс, Брюс; Джонсон, Александр; Льюис, Джулиан; Рафф, Мартин; Робертс, Кейт; Уолтер, Питер, ред. (2002). «Самосборка и динамическая структура филаментов цитоскелета» . Молекулярная биология клетки (4-е изд.). Наука о гирляндах. ISBN 978-0-8153-3218-3.
- ^ Кавамура, Масару; Маруяма, Кощак (март 1970 г.). "Электронно-микроскопическая длина частиц F-актина, полимеризованного in vitro". Журнал биохимии . 67 (3): 437–457. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a129267 . PMID 5463781 .
- ^ Хаусман Р. Э., Купер Г. М. (2007). «Глава 12: Цитоскелет и движение клеток». Клетка: молекулярный подход . Вашингтон, округ Колумбия:, Сандерленд, Массачусетс: ASM Press, Sinauer Associates. ISBN 978-0-87893-219-1.
- ^ Биндшадлер М., Осборн Э.А., Дьюи К.Ф., МакГрат Д.Л. (май 2004 г.). «Механистическая модель цикла актина» . Биофизический журнал . 86 (5): 2720–2739. Bibcode : 2004BpJ .... 86.2720B . DOI : 10.1016 / S0006-3495 (04) 74326-X . PMC 1304143 . PMID 15111391 .
- ^ Киршнер М.В. (июль 1980 г.). «Влияние беговой дорожки на стабильность и полярность полимеров актина и тубулина in vivo» . Журнал клеточной биологии . 86 (1): 330–334. DOI : 10,1083 / jcb.86.1.330 . PMC 2110666 . PMID 6893454 .
- ^ Годси Х., Каземи М.Т. (июнь 2011 г.). «Упругие свойства актиновых сборок в различных состояниях связывания нуклеотидов». Клетка. Мол. Bioeng . 5 (1): 1–13. DOI : 10.1007 / s12195-011-0181-Z . S2CID 83973622 .
- ^ Плоппер Г., Левин Б., Кассимерис Л. (2007). Ячейки . Бостон: Джонс и Бартлетт Паблишерс. п. 378 . ISBN 978-0-7637-3905-8.
гидролизная полимеризация актина.
- ^ Zhang DS, Piazza V, Perrin BJ, Rzadzinska AK, Poczatek JC, Wang M, Prosser HM, Ervasti JM, Corey DP, Lechene CP (январь 2012 г.). «Масс-спектрометрия с мультиизотопной визуализацией выявляет медленный оборот белка в стереоцилиях волосковых клеток» . Природа . 481 (7382): 520–524. Bibcode : 2012Natur.481..520Z . DOI : 10,1038 / природа10745 . PMC 3267870 . PMID 22246323 .
- ^ PDB : 2BTF ; Schutt CE, Myslik JC, Rozycki MD, Goonesekere NC, Lindberg U (октябрь 1993 г.). «Структура кристаллического профилин-бета-актина». Природа . 365 (6449): 810–816. Bibcode : 1993Natur.365..810S . DOI : 10.1038 / 365810a0 . PMID 8413665 . S2CID 4359724 .
- ^ Домингес Р. (ноябрь 2004 г.). «Актин-связывающие белки - объединяющая гипотеза». Направления биохимических наук . 29 (11): 572–578. DOI : 10.1016 / j.tibs.2004.09.004 . PMID 15501675 .
- ^ Goldschmidt-Clermont PJ, Furman MI, Wachsstock D, Safer D, Nachmias VT, Pollard TD (сентябрь 1992 г.). «Контроль обмена нуклеотидов актина с помощью тимозина бета 4 и профилина. Потенциальный механизм регуляции полимеризации актина в клетках» . Молекулярная биология клетки . 3 (9): 1015–1024. DOI : 10.1091 / mbc.3.9.1015 . PMC 275662 . PMID 1330091 .
- ^ Витке В., Подтелейников А.В., Ди Нардо А., Сазерленд Д.Д., Гурняк С.Б., Дотти С., Манн М. (февраль 1998 г.). «В мозге мышей профилин I и профилин II связаны с регуляторами пути эндоцитов и сборки актина» . Журнал EMBO . 17 (4): 967–976. DOI : 10.1093 / emboj / 17.4.967 . PMC 1170446 . PMID 9463375 .
- ^ Карлссон Л., Нистрем Л. Е., Сундквист И., Марки Ф., Линдберг Ю. (сентябрь 1977 г.). «Полимеризуемость актина зависит от профилина, низкомолекулярного белка в немышечных клетках». Журнал молекулярной биологии . 115 (3): 465–483. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (77) 90166-8 . PMID 563468 .
- ^ Kiselar JG, Janmey PA, Almo SC, Chance MR (апрель 2003 г.). «Визуализация Ca2 + -зависимой активации гельсолина с помощью синхротронного отпечатка стопы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (7): 3942–3947. Bibcode : 2003PNAS..100.3942K . DOI : 10.1073 / pnas.0736004100 . PMC 153027 . PMID 12655044 .
- ^ Ghoshdastider U, Popp D, Burtnick LD, Robinson RC (ноябрь 2013 г.). «Расширяющееся суперсемейство белков домена гомологии гельсолина». Цитоскелет . 70 (11): 775–795. DOI : 10.1002 / cm.21149 . PMID 24155256 . S2CID 205643538 .
- ^ Southwick FS (июнь 2000 г.). «Гельсолин и АДФ / кофилин усиливают актиновую динамику подвижных клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (13): 6936–6938. Bibcode : 2000PNAS ... 97.6936S . DOI : 10.1073 / pnas.97.13.6936 . PMC 34364 . PMID 10860951 .
- ^ Колдуэлл Дж. Э., Хейсс С. Г., Мермолл В., Купер Дж. А. (октябрь 1989 г.). «Влияние CapZ, белка, улавливающего актин мышц, на полимеризацию актина». Биохимия . 28 (21): 8506–8514. DOI : 10.1021 / bi00447a036 . PMID 2557904 .
- ^ Вебер А., Пеннис С.Р., Бэбкок Г.Г., Фаулер В.М. (декабрь 1994 г.). «Тропомодулин покрывает заостренные концы актиновых нитей» . Журнал клеточной биологии . 127 (6 Pt 1): 1627–1635. DOI : 10,1083 / jcb.127.6.1627 . PMC 2120308 . PMID 7798317 .
- ^ Робинсон Р.К., Турбедски К., Кайзер Д.А., Маршан Дж. Б., Хиггс Н. Н., Чо С., Поллард Т. Д. (ноябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура комплекса Arp2 / 3». Наука . 294 (5547): 1679–1684. Bibcode : 2001Sci ... 294.1679R . DOI : 10.1126 / science.1066333 . PMID 11721045 . S2CID 18088124 .
- ^ Маллинз Р.Д., Поллард Т.Д. (апрель 1999 г.). «Строение и функции комплекса Арп2 / 3». Текущее мнение в структурной биологии . 9 (2): 244–249. DOI : 10.1016 / S0959-440X (99) 80034-7 . PMID 10322212 .
- ^ Machesky LM, Gould KL (февраль 1999 г.). «Комплекс Арп2 / 3: многофункциональный органайзер актина». Текущее мнение в клеточной биологии . 11 (1): 117–121. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (99) 80014-3 . PMID 10047519 .
- ^ Morton WM, Ayscough KR, McLaughlin PJ (июнь 2000 г.). «Латрункулин изменяет поверхность раздела актин-мономерная субъединица, чтобы предотвратить полимеризацию». Природа клеточной биологии . 2 (6): 376–378. DOI : 10.1038 / 35014075 . hdl : 1842/757 . PMID 10854330 . S2CID 1803612 .
- ^ а б Купер Дж. А. (октябрь 1987 г.). «Влияние цитохалазина и фаллоидина на актин» . Журнал клеточной биологии . 105 (4): 1473–1478. DOI : 10,1083 / jcb.105.4.1473 . PMC 2114638 . PMID 3312229 .
- ^ Рубцова С.Н., Кондратов Р.В., Копнин ПБ, Чумаков П.М., Копнин Б.П., Васильев Ю.М. (июль 1998 г.). «Нарушение микрофиламентов актина цитохалазином D приводит к активации р53» . Письма FEBS . 430 (3): 353–357. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 00692-9 . PMID 9688570 . S2CID 38044707 .
- ^ Huber, F .; Schnauß, J .; Rönicke, S .; Rauch, P .; Müller, K .; Fütterer, C .; Käs, J. (январь 2013 г.). «Возникающая сложность цитоскелета: от единичных нитей до ткани» . Успехи физики . 62 (1): 1–112. Bibcode : 2013AdPhy..62 .... 1H . DOI : 10.1080 / 00018732.2013.771509 . PMC 3985726 . PMID 24748680 .
- ^ а б в Grummt I (апрель 2006 г.). «Актин и миозин как факторы транскрипции». Текущее мнение в области генетики и развития . 16 (2): 191–196. DOI : 10.1016 / j.gde.2006.02.001 . PMID 16495046 .
- ^ Zouwail S, Pettitt TR, Dove SK, Chibalina MV, Powner DJ, Haynes L, Wakelam MJ, Insall RH (июль 2005 г.). «Активность фосфолипазы D важна для локализации актина и подвижности на основе актина у Dictyostelium» . Биохимический журнал . 389 (Pt 1): 207–214. DOI : 10.1042 / BJ20050085 . PMC 1184553 . PMID 15769249 .
- ^ а б Eckert R, Randall D, Burggren WW, French K (2002). Физиология животных Эккерта: механизмы и адаптации . Нью-Йорк: WH Freeman and CO. ISBN 978-0-7167-3863-3.
- ^ Theriot, Julie A .; Митчисон, Тимоти Дж. (Июль 1991 г.). «Динамика актиновых микрофиламентов в двигательных клетках». Природа . 352 (6331): 126–131. Bibcode : 1991Natur.352..126T . DOI : 10.1038 / 352126a0 . PMID 2067574 . S2CID 3062637 .
- ^ Ли, Джульетта; Исихара, Акира; Theriot, Julie A .; Якобсон, Кен (март 1993 г.). «Принципы передвижения клеток простой формы». Природа . 362 (6416): 167–171. Bibcode : 1993Natur.362..167L . DOI : 10.1038 / 362167a0 . PMID 8450887 . S2CID 4366904 .
- ^ Тромбоцитопении (испанское издание) (2-е изд.). Elsevier Espana. 2001. с. 25. ISBN 978-84-8174-595-5.
- ^ а б в Паниагуа Р., Нисталь М., Сесма П., Альварес-Урия М., Фрайле Б., Анадон Р., Хосе Саес Ф. (2002). Citología e histología Vegetal y animal (на испанском языке). McGraw-Hill Interamericana de España, ISBN SAU 978-84-486-0436-3.
- ^ Сюй К., Чжун Г, Чжуан Х (январь 2013 г.). «Актин, спектрин и ассоциированные белки образуют периодическую структуру цитоскелета в аксонах» . Наука . 339 (6118): 452–456. Bibcode : 2013Sci ... 339..452X . DOI : 10.1126 / science.1232251 . PMC 3815867 . PMID 23239625 .
- ^ а б Мозли Дж. Б., Гуд Б. Л. (сентябрь 2006 г.). «Актиновый цитоскелет дрожжей: от клеточной функции к биохимическому механизму» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 70 (3): 605–645. DOI : 10.1128 / MMBR.00013-06 . PMC 1594590 . PMID 16959963 .
- ^ Meagher RB, McKinney EC, Kandasamy MK (июнь 1999 г.). «Изовариантная динамика расширяет и буферизует ответы сложных систем: разнообразного семейства генов актина растений» . Растительная клетка . 11 (6): 995–1006. DOI : 10.1105 / tpc.11.6.995 . PMC 1464670 . PMID 10368172 .
- ^ PDB 1unc ; Vermeulen W, Vanhaesebrouck P, Van Troys M, Verschueren M, Fant F, Goethals M, Ampe C, Martins JC, Borremans FA (май 2004 г.). «Структуры решения C-концевых субдоменов головного мозга ворсин и адвиллина человека, оценка требований связывания F-актина головного мозга» . Белковая наука . 13 (5): 1276–1287. DOI : 10.1110 / ps.03518104 . PMC 2286768 . PMID 15096633 .
- ^ а б Хигаки Т., Сано Т., Хаседзава С. (декабрь 2007 г.). «Актиновая микрофиламентная динамика и белки, связывающие актиновую сторону в растениях». Текущее мнение в биологии растений . 10 (6): 549–556. DOI : 10.1016 / j.pbi.2007.08.012 . PMID 17936064 .
- ^ Ковар Д.Р., Стайгер С.Дж., Уивер Е.А., Маккарди Д.В. (декабрь 2000 г.). «AtFim1 представляет собой белок, сшивающий актиновые филаменты из Arabidopsis thaliana». Заводской журнал . 24 (5): 625–636. DOI : 10.1046 / j.1365-313x.2000.00907.x . PMID 11123801 .
- ^ а б Кларк Т.Г., Мерриам Р.В. (декабрь 1977 г.). «Диффузионные и связанные актиновые ядра ооцитов Xenopus laevis». Cell . 12 (4): 883–891. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (77) 90152-0 . PMID 563771 . S2CID 34708250 .
- ^ Хофманн WA (2009-01-01). Клеточная и молекулярная биология ядерного актина . Международный обзор клеточной и молекулярной биологии. 273 . С. 219–263. DOI : 10.1016 / S1937-6448 (08) 01806-6 . ISBN 9780123748041. PMID 19215906 .
- ^ Ульфертс С., Праджапати Б., Гросс Р., Вартиайнен М.К. (февраль 2021 г.). «Новые свойства и функции актиновых и актиновых филаментов внутри ядра» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 13 (3): a040121. DOI : 10.1101 / cshperspect.a040121 . PMC 7919393 . PMID 33288541 .
- ^ а б Bohnsack MT, Stüven T, Kuhn C, Cordes VC, Görlich D (март 2006 г.). «Избирательный блок ядерного экспорта актина стабилизирует гигантские ядра ооцитов Xenopus». Природа клеточной биологии . 8 (3): 257–263. DOI : 10.1038 / ncb1357 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0012-E6EB-9 . PMID 16489345 . S2CID 16529470 .
- ^ Dopie J, Skarp KP, Rajakylä EK, Tanhuanpää K, Vartiainen MK (февраль 2012 г.). «Активное поддержание ядерного актина импортином 9 поддерживает транскрипцию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (9): E544–552. DOI : 10.1073 / pnas.1118880109 . PMC 3295300 . PMID 22323606 .
- ^ Вада А., Фукуда М., Мисима М., Нисида Е. (март 1998 г.). «Ядерный экспорт актина: новый механизм, регулирующий субклеточную локализацию основного цитоскелетного белка» . Журнал EMBO . 17 (6): 1635–1641. DOI : 10.1093 / emboj / 17.6.1635 . PMC 1170511 . PMID 9501085 .
- ^ Stüven T, Hartmann E, Görlich D (ноябрь 2003 г.). «Exportin 6: новый ядерный экспортный рецептор, специфичный для комплексов profilin.actin» . Журнал EMBO . 22 (21): 5928–5940. DOI : 10,1093 / emboj / cdg565 . PMC 275422 . PMID 14592989 .
- ^ а б Hofmann WA, Arduini A, Nicol SM, Camacho CJ, Lessard JL, Fuller-Pace FV, de Lanerolle P (июль 2009 г.). «СУМОилирование ядерного актина» . Журнал клеточной биологии . 186 (2): 193–200. DOI : 10,1083 / jcb.200905016 . PMC 2717643 . PMID 19635839 .
- ^ а б Чхабра Д., дос Ремедиос К. Г. (сентябрь 2005 г.). «Кофилин, актин и их комплекс наблюдаются in vivo с использованием флуоресцентного резонансного переноса энергии» . Биофизический журнал . 89 (3): 1902–1908. Bibcode : 2005BpJ .... 89.1902C . DOI : 10.1529 / biophysj.105.062083 . PMC 1366693 . PMID 15994898 .
- ^ Макдональд Д., Карреро Дж., Андрин К., де Фрис Дж., Хендзель М. Дж. (Февраль 2006 г.). «Нуклеоплазматический бета-актин существует в динамическом равновесии между видами полимеров с низкой подвижностью и быстро диффундирующими популяциями» . Журнал клеточной биологии . 172 (4): 541–552. DOI : 10,1083 / jcb.200507101 . PMC 2063674 . PMID 16476775 .
- ^ Jockusch BM, Schoenenberger CA, Stetefeld J, Aebi U (август 2006 г.). «Отслеживание различных форм ядерного актина». Тенденции в клеточной биологии . 16 (8): 391–396. DOI : 10.1016 / j.tcb.2006.06.006 . PMID 16828286 .
- ^ а б в г Migocka-Patrzałek M, Makowiecka A, Nowak D, Mazur AJ, Hofmann WA, Malicka-Błaszkiewicz M (ноябрь 2015 г.). «β- и γ-актины в ядре клеток меланомы человека A375» . Гистохимия и клеточная биология . 144 (5): 417–428. DOI : 10.1007 / s00418-015-1349-8 . PMC 4628621 . PMID 26239425 .
- ^ Педерсон Т., Эби Ю. (2002-12-01). «Актин в ядре: в какой форме и для чего?». Журнал структурной биологии . 140 (1–3): 3–9. DOI : 10.1016 / s1047-8477 (02) 00528-2 . PMID 12490148 .
- ^ Bergeron SE, Zhu M, Thiem SM, Friderici KH, Rubenstein PA (май 2010 г.). «Различия в ион-зависимой полимеризации между бета- и гамма-немышечными изоформами актина млекопитающих» . Журнал биологической химии . 285 (21): 16087–16095. DOI : 10.1074 / jbc.M110.110130 . PMC 2871477 . PMID 20308063 .
- ^ Спенсер В.А. (сентябрь 2011 г.). «Ядерный актин: ключевой игрок во внеклеточном матриксе-ядерном взаимодействии» . Коммуникативная и интегративная биология . 4 (5): 511–512. DOI : 10,4161 / cib.16256 . PMC 3204115 . PMID 22046450 .
- ^ а б Чжао К., Ван В., Рандо О.Дж., Сюэ И., Свидерек К., Куо А., Крэбтри Г.Р. (ноябрь 1998 г.). «Быстрое и фосфоинозитол-зависимое связывание SWI / SNF-подобного комплекса BAF с хроматином после передачи сигналов рецептора Т-лимфоцитов». Cell . 95 (5): 625–636. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81633-5 . PMID 9845365 . S2CID 3184211 .
- ^ а б Hofmann WA, Stojiljkovic L, Fuchsova B, Vargas GM, Mavrommatis E, Philimonenko V, Kysela K, Goodrich JA, Lessard JL, Hope TJ, Hozak P, de Lanerolle P (ноябрь 2004 г.). «Актин является частью пре-инициаторных комплексов и необходим для транскрипции РНК-полимеразой II». Природа клеточной биологии . 6 (11): 1094–1101. DOI : 10.1038 / ncb1182 . PMID 15502823 . S2CID 23909479 .
- ^ а б Ху П., Ву С., Эрнандес Н. (декабрь 2004 г.). «Роль бета-актина в транскрипции РНК-полимеразы III» . Гены и развитие . 18 (24): 3010–3015. DOI : 10,1101 / gad.1250804 . PMC 535912 . PMID 15574586 .
- ^ а б Филимоненко В.В., Чжао Дж., Ибен С., Дингова Х., Кисела К., Кале М., Зентграф Х., Хофманн В.А., де Ланероль П., Хозак П., Груммт I. (декабрь 2004 г.). «Ядерный актин и миозин I необходимы для транскрипции РНК-полимеразы I. Природа клеточной биологии . 6 (12): 1165–1172. DOI : 10.1038 / ncb1190 . PMID 15558034 . S2CID 6633625 .
- ^ Маральди Н.М., Латтанци Дж., Мармироли С., Скварцони С., Манзоли Ф.А. (01.01.2004). «Новые роли ламинов, белков ядерной оболочки и актина в ядре». Достижения в регуляции ферментов . 44 : 155–172. DOI : 10.1016 / j.advenzreg.2003.11.005 . PMID 15581488 .
- ^ Tondeleir D, Lambrechts A, Müller M, Jonckheere V, Doll T, Vandamme D, Bakkali K, Waterschoot D, Lemaistre M, Debeir O, Decaestecker C, Hinz B, Staes A, Timmerman E, Colaert N, Gevaert K, Vandekerckhove J , Ampe C (август 2012 г.). «Клетки, лишенные β-актина, генетически перепрограммированы и сохраняют условную миграционную способность» . Молекулярная и клеточная протеомика . 11 (8): 255–271. DOI : 10.1074 / mcp.M111.015099 . PMC 3412960 . PMID 22448045 .
- ^ Холаска Дж. М., Ковальски А. К., Уилсон К. Л. (сентябрь 2004 г.). «Emerin покрывает заостренный конец актиновых нитей: свидетельство наличия актиновой корковой сети на внутренней ядерной мембране» . PLOS Биология . 2 (9): E231. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020231 . PMC 509406 . PMID 15328537 .
- ^ Пакельварц М., МакНалли Е.М. (01.01.2011). «Мышечная дистрофия Эмери – Дрейфуса». Мышечные дистрофии . Справочник по клинической неврологии. 101 . С. 155–166. DOI : 10.1016 / B978-0-08-045031-5.00012-8 . ISBN 9780080450315. PMID 21496632 .
- ^ Фарранц А.К. (июнь 2008 г.). «Ремоделирование хроматина и организация актина» . Письма FEBS . 582 (14): 2041–2050. DOI : 10.1016 / j.febslet.2008.04.032 . PMID 18442483 . S2CID 23147656 .
- ^ Шёлиндер М., Бьорк П., Седерберг Э., Сабри Н., Фаррант А. К., Visa N (август 2005 г.). «Растущая пре-мРНК рекрутирует актин и факторы, модифицирующие хроматин, в транскрипционно активные гены» . Гены и развитие . 19 (16): 1871–1884. DOI : 10,1101 / gad.339405 . PMC 1186187 . PMID 16103215 .
- ^ а б Percipalle P, Visa N (март 2006 г.). «Молекулярные функции ядерного актина в транскрипции» . Журнал клеточной биологии . 172 (7): 967–971. DOI : 10,1083 / jcb.200512083 . PMC 2063754 . PMID 16549500 .
- ^ Федорова Е., Цинк Д. (ноябрь 2008 г.). «Ядерная архитектура и генная регуляция». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1783 (11): 2174–2184. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2008.07.018 . PMID 18718493 .
- ^ Скарп К.П., Вартиайнен М.К. (август 2010 г.). «Актин на ДНК - древние и динамичные отношения» . Цитоскелет . 67 (8): 487–495. DOI : 10.1002 / cm.20464 . PMID 20593452 . S2CID 37763449 .
- ^ Олав И.А., Рек-Петерсон С.Л., Крэбтри Г.Р. (01.01.2002). «Ядерный актин и родственные актину белки в ремоделировании хроматина». Ежегодный обзор биохимии . 71 : 755–781. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135507 . PMID 12045110 .
- ^ Чжэн Б., Хань М., Бернье М., Вэнь Дж. К. (май 2009 г.). «Ядерный актин и актин-связывающие белки в регуляции транскрипции и экспрессии генов» . Журнал FEBS . 276 (10): 2669–2685. DOI : 10.1111 / j.1742-4658.2009.06986.x . PMC 2978034 . PMID 19459931 .
- ^ Феррай К., Наум-Онгания Г., Лонгобарди Е., Палаццоло М., Дисанза А., Диас В. М., Криппа М. П., Сцита Г., Блази Ф. (август 2009 г.). «Индукция транскрипции HoxB ретиноевой кислотой требует полимеризации актина» . Молекулярная биология клетки . 20 (15): 3543–3551. DOI : 10,1091 / mbc.E09-02-0114 . PMC 2719572 . PMID 19477923 .
- ^ Xu YZ, Thuraisingam T, Morais DA, Rola-Pleszczynski M, Radzioch D (март 2010 г.). «Ядерная транслокация бета-актина участвует в регуляции транскрипции во время дифференцировки макрофагов клеток HL-60» . Молекулярная биология клетки . 21 (5): 811–820. DOI : 10,1091 / mbc.E09-06-0534 . PMC 2828967 . PMID 20053683 .
- ^ а б Миямото К., Паске В., Джуллиен Дж., Гурдон Дж. Б. (май 2011 г.). «Ядерная полимеризация актина необходима для транскрипционного репрограммирования Oct4 ооцитами» . Гены и развитие . 25 (9): 946–958. DOI : 10,1101 / gad.615211 . PMC 3084028 . PMID 21536734 .
- ^ Хуанг В., Гислетти С., Сайджо К., Ганди М., Ауади М., Теш Г.Дж., Чжан Д.X., Яо Дж., Член парламента Чехии, Гуд Б.Л., Розенфельд М.Г., Glass CK (февраль 2011 г.). «Коронин 2А опосредует актин-зависимую дерепрессию генов воспалительной реакции» . Природа . 470 (7334): 414–418. Bibcode : 2011Natur.470..414H . DOI : 10,1038 / природа09703 . PMC 3464905 . PMID 21331046 .
- ^ Миямото К., Гурдон Дж. Б. (сентябрь 2011 г.). «Ядерный актин и активация транскрипции» . Коммуникативная и интегративная биология . 4 (5): 582–583. DOI : 10,4161 / cib.16491 . PMC 3204135 . PMID 22046469 .
- ^ Chuang CH, Carpenter AE, Fuchsova B, Johnson T., de Lanerolle P, Belmont AS (апрель 2006 г.). «Дальнее направленное движение интерфазного участка хромосомы». Текущая биология . 16 (8): 825–831. DOI : 10.1016 / j.cub.2006.03.059 . PMID 16631592 . S2CID 1191289 .
- ^ Hofmann WA, Vargas GM, Ramchandran R, Stojiljkovic L, Goodrich JA, de Lanerolle P (ноябрь 2006 г.). «Ядерный миозин I необходим для образования первой фосфодиэфирной связи во время инициации транскрипции РНК-полимеразой II». Журнал клеточной биохимии . 99 (4): 1001–1009. DOI : 10.1002 / jcb.21035 . PMID 16960872 . S2CID 39237955 .
- ^ Олсон Э. Н., Нордхайм А (май 2010 г.). «Связывание динамики актина и транскрипции генов для управления подвижными функциями клеток» . Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 11 (5): 353–365. DOI : 10.1038 / nrm2890 . PMC 3073350 . PMID 20414257 .
- ^ Miralles F, Posern G, Zaromytidou AI, Treisman R (май 2003 г.). «Динамика актина регулирует активность SRF, регулируя его коактиватор MAL». Cell . 113 (3): 329–342. CiteSeerX 10.1.1.327.7451 . DOI : 10.1016 / s0092-8674 (03) 00278-2 . PMID 12732141 . S2CID 17209744 .
- ^ Вартиайнен МК (июнь 2008 г.). «Динамика ядерного актина - от формы к функции». Письма FEBS . 582 (14): 2033–2040. DOI : 10.1016 / j.febslet.2008.04.010 . PMID 18423404 . S2CID 35474838 .
- ^ Knöll B (июнь 2010 г.). «Актин-опосредованная экспрессия гена в нейронах: связь MRTF-SRF». Биологическая химия . 391 (6): 591–597. DOI : 10.1515 / BC.2010.061 . PMID 20370316 . S2CID 36373214 .
- ^ Tsopoulidis N, Kaw S, Laketa V, Kutscheidt S, Baarlink C, Stolp B, Grosse R, Fackler OT (январь 2019 г.). «Формирование ядерной актиновой сети, инициируемое Т-клеточным рецептором, управляет эффекторными функциями CD4 + Т-клеток» . Sci Immunol . 4 (31): eaav1987. DOI : 10.1126 / sciimmunol.aav1987 . PMID 30610013 .
- ^ а б Купер, Джеффри М. (2000). «Актин, миозин и движение клеток» . Клетка (2-е изд.). Sinauer Associates. ISBN 978-0-87893-106-4.
- ^ de Luna AB, Staff VV, López-Sendón J, Attie F, Ezquerra EA (2003). Cardiología clínica . Elsevier España. ISBN 978-84-458-1179-5.
- ^ а б Доминичак М.Х., Бейнс Дж. (2005). Bioquimica Medica: con acceptso a Student Consult (испанский ред.). Elsevier Espana. ISBN 978-84-8174-866-6.
- ^ Фудзивара К., Портер М.Э., Поллард Т.Д. (октябрь 1978 г.). «Локализация альфа-актинина в борозде дробления при цитокинезе» . Журнал клеточной биологии . 79 (1): 268–275. DOI : 10,1083 / jcb.79.1.268 . PMC 2110217 . PMID 359574 .
- ^ Пелхам Р.Дж., Чанг Ф. (сентябрь 2002 г.). «Динамика актина в сократительном кольце во время цитокинеза у делящихся дрожжей». Природа . 419 (6902): 82–86. Bibcode : 2002Natur.419 ... 82P . DOI : 10,1038 / природа00999 . PMID 12214236 . S2CID 4389564 .
- ^ Машима Т., Наито М., Ногучи К., Миллер Д.К., Николсон Д.В., Цуруо Т. (март 1997 г.). «Расщепление актина СРР-32 / апопаином во время развития апоптоза» . Онкоген . 14 (9): 1007–1012. DOI : 10.1038 / sj.onc.1200919 . PMID 9070648 .
- ^ Ван К.К. (январь 2000 г.). «Кальпаин и каспасе: вы можете отличить?». Тенденции в неврологии . 23 (1): 20–26. DOI : 10.1016 / S0166-2236 (99) 01479-4 . PMID 10631785 . S2CID 17571984 .
- ^ Вилла PG, Хензель В.Дж., Сенсенбреннер М., Хендерсон С.Е., Петтманн Б. (март 1998 г.). «Ингибиторы кальпаина, но не ингибиторы каспаз, предотвращают протеолиз актина и фрагментацию ДНК во время апоптоза». Журнал клеточной науки . 111 (Pt 6): 713–722. PMID 9472000 .
- ^ Хуот Дж., Хоул Ф., Руссо С., Дешеснес Р.Г., Шах Г.М., Ландри Дж. (Ноябрь 1998 г.). «SAPK2 / p38-зависимая реорганизация F-актина регулирует раннее образование пузырей на мембране во время стресс-индуцированного апоптоза» . Журнал клеточной биологии . 143 (5): 1361–1373. DOI : 10.1083 / jcb.143.5.1361 . PMC 2133090 . PMID 9832563 .
- ^ Адамс К.Л., Нельсон В.Дж., Смит С.Дж. (декабрь 1996 г.). «Количественный анализ реорганизации кадгерин-катенин-актин при развитии межклеточной адгезии» . Журнал клеточной биологии . 135 (6 Pt 2): 1899–1911. DOI : 10,1083 / jcb.135.6.1899 . PMC 2133977 . PMID 8991100 .
- ^ Витке В., Шлейхер М., Ноегель А.А. (январь 1992 г.). «Избыточность в системе микрофиламентов: аномальное развитие клеток Dictyostelium, лишенных двух сшивающих белков F-актина». Cell . 68 (1): 53–62. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90205-Q . PMID 1732064 . S2CID 37569656 .
- ^ Фернандес-Валле С., Горман Д., Гомес А.М., Бунге МБ (январь 1997 г.). «Актин играет роль как в изменениях формы клеток, так и в экспрессии генов, связанных с миелинизацией шванновских клеток» . Журнал неврологии . 17 (1): 241–250. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.17-01-00241.1997 . PMC 6793673 . PMID 8987752 .
- ^ Волыняк MJ, Sundstrom P (октябрь 2007 г.). «Роль динамики цитоскелета актина в активации пути циклического АМФ и экспрессии гена HWP1 у Candida albicans» . Эукариотическая клетка . 6 (10): 1824–1840. DOI : 10.1128 / EC.00188-07 . PMC 2043390 . PMID 17715368 .
- ^ Танака Х., Игучи Н., Эгидио де Карвалью С., Тадокоро Й., Йомогида К., Нишимуне Й. (август 2003 г.). «Новые актин-подобные белки T-ACTIN 1 и T-ACTIN 2 по-разному экспрессируются в цитоплазме и ядре гаплоидных зародышевых клеток мыши» . Биология размножения . 69 (2): 475–482. DOI : 10.1095 / biolreprod.103.015867 . PMID 12672658 .
- ^ Цзян Ю.В., Стиллман ди-джей (март 1996 г.). «Эпигенетические эффекты на транскрипцию дрожжей, вызванные мутациями в связанном с актином белке, присутствующем в ядре» . Гены и развитие . 10 (5): 604–619. DOI : 10,1101 / gad.10.5.604 . PMID 8598290 .
- ^ Усадьба У, Качар Б (декабрь 2008 г.). «Динамическая регуляция длины сенсорных стереоцилий» . Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 19 (6): 502–510. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2008.07.006 . PMC 2650238 . PMID 18692583 .
- ^ Рзадзинская А.К., Шнайдер М.Э., Дэвис С., Риордан Г.П., Качар Б. (март 2004 г.). «Молекулярная беговая дорожка актина и миозины поддерживают функциональную архитектуру стереоцилий и самообновление» . Журнал клеточной биологии . 164 (6): 887–897. DOI : 10,1083 / jcb.200310055 . PMC 2172292 . PMID 15024034 .
- ^ Сюй Дж., Ван Кеймеулен А., Вакида Н.М., Карлтон П., Бернс М.В., Борн Х.Р. (май 2007 г.). «Полярность показывает внутреннюю хиральность клетки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (22): 9296–9300. Bibcode : 2007PNAS..104.9296X . DOI : 10.1073 / pnas.0703153104 . PMC 1890488 . PMID 17517645 .
- ^ Тамада А., Кавасе С., Мураками Ф., Камигучи Х. (февраль 2010 г.). «Автономное правостороннее вращение филоподий конуса роста приводит в движение нейриты» . Журнал клеточной биологии . 188 (3): 429–441. DOI : 10,1083 / jcb.200906043 . PMC 2819689 . PMID 20123994 .
- ^ Ван Л.К., Рональдсон К., Пак М., Тейлор Дж., Чжан Й., Гимбл Дж. М., Вунджак-Новакович Дж. (Июль 2011 г.). «Клетки млекопитающих с микропроцессором демонстрируют фенотип-специфичную лево-правую асимметрию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (30): 12295–12300. Bibcode : 2011PNAS..10812295W . DOI : 10.1073 / pnas.1103834108 . PMC 3145729 . PMID 21709270 .
- ^ Су А.И., Уилтшир Т., Баталов С., Лапп Х., Чинг К.А., Блок D, Чжан Дж., Соден Р., Хаякава М., Крейман Г., Кук М.П., Уокер Дж. Р., Хогенеш Дж. Б. (апрель 2004 г.). «Атлас генов транскриптомов, кодирующих белки человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (16): 6062–6067. Bibcode : 2004PNAS..101.6062S . DOI : 10.1073 / pnas.0400782101 . PMC 395923 . PMID 15075390 .
- ^ а б "ACTS_HUMAN" . P68133 . Консорциум UniProt. Архивировано 5 ноября 2012 года . Проверено 21 января 2013 .
- ^ а б Купание FS, Rommelaere H, Machesky LM (2007). «Фенотипы связанных с миопатией мутантов актина в дифференцированных мышечных трубках C2C12» . BMC Cell Biology . 8 (1): 2. DOI : 10,1186 / 1471-2121-8-2 . PMC 1779783 . PMID 17227580 .
- ^ Kaindl AM, Rüschendorf F, Krause S, Goebel HH, Koehler K, Becker C, Pongratz D, Müller-Höcker J, Nürnberg P, Stoltenburg-Didinger G, Lochmüller H, Huebner A (ноябрь 2004 г.). «Миссенс-мутации ACTA1 вызывают доминантную врожденную миопатию с ядрами» . Журнал медицинской генетики . 41 (11): 842–848. DOI : 10.1136 / jmg.2004.020271 . PMC 1735626 . PMID 15520409 .
- ^ Sparrow JC, Nowak KJ, Durling HJ, Beggs AH, Wallgren-Pettersson C, Romero N, Nonaka I, Laing NG (сентябрь 2003 г.). «Заболевание мышц, вызванное мутациями в гене альфа-актина скелетных мышц (ACTA1)». Нервно-мышечные расстройства . 13 (7–8): 519–531. DOI : 10.1016 / S0960-8966 (03) 00101-9 . PMID 12921789 . S2CID 20716 .
- ^ Норт К., Райан М. М. (2002). «Немалиновая миопатия» . В Pagon RA, Bird TD, Dolan CR, Stephens K, Adam MP (ред.). GeneReviews [Интернет] . Сиэтл (Вашингтон): Вашингтонский университет, Сиэтл. Архивировано 18 января 2017 года.
- ^ Ильковски Б., Новак К.Дж., Домазетовска А., Максвелл А.Л., Клемент С., Дэвис К.Э., Лейнг Н.Г., Норт К.Н., Купер СТ (август 2004 г.). «Доказательства доминантно-отрицательного эффекта при миопатии немалина ACTA1, вызванной аномальным сворачиванием, агрегацией и измененной полимеризацией мутантных изоформ актина» . Молекулярная генетика человека . 13 (16): 1727–1743. DOI : 10,1093 / HMG / ddh185 . PMID 15198992 .
- ^ Кларк Н.Ф., Ильковски Б., Купер С., Валова В.А., Робинсон П.Дж., Нонака И., Фенг Дж.Дж., Марстон С., Норт К. (июнь 2007 г.). «Патогенез ACTA1-связанной врожденной диспропорции типа волокон». Анналы неврологии . 61 (6): 552–561. DOI : 10.1002 / ana.21112 . PMID 17387733 . S2CID 11746835 .
- ^ а б Miwa T, Manabe Y, Kurokawa K, Kamada S, Kanda N, Bruns G, Ueyama H, Kakunaga T. (июнь 1991 г.). «Структура, расположение хромосом и экспрессия гена гамма-актина гладкой мускулатуры человека (кишечного типа): эволюция шести генов актина человека» . Молекулярная и клеточная биология . 11 (6): 3296–3306. DOI : 10.1128 / mcb.11.6.3296 . PMC 360182 . PMID 1710027 .
- ^ Уотсон МБ, Линд М.Дж., Смит Л., Дрю П.Дж., Коуквелл Л. (2007). «Анализ экспрессии микроматрицы выявляет гены, связанные с устойчивостью к цисплатину in vitro в модели клеточной линии». Acta Oncologica . 46 (5): 651–658. DOI : 10.1080 / 02841860601156157 . PMID 17562441 . S2CID 7163200 .
- ^ Гуо, округ Колумбия, Панну Х, Тран-Фадулу В., Папке К.Л., Ю РК, Авидан Н., Буржуа С., Эстрера А.Л., Сафи Х.Дж., Спаркс Е, Амор Д., Адес Л., МакКоннелл В., Уиллоуби К.Э., Абуэло Д., Виллинг М. Льюис Р.А., Ким Д.Х., Шерер С., Тунг П.П., Ан С., Буя Л.М., Раман С.С., Шете С.С., Милевич Д.М. (декабрь 2007 г.). «Мутации в альфа-актине гладких мышц (ACTA2) приводят к аневризмам и расслоениям грудной аорты». Генетика природы . 39 (12): 1488–1493. DOI : 10.1038 / ng.2007.6 . PMID 17994018 . S2CID 62785801 .
- ^ Guo DC, Papke CL, Tran-Fadulu V, Regalado ES, Avidan N, Johnson RJ, Kim DH, Pannu H, Willing MC, Sparks E, Pyeritz RE, Singh MN, Dalman RL, Grotta JC, Marian AJ, Boerwinkle EA, Frazier LQ, LeMaire SA, Coselli JS, Estrera AL, Safi HJ, Veeraraghavan S, Muzny DM, Wheeler DA, Willerson JT, Yu RK, Shete SS, Scherer SE, Raman CS, Buja LM, Milewicz DM (май 2009 г.). «Мутации в альфа-актине гладких мышц (ACTA2) вызывают ишемическую болезнь сердца, инсульт и болезнь Моямойи, наряду с заболеванием грудной аорты» . Американский журнал генетики человека . 84 (5): 617–627. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2009.04.007 . PMC 2680995 . PMID 19409525 .
- ^ Акполат Н., Яхси С., Годекмердан А., Ялниз М., Демирбаг К. (сентябрь 2005 г.). «Значение альфа-SMA в оценке тяжести фиброза печени при инфекции гепатита В и развитии цирроза: гистопатологическое и иммуногистохимическое исследование». Гистопатология . 47 (3): 276–280. DOI : 10.1111 / j.1365-2559.2005.02226.x . PMID 16115228 . S2CID 23800095 .
- ^ Хамада Х., Петрино М.Г., Какунага Т. (октябрь 1982 г.). «Молекулярная структура и эволюционное происхождение гена актина сердечной мышцы человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 79 (19): 5901–5905. Bibcode : 1982PNAS ... 79.5901H . DOI : 10.1073 / pnas.79.19.5901 . PMC 347018 . PMID 6310553 .
- ^ а б Olson TM, Michels VV, Thibodeau SN, Tai YS, Keating MT (май 1998 г.). «Мутации актина при дилатационной кардиомиопатии, наследственной форме сердечной недостаточности». Наука . 280 (5364): 750–752. Bibcode : 1998Sci ... 280..750O . DOI : 10.1126 / science.280.5364.750 . PMID 9563954 . S2CID 26971894 .
- ^ Ся XG, Чжоу Х., Сампер Э., Мелов С., Сюй З. (январь 2006 г.). «Экспрессируемая Pol II кшРНК подавляет экспрессию гена Sod2 и вызывает фенотип нокаута гена у мышей» . PLOS Genetics . 2 (1): e10. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0020010 . PMC 1358942 . PMID 16450009 .
- ^ Интернет Менделирующее наследование в человеке (OMIM): актин, альфа, сердечная мышца; ACTC1 - 102540
- ^ Матссон Х., Исон Дж., Bookwalter С.С., Клар Дж., Густавссон П., Суннегард Дж., Энелл Х., Йонзон А., Виккула М., Гутьеррес I, Гранадос-Риверон Дж., Поуп М., Бу'лок Ф, Кокс Дж., Робинсон Т. Э., Песня F, Brook DJ, Marston S, Trybus KM, Dahl N (январь 2008 г.). «Мутации альфа-сердечного актина вызывают дефекты межпредсердной перегородки» . Молекулярная генетика человека . 17 (2): 256–265. DOI : 10,1093 / HMG / ddm302 . PMID 17947298 .
- ^ Кабаева, Жылдыз (11 ноября 2002 г.). Генетический анализ при гипертрофической кардиомиопатии (Дис.). DOI : 10.18452 / 14800 .
- ^ Olson TM, Doan TP, Kishimoto NY, Whitby FG, Ackerman MJ, Fananapazir L (сентябрь 2000 г.). «Унаследованные и de novo мутации в гене сердечного актина вызывают гипертрофическую кардиомиопатию». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии . 32 (9): 1687–1694. DOI : 10,1006 / jmcc.2000.1204 . PMID 10966831 .
- ^ Рамирес, Карлос Дарио; Падрон, Рауль (2004). «Кардиомиопатия гипертрофическая знакомая: гены, mutaciones y modelos animales. Revisión» [Семейная гипертрофическая кардиомиопатия: гены, мутации и модели на животных. Обзор]. Investigación Clínica (на испанском языке). 45 (1): 69–100.
- ^ Каски Дж. П., Сиррис П., Берч М., Томе-Эстебан М. Т., Фентон М., Кристиансен М., Андерсен П. С., Себир Н., Эшворт М., Динфилд Дж. Э., МакКенна В. Дж., Эллиотт П. М. (ноябрь 2008 г.). «Идиопатическая рестриктивная кардиомиопатия у детей вызвана мутациями в генах сердечного саркомера». Сердце . 94 (11): 1478–1484. DOI : 10.1136 / hrt.2007.134684 . PMID 18467357 . S2CID 44257334 .
- ^ Пиготт Т.Дж., Джефферсон Д. (1991). «Идиопатический паралич общего малоберцового нерва - обзор тринадцати случаев». Британский журнал нейрохирургии . 5 (1): 7–11. DOI : 10.3109 / 02688699108998440 . PMID 1850600 .
- ^ «Ген: ACTB» . AceView . Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI). Архивировано 18 июня 2013 года . Проверено 21 января 2013 .
- ^ Chang KW, Yang PY, Lai HY, Yeh TS, Chen TC, Yeh CT (сентябрь 2006 г.). «Идентификация новой изоформы актина при гепатоцеллюлярной карциноме». Гепатологические исследования . 36 (1): 33–39. DOI : 10.1016 / j.hepres.2006.05.003 . PMID 16824795 .
- ^ Уильямс К.Л., Рахимтула М., Меаров К.М. (2005). «Hsp27 и рост аксонов во взрослых сенсорных нейронах in vitro» . BMC Neuroscience . 6 (1): 24. DOI : 10,1186 / 1471-2202-6-24 . PMC 1087488 . PMID 15819993 .
- ^ «Опухоли мягких тканей: перицитома с t (7; 12)» . Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии . Университетская клиника Пуатье. Архивировано 30 декабря 2008 года . Проверено 21 января 2013 .
- ^ Procaccio V, Salazar G, Ono S, Styers ML, Gearing M, Davila A, Jimenez R, Juncos J, Gutekunst CA, Meroni G, Fontanella B, Sontag E, Sontag JM, Faundez V, Wainer BH (июнь 2006 г.). «Мутация бета-актина, которая изменяет динамику деполимеризации, связана с аутосомно-доминантными пороками развития, глухотой и дистонией» . Американский журнал генетики человека . 78 (6): 947–960. DOI : 10.1086 / 504271 . PMC 1474101 . PMID 16685646 .
- ^ Нунои Х., Ямадзаки Т., Цутия Х., Като С., Малеч Х.Л., Мацуда И., Канегасаки С. (июль 1999 г.). «Гетерозиготная мутация бета-актина, связанная с дисфункцией нейтрофилов и рецидивирующей инфекцией» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (15): 8693–8698. Bibcode : 1999PNAS ... 96.8693N . DOI : 10.1073 / pnas.96.15.8693 . PMC 17578 . PMID 10411937 .
- ^ а б «Ген: ACTG1» . AceView . Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI). Архивировано 18 июня 2013 года . Проверено 21 января 2013 .
- ^ Эрба Х.П., Ганнинг П., Кедес Л. (июль 1986 г.). «Нуклеотидная последовательность мРНК человеческого гамма-цитоскелета актина: аномальная эволюция немышечных генов актина позвоночных» . Исследования нуклеиновых кислот . 14 (13): 5275–5294. DOI : 10.1093 / NAR / 14.13.5275 . PMC 311540 . PMID 3737401 .
- ^ Брайан К.Е., Рубинштейн П.А. (июль 2009 г.). «Аллель-специфические эффекты мутаций гамма-актина глухоты человека (DFNA20 / 26) на взаимодействие актин / кофилин» . Журнал биологической химии . 284 (27): 18260–18269. DOI : 10.1074 / jbc.M109.015818 . PMC 2709362 . PMID 19419963 .
- ^ Зоннеманн К.Дж., Фицсимонс Д.П., Патель-младший, Лю Ю., Шнайдер М.Ф., Мосс Р.Л., Эрвасти Дж.М. (сентябрь 2006 г.). «Цитоплазматический гамма-актин не требуется для развития скелетных мышц, но его отсутствие приводит к прогрессирующей миопатии». Клетка развития . 11 (3): 387–397. DOI : 10.1016 / j.devcel.2006.07.001 . PMID 16950128 .
- ^ Gouin, E .; Gantelet, H .; Egile, C .; Lasa, I .; Ohayon, H .; Villiers, V .; Gounon, P .; Sansonetti, PJ; Коссарт, П. (1 июня 1999 г.). «Сравнительное исследование актиновой подвижности патогенных бактерий Listeria monocytogenes, Shigella flexneri и Rickettsia conorii» . Журнал клеточной науки . 112 (11): 1697–1708. PMID 10318762 .
- ^ Lambrechts A, Gevaert K, Cossart P, Vandekerckhove J, Van Troys M (май 2008 г.). «Кометные хвосты Listeria: действующий механизм подвижности на основе актина». Тенденции в клеточной биологии . 18 (5): 220–227. DOI : 10.1016 / j.tcb.2008.03.001 . PMID 18396046 .
- ^ Гуин Э., Велч, доктор медицины, Коссарт П. (февраль 2005 г.). «Актиновая подвижность внутриклеточных возбудителей». Текущее мнение в микробиологии . 8 (1): 35–45. DOI : 10.1016 / j.mib.2004.12.013 . PMID 15694855 .
- ^ Parks QM, Young RL, Poch KR, Malcolm KC, Vasil ML, Nick JA (апрель 2009 г.). «Повышение нейтрофилов в развитии биопленки Pseudomonas aeruginosa: человеческий F-актин и ДНК в качестве мишеней для терапии» . Журнал медицинской микробиологии . 58 (Pt 4): 492–502. DOI : 10,1099 / jmm.0.005728-0 . PMC 2677169 . PMID 19273646 .
- ^ Лю Ю., Белкина Н.В., Шоу С. (2009). «ВИЧ-инфекция Т-клеток: входящий актин и выходящий актин» . Научная сигнализация . 2 (66): pe23. DOI : 10.1126 / scisignal.266pe23 . PMID 19366992 . S2CID 30259258 .
- ^ Machesky LM, Tang HR (июль 2009 г.). «Актиновые протрузии: промоторы или ингибиторы инвазии рака?». Раковая клетка . 16 (1): 5–7. DOI : 10.1016 / j.ccr.2009.06.009 . PMID 19573806 .
- ^ Эриксон HP (июль 2007 г.). «Эволюция цитоскелета» . BioEssays . 29 (7): 668–677. DOI : 10.1002 / bies.20601 . PMC 2630885 . PMID 17563102 .
- ^ Гардинер Дж., Макги П., Общий Р., Марк Дж. (2008). «Являются ли гистоны, тубулин и актин производными от общего предкового белка?». Протоплазма . 233 (1–2): 1–5. DOI : 10.1007 / s00709-008-0305-Z . PMID 18615236 . S2CID 21765920 .
- ^ Галлетта Б.Дж., Купер Д.А. (февраль 2009 г.). «Актин и эндоцитоз: механизмы и филогения» . Текущее мнение в клеточной биологии . 21 (1): 20–27. DOI : 10.1016 / j.ceb.2009.01.006 . PMC 2670849 . PMID 19186047 .
- ^ Попп Д., Нарита А., Маэда К., Фудзисава Т., Гошдастидер У., Иваса М., Маеда Й., Робинсон Р.К. (май 2010 г.). «Структура волокна, организация и динамика в листах MreB» . Журнал биологической химии . 285 (21): 15858–15865. DOI : 10.1074 / jbc.M109.095901 . PMC 2871453 . PMID 20223832 .
- ^ ван ден Энт Ф, Амос Л.А., Лёве Дж. (сентябрь 2001 г.). «Прокариотическое происхождение актинового цитоскелета». Природа . 413 (6851): 39–44. Bibcode : 2001Natur.413 ... 39V . DOI : 10.1038 / 35092500 . PMID 11544518 . S2CID 4427828 .
- ^ Карбаллидо-Лопес Р. (декабрь 2006 г.). «Бактериальный актиноподобный цитоскелет» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 70 (4): 888–909. DOI : 10.1128 / MMBR.00014-06 . PMC 1698507 . PMID 17158703 .
- ^ Попп Д., Сюй В., Нарита А., Брзоска А.Дж., Скуррей Р.А., Ферт Н., Гошдастидер У., Гошдастидер У., Маеда Й., Робинсон Р.К., Шумахер М.А. (март 2010 г.). «Структура и динамика филаментов актин-подобного белка ParM pSK41: значение для сегрегации плазмидной ДНК» . Журнал биологической химии . 285 (13): 10130–10140. DOI : 10.1074 / jbc.M109.071613 . PMC 2843175 . PMID 20106979 .
- ^ Попп Д., Нарита А., Гошдастидер У., Маеда К., Маеда Й, Ода Т., Фудзисава Т., Ониши Х., Ито К., Робинсон Р.К. (апрель 2010 г.). «Полимерные структуры и динамические свойства бактериального актина AlfA». Журнал молекулярной биологии . 397 (4): 1031–1041. DOI : 10.1016 / j.jmb.2010.02.010 . PMID 20156449 .
- ^ Попп Д., Нарита А., Ли Л.Дж., Гошдастидер Ю., Сюэ Б., Сринивасан Р., Баласубраманиан М.К., Танака Т., Робинсон Р.К. (июнь 2012 г.). «Новая актин-подобная структура филаментов из Clostridium tetani» . Журнал биологической химии . 287 (25): 21121–21129. DOI : 10.1074 / jbc.M112.341016 . PMC 3375535 . PMID 22514279 .
- ^ Хесс Х, Клемменс Дж, Цинь Д., Ховард Дж, Фогель В. (2001). «Управляемые светом молекулярные челноки из моторных белков, переносящие грузы на искусственно созданных поверхностях». Нано-буквы . 1 (5): 235–239. Bibcode : 2001NanoL ... 1..235H . DOI : 10.1021 / nl015521e .
- ^ Манссон А., Сундберг М., Банк Р., Балаз М., Николлс И.А., Омлинг П., Тегенфельдт Дж. О., Тагеруд С., Монтелиус Л. (2005). «Молекулярные двигатели на основе актина для грузовых перевозок в нанотехнологиях - возможности и проблемы». IEEE Transactions on Advanced Packaging . 28 (4): 547–555. DOI : 10,1109 / TADVP.2005.858309 . S2CID 33608087 .
- ^ Шарма С., Ханукоглу I (2019). «Картирование участков локализации эпителиального натриевого канала (ENaC) и CFTR в сегментах придатка яичка млекопитающих». Журнал молекулярной гистологии . 50 (2): 141–154. DOI : 10.1007 / s10735-019-09813-3 . PMID 30659401 . S2CID 58026884 .
- ^ Vandesompele J, De Preter K, Pattyn F, Poppe B, Van Roy N, De Paepe A, Speleman F (июнь 2002 г.). «Точная нормализация количественных данных ОТ-ПЦР в реальном времени путем геометрического усреднения нескольких генов внутреннего контроля» . Геномная биология . 3 (7): ИССЛЕДОВАНИЕ0034. DOI : 10.1186 / GB-2002-3-7-research0034 . PMC 126239 . PMID 12184808 .
- ^ Селви С., Томпсон Е. В., Маттей К., Ли Р. А., Ирвинг М. Г., Гриффитс Л. Р. (октябрь 2001 г.). «Бета-актин - неподходящий внутренний контроль для ОТ-ПЦР» . Молекулярные и клеточные зонды . 15 (5): 307–311. DOI : 10.1006 / mcpr.2001.0376 . PMID 11735303 .
- ^ Мукаи К., Шоллмейер СП, Розай Дж. (Январь 1981 г.). «Иммуногистохимическая локализация актина: применение в хирургической патологии». Американский журнал хирургической патологии . 5 (1): 91–97. DOI : 10.1097 / 00000478-198101000-00013 . PMID 7018275 .
- ^ Хаддад Ф., Рой Р.Р., Чжун Х., Эджертон В.Р., Болдуин К.М. (август 2003 г.). «Атрофические реакции на мышечную бездействие. II. Молекулярные маркеры белкового дефицита». Журнал прикладной физиологии . 95 (2): 791–802. DOI : 10.1152 / japplphysiol.01113.2002 . PMID 12716877 . S2CID 8268572 .
- ^ Hocquette JF, Lehnert S, Barendse W, Cassar-Malek I, Picard B (2006). «Современные достижения в протеомном анализе и его использовании для определения качества мяса птицы». Журнал World's Poultry Science Journal . 62 (1): 123–130. DOI : 10,1079 / WPS200589 . S2CID 86189373 .
- ^ Нолле Л. (2004). «Методы и инструменты прикладного анализа пищевых продуктов». Справочник по анализу пищевых продуктов . 3 (2-е изд.). Нью-Йорк, Нью-Йорк: Марсель Деккер. С. 1741–2226. ISBN 978-0-8247-5039-8.
Внешние ссылки
- Методы окрашивания актином (окрашивание живых и фиксированных клеток)
- Ресурсный мотив Eukaryotic Linear Motif, класс LIG_Actin_RPEL_3
- Ресурсный мотив Eukaryotic Linear Motif, класс LIG_Actin_WH2_1
- Ресурсный мотив Eukaryotic Linear Motif, класс LIG_Actin_WH2_2
- Трехмерные макромолекулярные структуры актиновых филаментов из EM Data Bank (EMDB)
