ДНК


Дезоксирибонуклеиновая кислота ( / d ˈ ɒ k s ɪ ˌ r b nj ˌ k l ɪ k , - ˌ k l -/ ( слушайте )значок динамика ; [1] ДНК ) представляет собой полимер , состоящий из двух полинуклеотидных цепей, которые закручиваются друг вокруг друга, образуя двойную спираль , несущую генетические инструкции для развития, функционирования, роста иразмножение всех известных организмов и многих вирусов . ДНК и рибонуклеиновая кислота (РНК) являются нуклеиновыми кислотами . Наряду с белками , липидами и сложными углеводами ( полисахаридами ) нуклеиновые кислоты являются одним из четырех основных типов макромолекул , необходимых для всех известных форм жизни .

Две нити ДНК известны как полинуклеотиды , поскольку они состоят из более простых мономерных единиц, называемых нуклеотидами . [2] [3] Каждый нуклеотид состоит из одного из четырех азотсодержащих азотистых оснований ( цитозин [C], гуанин [G], аденин [A] или тимин [T]), сахара , называемого дезоксирибозой , и фосфатной группы . Нуклеотиды соединены друг с другом в цепочку ковалентными связями .(известная как фосфо-диэфирная связь) между сахаром одного нуклеотида и фосфатом следующего, что приводит к чередованию сахаро-фосфатного остова . Азотистые основания двух отдельных полинуклеотидных цепей связаны друг с другом в соответствии с правилами спаривания оснований (А с Т и С с G) водородными связями , образуя двухцепочечную ДНК. Комплементарные азотистые основания делятся на две группы: пиримидины и пурины . В ДНК пиримидинами являются тимин и цитозин; пурины – аденин и гуанин.

Обе нити двухцепочечной ДНК хранят одну и ту же биологическую информацию . Эта информация реплицируется , когда две нити расходятся. Большая часть ДНК (более 98% для человека) некодирующая , а это означает, что эти участки не служат паттернами для белковых последовательностей . Две нити ДНК идут в противоположных направлениях друг к другу и, таким образом, антипараллельны . К каждому сахару присоединен один из четырех типов азотистых оснований (или оснований ). Именно последовательность этих четырех азотистых оснований вдоль остова кодирует генетическую информацию. Цепи РНК создаются с использованием цепей ДНК в качестве шаблона в процессе, называемом транскрипцией ., где основания ДНК заменены на соответствующие им основания, за исключением случая тимина (Т), для которого РНК заменяет урацил (U). [4] Под генетическим кодом эти нити РНК определяют последовательность аминокислот в белках в процессе, называемом трансляцией .

В эукариотических клетках ДНК организована в виде длинных структур, называемых хромосомами . Перед типичным клеточным делением эти хромосомы удваиваются в процессе репликации ДНК , обеспечивая полный набор хромосом для каждой дочерней клетки. Эукариотические организмы ( животные , растения , грибы и протисты ) хранят большую часть своей ДНК внутри клеточного ядра в виде ядерной ДНК , а часть в митохондриях в виде митохондриальной ДНК или в хлоропластах в виде хлоропластной ДНК . [5]Напротив, прокариоты ( бактерии и археи ) хранят свою ДНК только в цитоплазме , в кольцевых хромосомах . В эукариотических хромосомах белки хроматина , такие как гистоны , уплотняют и организуют ДНК. Эти уплотняющие структуры управляют взаимодействиями между ДНК и другими белками, помогая контролировать, какие части ДНК транскрибируются.


Строение двойной спирали ДНК . Атомы в структуре имеют цветовую кодировку элемента , а подробные структуры двух пар оснований показаны в правом нижнем углу.
Химическая структура ДНК; водородные связи показаны пунктирными линиями. Каждый конец двойной спирали имеет открытую 5'-фосфатную группу на одной цепи и открытую 3'-гидроксильную группу (-ОН) на другой.
Участок ДНК. Основания лежат горизонтально между двумя спиралевидными нитями [15] ( анимационная версия ).
Большие и малые борозды ДНК. Последний является сайтом связывания красителя Hoechst 33258.
Слева направо структуры ДНК A, B и Z.
Квадруплекс ДНК, образованный повторами теломер . Петельчатая конформация остова ДНК сильно отличается от типичной спирали ДНК. Зеленые сферы в центре представляют собой ионы калия. [59]
Ковалентный аддукт между метаболически активированной формой бензо[ а ]пирена , основного мутагена табачного дыма , и ДНК [74]
Расположение ядерной ДНК эукариот в хромосомах
РНК-полимераза Т7 (синий) производит мРНК (зеленый) из матрицы ДНК (оранжевый) [93]
Репликация ДНК: двойная спираль раскручивается геликазой и топоизомеразой . Затем одна ДНК-полимераза производит копию ведущей цепи . Другая ДНК-полимераза связывается с отстающей цепью . Этот фермент образует прерывистые сегменты (называемые фрагментами Оказаки ) до того , как ДНК-лигаза соединит их вместе.
Взаимодействие ДНК (оранжевый) с гистонами (синий). Основные аминокислоты этих белков связываются с кислыми фосфатными группами ДНК.
Фактор транскрипции спираль-поворот-спираль лямбда-репрессора , связанный со своей ДНК-мишенью [116]
Рестриктаз EcoRV ( зеленый ) в комплексе со своей ДНК-субстратом [120]
Рекомбинация включает разрыв и воссоединение двух хромосом (M и F) с образованием двух перестроенных хромосом (C1 и C2).
Структура ДНК слева (показана схема) самособерется в структуру, визуализируемую с помощью атомно-силовой микроскопии справа. Нанотехнология ДНК — это область, которая занимается проектированием наноразмерных структур с использованием свойств молекулярного распознавания молекул ДНК. [170]
Маклин Маккарти (слева) обменивается рукопожатием с Фрэнсисом Криком и Джеймсом Уотсоном , соавторами модели двойной спирали.
Карандашный набросок двойной спирали ДНК, сделанный Фрэнсисом Криком в 1953 году.
Голубая табличка возле паба The Eagle в память о Крике и Уотсоне .