Таксономия (биология)
Это хорошая статья. Для получения дополнительной информации нажмите здесь.
Страница защищена ожидающими изменениями
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из научной классификации )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Не путать с таксидермией .
Смотрите также: Таксономический ранг

Часть серии о
Эволюционная биология
Вьюрки Дарвина, автор Gould.jpg
Вьюрки Дарвина Джона Гулда
Процессы и результаты
Естественная история
История эволюционной теории
  • Обзор
  • эпоха Возрождения
  • До Дарвина
  • Дарвин
  • Происхождение видов
  • Перед синтезом
  • Современный синтез
  • Молекулярная эволюция
  • Эво-дево
  • Текущее исследование
  • История видообразования
  • История палеонтологии ( хронология )
Поля и приложения
  • Приложения эволюции
  • Биосоциальная криминология
  • Экологическая генетика
  • Эволюционная эстетика
  • Эволюционная антропология
  • Эволюционные вычисления
  • Эволюционная экология
  • Эволюционная экономика
  • Эволюционная эпистемология
  • Эволюционная этика
  • Эволюционная теория игр
  • Эволюционная лингвистика
  • Эволюционная медицина
  • Эволюционная нейронаука
  • Эволюционная физиология
  • Эволюционная психология
  • Экспериментальная эволюция
  • Филогенетика
  • Палеонтология
  • Селекция
  • Эксперименты по видообразованию
  • Социобиология
  • Систематика
  • Универсальный дарвинизм
Социальные последствия
  • Эволюция как факт и теория
  • Социальные эффекты
  • Споры о сотворении и эволюции
  • Теистическая эволюция
  • Возражения против эволюции
  • Уровень поддержки
  •  Портал эволюционной биологии
  •  Категория
  • похожие темы
  • в
  • т
  • е

В биологии таксономия ( от древнегреческого τάξις ( таксис )  «расположение» и -νομία ( -номия )  « метод ») представляет собой научное исследование именования, определения ( очерчивания ) и классификации групп биологических организмов на основе общих характеристик. Организмы группируются в таксоны (единственное число: таксон), и этим группам присваивается таксономический ранг . ; группы данного ранга могут быть объединены, чтобы сформировать более инклюзивную группу более высокого ранга, таким образом создавая таксономическую иерархию. Основные ранги в современном использовании: область , царство , тип ( подразделение иногда используется в ботанике вместо типа ), класс , порядок , семейство , род и вид . Шведский ботаник Карл Линней считается основателем современной системы таксономии, поскольку он разработал ранжированную систему, известную как линнеевская таксономия , для классификации организмов и биномиальной номенклатуры.для обозначения организмов.

Благодаря достижениям в области теории, данных и аналитических технологий биологической систематики система Линнея превратилась в систему современной биологической классификации, предназначенной для отражения эволюционных отношений между организмами, как живыми, так и вымершими.

Определение

Точное определение таксономии варьируется от источника к источнику, но суть дисциплины остается неизменной: концепция, наименование и классификация групп организмов. [1] В качестве ориентира, последние определения таксономии представлены ниже:

  1. Теория и практика группировки особей в виды, объединения видов в более крупные группы и присвоения этим группам названий с целью создания классификации. [2]
  2. Область науки (и основной компонент систематики ), которая охватывает описание, идентификацию, номенклатуру и классификацию [3] .
  3. Наука о классификации, в биологии расположение организмов в классификации [4]
  4. «Наука о классификации применительно к живым организмам, в том числе изучение способов образования видов и т. д.». [5]
  5. «Анализ характеристик организма с целью классификации» [6]
  6. «Систематика изучает филогенез , чтобы обеспечить модель, которую можно перевести в классификацию и названия более всеобъемлющей области таксономии» (указано как желательное, но необычное определение) [7]

Разнообразные определения либо помещают таксономию в область систематики (определение 2), либо переворачивают это отношение (определение 6), либо рассматривают два термина как синонимы. Существуют некоторые разногласия относительно того , считается ли биологическая номенклатура частью таксономии (определения 1 и 2) или частью систематики вне таксономии. [8] Например, определение 6 сочетается со следующим определением систематики, которое ставит номенклатуру за пределы таксономии: [6]

  • Систематика : «Изучение идентификации, таксономии и номенклатуры организмов, включая классификацию живых существ в отношении их естественных отношений и изучение вариаций и эволюции таксонов».

В 1970 г. Миченер и соавт. определили «систематическую биологию» и «таксономию» (термины, которые часто путают и используют взаимозаменяемо) по отношению друг к другу следующим образом: [9]

Систематическая биология (далее просто систематика) — это область, которая (а) дает научные названия для организмов, (б) описывает их, (в) сохраняет их коллекции, (г) предоставляет классификации организмов, ключи для их идентификации и данные об их распространении, (e) исследует их эволюционную историю и (f) рассматривает их адаптацию к окружающей среде. Это область с долгой историей, которая в последние годы пережила заметный ренессанс, главным образом в отношении теоретического содержания. Часть теоретического материала относится к эволюционным областям (темы д и е выше), остальная часть относится, в частности, к проблеме классификации. Таксономия - это часть систематики, связанная с темами (а) - (г) выше.

Целый набор терминов, включая таксономию, систематическую биологию, систематику, биосистематику, научную классификацию, биологическую классификацию и филогенетику , иногда имел перекрывающиеся значения - иногда одинаковые, иногда немного разные, но всегда связанные и пересекающиеся. [1] [10] Здесь используется самое широкое значение термина «таксономия». Сам термин был введен в 1813 году де Кандолем в его «Элементарной теории ботаники » . [11] Джон Линдли дал раннее определение систематики в 1830 году, хотя он писал о «систематической ботанике», а не использовал термин «систематика». [12]Европейцы склонны использовать термины «систематика» и «биосистематика» для изучения биоразнообразия в целом, тогда как жители Северной Америки чаще используют «таксономию». [13] Тем не менее, таксономия, и в частности альфа-таксономия , представляет собой, в частности, идентификацию, описание и наименование (т.е. номенклатуру) организмов, [14] в то время как «классификация» фокусируется на размещении организмов в иерархических группах, которые показывают их отношения к другим организмы.

Монография и таксономическая редакция

Таксономическая ревизия или таксономический обзор — это новый анализ моделей изменчивости в конкретном таксоне . Этот анализ может быть выполнен на основе любой комбинации различных доступных видов признаков, таких как морфологические, анатомические, палинологические, биохимические и генетические. Монография _или полная ревизия - это ревизия, которая является всеобъемлющей для таксона в отношении информации, предоставленной в определенное время и для всего мира. Другие (частичные) версии могут быть ограничены в том смысле, что они могут использовать только некоторые из доступных наборов символов или иметь ограниченный пространственный охват. Пересмотр приводит к уточнению или новому пониманию отношений между подтаксонами внутри изучаемого таксона, что может привести к изменению классификации этих подтаксонов, идентификации новых подтаксонов или слиянию предыдущих подтаксонов. [15]

Таксономические признаки

Таксономические признаки - это таксономические атрибуты, которые можно использовать для предоставления доказательств, на основании которых выводятся отношения ( филогенез ) между таксонами. [16] Виды таксономических признаков включают: [17]

Альфа и бета таксономия

Не путать с альфа-разнообразием .

Термин « альфа-таксономия » в основном используется сегодня для обозначения дисциплины поиска, описания и именования таксонов , особенно видов. [18] В более ранней литературе этот термин имел другое значение, относящееся к морфологической таксономии и результатам исследований до конца 19 века. [19]

Уильям Бертрам Террилл ввел термин «альфа-таксономия» в серии статей, опубликованных в 1935 и 1937 годах, в которых он обсуждал философию и возможные будущие направления дисциплины таксономии. [20]

... среди таксономистов растет желание рассматривать свои проблемы с более широкой точки зрения, исследовать возможности более тесного сотрудничества со своими коллегами в области цитологии, экологии и генетики и признать, что некоторый пересмотр или расширение, возможно, радикального характера, их целей и методов, может быть желательным ... Террилл (1935) предположил, что, принимая старую бесценную таксономию, основанную на структуре и удобно обозначенную «альфа», можно увидеть отдаленную таксономию, построенную на как как можно более широкую основу морфологических и физиологических фактов, и такую, в которой «найдется место для всех данных наблюдений и экспериментов, относящихся, хотя бы косвенно, к строению, подразделению, происхождению и поведению видов и других таксономических групп». Идеалы могут, можно сказать, никогда не быть полностью реализованным. Однако они обладают большой ценностью, поскольку действуют как постоянные стимуляторы, и если у нас есть некий, пусть даже смутный, идеал таксономии «омега», мы можем немного продвинуться вниз по греческому алфавиту. Некоторые из нас радуют себя, думая, что сейчас мы нащупываем «бета» таксономию.[20]

Таким образом, Террилл явно исключает из альфа-таксономии различные области исследований, которые он включает в таксономию в целом, такие как экология, физиология, генетика и цитология. Далее он исключает филогенетическую реконструкцию из альфа-таксономии. [21]

Более поздние авторы использовали этот термин в другом смысле, чтобы обозначить разграничение видов (не подвидов или таксонов других рангов) с использованием любых доступных методов исследования, включая сложные вычислительные или лабораторные методы. [22] [18] Так, Эрнст Майр в 1968 г. определил « бета-таксономию » как классификацию рангов выше видов. [23]

Понимание биологического смысла изменчивости и эволюционного происхождения групп родственных видов еще более важно для второго этапа таксономической деятельности, разделения видов на группы родственников («таксонов») и их расположения в иерархии видов. более высокие категории. Именно эту деятельность обозначает термин «классификация»; его также называют «бета-таксономией».

Микротаксономия и макротаксономия

Основная статья: Проблема видов

То, как следует определять виды в конкретной группе организмов, порождает практические и теоретические проблемы, которые называются проблемой видов . Научная работа по определению способов определения видов получила название микротаксономии. [24] [25] [18] [ ненадежный источник? ] В более широком смысле макротаксономия - это изучение групп более высокого таксономического ранга подрода и выше. [18]

История

Хотя некоторые описания таксономической истории пытаются датировать таксономию древними цивилизациями, по-настоящему научная попытка классифицировать организмы не предпринималась до 18 века. Более ранние работы были в основном описательными и были сосредоточены на растениях, которые использовались в сельском хозяйстве или медицине. В этом научном мышлении есть ряд этапов. Ранняя таксономия была основана на произвольных критериях, так называемых «искусственных системах», включая систему Линнея половой классификации растений (классификация животных Линнея 1735 г. называлась « Systema Naturae »).(«Система природы»), подразумевая, что он, по крайней мере, считал ее чем-то большим, чем «искусственная система»). системы», такие как классификации де Жюссье (1789 г. ) , де Кандоля (1813 г.) и Бентама и Хукера (1862–1863 гг.). «Происхождение видов» (1859 г.) привело к новому объяснению классификаций, основанному на эволюционных отношениях.Это была концепция филетических систем, начиная с 1883 г.Этот подход характерен для Эйхлера .(1883 г.) и Энглер (1886–1892 гг.). Появление кладистической методологии в 1970-х годах привело к классификациям, основанным на единственном критерии монофилии , поддерживаемом наличием синапоморфий . С тех пор доказательная база была расширена за счет данных молекулярной генетики , которые по большей части дополняют традиционную морфологию . [26] [ нужна страница ] [27] [ нужна страница ] [28] [ нужна страница ]

долиннеевский

Ранние систематики

Именование и классификация человеческого окружения, вероятно, начались с появлением языка. Отличие ядовитых растений от съедобных является неотъемлемой частью выживания человеческих сообществ. Иллюстрации лекарственных растений появляются на египетских настенных росписях ок. 1500 г. до н.э., что указывает на понимание использования различных видов и наличие базовой таксономии. [29]

Древние времена

Дополнительная информация: биология Аристотеля § Классификация.
Описание редких животных (写生珍禽图) художника династии Сун Хуан Цюаня (903–965).

Впервые организмы были классифицированы Аристотелем ( Греция , 384—322 до н. э.) во время его пребывания на острове Лесбос . [30] [31] [32] Он классифицировал существ по их частям или, говоря современным языком , атрибутам , таким как наличие живорождения, наличие четырех ног, откладывание яиц, наличие крови или теплое тело. [33] Он разделил все живое на две группы: растения и животные. [31] Некоторые из его групп животных, такие как Anhaima (животные без крови, переводимые как беспозвоночные ) и Enhaima (животные с кровью, примерно позвоночные), а также такие группы, как акулы и китообразные , до сих пор широко используются. [34] Его ученик Теофраст (Греция, 370–285 гг. до н.э.) продолжил эту традицию, упомянув около 500 растений и их использование в своей Historia Plantarum . Опять же, несколько групп растений, которые в настоящее время все еще признаются, можно проследить до Теофраста, например, Cornus , Crocus и Narcissus . [31]

Средневековый

Таксономия в средние века была в значительной степени основана на аристотелевской системе [ 33] с дополнениями, касающимися философского и экзистенциального порядка существ. Это включало в себя такие концепции, как великая цепь бытия в западной схоластической традиции, [33] опять же восходящие в конечном счете к Аристотелю. Аристотелевская система не классифицировала растения или грибы из-за отсутствия микроскопов в то время, [32] поскольку его идеи были основаны на организации всего мира в едином континууме, согласно scala naturae (естественной лестнице). [31]Это тоже учитывалось в великой цепи бытия. [31] Успехи были сделаны такими учеными, как Прокопий , Тимофей из Газы , Деметриос Пепагомен и Фома Аквинский . Средневековые мыслители использовали абстрактные философские и логические классификации, более подходящие для абстрактной философии, чем для прагматической таксономии. [31]

Ренессанс и ранний модерн

В эпоху Возрождения и эпохи Просвещения категоризация организмов стала более распространенной, [31] и таксономические работы стали достаточно амбициозными, чтобы заменить древние тексты. Иногда это приписывают разработке сложных оптических линз, которые позволили изучить морфологию организмов гораздо более подробно. Одним из первых авторов, воспользовавшихся этим скачком в технологиях, был итальянский врач Андреа Чезальпино (1519–1603), которого называли «первым систематиком». [35] Его magnum opus De Plantis вышел в 1583 году и описал более 1500 видов растений. [36] [37]Два больших семейства растений, которые он впервые обнаружил, используются до сих пор: Asteraceae и Brassicaceae . [38] Затем в 17 веке Джон Рэй ( Англия , 1627–1705) написал много важных таксономических работ. [32] Возможно, его самым большим достижением был Methodus Plantarum Nova (1682 г.), [39] в котором он опубликовал подробную информацию о более чем 18 000 видов растений. В то время его классификации были, пожалуй, самыми сложными из когда-либо созданных систематиками, поскольку он основывал свои таксоны на множестве комбинированных признаков. Следующие крупные таксономические работы были произведены Жозефом Питтоном де Турнефором (Франция, 1656–1708 гг.). [40]Его работа 1700 года Institutiones Rei Herbariae включала более 9000 видов 698 родов, что оказало непосредственное влияние на Линнея, поскольку это был текст, который он использовал в юности. [29]

Линнеевская эпоха

Основная статья: линнеевская таксономия
Титульный лист Systema Naturae , Лейден, 1735 г.

Шведский ботаник Карл Линней (1707–1778) [33] открыл новую эру таксономии. Своими основными работами Systema Naturae 1st Edition в 1735 году [41] Species Plantarum в 1753 году [42] и Systema Naturae 10th Edition [ 43] он произвел революцию в современной таксономии. В его работах реализована стандартизированная биномиальная система именования видов животных и растений [44] .что оказалось элегантным решением для хаотичной и неорганизованной таксономической литературы. Он не только ввел стандарт класса, порядка, рода и вида, но также сделал возможным идентифицировать растения и животных из своей книги, используя более мелкие части цветка. [44] Таким образом родилась система Линнея , и она до сих пор используется в основном таким же образом, как и в 18 веке. [44] В настоящее время систематики растений и животных считают работу Линнея «отправной точкой» для действительных названий (в 1753 и 1758 годах соответственно). [45] Имена, опубликованные до этих дат, называются «долиннеевскими» и не считаются действительными (за исключением пауков, опубликованных в Svenska Spindlar [46]). Даже таксономические названия, опубликованные самим Линнеем до этих дат, считаются долиннеевскими. [29]

Современная система классификации

Основные статьи: Эволюционная таксономия и филогенетическая номенклатура
Эволюция позвоночных на уровне класса, ширина веретена указывает на количество семейств. Диаграммы веретена типичны для эволюционной таксономии.
То же отношение, выраженное в виде типичной для кладистики кладограммы .

Модель групп, вложенных в группы, была определена классификациями растений и животных Линнея, и эти модели начали представляться в виде дендрограмм царств животных и растений ближе к концу 18 века, задолго до книги Чарльза Дарвина « Происхождение видов». был опубликован. [32] Модель «Природной системы» не влекла за собой порождающий процесс, такой как эволюция, но, возможно, подразумевала его, вдохновляя ранних мыслителей-трансмутаторов. Среди ранних работ, исследующих идею трансмутации видов , были «Зоономия» Эразма Дарвина (деда Чарльза Дарвина) 1796 года и « Зоономия» Жана-Батиста Ламарка .Philosophie Zoologique 1809 года. [18] Идея была популяризирована в англоязычном мире благодаря спекулятивным, но широко читаемым «Остаткам естественной истории творения », анонимно опубликованным Робертом Чемберсом в 1844 году. [47]

С теорией Дарвина быстро появилось общее признание того, что классификация должна отражать дарвиновский принцип общего происхождения . [48] ​​Представления дерева жизни стали популярными в научных работах с включением известных ископаемых групп. Одной из первых современных групп, связанных с ископаемыми предками, были птицы. [49] [ нужен лучший источник ] Используя недавно обнаруженные окаменелости археоптерикса и гесперорниса , Томас Генри Хаксли заявил, что они произошли от динозавров, группы, официально названной Ричардом Оуэном в 1842 году. [50] [51]Полученное в результате описание динозавров, «давших начало» птицам или являющихся «предками» птиц, является важной отличительной чертой эволюционного таксономического мышления. По мере того как в конце 19-го и начале 20-го веков находили и узнавали все больше и больше ископаемых групп, палеонтологи работали над тем, чтобы понять историю животных на протяжении веков, связывая вместе известные группы. [52] Благодаря современному эволюционному синтезу в начале 1940-х годов существовало по существу современное понимание эволюции основных групп. Поскольку эволюционная таксономия основана на таксономических рангах Линнея, эти два термина в современном использовании в значительной степени взаимозаменяемы. [53]

Кладистический метод появился в 1960-х годах . [48] ​​В 1958 году Джулиан Хаксли использовал термин клада . [18] Позднее, в 1960 году, Кейн и Харрисон ввели термин кладистический . [18] Существенной особенностью является организация таксонов в иерархическом эволюционном дереве с желательным, чтобы все названные таксоны были монофилетическими. [48] ​​Таксон называется монофилетическим, если он включает всех потомков предковой формы. [54] [55] Группы, у которых удалены группы-потомки, называются парафилетическими , [54]в то время как группы, представляющие более одной ветви дерева жизни, называются полифилетическими . [54] [55] Монофилетические группы распознаются и диагностируются на основе синапоморфий , общих производных состояний признаков. [56]

Кладистические классификации совместимы с традиционной линнеевской таксономией и кодексами зоологической и ботанической номенклатуры . [57] Была предложена альтернативная система номенклатуры, Международный кодекс филогенетической номенклатуры или PhyloCode , целью которого является регулирование формального наименования клад. [58] [59] [ ненадежный источник? ] Линнеевские ранги будут необязательными в соответствии с PhyloCode , который предназначен для сосуществования с текущими кодами на основе рангов. [59] Пока неизвестно, примет ли систематическое сообщество PhyloCode .или отвергнуть его в пользу нынешних систем номенклатуры, которые использовались (и модифицировались по мере необходимости) более 250 лет.

Королевства и домены

Основная схема современной классификации. Могут быть использованы многие другие уровни; домен, высший уровень в жизни, является одновременно новым и спорным.
Основная статья: Королевство (биология)

Задолго до [ когда? ] Линней, растения и животные считались отдельными царствами. [60] [ ненадежный источник? ] Линней использовал это как высший ранг, разделив физический мир на растительное, животное и минеральное царства. По мере того, как достижения в микроскопии сделали возможной классификацию микроорганизмов, количество царств увеличилось, причем наиболее распространенными были системы с пятью и шестью царствами.

Домены — относительно новая группа. Трехдоменная система Карла Вёзе , впервые предложенная в 1977 году, не была общепринятой до недавнего времени. [61] Одной из основных характеристик трехдоменного метода является разделение Archaea и Bacteria , ранее сгруппированных в единое царство Bacteria (царство, также иногда называемое Monera ), [60] с Eukaryota для всех организмов, клетки которых содержат ядро . . [62] Небольшое количество ученых включают шестое царство, археи, но не принимают доменный метод. [60]

Томас Кавалье-Смит , широко опубликовавший классификацию протистов , недавно [ когда? ] предположил, что Neomura , клада, объединяющая Archaea и Eucarya , могла произойти от Bacteria, точнее от Actinomycetota . В его классификации 2004 г. археобактерии рассматривались как часть подцарства царства Бактерии, т. е. он полностью отвергал трехдоменную систему. [63] Стефан Лукета в 2012 году предложил систему из пяти «доминионов», добавив прионобиоту ( бесклеточную и без нуклеиновой кислоты ) иВирусобиота (бесклеточная, но с нуклеиновой кислотой) к традиционным трем доменам. [64]

Линней
1735 [65]		Геккель
1866 [66]		Чаттон
1925 [67]		Коупленд
1938 [68]		Уиттакер
1969 [69]		Везе и др.
1990 [70]		Кавалье-Смит
1998 [63]		Кавалер-Смит
2015 [71]
2 королевства3 королевства2 империи4 королевства5 королевств3 домена2 империи, 6 королевств2 империи, 7 королевств
(не лечится)ПротистапрокариотаМонераМонераБактерииБактерииБактерии
АрхеиАрхеи
ЭукариотаПротоктистаПротистаЭукарияпростейшиепростейшие
ХромистаХромиста
ОвощиРастенияРастенияРастенияРастенияРастения
ГрибыГрибыГрибы
АнималияАнималияАнималияАнималияАнималияАнималия
Основная статья: Королевство (биология) § Резюме

Недавние комплексные классификации

Частичные классификации существуют для многих отдельных групп организмов и пересматриваются и заменяются по мере поступления новой информации; однако всесторонние опубликованные методы лечения большей части или всей жизни встречаются реже; недавними примерами являются работы Adl et al., 2012 и 2019, [72] [73] , которые охватывают эукариот только с акцентом на протистов, и Ruggiero et al., 2015, [74] , охватывающих как эукариот, так и прокариот до ранга Отряд, хотя оба исключают ископаемых представителей. [74] Отдельный сборник (Ruggiero, 2014) [75] охватывает существующие таксоны в ранге Семейства. Другие, управляемые базой данных методы лечения включают Энциклопедию жизни ,Глобальный информационный фонд по биоразнообразию , таксономическая база данных NCBI , Временный реестр морских и неморских родов , Открытое древо жизни и Каталог жизни . База данных палеобиологии — это ресурс для окаменелостей.

Заявление

Биологическая таксономия является поддисциплиной биологии и обычно практикуется биологами, известными как «таксономисты», хотя энтузиасты - натуралисты также часто участвуют в публикации новых таксонов. [76] Поскольку таксономия направлена ​​на описание и организацию жизни , работа, проводимая таксономистами, имеет важное значение для изучения биоразнообразия и вытекающей из этого области природоохранной биологии . [77] [78]

Классификация организмов

Основная статья: Таксономический ранг

Биологическая классификация является важнейшим компонентом таксономического процесса. В результате он информирует пользователя о предполагаемых родственниках таксона. Биологическая классификация использует таксономические ранги, в том числе среди прочего (в порядке от наиболее инклюзивного до наименее инклюзивного): домен , царство , тип , класс , порядок , семейство , род , вид и штамм . [79] [примечание 1]

Таксономические описания

См. Также: Описание вида .
Типовой образец Nepenthes smilesii , тропического растения-кувшина .

«Определение» таксона заключено в его описании, или в его диагнозе, или в их сочетании. Не существует установленных правил, регулирующих определение таксонов, но наименование и публикация новых таксонов регулируются наборами правил. [8] В зоологии номенклатура наиболее часто используемых рангов ( от надсемейства до подвида ) регулируется Международным кодексом зоологической номенклатуры ( Кодекс МКЗН ). [80] В областях психологии , микологии и ботаники наименование таксонов регулируетсяМеждународный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений ( ICN ). [81]

Первоначальное описание таксона включает пять основных требований: [82]

  1. Таксону должно быть присвоено имя, основанное на 26 буквах латинского алфавита ( биномиальное для новых видов или одночленное для других рангов).
  2. Имя должно быть уникальным (т.е. не омонимом ).
  3. Описание должно быть основано хотя бы на одном именном типовом экземпляре .
  4. Он должен включать утверждения о соответствующих признаках либо для описания (определения) таксона, либо для его дифференциации от других таксонов (диагноз, Кодекс МКЗН , статья 13.1.1, МКП , статья 38). Оба кодекса намеренно отделяют определение содержания таксона (его границы ) от определения его названия.
  5. Эти первые четыре требования должны быть опубликованы в работе, доступной в многочисленных идентичных экземплярах, в качестве постоянной научной записи.

Однако часто включается гораздо больше информации, например, географический ареал таксона, экологические заметки, химия, поведение и т. д. То, как исследователи приходят к своим таксонам, различается: в зависимости от доступных данных и ресурсов методы варьируются от простых количественных до качественных . сравнения поразительных признаков, для проведения компьютерного анализа больших объемов данных о последовательностях ДНК . [83]

Цитата автора

Основные статьи: Цитата автора (ботаника) и Цитата автора (зоология)

«Авторитет» может быть помещен после научного названия. [84] Авторитет — это имя ученого или ученых, которые впервые официально опубликовали это имя. [84] Например, в 1758 году Линней дал азиатскому слону научное название Elephas maximus , поэтому это имя иногда пишется как « Elephas maximus Linnaeus, 1758». [85] Имена авторов часто сокращаются: обычно используется сокращение L. для Линнея . В ботанике существует, по сути, регламентированный список стандартных аббревиатур (см. список ботаников по авторским аббревиатурам ). [86]Система присвоения авторитетов немного различается между ботаникой и зоологией . [8] Однако стандартом является то, что если род вида был изменен с момента первоначального описания, название первоначального авторитетного источника помещается в круглые скобки. [87]

Фенетика

Сравнение филогенетических и фенетических (по характеру) концепций
Основная статья: Фенетика

В фенетике, также известной как таксономия или числовая таксономия, организмы классифицируются на основе общего сходства, независимо от их филогенеза или эволюционных взаимоотношений. [18] В результате получается мера гипергеометрического «расстояния» между таксонами. Фенетические методы стали относительно редкими в наше время, в значительной степени вытесненными кладистическим анализом, поскольку фенетические методы не отличают общие наследственные (или плезиоморфные ) черты от общих производных (или апоморфных ) черт. [88] Тем не менее, некоторые фенетические методы, такие как присоединение к соседям , сохранились в качестве быстрых оценок отношений, когда более продвинутые методы (такие как байесовский вывод) слишком затратны в вычислительном отношении. [89]

Базы данных

Основная статья: Таксономическая база данных

Современная таксономия использует технологии баз данных для поиска и каталогизации классификаций и их документации. [90] Хотя не существует широко используемой базы данных, существуют всеобъемлющие базы данных, такие как Каталог жизни , в котором делается попытка перечислить все зарегистрированные виды. [91] В каталоге перечислено 1,64 миллиона видов для всех королевств по состоянию на апрель 2016 года, что, как утверждается, охватывает более трех четвертей предполагаемых видов, известных современной науке. [92]

Смотрите также

  • Автоматическая идентификация видов
  • Бактериальная таксономия
  • Кластерный анализ
  • Консорциум Штрих-кода Жизни
  • Консорциум европейских таксономических учреждений
  • Генетипы
  • Глоссарий научного нейминга
  • Идентификация (биология)
  • Incertae sedis
  • Открытое Древо Жизни
  • Паратаксономия
  • Фенограмма
  • Теория множеств
  • Таксономия (общая)
  • Классификация вирусов

Заметки

  1. ↑ Эту систему ранжирования, за исключением «Напряжения», можно запомнить по мнемонике «Играют ли короли в шахматы на тонких стеклянных наборах?»

использованная литература

  1. ^ a b Wilkins, JS (5 февраля 2011 г.). «Что такое систематика и что такое таксономия?» . Архивировано из оригинала 27 августа 2016 года . Проверено 21 августа 2016 г.
  2. ^ Джадд, WS; Кэмпбелл, CS; Келлог, Э.А.; Стивенс, ПФ; Донохью, MJ (2007). «Таксономия». Систематика растений: филогенетический подход (3-е изд.). Сандерленд: Sinauer Associates.
  3. ^ Симпсон, Майкл Г. (2010). «Глава 1 Систематика растений: обзор». Систематика растений (2-е изд.). Академическая пресса. ISBN 978-0-12-374380-0.
  4. ^ Кирк, П. М., Кэннон, П. Ф., Минтер, Д. В., Сталперс, ред. JA. (2008) «Таксономия». В Словаре грибов , 10-е издание. КАБИ, Нидерланды.
  5. ^ Уокер, PMB, изд. (1988). Словарь науки и техники Вордсворта . WR Chambers Ltd. и издательство Кембриджского университета.
  6. ^ б Лоуренс , Э. (2005). Биологический словарь Хендерсона . Пирсон/Прентис Холл. ISBN 978-0-13-127384-9.
  7. ^ Уиллер, Квентин Д. (2004). «Таксономическая сортировка и бедность филогении». В HCJ Godfray & S. Knapp (ред.). Таксономия двадцать первого века . Философские труды Королевского общества . Том. 359. стр. 571–583. doi : 10.1098/rstb.2003.1452 . ПВК 1693342 . PMID 15253345 .  
  8. ^ a b c «Номенклатура, имена и таксономия» . Межгорный гербарий – УрГУ . 2005. Архивировано из оригинала 23 ноября 2016 года.
  9. ^ Миченер, Чарльз Д., Джон О. Корлисс, Ричард С. Коуэн, Питер Х. Рэйвен, Кертис В. Саброски, Дональд С. Сквайрс и Г. В. Уортон (1970). Систематика в поддержку биологических исследований . Отдел биологии и сельского хозяйства Национального исследовательского совета. Вашингтон, округ Колумбия, 25 стр.
  10. ^ Смолл, Эрнест (1989). «Систематика биологической систематики (или таксономия таксономии)». Таксон . 38 (3): 335–356. дои : 10.2307/1222265 . JSTOR 1222265 . 
  11. ^ Сингх, Гурчаран (2004). Систематика растений: комплексный подход . Издательства науки. п. 20. ISBN 978-1-57808-351-0– через Google Книги.
  12. ^ Уилкинс, Дж. С. Что такое систематика и что такое таксономия? Архивировано 27 августа 2016 года в Wayback Machine . Доступно на http://evolvingthoughts.net
  13. ^ Бруска, Р.К., и Бруска, Г.Дж. (2003). Беспозвоночные (2-е изд.). Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates, p. 27
  14. ↑ Форти, Ричард (2008), Сухая кладовая № 1: Тайная жизнь Музея естественной истории , Лондон: Harper Perennial, ISBN 978-0-00-720989-7
  15. ^ Макстед, Найджел (1992). «К определению методологии таксономической ревизии». Таксон . 41 (4): 653–660. дои : 10.2307/1222391 . JSTOR 1222391 . 
  16. ^ Майр, Эрнст (1991). Принципы систематической зоологии. Нью-Йорк: McGraw-Hill, с. 159.
  17. ^ Майр, Эрнст (1991), с. 162.
  18. ^ a b c d e f g h «Таксономия: значение, уровни, периоды и роль» . Обсуждение биологии . 27 мая 2016 г. Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 г.
  19. ^ Росселло-Мора, Рамон; Аманн, Рудольф (1 января 2001 г.). «Видовая концепция прокариот» . Обзоры микробиологии FEMS . 25 (1): 39–67. doi : 10.1111/j.1574-6976.2001.tb00571.x . ISSN 1574-6976 . PMID 11152940 .  
  20. ^ б Террилл 1938 .
  21. ↑ Turrill 1938 , стр. 365–366.
  22. ^ Стейскал, Г.К. (1965). «Кривые тренда скорости описания видов в зоологии». Наука . 149 (3686): 880–882. Бибкод : 1965Sci...149..880S . doi : 10.1126/наука.149.3686.880 . PMID 17737388 . S2CID 36277653 .  
  23. ↑ Майр, Эрнст (9 февраля 1968 г.), «Роль систематики в биологии: изучение всех аспектов разнообразия жизни является одной из важнейших задач биологии», Science , 159 (3815): 595–599, Бибкод : 1968Sci...159..595M , doi : 10.1126/science.159.3815.595 , PMID 4886900 
  24. ^ Майр, Эрнст (1982). «Глава 6: Микротаксономия, наука о видах» . Рост биологической мысли: разнообразие, эволюция и наследование . Belknap Press издательства Гарвардского университета. ISBN 978-0-674-36446-2.
  25. ^ «Результат вашего запроса» . биологические концепции.com . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  26. ^ Датта 1988 .
  27. ^ Стейс 1989 .
  28. ^ Стюесси 2009 .
  29. ^ a b c Манктелоу, М. (2010) История таксономии . Архивировано 29 мая 2015 г. в Wayback Machine . Лекция кафедры систематической биологии Упсальского университета .
  30. ^ Майр, Э. (1982) Рост биологической мысли . Белкнап П. из Гарвардского университета, Кембридж (Массачусетс)
  31. ^ a b c d e f g "Палеос: таксономия" . palaeos.com . Архивировано из оригинала 31 марта 2017 года.
  32. ^ a b c d "таксономия | биология" . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  33. ^ a b c d "Биология 101, глава 20" . cbs.dtu.dk . 23 марта 1998 г. Архивировано из оригинала 28 июня 2017 г.
  34. ^ Леруа, Арман Мари (2014). Лагуна: как Аристотель изобрел науку . Блумсбери. стр. 384–395. ISBN 978-1-4088-3622-4.
  35. ^ "Андреа Чезальпино | итальянский врач, философ и ботаник" . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  36. ^ Чезальпино, Андреа; Марескотти, Джорджио (1583 г.). Растительные книги XVI . Флоренция: Apud Georgium Marescottum - из Интернет-архива.
  37. ^ "Андреа Чезальпино | итальянский врач, философ и ботаник" . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  38. ^ Хайме, Проэнс (2010). Международное издание овощей I: Asteraceae, Brassicaceae, Chenopodicaceae и Cucurbitaceae (Справочник по селекции растений) . ISBN 978-1-4419-2474-2.
  39. ^ Джон, Рэй (1682). Methodus plantarum nova [ Новый метод растений ] (на латыни). impensis Henrici Faithorne & Joannis Kersey, ad insigne Rofæ Coemeterio D. Pauli. Архивировано из оригинала 29 сентября 2017 года.
  40. ^ "Жозеф Питтон де Турнефор | французский ботаник и врач" . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  41. ^ Линней, К. (1735) Systema naturae, sive regna tria naturae systeme proposita по классам, ординам, родам и видам . Хаак, Лейден
  42. ^ Линней, К. (1753) Виды Plantarum . Стокгольм, Швеция.
  43. ↑ Linnaeus, C. (1758) Systema naturae, sive regna tria naturaesysteme proposita per classs, ordines, geners, & views , 10th Edition. Хаак, Лейден
  44. ^ a b c "таксономия - система Линнея | биология" . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  45. ^ Донк, Массачусетс (декабрь 1957 г.). «Типизация и более поздние отправные точки» (PDF) . Таксон . 6 (9): 245–256. дои : 10.2307/1217493 . JSTOR 1217493 . Архивировано (PDF) из оригинала 18 мая 2015 г.  
  46. ^ Карл, Клерк; Карл, Бергквист; Эрик, Борг; Л., Готтман; Ларс, Сальвиус (1757 г.). Svenska spindlar [ Шведские пауки ] (на шведском языке). Литерис Лаур. Сальвии. Архивировано из оригинала 1 декабря 2017 года.
  47. ^ Секорд, Джеймс А. (2000). Викторианская сенсация: экстраординарная публикация, прием и тайное авторство остатков естественной истории творения . Издательство Чикагского университета . ISBN 978-0-226-74410-0. Архивировано из оригинала 16 мая 2008 г.
  48. ^ a b c «Таксономия - Классификация со времен Линнея | биология» . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  49. ^ «Окаменелость самой ранней современной птицы в мире может помочь нам понять вымирание динозавров» . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  50. ^ Хаксли, TH (1876): Лекции по эволюции. Нью-Йорк Трибьюн . Дополнительный. нет. 36. В сборнике эссе IV: стр. 46–138, исходный текст с рисунками . Архивировано 28 июня 2011 г. в Wayback Machine .
  51. Викискладе есть медиафайлы по теме Томаса Генри Хаксли . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 6 февраля 2018 года.
  52. ^ Рудвик, MJS (1985). Значение окаменелостей: эпизоды в истории палеонтологии . Издательство Чикагского университета. п. 24. ISBN 978-0-226-73103-2.
  53. ^ Патерлини, Марта (сентябрь 2007 г.). «Должен быть порядок. Наследие Линнея в век молекулярной биологии» . Отчеты ЕМБО . 8 (9): 814–816. doi : 10.1038/sj.embor.7401061 . ЧВК 1973966 . PMID 17767191 .  
  54. ^ a b c Тейлор, Майк. «Что означают такие термины, как монофилетический, парафилетический и полифилетический?» . miketaylor.org.uk . Архивировано из оригинала 1 августа 2010 года.
  55. ^ a b «Полифилетический против монофилетического» . ncse.com . Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 года.
  56. ^ Брауэр, Эндрю В.З. и Рэндалл Т. Шу. 2021. Биологическая систематика: принципы и приложения (3-е изд.), Издательство Корнельского университета, Итака, Нью-Йорк, с. 13
  57. ^ Шу, Рэндалл Т. «Система Линнея и ее 250-летнее существование». Ботаническое обозрение 69, вып. 1 (2003): 59.
  58. ^ Кейрос, Филип Д. Кантино, Кевин де. «Филокод» . огайо.эду . Архивировано из оригинала 10 мая 2016 года.
  59. ^ a b «PhyloCode: концепция, история и преимущества | Таксономия» . Обсуждение биологии . 12 июля 2016 г. Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 г.
  60. ^ a b c "Классификация живых организмов Царства" . Обсуждение биологии . 2 декабря 2014 г. Архивировано из оригинала 5 апреля 2017 г.
  61. ^ "Карл Вёзе | Институт геномной биологии Карла Р. Вёзе" . www.igb.Illinois.edu . Архивировано из оригинала 28 апреля 2017 года.
  62. ^ Кракрафт, Джоэл и Донахью, Майкл Дж. (ред.) (2004). Сборка Древа Жизни . Оксфорд, Англия: Издательство Оксфордского университета. ISBN 0-19-517234-5 . стр. 45, 78, 555 
  63. ^ a b Кавалье-Смит, Т. (1998). «Пересмотренная система жизни шести царств» . Биологические обзоры . 73 (3): 203–66. doi : 10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x . PMID 9809012 . S2CID 6557779 .  
  64. ^ Лукета, С. (2012). «Новые взгляды на мегаклассификацию жизни» (PDF) . Протистология . 7 (4): 218–237. Архивировано (PDF) из оригинала 2 апреля 2015 г.
  65. ^ Линней, К. (1735). Systemae Naturae, sive regna tria naturae, систематика предложений по классам, ординам, родам и видам .
  66. ^ Геккель, Э. (1866). Общая морфология организмов . Реймер, Берлин.
  67. ^ Чаттон, Э. (1925). « Pansporella perplexa . Размышления о биологии и филогении простейших». Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale . 10-VII: 1–84.
  68. ^ Коупленд, Х. (1938). «Царства организмов». Ежеквартальный обзор биологии . 13 (4): 383–420. дои : 10.1086/394568 . S2CID 84634277 . 
  69. ↑ Уиттакер, Р. Х. (январь 1969 г.). «Новые концепции царств организмов». Наука . 163 (3863): 150–60. Бибкод : 1969Sci...163..150W . doi : 10.1126/наука.163.3863.150 . PMID 5762760 . 
  70. ^ Везе, К .; Кендлер, О .; Уилис, М. (1990). «К естественной системе организмов: предложение для доменов Archaea, Bacteria и Eucarya» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W . doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМС 54159 . PMID 2112744 .  
  71. ^ Руджеро, Майкл А .; Гордон, Деннис П.; Оррелл, Томас М .; Байи, Николя; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавалье-Смит, Томас; Гайри, Майкл Д .; Кирк, Пол М .; Туесен, Эрик В. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня» . ПЛОС ОДИН . 10 (4): e0119248. Бибкод : 2015PLoSO..1019248R . doi : 10.1371/journal.pone.0119248 . ПВК 4418965 . PMID 25923521 .  
  72. ^ Адл, С.М.; Симпсон, AGB; Лейн, CE; Лукеш, Дж.; Басс, Д .; Боузер, СС; и другие. (декабрь 2015 г.). «Пересмотренная классификация эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 59 (5): 429–493. doi : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x . ПВК 3483872 . PMID 23020233 .  
  73. ^ Адл, С.М.; Басс, Д .; Лейн, CE; Лукеш, Дж.; Шох, CL; Смирнов, А .; и другие. (2019). «Поправки к классификации, номенклатуре и разнообразию эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 66 (1): 4–119. doi : 10.1111/jeu.12691 . ПМС 6492006 . PMID 30257078 .  
  74. ^ б Руджеро , Массачусетс; Гордон, Д.П.; Оррелл, ТМ; Байи, Н.; Бургуэн, Т .; Бруска, RC; и другие. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня» . ПЛОС ОДИН . 10 (4): e0119248. Бибкод : 2015PLoSO..1019248R . doi : 10.1371/journal.pone.0119248 . ПВК 4418965 . PMID 25923521 .  
  75. ^ Руджеро, Майкл А. (2014). Семейства всех живых организмов, версия 2.0.a.15, (26.04.14). Expert Solutions International, LLC, Рестон, Вирджиния. 420 стр. Включенные данные доступны для загрузки через https://www.gbif.org/dataset/8067e0a2-a26d-4831-8a1e-21b9118a299c (doi: 10.15468/tfp6yv)
  76. ^ «Несколько плохих ученых угрожают свергнуть таксономию» . Смитсоновский институт . Проверено 24 февраля 2019 г.
  77. ^ "Что такое таксономия?" . Лондон: Музей естественной истории. Архивировано из оригинала 1 октября 2013 года . Проверено 23 декабря 2017 г.
  78. ^ Макнили, Джеффри А. (2002). «Роль таксономии в сохранении биоразнообразия» (PDF) . Дж. Нат. Сохран . 10 (3): 145–153. дои : 10.1078/1617-1381-00015 . S2CID 16953722 . Архивировано из оригинала (PDF) 24 декабря 2017 г. - через Semantic Scholar.  
  79. ↑ «Мнемоника таксономия / биология: Орден Класса Филума Королевства ...» Архивировано из оригинала 6 июня 2017 года.
  80. ^ "Код МКЗН" . Animalbase.uni-goettingen.de .
  81. ^ «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений» . Международная ассоциация таксономии растений . Архивировано из оригинала 11 января 2013 года.
  82. ^ «Как я могу описать новые виды?» . Международная комиссия по зоологической номенклатуре . Архивировано из оригинала 6 марта 2012 года . Проверено 21 мая 2020 г.
  83. ^ «Таксономия - Оценка таксономических признаков» . Британская энциклопедия . Архивировано из оригинала 22 апреля 2019 года.
  84. ^ a b «Совет по редактированию: научные названия видов | AJE | Эксперты американского журнала» . www.aje.com . Архивировано из оригинала 9 апреля 2017 года.
  85. ^ «Карол Линней: классификация, таксономия и вклад в биологию - видео и стенограмма урока | Study.com» . Исследование.com . Архивировано из оригинала 9 апреля 2017 года.
  86. ^ Биоциклопедия.com. «Биологическая классификация» . biocyclopedia.com . Архивировано из оригинала 14 мая 2017 года.
  87. ^ «Зоологическая номенклатура: основное руководство для авторов, не занимающихся систематикой» . Аннелида.нет . Архивировано из оригинала 16 марта 2017 года.
  88. ^ "Классификация" . Университет штата Северная Каролина . Архивировано из оригинала 14 апреля 2017 года . Проверено 27 апреля 2017 г.
  89. ^ Макдональд, Дэвид (осень 2008 г.). «Глоссарий молекулярных маркеров» . Университет Вайоминга . Архивировано из оригинала 10 июня 2007 года.
  90. ^ Вуд, Дилан; Кинг, Маргарет; Лэндис, Дрю; Кортни, Уильям; Ван, Рунтанг; Келли, Росс; Тернер, Джессика А .; Калхун, Винс Д. (26 августа 2014 г.). «Использование современных технологий веб-приложений для создания интуитивно понятных и эффективных инструментов визуализации и обмена данными» . Границы нейроинформатики . 8 : 71. doi : 10.3389/fnif.2014.00071 . ISSN 1662-5196 . ПМК 4144441 . PMID 25206330 .   
  91. ^ "О - Список растений" . theplantlist.org .
  92. ^ «О Каталоге жизни: Ежегодный контрольный список 2016» . Каталог жизни . Интегрированная таксономическая информационная система (ИТИС). Архивировано из оригинала 15 мая 2016 года . Проверено 22 мая 2016 г.

Библиография

  • Датта, Субхаш Чандра (1988). Систематическая ботаника (4-е изд.). Нью-Дели: New Age International. ISBN 978-81-224-0013-7. Проверено 25 января 2015 г.
  • Стейс, Клайв А. (1989) [1980]. Таксономия и биосистематика растений (2-е изд.). Кембридж: Издательство Кембриджского университета . ISBN 978-0-521-42785-2. Проверено 19 апреля 2015 г.
  • Стюесси, Тод Ф. (2009). Таксономия растений: систематическая оценка сравнительных данных . Издательство Колумбийского университета. ISBN 978-0-231-14712-5. Проверено 6 февраля 2014 г.
  • Террилл, ВБ (1938). «Расширение таксономии с особым упором на Spermatophyta». Биологические обзоры . 13 (4): 342–373. doi : 10.1111/j.1469-185X.1938.tb00522.x . S2CID  84905335 .
  • Уайли, Эдвард О. и Брюс С. Либерман. 2011. «Филогенетика: теория и практика филогенетической систематики», 2-е изд. ISBN 978-0-470-90596-8 

внешние ссылки

  • Что такое таксономия? в Лондонском музее естественной истории
  • Таксономия в NCBI , Национальном центре биотехнологической информации .
  • Таксономия в UniProt Universal Protein Resource
  • ИТИС Интегрированная таксономическая информационная система
  • CETaF Консорциум европейских таксономических учреждений
  • Каталог бесплатных видов Wikispecies
  • Биологическая классификация. Архивировано 13 августа 2020 г. в Wayback Machine .
Получено с https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Taxonomy_(biology)&oldid=1097618391 "
Contribute a better translation