Некодирующий РНК ( ncRNA ) представляет собой РНК - молекула , которая не переводится в белка . Последовательность ДНК , из которой транскрибируется функциональная некодирующая РНК, часто называют геном РНК . Обильные и функционально важные типы некодирующих РНК включают в себя РНК передачи (тРНК) и рибосомальной РНК (рРНК), а также малые РНК , таких как микроРНК , миРНК , piРНК , , snoRNAs , snRNAs , exRNAs , scaRNAs и томудлинные нкРНК, такие как Xist и HOTAIR .
Число некодирующих РНК в геноме человека неизвестно; однако недавние транскриптомные и биоинформатические исследования показывают, что их тысячи. [1] [2] [3] [4] [5] [6] Многие из недавно идентифицированных нкРНК не прошли валидацию на предмет их функции. [7] Также вероятно, что многие нкРНК нефункциональны (иногда называемые мусорной РНК ) и являются продуктом ложной транскрипции. [8] [9]
Считается, что некодирующие РНК способствуют развитию заболеваний, включая рак и болезнь Альцгеймера .
История и открытия
Нуклеиновые кислоты были впервые обнаружены в 1868 году Фридрихом Мишером [10], а к 1939 году РНК была вовлечена в синтез белка . [11] Два десятилетия спустя Фрэнсис Крик предсказал функциональный компонент РНК, который опосредует трансляцию ; он рассуждал, что РНК лучше подходит для пар оснований с транскриптом мРНК, чем чистый полипептид . [12]
Первой некодирующей РНК, которая была охарактеризована, была тРНК аланина, обнаруженная в пекарских дрожжах , ее структура была опубликована в 1965 году. [13] Чтобы получить образец очищенной тРНК аланина, Robert W. Holley et al. использовали 140 кг коммерческих пекарских дрожжей, чтобы получить только 1 г очищенной тРНК Ala для анализа. [14] 80 нуклеотидная тРНК была секвенирована сначала путем переваривания рибонуклеазой поджелудочной железы (с образованием фрагментов, оканчивающихся цитозином или уридином ), а затем рибонуклеазой такадиастазы T1 (с получением фрагментов, заканчивающихся гуанозином ). Затем хроматография и идентификация 5'- и 3'-концов помогли расположить фрагменты для установления последовательности РНК. [14] Из трех структур, первоначально предложенных для этой тРНК, [13] структура «клеверного листа» была независимо предложена в нескольких следующих публикациях. [15] [16] [17] [18] Вторичная структура клеверного листа была окончательно определена после рентгеноструктурного анализа, проведенного двумя независимыми исследовательскими группами в 1974 году. [19] [20]
Следующей была открыта рибосомная РНК , а в начале 1980-х - УРНК. С тех пор открытие новых некодирующих РНК продолжилось с появлением snoRNA , Xist , CRISPR и многих других. [21] Недавние заметные дополнения включают рибопереключатели и miRNA ; открытие механизма RNAi , связанного с последним, принесло Крейгу С. Мелло и Эндрю Файру Нобелевскую премию по физиологии и медицине 2006 года . [22]
Недавние открытия нкРНК были достигнуты как с помощью экспериментальных, так и биоинформатических методов .
Биологические роли
Некодирующие РНК относятся к нескольким группам и участвуют во многих клеточных процессах. Они варьируются от центрально важных нкРНК, которые сохраняются на протяжении всей или большей части клеточной жизни, до более временных нкРНК, специфичных для одного или нескольких близкородственных видов. Считается, что более консервативные нкРНК являются молекулярными окаменелостями или реликвиями последнего универсального общего предка и мира РНК , и их текущая роль остается в основном в регуляции потока информации от ДНК к белку. [23] [24] [25]
В переводе
Многие консервативные, незаменимые и многочисленные нкРНК участвуют в трансляции . Частицы рибонуклеопротеина (РНП), называемые рибосомами, являются «фабриками», на которых в клетке происходит трансляция. Рибосома состоит из более чем 60% рибосомальной РНК ; они состоят из 3 нкРНК у прокариот и 4 нкРНК у эукариот . Рибосомные РНК катализируют трансляцию нуклеотидных последовательностей в белок. Другой набор нкРНК, РНК- переносчик, образуют «адаптерную молекулу» между мРНК и белком. Окно Н / АСА и C / D коробка snoRNAs являются нкРНК найдены в архей и эукариот. MRP РНКазы ограничен эукариотами. Обе группы нкРНК участвуют в созревании рРНК. SnoRNAs направляют ковалентные модификации рРНК, tRNA и snRNAs ; РНКаза MRP расщепляет внутренний транскрибируемый спейсер 1 между 18S и 5.8S рРНК. Повсеместная нкРНК, РНКаза P , является эволюционным родственником РНКазы MRP. [27] РНКаза P созревает последовательности тРНК, генерируя зрелые 5'-концы тРНК путем расщепления 5'-лидерных элементов тРНК-предшественников. Другой распространенный RNP, называемый SRP, распознает и транспортирует специфические растущие белки в эндоплазматический ретикулум у эукариот и плазматическую мембрану у прокариот . У бактерий РНК-мессенджер (тмРНК) - это РНП, участвующая в спасении застрявших рибосом, маркировке неполных полипептидов и содействии деградации аберрантной мРНК. [ необходима цитата ]
В сплайсинге РНК
У эукариот сплайсосома выполняет реакции сплайсинга, необходимые для удаления интронных последовательностей, этот процесс необходим для образования зрелой мРНК . Сплайсосома еще один РНП часто также известный как snRNP или три-snRNP. Есть две разные формы сплайсосомы: основная и малая формы. Компонентами нкРНК основной сплайсосомы являются U1 , U2 , U4 , U5 и U6 . Компонентами нкРНК минорной сплайсосомы являются U11 , U12 , U5 , U4atac и U6atac . [ необходима цитата ]
Другая группа интронов может катализировать собственное удаление из транскриптов хозяина; они называются самосплайсинговыми РНК. Существуют две основные группы самостоятельной сплайсинга РНК: группа I Каталитический интронов и группа II каталитического интронов . Эти нкРНК катализируют собственное вырезание из мРНК, тРНК и предшественников рРНК в широком диапазоне организмов. [ необходима цитата ]
У млекопитающих было обнаружено, что snoRNA могут также регулировать альтернативный сплайсинг мРНК, например snoRNA HBII-52 регулирует сплайсинг серотонинового рецептора 2C . [28]
У нематод SmY ncRNA, по-видимому, участвует в транс-сплайсинге мРНК . [ необходима цитата ]
В репликации ДНК
Y-РНК представляют собой стволовые петли, необходимые для репликации ДНК через взаимодействия с хроматином и инициирующими белками (включая комплекс распознавания ориджина ). [30] [31] Они также являются компонентами рибонуклеопротеиновой частицы Ro60 [32], которая является мишенью для аутоиммунных антител у пациентов с системной красной волчанкой . [33]
В регуляции генов
Выражение многих тысяч генов регулируются нкРНК. Эта регуляция может происходить как в транс, так и в цис . Появляется все больше свидетельств того, что особый тип нкРНК, называемый энхансерными РНК , транскрибируемый из энхансерной области гена, способствует экспрессии гена. [ необходима цитата ]
Транс-действующий
У высших эукариот микроРНК регулируют экспрессию генов. Одна миРНК может снижать уровни экспрессии сотен генов. Механизм, с помощью которого действуют зрелые молекулы миРНК, частично комплементарен одной или нескольким молекулам информационной РНК (мРНК), как правило, в 3 'НТО . Основная функция miRNA заключается в подавлении экспрессии генов.
Также было показано, что нкРНК РНКаза P влияет на экспрессию генов. В ядре человека РНКаза Р необходима для нормальной и эффективной транскрипции различных нкРНК, транскрибируемых РНК-полимеразой III . К ним относятся гены тРНК, 5S рРНК , SRP РНК и мяРНК U6 . РНКаза P играет свою роль в транскрипции через ассоциацию с Pol III и хроматином активных генов тРНК и 5S рРНК. [34]
Было показано, что 7SK РНК , нкРНК многоклеточных животных, действует как негативный регулятор фактора элонгации РНК-полимеразы II P-TEFb , и что на эту активность влияют пути реакции на стресс. [ необходима цитата ]
Бактериальная нкРНК, 6S РНК , специфически связывается с холоферментом РНК-полимеразы, содержащим фактор специфичности sigma70 . Это взаимодействие подавляет экспрессию сигма70-зависимого промотора во время стационарной фазы . [ необходима цитата ]
Другая бактериальная нкРНК, OxyS RNA, подавляет трансляцию путем связывания с последовательностями Шайна-Дальгарно, тем самым блокируя связывание рибосом. OxyS РНК индуцируется в ответ на окислительный стресс у Escherichia coli. [ необходима цитата ]
РНК B2 представляет собой небольшой транскрипт некодирующей РНК-полимеразы III, который подавляет транскрипцию мРНК в ответ на тепловой шок в клетках мыши. B2 РНК ингибирует транскрипцию, связываясь с ядром Pol II. Благодаря этому взаимодействию B2 РНК собирается в преинициативные комплексы на промоторе и блокирует синтез РНК. [35]
Недавнее исследование показало, что только акт транскрипции последовательности нкРНК может влиять на экспрессию генов. Транскрипция нкРНК РНК-полимеразой II необходима для ремоделирования хроматина у Schizosaccharomyces pombe . Хроматин постепенно превращается в открытую конфигурацию, поскольку транскрибируются несколько видов нкРНК. [36]
Цис-действующий
Ряд нкРНК встроены в 5 ' UTR (нетранслируемые области) генов, кодирующих белок, и по-разному влияют на их экспрессию. Например, рибопереключатель может напрямую связывать небольшую молекулу-мишень ; Связывание мишени влияет на активность гена. [ необходима цитата ]
Лидерные последовательности РНК находятся перед первым геном оперонов биосинтеза аминокислот. Эти элементы РНК образуют одну из двух возможных структур в областях, кодирующих очень короткие пептидные последовательности, которые богаты аминокислотой конечного продукта оперона. Терминаторная структура образуется, когда существует избыток регуляторной аминокислоты и движение рибосомы по сравнению с лидерным транскриптом не затрудняется. Когда имеется дефицит заряженной тРНК регуляторной аминокислоты, рибосома, транслирующая лидерный пептид, останавливается и формируется структура антитерминатора. Это позволяет РНК-полимеразе транскрибировать оперон. Известные лидеры РНК являются гистидин лидер оперона , лейцин оперон лидера , треонин оперон лидера и триптофана оперона лидера . [ необходима цитата ]
Элементы ответа на железо (IRE) связаны белками ответа на железо (IRP). IRE находится в UTR различных мРНК , продукты которых участвуют в метаболизме железа . Когда концентрация железа низкая, IRP связывают мРНК ферритина IRE, что приводит к репрессии трансляции. [ необходима цитата ]
Внутренние сайты входа в рибосомы (IRES) представляют собой структуры РНК, которые позволяют инициировать трансляцию в середине последовательности мРНК как часть процесса синтеза белка . [ необходима цитата ]
В защиту генома
Piwi-взаимодействующие РНК (piRNAs), экспрессируемые в семенниках и соматических клетках млекопитающих, образуют комплексы РНК-белок с белками Piwi . Эти комплексы piRNA (piRCs) были связаны с подавлением транскрипционного гена ретротранспозонов и других генетических элементов в клетках зародышевой линии , особенно в сперматогенезе .
Кластерные регулярно чередующиеся короткие палиндромные повторы (CRISPR) - это повторы, обнаруженные в ДНК многих бактерий и архей . Повторы разделены разделителями одинаковой длины. Было продемонстрировано, что эти спейсеры могут происходить из фага и впоследствии помогают защитить клетку от инфекции.
Хромосомная структура
Теломераза представляет собой фермент RNP, который добавляет повторы специфической последовательности ДНК («TTAGGG» у позвоночных) в теломерные области, которые находятся на концах хромосом эукариот . Теломеры содержат конденсированный материал ДНК, придающий хромосомам стабильность. Фермент представляет собой обратную транскриптазу , несущую теломеразную РНК , которая используется в качестве матрицы при удлинении теломер, которые укорачиваются после каждого цикла репликации .
Xist (X-неактивный-специфический транскрипт) представляет собой длинный ген ncRNA на Й - хромосоме из плацентарных млекопитающих , который выступает в качестве основного эффектора инактивации Х - хромосомы процесса формирования Barr тела . Антисмысловая РНК , Tsix , является негативным регулятором Xist. Х-хромосомы, лишенные экспрессии Tsix (и, следовательно, имеющие высокий уровень транскрипции Xist), инактивируются чаще, чем нормальные хромосомы. У дрозофилидов , которые также используют систему определения пола XY , РНК roX (РНК на X) участвуют в дозовой компенсации. [37] И Xist, и roX действуют посредством эпигенетической регуляции транскрипции за счет привлечения гистон-модифицирующих ферментов .
Бифункциональная РНК
Бифункциональные РНК или РНК с двойной функцией - это РНК, которые выполняют две различные функции. [38] [39] Большинство известных бифункциональных РНК представляют собой мРНК, которые кодируют как белок, так и нкРНК. Однако все большее количество ncRNA попадает в две разные категории ncRNA; например, H / ACA box snoRNA и miRNA . [40] [41]
Двумя хорошо известными примерами бифункциональных РНК являются РНК SgrS и РНКIII . Однако известно, что существует несколько других бифункциональных РНК (например, активатор стероидных рецепторов / SRA, [42] РНК VegT, [43] [44] РНК Oskar, [45] ENOD40 , [46] РНК p53 [47] и РНК SR1 . [48] Бифункциональные РНК недавно стали предметом специального выпуска Biochimie . [49]
Как гормон
Существует важная связь между некоторыми некодирующими РНК и контролем гормонально регулируемых путей. У дрозофилы гормоны, такие как экдизон и ювенильный гормон, могут способствовать экспрессии определенных микроРНК. Более того, эта регуляция происходит в различных временных точках развития C. elegans . [50] У млекопитающих miR-206 является важным регулятором альфа-рецепторов эстрогена . [51]
Некодирующие РНК имеют решающее значение в развитии нескольких эндокринных органов, а также при эндокринных заболеваниях, таких как сахарный диабет . [52] В частности, в клеточной линии MCF-7 добавление 17β- эстрадиола увеличивало глобальную транскрипцию некодирующих РНК, называемых днРНК, рядом с кодирующими генами, активируемыми эстрогеном. [53]
Во избежание патогенов
Было показано, что C. elegans обучается и наследует избегание патогенов после воздействия одной некодирующей РНК бактериального патогена . [54] [55]
Роли в болезни
Как и в случае с белками , мутации или дисбаланс в репертуаре нкРНК в организме могут вызывать множество заболеваний.
Рак
Многие нкРНК обнаруживают аномальные паттерны экспрессии в раковых тканях. [5] К ним относятся миРНК , длинные мРНК-подобные нкРНК , [56] [57] GAS5 , [58] SNORD50 , [59] теломеразная РНК и Y-РНК . [60] miRNA участвуют в крупномасштабной регуляции многих генов, кодирующих белки, [61] [62] Y-РНК важны для инициации репликации ДНК, [30] теломеразная РНК, которая служит праймером для теломеразы, RNP, который расширяет теломерные области на концах хромосом (см. Теломеры и болезнь для получения дополнительной информации). Прямая функция длинных мРНК-подобных нкРНК менее ясна.
Было показано, что мутации зародышевой линии в первичных предшественниках miR-16-1 и miR-15 гораздо чаще встречаются у пациентов с хроническим лимфолейкозом по сравнению с контрольной популяцией. [63] [64]
Было высказано предположение, что редкий SNP ( rs11614913 ), который перекрывает has-mir-196a2 , оказался связанным с немелкоклеточной карциномой легкого . [65] Аналогичным образом, скрининг 17 miRNA, которые, как было предсказано, регулируют ряд генов, связанных с раком груди, обнаружил вариации в микроРНК miR-17 и miR-30c-1 пациентов; эти пациенты не были носителями мутаций BRCA1 или BRCA2 , что дает возможность предположить , что семейный рак груди может быть вызван вариациями в этих miRNA. [66] р53 супрессоров опухолей, вероятно , является самым важным фактором предотвращения образования опухоли и прогрессии. Белок p53 функционирует как фактор транскрипции, играющий решающую роль в организации клеточного стрессового ответа. Помимо своей решающей роли в развитии рака, p53 участвует в других заболеваниях, включая диабет, гибель клеток после ишемии и различные нейродегенеративные заболевания, такие как Хантингтон, Паркинсон и Альцгеймер. Исследования показали, что экспрессия p53 регулируется некодирующей РНК. [4]
Другим примером некодирующей РНК с нарушенной регуляцией в раковых клетках является длинная некодирующая РНК Linc00707. Linc00707 активируется и губки miRNAs в мезенхимальных стволовых клетках костного мозга человека [67] при гепатоцеллюлярной карциноме [68] раке желудка [69] или раке груди [70] [71] и, таким образом, способствует остеогенезу, способствует развитию гепатоцеллюлярной карциномы. прогрессии, способствует пролиферации и метастазированию или косвенно регулирует экспрессию белков, участвующих в агрессивности рака, соответственно.
Синдром Прадера-Вилли
Было показано, что делеция 48 копий C / D box snoRNA SNORD116 является основной причиной синдрома Прадера-Вилли . [72] [73] [74] [75] Прадера-Вилли - это нарушение развития, связанное с перееданием и трудностями в обучении. SNORD116 имеет потенциальные сайты-мишени в пределах ряда генов, кодирующих белок, и может играть роль в регулировании альтернативного сплайсинга. [76]
Аутизм
Хромосомный локус, содержащий небольшой кластер генов ядрышковой РНК SNORD115 , был дублирован примерно у 5% людей с аутистическими признаками . [77] [78] Модель мыши, созданная для дублирования кластера SNORD115, демонстрирует аутистическое поведение. [79] Недавнее небольшое исследование посмертной ткани мозга продемонстрировало измененную экспрессию длинных некодирующих РНК в префронтальной коре и мозжечке аутичного мозга по сравнению с контрольной группой. [80]
Гипоплазия волос и хрящей
Было показано, что мутации в РНКазе MRP вызывают гипоплазию хрящей и волос , заболевание, связанное с рядом симптомов, таких как низкий рост, редкие волосы, аномалии скелета и подавленная иммунная система, что часто встречается у амишей и финнов . [81] [82] [83] Лучше всего охарактеризованный вариант - это переход от A к G на нуклеотиде 70, который находится в области петли на два основания 5 ' консервативного псевдоузла . Однако многие другие мутации в РНКазе MRP также вызывают CHH.
Болезнь Альцгеймера
Антисмысловая РНК, BACE1-AS , транскрибируется с цепи, противоположной BACE1, и активируется у пациентов с болезнью Альцгеймера . [84] BACE1-AS регулирует экспрессию BACE1, повышая стабильность мРНК BACE1 и генерируя дополнительный BACE1 посредством посттранскрипционного механизма прямой связи. По тому же механизму он также повышает концентрацию бета-амилоида , основного компонента сенильных бляшек. Концентрации BACE1-AS повышены у субъектов с болезнью Альцгеймера и у мышей, трансгенных по белку-предшественнику амилоида.
miR-96 и потеря слуха
Вариации внутри области зародыша зрелой miR-96 были связаны с аутосомно-доминантной прогрессирующей потерей слуха у людей и мышей. Гомозиготные мутантные мыши были глубоко глухими, не показывая кохлеарные ответов. Гетерозиготные мыши и люди постепенно теряют способность слышать. [85] [86] [87]
Различие между функциональной РНК (фРНК) и нкРНК
Ученые начали отличать функциональную РНК ( фРНК ) от нкРНК, чтобы описать функциональные на уровне РНК области, которые могут быть или не быть автономными транскриптами РНК. [88] [89] [90] Это означает, что фРНК (такие как рибопереключатели, элементы SECIS и другие цис-регуляторные области) не являются нкРНК. Тем не менее, фРНК также может включать мРНК , поскольку это РНК, кодирующая белок, и, следовательно, является функциональной. Кроме того, искусственно созданные РНК также подпадают под общий термин фРНК. В некоторых публикациях [21] утверждается, что ncRNA и fRNA почти синонимичны, однако другие указывали, что большая часть аннотированных ncRNAs, вероятно, не имеет функции. [8] [9] Также было предложено просто использовать термин РНК , поскольку отличие от РНК, кодирующей белок ( информационная РНК ), уже дается квалификатором мРНК . [91] Это устраняет двусмысленность при обращении к гену, «кодирующему некодирующую» РНК. Кроме того, может быть ряд нкРНК, неправильно обозначенных в опубликованной литературе и наборах данных. [92] [93] [94]
Смотрите также
- Внеклеточная РНК
- Список РНК
- Структура нуклеиновой кислоты
- Рфам
- Рибопереключатель
- Рибозим
- РНК, присутствующие в образцах окружающей среды
- VA (вирусно-ассоциированная) РНК
Рекомендации
- ^ Cheng J, Kapranov P, Drenkow J, Dike S, Brubaker S, Patel S, et al. (Май 2005 г.). «Транскрипционные карты 10 хромосом человека с разрешением 5 нуклеотидов». Наука . 308 (5725): 1149–54. Bibcode : 2005Sci ... 308.1149C . DOI : 10.1126 / science.1108625 . PMID 15790807 . S2CID 13047538 .
- ^ Консорциум проекта ENCODE, Бирни Э., Стаматояннопулос Дж. А. , Дутта А., Гиго Р., Джингерас Т. Р. и др. (Июнь 2007 г.). «Идентификация и анализ функциональных элементов в 1% генома человека в рамках пилотного проекта ENCODE» . Природа . 447 (7146): 799–816. Bibcode : 2007Natur.447..799B . DOI : 10,1038 / природа05874 . PMC 2212820 . PMID 17571346 .
- ^ Washietl S, Pedersen JS, Korbel JO, Stocsits C, Gruber AR, Hackermüller J, et al. (Июнь 2007 г.). «Структурированные РНК в выбранных ENCODE областях генома человека» . Геномные исследования . 17 (6): 852–64. DOI : 10.1101 / gr.5650707 . PMC 1891344 . PMID 17568003 .
- ^ а б Моррис К.В., изд. (2012). Некодирующие РНК и эпигенетическая регуляция экспрессии генов: факторы естественного отбора . Caister Academic Press . ISBN 978-1-904455-94-3.
- ^ а б Шахруки П., Ларссон Э (2012). «Некодирующий онкоген: случай отсутствия доказательств ДНК?» . Границы генетики . 3 : 170. DOI : 10,3389 / fgene.2012.00170 . PMC 3439828 . PMID 22988449 .
- ^ ван Бакель Х., Нислоу С., Бленкоу Б.Дж., Хьюз Т.Р. (май 2010 г.). Эдди С.Р. (ред.). «Большинство транскриптов« темной материи »связаны с известными генами» . PLOS Биология . 8 (5): e1000371. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000371 . PMC 2872640 . PMID 20502517 .
- ^ Hüttenhofer A, Schattner P, Polacek N (май 2005 г.). «Некодирующие РНК: надежда или шумиха?». Тенденции в генетике . 21 (5): 289–97. DOI : 10.1016 / j.tig.2005.03.007 . PMID 15851066 .
- ^ а б Brosius J (май 2005 г.). «Не тратьте, не хотите - избыток транскриптов у многоклеточных эукариот». Тенденции в генетике . 21 (5): 287–8. DOI : 10.1016 / j.tig.2005.02.014 . PMID 15851065 .
- ^ а б Палаццо AF, Ли ES (2015). «Некодирующая РНК: что функционально, а что нежелательно?» . Границы генетики . 6 : 2. дои : 10,3389 / fgene.2015.00002 . PMC 4306305 . PMID 25674102 .
- ^ Dahm R (февраль 2005 г.). «Фридрих Мишер и открытие ДНК». Биология развития . 278 (2): 274–88. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2004.11.028 . PMID 15680349 .
- ^ Касперссон Т., Шульц Дж. (1939). «Нуклеотиды пентозы в цитоплазме растущих тканей». Природа . 143 (3623): 602–3. Bibcode : 1939Natur.143..602C . DOI : 10.1038 / 143602c0 . S2CID 4140563 .
- ^ Крик Ф.Х. (1958). «О синтезе белка». Симпозиумы Общества экспериментальной биологии . 12 : 138–63. PMID 13580867 .
- ^ а б Холли Р.В. и др. (Март 1965 г.). «Структура рибонуклеиновой кислоты». Наука . 147 (3664): 1462–5. Bibcode : 1965Sci ... 147.1462H . DOI : 10.1126 / science.147.3664.1462 . PMID 14263761 . S2CID 40989800 .
- ^ а б «Нобелевская премия по физиологии и медицине 1968 года» . Нобелевский фонд . Проверено 28 июля 2007 .
- ^ Мэдисон Дж. Т., Эверетт Г. А., Кунг Х. (июль 1966 г.). «Нуклеотидная последовательность дрожжевой РНК переноса тирозина». Наука . 153 (3735): 531–4. Bibcode : 1966Sci ... 153..531M . CiteSeerX 10.1.1.1001.2662 . DOI : 10.1126 / science.153.3735.531 . PMID 5938777 . S2CID 9265016 .
- ^ Захау Х.Г., Дюттинг Д., Фельдманн Х., Мельхерс Ф., Карау В. (1966). «Рибонуклеиновые кислоты, специфичные для переноса серина. XIV. Сравнение нуклеотидных последовательностей и моделей вторичной структуры». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 31 : 417–24. DOI : 10.1101 / SQB.1966.031.01.054 . PMID 5237198 .
- ^ Дудок Б.С., Кац Г., Тейлор Е.К., Холли Р.В. (март 1969 г.). «Первичная структура РНК переноса фенилаланина зародышей пшеницы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 62 (3): 941–5. Bibcode : 1969PNAS ... 62..941D . DOI : 10.1073 / pnas.62.3.941 . PMC 223689 . PMID 5257014 .
- ^ Крамер Ф., Допнер Х., Хаар Ф. В. Д., Шлимме Э., Зайдель Х. (декабрь 1968 г.). «О конформации транспортной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 61 (4): 1384–91. Bibcode : 1968PNAS ... 61.1384C . DOI : 10.1073 / pnas.61.4.1384 . PMC 225267 . PMID 4884685 .
- ^ Ladner JE, et al. (Ноябрь 1975 г.). «Структура дрожжевой РНК переноса фенилаланина при разрешении 2,5 A» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 72 (11): 4414–8. Полномочный код : 1975PNAS ... 72.4414L . DOI : 10.1073 / pnas.72.11.4414 . PMC 388732 . PMID 1105583 .
- ^ Ким Ш. и др. (Январь 1973 г.). «Трехмерная структура дрожжевой РНК-переносчика фенилаланина: фолдинг полинуклеотидной цепи». Наука . 179 (4070): 285–8. Bibcode : 1973Sci ... 179..285K . DOI : 10.1126 / science.179.4070.285 . PMID 4566654 . S2CID 28916938 .
- ^ а б Эдди С.Р. (декабрь 2001 г.). «Некодирующие гены РНК и современный мир РНК». Обзоры природы. Генетика . 2 (12): 919–29. DOI : 10.1038 / 35103511 . PMID 11733745 . S2CID 18347629 .
- ^ Данехольт, Бертил. «Дополнительная информация: РНК-интерференция» . Нобелевская премия по физиологии и медицине 2006 года . Архивировано из оригинала на 2007-01-20 . Проверено 25 января 2007 .
- ^ Джеффарес, округ Колумбия, Пул А.М., Пенни Д. (январь 1998 г.). «Реликвии из мира РНК». Журнал молекулярной эволюции . 46 (1): 18–36. Bibcode : 1998JMolE..46 ... 18J . DOI : 10.1007 / PL00006280 . PMID 9419222 . S2CID 2029318 .
- ^ Пул А.М., Джеффарес, округ Колумбия, Пенни Д. (январь 1998 г.). «Путь из мира РНК». Журнал молекулярной эволюции . 46 (1): 1–17. Bibcode : 1998JMolE..46 .... 1P . DOI : 10.1007 / PL00006275 . PMID 9419221 . S2CID 17968659 .
- ^ Пул А., Джеффарес Д., Пенни Д. (октябрь 1999 г.). «Ранняя эволюция: прокариоты, новые дети в блоке». BioEssays . 21 (10): 880–9. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-1878 (199910) 21:10 <880 :: AID-BIES11> 3.0.CO; 2-P . PMID 10497339 .
- ^ Ban N, Nissen P, Hansen J, Moore PB, Steitz TA (август 2000 г.). «Полная атомная структура большой субъединицы рибосомы при разрешении 2,4 А». Наука . 289 (5481): 905–20. Bibcode : 2000Sci ... 289..905B . CiteSeerX 10.1.1.58.2271 . DOI : 10.1126 / science.289.5481.905 . PMID 10937989 .
- ^ Чжу Ю., Стрибинскис В., Рамос К.С., Ли Ю. (май 2006 г.). «Анализ последовательности РНКазы MRP РНК показывает ее происхождение от РНК эукариотической РНКазы P» . РНК . 12 (5): 699–706. DOI : 10,1261 / rna.2284906 . PMC 1440897 . PMID 16540690 .
- ^ Кишор С., Штамм С. (январь 2006 г.). «SnoRNA HBII-52 регулирует альтернативный сплайсинг серотонинового рецептора 2C». Наука . 311 (5758): 230–2. Bibcode : 2006Sci ... 311..230K . DOI : 10.1126 / science.1118265 . PMID 16357227 . S2CID 44527461 .
- ^ Штейн AJ, Fuchs G, Fu C, Wolin SL, Reinisch KM (май 2005 г.). «Структурное понимание контроля качества РНК: аутоантиген Ro связывает неправильно свернутые РНК через свою центральную полость» . Cell . 121 (4): 529–39. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.03.009 . PMC 1769319 . PMID 15907467 .
- ^ а б Christov CP, Gardiner TJ, Szüts D, Krude T (сентябрь 2006 г.). «Функциональная потребность в некодирующих Y РНК для репликации хромосомной ДНК человека» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (18): 6993–7004. DOI : 10.1128 / MCB.01060-06 . PMC 1592862 . PMID 16943439 .
- ^ Чжан А.Т., Лэнгли А.Р., Христов С.П., Хейр Э., Шафи Т., Гардинер Т.Дж., Круде Т. (июнь 2011 г.). «Динамическое взаимодействие Y РНК с хроматином и белками инициации во время репликации ДНК человека» . Журнал клеточной науки . 124 (Pt 12): 2058–69. DOI : 10,1242 / jcs.086561 . PMC 3104036 . PMID 21610089 .
- ^ Холл А.Е., Тернбулл С., Далмей Т. (апрель 2013 г.). «Y РНК: последние разработки». Биомолекулярные концепции . 4 (2): 103–10. DOI : 10.1515 / Bmc-2012-0050 . PMID 25436569 . S2CID 12575326 .
- ^ Лернер М.Р., Бойл Дж. А., Хардин Дж. А., Стейтц Дж. А. (январь 1981 г.). «Два новых класса малых рибонуклеопротеидов, обнаруживаемые антителами, связанными с красной волчанкой». Наука . 211 (4480): 400–2. Bibcode : 1981Sci ... 211..400L . DOI : 10.1126 / science.6164096 . PMID 6164096 .
- ^ Райнер Р., Бен-Асули Ю., Крыловецкий И., Ярроус Н. (июнь 2006 г.). «Роль каталитической рибонуклеопротеиновой РНКазы Р в транскрипции РНК-полимеразы III» . Гены и развитие . 20 (12): 1621–35. DOI : 10,1101 / gad.386706 . PMC 1482482 . PMID 16778078 .
- ^ Эспиноза CA, Аллен Т.А., Hieb AR, Kugel JF, Goodrich JA (сентябрь 2004 г.). «B2 РНК напрямую связывается с РНК-полимеразой II, подавляя синтез транскриптов». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (9): 822–9. DOI : 10.1038 / nsmb812 . PMID 15300239 . S2CID 22199826 .
- ^ Хирота К., Миёси Т., Куго К., Хоффман К.С., Шибата Т., Охта К. (ноябрь 2008 г.). «Поэтапное ремоделирование хроматина каскадом инициации транскрипции некодирующих РНК». Природа . 456 (7218): 130–4. Bibcode : 2008Natur.456..130H . DOI : 10,1038 / природа07348 . PMID 18820678 . S2CID 4416402 .
- ^ Парк Y, Келли Р.Л., О-Х., Курода М.И., Меллер В.Х. (ноябрь 2002 г.). «Степень распространения хроматина, определяемая привлечением roX РНК белков MSL». Наука . 298 (5598): 1620–3. Bibcode : 2002Sci ... 298.1620P . DOI : 10.1126 / science.1076686 . PMID 12446910 . S2CID 27167367 .
- ^ Wadler CS, Vanderpool CK (декабрь 2007 г.). «Двойная функция бактериальной малой РНК: SgrS выполняет регуляцию, зависящую от спаривания оснований, и кодирует функциональный полипептид» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (51): 20454–9. Bibcode : 2007PNAS..10420454W . DOI : 10.1073 / pnas.0708102104 . PMC 2154452 . PMID 18042713 .
- ^ Динджер М.Э., Пан К.С., Мерсер Т.Р., Маттик Дж.С. (ноябрь 2008 г.). Макэнтайр Дж (ред.). «Дифференциация белок-кодирующих и некодирующих РНК: проблемы и неоднозначности» . PLOS Вычислительная биология . 4 (11): e1000176. Bibcode : 2008PLSCB ... 4E0176D . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1000176 . PMC 2518207 . PMID 19043537 .
- ^ Сарайя А.А., Ван СС (ноябрь 2008 г.). Гольдберг Д.Е. (ред.). «snoRNA, новый предшественник микроРНК в Giardia lamblia» . PLOS Патогены . 4 (11): e1000224. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1000224 . PMC 2583053 . PMID 19043559 .
- ^ Эндер С., Крек А., Фридлендер М. Р., Бейтцингер М., Вайнманн Л., Чен В., Пфеффер С., Раевски Н., Майстер Г. (ноябрь 2008 г.). «Человеческая мяРНК с функциями, подобными микроРНК». Молекулярная клетка . 32 (4): 519–28. DOI : 10.1016 / j.molcel.2008.10.017 . PMID 19026782 .
- ^ Лейг Э (август 2007 г.). «Активатор РНК стероидных рецепторов (SRA1): необычные двухсторонние генные продукты с подозрением на связь с раком груди» . Сигнализация ядерных рецепторов . 5 : e006. DOI : 10.1621 / nrs.05006 . PMC 1948073 . PMID 17710122 .
- ^ Чжан Дж, король М.Л. (декабрь 1996 г.). «РНК Xenopus VegT локализуется в вегетативной коре головного мозга во время оогенеза и кодирует новый фактор транскрипции Т-бокса, участвующий в формировании мезодермального паттерна». Развитие . 122 (12): 4119–29. PMID 9012531 .
- ^ Клок М., Вилк К., Варгас Д., Ширато Ю., Билински С., Эткин Л.Д. (август 2005 г.). «Возможная структурная роль некодирующих и кодирующих РНК в организации цитоскелета вегетативной коры ооцитов Xenopus» . Развитие . 132 (15): 3445–57. DOI : 10.1242 / dev.01919 . PMID 16000384 .
- ^ Дженни А., Хашет О, Заворски П., Цирклафф А., Вестон, доктор медицины, Джонстон Д.С., Эрдели М., Эфрусси А. (август 2006 г.). «Независимая от трансляции роль oskar РНК в раннем оогенезе Drosophila» . Развитие . 133 (15): 2827–33. DOI : 10.1242 / dev.02456 . PMID 16835436 .
- ^ Гультяев А.П., Русси А (2007). «Идентификация консервативных вторичных структур и сегментов экспансии в РНК enod40 выявляет новые гомологи enod40 в растениях» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (9): 3144–52. DOI : 10.1093 / NAR / gkm173 . PMC 1888808 . PMID 17452360 .
- ^ Candeias MM, Malbert-Colas L, Powell DJ, Daskalogianni C, Maslon MM, Naski N, Bourougaa K, Calvo F, Fåhraeus R (сентябрь 2008 г.). «МРНК P53 контролирует активность p53, управляя функциями Mdm2». Природа клеточной биологии . 10 (9): 1098–105. DOI : 10.1038 / ncb1770 . PMID 19160491 . S2CID 5122088 .
- ^ Гимпель М., Прейс Х., Барт Э., Грамцов Л., Брантл С. (декабрь 2012 г.). «SR1 - малая РНК с двумя удивительно консервативными функциями» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (22): 11659–72. DOI : 10.1093 / NAR / gks895 . PMC 3526287 . PMID 23034808 .
- ^ Francastel C, Hubé F (ноябрь 2011 г.). «Кодирование или не кодирование: нужно ли, чтобы они были эксклюзивными?» . Биохимия . 93 (11): vi – vii. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (11) 00322-1 . PMID 21963143 .
- ^ Семпере Л.Ф., Сокол Н.С., Дубровский Е.Б., Бергер Е.М., Амброс В. (июль 2003 г.). «Временная регуляция экспрессии микроРНК в Drosophila melanogaster, опосредованная гормональными сигналами и активностью генов широкого комплекса». Биология развития . 259 (1): 9–18. DOI : 10.1016 / S0012-1606 (03) 00208-2 . PMID 12812784 .
- ^ Adams BD, Furneaux H, White BA (май 2007 г.). «Микро-рибонуклеиновая кислота (miRNA) miR-206 нацелена на человеческий рецептор эстрогена-альфа (ERalpha) и подавляет экспрессию РНК-мессенджера ERalpha и белка в линиях клеток рака молочной железы» . Молекулярная эндокринология . 21 (5): 1132–47. DOI : 10.1210 / me.2007-0022 . PMID 17312270 .
- ^ Knoll M, Lodish HF, Sun L (март 2015 г.). «Длинные некодирующие РНК как регуляторы эндокринной системы» . Обзоры природы. Эндокринология . 11 (3): 151–60. DOI : 10.1038 / nrendo.2014.229 . ЛВП : 1721,1 / 116703 . PMC 4376378 . PMID 25560704 .
- ^ Ли В., Нотани Д., Ма Кью, Танаса Б., Нуньез Э., Чен А.Й., Меркурджев Д., Чжан Дж., Охги К., Сонг Х, О С., Ким Х.С., Гласс С.К., Розенфельд М.Г. (июнь 2013 г.). «Функциональные роли энхансерных РНК для эстроген-зависимой транскрипционной активации» . Природа . 498 (7455): 516–20. Bibcode : 2013Natur.498..516L . DOI : 10,1038 / природа12210 . PMC 3718886 . PMID 23728302 .
- ^ «Исследователи обнаруживают, как черви передают знания о возбудителе потомству» . Phys.org . Дата обращения 11 октября 2020 .
- ^ Калецкий, Рахиль; Мур, Ребекка С .; Врла, Джеффри Д .; Parsons, Lance R .; Гитай, Земер; Мерфи, Колин Т. (9 сентября 2020 г.). «C. elegans интерпретирует бактериальные некодирующие РНК, чтобы научиться избегать патогенов» . Природа : 1–7. DOI : 10.1038 / s41586-020-2699-5 . ISSN 1476-4687 . Дата обращения 11 октября 2020 .
- ^ Pibouin L, Villaudy J, Ferbus D, Muleris M, Prospéri MT, Remvikos Y, Goubin G (февраль 2002 г.). «Клонирование мРНК сверхэкспрессии в карциноме толстой кишки-1: последовательность сверхэкспрессируется в подмножестве карцином толстой кишки». Генетика и цитогенетика рака . 133 (1): 55–60. DOI : 10.1016 / S0165-4608 (01) 00634-3 . PMID 11890990 .
- ^ Fu X, Ravindranath L, Tran N, Petrovics G, Srivastava S (март 2006 г.). «Регулирование апоптоза с помощью некодирующего гена, специфичного и связанного с раком простаты, PCGEM1». ДНК и клеточная биология . 25 (3): 135–41. DOI : 10.1089 / dna.2006.25.135 . PMID 16569192 .
- ^ Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (январь 2009 г.). «GAS5, РНК, не кодирующая белок, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди» . Онкоген . 28 (2): 195–208. DOI : 10.1038 / onc.2008.373 . PMID 18836484 .
- ^ Dong XY, Guo P, Boyd J, Sun X, Li Q, Zhou W, Dong JT (август 2009 г.). «Влияние snoRNA U50 на рак груди человека» . Журнал генетики и геномики = И Чуань Сюэ Бао . 36 (8): 447–54. DOI : 10.1016 / S1673-8527 (08) 60134-4 . PMC 2854654 . PMID 19683667 .
- ^ Христов С.П., Тривье Э., Круде Т. (март 2008 г.). «Некодирующие человеческие Y-РНК сверхэкспрессируются в опухолях и необходимы для пролиферации клеток» . Британский журнал рака . 98 (5): 981–8. DOI : 10.1038 / sj.bjc.6604254 . PMC 2266855 . PMID 18283318 .
- ^ Фарх К.К., Гримсон А., Ян С., Льюис Б.П., Джонстон В.К., Лим LP, Бердж CB, Бартель Д.П. (декабрь 2005 г.). «Широкое влияние микроРНК млекопитающих на репрессию и эволюцию мРНК». Наука . 310 (5755): 1817–21. Bibcode : 2005Sci ... 310.1817F . DOI : 10.1126 / science.1121158 . PMID 16308420 . S2CID 1849875 .
- ^ Лим LP, Лау NC, Гарретт-Энгеле П., Гримсон А., Шелтер Дж. М., Касл Дж., Бартель Д. П., Линсли П. С., Джонсон Дж. М. (февраль 2005 г.). «Анализ микроматрицы показывает, что некоторые микроРНК подавляют большое количество целевых мРНК». Природа . 433 (7027): 769–73. Bibcode : 2005Natur.433..769L . DOI : 10,1038 / природа03315 . PMID 15685193 . S2CID 4430576 .
- ^ Калин Г.А., Феррачин М., Чиммино А., Ди Лева Г., Шимицу М., Войчик С.Е., Иорио М.В., Висоне Р., Север Н.И., Фаббри М., Юлиано Р., Палумбо Т., Пичиорри Ф., Рольдо С., Гарсон Р., Севиньяни К., Рассенти Л., Альдер Х., Волиния С., Лю К.Г., Киппс Т.Дж., Негрини М., Кроче С.М. (октябрь 2005 г.). «Сигнатура MicroRNA, связанная с прогнозом и прогрессированием хронического лимфолейкоза». Медицинский журнал Новой Англии . 353 (17): 1793–801. DOI : 10.1056 / NEJMoa050995 . PMID 16251535 .
- ^ Калин Г.А., Думитру С.Д., Шимицу М., Бичи Р., Зупо С., Ноч Э, Олдлер Х., Ротанг С., Китинг М., Рай К., Рассенти Л., Киппс Т., Негрини М., Буллрих Ф., Кроче С.М. (ноябрь 2002 г.). «Частые делеции и подавление микро-РНК генов miR15 и miR16 в 13q14 при хроническом лимфолейкозе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (24): 15524–9. Bibcode : 2002PNAS ... 9915524C . DOI : 10.1073 / pnas.242606799 . PMC 137750 . PMID 12434020 .
- ^ Ху З, Чен Дж, Тянь Т, Чжоу Х, Гу Х, Сюй Л., Цзэн И, Мяо Р, Цзинь Г, Ма Х, Чен И, Шен Х (июль 2008 г.). «Генетические варианты последовательностей miRNA и выживаемость при немелкоклеточном раке легкого» . Журнал клинических исследований . 118 (7): 2600–8. DOI : 10.1172 / JCI34934 . PMC 2402113 . PMID 18521189 .
- ^ Шэнь Дж., Амброзоне CB, Чжао Х. (март 2009 г.). «Новые генетические варианты в генах микроРНК и семейном раке груди». Международный журнал рака . 124 (5): 1178–82. DOI : 10.1002 / ijc.24008 . PMID 19048628 .
- ^ Цзя, Бо; Ван, Чжипин; Сунь, Сян; Чен, Цзюнь; Чжао, Цзяньцзян; Цю, Сяолин (декабрь 2019 г.). «Длинная некодирующая РНК LINC00707 губки miR-370-3p для стимулирования остеогенеза мезенхимальных стволовых клеток, полученных из костного мозга человека, посредством активации WNT2B» . Исследование стволовых клеток и терапия . 10 (1): 67. DOI : 10,1186 / s13287-019-1161-9 . ISSN 1757-6512 . PMC 6387535 . PMID 30795799 .
- ^ Ту, Цзяньфэй; Чжао, Чжунвэй; Сюй, Мин; Чен, Миньцзян; Вэн, Цяоюй; Ван, Цзянмэй; Цзи, Цзянсун (июль 2019 г.). «LINC00707 вносит вклад в прогрессирование гепатоцеллюлярной карциномы посредством размягчения miR ‐ 206 для увеличения CDK14» . Журнал клеточной физиологии . 234 (7): 10615–10624. DOI : 10.1002 / jcp.27737 . ISSN 0021-9541 .
- ^ Се, Мин; Ма, Тяньши; Сюэ, Цзянъян; Ма, Хунвэй; Солнце, Мин; Чжан, Чжихун; Лю Миньцзюань; Лю, Инхуа; Джу, Сонгвен; Ван, Чжаосиа; Де, Вэй (февраль 2019 г.). «Длинная межгенная небелковая кодирующая РНК 707 способствует пролиферации и метастазированию рака желудка за счет взаимодействия со стабилизирующим мРНК белком HuR» . Письма о раке . 443 : 67–79. DOI : 10.1016 / j.canlet.2018.11.032 .
- ^ Ли, Тонг; Ли, Юньпэн; Вс, Хунъянь (2019-06-06). «МикроРНК-876 образована длинной некодирующей РНК LINC00707 и напрямую нацелена на метадгерин для подавления злокачественного новообразования молочной железы». Лечение рака и исследования . DOI : 10,2147 / cmar.s210845 . PMC 6559252 . PMID 31239777 . Отсутствует или пусто
|url=
( справка ) - ^ Юань, R.-X .; Bao, D .; Чжан, Ю. (май 2020 г.). «Linc00707 способствует пролиферации, инвазии и миграции клеток через регуляторную петлю miR-30c / CTHRC1 при раке груди» . Европейский обзор медицинских и фармакологических наук . 24 (9): 4863–4872. DOI : 10,26355 / eurrev_202005_21175 . ISSN 1128-3602 .
- ^ Саху Т., дель Гаудио Д., Герман-младший, Шинави М., Петерс С.У., Лицо Р.Э., Гарника А., Чунг С.В., Боде А.Л. «Фенотип Прадера-Вилли, вызванный отцовской недостаточностью для небольшого кластера ядрышковой РНК HBII-85 C / D box» . Генетика природы . 40 (6): 719–21. DOI : 10.1038 / ng.158 . PMC 2705197 . PMID 18500341 .
- ^ Скрябин Б.В., Губарь Л.В., Сигер Б., Пфайфер Дж., Гендель С., Робек Т., Карпова Е., Рождественский Т.С., Брозиус Дж. (Декабрь 2007 г.). «Делеция генного кластера мяРНК MBII-85 у мышей приводит к задержке послеродового роста» . PLOS Genetics . 3 (12): e235. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0030235 . PMC 2323313 . PMID 18166085 .
- ^ Динг Ф., Ли Х. Х., Чжан С., Соломон Н. М., Кампер С. А., Коэн П., Франк У. (март 2008 г.). Акбарян С (ред.). «Делеция SnoRNA Snord116 (Pwcr1 / MBII-85) вызывает дефицит роста и гиперфагию у мышей» . PLOS ONE . 3 (3): e1709. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.1709D . DOI : 10.1371 / journal.pone.0001709 . PMC 2248623 . PMID 18320030 .
- ^ Ding F, Prints Y, Dhar MS, Johnson DK, Garnacho-Montero C, Nicholls RD, Francke U (июнь 2005 г.). «Отсутствие мяРНК Pwcr1 / MBII-85 критично для неонатальной летальности в моделях мышей с синдромом Прадера-Вилли». Геном млекопитающих . 16 (6): 424–31. DOI : 10.1007 / s00335-005-2460-2 . PMID 16075369 . S2CID 12256515 .
- ^ Базелей П.С., Шепелев В., Талебизаде З., Батлер М.Г., Федорова Л., Филатов В., Федоров А. (январь 2008 г.). "snoTARGET показывает, что человеческие мишени snoRNA-сирот располагаются близко к альтернативным сплайсинговым соединениям" . Джин . 408 (1–2): 172–9. DOI : 10.1016 / j.gene.2007.10.037 . PMC 6800007 . PMID 18160232 .
- ^ Болтон П.Ф., Велтман М.В., Вайсблатт Э., Холмс-младший, Томас Н.С., Юингс С.А., Томпсон Р.Дж., Робертс С.Е., Деннис Н.Р., Браун С.Е., Гудсон С., Мур В., Браун Дж. (Сентябрь 2004 г.). «Аномалии хромосомы 15q11-13 и другие заболевания у людей с расстройствами аутистического спектра». Психиатрическая генетика . 14 (3): 131–7. DOI : 10.1097 / 00041444-200409000-00002 . PMID 15318025 . S2CID 37344935 .
- ^ Cook EH, Scherer SW (октябрь 2008 г.). «Вариации числа копий, связанные с психоневрологическими состояниями». Природа . 455 (7215): 919–23. Bibcode : 2008Natur.455..919C . DOI : 10,1038 / природа07458 . PMID 18923514 . S2CID 4377899 .
- ^ Накатани Дж, Тамада К., Хатанака Ф, Исэ С, Охта Х, Иноуэ К., Томонага С., Ватанабэ Й, Чунг Й.Дж., Банерджи Р., Ивамото К., Като Т, Окадзава М., Ямаути К., Танда К., Такао К., Миякава Т. , Брэдли А., Такуми Т. (июнь 2009 г.). «Аномальное поведение в модели мышей, созданной с помощью хромосом, для дупликации 15q11-13 человека, наблюдаемой при аутизме» . Cell . 137 (7): 1235–46. DOI : 10.1016 / j.cell.2009.04.024 . PMC 3710970 . PMID 19563756 .
- ^ Зиац М.Н., Реннерт О.М. (март 2013 г.). «Аберрантная экспрессия длинных некодирующих РНК в головном мозге аутистов» . Журнал молекулярной неврологии . 49 (3): 589–93. DOI : 10.1007 / s12031-012-9880-8 . PMC 3566384 . PMID 22949041 .
- ^ Ridanpää M, van Eenennaam H, Pelin K, Chadwick R, Johnson C, Yuan B, vanVenrooij W., Pruijn G, Salmela R, Rockas S, Mäkitie O, Kaitila I, de la Chapelle A (январь 2001 г.). «Мутации в РНК-компоненте РНКазы MRP вызывают плейотропное заболевание человека, гипоплазию волос и хрящей». Cell . 104 (2): 195–203. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00205-7 . PMID 11207361 . S2CID 13977736 .
- ^ Мартин А.Н., Ли И (март 2007 г.). «РНКаза MRP РНК и генетические заболевания человека» . Клеточные исследования . 17 (3): 219–26. DOI : 10.1038 / sj.cr.7310120 . PMID 17189938 .
- ^ Кавадас Ф.Д., Джилиани С., Гу Й., Маццолари Э., Бейтс А., Пегояни Э., Ройфман С.М., Нотаранджело Л. Д. (декабрь 2008 г.). «Вариабельность клинических и лабораторных особенностей у пациентов с мутациями гена эндорибонуклеазы, обрабатывающими митохондриальную РНК рибонуклеазой». Журнал аллергии и клинической иммунологии . 122 (6): 1178–84. DOI : 10.1016 / j.jaci.2008.07.036 . PMID 18804272 .
- ^ Faghihi MA, Modarresi F, Khalil AM, Wood DE, Sahagan BG, Morgan TE, Finch CE, St Laurent G, Kenny PJ, Wahlestedt C (июль 2008 г.). «Экспрессия некодирующей РНК повышается при болезни Альцгеймера и обеспечивает быструю прямую регуляцию бета-секретазы» . Природная медицина . 14 (7): 723–30. DOI : 10.1038 / nm1784 . PMC 2826895 . PMID 18587408 .
- ^ Mencía A, Modamio-Høybjør S, Redshaw N, Morín M, Mayo-Merino F, Olavarrieta L, Aguirre LA, del Castillo I, Steel KP, Dalmay T., Moreno F, Moreno-Pelayo MA (май 2009 г.). «Мутации в области зародыша miR-96 человека ответственны за несиндромную прогрессирующую потерю слуха». Генетика природы . 41 (5): 609–13. DOI : 10.1038 / ng.355 . PMID 19363479 . S2CID 11113852 .
- ^ Lewis MA, Quint E, Glazier AM, Fuchs H, De Angelis MH, Langford C, van Dongen S, Abreu-Goodger C, Piipari M, Redshaw N, Dalmay T., Moreno-Pelayo MA, Enright AJ, Steel KP (май 2009 г.) ). «ENU-индуцированная мутация miR-96, связанная с прогрессирующей потерей слуха у мышей» . Генетика природы . 41 (5): 614–8. DOI : 10.1038 / ng.369 . PMC 2705913 . PMID 19363478 .
- ^ Соукуп Г.А. (июнь 2009 г.). «Немного, но громко: малые РНК оказывают сильное влияние на развитие ушей» . Исследование мозга . 1277 : 104–14. DOI : 10.1016 / j.brainres.2009.02.027 . PMC 2700218 . PMID 19245798 .
- ^ Картер Р.Дж., Дубчак И., Холбрук С.Р. (октябрь 2001 г.). «Вычислительный подход к идентификации генов функциональных РНК в геномных последовательностях» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (19): 3928–38. DOI : 10.1093 / NAR / 29.19.3928 . PMC 60242 . PMID 11574674 .
- ^ Pedersen JS, Bejerano G, Siepel A, Rosenbloom K, Lindblad-Toh K, Lander ES, Kent J, Miller W, Haussler D (апрель 2006 г.). «Идентификация и классификация консервативных вторичных структур РНК в геноме человека» . PLOS Вычислительная биология . 2 (4): e33. Bibcode : 2006PLSCB ... 2 ... 33P . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.0020033 . PMC 1440920 . PMID 16628248 .
- ^ Томас Дж. М., Хорспул Д., Браун Дж., Черепанов В., Аптон К. (январь 2007 г.). «GraphDNA: программа на Java для графического отображения анализов состава ДНК» . BMC Bioinformatics . 8 : 21. DOI : 10,1186 / 1471-2105-8-21 . PMC 1783863 . PMID 17244370 .
- ^ Бросиус Дж., Раабе, Калифорния (февраль 2015 г.). «Что такое РНК? Верхний уровень классификации РНК» . Биология РНК . 13 (2): 140–4. DOI : 10.1080 / 15476286.2015.1128064 . PMC 4829331 . PMID 26818079 .
- ^ Цзи, Чжэ; Песня, Жуйшэн; Регев, Авив; Struhl, Кевин (2015-12-19). «Многие днРНК, 5'UTR и псевдогены транслируются, а некоторые, вероятно, экспрессируют функциональные белки» . eLife . 4 : e08890. DOI : 10.7554 / eLife.08890 . ISSN 2050-084X . PMC 4739776 . PMID 26687005 .
- ^ Тосар, Хуан Пабло; Ровира, Карлос; Кайота, Альфонсо (22 января 2018 г.). «Некодирующие фрагменты РНК составляют большинство аннотированных пиРНК, экспрессируемых в соматических негонадных тканях» . Биология коммуникации . 1 (1): 2. DOI : 10.1038 / s42003-017-0001-7 . ISSN 2399-3642 . PMC 6052916 . PMID 30271890 .
- ^ Хаусман, Гали; Улицкий, Игорь (январь 2016). «Методы различения кодирующих белок и длинных некодирующих РНК и неуловимая биологическая цель трансляции длинных некодирующих РНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов . 1859 (1): 31–40. DOI : 10.1016 / j.bbagrm.2015.07.017 . ISSN 0006-3002 . PMID 26265145 .
Внешние ссылки
- Обширная база данных нкРНК млекопитающих
( Копия Wayback Machine )
- База данных Rfam - тщательно подобранный список сотен семейств связанных нкРНК
- NONCODE.org - бесплатная база данных всех видов некодирующих РНК (кроме тРНК и рРНК)
- RNAcon Предсказание и классификация нкРНК BMC Genomics 2014, 15: 127
- ENCODE thread explorer Описание некодирующих РНК. Природа (журнал)
- Ресурс баз данных некодирующей РНК (NRDR) - тщательно подобранный источник данных, связанных с базами данных РНК, которые не кодируют, доступными через Интернет.
- DASHR - база данных малых некодирующих РНК Bioinformatics 2018