Последовательность нуклеиновой кислоты представляет собой последовательность оснований в нуклеотидах, образующих аллели внутри молекулы ДНК (с использованием GACT) или РНК (GACU). Эта последовательность обозначается серией из пяти разных букв, обозначающих порядок нуклеотидов. По соглашению последовательности обычно располагаются от 5'-конца к 3'-концу . Для ДНК с ее двойной спиралью существует два возможных направления обозначенной последовательности; из этих двух используется смысловая цепь . Поскольку нуклеиновые кислоты обычно представляют собой линейные (неразветвленные) полимеры , определение последовательности эквивалентно определению ковалентной структуры всей молекулы. По этой причине последовательность нуклеиновой кислоты также называют первичной структурой .
Последовательность представляет генетическую информацию . Биологическая дезоксирибонуклеиновая кислота представляет собой информацию , направляющую функции организма .
Нуклеиновые кислоты также имеют вторичную структуру и третичную структуру . Первичную структуру иногда ошибочно называют «первичной последовательностью». Однако не существует параллельной концепции вторичной или третичной последовательности.
Нуклеиновые кислоты состоят из цепочки связанных единиц, называемых нуклеотидами. Каждый нуклеотид состоит из трех субъединиц: фосфатная группа и сахар ( рибоза в случае РНК , дезоксирибоза в ДНК ) составляют основу цепи нуклеиновой кислоты, а к сахару присоединено одно из множества нуклеиновых оснований . Нуклеиновые основания играют важную роль в спаривании оснований нитей для формирования вторичных и третичных структур более высокого уровня , таких как знаменитая двойная спираль .
Возможные буквы: A , C , G и T , обозначающие четыре нуклеотидных основания цепи ДНК – аденин , цитозин , гуанин , тимин – ковалентно связанные с фосфодиэфирным остовом. В типичном случае последовательности печатаются примыкающими друг к другу без промежутков, как в последовательности AAAGTCTGAC, читаемой слева направо в направлении от 5’ к 3’ . Что касается транскрипции , последовательность находится в кодирующей цепи, если она имеет тот же порядок, что и транскрибируемая РНК.
Одна последовательность может быть комплементарной другой последовательности, что означает, что они имеют основание в каждой позиции в комплементарном (т. е. от A до T, от C до G) и в обратном порядке. Например, последовательность, комплементарная TTAC, представляет собой GTAA. Если одна цепь двухцепочечной ДНК считается смысловой цепью, то другая цепь, называемая антисмысловой цепью, будет иметь последовательность, комплементарную смысловой цепи.