Acidilobus saccharovorans является thermoacidophilic (то есть, оба термофильными и ацидофильным ) виды из анаэробных архебактерий . Этот вид был впервые описан в 2009 году после тогоизолированно от горячих источников в Камчатке . [2] [3]
Acidilobus saccharovorans | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | Acidilobus saccharovorans |
Биномиальное имя | |
Acidilobus saccharovorans |
Описание
A. saccharovorans имеет кокковидную морфологию диаметром 1-2 мкм с относительно толстым S-слоем и пучком жгутиков . Он имеет оптимальную температуру роста 80–85 ° C (квалифицируя его как гипертермофил ) и оптимальный pH 3,5–4,0. Это облигатный анаэроб с ферментативным метаболизмом. Его рост ускоряется наличием элементарной серы , которая восстанавливается до сероводорода ; однако сера не важна для роста. Он устойчив к антибиотикам хлорамфеникола , пенициллина и стрептомицина . [2] A. saccharovorans отличается от A. aceticus , единственного другого признанного вида в этом роде, в двух основных отношениях: он жгутик, тогда как A. aceticus неподвижен; и он способен расти на более широком разнообразии субстратов, включая многие сахара и полисахариды . [4] [3] Его название связано с этим свойством метаболизма. [2]
Геном и метаболизм
О последовательности генома A. saccharovorans сообщили в 2010 году как о первом полном геноме архей, термоацидофильных и облигатно анаэробных. [5] Геном содержит гены, соответствующие метаболическим путям Эмбдена-Мейерхофа и Энтнера-Дудорова . Неожиданно было обнаружено, что он также содержит гены, кодирующие ферменты окислительного цикла трикарбоновых кислот , хотя и без ключевого фермента, цитратлиазы АТФ , который позволил бы этому пути работать восстановительно. В отличие от архей, он кодирует путь бета-окисления , который, как ожидается, позволит ему расти на триацилглицеридах и жирных кислотах . [5] Однако эти метаболические возможности еще не были продемонстрированы экспериментально. [6] Предсказанный протеом также содержит ряд особенностей, интерпретируемых как адаптация к росту в кислых условиях за счет использования высокой внеклеточной концентрации протонов . [5]
Филогенетика
Сравнение с другими секвенированными геномами предполагает, что A. saccharovorans наиболее близок к Aeropyrum pernix . Геном также содержит свидетельства горизонтального переноса генов между Acidilobales и Sulfolobales , отряд аэробных термоацидофилов, часто встречающихся в одних и тех же горячих источниках. В A. saccharovorans последовательность генома была первоначально сообщалось , для поддержки создания нового заказа , Acidilobales , содержащий семейства Acidilobaceae и Caldisphaeraceae , [5] , который в настоящее время принимаются. [1] Однако филогеномическое исследование консервативных последовательностей архей в 2015 году показало, что эти два семейства лучше расположить в порядке Desulfurococcales , который также содержит Aeropyrum pernix . [7]
Экология
Виды Acidilobales широко распространены в горячих источниках с кислой средой, где они, вероятно, играют роль в полном окислении органического материала. Основываясь на метаболических возможностях, предсказанных на основе генома A. saccharovorans , Acidilobales метаболически сходны с Thermoproteales , и эти два отряда могут выполнять аналогичные экологические роли в кислых и нейтральных горячих источниках соответственно. [2] [6]
Рекомендации
- ^ а б «Acidilobus aceticus» . Интегрированная система таксономической информации . Проверено 10 июня +2016 .
- ^ а б в г д Прокофьева М.И.; Кострикина Н.А.; Колганова, Т.В. Турова, Т.П .; Лысенко АМ; Лебединский, А В; Бонч-Осмоловская Е.А. (декабрь 2009 г.). «Выделение анаэробного термоацидофильного кренархеота Acidilobus saccharovorans sp. Nov. И предложение Acidilobales ord. Nov., Включая Acidilobaceae fam. Nov. И Caldisphaeraceae fam. Nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (Pt 12): 3116–22. DOI : 10.1099 / ijs.0.010355-0 . PMID 19643887 .
- ^ а б Прокофьева Мария; Меркель, Александр; Лебединский, Александр; Бонч-Осмоловская, Елисавета (2014). «Семья Acidilobaceae». Прокариоты: другие основные родословные бактерий и архей : 9–14. DOI : 10.1007 / 978-3-642-38954-2_332 . ISBN 978-3-642-38953-5.
- ^ Прокофьева М.И.; Мирошниченко, М.Л .; Кострикина Н.А.; Черных Н.А. Кузнецов, ББ; Турова, Т.П .; Бонч-Осмоловская Е.А. (ноябрь 2000 г.). «Acidilobus aceticus gen. Nov., Sp. Nov., Новый анаэробный термоацидофильный археон из континентальных горячих источников Камчатки». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (6): 2001–8. DOI : 10.1099 / 00207713-50-6-2001 . PMID 11155973 .
- ^ а б в г Марданов, А.В.; Светличный В.А.; Белецкий, А.В. Прокофьева М.И.; Бонч-Осмоловская Е.А.; Равин, Н.В.; Скрябин, К.Г. (август 2010). «Последовательность генома кренархея Acidilobus saccharovorans поддерживает новый отряд, Acidilobales, и предполагает важную экологическую роль наземных кислых горячих источников» . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (16): 5652–7. DOI : 10,1128 / aem.00599-10 . PMC 2918975 . PMID 20581186 .
- ^ а б Бонч-Осмоловская, Елисавета (2012). «Метаболическое разнообразие термофильных прокариот - что нового». Экстремофилы: микробиология и биотехнология . Норфолк: Caister Academic Press . С. 109–31. ISBN 9781904455981.
- ^ Петижан, К; Deschamps, P; López-García, P; Морейра, Д; Брошье-Армане, К. (май 2015 г.). «Расширение законсервированного филогенетического ядра архей распутывает эволюцию третьей области жизни». Молекулярная биология и эволюция . 32 (5): 1242–54. DOI : 10.1093 / molbev / msv015 . PMID 25660375 .
Внешние ссылки
- Типовой штамм Acidilobus saccharovorans в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию