Таблицы кодонов ДНК и РНК

Три последовательных основания ДНК, называемые нуклеотидными триплетами или кодонами, транслируются в аминокислоты (GCA в аланин , AGA в аргинин , GAT в аспарагиновую кислоту , AAT в аспарагин и TGT в цистеин в этом примере).

Таблица кодона может быть использована для перевода генетического кода в последовательность аминокислот . ^[1]^[2] Стандартный генетический код традиционно представлен в виде РНК - кодонов таблицы, потому что , когда белки сделаны в клетке с помощью рибосом , это РНК , которая направляет биосинтез белка . ^[2]^[3] Последовательность мРНК определяется последовательностью геномной ДНК . ^[4] В таком контексте стандартный генетический код называется таблицей трансляции 1. ^[3]Он также может быть представлен в таблице кодонов ДНК. Кодоны ДНК в таких таблицах расположены на смысловой цепи ДНК и расположены в направлении 5'-к-3 ' . ^[5] Различные таблицы с альтернативными кодонами используются в зависимости от источника генетического кода, например из ядра клетки , митохондрии , пластиды или гидрогеносомы . ^[6]

В генетическом коде и в таблицах ниже 64 различных кодона; большинство указывают аминокислоту. ^[7] Три последовательность, УАГ, УГ и UAA, известная как стоп - кодоны , ^{[Примечание 1]} не кодирует аминокислоты , но вместо того, чтобы сигнализировать о выпуске зарождающегося полипептида из рибосомы. ^[8] В стандартном коде последовательность AUG, читаемая как метионин, может служить стартовым кодоном и вместе с последовательностями, такими как фактор инициации , инициировать трансляцию. ^[3]^[9]^[10] В редких случаях стартовые кодоны в стандартном коде могут также включать GUG или UUG; эти кодоны обычно представляют собой валини лейцин соответственно, но в качестве стартовых кодонов они переводятся как метионин или формилметионин . ^[3]^[10]

Первая таблица - стандартная таблица - может использоваться для перевода триплетов нуклеотидов в соответствующую аминокислоту или соответствующий сигнал, если это стартовый или стоп-кодон. Вторая таблица, уместно названная обратной, делает противоположное: ее можно использовать для вывода возможного триплетного кода, если аминокислота известна. Поскольку несколько кодонов могут кодировать одну и ту же аминокислоту, в некоторых случаях дается нотация нуклеиновых кислот Международного союза теоретической и прикладной химии (IUPAC) .

Таблица перевода 1 [ править ]

Таблица кодонов стандартной РНК [ править ]

Аминокислотные биохимические свойства

Неполярный

Полярный

Базовый

Кислый ↓

Прекращение: стоп-кодон *

Инициирование: возможный стартовый кодон

Стандартный генетический код ^[1]^[11]
1-я база	2-я база								3-я база
1-я база	U		C		А		грамм		3-я база
U	UUU	(Phe / F) фенилаланин	УКУ	(Ser / S) серин	UAU	(Tyr / Y) Тирозин	UGU	(Cys / C) Цистеин	U
	UUC	(Phe / F) фенилаланин	UCC		ОАК	(Tyr / Y) Тирозин	UGC	(Cys / C) Цистеин	C
	UUA	(Leu / L) лейцин	УЦА		UAA	Стоп ( Охра ) * ^{[примечание 2]}	UGA	Стоп ( Опал ) * ^{[примечание 2]}	А
	UUG		UCG		UAG	Стоп ( Янтарь ) * ^{[примечание 2]}	UGG	(Trp / W) Триптофан	грамм
C	CUU		CCU	(Pro / P) Пролин	CAU	(His / H) Гистидин	CGU	(Arg / R) Аргинин	U
	CUC		CCC		САС	(His / H) Гистидин	CGC		C
	CUA		CCA		CAA	(Gln / Q) Глютамин	CGA		А
	CUG		CCG		CAG	(Gln / Q) Глютамин	CGG		грамм
А	AUU	(Ile / I) Изолейцин	ACU	(Thr / T) Треонин	AAU	(Asn / N) аспарагин	AGU	(Ser / S) серин	U
	AUC		АКК		AAC	(Asn / N) аспарагин	AGC	(Ser / S) серин	C
	AUA		ACA		AAA	(Lys / K) Лизин	AGA	(Arg / R) Аргинин	А
	AUG	(Met / M) метионин	АЧГ		AAG	(Lys / K) Лизин	AGG	(Arg / R) Аргинин	грамм
грамм	ГУУ	(Val / V) Валин	GCU	(Ала / А) Аланин	ГАУ	(Asp / D) Аспарагиновая кислота ↓	ГГУ	(Gly / G) Глицин	U
	GUC		GCC		GAC	(Asp / D) Аспарагиновая кислота ↓	GGC		C
	GUA		GCA		GAA	(Glu / E) Глутаминовая кислота ↓	GGA		А
	GUG		GCG		GAG	(Glu / E) Глутаминовая кислота ↓	GGG		грамм

Таблица кодонов обратной РНК [ править ]

Обратная таблица для стандартного генетического кода (сжатая с использованием нотации IUPAC ) ^[14]
Аминокислота	Кодоны ДНК	Сжатый	Аминокислота	Кодоны ДНК	Сжатый
Ала, А	GCU, GCC, GCA, GCG	GCN	Иль, я	AUU, AUC, AUA	AUH
Арг, R	CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG	CGN, AGR; или CGY, MGR	Лей, L	CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG	CUN, UUR; или CUY, YUR
Асн, N	AAU, AAC	AAY	Лис, К	AAA, AAG	AAR
Асп, D	GAU, GAC	Гей	Met, M	AUG
Asn или Asp, B	AAU, AAC; GAU, GAC	РЭЙ	Phe, F	UUU, UUC	UUY
Cys, C	УГУ, УГК	UGY	Pro, P	CCU, CCC, CCA, CCG	CCN
Gln, Q	CAA, CAG	МАШИНА	Сер, С	УКУ, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC	UCN, AGY
Клей	GAA, GAG	GAR	Thr, T	ACU, ACC, ACA, ACG	ACN
Gln или Glu, Z	CAA, CAG; GAA, GAG	SAR	Трп, Вт	UGG
Gly, G	GGU, GGC, GGA, GGG	GGN	Тюр, Y	UAU, UAC	UAY
Его, H	CAU, CAC	CAY	Вал, В	ГУ, ГУК, ГУА, ГУГ	ПИСТОЛЕТ
НАЧНИТЕ	AUG		ОСТАНОВКА	UAA, UGA, UAG	УРА, УАР

Стандартная таблица кодонов ДНК [ править ]

Аминокислотные биохимические свойства

Неполярный

Полярный

Базовый

Кислый ↓

Прекращение: стоп-кодон *

Инициирование: возможный стартовый кодон

Стандартный генетический код ^[15]^{[примечание 3]}
1-я база	2-я база								3-я база
1-я база	Т		C		А		грамм		3-я база
Т	TTT	(Phe / F) фенилаланин	TCT	(Ser / S) серин	ТАТ	(Tyr / Y) Тирозин	TGT	(Cys / C) Цистеин	Т
	TTC	(Phe / F) фенилаланин	TCC		TAC	(Tyr / Y) Тирозин	ТГК	(Cys / C) Цистеин	C
	TTA	(Leu / L) лейцин	TCA		TAA	Стоп ( Охра ) * ^{[примечание 2]}	TGA	Стоп ( Опал ) * ^{[примечание 2]}	А
	ТТГ		TCG		ТЕГ	Стоп ( Янтарь ) * ^{[примечание 2]}	TGG	(Trp / W) Триптофан	грамм
C	CTT		CCT	(Pro / P) Пролин	КОТ	(His / H) Гистидин	CGT	(Arg / R) Аргинин	Т
	CTC		CCC		САС	(His / H) Гистидин	CGC		C
	CTA		CCA		CAA	(Gln / Q) Глютамин	CGA		А
	CTG		CCG		CAG	(Gln / Q) Глютамин	CGG		грамм
А	ATT	(Ile / I) Изолейцин	ДЕЙСТВОВАТЬ	(Thr / T) Треонин	AAT	(Asn / N) аспарагин	AGT	(Ser / S) серин	Т
	УВД		АКК		AAC	(Asn / N) аспарагин	AGC	(Ser / S) серин	C
	ATA		ACA		AAA	(Lys / K) Лизин	AGA	(Arg / R) Аргинин	А
	ПТГ	(Met / M) метионин	АЧГ		AAG	(Lys / K) Лизин	AGG	(Arg / R) Аргинин	грамм
грамм	GTT	(Val / V) Валин	GCT	(Ала / А) Аланин	GAT	(Asp / D) Аспарагиновая кислота ↓	GGT	(Gly / G) Глицин	Т
	GTC		GCC		GAC	(Asp / D) Аспарагиновая кислота ↓	GGC		C
	GTA		GCA		GAA	(Glu / E) Глутаминовая кислота ↓	GGA		А
	GTG		GCG		GAG	(Glu / E) Глутаминовая кислота ↓	GGG		грамм

Таблица обратных кодонов ДНК [ править ]

Обратная таблица для стандартного генетического кода (сжатая с использованием нотации IUPAC ) ^[14]
Аминокислота	Кодоны ДНК	Сжатый	Аминокислота	Кодоны ДНК	Сжатый
Ала, А	GCT, GCC, GCA, GCG	GCN	Иль, я	ATT, ATC, ATA	ATH
Арг, R	CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG	CGN, AGR; или CGY, MGR	Лей, L	CTT, CTC, CTA, CTG; ТТА, ТТГ	CTN, TTR; или CTY, YTR
Асн, N	AAT, AAC	AAY	Лис, К	AAA, AAG	AAR
Асп, D	GAT, GAC	Гей	Met, M	ПТГ
Asn или Asp, B	AAT, AAC; GAT, GAC	РЭЙ	Phe, F	TTT, TTC	Телетайп
Cys, C	ТГТ, ТГК	TGY	Pro, P	CCT, CCC, CCA, CCG	CCN
Gln, Q	CAA, CAG	МАШИНА	Сер, С	TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC	TCN, AGY
Клей	GAA, GAG	GAR	Thr, T	ACT, ACC, ACA, ACG	ACN
Gln или Glu, Z	CAA, CAG; GAA, GAG	SAR	Трп, Вт	TGG
Gly, G	GGT, GGC, GGA, GGG	GGN	Тюр, Y	ТАТ, ТАС	ВРЕМЯ
Его, H	CAT, CAC	CAY	Вал, В	GTT, GTC, GTA, GTG	GTN
НАЧНИТЕ	ПТГ		ОСТАНОВКА	TAA, TGA, TAG	TRA, TAR

Альтернативные кодоны в других таблицах перевода [ править ]

Когда-то считалось, что генетический код универсален: ^[17] кодон будет кодировать одну и ту же аминокислоту независимо от организма или источника. Однако сейчас все согласны с тем, что генетический код развивается, ^[18] приводя к расхождениям в том, как кодон транслируется в зависимости от генетического источника. ^[17]^[18] Например, в 1981 году было обнаружено, что использование кодонов AUA, UGA, AGA и AGG системой кодирования в митохондриях млекопитающих отличается от универсального кода. ^[17] Стоп-кодоны также могут быть затронуты: у реснитчатых простейших универсальные стоп-кодоны UAA и UAG кодируют глутамин. ^[18]^{[примечание 4]} В следующей таблице показаны эти альтернативные кодоны.

Аминокислотные биохимические свойства

Неполярный

Полярный

Базовый

Кислый ↓

Прекращение: стоп-кодон *

Сравнение трансляций кодонов с альтернативными и стандартными генетическими кодами ^[3]
Код	Таблица перевода	Кодон ДНК задействован	РНК-кодон вовлечен	Перевод с этим кодом			Стандартный перевод	Примечания
Стандарт	1							Включает таблицу перевода 8 ( хлоропласты растений ).
Митохондрии позвоночных	2	AGA	AGA	Стоп *			Арг (R)
		AGG	AGG	Стоп *			Арг (R)
		ATA	AUA	Встреча (M)			Иль (I)
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Митохондриальные дрожжи	3	ATA	AUA	Встреча (M)			Иль (I)
		CTT	CUU	Thr (T)			Лей (L)
		CTC	CUC	Thr (T)			Лей (L)
		CTA	CUA	Thr (T)			Лей (L)
		CTG	CUG	Thr (T)			Лей (L)
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
		CGA	CGA	отсутствующий			Арг (R)
		CGC	CGC	отсутствующий			Арг (R)
Плесень, простейшие и кишечнополостные митохондрии + микоплазма / спироплазма	4	TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *	Включает таблицу трансляции 7 ( кинетопласты ).
Митохондриальные беспозвоночные	5	AGA	AGA	Сер (S)			Арг (R)
		AGG	AGG	Сер (S)			Арг (R)
		ATA	AUA	Встреча (M)			Иль (I)
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Инфузорное, дазикладовое и гексамитовое ядерное	6	TAA	UAA	Gln (Q)			Стоп *
Инфузорное, дазикладовое и гексамитовое ядерное	6	ТЕГ	UAG	Gln (Q)			Стоп *
Митохондрии иглокожих и плоских червей	9	AAA	AAA	Asn (N)			Лис (К)
		AGA	AGA	Сер (S)			Арг (R)
		AGG	AGG	Сер (S)			Арг (R)
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Эуплотид ядерный	10	TGA	UGA	Цис (С)			Стоп *
Бактериальные, архейные и растительные пластиды	11							См. Таблицу перевода 1 .
Альтернативные дрожжевые ядерные	12	CTG	CUG	Сер (S)			Лей (L)
Асцидий митохондриальный	13	AGA	AGA	Гли (G)			Арг (R)
		AGG	AGG	Гли (G)			Арг (R)
		ATA	AUA	Встреча (M)			Иль (I)
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Альтернативный митохондриальный плоский червь	14	AAA	AAA	Asn (N)			Лис (К)
		AGA	AGA	Сер (S)			Арг (R)
		AGG	AGG	Сер (S)			Арг (R)
		TAA	UAA	Тюр (Y)			Стоп *
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Ядерная блефария	15	ТЕГ	UAG	Gln (Q)			Стоп *	По состоянию на 18 ноября 2016 г .: отсутствует в обновлении NCBI. Аналогично таблице перевода 6 .
Митохондрии Chlorophycean	16	ТЕГ	UAG	Лей (L)			Стоп *
Митохондриальные трематоды	21 год	TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
		ATA	AUA	Встреча (M)			Иль (I)
		AGA	AGA	Сер (S)			Арг (R)
		AGG	AGG	Сер (S)			Арг (R)
		AAA	AAA	Asn (N)			Лис (К)
Scenedesmus obliquus митохондриальный	22	TCA	УЦА	Стоп *			Сер (S)
Scenedesmus obliquus митохондриальный	22	ТЕГ	UAG	Лей (L)			Стоп *
Митохондриальный Thraustochytrium	23	TTA	UUA	Стоп *			Лей (L)	Аналогично таблице перевода 11 .
Птеробранхии митохондриальные	24	AGA	AGA	Сер (S)			Арг (R)
		AGG	AGG	Лис (К)			Арг (R)
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Кандидат в разделение SR1 и Gracilibacteria	25	TGA	UGA	Гли (G)			Стоп *
Пахисолен tannophilus ядерный	26 год	CTG	CUG	Ала (А)			Лей (L)
Кариореликт ядерный	27	TAA	UAA	Gln (Q)			Стоп *
		ТЕГ	UAG	Gln (Q)			Стоп *
		TG	UGA	Стоп *	или же	Trp (Вт)	Стоп *
Кондилостома ядерная	28 год	TAA	UAA	Стоп *	или же	Gln (Q)	Стоп *
		ТЕГ	UAG	Стоп *	или же	Gln (Q)	Стоп *
		TGA	UGA	Стоп *	или же	Trp (Вт)	Стоп *
Мезодиниум ядерный	29	TAA	UAA	Тюр (Y)			Стоп *
Мезодиниум ядерный	29	ТЕГ	UAG	Тюр (Y)			Стоп *
Перитрих ядерный	30	TA	UAA	Glu (E) ↓			Стоп *
Перитрих ядерный	30	ТЕГ	UAG	Glu (E) ↓			Стоп *
Бластокритидия ядерная	31 год	TAA	UAA	Стоп *	или же	Glu (E) ↓	Стоп *
		ТЕГ	UAG	Стоп *	или же	Glu (E) ↓	Стоп *
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *
Митохондриальный код Cephalodiscidae	33	AGA	AGA	Сер (S)			Арг (R)	Аналогично таблице перевода 24 .
		AGG	AGG	Лис (К)			Арг (R)
		TAA	UAA	Тюр (Y)			Стоп *
		TGA	UGA	Trp (Вт)			Стоп *

См. Также [ править ]

Биоинформатика
Список генетических кодов

Заметки [ править ]

^ Каждый стоп-кодон имеет определенное имя: UAG - янтарный , UGA - опаловый или умбровый , а UAA - охра . ^[8] В ДНК этими стоп-кодонами являются TAG, TGA и TAA соответственно.
^ a b c d e f Историческая основа для обозначения стоп-кодонов как янтарь, охра и опал описана в автобиографии Сиднея Бреннера ^[12] и в исторической статье Боба Эдгара. ^[13]
^ Основное различие между ДНК и РНК заключается в том, что тимин (T) встречается только в первом. В РНК он заменен урацилом (U). ^[16] Это единственное различие между стандартной таблицей кодонов РНК и стандартной таблицей кодонов ДНК.
^ Euplotes octacarinatus является исключением. ^[18]

Ссылки [ править ]

^ a b «Таблица перевода аминокислот» . Государственный университет Орегона. Архивировано 29 мая 2020 года . Дата обращения 2 декабря 2020 .
^ a b Барти, Лиза; Брук, Джек. MHCC Biology 112: Биология для медицинских работников . Откройте Орегон. п. 42. Архивировано 6 декабря 2020 года . Дата обращения 6 декабря 2020 .
^ a b c d e Elzanowski A, Ostell J (7 января 2019 г.). «Генетические коды» . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 9 октября 2020 года . Проверено 21 февраля 2019 .
^ «Функции РНК» . Scitable . Природное образование. Архивировано 18 октября 2008 года . Проверено 5 января 2021 года .
^ Шу JJ (2017). «Новая интегрированная симметричная таблица генетических кодов». Биосистемы . 151 : 21–26. arXiv : 1703.03787 . DOI : 10.1016 / j.biosystems.2016.11.004 . PMID 27887904 . S2CID 1121152 .
^ "Генетические коды" . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано 13 мая 2011 года . Дата обращения 2 декабря 2020 .
^ "Кодон" . Национальный институт исследования генома человека . Архивировано 22 октября 2020 года . Проверено 10 октября 2020 .
↑ a b Малой С. (29 ноября 2003 г.). «Как бессмысленные мутации получили свои названия» . Курс микробной генетики . Государственный университет Сан-Диего. Архивировано из оригинального 23 сентября 2020 года . Проверено 10 октября 2020 .
^ Хиннебуш AG (2011). «Молекулярный механизм сканирования и отбора стартовых кодонов у эукариот» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . Американское общество микробиологии. 75 (3): 434–467. DOI : 10.1128 / MMBR.00008-11 . PMC 3165540 . PMID 21885680 .
^ a b Touriol C, Bornes S, Bonnal S, Audigier S, Prats H, Prats AC, Vagner S (2003). «Создание разнообразия изоформ белка путем альтернативной инициации трансляции в кодонах, отличных от AUG» . Биология клетки . 95 (3–4): 169–78. DOI : 10.1016 / S0248-4900 (03) 00033-9 . PMID 12867081 .
^ «Информация в ДНК определяет клеточную функцию через перевод» . Scitable . Природное образование. Архивировано 23 сентября 2017 года . Дата обращения 5 декабря 2020 .
^ Бреннер, Сидней; Вольперт, Льюис (2001). Жизнь в науке . Биомед Централ Лимитед. п. 101–104. ISBN 9780954027803.
↑ Эдгар Б (2004). «Геном бактериофага Т4: археологические раскопки» . Генетика . 168 (2): 575–82. PMC 1448817 . PMID 15514035 . см. страницы 580–581
^ a b IUPAC - Комиссия IUB по биохимической номенклатуре. «Аббревиатуры и символы нуклеиновых кислот, полинуклеотидов и их составляющих» (PDF) . Международный союз теоретической и прикладной химии . Дата обращения 5 декабря 2020 .
^ "Что делает ДНК?" . Ваш геном . Добро пожаловать в Genome Campus. Архивировано 29 ноября 2020 года . Проверено 12 января 2021 года .
^ "Гены" . ДНК, генетика и эволюция . Бостонский университет. Архивировано 28 апреля 2020 года . Проверено 10 декабря 2020 .
^ a b c Осава, A (ноябрь 1993 г.). «Эволюционные изменения генетического кода» . Сравнительная биохимия и физиология . 106 (2): 489–94. DOI : 10.1016 / 0305-0491 (93) 90122-л . PMID 8281749 .
^ a b c d Osawa S, Jukes TH, Watanabe K, Muto A (март 1992 г.). «Последние свидетельства эволюции генетического кода» . Обзор микробиологии . 56 (1): 229–64. DOI : 10.1128 / MR.56.1.229-264.1992 . PMC 372862 . PMID 1579111 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Chevance FV, Hughes KT (2 мая 2017 г.). «Дело о генетическом коде как о тройке троек» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (18): 4745–4750. DOI : 10.1073 / pnas.1614896114 . JSTOR 26481868 . PMC 5422812 . PMID 28416671 . Проверено 17 октября 2020 года .
Девер Т.Е. (29 июня 2012 г.). «Новый старт для синтеза белка» . Наука . Американская ассоциация развития науки. 336 (6089): 1645–1646. Bibcode : 2012Sci ... 336.1645D . DOI : 10.1126 / science.1224439 . JSTOR 41585146 . PMID 22745408 . S2CID 44326947 . Проверено 17 октября 2020 года .
Гарднер Р.С., Вахба А.Дж., Базилио С., Миллер Р.С., Лендьель П., Шпейер Дж.Ф. (декабрь 1962 г.). «Синтетические полинуклеотиды и код аминокислот. VII» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 48 (12): 2087–2094. Bibcode : 1962PNAS ... 48.2087G . DOI : 10.1073 / pnas.48.12.2087 . PMC 221128 . PMID 13946552 .
Накамото Т. (март 2009 г.). «Эволюция и универсальность механизма инициирования синтеза белка». Джин . 432 (1–2): 1–6. DOI : 10.1016 / j.gene.2008.11.001 . PMID 19056476 .
Вахба А.Дж., Гарднер Р.С., Базилио С., Миллер Р.С., Шпейер Дж. Ф., Лендьель П. (январь 1963 г.). «Синтетические полинуклеотиды и код аминокислот. VIII» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 49 (1): 116–122. Bibcode : 1963PNAS ... 49..116W . DOI : 10.1073 / pnas.49.1.116 . PMC 300638 . PMID 13998282 .
Яновский Ц. (9 марта 2007 г.). «Установление триплетной природы генетического кода» . Cell . 128 (5): 815–818. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.02.029 . PMID 17350564 . S2CID 14249277 . Дата обращения 9 октября 2020 .
Заневельд Дж., Хамади М., Суока Н., Рыцарь Р. (28 февраля 2009 г.). «CodonExplorer: интерактивная онлайн-база данных для анализа использования кодонов и состава последовательностей». Биоинформатика для анализа последовательностей ДНК . Методы молекулярной биологии. 537 . С. 207–232. DOI : 10.1007 / 978-1-59745-251-9_10 . ISBN 978-1-58829-910-9. PMC 2953947 . PMID 19378146 .

Внешние ссылки [ править ]

Таблица кодонов ДНК, организованная в виде колеса

[9] Каждый стоп-кодон имеет определенное имя: UAG - янтарный , UGA - опаловый или умбровый , а UAA - охра . ^[8] В ДНК этими стоп-кодонами являются TAG, TGA и TAA соответственно.

[historical-15] Историческая основа для обозначения стоп-кодонов как янтарь, охра и опал описана в автобиографии Сиднея Бреннера ^[12] и в исторической статье Боба Эдгара. ^[13]

[19] Основное различие между ДНК и РНК заключается в том, что тимин (T) встречается только в первом. В РНК он заменен урацилом (U). ^[16] Это единственное различие между стандартной таблицей кодонов РНК и стандартной таблицей кодонов ДНК.

[22] Euplotes octacarinatus является исключением. ^[18]

[RNA_codon_table-1] «Таблица перевода аминокислот» . Государственный университет Орегона. Архивировано 29 мая 2020 года . Дата обращения 2 декабря 2020 .

[oregon-2] Барти, Лиза; Брук, Джек. MHCC Biology 112: Биология для медицинских работников . Откройте Орегон. п. 42. Архивировано 6 декабря 2020 года . Дата обращения 6 декабря 2020 .

[geneticcodes-3] Elzanowski A, Ostell J (7 января 2019 г.). «Генетические коды» . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 9 октября 2020 года . Проверено 21 февраля 2019 .

[4] «Функции РНК» . Scitable . Природное образование. Архивировано 18 октября 2008 года . Проверено 5 января 2021 года .

[table-5] Шу JJ (2017). «Новая интегрированная симметричная таблица генетических кодов». Биосистемы . 151 : 21–26. arXiv : 1703.03787 . DOI : 10.1016 / j.biosystems.2016.11.004 . PMID 27887904 . S2CID 1121152 .

[6] "Генетические коды" . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано 13 мая 2011 года . Дата обращения 2 декабря 2020 .

[7] "Кодон" . Национальный институт исследования генома человека . Архивировано 22 октября 2020 года . Проверено 10 октября 2020 .

[stop-8] Малой С. (29 ноября 2003 г.). «Как бессмысленные мутации получили свои названия» . Курс микробной генетики . Государственный университет Сан-Диего. Архивировано из оригинального 23 сентября 2020 года . Проверено 10 октября 2020 .

[10] Хиннебуш AG (2011). «Молекулярный механизм сканирования и отбора стартовых кодонов у эукариот» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . Американское общество микробиологии. 75 (3): 434–467. DOI : 10.1128 / MMBR.00008-11 . PMC 3165540 . PMID 21885680 .

[pmid12867081-11] Touriol C, Bornes S, Bonnal S, Audigier S, Prats H, Prats AC, Vagner S (2003). «Создание разнообразия изоформ белка путем альтернативной инициации трансляции в кодонах, отличных от AUG» . Биология клетки . 95 (3–4): 169–78. DOI : 10.1016 / S0248-4900 (03) 00033-9 . PMID 12867081 .

[12] «Информация в ДНК определяет клеточную функцию через перевод» . Scitable . Природное образование. Архивировано 23 сентября 2017 года . Дата обращения 5 декабря 2020 .

[13] Бреннер, Сидней; Вольперт, Льюис (2001). Жизнь в науке . Биомед Централ Лимитед. п. 101–104. ISBN 9780954027803.

[pmid15514035-14] Эдгар Б (2004). «Геном бактериофага Т4: археологические раскопки» . Генетика . 168 (2): 575–82. PMC 1448817 . PMID 15514035 . см. страницы 580–581

[iupac-16] IUPAC - Комиссия IUB по биохимической номенклатуре. «Аббревиатуры и символы нуклеиновых кислот, полинуклеотидов и их составляющих» (PDF) . Международный союз теоретической и прикладной химии . Дата обращения 5 декабря 2020 .

[17] "Что делает ДНК?" . Ваш геном . Добро пожаловать в Genome Campus. Архивировано 29 ноября 2020 года . Проверено 12 января 2021 года .

[18] "Гены" . ДНК, генетика и эволюция . Бостонский университет. Архивировано 28 апреля 2020 года . Проверено 10 декабря 2020 .

[evolve1-20] Осава, A (ноябрь 1993 г.). «Эволюционные изменения генетического кода» . Сравнительная биохимия и физиология . 106 (2): 489–94. DOI : 10.1016 / 0305-0491 (93) 90122-л . PMID 8281749 .

[evolve2-21] Osawa S, Jukes TH, Watanabe K, Muto A (март 1992 г.). «Последние свидетельства эволюции генетического кода» . Обзор микробиологии . 56 (1): 229–64. DOI : 10.1128 / MR.56.1.229-264.1992 . PMC 372862 . PMID 1579111 .

[1]