Базы данных Транспортера классификации (или TCDB ) является Международным союзом биохимии и молекулярная биология (МСБХМБЫ) системы классификации обсуждения и для мембранных транспортных белков , в том числе ионных каналов . [1] [2] [3]
Классификация
Верхний уровень классификации и несколько примеров белков с известной трехмерной структурой:
1. Каналы и поры
1. каналы α-типа
- 1.A.1 Суперсемейство управляемых напряжением ионных каналов
- 1.A.2 Семейство каналов K + внутреннего выпрямителя
- 1.A.3 Семейство Са 2+ каналов рианодин-инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора
- 1.A.4 Переходный рецепторный потенциал Семейство каналов Ca 2+
- 1.A.5 Семейство катионных каналов полицистина
- 1.A.6 Семейство эпителиальных Na + каналов
- 1.A.7 Семейство катионных каналов рецептора АТФ P2X
- 1.A.8 Основное суперсемейство внутренних белков
- 1.A.9 Нейротрансмиттерный рецептор, петля Cys, семейство лиганд-зависимых ионных каналов
- 1.A.10 Глутамат-закрытый тип семья ионного канала из рецепторов нейромедиаторов
- 1.A.11 Семейство канальных транспортеров аммония
- 1.A.12 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
- 1.A.13 Семейство эпителиальных хлоридных каналов
- 1.A.14 Семейство переноса генов, усиленных семенниками
- 1.A.15 Неселективное семейство катионов канала-2
- 1.A.16 Семейство формиат -нитритных переносчиков
- 1.A.17 Семейство кальцийзависимых хлоридных каналов
- 1.A.18 Семейство Tic110, формирующее анион-канал хлоропластной оболочки
- 1.A.19 Семейство каналов матрикс-2 вируса гриппа типа А
- 1.A.20 BCL2 / семейство белков 3, взаимодействующих с аденовирусом E1B
- 1.A.21 Семейство Bcl-2
- 1.A.22 Механочувствительный ионный канал с большой проводимостью
- 1.A.23 Механочувствительный ионный канал с малой проводимостью
- 1.A.24 Семейство коннексинов, образующих щелевые соединения
- 1.A.25 Семейство иннексинов, образующих щелевые соединения
- 1.A.26 Семейство транспортеров Mg 2+ -E
- 1.A.27 Семья Фосфолеммана
- 1.A.28 Семейство транспортеров мочевины
- 1.A.29 Семейство мочевинных / амидных каналов
- 1.A.30 H + - или Na + -транслоцирующий бактериальный жгутиковый мотор MotAB / суперсемейство ExbBD-транспортера через внешнюю мембрану
- 1.A.31 Семейство аннексинов
- 1.A.32 Семейство каналов NB вируса гриппа типа B
- 1.A.33 Семейство белков теплового шока 70, образующих катион-канал
- 1.A.34 Семейство каналообразующих комплексов Bacillus, подобных щелевому соединению
- 1.A.35 Семейство переносчиков ионов металлов CorA
- 1.A.36 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
- 1.A.37 CD20 Ca 2+ семьи канала
- 1.A.38 Семейство регуляторов pH Гольджи
- 1.A.39 Семейство каналов CM2 вируса гриппа типа C
- 1.A.40 Семейство Vpu-каналов вируса иммунодефицита человека типа I
- 1.A.41 Птичий реовирус p10 Семейство вропоринов
- 1.A.42 Семейство вирусных белков R ВИЧ
- 1.A.43 Устойчивость к камфоре или семейство экспортеров фторида
- 1.A.44 Порообразующий белок кончика хвоста pb2 семейства фага Т5
- 1.A.45 Семейство инъекционных фагов P22
- 1.A.46 Семейство бестрофинов, формирующих анионные каналы
- 1.A.47 Нуклеотид-чувствительный анион-селективный канал, семейство ICln
- 1.A.48 Анионный канал Семья Твити
- 1.A.49 Коронавирус человека ns12.9 Семейство виропоринов
- 1.A.50 Семейство фосфоламбанов (Ca 2+ -канал и регулятор Ca 2+ -АТФазы)
- 1.A.51 Семейство потенциалзависимых протонных каналов (VPC)
- 1.A.52 Са 2+ Выпуск активированного Са 2+ (КРАУМ) канал (КРАУМ-С) Семейным
- 1.A.53 Семейство катион-селективных каналов виропорина P7 вируса гепатита C (HCV-P7)
- 1.A.54 Семейство пресенилинов ER Ca 2+ Leak Channel (пресенилин)
- 1.A.55 Са 2+ канал, связанный с синаптическими пузырьками, семейство цветов (Flower)
- 1.A.56 Семейство медных транспортеров (Ctr)
- 1.A.57 Коронавирус SARS Виропорин (SARS-VP)
- 1.A.58 Семейство матричных белков 2 вируса гриппа типа B (BM2-C)
- 1.A.59 Порообразующий пептид вируса болезни бурсальной полости, семейство Pep46 (Pep46)
- 1.A.60 Пептид, преобразующий реовирус млекопитающих, семейство Mu-1 (Mu-1)
- 1.A.61 Семейство цепи F (гамма-пептид), образующей канал Nodavirus насекомых
- 1.A.62 Семейство гомотримерных катионных каналов (TRIC)
- 1.A.63 α-спиральный порин внешней мембраны Ignicoccus (семейство I-OMP
- 1.A.64 Семейство плазмолипинов (плазмолипинов)
- 1.A.65 Семейство белков коронавируса виропорин E (виропорин E)
- 1.A.66 Семейство пардаксин (пардаксин)
- 1.A.67 Семейство мембранных транспортеров Mg 2+ (MMgT)
- 1.A.68 Семейство малых гидрофобных вирусов виропоринов (V-SH)
- 1.A.69 Семейство каналов рецепторов гетеромерного одоранта (HORC)
- 1.A.70 Молекула против микробов семейства A (MamA)
- 1.A.71 Семейство кислотно-растворимых белков мозга (канал BASP1)
- 1.A.72 Надсемейство Мер
- 1.A.73 Семейство белков лизиса колицина (CLP)
- 1.A.74 Семейство Mitsugumin 23 (MG23)
- 1.A.75 Механический ноцицептор, семейство пьезо (пьезо)
- 1.A.76 Семейство транспортеров магния1 (MagT1)
- 1.A.77 Семейство Mg 2+ / Ca 2+ Uniporter (MCU)
- 1.A.78 K + -селективный канал в семействе эндосом и лизосом (KEL)
- 1.A.79 Белок захвата холестерина (ChUP) или семейство двухцепочечных РНК
- 1.A.80 Семейство виропоринов NS4a (NS4a)
- 1.A.81 Семейство низкоаффинных каналов Ca 2+ (LACC)
- 1.A.82 Семейство каналов механотрансдукции волосковых клеток (HCMC)
- 1.A.83 Семейство вирусов SV40 Viroporin VP2 (SV40 VP2)
- 1.A.84 Семейство Ca 2+ -каналов модулятора гомеостаза кальция (CALHM-C)
- 1.A.85 Семейство полиовирусов 2B виропоринов (2B виропоринов)
- 1.A.86 Семейство вируса папилломы человека типа 16 (HPV16) L2 виропорин (L2 виропорин)
- 1.A.87 Семейство механочувствительных кальциевых каналов (MCA)
- 1.A.88 Семейство грибковых калиевых каналов (F-Kch)
- 1.A.89 Семейство человеческого коронавируса 229E виропорин (229E виропорин)
- 1.A.90 Семейство виропоринов метапневмовируса человека (HMPV) (HMPV-виропорин)
- 1.A.91 Асексуальный белок 3.2, связанный с цитоадгезией, семейства Plasmodium falciparum (Clag3)
- 1.A.92 Семейство реовирусов Viroporin VP10 (RVP10)
- 1.A.93 Семейство неструктурного белка 3 вируса синего языка виропоринов (NS3)
- 1.A.94 Семейство ротавирусных неструктурных гликопротеинов 4 виропоринов (NSP4)
- 1.A.95 Семейство эфемеровирусов виропоринов (EVVP)
- 1.A.96 Семейство виропоринов вируса полиомы человека (PVVP)
- 1.A.97 Семейство виропоринов E5 вируса папилломы человека 16 типа (HPV-E5)
- 1.A.98 Семейство белков P13 Т-лимфотропного вируса 1 человека (HTLV1-P13)
- 1.A.99 Семейство малых мембранных белков E оболочки вируса инфекционного бронхита (IBV-E)
- 1.A.100 Предполагаемый виропорин Rhabdoviridae, семейство U5 (RV-U5)
- 1.A.101 Семейство пероксисомальных порообразующих Pex11 (Pex11)
- 1.A.102 Семейство виропоринов PB1-F2 (PB1-F2) вируса гриппа A
- 1.A.103 Семейство обезьяньих вирусов 5 (вирус парагриппа 5) SH (SV5-SH)
- 1.A.104 Предполагаемый Na + канал биосинтеза жгутиков, семейство FlaH (FlaH)
- 1.A.105 Семейство киназных доменов смешанного происхождения (MLKL)
- 1.A.106 Семейство кальциевых каналов, активируемых нагрузкой кальцием (CLAC)
- 1.A.107 Семейство порообразующих глобинов (глобинов)
1.B. β-бочкообразные порины и другие белки внешней мембраны
- 1.B.1 Общее бактериальное семейство поринов
- 1.B.2 Семейство хламидийных поринов (ХП)
- 1.B.3 Семейство сахарных поринов (SP)
- 1.B.4 Семейство Brucella-Rhizobium porin (BRP)
- 1.B.5 Семейство Pseudomonas OprP porin (POP)
- 1.B.6 Семейство поринов OmpA-OmpF (OOP)
- 1.B.7 Семейство Rhodobacter PorCa porin (RPP)
- 1.B.8 Семейство митохондриальных и пластидных поринов (MPP)
- 1.B.9 Семейство белков внешней мембраны FadL (FadL)
- 1.B.10 Нуклеозид-специфичные каналообразующие семейства поринов внешней мембраны (Tsx)
- 1.B.11 Семейство фимбриальных поринов с внешней мембраной (FUP)
- 1.B.12 Семейство Автотранспортер-1 (АТ-1)
- 1.B.13 Семейство экспортных альгинатных поринов (AEP)
- 1.B.14 Семейство рецепторов наружной мембраны (OMR)
- 1.B.15 Семейство рафинозных поринов (RafY)
- 1.B.16 Семейство короткоцепочечных амидов и мочевины поринов (SAP)
- 1.B.17 Семейство фактора внешней мембраны (OMF)
- 1.B.18 Семейство вспомогательных белков внешней мембраны (OMA)
- 1.B.19 Семейство глюкозоселективных поринов OprB (OprB)
- 1.B.20 Семейство секреции с двумя партнерами (TPS)
- 1.B.21 Семейство поринов OmpG (OmpG)
- 1.B.22 Семейство секретинов (секретинов) внешней бактериальной мембраны
- 1.B.23 Семейство цианобактериальных поринов (CBP)
- 1.B.24 Микобактериальный порин
- 1.B.25 Семейство поринов внешней мембраны (Opr)
- 1.B.26 Семейство циклодекстринпоринов (CDP)
- 1.B.31 Семейство основных наружных мембран Campylobacter jejuni (MomP)
- 1.B.32 Семейство поринов внешней мембраны фузобактерий (FomP)
- 1.B.33 Семейство поринов, вставленных во внешнюю мембрану (комплекс Bam) (OmpIP)
- 1.B.34 Коринебактериальные порины
- 1.B.35 Семейство олигогалактуронат-специфичных поринов (KdgM)
- 1.B.39 Бактериальный порин, семейство OmpW (OmpW)
- 1.B.42 Семейство экспортных поринов липополисахаридов внешней мембраны (LPS-EP)
- 1.B.43 Семейство Coxiella porin P1 (CPP1)
- 1.B.44 Вероятный белок семейства porphyromonas gingivalis porin (PorT), перемещающий белок
- 1.B.49 Семейство поринов Anaplasma P44 (A-P44)
- 1.B.48 Транспортеры типа Curli
- 1.B.54 Intimin / Invasin (Int / Inv) или Автовоз-3 семьи
- 1.B.55 Семейство поли-ацетил-D-глюкозаминпоринов (PgaA)
- 1.B.57 Семейство белков большой наружной мембраны Legionella (LM-OMP)
- 1. Семейство поринов B.60 Omp50 (Omp50 Porin)
- 1.B.61 Семейство дельта-протеобактериальных поринов (Delta-porin)
- 1.B.62 Предполагаемое семейство бактериальных поринов (PBP)
- 1.B.66 Предполагаемое семейство бета-ствольных поринов-2 (BBP2)
- 1.B.67 Предполагаемое семейство бета-баррелей поринов-4 (BBP4)
- 1.B.68 Предполагаемое суперсемейство бета-баррелей поринов-5 (BBP5)
- 1.B.70 Семейство наружных мембранных каналов (OMC)
- 1.B.71 Семейство протеобактериальных / веррукомикробных поринов (ПВП)
- 1.B.72 Семейство поринов внешней мембраны протохламидий (PomS / T)
- 1.B.73 Семейство биогенеза / сборки капсул (CBA)
- 1.B.78 DUF3374 семейство связанных с транспортом электронов поринов (ETPorin)
1.C Порообразующие токсины (белки и пептиды)
- 1.C.3 Семейство α- гемолизина (αHL)
- 1.C.4 Aerolysin семьи
- 1.C.5 ε-токсин семьи
- 1.C.11 Суперсемейство RTX-токсинов
- 1.C.12 Комплекс мембранной атаки / надсемейство перфоринов
- 1.C.13 лейкоцидин семьи
- 1.C.14 Семейство цитогемолизинов (CHL)
- 1.C.39 Семейство тиол -активированных холестерин-зависимых цитолизинов
- 1.C.43 Lysenin семьи
- 1.C.56 Семейство катионных каналов HrpZ Pseudomonas syringae
- 1.C.57 Семейство клостридиальных цитотоксинов
- 1.C.58 Семейство Microcin E492 / C24 (Microcin E492)
- 1.C.74 Семейство змеиных цитотоксинов (SCT)
- 1.C.97 Семейство порообразующих плевротолизинов
1.D Каналы, не синтезированные рибосомами
- 1.D.1 грамицидина А канал семьи
- 1.D.2 Канала для формирования Syringomycin Семьи
- 1.D.3 Семейство каналообразующих сирингопептинов
- 1.D.4 Семья, образующая канал Толаасин
- 1.D.5 Семейство каналообразующих антибиотиков аламетицин или пептаибол
- 1.D.6 Семейство комплексных поли 3-гидроксибутиратных каналов Ca 2+ (cPHB-CC)
- 1.D.7 Семья Бетиколина
- 1.D.8 сапонины семьи
- 1.D.9 Семейство полиглутаминовых ионных каналов (PG-IC)
- 1.D.10 Семейство каналов, образующих церамид
- 1.D.11 сурфактин семьи
- 1.D.12 Семья Боверицинов (Beauvericin)
- 1.D.13 Амфипатические пептидные антибиотики с доставкой ДНК (DAPA)
- 1.D.14 Семейство синтетических Leu / Ser амфипатических каналообразующих пептидов (l / S-SCP)
- 1.D.15 Семейство даптомицина (даптомицина)
- 1.D.16 Семейство синтетических амфипатических порообразующих гептапептидов (SAPH)
- 1.D.17 Комбинаторно-разработанное семейство порообразующих β-листовых пептидов
- 1.D.18 Семейство порообразующих конъюгатов гуанозин-желчная кислота
- 1.D.19 Лекарство, образующее канал Ca 2+ , семейство дигитоксинов
- 1.D.20 Семейство порообразующих полиеновых макролидных антибиотиков / грибковых агентов (PMAA)
- 1.D.21 Семейство липидных нанопор (LipNP)
- 1.D.22 Протон-транслокации каротиноидов пигмент, зеаксантин Семейный
- 1.D.23 Семейство порообразующих фениленэтиниленовых противомикробных средств (PEPA)
- 1.D.24 Семейство морских губок из политеонамида B (pTB)
- 1.D.25 Семейство ариламиновых фолдамеров (AAF)
- 1.D.26 Семейство 9'-O-β-D-глюкозидов дигидродегидродикониферилового спирта (DDDC9G)
- 1.D.27 Семейство Thiourea isosteres
- 1.D.28 Семейство липопептаиболов
- 1.D.29 Семейство макроциклических олигохолатов
- 1.D.30 Семейство искусственных гидразид-связанных столбов [5] ареновых каналов (HAPA-C)
- 1.D.31 амфотерицин Семейный
- 1.D.32 порообразующий Novicidin Family
- 1.D.33 Канал для формирования Polytheonamide B Family
- 1.D.34 Каналообразующие олигоэфирные болаамфифилы
- 1.D.35 порообразующие циклический Lipodepsipeptide Family
- 1.D.36 Семейство ионных каналов олигоборненов
- 1.D.37 Hibicuslide C Семейный
- 1.D.38 Семейство циклических пептидных нанотрубок (cPepNT)
- 1.D.39 Семейство контролируемых светом амфифильных молекулярных ионных каналов на основе азобензола (AAM-IC)
- 1.D.40 Семейство липидных тороидальных пор, индуцированных белком
- 1.D.41 Семейство ионофоров спротетонатного типа (спирогексанолид)
- 1.D.42 Семейство трипептидов Phe-Arg-столба [5] ареновых каналов (TPPA-C)
- 1.D.43 Семейство гуанозиндинуклеозидных каналов (TT-GDN-C), адаптированных к триазолам
- 1.D.44 Синтетический ионный канал с редокс-активным семейством ферроцена (ICRF)
- 1.D.45 Семейство мембранных пор сонопорации и электропорации (SEMP)
- 1.D.46 Семейство ДНК-нанопор (DnaNP)
- 1.D.47 Семейство порообразующих синтетических циклических пептидов (PSCP)
- 1.D.48 порообразующего Syringomycin E Family
- 1.D.49 Семейство трансмембранных каротиноидных радикальных каналов (CRC)
- 1.D.50 Семейство переносчиков амфифильных бис-катехол-анионов (AC-AT)
- 1.D.51 Семейство белковых нанопор (ProNP)
- 1.D.52 Семейство нанопор макроцикла ароматического олигоамида (OmnNP)
- 1.D.53 Семейство альфа, гамма-пептидных нанотрубок (a, gPepNT)
- 1.D.54 Семейство калий-селективных гексил-бензоуреидо-15-краун-5-эфирных ионных каналов (HBEC)
- 1.D.55 Семейство нанопор на основе порфирина (PorNP)
- 1.D.56 Семейство олигомерных нанопор (AibNP) альфа-аминоизобутирата (Aib)
- 1.D.57 Семейство липидных электропор (LEP)
- 1.D.58 Семейство продигиозена (продигиозена), переносящего анион
- 1.D.59 Семейство переносчиков анионов перенозина (Perenosin)
- 1.D.60 Семейство альфа, гамма-циклических пептидов (AGCP)
- 1.D.61 Семейство анионофорных 2,6-бис (бензимидазол-2-ил) пиридинов (ABBP)
- 1.D.62 Семейство каналообразующих производных бис-триазолилдигуанозина (TDG)
- 1.D.63 Семейство нанопор на основе пептидов (PepNP)
- 1.D.64 Семейство углеродных нанотрубок (CarNT)
- 1.D.65 Семейство порообразующих амфидинолов (амфидинолов)
- 1.D.66 Семейство спиральных макромолекул и нанопор (HmmNP)
- 1.D.67 Семейство спиральных пептидных ионных каналов (CEHP), модифицированных коронным эфиром
- 1.D.68 Семейство порообразующих плейроновых блочных полимеров (PPBP)
- 1.D.69 Семейство конических нанопор (ConNP)
- 1.D.70 Семейство металлических (Au / Ag / Pt / графен) нанопор (MetNP)
- 1.D.71 Семейство синтетических пептидов TP359 (TP359)
- 1.D.72 Семейство триазиновых рецепторов на основе хлорид-носителя (CCTTR)
- 1.D.73 Семейство мезопористых нанопор кремнезема (SilNP)
- 1.D.74 Семейство синтетических жестких п-октифенилстейв-пор (SSROP), чувствительных к стимулам
1.Э Холинс
1.F Поры слияния пузырьков
- 1.F.1 Семейство пор слияния синаптосомных пузырьков (SVF-Pore)
- 1.F.2 Семейство октамерных экзоцист (экзоцист)
1.G Поры слияния вирусов
- 1.G.1 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-1 (VMFP1)
- 1.G.2 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-2 (VMFP2)
- 1.G.3 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-3 (VMFP3)
- 1.G.4 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-4 (VMFP4)
- 1.G.5 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-5 (VMFP5)
- 1.G.6 Семейство слитых белков гепаднавируса S (белок HBV-S)
- 1.G.7 Семейство FAST Fusion Protein (R-FAST) реовируса
- 1.G.8 Семейство слитых белков аренавируса (AV-FP)
- 1.G.9 Семейство синцитина (синцитина)
- 1.G.10 Семейство комплексов слияния мембран вируса простого герпеса (HSV-MFC)
- 1.G.11 Семейство белковых комплексов входа в клетки поксвируса (PEP-C)
- 1.G.12 Семейство слитых белков вируса лейкоза птиц gp95 (ALV-gp95)
- 1.G.13 Семейство малых трансмембран, связанных с слиянием ортореовирусов (FAST)
- 1.G.14 Семейство гемагглютининов и слитых порообразующих белков вируса гриппа (Influenza-H / FPP)
- 1.G.15 Семейство гликопротеинов основной оболочки вируса ядерного полиэдроза Autographa californica GP64 (GP64)
- 1.G.16 Семейство гибридных пептидов вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) (ВИЧ-FP)
- 1.G.17 Семейство гликопротеинов оболочки вируса лейкемии крупного рогатого скота (BLV-Env)
- 1.G.18 Пептид слияния SARS-CoV в семействе предшественников гликопротеинов Spike (SARS-FP)
- 1.G.19 Семейство ротавирусных комплексов слияния порообразующих мембран (Rotavirus MFC)
- 1.G.20 Семейство гликопротеинов слияния с оболочкой Gc-конверта хантавируса (Gc-EFG)
- 1.G.21 Семейство вирусов Эпштейна-Барра (вирус герпеса человека 4) Gp42 (Gp42)
- 1.G.22 Семейство гликопротеинов gO (gO) цитомегаловируса (вируса герпеса человека 5)
1.h каналы парацеллюлярной
- 1.H.1 Семейство Claudin Tight Junction (Claudin1)
- 1.H.2 Семейство беспозвоночных PMP22-Claudin (Claudin2)
1.I Мембранные каналы
- 1.I.1 Семейство ядерных поровых комплексов , включая кариоферины
- 1.I.2 Семейство плазмодесм растений
2. Электрохимические транспортеры, управляемые потенциалом.
2.A Портеры ( унипортеры , симпортеры , антипортеры )
- 2.A.1 Основные Посредники суперсемейства (МФС), смотрите также Лактоза пермеаза , фосфат пермеаза и Глюкоза транспортер
- 2.A.2 Гликозид-пентозид-гексуронид (GPH): семейство катионных симпортеров
- 2.A.3 Семейство аминокислот, полиаминов и органических соединений (APC)
- 2.A.4 Семейство посредников диффузии катионов (CDF)
- 2.A.5 Цинк (Zn 2+ ) -Утюг (Fe 2+ ) пермеазы Семейный
- 2.A.6 Суперсемейство Resistance-Nodulation-Cell Division , см. Также мембранный белок, экспортирующий белок SecDF.
- 2.A.7 Суперсемейство переносчиков наркотиков / метаболитов (DMT)
- 2.A.8 Семейство глюконат: H + -симпортер (GntP)
- 2.A.9 Семейство мембранных протеиновых инсертаз (YidC / Alb3 / Oxa1)
- 2.A.10 Семейство переносчиков 2-кето-3-дезоксиглюконата (KdgT)
- 2.A.11 Семейство Citrate-Mg 2+ : H + (CitM) Citrate-Ca 2+ : H + (CitH) Symporter (CitMHS)
- 2.A.12 АТФ: семейство антипортеров АДФ
- 2.A.13 Семейство поглощения C4-дикарбоксилата (Dcu)
- 2.A.14 лактат пермеазы семьи
- 2.A.15 Семейство переносчиков бетаина / карнитина / холина (BCCT)
- 2.A.16 теллуритных сопротивление / дикарбоксилат Transporter Family
- 2.A.17 Семейство протон-зависимых переносчиков олигопептидов
- 2.A.18 Семейство аминокислот / ауксинпермеаз (AAAP)
- 2.A.19 Семейство Ca 2+ : катион-антипортер (CaCA)
- 2.A.20 Семейство переносчиков неорганического фосфата (PiT)
- 2.A.21 Растворенное вещество : семейство натриевых симпортеров
- 2.A.22 Нейротрансмиттер: семейство натриевых симпортеров
- 2.A.23 Семейство дикарбоксилат / аминокислота: катионный (Na + или H + ) симпортер (DAACS)
- 2.A.24 Семейство переносчиков 2-гидроксикарбоксилата (2-HCT)
- 2.A.25 Аланин или глицин: семейство симпортеров катионов ( AGCS )
- 2.A.26 Семейство аминокислот с разветвленной цепью: симпортер катионов (LIVCS)
- 2.A.27 Семейство глутамат: Na + -симпортер (ESS)
- 2.A.28 Желчная кислота: семейство симпортеров Na +
- 2.A.29 Семья митохондриального носителя
- 2.A.30 Семейство котранспортеров катионов и хлоридов (CCC)
- 2.A.31 Семейство анионообменников
- 2.A.32 Семейство транспортеров кремния (сидячих)
- 2.A.33 NhaA Na + : H + -антипортер (NhaA) Семейный
- 2.A.34 Семейство NhaB Na + : H + Antiporter (NhaB)
- 2.A.35 Семейство NhaC Na + : H + -антипортер (NhaC)
- 2.A.36 Моновалентный катион: семейство протонного антипортера-1 (CPA1)
- 2.A.37 Моновалентный катион: семейство протонного антипортера-2 (CPA2)
- 2.A.38 K + Transporter (TRK) Семейный
- 2.A.39 Нуклеарное основание: Семейство Cation Symporter-1 (NCS1)
- 2.A.40 Nucleobase: Семейство катионов Symporter-2 (NCS2)
- 2.A.41 Семейство концентрирующих переносчиков нуклеозидов (CNT)
- 2.A.42 Семейство пермеаз гидрокси / ароматических аминокислот (HAAAP)
- 2.A.43 Семейство лизосомальных переносчиков цистина (LCT)
- 2.A.45 Семейство выделений арсенита-антимонита
- 2.A.46 Семья бензоата: H + Symporter (BenE)
- 2.A.47 Двухвалентный анион : семейство симпортеров Na + (DASS)
- 2.A.48 Семейство сокращенных переносчиков фолиевой кислоты (RFC)
- 2.A.49 Семейство носителей хлоридов / каналов (ClC)
- 2.A.50 Семейство поглощения глицерина (GUP)
- 2.A.51 Семейство переносчиков хромат-ионов (CHR)
- 2.A.52 Семейство транспортеров Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT)
- 2.A.53 Семейство сульфатпермеазы (SulP)
- 2.A.54 Семейство митохондриальных трикарбоксилатных переносчиков (МТС)
- 2.A.55 Семейство переносчиков ионов металлов (Mn 2+ -железо) (Nramp)
- 2.A.56 Семейство трехсторонних АТФ-независимых периплазматических транспортеров (TRAP-T)
- 2.A.57 Семейство равновесных переносчиков нуклеозидов (ЛОР)
- 2.A.58 Семейство фосфатно-Na + -симпортеров (PNaS)
- 2.A.59 Семейство Arsenical Resistance-3 (ACR3)
- 2.A.60 органо Анион Transporter (ОАТ) Семейный
- 2.A.61 Семейство C (DcuC) с поглощением C4-дикарбоксилата
- 2.A.62 Семейство NhaD Na + : H + Antiporter (NhaD)
- 2.A.63 Моновалентный катион (K + или Na + ): семейство протонного антипортера-3 (CPA3)
- 2.A.64 Семейство нацеленных на близнец аргинина (Tat)
- 2.A.65 Семейство переносчиков билирубина (BRT)
- 2.A.66 Суперсемейство мультилекарственных / олигосахаридиллипидных / полисахаридных (MOP) флиппаз
- 2.A.67 Семейство переносчиков олигопептидов (OPT)
- 2.A.68 Семейство p-аминобензоилглутаматных переносчиков (AbgT)
- 2.A.69 Семейство ауксиновых переносчиков оттока (AEC)
- 2.A.70 Семья малонат: Na + -симпортер (MSS)
- 2.A.71 Семейство переносчиков фолата-биоптерина (FBT)
- 2.A.72 Семейство пермеазы поглощения K + (KUP)
- 2.A.73 Семейство поглощения короткоцепочечных жирных кислот (AtoE)
- 2.A.74 Семейство мультилекарственных эндосомальных транспортеров (МЭТ) 4 TMS
- 2.A.75 Семейство экспортеров L-лизина (LysE)
- 2.A.76 Устойчивость к семейству гомосерина / треонина (RhtB)
- 2.A.77 Семейство резистентных к кадмию (CadD)
- 2.A.78 Семейство экспортеров аминокислот с разветвленной цепью (LIV-E)
- 2.A.79 Семейство экспортеров треонина / серина (ThrE)
- 2.A.80 Семейство транспортеров трикарбоксилата (TTT)
- 2.A.81 Семейство аспартатов: аланиновых обменников (AAEx)
- 2.A.82 Семейство переносчиков органических растворенных веществ (OST)
- 2.A.83 Семейство Na + -зависимых переносчиков бикарбонатов (SBT)
- 2.A.84 Семейство экспортеров мальтозы из хлоропластов (MEX)
- 2.A.85 Семейство экспортеров ароматических кислот (ArAE)
- 2.A.86 Семейство экспортеров Autoinducer-2 (AI-2E) (ранее семейство PerM, TC № 9.B.22)
- 2.A.87 Семейство прокариотических транспортеров рибофлавина (P-RFT)
- 2.A.88 Семейство транспортеров захвата витаминов (VUT или ECF)
- 2.A.89 Семейство вакуумных транспортеров железа (VIT)
- 2.A.90 Семейство рецепторов / переносчиков витамина А (STRA6)
- 2.A.91 Комплекс импорта митохондриальной тРНК (M-RIC) (Ранее 9.C.8)
- 2.A.92 Семейство холиновых транспортеров (CTL)
- 2.A.94 Семейство фосфатпермеазы (Pho1)
- 2.A.95 Семейство переносчиков нейтральных аминокислот 6TMS (NAAT)
- 2.A.96 Семейство транспортеров захвата ацетата (AceTr)
- 2.A.97 Семейство митохондриальной внутренней мембраны K + / H + и Ca 2+ / H + Exchanger (LetM1)
- 2.A.98 Семья предполагаемых экспортеров сульфатов (PSE)
- 2.A.99 Семейство переносчиков захвата 6TMS Ni 2+ (HupE-UreJ)
- 2.A.100 Семья Ферропортин (Fpn)
- 2.A.101 Семейство Malonate Uptake (MatC) (ранее UIT1)
- 2.A.102 Семейство пермеаз захвата 4-толуолсульфоната (TSUP)
- 2.A.103 Семейство экспортеров бактериальных прекурсоров муреина (MPE)
- 2.A.104 Семейство экспортеров L-аланина (AlaE)
- 2.A.105 Семейство митохондриальных переносчиков пирувата (MPC)
- 2.A.106 Семейство Ca 2+ : H + антипортер-2 (CaCA2)
- 2.A.107 Семейство MntP Mn 2+ Exporter (MntP)
- 2.A.108 Семейство транспортеров железа / свинца (ILT)
- 2.A.109 Семейство резистентных к ионам теллура (TerC)
- 2.A.110 Heme Transporter, семейство гем-зависимых генных белков (HRG)
- 2.A.111 Семейство Na + / H + антипортер-E (NhaE)
- 2.A.112 Семейство антигенов группы крови KX (KXA)
- 2.A.113 Семейство транспортеров никеля / кобальта (NicO)
- 2.A.114. Предполагаемое семейство CstA (CstA), предполагающего переносчик пептидов от углеродного голодания
- 2.A.115 Семья экспортеров новобиоцина (NbcE)
- 2.A.116 Семейство пептидогликолипидных белков (GAP)
- 2.A.117 Семейство экспортеров хлоргексадина (CHX)
- 2.A.118 Семейство основных аминокислотных антипортеров (ArcD)
- 2.A.119 Семья экспортеров органо-мышьяка (ArsP)
- 2.A.120 Предполагаемое семейство аминокислотных пермеаз (PAAP)
- 2.A.121 Семейство транспортеров сульфатов (CysZ)
- 2.A.122 Семейство холиноподобных вспомогательных белков LrgB / CidB (LrgB / CidB)
- 2.A.123 Сладкое; PQ-петля; Слюна; Семья MtN3 (Sweet)
- 2.A.124 Семейство экспортеров лизина (LysO)
- 2.A.125 Семейство эукариотических транспортеров рибофлавина (E-RFT)
- 2.A.126 Семейство экспортеров жирных кислот (FAX)
- 2.A.127 Семейство энтеробактериальных переносчиков кардиолипина (CLT)
2.B Нерибосомно синтезированные портеры
- 2.В.1 валиномицин Carrier Family
- 2.B.2 монензин семья
- 2.b.3 нигерицина семьи
- 2.B.4 Семейство макротетролидных антибиотиков (МА)
- 2.B.5 Семейство макроциклических полиэфиров (MP)
- 2.B.6 Ionomycin семьи
- 2.B.7 Семейство трансмембранной α-спиральной транслокации фосфолипидов (TMP-PLT)
- 2.B.8 Семейство бафиломицина A1 (бафиломицина)
- 2.B.9 Функциональное семейство пептидов, проникающих в клетки (CPP)
- 2.B.10 Синтетический CPP, семейство Transportan
- 2.B.11 Семейство ионофоров- носителей кальцимицина или A23187
- 2.B.12 салиномицина семьи
- 2.B.13 Семейство тетрапирролических макроциклических анионных антипортеров (TPMC-AA)
- 2.B.14 Семейство ласалоцидов A или X-537A Ionophore (Lasalocid)
- 2.B.15 Семейство хлоридных носителей на основе трис-тиомочевины (TTT-CC)
- 2.B.16 Семейство сложных анионных носителей, содержащих галогеновые связи (HCAC)
- 2.B.17 Семейство изофталамидных производных H + : Cl - ко-транспортеров (IDC)
- 2.B.18 Производное пиридин-2,6-дикарбоксамина (PDCA) H +: Cl - семейство ко-переносчиков
- 2.B.19 Семейство производных пиррола (C4P) Calix (4)
- 2.B.20 Семейство продигиозина (продигиозина) хлорида / бикарбонатного обменника
- 2.B.21 Семейство анионных переносчиков производных орто-фенилендиамин-бис-мочевины (oPDA-U)
- 2.B.22 Семейство транспортеров анионов, функционализированных имидазолием (IAT)
- 2.B.23 Гомотетрамерный трансмембранный Zn 2+ / Co 2+ : синтетический антипортер протонов, семейство рокеров (рокеров )
- 2.B.24 Семейство 2,6-бис (бензимидазол-2-ил) пиридин-анион-носитель (BBP-AC)
- 2.B.25 Семейство пептид-опосредованных липидных триггеров (PLFF)
- 2.B.26 Семейство бис (имидазолил) -функционализированных бис (холоил) конъюгатов (BIBCC)
- 2.B.27 Семейство транспортеров трис-мочевины-аниона
- 2.B.29 Anionophoric Marine Алкалоид Tambjamine Семейный
2.C Ионно-градиентные блоки питания
- 2.C.1 Семейство дополнительных белков TonB-ExbB-ExbD / TolA-TolQ-TolR (TonB) для активации активного транспорта, опосредованного рецепторами внешней мембраны (OMR)
3. Основные активные переносчики
3.А. Транспортеры, управляемые гидролизом PP-связью
- 3.A.1 ABC-транспортеры, включая BtuCD, транспортер захвата молибдата, регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе и другие.
- 3.A.2 Н + - или Na + -translocating F-типа АТФазы , V-типа АТФазы и А-тип АТФазы , надсемейство
- 3.A.3 P-тип АТФазы Надсемейство
- 3.A.4 В Арсените-Антимоните оттока семья
- 3.A.5 Общие секреторный путь (Sec) транслокон (препротеин транслоказы SecY)
- 3.A.6 Семейство секреторных путей типа III (связанных с вирулентностью) (IIISP)
- 3.A.7 Семейство секреторных путей (IVSP) типа IV (конъюгальный перенос ДНК-белок или VirB)
- 3.A.8 Семейство митохондриальных протеинтранслоказ (MPT)
- 3.A.9 Семейство транслоказ белков оболочки хлоропластов (CEPT или Tic-Toc)
- 3.A.10 Н + , Na + -translocating пирофосфатаза семьи
- 3.A.11 Семейство транспортеров трансформации ДНК (ДНК-Т), связанных с компетентностью бактерий
- 3.A.12 Семейство транслокаторов ДНК перегородки (S-ДНК-T)
- 3.A.13 Семейство экспортеров нитчатых фагов (FPhE)
- 3.A.14 Семейство фимбрилина / экспортеров белка (FPE)
- 3.A.15 Семейство основных терминальных ответвлений (MTB), секретирующих белок внешней мембраны
- 3.A.16 Семейство эндоплазматических ретикулярных ретротранслоконов (ER-RT)
- 3.A.17 Семейство инъекционных фагов Т7 (T7 Injectisome)
- 3.A.18 Семейство ядерных экспортеров мРНК (мРНК-E)
- 3.A.19 Семейство комплексов распознавания / вставки TMS (TRC)
- 3.A.20 Семейство импортеров пероксисомального белка (ИПП)
- 3.A.21 Семейство комплексов биогенеза / вставки белков с заякоренной хвостом мембраны (TAMP-B)
- 3.A.22 Семейство экспортных комплексов ядерной мРНК TREX / TAP, связанных с транскрипцией (TREX)
- 3.A.23 Семейство симбиоза / секреторного пути вирулентности (VISP) типа VI
- 3.A.24 Тип VII или семейство систем секреции белков ESX (T7SS)
- 3.A.25 Семейство ERAD-подобных машин для симбионтов (SELMA)
- 3.A.26 Семейство Plasmodium Translocon экспортируемых белков (PTEX)
3.B Транспортеры, управляемые декарбоксилированием
- 3.B.1 Семейство декарбоксилаз карбоновой кислоты, переносящей Na + (NaT-DC)
3.C Транспортеры с переносом метилового эфира
- 3.C.1 Метилтетрагидрометаноптерин, переносящий Na + : семейство коэнзим М-метилтрансферазы (NaT-MMM)
3.D. Транспортеры с окислительным восстановлением
Они включают ряд трансмембранных цитохром b- подобных белков, включая кофермент Q - цитохром с редуктазу (цитохром bc1); комплекс цитохрома b6f ; формиатдегидрогеназа, респираторная нитратредуктаза ; сукцинат - кофермент Q редуктаза (фумаратредуктаза); и сукцинатдегидрогеназа . См. Цепь переноса электронов .
- 3.D.1 Семейство H + или Na + -транслоцирующих НАДН-дегидрогеназ («комплекс I»)
- 3.D.2 Семейство протон-транслоцирующих трансгидрогеназ (ПТГ)
- 3.D.3 Надсемейство хинолов, переносящих протоны: цитохром с редуктаза )
- 3.D.4 Протон-транслокации цитохромоксидазы (ЦОГ) надсемейство
- 3.D.5 Семейство Na + -транслоцирующих НАДН: хинондегидрогеназ (Na-NDH или NQR)
- 3.D.6 Предполагаемое семейство NADH, переносящего ионы (H + или Na + ): ферредоксиноксидоредуктаза (NFO или RNF)
- 3.D.7 Семейство H 2 : гетеродисульфид оксидоредуктазы (HHO)
- 3.D.8 Семейство формилметанофурандегидрогеназ (FMF-DH), накачивающих Na + - или H +
- 3.D.9 Семейство H + -транслоцирующей дегидрогеназы F420H2 (F420H2DH)
- 3.D.10 Семейство прокариотических сукцинатдегидрогеназ (SDH)
3.E. Светопоглощающие транспортеры
- Бактериородопсиноподобные белки, включая родопсин (см. Также опсин )
- Бактериальные фотосинтетические реакционные центры и фотосистемы I и II
- Светособирающие комплексы из бактерий и хлоропластов
4. Групповые транслокаторы
4.А групповые транслокаторы, управляемые фосфопереносом
- 4.A.1 Семейство PTS глюкоза-глюкозид (Glc)
- 4.A.2 Семейство PTS фруктоза-маннит (Fru)
- 4.A.3 Семейство PTS лактоза-N, N'-диацетилхитобиоза-β-глюкозид (Lac)
- 4.A.4 Семейство PTS Glucitol (кишечник)
- 4.A.5 Семейство PTS Galactitol (Gat)
- 4.A.6 Семейство PTS манноза-фруктоза-сорбоза (мужчина)
- 4.A.7 Семейство PTS L-аскорбата (L-Asc)
4.B Переносчики захвата никотинамид-рибонуклеозида
- 4.B.1 Семейство пермеаз захвата никотинамид рибонуклеозидов (NR) (PnuC)
4.C Транспортеры, связанные с ацил-КоА-лигазой
- 4.C.1 Предлагаемое семейство переносчиков жирных кислот (FAT)
- 4.C.2 Семейство карнитин-O-ацилтрансферазы (CrAT)
- 4.C.3 Семейство ацил-КоА-тиоэстеразы (AcoT)
4.D полисахарид-синтаза / экспортеры
- 4.D.1 Семейство предполагаемой векторной гликозильной полимеризации (VGP)
- 4.D.2 Семейство гликозилтрансферазы 2 (GT2)
- 4.D.3 Семейство гликан-глюкозилтрансфераз (OpgH)
4.E. Групповые транслокаторы, катализируемые вакуумными полифосфат-полимеразой
- 4.E.1 Семейство вакуолярных (ацидокальцисом) полифосфат-полимераз (V-PPP)
5. Транспортные носители электронов
5. Трансмембранные переносчики 2-х электронов.
- 5.A.1 Семейство оксидоредуктазы D с дисульфидной связью (DsbD)
- 5.A.2 Семейство оксидоредуктазы B с дисульфидной связью (DsbB)
- 5.A.3 Семейство прокариотических молибдоптерин-содержащих оксидоредуктаз (PMO)
5.B Трансмембранные переносчики 1-электрона
- 5.B.1 Семейство НАДФН-оксидазы фагоцитов (gp91phox)
- 5.B.2 Семейство эукариотических цитохромов b561 (Cytb561)
- 5.B.3 Семейство Geobacter Nanowire Electron Transfer (G-NET)
- 5.B.4 Семейство суперкомплексов фотосистемы I растений (PSI)
- 5.B.5 Семейство внеклеточных оксидоредуктаз металлов (EMOR)
- 5.B.6 Семейство трансмембранного эпителиального антигена протеина-3-железоредуктазы (STEAP)
- 5.B.7 Семья ЙедЗ (YedZ)
- 5.B.8 Семейство поринов / цитохромных комплексов транс-наружной мембраны для переноса электронов (ET-PCC)
- 5.B.9 Семейство порин-цитохром c (Cyc2)
8. Дополнительные факторы, связанные с транспортировкой.
8.A Вспомогательные транспортные белки
8.B Белковые / пептидные токсины, синтезируемые рибосомами, нацелены на каналы и носителей
8.C Нерибосомно синтезированные токсины, нацеленные на каналы и носителей
9. Не полностью охарактеризованные транспортные системы.
9.A Признанные переносчики неизвестного биохимического механизма
9.B Предполагаемые транспортные белки
9.C Функционально охарактеризованные транспортеры без идентифицированных последовательностей
Рекомендации
- ^ Saier, Milton H .; Reddy, Vamsee S .; Tamang, Dorjee G .; Вестермарк, Оке (январь 2014 г.). «База данных классификации транспортеров» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (D1): D251 – D258. DOI : 10.1093 / NAR / gkt1097 . PMC 3964967 . PMID 24225317 .
- ^ Saier, MH; Йена, MR; Не нормально.; Tamang, DG; Элкан, К. (1 января 2009 г.). «База данных классификации транспортеров: последние достижения» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (База данных): D274 – D278. DOI : 10.1093 / NAR / gkn862 . PMC 2686586 . PMID 19022853 .
- ^ Saier, MH; Тран, резюме; Баработе, Р. Д. (1 января 2006 г.). «TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (90001): D181 – D186. DOI : 10.1093 / NAR / gkj001 . PMC 1334385 . PMID 16381841 .
Внешние ссылки
- База данных классификации транспортеров
- Список на qmul.ac.uk
- Сайер М.Х., Тран CV, Баработе Р.Д. (январь 2006 г.). «TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках» . Nucleic Acids Res . 34 (Выпуск базы данных): D181–6. DOI : 10.1093 / NAR / gkj001 . PMC 1334385 . PMID 16381841 .
- Буш В., Сайер М. Х. (2002). «Система классификации транспортеров (ТК), 2002». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол . 37 (5): 287–337. DOI : 10.1080 / 10409230290771528 . PMID 12449427 . S2CID 10558982 .
- Классификация переносчиков человека в фармакологии