| Синдром Альстрома 1 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Символ | ALMS1 | ||||||
| Ген NCBI | 7840 | ||||||
| HGNC | 428 | ||||||
| OMIM | 606844 | ||||||
| RefSeq | NM_015120 | ||||||
| UniProt | Q8TCU4 | ||||||
| Прочие данные | |||||||
| Locus | Chr. 2 п. 13.1 | ||||||
| |||||||
Синдром альстрёмо 1 также известный как ALMS1 является белком , который в организме человека кодируется ALMS1 геном . [1] [2]
Молекулярная биология [ править ]
Ген расположен на коротком плече хромосомы 2 (2p13.2) на плюсовой (Ватсон) цепи. Его длина составляет 224 161 основание, организованных в 23 экзона. Кодируемый белок содержит 4 167 аминокислот и молекулярную массу 460 937 Да. Известны три изофомы. Сам белок имеет большой домен тандемного повтора, состоящий из 34 несовершенных повторов из 47 аминокислот. Мутации, связанные с заболеванием, обычно обнаруживаются в экзонах 8, 10 и 16.
Ген экспрессируется в тканях плода, включая аорту , мозг , глаз , почки , печень , легкие , обонятельную луковицу , поджелудочную железу , скелетные мышцы , селезенку и семенники . Белок находится в цитоплазме , центросоме , проекциях клеток и базальном теле ресничек . Во время митоза он локализуется на обоих полюсах веретена .
Функция [ править ]
Нокдаун Alms1 с помощью короткой интерферирующей РНК во внутренних мозговых клетках собирательного протока мыши вызывает дефект цилиогенеза . Реснички были низкорослыми, а обработанные клетки не обладали способностью увеличивать приток кальция в ответ на механические стимулы. [3]
Ассоциация болезней [ править ]
Было обнаружено, что мутации в гене ALMS1 являются причиной синдрома Альстрёма с 81 мутацией, вызывающей заболевание . [4]
Известны множественные мутации: в настоящее время (2007 г.) их всего 79. Они включают как бессмысленные мутации, так и мутации со сдвигом рамки считывания. Большинство мутаций было обнаружено в экзонах 8,10 и 16.
Открытие [ править ]
Лаборатория Джексона в Бар - Харбор , штат Мэн , США с университетом Саутгемптона , Великобритания , изолированных ALMS1 в качестве единственного гена , ответственного за синдром альстрёма . [1]
См. Также [ править ]
- Alms1, центросома и белок, связанный с базальным телом
Ссылки [ править ]
- ^ a b Коллин Г.Б., Маршалл Д.Д., Кардон Л.Р., Нишина П.М. (февраль 1997 г.). «Картирование гомозиготности при синдроме Альстрёма по хромосоме 2р» . Гм. Мол. Genet . 6 (2): 213–219. DOI : 10.1093 / HMG / 6.2.213 . PMID 9063741 .
- ^ Нагасе Т, Ишикав К, Д Накаджима, Охир М, Секите Н, Миядзима Н, Танака А, Котань Н, Nomura N, O Охара (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Res . 4 (2): 141–150. DOI : 10.1093 / dnares / 4.2.141 . PMID 9205841 .
- ^ Ли G, R Vega, Нелмс К, Gekakis Н, Goodnow С, Макнэмэра Р, У Н, Хонг Н.А., Glynne R (январь 2007 г.). «Роль белка синдрома Альстрёма, alms1, в цилиогенезе почек и клеточном покое» . PLOS Genet . 3 (1): e8. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0030008 . PMC 1761047 . PMID 17206865 .
- ^ Джой Т, Као Н, черный G, R Малик, Чарлтон-Menys В, Hegele Р.А., Даррингтон П. Н. (2007). «Синдром Альстрома (OMIM 203800): клинический случай и обзор литературы» . Журнал "Орфанет редких болезней" . 2 (1): 49. DOI : 10,1186 / 1750-1172-2-49 . PMC 2266715 . PMID 18154657 .
Внешние ссылки [ править ]
- GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме Альстрома
- Записи OMIM о синдроме Альстрёма
- ALMS1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
