Биологическая фиксация углерода


Биологическая фиксация углерода или ассимиляция углерода — это процесс, при котором неорганический углерод (в частности, в форме двуокиси углерода ) превращается в органические соединения живыми организмами . [1] Соединения затем используются для хранения энергии и в качестве структуры для других биомолекул . Углерод в основном фиксируется посредством фотосинтеза , но некоторые организмы используют процесс, называемый хемосинтезом , в отсутствие солнечного света.

Организмы, которые растут за счет фиксации углерода, называются автотрофами , к ним относятся фотоавтотрофы (использующие солнечный свет) и литоавтотрофы (использующие неорганическое окисление). Гетеротрофы сами по себе не способны фиксировать углерод, но способны расти, потребляя углерод, зафиксированный автотрофами или другими гетеротрофами. «Связанный углерод», «восстановленный углерод» и «органический углерод» могут использоваться взаимозаменяемо для обозначения различных органических соединений. [2] Хемосинтез – это фиксация углерода за счет химической энергии, а не солнечного света. Серо- и водородокисляющие бактерии часто используют цикл Кальвина или восстановительный цикл лимонной кислоты. [3]

Основной фиксированной формой неорганического углерода является двуокись углерода (CO 2 ). Подсчитано, что около 258 миллиардов тонн углекислого газа ежегодно преобразуется в результате фотосинтеза. Большая часть фиксации происходит в земной среде, особенно в тропиках. Общее количество фиксированного углекислого газа намного больше, поскольку примерно 40% расходуется на дыхание после фотосинтеза. [2] [4]

Известно семь автотрофных путей фиксации углерода. Цикл Кальвина фиксирует углерод в хлоропластах растений и водорослей, а также в цианобактериях . Он также фиксирует углерод при аноксигенном фотосинтезе у одного типа протеобактерий , называемых пурпурными бактериями , и у некоторых нефототрофных протеобактерий. [5]

Из пяти других автотрофных путей два известны только у бактерий ( восстановительный цикл лимонной кислоты и цикл 3-гидроксипропионата ), два только у архей (два варианта цикла 3-гидроксипропионата) и один как у бактерий, так и у архей ( восстановительный путь ацетил-КоА ).

На цикл Кальвина приходится 90% биологической фиксации углерода. Потребляя АТФ и НАДФН, цикл Кальвина у растений объясняет преобладание фиксации углерода на суше. У водорослей и цианобактерий это объясняет преобладание фиксации углерода в океанах. Цикл Кальвина превращает углекислый газ в сахар в виде триозофосфата (TP), который представляет собой глицеральдегид-3-фосфат (GAP) вместе с дигидроксиацетонфосфатом (DHAP):


Нитевидная цианобактерия
Такие цианобактерии осуществляют фотосинтез. Их появление предвещало эволюцию многих фотосинтезирующих растений и насыщало кислородом атмосферу Земли.
График, показывающий чистый годовой объем фиксации CO 2 наземными и морскими организмами.
Карта основных метаболических путей в стиле метро


Гликогенолиз _
Гликогенез _
Гликолиз _
глюконеогенез _
Декарбоксилирование пирувата _
Ферментация
кетолиз _
кетогенез _
питательные вещества для глюконеогенеза
Прямой / C4 / CAM карбоновый впуск
Легкая реакция
Окислительное фосфорилирование
Дезаминирование аминокислот
Цитратный шаттл
липогенез
Липолиз
Стероидогенез
Путь МВА
Путь МЕР
Шикимате путь
Транскрипция и
репликация
Перевод
протеолиз
Гликозилирование _


Сахарные кислоты
Двойные / множественные сахара и гликаны
Простые сахара
Инозитол-П
Аминосахара
и сиаловые кислоты
Нуклеотидные сахара
Гексоза-П
Триос-П
глицерин
Р-глицераты
Пентоза-П
Тетроза-П
Пропионил- КоА
сукцинат
Ацетил -КоА
Пентоза-П
Р-глицераты
глиоксилат
Фотосистемы
пируват
лактат
Ацетил -КоА
Цитрат
оксалоацетат _
Малат
Сукцинил- КоА
α-кето- глутарат
Кетоновые тела
Дыхательная цепь
Сериновая группа
аланин
Аминокислоты с разветвленной цепью
Аспартатная группа
Группа гомосерина
и лизин
Глутаматная группа
и пролин
Аргинин
Креатин
и полиамины
Кетогенные и
глюкогенные аминокислоты
Аминокислоты
Шикимате
Ароматические аминокислоты и гистидин
Аскорбат
( витамин С )
δ-АЛК
Желчные пигменты
гем
Кобаламины ( витамин B12 )
Различные витамины группы В
Кальциферолы
( витамин D )
Ретиноиды
( витамин А )
Хиноны ( витамин К )
и токоферолы ( витамин Е )
Кофакторы
Витамины
и минералы
Антиоксиданты
ПРПП
нуклеотиды
Нуклеиновые кислоты
Белки
Гликопротеины
и протеогликаны
Хлорофиллы
депутат Европарламента
МВА
Ацетил -КоА
поликетиды
Терпеноидные остовы
Терпеноиды
и каротиноиды ( витамин А )
Холестерин
Желчные кислоты
Глицеро- фосфолипиды
глицеролипиды
Ацил-КоА
Жирные кислоты
Гликосфинголипиды _
сфинголипиды
Воски
Полиненасыщенные жирные кислоты
Нейротрансмиттеры
и гормоны щитовидной железы
Стероиды
Эндоканнабиноиды _
Эйкозаноиды