В молекулярной биологии , мессенджер рибонуклеиновая кислота ( мРНК ) представляет собой одноцепочечная молекула из РНКА , которая соответствует генетической последовательности о наличии гена , и считываются рибосомой в процессе синтеза в белках .
Транскрипция - это процесс копирования гена из ДНК в мРНК. Этот процесс немного отличается у эукариот и прокариот , включая то, что прокариотическая РНК-полимераза ассоциируется с ферментами, обрабатывающими ДНК, во время транскрипции, так что процессинг может происходить во время транскрипции. Следовательно, это приводит к тому, что новая цепь мРНК становится двухцепочечной за счет образования комплементарной цепи, известной как цепь транспортной РНК (тРНК). Кроме того, РНК не может образовывать структуры в результате спаривания оснований . Более того, матрицей для мРНК является комплементарная цепь тРНК, которая идентична по последовательности антикодоновой последовательности, с которой связывается ДНК. Короткоживущий, необработанный или частично процессированный продукт называется мРНК-предшественником или пре-мРНК ; после полной обработки она называется зрелой мРНК .
мРНК создается в процессе транскрипции , когда фермент ( РНК-полимераза ) преобразует ген в мРНК первичного транскрипта (также известную как пре-мРНК ). Эта пре-мРНК обычно все еще содержит интроны , области, которые не будут кодировать окончательную аминокислотную последовательность . Они удаляются в процессе сплайсинга РНК , оставляя только экзоны , участки, которые будут кодировать белок. Эта последовательность экзона составляет зрелую мРНК . Затем зрелая мРНК считывается рибосомой, и, используя аминокислоты, переносимые транспортной РНК, рибосома создает белок. Этот процесс известен как перевод . Все эти процессы составляют часть центральной догмы молекулярной биологии , которая описывает поток генетической информации в биологической системе.
Как и в ДНК , генетическая информация в мРНК содержится в последовательности нуклеотидов , которые организованы в кодоны, состоящие из трех рибонуклеотидов каждый. Каждый кодон кодирует определенную аминокислоту , за исключением стоп-кодонов , которые прекращают синтез белка. Для трансляции кодонов в аминокислоты требуются два других типа РНК: транспортная РНК, которая распознает кодон и обеспечивает соответствующую аминокислоту, и рибосомная РНК (рРНК), центральный компонент механизма производства белка рибосом.
Существование мРНК было впервые предложено Жаком Моно и Франсуа Жакобом , а впоследствии было обнаружено Джейкобом, Сиднеем Бреннером и Мэтью Мезельсоном в Калифорнийском технологическом институте в 1961 году [1].
Синтез, обработка и функция
Кратковременное существование молекулы мРНК начинается с транскрипции и в конечном итоге заканчивается деградацией. В течение своей жизни молекула мРНК также может обрабатываться, редактироваться и транспортироваться перед трансляцией. Молекулы мРНК эукариот часто требуют обширной обработки и транспорта, в то время как молекулы мРНК прокариот - нет. Молекула мРНК эукариот и окружающие ее белки вместе называются РНП-мессенджером .
Транскрипция
Транскрипция - это когда РНК копируется из ДНК. Во время транскрипции РНК-полимераза при необходимости копирует ген из ДНК в мРНК. Этот процесс немного отличается у эукариот и прокариот. Одно заметное отличие состоит в том, что прокариотическая РНК-полимераза связывается с ферментами, обрабатывающими ДНК, во время транскрипции, так что процессинг может происходить во время транскрипции. Следовательно, это приводит к тому, что новая цепь мРНК становится двухцепочечной, образуя комплементарную цепь, известную как цепь тРНК, которые при объединении не могут образовывать структуры из спаривания оснований. Более того, матрицей для мРНК является комплементарная цепь тРНК, которая идентична по последовательности антикодоновой последовательности, с которой связывается ДНК. Короткоживущий, необработанный или частично процессированный продукт называется мРНК-предшественником или пре-мРНК ; после полной обработки она называется зрелой мРНК .
Обработка пре-мРНК эукариот
Обработка мРНК сильно различается у эукариот , бактерий и архей . Неэукариотическая мРНК, по сути, созревает после транскрипции и не требует обработки, за исключением редких случаев. [2] Эукариотическая пре-мРНК, однако, требует нескольких этапов обработки, прежде чем она будет доставлена в цитоплазму и ее трансляция рибосомой.
Сращивание
Обширный процессинг пре-мРНК эукариот, который приводит к зрелой мРНК, представляет собой сплайсинг РНК , механизм, с помощью которого интроны или аутроны (некодирующие области) удаляются, а экзоны (кодирующие области) соединяются вместе.
Добавление крышки 5 футов
5' крышки (называемый также в колпачок РНК РНК - 7-метилгуанозин колпачок или РНК - м 7 G колпачок) заключается в том была добавлена к „фронт“ или модифицированный гуанин нуклеотид 5' - конце эукариотической РНК в скором времени после начала транскрипции. 5'-кэп состоит из концевого остатка 7-метилгуанозина, который связан через 5'-5'-трифосфатную связь с первым транскрибированным нуклеотидом. Его присутствие имеет решающее значение для распознавания рибосомой и защиты от РНКаз .
Добавление кэпа связано с транскрипцией и происходит совместно с транскрипцией, так что одно влияет на другое. Вскоре после начала транскрипции 5'-конец синтезируемой мРНК связывается синтезирующим кэп комплексом, связанным с РНК-полимеразой . Этот ферментный комплекс катализирует химические реакции, необходимые для кэппирования мРНК. Синтез протекает как многоступенчатая биохимическая реакция.
Редактирование
В некоторых случаях мРНК будет редактироваться , изменяя нуклеотидный состав этой мРНК. Примером у людей является мРНК аполипопротеина B , которая редактируется в некоторых тканях, но не редактируется в других. Редактирование создает ранний стоп-кодон, который после трансляции дает более короткий белок.
Полиаденилирование
Полиаденилирование - это ковалентное связывание полиаденилильного фрагмента с молекулой информационной РНК. В эукариотических организмах большинство молекул матричной РНК (мРНК) полиаденилировано на 3'-конце, но недавние исследования показали, что короткие участки уридина (олигоуридилирование) также обычны. [3] поли (А) хвост и белок связан с ней помочь в защите от деградации мРНК экзонуклеазами. Полиаденилирование также важно для терминации транскрипции, экспорта мРНК из ядра и трансляции. мРНК также может быть полиаденилирована в прокариотических организмах, где поли (А) хвосты действуют скорее для облегчения, чем препятствия экзонуклеолитической деградации.
Полиаденилирование происходит во время и / или сразу после транскрипции ДНК в РНК. После завершения транскрипции цепь мРНК расщепляется под действием эндонуклеазного комплекса, связанного с РНК-полимеразой. После расщепления мРНК к свободному 3'-концу в сайте расщепления добавляется около 250 остатков аденозина. Эта реакция катализируется полиаденилат-полимеразой. Так же, как и при альтернативном сплайсинге , может быть более одного варианта полиаденилирования мРНК.
Встречаются также мутации сайта полиаденилирования. Первичный транскрипт РНК гена расщепляется по сайту присоединения поли-А, и 100-200 А добавляются к 3'-концу РНК. Если этот сайт изменен, образуется аномально длинная и нестабильная конструкция мРНК.
Транспорт
Еще одно различие между эукариотами и прокариотами - транспорт мРНК. Поскольку транскрипция и трансляция эукариот разделены по компартментам, мРНК эукариот должны экспортироваться из ядра в цитоплазму - процесс, который может регулироваться разными сигнальными путями. [4] Зрелые мРНК распознаются посредством их процессированных модификаций и затем экспортируются через ядерную пору за счет связывания с кэп-связывающими белками CBP20 и CBP80, [5], а также с комплексом транскрипции / экспорта (TREX). [6] [7] Множественные пути экспорта мРНК были идентифицированы у эукариот. [8]
В пространственно сложных клетках некоторые мРНК транспортируются в определенные субклеточные пункты назначения. В зрелых нейронах определенные мРНК транспортируются от сомы к дендритам . Один сайт трансляции мРНК находится в полирибосомах, выборочно локализованных под синапсами. [9] мРНК для Arc / Arg3.1 индуцируется синаптической активностью и селективно локализуется рядом с активными синапсами на основе сигналов, генерируемых рецепторами NMDA. [10] Другие мРНК также перемещаются в дендриты в ответ на внешние стимулы, такие как мРНК β-актина. [11] При экспорте из ядра мРНК актина связывается с ZBP1 и субъединицей 40S. Комплекс связывается моторным белком и транспортируется к месту назначения (расширение нейрита) вдоль цитоскелета. В конечном итоге ZBP1 фосфорилируется с помощью Src, чтобы инициировать трансляцию. [12] В развивающихся нейронах мРНК также транспортируются в растущие аксоны и особенно в конусы роста. Многие мРНК помечены так называемыми «почтовыми индексами», которые нацелены на их транспортировку в определенное место. [13]
Перевод
Поскольку прокариотическая мРНК не нуждается в процессинге или транспортировке, трансляция рибосомой может начаться сразу после окончания транскрипции. Следовательно, можно сказать, что прокариотическая трансляция связана с транскрипцией и происходит котранскрипционно .
Эукариотическая мРНК, которая была обработана и транспортирована в цитоплазму (т.е. зрелая мРНК), затем может транслироваться рибосомой. Перевод может происходить на рибосомах свободно плавающие в цитоплазме, или направленный на эндоплазматическую сеть посредством частицы распознавания сигнала . Следовательно, в отличие от прокариот, трансляция эукариот напрямую не связана с транскрипцией. В некоторых случаях возможно даже, что снижение уровней мРНК сопровождается повышенными уровнями белка, как это наблюдалось для уровней мРНК / белка EEF1A1 при раке молочной железы. [14] [необходим неосновной источник ]
Состав
Кодирующие регионы
Кодирующие области состоят из кодонов , которые декодируются и транслируются в белки рибосомой; у эукариот обычно на одну, а у прокариот обычно на несколько. Кодирующие области начинаются со стартового кодона и заканчиваются стоп-кодоном . В общем, стартовый кодон представляет собой триплет AUG, а стоп-кодон - UAG («янтарь»), UAA («охра») или UGA («опал»). Кодирующие области обычно стабилизируются внутренними парами оснований, что препятствует деградации. [15] [16] Помимо того, что они кодируют белок, части кодирующих областей могут служить регуляторными последовательностями в пре-мРНК в качестве энхансеров экзонного сплайсинга или сайленсеров экзонного сплайсинга .
Непереведенные регионы
Нетранслируемые области (UTR) - это участки мРНК перед стартовым кодоном и после стоп-кодона, которые не транслируются, называемые пятью первичными нетранслируемыми областями (5 'UTR) и тремя первичными нетранслированными областями (3' UTR), соответственно. Эти области транскрибируются с кодирующей областью и, таким образом, являются экзонными, поскольку они присутствуют в зрелой мРНК. Нетранслируемым областям приписывается несколько ролей в экспрессии генов, включая стабильность мРНК, локализацию мРНК и эффективность трансляции . Способность UTR выполнять эти функции зависит от последовательности UTR и может различаться для разных мРНК. Генетические варианты в 3 'UTR также участвуют в восприимчивости к заболеванию из-за изменения структуры РНК и трансляции белка. [17]
Стабильность мРНК может контролироваться с помощью 5 'UTR и / или 3' UTR из-за различного сродства к ферментам, разрушающим РНК, называемым рибонуклеазами, и к вспомогательным белкам, которые могут стимулировать или ингибировать деградацию РНК. (См. Также C-богатый элемент стабильности .)
Эффективность трансляции, включая иногда полное запрещение трансляции, можно контролировать с помощью UTR. Белки, которые связываются с 3 'или 5' UTR, могут влиять на трансляцию, влияя на способность рибосомы связываться с мРНК. МикроРНК, связанные с 3'-UTR, также могут влиять на эффективность трансляции или стабильность мРНК.
Считается, что цитоплазматическая локализация мРНК является функцией 3 'UTR. Белки, которые необходимы в определенной области клетки, также могут транслироваться туда; в таком случае 3'-UTR может содержать последовательности, которые позволяют транскрипту быть локализованным в этой области для трансляции.
Некоторые элементы, содержащиеся в нетранслируемых областях, при транскрибировании в РНК образуют характерную вторичную структуру . Эти структурные элементы мРНК участвуют в регуляции мРНК. Некоторые из них, такие как элемент SECIS , являются мишенями для связывания белков. Один класс элементов мРНК, рибопереключатели , напрямую связывают небольшие молекулы, изменяя их укладку, чтобы изменить уровни транскрипции или трансляции. В этих случаях мРНК регулируется сама.
Поли (А) хвост
3'-поли (A) -хвост представляет собой длинную последовательность адениновых нуклеотидов (часто несколько сотен), добавленных к 3'-концу пре-мРНК. Этот хвост способствует экспорту из ядра и трансляции и защищает мРНК от деградации.
Моноцистронная мРНК в сравнении с полицистронной
Молекула мРНК называется моноцистронной, если она содержит генетическую информацию для трансляции только одной белковой цепи (полипептида). Так обстоит дело с большинством мРНК эукариот . [18] [19] С другой стороны, полицистронная мРНК несет несколько открытых рамок считывания (ORF), каждая из которых транслируется в полипептид. Эти полипептиды обычно имеют родственную функцию (они часто представляют собой субъединицы, составляющие конечный комплексный белок), и их кодирующая последовательность сгруппирована и регулируется вместе в регуляторной области, содержащей промотор и оператор . Большая часть мРНК, обнаруженной у бактерий и архей, является полицистронной [18], как и митохондриальный геном человека. [20] Дицистронная или бицистронная мРНК кодирует только два белка .
циркуляризация мРНК
У эукариот молекулы мРНК образуют кольцевые структуры из-за взаимодействия между eIF4E и поли (A) -связывающим белком , которые оба связываются с eIF4G , образуя мостик мРНК-белок-мРНК. [21] Считается, что циркуляризация способствует циклированию рибосом на мРНК, что приводит к эффективной по времени трансляции, а также может обеспечивать транслирование только интактной мРНК (для частично деградированной мРНК характерно отсутствие кэпа m7G или поли-A-хвоста). [22]
Существуют и другие механизмы циркуляризации, особенно в мРНК вируса. В мРНК полиовируса используется участок клеверного листа ближе к 5'-концу для связывания PCBP2, который связывает поли (A) -связывающий белок , образуя знакомый круг мРНК-белок-мРНК. Вирус желтого карлика ячменя имеет связывание между сегментами мРНК на его 5'-конце и 3'-конце (так называемые петли «целующегося стебля»), циркулируя мРНК без каких-либо белков.
Геномы РНК-вирусов (+ цепи которых транслируются как мРНК) также обычно подвергаются циркуляризации. [ необходимая цитата ] Во время репликации генома циркуляризация действует для увеличения скорости репликации генома, циклическая циркуляция вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразы во многом так же, как предполагается, что рибосома циклизуется.
Деградация
Различные мРНК в одной и той же клетке имеют разное время жизни (стабильность). В бактериальных клетках отдельные мРНК могут выжить от секунд до более часа. Однако время жизни в среднем составляет от 1 до 3 минут, что делает бактериальную мРНК гораздо менее стабильной, чем мРНК эукариот. [23] В клетках млекопитающих время жизни мРНК колеблется от нескольких минут до дней. [24] Чем выше стабильность мРНК, тем больше белка может быть произведено из этой мРНК. Ограниченное время жизни мРНК позволяет клетке быстро изменять синтез белка в ответ на меняющиеся потребности. Существует множество механизмов, которые приводят к разрушению мРНК, некоторые из которых описаны ниже.
Прокариотическая деградация мРНК
В целом у прокариот время жизни мРНК намного короче, чем у эукариот. Прокариоты разрушают сообщения с помощью комбинации рибонуклеаз, включая эндонуклеазы, 3'-экзонуклеазы и 5'-экзонуклеазы. В некоторых случаях малые молекулы РНК (мРНК) длиной от десятков до сотен нуклеотидов могут стимулировать деградацию специфических мРНК за счет спаривания оснований с комплементарными последовательностями и облегчения расщепления рибонуклеазой РНКазой III . Недавно было показано, что бактерии также имеют своего рода 5-футовый колпачок, состоящий из трифосфата на 5'-конце . [25] Удаление двух фосфатов оставляет 5'-монофосфат, в результате чего сообщение разрушается экзонуклеазой РНКазой J, которая расщепляет 5 'до 3'.
Оборот мРНК эукариот
Внутри эукариотических клеток существует баланс между процессами трансляции и распада мРНК. Активно транслируемые сообщения связываются рибосомами , факторами инициации эукариот eIF-4E и eIF-4G и поли (A) -связывающим белком . eIF-4E и eIF-4G блокируют расщепляющий фермент ( DCP2 ), а поли (A) -связывающий белок блокирует экзосомный комплекс , защищая концы сообщения. Баланс между трансляцией и распадом отражается в размере и количестве цитоплазматических структур, известных как P-тельца [26] . Поли (A) хвост мРНК укорачивается специализированными экзонуклеазами, которые нацелены на специфические информационные РНК с помощью комбинации цис -регуляторные последовательности на РНК и транс-действующих РНК-связывающих белках. Считается, что удаление поли (A) хвоста нарушает круговую структуру сообщения и дестабилизирует комплекс связывания кэпа . Сообщение затем подвергается разложению либо экзосомой или decapping комплекса . Таким образом, переводно неактивные сообщения могут быть быстро уничтожены, в то время как активные сообщения остаются нетронутыми. Механизм остановки трансляции и передачи сообщения комплексам распада в деталях не изучен.
Распад AU-богатых элементов
Присутствие AU-богатых элементов в некоторых мРНК млекопитающих имеет тенденцию дестабилизировать эти транскрипты за счет действия клеточных белков, которые связывают эти последовательности и стимулируют удаление поли (A) хвоста. Считается, что потеря поли (A) хвоста способствует деградации мРНК, облегчая атаку как экзосомного комплекса [27], так и комплекса декапирования . [28] Быстрая деградация мРНК с помощью элементов, богатых AU, является критическим механизмом для предотвращения перепроизводства мощных цитокинов, таких как фактор некроза опухоли (TNF) и фактор, стимулирующий колонии гранулоцитов-макрофагов (GM-CSF). [29] Элементы, богатые AU, также регулируют биосинтез протоонкогенных факторов транскрипции, таких как c-Jun и c-Fos . [30]
Нонсенс-опосредованный распад
Эукариотические сообщения подлежат наблюдению с помощью бессмысленного распада (NMD), который проверяет наличие преждевременных стоп-кодонов (бессмысленных кодонов) в сообщении. Они могут возникать из-за неполного сплайсинга, рекомбинации V (D) J в адаптивной иммунной системе , мутаций в ДНК, ошибок транскрипции, негерметичного сканирования рибосомой, вызывающего сдвиг рамки , и других причин. Обнаружение преждевременного стоп-кодона запускает деградацию мРНК за счет 5 'декапирования, удаления 3' поли (A) хвоста или эндонуклеолитического расщепления . [31]
Малая интерферирующая РНК (миРНК)
В многоклеточных , малые интерферирующие РНК (киРНК) , обработанные Dicer включены в комплекс , известный как РНК-индуцированного глушителей комплекс или RISC - . Этот комплекс содержит эндонуклеазу, которая расщепляет идеально комплементарные сообщения, с которыми связывается миРНК. Затем полученные фрагменты мРНК разрушаются экзонуклеазами . siRNA обычно используется в лабораториях для блокирования функции генов в культуре клеток. Считается, что он является частью врожденной иммунной системы как защита от вирусов с двухцепочечной РНК. [32]
МикроРНК (миРНК)
МикроРНК (миРНК) представляют собой небольшие РНК, которые обычно частично комплементарны последовательностям информационных РНК многоклеточных животных. [33] Связывание miRNA с сообщением может подавлять трансляцию этого сообщения и ускорять удаление поли (A) хвоста, тем самым ускоряя деградацию мРНК. Механизм действия миРНК является предметом активных исследований. [34]
Другие механизмы распада
Есть и другие способы, с помощью которых сообщения могут быть разрушены, в том числе безостановочный распад и молчание с помощью Piwi-взаимодействующей РНК (piRNA), среди прочего.
Приложения
Вакцины на основе мРНК были доставлены сотням миллионов людей с момента их первоначального утверждения в декабре 2020 года.
Полноразмерные молекулы мРНК предлагались в качестве терапевтических средств с начала эры биотехнологий . Эта область стала активной в 2012 году, когда Moderna Therapeutics привлекла почти миллиард долларов венчурного финансирования за первые три года. [35] [36] [37] [38]
Теоретически введение последовательности матричной РНК, модифицированной нуклеозидами, может заставить клетку производить белок, который, в свою очередь, может непосредственно лечить болезнь или действовать как вакцина ; более косвенно белок может управлять эндогенными стволовыми клетками, чтобы дифференцироваться желаемым образом. [39] [40]
Основные задачи РНК-терапии заключаются в доставке РНК в соответствующие клетки. [36] Проблемы включают тот факт, что последовательности голой РНК естественным образом разрушаются после приготовления; они могут заставить иммунную систему организма атаковать их как захватчиков; и они непроницаемы для клеточной мембраны . [40] Оказавшись внутри клетки, они должны покинуть транспортный механизм клетки, чтобы начать действовать в цитоплазме , в которой находятся необходимые рибосомы . [39]
Терапия на основе мРНК изучается как метод лечения или терапии рака, аутоиммунных заболеваний, метаболических заболеваний и респираторных воспалительных заболеваний. Терапевтические методы редактирования генов, такие как CRISPR, также могут быть полезны при использовании мРНК для побуждения клеток к выработке желаемого белка Cas . [41]
Смотрите также
- GeneCalling , технология профилирования мРНК
- Миссенс мРНК
- отображение мРНК
- надзор за мРНК
- Транскриптом , сумма всех РНК в клетке
Рекомендации
- ↑ Кобб, Мэтью (29 июня 2015 г.). "Кто открыл информационную РНК?" . Текущая биология . 25 (13): R526 – R532. DOI : 10.1016 / j.cub.2015.05.032 . PMID 26126273 .
- ^ Уотсон, Джеймс Д. (22 февраля 2013 г.). Молекулярная биология гена, 7-е издание . Pearson Higher Ed USA. ISBN 9780321851499.
- ^ Choi et al. РНК. 2012. 18: 394–401.
- ^ Куарежма А.Дж., Сиверт Р., Никерсон Дж. А. (апрель 2013 г.). «Регулирование экспорта мРНК с помощью пути передачи сигнала киназы PI3 / AKT» . Молекулярная биология клетки . 24 (8): 1208–1221. DOI : 10,1091 / mbc.E12-06-0450 . PMC 3623641 . PMID 23427269 .
- ^ Kierzkowski D, Kmieciak M, Piontek P, Wojtaszek P, Szweykowska-Kulinska Z, Jarmolowski A (сентябрь 2009 г.). «CBP20 Arabidopsis нацелен на связывающий кепку комплекс с ядром и стабилизируется CBP80» . Заводской журнал . 59 (5): 814–825. DOI : 10.1111 / j.1365-313X.2009.03915.x . PMID 19453442 .
- ^ Стрэссер К., Масуда С., Мейсон П., Пфаннштиль Дж., Оппицци М., Родригес-Наварро С., Рондон А.Г., Агилера А., Штруль К., Рид Р., Hurt E (май 2002 г.). «TREX - это консервативный комплекс, связывающий транскрипцию с экспортом информационной РНК». Природа . 417 (6886): 304–308. Bibcode : 2002Natur.417..304S . DOI : 10.1038 / nature746 . PMID 11979277 . S2CID 1112194 .
- ^ Катахира Дж., Йонеда Й. (27 октября 2014 г.). «Роли комплекса TREX в ядерном экспорте мРНК» . Биология РНК . 6 (2): 149–152. DOI : 10,4161 / rna.6.2.8046 . PMID 19229134 .
- ^ Ченик С., Чуа Х.Н., Чжан Х., Тарнавски С.П., Акеф А., Дерти А., Тасан М., Мур М.Дж., Палаццо А.Ф., Рот ФП (апрель 2011 г.). «Геномный анализ показывает взаимодействие между интронами 5'UTR и ядерным экспортом мРНК для секреторных и митохондриальных генов» . PLOS Genetics . 7 (4): e1001366. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001366 . PMC 3077370 . PMID 21533221 .
- ^ Стюард О., Леви В. Б. (март 1982 г.). «Преимущественная локализация полирибосом под основанием дендритных шипов в гранулярных клетках зубчатой извилины» . Журнал неврологии . 2 (3): 284–291. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.02-03-00284.1982 . PMC 6564334 . PMID 7062109 .
- ^ Стюард О., Уорли П.Ф. (апрель 2001 г.). «Избирательное нацеливание вновь синтезированной мРНК Arc на активные синапсы требует активации рецептора NMDA». Нейрон . 30 (1): 227–240. DOI : 10.1016 / s0896-6273 (01) 00275-6 . PMID 11343657 . S2CID 13395819 .
- ^ Работа C, Eberwine J (декабрь 2001 г.). «Локализация и трансляция мРНК в дендритах и аксонах». Обзоры природы. Неврология . 2 (12): 889–898. DOI : 10.1038 / 35104069 . PMID 11733796 . S2CID 5275219 .
- ^ Hüttelmaier, S .; Zenklusen, D .; Ледерер, М .; Dictenberg, J .; Lorenz, M .; Meng, X .; Bassell, GJ; Condeelis, J .; Певица, RH (2005). «Пространственная регуляция жирной трансляции β-актина посредством Src-зависимого фосфорилирования ZBP1». Природа . 438 (7067): 512–515. DOI : 10,1038 / природа04115 . PMID 16306994 . S2CID 2453397 .
- ^ Эйнгер К., Авосса Д., Диана А.С., Барри С., Барбарезе Е., Карсон Дж. Х. (сентябрь 1997 г.). «Транспорт и элементы локализации в мРНК основного белка миелина» . Журнал клеточной биологии . 138 (5): 1077–1087. DOI : 10,1083 / jcb.138.5.1077 . PMC 2136761 . PMID 9281585 .
- ^ Lin CY, Beattie A, Baradaran B, Dray E, Duijf PH (сентябрь 2018 г.). «Противоречивая мРНК и неправильная экспрессия белка EEF1A1 в протоковой карциноме молочной железы из-за регуляции клеточного цикла и клеточного стресса» . Научные отчеты . 8 (1): 13904. Bibcode : 2018NatSR ... 813904L . DOI : 10.1038 / s41598-018-32272-х . PMC 6141510 . PMID 30224719 .
- ^ Шабалина С.А., Огурцов А.Ю., Спиридонов Н.А. (2006). «Периодический паттерн вторичной структуры мРНК, созданный генетическим кодом» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (8): 2428–2437. DOI : 10.1093 / NAR / gkl287 . PMC 1458515 . PMID 16682450 .
- ^ Katz L, Burge CB (сентябрь 2003 г.). «Широко распространенный отбор по локальной вторичной структуре РНК в кодирующих областях бактериальных генов» . Геномные исследования . 13 (9): 2042–2051. DOI : 10.1101 / gr.1257503 . PMC 403678 . PMID 12952875 .
- ^ Лу Ю.Ф., Маугер Д.М., Гольдштейн Д.Б., Городской Т.Дж., Недели КМ, Брэдрик С.С. (ноябрь 2015 г.). «Структура мРНК IFNL3 реконструирована функциональным некодирующим полиморфизмом, связанным с клиренсом вируса гепатита С» . Научные отчеты . 5 : 16037. Bibcode : 2015NatSR ... 516037L . DOI : 10.1038 / srep16037 . PMC 4631997 . PMID 26531896 .
- ^ а б Козак М. (март 1983 г.). «Сравнение инициирования синтеза белка в прокариотах, эукариотах и органеллах» . Микробиологические обзоры . 47 (1): 1–45. DOI : 10.1128 / MMBR.47.1.1-45.1983 . PMC 281560 . PMID 6343825 .
- ^ Нирс С., Поллет Н. (декабрь 1999 г.). «Группы синэкспрессии у эукариот». Природа . 402 (6761): 483–487. Bibcode : 1999Natur.402..483N . DOI : 10.1038 / 990025 . PMID 10591207 . S2CID 4349134 .
- ^ Мерсер Т.Р., Неф С., Динджер М.Э., Кроуфорд Дж., Смит М.А., Ширвуд А.М., Хауген Э., Бракен С.П. , Рэкхэм О., Стаматояннопулос Дж. А. , Филиповска А., Маттик Дж. С. (август 2011 г.). «Митохондриальный транскриптом человека» . Cell . 146 (4): 645–658. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.06.051 . PMC 3160626 . PMID 21854988 .
- ^ Wells SE, Hillner PE, Vale RD, Sachs AB (июль 1998 г.). «Циркуляризация мРНК эукариотическими факторами инициации трансляции». Молекулярная клетка . 2 (1): 135–140. CiteSeerX 10.1.1.320.5704 . DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80122-7 . PMID 9702200 .
- ^ Лопес-Ластра М., Ривас А., Баррия М.И. (2005). «Синтез белка в эукариотах: растущая биологическая значимость кэп-независимой инициации трансляции» . Биологические исследования . 38 (2–3): 121–146. DOI : 10.4067 / S0716-97602005000200003 . PMID 16238092 .
- ^ Левин, Бенджамин ; Krebs, Jocelyn E .; Килпатрик, Стивен Т .; Гольдштейн, Эллиотт С., ред. (2011). Гены Левина X (10-е изд.). Садбери, Массачусетс: Джонс и Бартлетт. ISBN 9780763766320. OCLC 456641931 .
- ^ Ю. Дж., Рассел Дж. Э. (сентябрь 2001 г.). «Структурный и функциональный анализ комплекса мРНП, который обеспечивает высокую стабильность мРНК человеческого бета-глобина» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (17): 5879–5888. DOI : 10.1128 / mcb.21.17.5879-5888.2001 . PMC 87307 . PMID 11486027 .
- ^ Деана А., Селесник Х, Беласко Дж. Г. (январь 2008 г.). «Бактериальный фермент RppH запускает деградацию информационной РНК путем удаления 5'-пирофосфата». Природа . 451 (7176): 355–358. Bibcode : 2008Natur.451..355D . DOI : 10,1038 / природа06475 . PMID 18202662 . S2CID 4321451 .
- ^ Паркер Р., Шет У. (март 2007 г.). «P-тельца и контроль трансляции и деградации мРНК». Молекулярная клетка . 25 (5): 635–646. DOI : 10.1016 / j.molcel.2007.02.011 . PMID 17349952 .
- ^ Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (ноябрь 2001 г.). «AU-связывающие белки рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Cell . 107 (4): 451–464. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5 . PMID 11719186 . S2CID 14817671 .
- ^ Fenger-Grøn M, Fillman C, Norrild B, Lykke-Andersen J (декабрь 2005 г.). «Множественные процессинговые факторы организма и ARE-связывающий белок TTP активируют декапирование мРНК» (PDF) . Молекулярная клетка . 20 (6): 905–915. DOI : 10.1016 / j.molcel.2005.10.031 . PMID 16364915 . Архивировано из оригинального (PDF) 06.06.2011.
- ^ Шоу Г., Камен Р. (август 1986 г.). «Консервативная последовательность AU из 3'-нетранслируемой области мРНК GM-CSF опосредует селективную деградацию мРНК». Cell . 46 (5): 659–667. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (86) 90341-7 . PMID 3488815 . S2CID 40332253 .
- ^ Chen CY, Shyu AB (ноябрь 1995 г.). «AU-богатые элементы: характеристика и важность в деградации мРНК». Направления биохимических наук . 20 (11): 465–470. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (00) 89102-1 . PMID 8578590 .
- ^ Искен О., Макват Л.Е. (август 2007 г.). «Контроль качества мРНК эукариот: защита клеток от аномальной функции мРНК» . Гены и развитие . 21 (15): 1833–1856. DOI : 10,1101 / gad.1566807 . PMID 17671086 .
- ^ Obbard DJ, Гордон К. Х., Бак А. Х., Джиггинс FM (январь 2009 г.). «Эволюция РНКи как защиты от вирусов и мобильных элементов» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия B, Биологические науки . 364 (1513): 99–115. DOI : 10.1098 / rstb.2008.0168 . PMC 2592633 . PMID 18926973 .
- ^ Бреннеке Дж., Старк А., Рассел Р. Б., Коэн С. М. (март 2005 г.). «Принципы распознавания микроРНК-мишеней» . PLOS Биология . 3 (3): e85. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0030085 . PMC 1043860 . PMID 15723116 .
- ^ Eulalio A, Huntzinger E, Nishihara T, Rehwinkel J, Fauser M, Izaurralde E (январь 2009 г.). «Деаденилирование - широко распространенный эффект регуляции miRNA» . РНК . 15 (1): 21–32. DOI : 10,1261 / rna.1399509 . PMC 2612776 . PMID 19029310 .
- ^ Грегори Хуанг (6 декабря 2012 г.). «Moderna, буксировка на 40 миллионов долларов, надеется заново изобрести биотехнологию с помощью« Сделай свой собственный препарат » » . Xconomy.
- ^ а б Качмарек Й.К., Ковальски П.С., Андерсон Д.Г. (июнь 2017 г.). «Достижения в области доставки РНК-терапии: от концепции к клинической реальности» . Геномная медицина . 9 (1): 60. DOI : 10,1186 / s13073-017-0450-0 . PMC 5485616 . PMID 28655327 .
- ^ Crow D (7 сентября 2017 г.). «Обещание Moderna заставляет инвесторов биться чаще; Biotech Group обещает переписать правила разработки лекарств - хотя скептики говорят, что оценка в $ 5 млрд незаслуженная» . Financial Times .
- ^ Адамс Б. (14 сентября 2017 г.). «Moderna меняет модель исследований и разработок, публикует сообщения о раке, обновляет результаты исследований CV» . FierceBiotech .
- ^ а б Хадж К.А., Уайтхед К.А. (12 сентября 2017 г.). «Инструменты для перевода: невирусные материалы для терапевтической доставки мРНК» . Материалы обзора природы . 2 (10): 17056. Bibcode : 2017NatRM ... 217056H . DOI : 10.1038 / natrevmats.2017.56 .
- ^ а б Гуссейнов Э., Козлов М., Сканлан Ц. (15 сентября 2015 г.). «Терапия и вакцины на основе РНК» . Новости генной инженерии .
- ^ Хариди, Рич (2021-04-23). «Революция мРНК: как COVID-19 быстро продвинулся вперед в экспериментальной технологии» . Новый Атлас . Проверено 26 апреля 2021 .
дальнейшее чтение
- Alsaweed M, Lai CT, Hartmann PE, Geddes DT, Kakulas F (февраль 2016 г.). «МикроРНК грудного молока в основном происходят из молочной железы, что приводит к уникальным профилям миРНК фракционированного молока» . Научные отчеты . 6 (1): 20680. Bibcode : 2016NatSR ... 620680A . DOI : 10.1038 / srep20680 . PMC 4745068 . PMID 26854194 .
- Lillycrop KA, Burdge GC (октябрь 2012 г.). «Эпигенетические механизмы, связывающие раннее питание с долгосрочным здоровьем». Лучшие практики и исследования. Клиническая эндокринология и метаболизм . 26 (5): 667–676. DOI : 10.1016 / j.beem.2012.03.009 . PMID 22980048 .
- Мельник BC, Какулас Ф., Геддес Д.Т., Хартманн П.Е., Джон С.М., Каррера-Бастос П., Кордаин Л., Шмитц Г. (21 июня 2016 г.). «МикроРНК молока: простые питательные вещества или системные функциональные регуляторы?» . Питание и обмен веществ . 13 (1): 42. DOI : 10,1186 / s12986-016-0101-2 . PMC 4915038 . PMID 27330539 .
- Vickers MH (июнь 2014 г.). «Питание в раннем возрасте, эпигенетика и программирование болезней более позднего возраста» . Питательные вещества . 6 (6): 2165–2178. DOI : 10.3390 / nu6062165 . PMC 4073141 . PMID 24892374 .
- Чжоу Ц., Ли М, Ван X, Ли Ц., Ван Т, Чжу Ц., Чжоу X, Ван X, Гао X, Ли X (2012). «Связанные с иммунитетом микроРНК в изобилии присутствуют в экзосомах грудного молока» . Международный журнал биологических наук . 8 (1): 118–123. DOI : 10.7150 / ijbs.8.118 . PMC 3248653 . PMID 22211110 .
Внешние ссылки
- Жизнь мРНК Flash анимация
- Атлас РНКи : база данных библиотек РНКи и результатов их целевого анализа
- miRSearch : инструмент для поиска микроРНК, нацеленных на мРНК
- Как кодируется мРНК? : YouTube видео