 | Эта статья требует дополнительных ссылок для проверки . ( ноябрь 2007 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
| Грипп (грипп) |
|---|
 |
Проект секвенирования генома гриппа (IGSP), начатый в начале 2004 г., направлен на изучение эволюции гриппа путем предоставления общедоступного набора данных полных последовательностей генома гриппа из коллекций изолятов, представляющих различные распределения видов.
Проект финансируется Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), подразделением Национальных институтов здравоохранения (NIH), и осуществляется на базе Центра микробного секвенирования NIAID при Институте геномных исследований (TIGR). в 2006 году стал Институтом Вентера). Информация о последовательностях, созданная в рамках проекта, постоянно размещалась в открытом доступе через GenBank .
Истоки [ править ]
В конце 2003 года Дэвид Липман , Лоне Симонсен , Стивен Зальцберг и консорциум других ученых написали предложение о начале секвенирования большого количества вирусов гриппа в Институте геномных исследований (TIGR). До этого проекта в открытом доступе была лишь небольшая часть геномов гриппа. [ необходима цитата ] Их предложение было одобрено Национальными институтами здравоохранения (NIH), а позже стало IGSP. Позднее в том же году в TIGR началась разработка новых технологий под руководством Элоди Гедин, а первая публикация, описывающая> 100 геномов гриппа, появилась в 2005 году в журнале Nature [1]
Цели исследования [ править ]
Проект делает все данные о последовательностях общедоступными через GenBank , международную базу данных с возможностью поиска, финансируемую Национальным институтом здравоохранения. Это исследование помогает международным исследователям получить информацию, необходимую для разработки новых вакцин , методов лечения и диагностики, а также улучшить понимание общей молекулярной эволюции гриппа и других генетических факторов, определяющих их вирулентность. [ необходима цитата ] Такие знания могли бы не только помочь смягчить воздействие ежегодных эпидемий гриппа , но также могли бы улучшить научные знания о появлении пандемических вирусов гриппа .
Результаты [ править ]
Первые геномы проекта были завершены в марте 2005 года, и с тех пор он быстро ускорился. К середине 2008 г. было полностью секвенировано более 3000 изолятов вирусов гриппа, эндемичных для популяций людей («человеческий грипп»), птиц («птичий грипп») и свиней («свиной грипп»), включая многие штаммы H3N2 (человеческий грипп). ), H1N1 (человек) и H5N1 (птичий). [1]
Принадлежности [ править ]
Проект финансируется Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), который является составной частью NIH, который является агентством Министерства здравоохранения и социальных служб США .
IGSP расширился, и теперь в него входит постоянно растущий список сотрудников, которые внесли свой вклад как опыт, так и ценные коллекции изолятов гриппа. Ключевыми первыми участниками были Питер Палезе из Медицинской школы Маунт-Синай в Нью-Йорке, Джилл Тейлор из Центра Уодсворт при Департаменте здравоохранения штата Нью-Йорк , Лэнс Дженнингс из Кентерберийских лабораторий здравоохранения (Новая Зеландия), Джефф Таубенбергер из Института вооруженных сил. патологии (который позже переехал в NIH), Ричард Слемонс из государственного университета Огайо и Роб Вебстер из детской больницы Св. Джуда в Мемфисе, штат Теннесси.
В 2006 году к проекту присоединилась Илария Капуа из Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (Италия), которая предоставила ценную коллекцию изолятов птичьего гриппа (включая несколько штаммов H5N1 ). Некоторые из этих птичьих изолятов были описаны в публикации в Emerging Infectious Diseases в 2007 году. [2] Нэнси Кокс из Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) и Роберт Коуч из Медицинского колледжа Бэйлора также присоединились к проекту в 2006 году, внося свой вклад в 150 изолятов гриппа B.
Проект начал перспективные исследования сезона гриппа 2007 с сотрудниками Florence Bourgeois и Кеннет Мандл из детской больницы Бостона и Гарвардской школы общественного здравоохранения и Лорел Edelman из Surveillance Data Inc. [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Ghedin E, Sengamalay NA, Shumway M, Zaborsky J, Feldblyum T, Subbu V, Spiro DJ, Sitz J, Koo H, Bolotov P, Dernovoy D, Tatusova T, Bao Y, St George K, Taylor J, Lipman DJ, Fraser CM, Taubenberger JK, Salzberg SL (октябрь 2005 г.). «Крупномасштабное секвенирование гриппа человека раскрывает динамический характер эволюции вирусного генома» . Природа . 437 (7062): 1162–6. Bibcode : 2005Natur.437.1162G . DOI : 10,1038 / природа04239 . PMID 16208317 . [ Вирусов гриппа больше, чем ожидалось, мутации неожиданным образом Сводка] Проверить
|lay-url=значение ( справка) .(как PDF - ^ Зальцберг С.Л., Кингсфорд С., Каттоли Г. и др. (Май 2007 г.). «Геномный анализ, связывающий недавние вирусы европейского и африканского гриппа (H5N1)» . Возникающая инфекция. Дис . 13 (5): 713–8. DOI : 10.3201 / eid1305.070013 . PMC 2432181 . PMID 17553249 .
Внешние ссылки [ править ]
- Домашняя страница проекта по секвенированию гриппа в ТИГР
- Домашняя страница проекта секвенирования генома гриппа в NIAID
- Ресурсы по вирусам гриппа в NCBI (NIH)
- Fauci AS (январь 2006 г.). «Угроза пандемического гриппа и готовность» . Возникающая инфекция. Дис . 12 (1): 73–7. DOI : 10.3201 / eid1201.050983 . PMC 3291399 . PMID 16494721 .
- База данных исследований гриппа База данных последовательностей гриппа и сопутствующей информации.
