Это список модельных организмов, используемых в научных исследованиях.
Вирусы
- Фаг лямбда
- Phi X 174 - его геном был впервые секвенирован. Геном представляет собой круг из 11 генов длиной 5386 пар оснований .
- SV40
- Фаг Т4
- Вирус табачной мозаики
- Вирус простого герпеса
Прокариоты
- Escherichia coli ( E. coli ) - обычная грамотрицательная кишечная бактерия, широко используемая в молекулярной генетике .
- Сенная палочка - эндоспоры формирования грам-положительных бактерий.
- Caulobacter crescentus - бактерия, которая делится на две отдельные клетки, используемые для изучения клеточной дифференциации .
- Mycoplasma genitalium - минимальный организм.
- Aliivibrio fischeri - определение кворума , биолюминесценция и симбиоз животных и бактерийс гавайскими кальмарами бобтейлов .
- Bacteroides thetaiotaomicron - разлагающий полисахариды член кишечной микробиоты человека, используемый для изучения функциональных аспектов кишечной микробиоты. [1]
- Synechocystis , фотосинтетическая цианобактерия, широко используемая висследованиях фотосинтеза .
- Pseudomonas fluorescens - почвенная бактерия, которая в лаборатории легко превращается в разные штаммы.
- Azotobacter vinelandii , облигатный аэробный диазотроф, используемый висследованиях азотфиксации .
- Streptomyces coelicolor , нитчатая бактерия, обитающая в почве, используется для производства многих клинически полезных антибиотиков . [2]
Эукариоты
Протисты
- Chlamydomonas reinhardtii - одноклеточная зеленая водоросль, используемая для изучения фотосинтеза , жгутиков и подвижности , регуляции метаболизма , межклеточного распознавания и адгезии , реакции на недостаток питательных веществ и многих других вопросов. Chlamydomonas reinhardtii имеет хорошо изученную генетику со многими известными и картированными мутантами и экспрессируемыми тегами последовательностей, а также существуют передовые методы генетической трансформации и отбора генов. [3] О секвенированиигенома Chlamydomonas reinhardtii сообщалось в октябре 2007 года. [4] В Университете Дьюка существует центр генетического фонда Chlamydomonas , а международнаягруппа исследователей хламидомонады проводит регулярные встречи для обсуждения результатов исследований. Хламидомонады легко выращивать на недорогой определенной среде .
- Stentor coeruleus используется в молекулярной биологии (его геном секвенирован) [5] и изучается как модель регенерации единичных клеток.
- Dictyostelium discoideum используется в молекулярной биологии и генетике (его геном секвенирован) и изучается как пример клеточной коммуникации , дифференциации и запрограммированной гибели клеток .
- Tetrahymena thermophila - свободный живые пресноводные реснитчатые простейшие .
- Emiliania huxleyi - одноклеточная морская кокколитофоральная водоросль, широко изучаемая как модельныйвид фитопланктона .
- Thalassiosira pseudonana - одноклеточная морская диатомовая водоросль, широко изучаемая как модельная морская диатомовая водоросль с момента публикации ее генома в 2004 году.
- Naegleria gruberi - пресноводная непатогенная амебофлагеллята, иногда используемая в экспериментах по биологии эукариотических клеток.
Грибы
- Ashbya gossypii , патоген хлопка, предмет генетических исследований (полярность, клеточный цикл)
- Aspergillus nidulans , плесень - объект генетических исследований
- Coprinus cinereus , гриб (генетические исследования развития грибов, генетические исследования мейоза ) [6]
- Cryptococcus neoformans , условно-патогенный микроорганизм человека
- Neurospora crassa - плесень апельсинового хлеба(генетические исследования мейоза , регуляции метаболизма и циркадного ритма ) [7]
- Saccharomyces cerevisiae , пекарские дрожжи или почкующиеся дрожжи (используются в пивоварении и выпечке)
- Schizophyllum commune - модель грибовидного образования. [8]
- Schizosaccharomyces pombe , делящиеся дрожжи (клеточный цикл, полярность клеток, РНКи, структура и функция центромеры, транскрипция)
- Ustilago maydis , диморфные дрожжи и растительный патоген кукурузы (диморфизм, растительный патоген, транскрипция)
Растения
- Arabidopsis thaliana , в настоящее время самое популярное модельное растение. Это травянистое двудольное растениесемейства Brassicaceae тесно связано с горчичным растением . Его небольшой рост и короткое время генерации облегчают быстрые генетические исследования [9], и многие фенотипические и биохимические мутанты были картированы. [9] Арабидопсис был первым растением, геном которого был секвенирован . [9] Его геномная последовательность, наряду с широким спектром информации, касающейся Arabidopsis , поддерживается базой данных TAIR . [9]
( физиология растений , биология развития , молекулярная генетика , популяционная генетика , цитология , молекулярная биология ) - Род Boechera сочетает в себе экспериментальную податливость и генетические инструменты, разработанные для его близкого родственника Arabidopsis, с в значительной степени нетронутой естественной историей, что делает его многообещающей модельной системой для исследований на стыке генетики, геномики, экологии и эволюции. Род включает виды с редким признаком апомиксиса на диплоидном уровне. [10]
( Эволюционная экология , Популяционная генетика , Молекулярная экология , Эволюционная биология , Экологическая генетика ) - Selaginella moellendorffii - это остаток древней линии сосудистых растений, которая является ключом к пониманию эволюции наземных растений. У него небольшой размер генома (~ 110 МБ), и его последовательность была опубликована Объединенным институтом генома в начале 2008 года ( эволюционная биология , молекулярная биология ).
- Brachypodium distachyon - это новая экспериментальная модельная трава, обладающая многими характеристиками, которые делают ее отличной моделью для злаков умеренного климата. ( Агрономия , Молекулярная биология , Генетика )
- Setaria viridis - это новая модельная трава для фотосинтеза C4 и родственных биоэнергетических трав. [11] [12]
- Lotus japonicus - модельное бобовое растение, используемое для изучения симбиоза, отвечающего за фиксацию азота . ( Агрономия , Молекулярная биология )
- Lemna gibba - это быстрорастущее водное однодольное растение , одно из самых маленьких цветковых растений. Анализы роста Lemna используются для оценки токсичности химических веществ для растений в экотоксикологии . Поскольку его можно выращивать в чистой культуре , можно исключить микробное действие. Lemna используется в качестве рекомбинантной системы экспрессии для экономичного производства сложных биофармацевтических препаратов . Он также используется в образовании для демонстрации кривых роста населения .
- Кукуруза ( Zea mays L.) - зерно злаковых. Это диплоидное однодольное растение с 10 большими парами хромосом, легко изучаемое под микроскопом. Его генетические особенности, включая множество известных и картированных фенотипических мутантов и большое количество потомков от одного скрещивания (обычно 100-200), облегчили открытие транспозонов («прыгающих генов»). Было нанесено на карту множество ДНК-маркеров и секвенирован геном. ( Генетика , молекулярная биология , агрономия )
- Medicago truncatula - это модельное растение бобовых, близкое к люцерне обыкновенной. Его довольно небольшой геном в настоящее время секвенируется. Он используется для изучения симбиоза, ответственного за азотфиксацию. ( Агрономия , Молекулярная биология )
- Mimulus guttatus - модельный организм, используемый в исследованиях эволюционного и функционального генома. Род Mimulus содержит c. 120 видов и относится к семейству Phrymaceae . Несколько генетических ресурсов были разработаны для изучения этого рода, и некоторые из них находятся в свободном доступе ( http://www.mimulusevolution.org )
- Nicotiana benthamiana часто считается модельным организмом для изучения патогенов растений. [13]
- Табак BY-2 клетка представляет собой суспензию клеточной линии от табака ( Nicotiana аЬасит )который является полезным для изучения физиологии растений вообще на клеточной уровне. Вближайшем будущемгеном этого сорта не будет секвенирован, но секвенирование его дикого вида Nicotiana tabacum в настоящее время продолжается. ( Цитология , физиология растений , биотехнология )
- Рис ( Oryza sativa ) используется в качестве модели для биологии злаков . У него один из самых маленьких геномов среди всех видов злаков, и секвенирование его генома завершено. [14] ( Агрономия , Молекулярная биология )
- Physcomitrella patens - это мох, который все чаще используют для изучения развития и молекулярной эволюции растений. [15] Это пока единственное несосудистое растение (и, следовательно, единственное « примитивное » растение), геном которого полностью секвенирован. [15] Более того, в настоящее время это единственное наземное растение с эффективным нацеливанием на гены, которое делает возможным нокаут генов . [16] Полученные в результате нокаутные мхи хранятся и распространяются Международным центром запаса мха . ( Физиология растений , Эволюционная биология , Молекулярная генетика , Молекулярная биология )
- Marchantia polymorpha - это печеночник, который также становится моделью для биологии и развития растений.
- Populus - это род, используемый в качестве модели в лесной генетике и исследованиях древесных растений. Он имеет небольшой размер генома, очень быстро растет и легко трансформируется. Последовательность генома тополя черного ( Populus trichocarpa ) общедоступна. [17]
- См. Также Chlamydomonas reinhardtii выше в разделе «Протисты».
Животные
Беспозвоночные
- Amphimedon queenslandica , демоспонж из филума Porifera, используемый в качестве модели для эволюционной биологии развития и сравнительной геномики [18]
- Arbacia punctulata , морской еж с пурпурными шипами, классический объект эмбриологических исследований.
- Аплизия , морской слизень, реакция выделения чернил которого служит моделью в нейробиологии, а конусы роста служат модельюперестройки цитоскелета.
- Branchiostoma floridae , вид, широко известный как amphioxus или lancelet из подтипа Cephalochordata типа Chordata, используемый в качестве модели для понимания эволюции нехордовых дейтеростомов, хордовых беспозвоночных и позвоночных [19]
- Caenorhabditis elegans , нематода , обычно называемая C. elegans [20], - отличная модель для понимания генетического контроля развития и физиологии. C.elegans имеет фиксированное количество 1031 ячейку. C. elegans был первым многоклеточным организмом, геном которого был полностью секвенирован.
- Caledia captiva (Orthoptera) в восточной Австралии, использовалась для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Callosobruchus maculatus , шаровидный жук, используемый для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Chorthippus parallelus , луговый кузнечик, используемый для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Циона кишечника , морской брызг
- Daphnia spp. , мелкие планктонные ракообразные , очень чувствительные к загрязнению, используемые для оценки экологической токсичности химических веществ для водных беспозвоночных. [21]
- Coelopidae - морские водоросли, используемые для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Diopsidae - черноглазые мухи, используемые для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Дрозофила , обычно вид Drosophila melanogaster - разновидность плодовой мухи , известной как объект генетических экспериментов Томаса Ханта Моргана и других. Легко выращивается в лаборатории, быстрое поколение, легко индуцируемые мутации, множество наблюдаемых мутаций. В последнее время дрозофила используется для нейрофармакологических исследований. [22] ( Молекулярная генетика , Популяционная генетика , Биология развития ) .
- Сколопы Euprymna , кальмар гавайский бобтейл, модель животного-бактериального симбиоза , биолюминесцентные вибрионы
- Galleria mellonella (большая восковая моль), личинки которой являются отличным модельным организмом для токсикологии in vivo и тестирования патогенности, заменяя использование мелких млекопитающих в таких экспериментах.
- Gryllus bimaculatus , полевой сверчок, используемый для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Гидра , книдариец , является модельным организмом, который понимает процессы регенерации и морфогенеза , а также эволюцию двуногих строений тела [23]
- Loligo pealei , кальмар, объект исследования нервной функции из-за его гигантского аксона (диаметром около 1 мм, примерно в тысячу раз больше, чем типичные аксоны млекопитающих).
- Lymnaea stagnalis (большая прудовая улитка), широко используемый модельный моллюск, для изучения биоминерализации, нейробиологии, экотоксикологии, полового отбора и асимметрии тела [24]
- Macrostomum lignano , свободноживущий морской плоский червь, модельный организм для изучения стволовых клеток, регенерации, старения, функции генов и эволюции пола. Легко выращивается в лаборатории, короткое время генерации, неопределенный рост, сложное поведение [25]
- Mnemiopsis leidyi из филума Ctenophora (гребешок), используемого в качестве модели для эволюционной биологии развития и сравнительной геномики [26] [27]
- Nematostella vectensis , морской анемон из филума Cnidaria, используемый в качестве модели для эволюционной биологии развития и сравнительной геномики [28] [29]
- Oikopleura двудомной , [30] appendicularian , свободно плавание оболочников (или urochordate)
- Ormia ochracea , тахинидная муха, используемая для изучения локализации звука. [31]
- Oscarella carmela -губка- гомосклероморф (тип Porifera ), используемая в качестве модели в эволюционной биологии развития [32]
- Parhyale hawaiensis - ракообразное-амфипод, используемое в исследованиях эволюционного развития ( evo-DevO ) с обширным набором инструментов для генетических манипуляций.
- Platynereis dumerilii - морская полихетчатая кольчатка, которая развивалась очень медленно и поэтому сохранила многие наследственные черты. [33]
- Podisma spp. в Альпах, где изучали половой отбор и сексуальные конфликты.
- Pristionchus pacificus , круглый червь, используемый в эволюционной биологии развития в сравнительном анализе с C. elegans
- Scathophaga stercoraria , желтая навозная муха, используемая для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Schmidtea mediterranea - пресноводная планария; модель для регенерации и развития таких тканей, как мозг и зародышевые линии
- Стоматогастральный ганглий различных видов членистоногих ; модель для генерации двигательного паттерна во всех повторяющихся движениях
- Strongylocentrotus purpuratus , пурпурный морской еж , широко используемый в биологии развития.
- Symsagittifera roscoffensis , плоский червь , объект исследования развития двуногого строения тела.
- Tribolium castaneum , мучной жук - маленький, легко удерживаемый чернотелок, особенно используемый вэкспериментахпо поведенческой экологии.
- Trichoplax adhaerens , очень простое свободноживущее животное из типа Placozoa, используемое в качестве модели в эволюционной биологии развития и сравнительной геномике [34]
- Tubifex tubifex , олигохета, используемая для оценки экологической токсичности химических веществ для водных и наземных червей. [35]
Позвоночные
- Аксолотль ( Ambystoma mexicanum ), используемый для изучения процессов регенерации и развития
- Bombina bombina и Bombina variegata , используемые для изучения полового отбора и сексуального конфликта.
- Каролина анол ( Anolis carolinensis ), используемый для изучения геномики рептилий
- Кошка ( Felis sylvestris catus ) - используется в нейрофизиологических исследованиях.
- Курица ( Gallus gallus domesticus ) - используется для исследований развития, поскольку является амниотом и отлично подходит для микроманипуляций (например, трансплантации тканей) и сверхэкспрессии генных продуктов.
- Хлопковая крыса ( Sigmodon hispidus ) - ранее использовалась в исследованиях полиомиелита.
- Собака ( Canis lupus familis ) - важная респираторная и сердечно-сосудистая модель, также внесшая свой вклад в открытие классической обусловленности .
- Золотой хомяк ( Mesocricetus auratus ) - впервые использовался для изучения кала-азара ( лейшманиоза ).
- Морская свинка ( Cavia porcellus ) - использовалась Робертом Кохом и другими ранними бактериологами в качестве хозяина для бактериальных инфекций, отсюда и синоним слова «лабораторное животное», хотя сегодня он используется реже.
- Маленькая коричневая летучая мышь ( Myotis lucifugus ) - использовалась для доказательства существования эхолокации у летучих мышей в 1930-х годах, а также использовалась в экспериментах по прогнозированию поведения микробов, поскольку это надежный вид, который имеет типичные черты видов летучих мышей умеренного пояса.
- Медака ( Oryzias latipes , или японская рисовая рыба) - важная модель в биологии развития и имеет то преимущество, что она намного прочнее традиционных рыбок данио.
- Мышь ( Mus musculus ) - классическая модель позвоночного животного. Существует множество инбредных линий, а также линий, отобранных по определенным признакам, часто представляющим этологический или медицинский интерес, например, размер тела, ожирение, мускулистость, произвольное поведение при движении колеса . [36] ( Количественная генетика , молекулярная эволюция , геномика )
- Голый землекоп ( Heterocephalus glaber ) исследовали на предмет их характерной нечувствительности к боли, терморегуляции, устойчивости к раку, эусоциальности и долголетия.
- Nothobranchius furzeri изучается из-за их чрезвычайно короткой продолжительности жизни в исследованиях старения, болезней и эволюции.
- Голубь ( Columba livia domestica ), широко изученный в области когнитивных наук и интеллекта животных.
- Poecilia reticulata , гуппи, использовалась для изучения полового отбора и сексуальных конфликтов.
- Крыса ( Rattus norvegicus ) - особенно полезна в качестве токсикологической модели; также особенно полезен в качестве неврологической модели и источника первичных культур клеток из-за большего размера органов и суборганелларных структур по сравнению с мышью. ( Молекулярная эволюция , Геномика )
- Макака-резус (или макака-резус) ( Macaca mulatta ) - используется для исследований по инфекционным заболеваниям и когнитивным функциям .
- Морская минога ( Petromyzon marinus ) - исследование спинного мозга
- Такифугу ( Takifugu rubripes , рыба-фугу ) - имеет небольшой геном с небольшим количеством мусорной ДНК .
- Трехиглая колюшка ( Gasterosteus aculeatus ), рыба, используемая для изучения этологии и поведенческой экологии.
- Xenopus tropicalis и Xenopus laevis (африканская когтистая лягушка) - яйца и эмбрионы этих лягушек используются в биологии развития, клеточной биологии, токсикологии и нейробиологии [37] [38]
- Зебровый зяблик ( Taeniopygia guttata ) - использовался при изучении системы песен певчих птиц и изучении слуховых систем не млекопитающих .
- Данио ( Danio rerio , пресноводная рыба) - имеет почти прозрачное тело на раннем этапе развития, что обеспечивает уникальный визуальный доступ к внутренней анатомии животного. Рыбки данио используются для изучения развития, токсикологии и токсикопатологии, [39] специфических функций генов и роли сигнальных путей.
Рекомендации
- ^ Дэниел Райан; Лаура Дженнишес; Сара Райхардт; Ларс Барквист; Александр Вестерманн (16 июля 2020 г.). «Карта транскриптома с высоким разрешением определяет регуляцию метаболизма малой РНК в кишечном микробе Bacteroides thetaiotaomicron» . Nature Communications . 11 . DOI : 10.1038 / s41467-020-17348-5 .
- ^ «Streptomyces coelicolor» . Центр Джона Иннеса . Проверено 13 апреля 2018 .
- ^ «Ресурсы Chlamydomonas reinhardtii в Объединенном институте генома» . Архивировано из оригинала на 2008-07-23 . Проверено 1 февраля 2015 .
- ↑ Секвенирование генома хламидомонады опубликовано в журнале Science, 12 октября 2007 г.
- ^ Макроядерный геном Stentor coeruleus обнаруживает крошечные интроны в гигантской клетке
- ^ Куэс У (июнь 2000 г.). «История жизни и процессы развития базидиомицета Coprinus cinereus» . Microbiol. Мол. Биол. Ред. 64 (2): 316–53. DOI : 10.1128 / MMBR.64.2.316-353.2000 . PMC 98996 . PMID 10839819 .
- ^ Дэвис, Роуленд Х. (2000). Neurospora: вклад модельного организма . Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-512236-7.
- ^ Ом, Р .; Де Йонг, Дж .; Lugones, L .; Aerts, A .; Kothe, E .; Stajich, J .; De Vries, R .; Запись, E .; Levasseur, A .; Baker, SE; Варфоломей, К.А.; Коутиньо, премьер-министр; Erdmann, S .; Фаулер, Т.Дж.; Гатман, AC; Lombard, V .; Henrissat, B .; Knabe, N .; Kües, U .; Лилли, WW; Lindquist, E .; Lucas, S .; Магнусон, Дж. К.; Пиуми, ФО; Раудаскоски, М .; Саламов, А .; Schmutz, J .; Шварце, FWMR; Ванкук, П.А.; Хортон, Дж.С. (2010). «Последовательность генома модельного гриба Schizophyllum commune» . Природа Биотехнологии . 28 (9): 957–963. DOI : 10.1038 / nbt.1643 . PMID 20622885 .
- ^ a b c d Об арабидопсисе на странице информационных ресурсов арабидопсиса ( TAIR )
- ^ Рашворт, C; и другие. (2011). « Boechera , модельная система для экологической геномики» . Молекулярная экология . 20 (23): 4843–57. DOI : 10.1111 / j.1365-294X.2011.05340.x . PMC 3222738 . PMID 22059452 .
- ^ Брутнелл, Т; и другие. (2010). «Setaria viridis: модель фотосинтеза C4» . Растительная клетка . 22 (8): 2537–44. DOI : 10.1105 / tpc.110.075309 . PMC 2947182 . PMID 20693355 .
- ^ Цзян, Хуэй; Барбье, Хьюг; Брутнелл, Томас (2013). «Методы скрещивания Setaria viridis , новая модельная система для трав» . Журнал визуализированных экспериментов (80): 50527. DOI : 10,3791 / 50527 . ISSN 1940-087X . PMC 3938206 . PMID 24121645 .
- ^ Гудин, Майкл; Дэвид Зейтлин; Раяпати Найду; Стивен Ломмел (август 2008 г.). «Nicotiana benthamiana: ее история и будущее как модель взаимодействия растений и патогенов» . Молекулярные взаимодействия растений и микробов . 21 (8): 1015–1026. DOI : 10.1094 / MPMI-21-8-1015 . PMID 18616398 .
- ^ Чжоу, S .; Bechner, MC; Место, М .; Churas, CP; Pape, L .; Леонг, SA; Runnheim, R .; Форрест, ДК; Goldstein, S .; Ливны, М .; Шварц, округ Колумбия (2007). «Подтверждение последовательности генома риса с помощью оптического картирования» . BMC Genomics . 8 : 278. DOI : 10.1186 / 1471-2164-8-278 . PMC 2048515 . PMID 17697381 .
- ^ а б Ренсинг С.А., Ланг Д., Циммер А.Д. и др. (Январь 2008 г.). «Геном Physcomitrella раскрывает эволюционное понимание завоевания земли растениями» . Наука . 319 (5859): 64–9. Bibcode : 2008Sci ... 319 ... 64R . DOI : 10.1126 / science.1150646 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0012-3787-A . PMID 18079367 .
- ^ Рески, Ральф (1998). «Физкомитрелла и арабидопсис: Давид и Голиаф обратной генетики». Тенденции в растениеводстве . 3 (6): 209–210. DOI : 10.1016 / S1360-1385 (98) 01257-6 .
- ^ " Populus trichocarpa (Тополь западный)" . Фитозом . Проверено 22 июля 2013 года .
- ^ Шривастава, М .; Симаков, О .; Chapman, J .; Fahey, B .; Готье, MEA; Mitros, T .; Ричардс, GS; Conaco, C .; Dacre, M .; Hellsten, U .; Larroux, C .; Патнэм, штат Нью-Хэмпшир; Станке, М .; Адамска, М .; Darling, A .; Дегнан, С.М. Окли, штат TH; Плачетки, округ Колумбия; Zhai, Y .; Адамски, М .; Calcino, A .; Cummins, SF; Гудштейн, DM; Harris, C .; Джексон, диджей; Лейс, ИП; Shu, S .; Вудкрофт, Би Джей; Vervoort, M .; Косик, К.С. (2010). « Геном Amphimedon queenslandica и эволюция сложности животных» . Природа . 466 (7307): 720–726. Bibcode : 2010Natur.466..720S . DOI : 10,1038 / природа09201 . PMC 3130542 . PMID 20686567 .
- ^ Голландия, LZ; Albalat, R .; Azumi, K .; Benito-Gutiérrez, E .; Удар, MJ; Bronner-Fraser, M .; Brunet, F .; Обухов, Т .; Candiani, S .; Дишоу, LJ; Ferrier, DEK; Garcia-Fernàndez, J .; Гибсон-Браун, Дж. Дж .; Gissi, C .; Годзик, А .; Hallböök, F .; Hirose, D .; Hosomichi, K .; Икута, Т .; Inoko, H .; Kasahara, M .; Kasamatsu, J .; Кавасима, Т .; Kimura, A .; Кобаяши, М .; Козьмик, З .; Кубокава, К .; Laudet, V .; Litman, GW; Макхарди, AC (2008). «Геном амфиоксуса проливает свет на происхождение позвоночных и биологию головнохордовых» . Геномные исследования . 18 (7): 1100–1111. DOI : 10.1101 / gr.073676.107 . PMC 2493399 . PMID 18562680 .
- ^ Загадка, Дональд Л. (1997). C. elegans II . Плейнвью, Нью-Йорк: Лаборатория издательства Колд-Спринг-Харбор. ISBN 978-0-87969-532-3.
- ^ Мюллер Х.Г. (1982). «Чувствительность Daphnia magna straus к восьми химиотерапевтическим агентам и двум красителям». Бык. Environ. Contam. Toxicol . 28 (1): 1-2. DOI : 10.1007 / BF01608403 . PMID 7066538 .
- ^ Манев Х., Димитриевич Н, Дзитоева С. (2003). «Методики: дрозофилы как модели для нейрофармакологических исследований». Trends Pharmacol. Sci . 24 (1): 41–3. DOI : 10.1016 / S0165-6147 (02) 00004-4 . PMID 12498730 .
- ^ Chapman, JA; Киркнесс, EF; Симаков, О .; Hampson, SE; Mitros, T .; Weinmaier, T .; Rattei, T .; Баласубраманян, PG; Borman, J .; Busam, D .; Disbennett, K .; Pfannkoch, C .; Сумин, Н .; Sutton, GG; Вишванатан, LD; Валенц, В .; Гудштейн, DM; Hellsten, U .; Кавасима, Т .; Прочник, СЭ; Патнэм, штат Нью-Хэмпшир; Shu, S .; Blumberg, B .; Дана, CE; Джи, L .; Киблер, Д.Ф .; Закон, L .; Lindgens, D .; Мартинес, Делавэр; и другие. (2010). «Динамический геном гидры» . Природа . 464 (7288): 592–596. Bibcode : 2010Natur.464..592C . DOI : 10,1038 / природа08830 . PMC 4479502 . PMID 20228792 .
- ^ Фодор, Иштван; Хусейн, Ахмед А.А.; Бенджамин, Пол Р; Koene, Joris M; Пиргер, Жолт (16.06.2020). Кинг, Стюарт РФ; Роджерс, Питер; Ирисарри, Икер; Воронежская, Елена Е; Coutellec, Мари-Агнес (ред.). «Неограниченный потенциал большой прудовой улитки Lymnaea stagnalis» . eLife . 9 : e56962. DOI : 10.7554 / eLife.56962 . ISSN 2050-084X .
- ^ Ladurner, P; Schärer, L; Сальвенмозер, Вт; Ригер, Р. (2005). «Новый модельный организм среди низших Bilateria и использование цифровой микроскопии в таксономии мейобентосных Platyhelminthes: Macrostomum lignano , n. Sp. (Rhabditophora, Macrostomorpha)» . Журнал зоологической систематики и эволюционных исследований . 43 : 114–126. DOI : 10.1111 / j.1439-0469.2005.00299.x . Архивировано из оригинала на 2013-01-05.
- ^ Pang, K .; Мартиндейл, MQ (2008). «Гребневики». Текущая биология . 18 (24): R1119 – R1120. DOI : 10.1016 / j.cub.2008.10.004 . PMID 19108762 .
- ^ Райан, Дж. Ф.; Pang, K .; Программа сравнительного секвенирования; Малликин, JC; Martindale, MQ; Baxevanis, AD; Программа сравнительного секвенирования NISC (2010 г.). «Гомеодоменный комплемент гребневика Mnemiopsis leidyi предполагает, что Ctenophora и Porifera расходились до ParaHoxozoa» . EvoDevo . 1 (1): 9. дои : 10,1186 / 2041-9139-1-9 . PMC 2959044 . PMID 20920347 .
- ^ Darling, JA; Reitzel, AR; Бертон, П.М. Mazza, ME; Райан, Дж. Ф.; Салливан, JC; Финнерти, младший (2005). «Восходящая звездочка: звездочка морского анемона, Nematostella vectensis». BioEssays . 27 (2): 211–221. DOI : 10.1002 / bies.20181 . PMID 15666346 .
- ^ Патнэм, штат Нью-Хэмпшир; Шривастава, М .; Hellsten, U .; Диркс, Б .; Chapman, J .; Саламов, А .; Терри, А .; Shapiro, H .; Lindquist, E .; Капитонов В.В.; Jurka, J .; Генихович, Г .; Григорьев И.В. Лукас, С. М.; Стил, RE; Финнерти-младший; Technau, U .; Martindale, MQ; Рохсар, Д.С. (2007). «Геном морских анемонов раскрывает репертуар генов предков Eumetazoan и геномную организацию» . Наука . 317 (5834): 86–94. Bibcode : 2007Sci ... 317 ... 86P . DOI : 10.1126 / science.1139158 . PMID 17615350 .
- ^ Объект Аппендикулярии в Международном центре морской молекулярной биологии Сарс
- ^ Кейд, В. (1975-12-26). "Акустически ориентированные паразитоиды: фонотаксис полета к песне сверчка". Наука . 190 (4221): 1312–1313. Bibcode : 1975Sci ... 190.1312C . DOI : 10.1126 / science.190.4221.1312 . ISSN 0036-8075 .
- ^ Ван, X .; Лавров, Д.В. (2006). «Митохондриальный геном гомосклероморфа Oscarella carmela (Porifera, Demospongiae) обнаруживает неожиданную сложность у общего предка губок и других животных» . Молекулярная биология и эволюция . 24 (2): 363–373. DOI : 10.1093 / molbev / msl167 . PMID 17090697 .
- ^ Tessmar-Raible, K .; Арендт, Д. (2003). «Новые системы: между позвоночными и членистоногими, Lophotrochozoa». Текущее мнение в области генетики и развития . 13 (4): 331–340. DOI : 10.1016 / s0959-437x (03) 00086-8 . PMID 12888005 .
- ^ Шривастава, М .; Begovic, E .; Chapman, J .; Патнэм, штат Нью-Хэмпшир; Hellsten, U .; Кавасима, Т .; Kuo, A .; Mitros, T .; Саламов, А .; Карпентер, М.Л .; Синьорович, А.Ю .; Морено, Массачусетс; Камм, К .; Grimwood, J .; Schmutz, J .; Shapiro, H .; Григорьев И.В. Buss, LW; Schierwater, B .; Деллапорта, SL; Рохсар, Д.С. (2008). «Геном Trichoplax и природа плакозоя» (PDF) . Природа . 454 (7207): 955–960. Bibcode : 2008Natur.454..955S . DOI : 10,1038 / природа07191 . PMID 18719581 .
- ^ Рейнольдсон ТБ, Томпсон С.П., Бэмси Дж.Л. (1991). «Биологический анализ осадка с использованием тубифицида олигохетического червя Tubifex tubifex». Environ. Toxicol. Chem . 10 (8): 1061–72. DOI : 10.1002 / etc.5620100811 .
- ^ Колб, Э.М.; Rezende, EL; Holness, L .; Радтке, А .; Ли, СК; Obenaus, A .; Гарланд-младший, Т (2013). «Мыши, отобранные для высокой степени произвольного бега на колесах, имеют более крупный средний мозг: поддержка мозаичной модели эволюции мозга» . Журнал экспериментальной биологии . 216 : 515–523. DOI : 10,1242 / jeb.076000 . PMID 23325861 .
- ^ Wallingford, J .; Лю, К .; Чжэн, Ю. (2010). «Ксенопус». Текущая биология . 20 : R263–4. DOI : 10.1016 / j.cub.2010.01.012 . PMID 20334828 .
- ^ Харланд, РМ; Грейнджер, RM (2011). «Исследование Xenopus: метаморфозы генетики и геномики» . Тенденции в генетике . 27 : 507–15. DOI : 10.1016 / j.tig.2011.08.003 . PMC 3601910 . PMID 21963197 .
- ^ Шпицберген JM, Кент ML (2003). «Современное состояние модели рыбок данио для исследований токсикологии и токсикологической патологии - преимущества и текущие ограничения» . Toxicol Pathol . 31 (Дополнение): 62–87. DOI : 10.1080 / 01926230390174959 . PMC 1909756 . PMID 12597434 .