Позвоночный митохондриальный код (таблица перевода 2 ) является генетическим кодом найден в митохондриях всех позвоночных .
Эволюция
Считалось, что AGA и AGG стали митохондриальными стоп-кодонами на ранней стадии эволюции позвоночных. [1] Однако, по крайней мере, у людей теперь было показано, что последовательности AGA и AGG не распознаются как кодоны терминации . Сдвиг рамки -1 миторибосомы происходит в кодонах AGA и AGG, которые, как предполагается, завершают открытые рамки считывания (ORF) CO1 и ND6 , и, следовательно, обе ORF заканчиваются в стандартном кодоне UAG. [2]
Неполные стоп-кодоны
Митохондриальные гены у некоторых позвоночных (включая человека) имеют неполные стоп-кодоны, оканчивающиеся на U или UA, которые становятся полными терминирующими кодонами (UAA) при последующем полиаденилировании . [3] [4] [5] [6]
Таблица перевода
Биохимические свойства аминокислот | неполярный | полярный | базовый | кислый | Прекращение: стоп-кодон |
1-я база | 2-я база | 3-я база | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
U | C | А | грамм | ||||||
U | UUU | (Phe / F) фенилаланин | УКУ | (Ser / S) серин | UAU | (Tyr / Y) Тирозин | UGU | (Cys / C) Цистеин | U |
UUC | UCC | ОАК | UGC | C | |||||
UUA | (Leu / L) лейцин | УЦА | UAA | Стоп | UGA | (Trp / W) Триптофан | А | ||
UUG | UCG | UAG | UGG | грамм | |||||
C | CUU | CCU | (Pro / P) Пролин | CAU | (His / H) Гистидин | CGU | (Arg / R) Аргинин | U | |
CUC | CCC | САС | CGC | C | |||||
CUA | CCA | CAA | (Gln / Q) Глютамин | CGA | А | ||||
CUG | CCG | CAG | CGG | грамм | |||||
А | AUU | (Ile / I) Изолейцин | ACU | (Thr / T) Треонин | AAU | (Asn / N) аспарагин | AGU | (Ser / S) серин | U |
AUC | АКК | AAC | AGC | C | |||||
AUA | (Met / M) метионин | ACA | AAA | (Lys / K) Лизин | AGA | Стоп | А | ||
AUG [A] | АЧГ | AAG | AGG | грамм | |||||
грамм | ГУУ | (Val / V) Валин | GCU | (Ала / А) Аланин | ГАУ | (Asp / D) аспарагиновая кислота | ГГУ | (Gly / G) Глицин | U |
GUC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GUA | GCA | GAA | (Glu / E) Глутаминовая кислота | GGA | А | ||||
GUG | GCG | GAG | GGG | грамм |
Отличия от стандартного кода
Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (2) | Стандартный код (1) | |
---|---|---|---|---|
AGA | AGA | СТОП = Тер (*) | Арг (R) | |
AGG | AGG | СТОП = Тер (*) | Арг (R) | |
ATA | AUA | Встреча (M) | Иль (I) | |
TGA | UGA | Trp (Вт) | СТОП = Тер (*) |
Альтернативные кодоны инициации
Смотрите также
- Список генетических кодов
Рекомендации
- Эта статья содержит общедоступный текст со страницы NCBI, составленный Анджеем (Анджай) Эльзановски и Джимом Остеллом. [9]
- ^ С. Осава, Т. Ohama, TH Jukes и К. Ватанабе (сентябрь 1989). «Эволюция митохондриального генетического кода. I. Происхождение серина и стоп-кодонов AGR в митохондриях многоклеточных животных». J Mol Evol . 29 (3): 202–7. DOI : 10.1007 / bf02100203 . PMID 2506356 . S2CID 21051869 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
- ^ Р. Дж. Темперли; Р. Рихтер; S Dennerlein; RN Lightowlers; ZM Chrzanowska-Lightowlers (январь 2010). «Голодные кодоны способствуют сдвигу рамки считывания в митохондриальных рибосомах человека». Наука . 327 (5963): 301. DOI : 10.1126 / science.1180674 . PMID 20075246 . S2CID 206522983 .
- ^ Temperley, RJ; Wydro, M; Lightowlers, RN; Chrzanowska-Lightowlers, ZM (2010). «Человеческие митохондриальные мРНК - как члены всех семейств, похожие, но разные» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика . 1797 (6–7): 1081–5. DOI : 10.1016 / j.bbabio.2010.02.036 . PMC 3003153 . PMID 20211597 .
- ^ WR Hou, Y. Chen, X. Wu, JC Hu, ZS Peng, J. Yang, ZX Tang, CQ Zhou, YM Li, SK Yang, YJ Du, LL Kong, ZL Ren, HY Zhang и SS Shuai (декабрь 2006 г.) ). «Полная последовательность митохондриального генома азиатского черного медведя сычуаньского подвида (Ursus thibetanus mupinensis)» . Int J Biol Sci . 3 (2): 85–90. DOI : 10.7150 / ijbs.3.85 . PMC 1752227 . PMID 17205108 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
- ^ О, ди-джей; Ким, JY; Ли, JA; Юн, WJ; Парк, SY; Юнг, YH (2007). «Полный митохондриальный геном рыбы-кролика Siganus fuscescens (Perciformes, Siganidae)». Последовательность ДНК . 18 (4): 295–301. DOI : 10.1080 / 10425170701248525 . PMID 17541835 . S2CID 38458668 .
- ^ Ki, JS; Hwang, DS; Park, TJ; Хан, SH; Ли, Дж.С. (2009). «Сравнительный анализ полного митохондриального генома евразийской выдры Lutra lutra (Carnivora; Mustelidae)». Отчеты по молекулярной биологии . 37 (4): 1943–55. DOI : 10.1007 / s11033-009-9641-0 . PMID 19757186 . S2CID 24233602 .
- ^ Накамото Т. (март 2009 г.). «Эволюция и универсальность механизма инициирования синтеза белка». Джин . 432 (1–2): 1–6. DOI : 10.1016 / j.gene.2008.11.001 . PMID 19056476 .
- ^ П. Дежарден и Р. Мораис (февраль 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность и эволюция кодирующих и некодирующих областей митохондриального генома перепела». J Mol Evol . 32 (2): 153–161. DOI : 10.1007 / bf02515387 . PMID 1706782 . S2CID 1974138 .
- ^ Генетические коды