Эволюция

Эволюция - это изменение наследственных характеристик биологических популяций на протяжении последующих поколений . [1] [2] Эти характеристики являются выражениями из генов , которые передаются от родителей к потомству во время воспроизведения . Различные характеристики, как правило, существуют в любой данной популяции в результате мутации , генетической рекомбинации и других источников генетической изменчивости . [3] Эволюция происходит, когда эволюционные процессы, такие как естественный отбор (включаяполовой отбор ) и генетический дрейф влияют на эту вариацию, в результате чего определенные характеристики становятся более частыми или редкими в популяции. [4] Именно этот процесс эволюции привел к появлению биоразнообразия на всех уровнях биологической организации , включая уровни видов , отдельных организмов и молекул . [5] [6]

Научная теория эволюции путем естественного отбора была задумана независимо от Чарльза Дарвина и Альфреда Рассела Уоллеса в середине 19-го века и подробно изложены в книге Дарвина Происхождение видов . [7] Эволюция путем естественного отбора была впервые продемонстрирована наблюдением, что часто рождается больше потомства, чем может выжить. Далее следуют три наблюдаемых факта о живых организмах: (1) черты характера различаются у разных людей в отношении их морфологии, физиологии и поведения ( фенотипическая изменчивость ), (2) разные черты обеспечивают разную скорость выживания и воспроизводства (дифференциальная приспособленность ) и ( 3) признаки могут передаваться из поколения в поколение ( наследственность приспособленности). [8] Таким образом, в последующих поколениях члены популяции с большей вероятностью будут заменены потомками родителей с благоприятными характеристиками, которые позволили им выживать и воспроизводиться в соответствующей среде . В начале 20 века другие конкурирующие идеи эволюции, такие как мутационизм и ортогенез, были опровергнуты, поскольку современный синтез согласовал дарвиновскую эволюцию с классической генетикой , которая установила, что адаптивная эволюция вызвана естественным отбором, воздействующим на менделевскую генетическую изменчивость. [9]

У всей жизни на Земле есть последний универсальный общий предок (LUCA) [10] [11] [12], который жил примерно 3,5–3,8 миллиарда лет назад. [13] Окаменелости включают в себя переход от раннего биогенного графита , [14] к микробному мату ископаемых, [15] [16] [17] к фоссилизируемым многоклеточные организмам . Существующие модели биоразнообразия были сформированы повторяющимися образованиями новых видов ( видообразование ), изменениями внутри видов ( анагенез ) и утратой видов ( вымирание ) на протяжении эволюционной истории жизни на Земле. [18] Морфологические и биохимические признаки более схожи между видами, имеющими более позднего общего предка , и могут использоваться для реконструкции филогенетических деревьев . [19] [20]

Эволюционные биологи продолжали изучать различные аспекты эволюции, формируя и проверяя гипотезы, а также конструируя теории, основанные на данных, полученных в полевых или лабораторных условиях, и на данных, полученных с помощью методов математической и теоретической биологии . Их открытия повлияли не только на развитие биологии, но и на множество других научных и промышленных областей, включая сельское хозяйство , медицину и информатику . [21]

Лукреций
Альфред Рассел Уоллес
Томас Роберт Мальтус
В 1842 году Чарльз Дарвин написал свой первый очерк « Происхождение видов» . [22]

Классические времена

Предположение о том, что один тип организмов может происходить от другого типа, восходит к некоторым первым досократовским греческим философам , таким как Анаксимандр и Эмпедокл . [23] Такие предложения сохранились до римских времен. Поэт и философ Лукреций следовал Эмпедокла в его мастерской De Rerum Natura ( О природе вещей ). [24] [25]

Средневековый

В отличие от этих материалистических взглядов, аристотелизм рассматривал все естественные вещи как актуализацию фиксированных естественных возможностей, известных как формы . [26] [27] Это было частью средневекового телеологического понимания природы, в котором все вещи должны играть определенную роль в божественном космическом порядке. Вариации этой идеи стали стандартным пониманием средневековья и были интегрированы в христианское учение, но Аристотель не требовал, чтобы реальные типы организмов всегда однозначно соответствовали точным метафизическим формам, и конкретно приводил примеры того, как новые типы жизни все могло произойти. [28]

Додарвиновский

В 17 - м веке, новый метод в современной науке отверг аристотелевскую подход. Он искал объяснения природных явлений в терминах физических законов, которые были одинаковыми для всех видимых вещей и не требовали существования каких-либо фиксированных природных категорий или божественного космического порядка. Однако этот новый подход медленно укоренялся в биологических науках, последнем оплоте концепции фиксированных природных типов. Джон Рэй применил один из ранее более общих терминов для фиксированных природных типов, «виды», к типам растений и животных, но он строго определил каждый тип живых существ как вид и предложил, чтобы каждый вид мог быть определен по характеристикам, которые увековечили сами поколение за поколением. [29] Биологическая классификация, введенная Карлом Линнеем в 1735 году, явно признала иерархическую природу взаимоотношений видов, но все же рассматривала виды как фиксированные в соответствии с божественным планом. [30]

Другие естествоиспытатели того времени размышляли об эволюционном изменении видов с течением времени в соответствии с законами природы. В 1751 году Пьер Луи Мопертюи писал о естественных модификациях, происходящих во время воспроизводства и накапливающихся в течение многих поколений для создания новых видов. [31] Жорж-Луи Леклерк, граф де Бюффон , предположил, что виды могут перерождаться в разные организмы, а Эразм Дарвин предположил, что все теплокровные животные могли происходить от одного микроорганизма (или «нити»). [32] Первой полноценной эволюционной схемой была теория «трансмутации» Жана-Батиста Ламарка 1809 года [33], которая предусматривала спонтанное зарождение, непрерывно порождающее простые формы жизни, которые развивались в более сложных параллельных линиях с присущей прогрессивной тенденцией, и постулировал, что на местном уровне эти линии адаптировались к окружающей среде, унаследовав изменения, вызванные их использованием или неиспользованием родителями. [34] (Последний процесс позже был назван ламаркизмом .) [34] [35] [36] Эти идеи были осуждены авторитетными натуралистами как предположения, лишенные эмпирической поддержки. В частности, Жорж Кювье настаивал на том, что виды не связаны между собой и фиксированы, а их сходство отражает божественный замысел для функциональных нужд. Тем временем идеи доброжелательного замысла Рэя были развиты Уильямом Пэли в « Естественной теологии или доказательствах существования и атрибутов божества» (1802 г.), в которой предлагались сложные адаптации в качестве доказательства божественного замысла и которым восхищался Чарльз Дарвин. [37] [38]

Дарвиновская революция

Решающий разрыв с концепцией постоянных типологических классов или типов в биологии произошел с теорией эволюции посредством естественного отбора, которую Чарльз Дарвин сформулировал в терминах переменных популяций. Дарвин использовал выражение « происхождение с модификацией », а не «эволюция». [39] Частично находясь под влиянием «Очерка о принципе народонаселения» (1798 г.) Томаса Роберта Мальтуса , Дарвин отметил, что рост населения приведет к «борьбе за существование», в которой преобладают благоприятные вариации по мере того, как другие погибают. В каждом поколении многие потомки не доживают до возраста воспроизводства из-за ограниченных ресурсов. Это могло бы объяснить разнообразие растений и животных от общей родословной через действие законов природы одинаково для всех типов организмов. [40] [41] [42] [43] Дарвин развивал свою теорию «естественного отбора» с 1838 года и писал свою «большую книгу» по этому вопросу, когда Альфред Рассел Уоллес прислал ему версию практически той же теории в 1858. Их отдельные статьи были представлены вместе на собрании Линнеевского общества в Лондоне в 1858 году . [44] В конце 1859 года Дарвин опубликовал свой «реферат» под названием «Происхождение видов», который подробно объяснил естественный отбор таким образом, что привел к все более широкому принятию дарвиновских концепций эволюции за счет альтернативных теорий . Томас Генри Хаксли применил идеи Дарвина к людям, используя палеонтологию и сравнительную анатомию, чтобы предоставить убедительные доказательства того, что люди и обезьяны имели общее происхождение. Некоторых это беспокоило, поскольку это подразумевало, что у людей нет особого места во Вселенной . [45]

Пангенезис и наследственность

Механизмы репродуктивной наследственности и происхождение новых признаков оставались загадкой. С этой целью Дарвин разработал свою предварительную теорию пангенезиса . [46] В 1865 году Грегор Мендель сообщил, что черты наследуются предсказуемым образом через независимый набор и сегрегацию элементов (позже известных как гены). Законы наследования Менделя в конечном итоге вытеснили большую часть теории пангенезиса Дарвина. [47] Август Вейсманн провел важное различие между половыми клетками , дающими начало гаметам (например, сперматозоидами и яйцеклетками ), и соматическими клетками тела, продемонстрировав, что наследственность передается только через зародышевую линию. Хьюго де Фрис соединил теорию пангенеза Дарвина с различием клеток зародыша / сомы Вейсмана и предположил, что пангены Дарвина концентрируются в ядре клетки и при экспрессии могут перемещаться в цитоплазму, изменяя структуру клетки . Де Фриз был также одним из исследователей, которые сделали работу Менделя широко известной, полагая, что менделевские черты соответствуют передаче наследственных вариаций вдоль зародышевой линии. [48] Чтобы объяснить, как возникают новые варианты, де Фрис разработал теорию мутаций, которая привела к временному разрыву между теми, кто принимал дарвиновскую эволюцию, и специалистами по биометрии, которые были союзниками де Вриза. [49] [50] В 1930-х годах пионеры в области популяционной генетики , такие как Рональд Фишер , Сьюэлл Райт и Дж. Б.С. Холдейн, заложили основы эволюции на прочную статистическую философию. Таким образом было разрешено ложное противоречие между теорией Дарвина, генетическими мутациями и менделевской наследственностью . [51]

`` Современный синтез ''

В 1920-х и 1930-х годах так называемый современный синтез соединил естественный отбор и популяционную генетику, основанную на менделевской наследственности, в единую теорию, которая применялась в целом к ​​любой отрасли биологии. Современный синтез объяснил закономерности, наблюдаемые у разных видов в популяциях, через переходы ископаемых в палеонтологии. [51]

Дальнейшие синтезы

С тех пор современный синтез был расширен в свете многочисленных открытий для объяснения биологических явлений по всей и интегративной шкале биологической иерархии , от генов до популяций. [52]

Публикация структуры ДНК по Джеймс Уотсон и Фрэнсис Крик с вкладом Розалинд Франклин в 1953 году показали , физический механизм наследования. [53] Молекулярная биология улучшила понимание взаимосвязи между генотипом и фенотипом . Были также достигнуты успехи в филогенетической систематике , отображающей переход признаков в сравнительную и проверяемую структуру посредством публикации и использования эволюционных деревьев . [54] В 1973 году биолог-эволюционист Феодосий Добжанский написал, что « ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции », потому что он выявил взаимосвязь между тем, что сначала казалось разрозненными фактами естественной истории, в связную пояснительную совокупность знаний. который описывает и предсказывает многие наблюдаемые факты о жизни на этой планете. [55]

Одно расширение, известное как эволюционная биология развития и неофициально называемое «evo-DevO», подчеркивает, как изменения между поколениями (эволюция) влияют на паттерны изменений внутри отдельных организмов ( развитие ). [56] [57] С начала 21 века и в свете открытий, сделанных в последние десятилетия, некоторые биологи выступали за расширенный эволюционный синтез , который мог бы учитывать эффекты негенетических способов наследования, таких как эпигенетика , родительские эффекты , экологическая и культурная наследственность , а также способность к развитию . [58] [59]

Структура ДНК . Основания в центре, окружены фосфатно-сахарными цепями двойной спирали .

Эволюция организмов происходит через изменения наследственных черт - унаследованных характеристик организма. У людей, например, цвет глаз является наследственной характеристикой, и человек может унаследовать «черту карих глаз» от одного из своих родителей. [60] Унаследованные признаки контролируются генами, и полный набор генов в геноме организма (генетическом материале) называется его генотипом. [61]

Полный набор наблюдаемых признаков, составляющих структуру и поведение организма, называется его фенотипом. Эти черты проистекают из взаимодействия его генотипа с окружающей средой. [62] В результате многие аспекты фенотипа организма не наследуются. Например, загорелая кожа возникает в результате взаимодействия генотипа человека и солнечного света; таким образом, загар не передается детям людей. Однако некоторым людям легче загорать, чем другим, из-за различий в генотипах; Яркий пример - люди с наследственной чертой альбинизма , которые совсем не загорают и очень чувствительны к солнечным ожогам . [63]

Наследственные черты передаются от одного поколения к другому через ДНК, молекулу, которая кодирует генетическую информацию. [61] ДНК представляет собой длинный биополимер, состоящий из четырех типов оснований. Последовательность оснований в определенной молекуле ДНК определяет генетическую информацию аналогично последовательности букв, составляющих предложение. Перед делением клетки ДНК копируется, так что каждая из двух образовавшихся клеток унаследует последовательность ДНК. Части молекулы ДНК, которые определяют одну функциональную единицу, называются генами; разные гены имеют разные последовательности оснований. Внутри клетки длинные цепи ДНК образуют конденсированные структуры, называемые хромосомами . Конкретное расположение последовательности ДНК в хромосоме называется локусом . Если последовательность ДНК в локусе у разных людей различается, разные формы этой последовательности называются аллелями. Последовательности ДНК могут изменяться в результате мутаций, создавая новые аллели. Если в гене происходит мутация, новый аллель может повлиять на признак, который контролирует ген, изменяя фенотип организма. [64] Однако, хотя это простое соответствие между аллелем и признаком работает в некоторых случаях, большинство признаков являются более сложными и контролируются локусами количественных признаков (множественными взаимодействующими генами). [65] [66]

Недавние открытия подтвердили важные примеры наследственных изменений, которые нельзя объяснить изменениями последовательности нуклеотидов в ДНК. Эти явления классифицируются как системы эпигенетической наследственности. [67] метилирование ДНК маркировки хроматин , самоподдерживающийся метаболические циклы, молчание генов с помощью РНК - интерференции и трехмерная конформация из белков (таких как прионы ) являются областями , где эпигенетические системы наследования были обнаружены на организмическую уровне. [68] Биологи развития предполагают, что сложные взаимодействия в генетических сетях и коммуникации между клетками могут привести к наследственным вариациям, которые могут лежать в основе некоторых механизмов пластичности развития и канализации . [69] Наследственность может также проявляться в еще более крупных масштабах. Например, экологическая наследственность в процессе создания ниши определяется регулярной и повторяющейся деятельностью организмов в окружающей их среде. Это порождает унаследованные эффекты, которые изменяют и возвращают в режим отбора последующих поколений. Потомки наследуют гены и характеристики окружающей среды, порожденные экологическими действиями предков. [70] Другие примеры наследуемости в эволюции, которые не находятся под прямым контролем генов, включают наследование культурных черт и симбиогенез . [71] [72]

Черный морф в эволюции берёзовой бабочки

Эволюция может происходить, если в популяции есть генетические вариации . Вариации происходят из-за мутаций в геноме, перетасовки генов в результате полового размножения и миграции между популяциями ( поток генов ). Несмотря на постоянное введение новых вариаций через мутации и поток генов, большая часть генома вида идентична у всех особей этого вида. [73] Однако даже относительно небольшие различия в генотипах могут привести к резким различиям в фенотипах: например, шимпанзе и люди различаются лишь примерно в 5% своих геномов. [74]

Фенотип отдельного организма является результатом как его генотипа, так и влияния окружающей среды, в которой он жил. Существенная часть фенотипической изменчивости в популяции вызвана генотипической изменчивостью. [66] Современный эволюционный синтез определяет эволюцию как изменение во времени этой генетической вариации. Частота одного конкретного аллеля станет более или менее преобладающей по сравнению с другими формами этого гена. Вариация исчезает, когда новый аллель достигает точки фиксации - когда он либо исчезает из популяции, либо полностью заменяет предковый аллель. [75]

До открытия менделевской генетики одной общей гипотезой было смешанное наследование . Но при смешанном наследовании генетическая изменчивость будет быстро утеряна, что сделает эволюцию путем естественного отбора маловероятной. Принцип Харди – Вайнберга позволяет решить, как сохраняется вариация в популяции с менделевским наследованием. Частоты аллелей (вариаций в гене) останутся постоянными при отсутствии отбора, мутации, миграции и генетического дрейфа. [76]

Мутация

Дублирование части хромосомы

Мутации - это изменения в последовательности ДНК генома клетки и основной источник генетической изменчивости всех организмов. [3] Когда происходят мутации, они могут изменить продукт гена , или помешать гену функционировать, или не иметь никакого эффекта. Основываясь на исследованиях на мухе Drosophila melanogaster , было высказано предположение, что если мутация изменяет белок, продуцируемый геном, это, вероятно, будет вредным, причем около 70% этих мутаций будут иметь повреждающие эффекты, а остальные будут либо нейтральными, либо слабыми. выгодный. [77]

Мутации могут включать дублирование больших участков хромосомы (обычно в результате генетической рекомбинации ), что может привести к появлению дополнительных копий гена в геноме. [78] Дополнительные копии генов являются основным источником сырья, необходимого для развития новых генов. [79] Это важно, потому что большинство новых генов эволюционируют внутри генных семейств из уже существующих генов, имеющих общих предков. [80] Например, человеческий глаз использует четыре гена для создания структур, воспринимающих свет: три для цветного зрения и один для ночного видения ; все четверо произошли от одного предкового гена. [81]

Новые гены могут быть сгенерированы из наследственного гена, когда дублирующая копия мутирует и приобретает новую функцию. Этот процесс становится проще после дублирования гена, потому что это увеличивает избыточность системы; один ген в паре может приобретать новую функцию, в то время как другая копия продолжает выполнять свою первоначальную функцию. [82] [83] Другие типы мутаций могут даже генерировать совершенно новые гены из ранее некодирующей ДНК. [84] [85]

Генерация новых генов может также включать дупликацию небольших частей нескольких генов, при этом эти фрагменты затем рекомбинируются с образованием новых комбинаций с новыми функциями. [86] [87] Когда новые гены собираются из перетасовки уже существующих частей, домены действуют как модули с простыми независимыми функциями, которые можно смешивать вместе для создания новых комбинаций с новыми и сложными функциями. [88] Например, поликетидсинтазы - это крупные ферменты, которые производят антибиотики ; они содержат до ста независимых доменов, каждый из которых катализирует один этап в общем процессе, например этап на сборочной линии. [89]

Секс и рекомбинация

У бесполых организмов гены наследуются вместе или связаны , поскольку они не могут смешиваться с генами других организмов во время воспроизводства. Напротив, потомство половых организмов содержит случайные смеси хромосом своих родителей, полученные путем независимого отбора. В родственном процессе, называемом гомологичной рекомбинацией , половые организмы обмениваются ДНК между двумя совпадающими хромосомами. [90] Рекомбинация и повторная сортировка не изменяют частоты аллелей, а вместо этого изменяют, какие аллели связаны друг с другом, производя потомство с новыми комбинациями аллелей. [91] Пол обычно увеличивает генетическую изменчивость и может увеличить скорость эволюции. [92] [93]

Эта диаграмма показывает двойную цену секса . Если каждый человек были внести свой вклад в такое же количество потомства (два), (а) сексуальное население остается тем же самым размером каждого поколения, где (б) бесполое размножение парный населения в размере каждого поколения.

Двукратную стоимость секса впервые описал Джон Мейнард Смит . [94] Первая цена заключается в том, что у видов с половым диморфизмом только один из двух полов может рожать детенышей. Эта стоимость не распространяется на виды-гермафродиты, такие как большинство растений и многих беспозвоночных . Вторая цена заключается в том, что любой человек, который размножается половым путем, может передать только 50% своих генов любому отдельному потомству, и еще меньше передается с каждым новым поколением. [95] Тем не менее, половое размножение - более распространенный способ размножения среди эукариот и многоклеточных организмов. Гипотеза Красной Королевы использовалась для объяснения значения полового размножения как средства, обеспечивающего непрерывную эволюцию и адаптацию в ответ на коэволюцию с другими видами в постоянно меняющейся среде. [95] [96] [97] [98] Другая гипотеза состоит в том, что половое размножение - это прежде всего адаптация, способствующая точному рекомбинационному восстановлению повреждений ДНК зародышевой линии, и что увеличение разнообразия является побочным продуктом этого процесса, который иногда может быть адаптивно полезным. [99] [100]

Генетический поток

Поток генов - это обмен генами между популяциями и между видами. [101] Следовательно, это может быть новый для популяции или вида источник изменчивости. Поток генов может быть вызван перемещением особей между отдельными популяциями организмов, что может быть вызвано перемещением мышей между внутренними и прибрежными популяциями или перемещением пыльцы между толерантными к тяжелым металлам и чувствительными к тяжелым металлам популяциями травы.

Передача генов между видами включает образование гибридных организмов и горизонтальный перенос генов . Горизонтальный перенос генов - это перенос генетического материала от одного организма к другому, не являющемуся его потомством; это наиболее распространено среди бактерий . [102] В медицине это способствует распространению устойчивости к антибиотикам , поскольку, когда одна бактерия приобретает гены устойчивости, она может быстро передать их другим видам. [103] Произошел горизонтальный перенос генов от бактерий к эукариотам, таким как дрожжи Saccharomyces cerevisiae и долгоносик из фасоли адзуки Callosobruchus chinensis . [104] [105] Примером крупномасштабного переноса являются эукариотические бделлоидные коловратки , которые получили ряд генов от бактерий, грибов и растений. [106] Вирусы также могут переносить ДНК между организмами, что позволяет переносить гены даже через биологические домены . [107]

Масштабный перенос генов также произошел между предками эукариотических клеток и бактериями во время приобретения хлоропластов и митохондрий . Возможно, сами эукариоты произошли в результате горизонтального переноса генов между бактериями и археями . [108]

Мутация, сопровождаемая естественным отбором, приводит к более темной окраске популяции.

С неодарвинистской точки зрения, эволюция происходит, когда есть изменения в частотах аллелей в популяции скрещивающихся организмов [76], например, аллель черного окраса в популяции моли становится все более распространенным. Механизмы, которые могут привести к изменению частот аллелей, включают естественный отбор, генетический дрейф, поток генов и смещение мутаций.

Естественный отбор

Эволюция путем естественного отбора - это процесс, с помощью которого признаки, улучшающие выживание и воспроизводство, становятся более распространенными в последующих поколениях популяции. Он воплощает в себе три принципа: [8]

  • В популяциях организмов существуют различия в отношении морфологии, физиологии и поведения (фенотипическая изменчивость).
  • Разные черты дают разные показатели выживаемости и воспроизводства (дифференциальная приспособленность).
  • Эти черты могут передаваться из поколения в поколение (наследственность приспособленности).

Производится больше потомства, чем может выжить, и эти условия вызывают конкуренцию между организмами за выживание и воспроизводство. Следовательно, организмы с признаками, дающими им преимущество перед конкурентами, с большей вероятностью передадут свои признаки следующему поколению, чем организмы с признаками, не дающими преимущества. [109] Эта телеономия - это качество, посредством которого процесс естественного отбора создает и сохраняет черты, которые, по- видимому , подходят для выполняемых ими функциональных ролей. [110] Последствия отбора включают неслучайное спаривание [111] и генетический автостоп .

Центральная концепция естественного отбора - это эволюционная приспособленность организма. [112] Пригодность измеряется способностью организма выживать и воспроизводиться, что определяет размер его генетического вклада в следующее поколение. [112] Однако приспособленность - это не то же самое, что общее количество потомков: вместо этого приспособленность указывается долей последующих поколений, несущих гены организма. [113] Например, если бы организм мог хорошо выжить и быстро размножаться, но его потомство было бы слишком маленьким и слабым, чтобы выжить, этот организм внес бы небольшой генетический вклад в будущие поколения и, следовательно, имел бы низкую приспособленность. [112]

Если аллель увеличивает приспособленность больше, чем другие аллели этого гена, то с каждым поколением этот аллель будет становиться все более распространенным в популяции. Эти черты , как говорят, «выбран для » . Примерами черт, которые могут улучшить приспособленность, являются повышенная выживаемость и повышенная плодовитость . И наоборот, более низкая приспособленность, вызванная наличием менее полезного или вредного аллеля, приводит к тому, что этот аллель становится более редким - они «отбираются против ». [114] Важно отметить, что приспособленность аллеля не является фиксированной характеристикой; при изменении окружающей среды ранее нейтральные или вредные черты могут стать полезными, а ранее полезные черты - вредными. [64] Однако, даже если направление отбора действительно изменится таким образом, черты, которые были утрачены в прошлом, могут не развиваться повторно в идентичной форме (см . Закон Долло ). [115] [116] Однако повторная активация спящих генов, если они не были удалены из генома и подавлялись, возможно, в течение сотен поколений, может привести к повторному появлению признаков, которые считались утраченными. как в задних конечностях дельфинов , зубы в кур , крыла в бескрылых палках насекомых , хвостах и дополнительные соски у людей и т.д. [117] «отсылки» , такие как они известны как атавизмы .

Эти диаграммы отображают различные типы генетического отбора. На каждом графике переменная оси абсцисс представляет собой тип фенотипического признака, а переменная оси ординат - количество организмов. Группа A - это исходная популяция, а Группа B - это популяция после отбора.
· График 1 показывает направленный отбор , при котором предпочтение отдается одному крайнему фенотипу .
· График 2 показывает стабилизирующий отбор , при котором промежуточный фенотип предпочтительнее крайних признаков.
· График 3 показывает разрушительный отбор , при котором крайние фенотипы предпочтительнее промежуточных.

Естественный отбор в популяции по признаку, который может варьироваться в пределах диапазона значений, например роста, можно разделить на три разных типа. Первый - это направленный отбор , который представляет собой сдвиг среднего значения признака с течением времени - например, организм постепенно становится выше. [118] Во-вторых, разрушительный отбор - это отбор по крайним значениям черт, который часто приводит к тому, что два разных значения становятся наиболее распространенными, с отбором против среднего значения. Это было бы тогда, когда преимущество имели либо низкие, либо высокие организмы, но не средние. Наконец, при стабилизации отбора происходит отбор против крайних значений признаков на обоих концах, что приводит к уменьшению дисперсии вокруг среднего значения и меньшему разнообразию. [109] [119] Это может, например, привести к тому, что организмы в конечном итоге будут иметь подобную высоту.

В большинстве случаев естественный отбор делает природу мерой, с которой индивиды и индивидуальные черты имеют большую или меньшую вероятность выживания. «Природа» в этом смысле относится к экосистеме , то есть к системе, в которой организмы взаимодействуют со всеми другими элементами, как физическими, так и биологическими , в своей локальной среде. Юджин Одум , основатель экологии , определил экосистему как: «Любая единица, которая включает в себя все организмы ... в данной области, взаимодействующие с физической средой, так что поток энергии приводит к четко определенной трофической структуре, биотическому разнообразию, и материальные циклы (т. е. обмен материалами между живыми и неживыми частями) внутри системы… » [120] Каждая популяция в экосистеме занимает определенную нишу или положение с различными отношениями с другими частями системы. Эти отношения включают в себя историю жизни организма, его положение в пищевой цепи и географический ареал. Это широкое понимание природы позволяет ученым выделить определенные силы, которые вместе составляют естественный отбор.

Естественный отбор может действовать на разных уровнях организации , таких как гены, клетки, отдельные организмы, группы организмов и виды. [121] [122] [123] Выбор может действовать на нескольких уровнях одновременно. [124] Примером отбора, происходящего ниже уровня отдельного организма, являются гены, называемые транспозонами , которые могут реплицироваться и распространяться по геному. [125] Отбор на более высоком уровне, чем индивидуальный, такой как групповой отбор , может способствовать развитию сотрудничества. [126]

Генетический автостоп

Рекомбинация позволяет разделить аллели одной и той же цепи ДНК. Однако скорость рекомбинации низкая (примерно два события на хромосому на поколение). В результате гены, расположенные близко друг к другу на хромосоме, не всегда могут быть удалены друг от друга, а гены, которые расположены близко друг к другу, имеют тенденцию унаследоваться вместе, явление, известное как сцепление . [127] Эта тенденция измеряется путем определения того, насколько часто два аллеля встречаются вместе на одной хромосоме по сравнению с ожидаемыми , что называется их неравновесием по сцеплению . Набор аллелей, который обычно наследуется в группе, называется гаплотипом . Это может быть важно, когда один аллель в конкретном гаплотипе очень полезен: естественный отбор может управлять избирательным движением , которое также приведет к тому, что другие аллели в гаплотипе станут более распространенными в популяции; этот эффект называется генетическим автостопом или генетическим проектом. [128] Генетический проект, вызванный тем фактом, что некоторые нейтральные гены генетически связаны с другими, находящимися в процессе отбора, могут быть частично захвачены соответствующим эффективным размером популяции. [129]

Половой отбор

Особым случаем естественного отбора является половой отбор, который представляет собой отбор по любому признаку, который увеличивает успех спаривания за счет увеличения привлекательности организма для потенциальных партнеров. [130] Черты, развившиеся в результате полового отбора, особенно заметны у самцов нескольких видов животных. Несмотря на сексуальную привлекательность, такие черты, как громоздкие рога, брачные крики, большой размер тела и яркие цвета, часто привлекают хищников, что ставит под угрозу выживание отдельных самцов. [131] [132] Этот недостаток выживания уравновешивается более высоким репродуктивным успехом у самцов, которые демонстрируют эти трудно поддельные , сексуально отобранные черты. [133]

Генетический дрейф

Моделирование генетического дрейфа 20 несвязанных аллелей в популяциях 10 (вверху) и 100 (внизу). Дрейф к фиксации происходит быстрее в меньшей популяции.

Генетический дрейф - это случайные колебания частот аллелей в популяции от одного поколения к другому. [134] Когда силы отбора отсутствуют или относительно слабы, частоты аллелей с одинаковой вероятностью будут дрейфовать вверх или вниз в каждом последующем поколении, потому что аллели подвержены ошибкам выборки . [135] Этот дрейф останавливается, когда аллель в конечном итоге становится фиксированным, либо путем исчезновения из популяции, либо полностью заменяя другие аллели. Таким образом, генетический дрейф может исключить некоторые аллели из популяции исключительно случайно. Даже при отсутствии селективных сил генетический дрейф может привести к тому, что две отдельные популяции, которые начинали с одной и той же генетической структуры, разделятся на две расходящиеся популяции с разными наборами аллелей. [136]

Нейтральная теория молекулярной эволюции предположил , что большинство эволюционных изменений являются результатом фиксации нейтральных мутаций генетического дрейфа. [137] Следовательно, в этой модели большинство генетических изменений в популяции являются результатом постоянного давления мутаций и генетического дрейфа. [138] От этой формы нейтральной теории в настоящее время в значительной степени отказались, поскольку она, похоже, не соответствует генетической изменчивости, наблюдаемой в природе. [139] [140] Однако более свежая и хорошо обоснованная версия этой модели - это почти нейтральная теория , согласно которой мутация, которая будет эффективно нейтральной в небольшой популяции, не обязательно будет нейтральной в большой популяции. [109] Другие альтернативные теории предполагают, что генетический дрейф затмевается другими стохастическими силами в эволюции, такими как генетический автостоп, также известный как генетический проект. [135] [129] [141]

Время фиксации нейтрального аллеля в результате генетического дрейфа зависит от размера популяции, причем фиксация происходит быстрее в меньших популяциях. [142] Количество особей в популяции не имеет решающего значения, это показатель, известный как эффективный размер популяции. [143] Эффективная популяция обычно меньше, чем общая популяция, поскольку она учитывает такие факторы, как уровень инбридинга и стадия жизненного цикла, на которой популяция самая маленькая. [143] Эффективный размер популяции не может быть одинаковым для каждого гена в одной и той же популяции. [144]

Обычно трудно измерить относительную важность процессов отбора и нейтральности, включая дрейф. [145] Сравнительная важность адаптивных и неадаптивных сил в управлении эволюционными изменениями является областью текущих исследований . [146]

Генетический поток

Поток генов включает обмен генами между популяциями и между видами. [101] Наличие или отсутствие потока генов коренным образом меняет ход эволюции. Из-за сложности организмов любые две полностью изолированные популяции в конечном итоге разовьют генетическую несовместимость посредством нейтральных процессов, как в модели Бейтсона-Добжанского-Мюллера , даже если обе популяции останутся практически идентичными с точки зрения их адаптации к окружающей среде.

Если генетическая дифференциация между популяциями развивается, поток генов между популяциями может привнести черты или аллели, которые являются невыгодными для местной популяции, и это может привести к тому, что у организмов в этих популяциях появятся механизмы, предотвращающие спаривание с генетически отдаленными популяциями, что в конечном итоге приведет к появлению новых видов. . Таким образом, обмен генетической информацией между людьми имеет фундаментальное значение для развития концепции биологических видов .

Во время разработки современного синтеза Сьюэлл Райт разработал свою теорию смещения баланса , которая рассматривала поток генов между частично изолированными популяциями как важный аспект адаптивной эволюции. [147] Однако в последнее время значительная критика важности теории сдвига баланса. [148]

Предвзятость мутации

Ошибка мутации обычно понимается как разница в ожидаемых скоростях для двух разных видов мутации, например, ошибка перехода-трансверсии, систематическая ошибка GC-AT, ошибка делеции-вставки. Это связано с идеей предвзятости в развитии .

Холдейн [149] и Фишер [150] утверждали, что, поскольку мутация - это слабое давление, которое легко преодолеть с помощью отбора, тенденции мутации будут неэффективными, кроме как в условиях нейтральной эволюции или чрезвычайно высокой скорости мутаций. Этот аргумент противоположного давления долгое время использовался для того, чтобы исключить возможность внутренних тенденций в эволюции [151], пока молекулярная эра не вызвала возобновление интереса к нейтральной эволюции.

Нобору Суэока [152] и Эрнст Фриз [153] предположили, что систематические ошибки в мутациях могут быть ответственны за систематические различия в составе геномных GC между видами. Идентификация штамма-мутатора E. coli, имеющего тенденцию к GC, в 1967 году [154] вместе с предложением нейтральной теории , установила правдоподобность мутационных объяснений молекулярных паттернов, которые сейчас широко распространены в литературе по молекулярной эволюции.

Например, ошибки мутаций часто используются в моделях использования кодонов. [155] Такие модели также включают эффекты отбора, следуя модели мутации-отбора-дрейфа [156], которая допускает как смещения мутаций, так и дифференциальный отбор, основанный на эффектах на трансляцию. Гипотезы о предвзятости мутаций сыграли важную роль в развитии представлений об эволюции состава генома, включая изохоры. [157] Различные ошибки вставки и удаления в разных таксонах могут привести к эволюции генома разного размера. [158] [159] Гипотеза Линча относительно размера генома основана на мутационных предубеждениях в сторону увеличения или уменьшения размера генома.

Однако мутационные гипотезы эволюции состава претерпели сокращение масштабов, когда было обнаружено, что (1) конверсия генов, обусловленная GC, вносит важный вклад в состав диплоидных организмов, таких как млекопитающие [160] и (2) бактериальные геномы часто имеют AT-смещенная мутация. [161]

Современные представления о роли предубеждений, связанных с мутациями, отражают теорию, отличную от теории Холдейна и Фишера. Более поздняя работа [151] показала, что первоначальная теория «давления» предполагает, что эволюция основана на постоянных вариациях: когда эволюция зависит от введения новых аллелей, мутационные ошибки и ошибки развития во введении могут наложить искажения на эволюцию, не требуя нейтральной эволюции или высокая частота мутаций .

Несколько недавних исследований сообщают, что мутации, участвующие в адаптации, отражают общие предубеждения мутаций [162] [163] [164], хотя другие оспаривают эту интерпретацию. [165]

"> Воспроизвести медиа
Визуальная демонстрация быстрой эволюции устойчивости к антибиотикам у E. coli, растущей на планшете с увеличивающимися концентрациями триметоприма . [166]

Эволюция влияет на все аспекты формы и поведения организмов. Наиболее заметны специфические поведенческие и физические адаптации, являющиеся результатом естественного отбора. Эти приспособления повышают физическую форму, помогая таким действиям, как поиск пищи, избегание хищников или привлечение партнеров. Организмы также могут реагировать на отбор, сотрудничая друг с другом, обычно помогая своим родственникам или вступая во взаимовыгодный симбиоз . В более долгосрочной перспективе эволюция порождает новые виды путем разделения предковых популяций организмов на новые группы, которые не могут или не будут скрещиваться.

Эти результаты эволюции различаются по шкале времени как макроэволюция и микроэволюция. Макроэволюция относится к эволюции, которая происходит на уровне видов или выше, в частности, к видообразованию и исчезновению; тогда как микроэволюция относится к меньшим эволюционным изменениям внутри вида или популяции, в частности к сдвигам в частоте аллелей и адаптации. [167] В целом макроэволюция рассматривается как результат длительных периодов микроэволюции. [168] Таким образом, различие между микро- и макроэволюцией не является фундаментальным - разница просто во времени. [169] Однако в макроэволюции могут иметь значение черты всего вида. Например, большое количество вариаций среди индивидуумов позволяет виду быстро адаптироваться к новым местам обитания , уменьшая вероятность его вымирания, в то время как широкий географический диапазон увеличивает вероятность видообразования, повышая вероятность того, что часть популяции перестанет существовать. стать изолированным. В этом смысле микроэволюция и макроэволюция могут включать отбор на разных уровнях - с микроэволюцией, действующей на гены и организмы, в отличие от макроэволюционных процессов, таких как отбор видов, воздействующих на целые виды и влияющих на темпы их видообразования и исчезновения. [170] [171] [172]

Распространенное заблуждение состоит в том, что у эволюции есть цели, долгосрочные планы или врожденная тенденция к «прогрессу», выраженная в таких убеждениях, как ортогенез и эволюционизм; На самом деле, однако, эволюция не имеет долгосрочной цели и не обязательно приводит к большей сложности. [173] [174] [175] Хотя сложные виды эволюционировали, они возникают как побочный эффект увеличения общего числа организмов, а простые формы жизни по-прежнему более распространены в биосфере. [176] Например, подавляющее большинство видов - микроскопические прокариоты , которые, несмотря на свой небольшой размер, составляют около половины мировой биомассы [177] и составляют подавляющее большинство биоразнообразия Земли. [178] Таким образом, простые организмы были доминирующей формой жизни на Земле на протяжении всей ее истории и продолжают оставаться основной формой жизни до наших дней, при этом сложная жизнь кажется более разнообразной только потому, что она более заметна . [179] Действительно, эволюция микроорганизмов особенно важна для современных эволюционных исследований , поскольку их быстрое размножение позволяет изучать экспериментальную эволюцию и наблюдать эволюцию и адаптацию в реальном времени. [180] [181]

Приспособление

Гомологические кости конечностей четвероногих . Кости этих животных имеют одинаковую базовую структуру, но адаптированы для конкретных целей.

Адаптация - это процесс, который делает организмы более приспособленными к их среде обитания. [182] [183] Кроме того, термин «адаптация» может относиться к признаку, который важен для выживания организма. Например, приспособление лошадиных зубов к измельчению травы. Используя термин « адаптация» для описания эволюционного процесса и адаптивного признака продукта (части тела или функции), можно различить два значения этого слова. Адаптации производятся естественным отбором. [184] Следующие определения принадлежат Феодосию Добжанскому:

  1. Адаптация - это эволюционный процесс, в результате которого организм становится лучше приспособлен к своей среде обитания или местам обитания. [185]
  2. Адаптированность - это состояние адаптированности: степень, в которой организм способен жить и воспроизводиться в данном наборе сред обитания. [186]
  3. Адаптивная черта является одним из аспектов картины развития организма , который включает или повышает вероятность того , что организм выживать и воспроизводиться. [187]

Адаптация может вызвать либо усиление новой функции, либо потерю наследственной особенности. Примером, демонстрирующим оба типа изменений, является адаптация бактерий к отбору антибиотиков, при этом генетические изменения, вызывающие устойчивость к антибиотикам, как за счет модификации мишени лекарства, так и за счет увеличения активности переносчиков, которые выкачивают лекарство из клетки. [188] Другими яркими примерами являются бактерии Escherichia coli, развивающие способность использовать лимонную кислоту в качестве питательного вещества в долгосрочном лабораторном эксперименте , [189] Flavobacterium развивает новый фермент, который позволяет этим бактериям расти на побочных продуктах нейлона. производство, [190] [191] и почвенная бактерия Sphingobium, развивающая совершенно новый метаболический путь, который разрушает синтетический пестицид пентахлорфенол . [192] [193] Интересная, но все же спорная идея состоит в том, что некоторые адаптации могут увеличить способность организмов генерировать генетическое разнообразие и адаптироваться посредством естественного отбора (увеличивая эволюционируемость организмов). [194] [195] [196] [197] [198]

Усатые киты скелет. Буквы a и b обозначают кости плавников , которые были адаптированы из костей передних ног , в то время как c указывает на рудиментарные кости ног, что предполагает адаптацию от суши к морю. [199]

Адаптация происходит через постепенное изменение существующих структур. Следовательно, структуры со сходной внутренней организацией могут выполнять разные функции в родственных организмах. Это результат того, что единая предковая структура приспособлена функционировать по-разному. Кости в крыльях летучих мышей , например, очень похожи на кости ног мышей и рук приматов из-за того, что все эти структуры произошли от общего предка млекопитающих. [200] Однако, поскольку все живые организмы в некоторой степени связаны между собой, [201] даже органы, которые, по всей видимости, не имеют структурного сходства, такие как глаза членистоногих , кальмаров и позвоночных , или конечности и крылья членистоногих и позвоночных, могут зависят от общего набора гомологичных генов, которые контролируют их сборку и функцию; это называется глубокой гомологией . [202] [203]

В процессе эволюции некоторые структуры могут потерять свою первоначальную функцию и стать рудиментарными структурами . [204] Такие структуры могут иметь незначительную функцию или вообще не выполнять ее у нынешних видов, но все же иметь четкую функцию у предковых или других близкородственных видов. Примеры включают псевдогены , [205] нефункциональные остатки глаз у слепых пещерных рыб, [206] крылья у нелетающих птиц, [207] наличие тазобедренных костей у китов и змей, [199] и половые признаки у организмов. которые воспроизводятся путем бесполого размножения. [208] Примеры рудиментарных структур в организме человека включают зубы мудрости , [209] копчик , [204] червеобразный отросток , [204] и другие поведенческие остатки , такие как мурашки [210] [211] и примитивные рефлексы . [212] [213] [214]

Однако многие черты, которые кажутся простыми адаптациями, на самом деле являются эксаптациями : структуры, изначально адаптированные для одной функции, но по совпадению стали полезными для некоторых других функций в этом процессе. [215] Одним из примеров является африканская ящерица Holaspis guentheri , у которой развилась чрезвычайно плоская голова, позволяющая прятаться в расщелинах, что можно увидеть, посмотрев на ее ближайших родственников. Однако у этого вида голова стала настолько уплощенной, что помогает скользить с дерева на дерево - эксаптация. [215] Внутри клеток молекулярные машины, такие как бактериальные жгутики [216] и механизмы сортировки белков [217], развивались путем привлечения нескольких ранее существовавших белков, которые ранее выполняли разные функции. [167] Другой пример - привлечение ферментов гликолиза и метаболизма ксенобиотиков в качестве структурных белков, называемых кристаллинами, в хрусталиках глаз организмов. [218] [219]

Область современных исследований в эволюционной биологии развития - это эволюционная основа адаптаций и эксаптаций. [220] Это исследование рассматривает происхождение и эволюцию эмбрионального развития и то, как модификации развития и процессов развития создают новые особенности. [221] Эти исследования показали, что эволюция может изменять развитие, создавая новые структуры, такие как эмбриональные костные структуры, которые развиваются в челюсть у других животных, вместо того, чтобы формировать часть среднего уха у млекопитающих . [222] Также возможно, что структуры, которые были утрачены в ходе эволюции, снова появятся из-за изменений в генах развития, таких как мутация у кур, из-за которой у эмбрионов вырастают зубы, похожие на зубы крокодилов . [223] Сейчас становится ясно, что большинство изменений в форме организмов происходит из-за изменений в небольшом наборе консервативных генов. [224]

Коэволюция

Обыкновенная подвязочная змея ( Thamnophis sirtalis sirtalis ) выработала устойчивость к защитному веществу тетродотоксину у своей жертвы-амфибии.

Взаимодействие между организмами может привести как к конфликту, так и к сотрудничеству. Когда взаимодействие происходит между парами видов, такими как патоген и хозяин или хищник и его жертва, эти виды могут развивать согласованные наборы адаптаций. Здесь эволюция одного вида вызывает адаптацию у второго вида. Эти изменения у второго вида, в свою очередь, вызывают новые адаптации у первого вида. Этот цикл отбора и реакции называется коэволюцией. [225] Примером может служить производство тетродотоксина у тритона с грубой кожей и эволюция устойчивости к тетродотоксину у его хищника, обыкновенной подвязочной змеи . В этой паре хищник-жертва эволюционная гонка вооружений произвела высокий уровень токсина у тритона и, соответственно, высокий уровень устойчивости к токсину у змеи. [226]

Сотрудничество

Не все совместно эволюционирующие взаимодействия между видами связаны с конфликтами. [227] Возникло много случаев взаимовыгодного взаимодействия. Например, существует тесное сотрудничество между растениями и микоризными грибами, которые растут на их корнях и помогают растениям поглощать питательные вещества из почвы. [228] Это взаимная взаимосвязь, поскольку растения обеспечивают грибы сахарами в результате фотосинтеза . Здесь грибы фактически растут внутри клеток растений, позволяя им обмениваться питательными веществами со своими хозяевами, посылая сигналы , подавляющие иммунную систему растений . [229]

Коалиции между организмами одного и того же вида также развивались. Крайним случаем является эусоциальность социальных насекомых, таких как пчелы , термиты и муравьи , когда стерильные насекомые кормят и охраняют небольшое количество организмов в колонии , способных к размножению. В еще меньшем масштабе соматические клетки, составляющие тело животного, ограничивают их размножение, поэтому они могут поддерживать стабильный организм, который затем поддерживает небольшое количество половых клеток животного для производства потомства. Здесь соматические клетки реагируют на определенные сигналы, которые инструктируют их, расти, оставаться такими, как они есть, или умереть. Если клетки игнорируют эти сигналы и размножаются ненадлежащим образом, их неконтролируемый рост вызывает рак . [230]

Такое сотрудничество внутри вида могло развиться в процессе родственного отбора , когда один организм действует, чтобы помочь вырастить потомство родственника. [231] Это действие выбрано, потому что, если помогающий человек содержит аллели, которые способствуют вспомогательному действию, вполне вероятно, что его родственники также будут содержать эти аллели и, таким образом, эти аллели будут переданы. [232] Другие процессы, которые могут способствовать сотрудничеству, включают групповой отбор , когда сотрудничество приносит пользу группе организмов. [233]

Видообразование

Четыре географических способа видообразования

Видообразование - это процесс, при котором вид разделяется на два или более видов-потомков. [234]

Есть несколько способов определить понятие «вид». Выбор определения зависит от особенностей рассматриваемого вида. [235] Например, некоторые видовые концепции более применимы к организмам, воспроизводящим половым путем, в то время как другие лучше подходят к бесполым организмам. Несмотря на разнообразие представлений о различных видах, эти различные концепции можно отнести к одному из трех широких философских подходов: межпородному скрещиванию, экологическому и филогенетическому. [236] Концепция биологических видов - классический пример метода скрещивания. Согласно определению биолога-эволюциониста Эрнста Майра в 1942 году, BSC утверждает, что «виды - это группы фактически или потенциально скрещивающихся естественных популяций, которые репродуктивно изолированы от других подобных групп». [237] Несмотря на широкое и долгосрочное использование, BSC, как и другие, не лишен противоречий, например, потому что эти концепции не могут быть применены к прокариотам, [238] и это называется проблемой видов . [235] Некоторые исследователи предприняли попытку унифицированного монистического определения видов, в то время как другие придерживаются плюралистического подхода и предполагают, что могут существовать разные способы логической интерпретации определения вида. [235] [236]

Барьеры на пути к воспроизводству между двумя расходящимися половыми популяциями необходимы для того, чтобы популяции стали новыми видами. Поток генов может замедлить этот процесс, распространяя новые генетические варианты также на другие популяции. В зависимости от того, насколько далеко два вида разошлись с момента их последнего общего предка , у них все еще может быть возможность произвести потомство, как в случае спаривания лошадей и ослов для получения мулов . [239] Такие гибриды обычно бесплодны . В этом случае близкородственные виды могут регулярно скрещиваться, но гибриды будут отбираться против, и виды останутся отличными. Однако время от времени образуются жизнеспособные гибриды, и эти новые виды могут обладать либо промежуточными свойствами между родительскими видами, либо обладать совершенно новым фенотипом. [240] Значение гибридизации в производстве новых видов животных , остается неясным, хотя случаи были замечены во многих видах животных, [241] с серыми квакшами будучи особенно хорошо изученный примером. [242]

Видообразование наблюдалось несколько раз как в контролируемых лабораторных условиях (см. Лабораторные эксперименты по видообразованию ), так и в природе. [243] У организмов, размножающихся половым путем, видообразование является результатом репродуктивной изоляции, за которой следует генеалогическое расхождение. Есть четыре основных географических способа видообразования. Наиболее распространенным у животных является аллопатрическое видообразование , которое происходит в популяциях, изначально изолированных географически, например, в результате фрагментации среды обитания или миграции. Отбор в этих условиях может вызвать очень быстрые изменения внешнего вида и поведения организмов. [244] [245] Поскольку отбор и дрейф действуют независимо на популяции, изолированные от остальных их видов, разделение может в конечном итоге привести к появлению организмов, которые не могут скрещиваться. [246]

Второй способ видообразования - это перипатрическое видообразование , которое происходит, когда небольшие популяции организмов становятся изолированными в новой среде. Это отличается от аллопатрического видообразования тем, что изолированные популяции численно намного меньше, чем родительская популяция. Здесь эффект основателя вызывает быстрое видообразование после того, как увеличение инбридинга увеличивает отбор гомозигот, что приводит к быстрым генетическим изменениям. [247]

Третий способ - парапатрическое видообразование . Это похоже на перипатрическое видообразование в том, что небольшая популяция проникает в новую среду обитания, но отличается тем, что между этими двумя популяциями нет физического разделения. Вместо этого видообразование является результатом эволюции механизмов, которые уменьшают поток генов между двумя популяциями. [234] Обычно это происходит, когда произошло резкое изменение окружающей среды в среде обитания родительского вида. Одним из примеров является трава Anthoxanthum odoratum , которая может претерпевать парапатрическое видообразование в ответ на локальное загрязнение металлами из шахт. [248] Здесь развиваются растения, обладающие устойчивостью к высоким уровням металлов в почве. Отбор против скрещивания с родительской популяцией, чувствительной к металлам, привел к постепенному изменению времени цветения устойчивых к металлу растений, что в конечном итоге привело к полной репродуктивной изоляции. Отбор против гибридов между двумя популяциями может вызвать подкрепление , которое представляет собой эволюцию признаков, способствующих спариванию внутри вида, а также смещение признаков , когда два вида становятся более разными по внешнему виду. [249]

Географическая изоляция из вьюрков на Галапагосских островах выпустил более десятка новых видов.

Наконец, в симпатрическом видообразовании виды расходятся без географической изоляции или изменений среды обитания. Эта форма встречается редко, поскольку даже небольшой поток генов может устранить генетические различия между частями популяции. [250] Обычно симпатрическое видообразование у животных требует эволюции как генетических различий, так и неслучайного спаривания , чтобы позволить репродуктивную изоляцию развиваться. [251]

Один тип симпатрического видообразования включает скрещивание двух родственных видов для получения нового гибридного вида. Это не характерно для животных, поскольку гибриды животных обычно бесплодны. Это происходит потому , что во время мейоза в гомологичных хромосомах от каждого родителя из разных видов и не могут успешно выполнить сопряжение. Однако это чаще встречается у растений, потому что растения часто удваивают количество хромосом, образуя полиплоиды . [252] Это позволяет хромосомам каждого родительского вида образовывать подходящие пары во время мейоза, поскольку хромосомы каждого родителя уже представлены парой. [253] Примером такого события видообразования является скрещивание видов растений Arabidopsis thaliana и Arabidopsis arenosa с образованием нового вида Arabidopsis suecica . [254] Это произошло около 20 000 лет назад, [255] и процесс видообразования был повторен в лаборатории, что позволяет изучить генетические механизмы, участвующие в этом процессе. [256] Действительно, удвоение хромосом внутри вида может быть частой причиной репродуктивной изоляции, так как половина удвоенных хромосом не будет иметь себе равных при скрещивании с недвойственными организмами. [257]

События видообразования важны в теории прерывистого равновесия , которая объясняет в летописи окаменелостей короткие «всплески» эволюции, перемежающиеся относительно длительными периодами застоя, когда виды остаются относительно неизменными. [258] В этой теории видообразование и быстрая эволюция связаны с естественным отбором и генетическим дрейфом, наиболее сильно воздействующими на организмы, претерпевающие видообразование в новых средах обитания или небольших популяциях. В результате периоды застоя в летописи окаменелостей соответствуют родительской популяции, а организмы, претерпевающие видообразование и быструю эволюцию, обнаруживаются в небольших популяциях или географически ограниченных средах обитания и поэтому редко сохраняются в виде окаменелостей. [171]

Вымирание

Тираннозавр рекс . ОТСУТСТВИЯ птичьи динозавры вымерли в вымирание мела и палеогена в конце мелового периода.

Вымирание - это исчезновение целого вида. Вымирание не является чем-то необычным, поскольку виды регулярно появляются в результате видообразования и исчезают в результате исчезновения. [259] Почти все виды животных и растений, которые жили на Земле, в настоящее время вымерли, [260] и исчезновение, по-видимому, является конечной судьбой всех видов. [261] Эти вымирания происходили постоянно на протяжении всей истории жизни, хотя скорость вымирания резко возрастает из-за случайных событий массового вымирания . [262] мел-палеоген вымирание , в течение которого нептичьих динозавры вымерли, является наиболее хорошо известным, но ранее пермотриасовым вымирание было еще более серьезным, причем примерно 96% от всех видов морских доведенных до вымирание. [262] голоцен вымирание является постоянным массовым вымиранием связаны с расширением человечества по всему миру за последние несколько тысяч лет. Современные темпы исчезновения в 100–1000 раз превышают фоновые, и к середине 21 века может исчезнуть до 30% существующих видов. [263] Человеческая деятельность в настоящее время является основной причиной продолжающегося вымирания; [264] [265] глобальное потепление может еще больше ускорить его в будущем. [266] Несмотря на предполагаемое исчезновение более 99 процентов всех видов, когда-либо живших на Земле, [267] [268] в настоящее время на Земле обитает около 1 триллиона видов, из которых описана лишь одна тысячная процента. [269]

Роль вымирания в эволюции не очень хорошо изучена и может зависеть от того, какой тип вымирания рассматривается. [262] Причины непрерывных вымираний «низкого уровня», которые образуют большинство вымираний, могут быть результатом конкуренции между видами за ограниченные ресурсы ( принцип конкурентного исключения ). [56] Если один вид сможет конкурировать с другим, это может привести к отбору видов, при этом наиболее подходящие виды выживут, а другие виды будут вымерены. [122] Периодические массовые вымирания также важны, но вместо того, чтобы действовать как сила отбора, они резко сокращают разнообразие неспецифическим образом и способствуют всплескам быстрой эволюции и видообразования выживших. [270]

Происхождение жизни

Земли составляет около 4,54 миллиарда лет. [271] [272] [273] Самое раннее неоспоримое свидетельство существования жизни на Земле датируется по крайней мере 3,5 миллиарда лет назад, [13] [274] во время эоархейской эры, после того, как геологическая кора начала затвердевать после более раннего расплавленного Хадейского эона . Окаменелости микробных матов были найдены в песчанике возрастом 3,48 миллиарда лет в Западной Австралии. [15] [16] [17] Другим ранним вещественным доказательством наличия биогенного вещества является графит в метаосадочных породах возрастом 3,7 миллиарда лет, обнаруженных в Западной Гренландии [14], а также «остатки биотической жизни », обнаруженные в течение 4,1 миллиарда лет. -старые породы в Западной Австралии. [275] [276] Комментируя австралийские открытия, Стивен Блэр Хеджес написал: «Если жизнь возникла на Земле относительно быстро, то она могла бы стать обычным явлением во Вселенной». [275] [277] В июле 2016, ученые сообщили , идентифицирующий набор 355 генов из последнего универсального общего предка (LUCA) всех организмов , живущих на Земле. [278]

По оценкам, более 99 процентов всех видов, насчитывающих более пяти миллиардов видов [279] , когда-либо обитавших на Земле, вымерли. [267] [268] Оценки числа существующих на Земле видов варьируются от 10 миллионов до 14 миллионов, [280] [281] из которых около 1,9 миллиона, по оценкам, были названы [282] и 1,6 миллиона задокументированы в центральной базе данных. на сегодняшний день [283], по крайней мере 80 процентов еще не описаны.

Считается, что высокоэнергетическая химия произвела самовоспроизводящуюся молекулу около 4 миллиардов лет назад, а полмиллиарда лет спустя существовал последний общий предок всей жизни . [11] Текущий научный консенсус состоит в том, что сложная биохимия, из которой состоит жизнь, возникла в результате более простых химических реакций. [284] [285] Начало жизни могло включать самореплицирующиеся молекулы, такие как РНК [286], и сборку простых клеток. [287]

Общий спуск

Все организмы на Земле произошли от общего предка или наследственного генофонда . [201] [288] Современные виды - это этап в процессе эволюции, а их разнообразие - результат долгой серии событий видообразования и исчезновения. [289] Общее происхождение организмов было впервые выведено из четырех простых фактов об организмах: во-первых, они имеют географическое распространение, которое нельзя объяснить местной адаптацией. Во-вторых, разнообразие жизни - это не набор совершенно уникальных организмов, а организмов, которые имеют общие морфологические черты. В-третьих, рудиментарные черты без четкой цели напоминают функциональные наследственные черты. В-четвертых, организмы можно классифицировать, используя эти сходства, в иерархию вложенных групп, подобную генеалогическому древу. [290]

В гуманоидах являются потомками общего предка .

Современные исследования показали, что из-за горизонтального переноса генов это «древо жизни» может быть более сложным, чем простое ветвящееся дерево, поскольку некоторые гены независимо распространились между отдаленно родственными видами. [291] [292] Чтобы решить эту и другие проблемы, некоторые авторы предпочитают использовать « Коралл жизни » в качестве метафоры или математической модели для иллюстрации эволюции жизни. Эта точка зрения восходит к идее, кратко упомянутой Дарвином, но позже от которой отказались. [293]

Прошлые виды также оставили записи о своей эволюционной истории. Ископаемые останки, наряду со сравнительной анатомией современных организмов, составляют морфологическую или анатомическую летопись. [294] Сравнивая анатомию как современных, так и вымерших видов, палеонтологи могут сделать вывод о происхождении этих видов. Однако этот подход наиболее эффективен для организмов с твердыми частями тела, такими как раковины, кости или зубы. Кроме того, поскольку прокариоты, такие как бактерии и археи, имеют ограниченный набор общих морфологий, их окаменелости не предоставляют информации об их происхождении.

Совсем недавно доказательства общего происхождения были получены в результате изучения биохимических сходств между организмами. Например, все живые клетки используют один и тот же базовый набор нуклеотидов и аминокислот . [295] Развитие молекулярной генетики выявило свидетельства эволюции, оставшиеся в геномах организмов: датирование, когда виды расходились, с помощью молекулярных часов, вызванных мутациями. [296] Например, эти сравнения последовательностей ДНК показали, что люди и шимпанзе имеют 98% общих геномов, и анализ нескольких областей, в которых они различаются, помогает пролить свет на то, когда существовал общий предок этих видов. [297]

Эволюция жизни

EuryarchaeotaNanoarchaeotaCrenarchaeotaProtozoaAlgaePlantSlime moldsAnimalFungusGram-positive bacteriaChlamydiaeChloroflexiActinobacteriaPlanctomycetesSpirochaetesFusobacteriaCyanobacteriaThermophilesAcidobacteriaProteobacteria
Эволюционное древо, показывающее отклонение современных видов от их общего предка, в центре. [298] Три домена окрашены в синий цвет, бактерии - в синий, археи - в зеленый, а эукариоты - в красный.

Прокариоты населяли Землю примерно 3-4 миллиарда лет назад. [299] [300] Никаких очевидных изменений в морфологии или клеточной организации у этих организмов в течение следующих нескольких миллиардов лет не произошло. [301] Эукариотические клетки возникли между 1,6 и 2,7 миллиардами лет назад. Следующее серьезное изменение в клеточной структуре произошло, когда бактерии были поглощены эукариотическими клетками в кооперативной ассоциации, называемой эндосимбиозом . [302] [303] Поглощенные бактерии и клетка-хозяин затем подверглись совместной эволюции, при этом бактерии эволюционировали в митохондрии или гидрогеносомы . [304] Другое поглощение организмов, похожих на цианобактерии, привело к образованию хлоропластов в водорослях и растениях. [305]

История жизни была историей одноклеточных эукариот, прокариот и архей примерно до 610 миллионов лет назад, когда многоклеточные организмы начали появляться в океанах в эдиакарский период. [299] [306] эволюция многоклеточности произошла в нескольких независимых событиях, в организмах , как разнообразно , как губки , бурые водоросли , цианобактерий, миксомицеты и миксобактерии . [307] В январе 2016 года ученые сообщили, что около 800 миллионов лет назад небольшое генетическое изменение в одной молекуле под названием GK-PID могло позволить организмам перейти от одноклеточного организма к одной из многих клеток. [308]

Вскоре после появления этих первых многоклеточных организмов в течение примерно 10 миллионов лет появилось значительное количество биологического разнообразия в результате события, названного кембрийским взрывом . Здесь большинство видов современных животных появилось в летописи окаменелостей, а также уникальные линии, которые впоследствии вымерли. [309] Были предложены различные триггеры кембрийского взрыва, включая накопление кислорода в атмосфере в результате фотосинтеза. [310]

Около 500 миллионов лет назад растения и грибы заселили землю, а вскоре за ними последовали членистоногие и другие животные. [311] Насекомые были особенно успешными и даже сегодня составляют большинство видов животных. [312] Амфибии впервые появились около 364 миллионов лет назад, за ними последовали ранние амниоты и птицы около 155 миллионов лет назад (оба из « рептилийных » линий), млекопитающие около 129 миллионов лет назад, гоминины около 10 миллионов лет назад и современные люди. около 250 000 лет назад. [313] [314] [315] Однако, несмотря на эволюцию этих крупных животных, более мелкие организмы, подобные типам, которые развились на ранней стадии этого процесса, по-прежнему очень успешны и доминируют на Земле, при этом большая часть биомассы и видов прокариоты. [178]

Концепции и модели, используемые в эволюционной биологии, такие как естественный отбор, имеют множество приложений. [316]

Искусственный отбор - это преднамеренный отбор признаков в популяции организмов. Это использовалось на протяжении тысячелетий при приручении растений и животных. [317] В последнее время такой отбор стал жизненно важной частью генной инженерии , при этом селектируемые маркеры, такие как гены устойчивости к антибиотикам, используются для манипулирования ДНК. Белки с ценными свойствами эволюционировали в результате повторяющихся циклов мутации и отбора (например, модифицированные ферменты и новые антитела ) в процессе, называемом направленной эволюцией . [318]

Понимание изменений, произошедших в ходе эволюции организма, может выявить гены, необходимые для построения частей тела, гены, которые могут быть вовлечены в генетические нарушения человека . [319] Например, мексиканская тетра - пещерная рыба- альбинос , потерявшая зрение в процессе эволюции. Совместное размножение разных популяций этой слепой рыбы дало потомство с функциональными глазами, поскольку разные мутации произошли в изолированных популяциях, которые развивались в разных пещерах. [320] Это помогло идентифицировать гены, необходимые для зрения и пигментации. [321]

Эволюционная теория имеет множество приложений в медицине. Многие болезни человека не являются статичными явлениями, но могут эволюционировать. Вирусы, бактерии, грибки и раковые образования становятся устойчивыми к иммунной защите хозяина , а также к фармацевтическим препаратам . [322] [323] [324] Те же проблемы возникают в сельском хозяйстве с устойчивостью к пестицидам [325] и гербицидам [326] . Возможно, что мы стоим перед концом эффективного срока службы большинства доступных антибиотиков [327], и для прогнозирования эволюции и эволюционируемости [328] наших патогенов и разработки стратегий для замедления или обхода этого требуется более глубокое знание сложных движущих сил эволюция на молекулярном уровне. [329]

В информатике моделирование эволюции с использованием эволюционных алгоритмов и искусственной жизни началось в 1960-х годах и было расширено за счет моделирования искусственного отбора. [330] Искусственная эволюция стала широко признанным методом оптимизации в результате работ Инго Рехенберга в 1960-х годах. Он использовал стратегии эволюции для решения сложных инженерных задач. [331] Генетические алгоритмы, в частности, стали популярными благодаря трудам Джона Генри Холланда . [332] Практические приложения также включают автоматическую эволюцию компьютерных программ . [333] Эволюционные алгоритмы теперь используются для решения многомерных задач более эффективно, чем программное обеспечение, созданное людьми-разработчиками, а также для оптимизации проектирования систем. [334]

Когда в 1870-х годах эволюция получила широкое признание, карикатуры на Чарльза Дарвина с обезьяной или телом обезьяны символизировали эволюцию. [335]

В XIX веке, особенно после публикации « Происхождения видов» в 1859 году, идея о том, что жизнь эволюционировала, была активным источником академических дебатов, сосредоточенных на философских, социальных и религиозных последствиях эволюции. Сегодня современный эволюционный синтез принимается подавляющим большинством ученых. [56] Однако эволюция остается спорной концепцией для некоторых теистов . [336]

В то время как различные религии и конфессии примирили свои убеждения с эволюцией с помощью таких концепций, как теистическая эволюция , есть креационисты, которые считают, что эволюции противоречат мифы о творении, встречающиеся в их религиях, и которые выдвигают различные возражения против эволюции . [167] [337] [338] Как показали ответы на публикацию « Остатков естественной истории сотворения мира» в 1844 году, наиболее противоречивым аспектом эволюционной биологии является то, что человеческая эволюция считает, что люди имеют общее происхождение с обезьянами и обезьянами. что умственные и нравственные способности человечества имеют те же естественные причины, что и другие унаследованные черты животных. [339] В некоторых странах, особенно в Соединенных Штатах, эта напряженность между наукой и религией подпитывает нынешние противоречия между творением и эволюцией, религиозный конфликт, сосредоточенный на политике и государственном образовании . [340] В то время как другие научные области, такие как космология [341] и наука о Земле [342], также противоречат буквальным интерпретациям многих религиозных текстов , эволюционная биология встречает значительно большее сопротивление со стороны религиозных буквалистов.

Преподавание эволюции в американских классах биологии средней школы было необычным на протяжении большей части первой половины 20 века. Решение по делу о Скоупс от 1925 года привело к тому, что этот предмет стал очень редким в американских учебниках по вторичной биологии для целого поколения, но позже он был постепенно возвращен и стал юридически защищенным решением по делу Эпперсон против Арканзаса 1968 года . С тех пор, конкурируя религиозная вера креационизм была юридически запрещена в средней школьной программы в различных решений в 1970 - х и 1980 - х годов, но он вернулся в псевдонаучной форме , как интеллектуальный дизайн (ID), должны быть исключены еще раз в 2005 Kitzmiller ст. Dover Дело районного школьного округа . [343] Дебаты по поводу идей Дарвина не вызвали серьезных споров в Китае. [344]

  • Аргумент от плохого дизайна
  • Биологическая классификация
  • Доказательства общего происхождения
  • Эволюция в изменчивой среде
  • Эволюционная антропология
  • Эволюционная экология
  • Эволюционная эпистемология
  • Эволюционная нейробиология
  • Эволюция биологической сложности
  • Эволюция растений
  • Проект Стив
  • Хронология эволюционной истории жизни
  • Универсальный дарвинизм

  1. ↑ Холл и Халльгримссон, 2008 , стр.  4–6.
  2. ^ «Ресурсы эволюции» . Вашингтон, округ Колумбия: Национальные академии наук, инженерии и медицины . 2016. Архивировано 3 июня 2016 года .
  3. ^ a b Futuyma & Kirkpatrick 2017 , стр. 79–102, Глава 4: Мутации и вариации
  4. ^ Скотт-Филлипс, Томас С.; Laland, Kevin N .; Шукер, Дэвид М .; Дикинс, Томас Э .; Уэст, Стюарт А. (май 2014 г.). "Перспектива строительства ниши: критическая оценка" . Эволюция . 68 (5): 1231–1243. DOI : 10.1111 / evo.12332 . ISSN  0014-3820 . PMC  4261998 . PMID  24325256 . Эволюционные процессы обычно рассматриваются как процессы, посредством которых происходят эти изменения. Четыре таких процесса широко известны: естественный отбор (в широком смысле, включая половой отбор), генетический дрейф, мутации и миграция (Fisher 1930; Haldane 1932). Последние два порождают вариацию; первые два сортируют это.
  5. ↑ Холл и Халльгримссон, 2008 , стр. 3-5.
  6. ^ Voet, Voet и Pratt 2016 . С. 1-22, Глава 1: Введение в химию жизни
  7. ^ Дарвин 1859
  8. ^ а б Левонтин, Ричард С. (ноябрь 1970 г.). «Единицы отбора» (PDF) . Ежегодный обзор экологии и систематики . 1 : 1–18. DOI : 10.1146 / annurev.es.01.110170.000245 . ISSN  1545-2069 . JSTOR  2096764 . Архивировано (PDF) из оригинала 06.02.2015.
  9. ^ Futuyma & Киркпатрик 2017 , стр 3-26, Глава 1:. Эволюционная биология
  10. ^ Kampourakis 2014 , стр.  127-129
  11. ^ а б Дулиттл, У. Форд (февраль 2000 г.). «Искоренение древа жизни» (PDF) . Scientific American . 282 (2): 90–95. Bibcode : 2000SciAm.282b..90D . DOI : 10.1038 / Scientificamerican0200-90 . ISSN  0036-8733 . PMID  10710791 . Архивировано из оригинального (PDF) 07 сентября 2006 года . Проверено 5 апреля 2015 .
  12. ^ Глансдорф, Николас; Ин Сюй; Лабедан, Бернард (9 июля 2008 г.). «Последний всеобщий общий предок: возникновение, конституция и генетическое наследие неуловимого предшественника» . Биология Директ . 3 : 29. DOI : 10.1186 / 1745-6150-3-29 . ISSN  1745-6150 . PMC  2478661 . PMID  18613974 .
  13. ^ а б Шопф, Дж. Уильям ; Кудрявцев Анатолий Б .; Czaja, Andrew D .; Трипати, Абхишек Б. (5 октября 2007 г.). «Свидетельства архейской жизни: строматолиты и микрофоссилий». Докембрийские исследования . 158 (3–4): 141–155. Bibcode : 2007PreR..158..141S . DOI : 10.1016 / j.precamres.2007.04.009 . ISSN  0301-9268 .
  14. ^ а б Отомо, Йоко; Какегава, Такеши; Исида, Акизуми; и другие. (Январь 2014). «Доказательства биогенного графита в метаосадочных породах Исуа раннего архея». Природа Геонауки . 7 (1): 25–28. Bibcode : 2014NatGe ... 7 ... 25оС . DOI : 10.1038 / ngeo2025 . ISSN  1752-0894 .
  15. ^ а б Боренштейн, Сет (13 ноября 2013 г.). «Старые ископаемые найдено: Встретить вашу микробной мама» . Волнуйтесь . Йонкерс, Нью-Йорк: Интерактивная сеть Mindspark . Ассошиэйтед Пресс . Архивировано 29 июня 2015 года . Проверено 31 мая 2015 .
  16. ^ а б Перлман, Джонатан (13 ноября 2013 г.). «Найдены древнейшие признаки жизни на Земле» . Дейли телеграф . Лондон. Архивировано 16 декабря 2014 года . Проверено 15 декабря 2014 .
  17. ^ а б Ноффке, Нора; Кристиан, Даниэль; Уэйси, Дэвид; Хейзен, Роберт М. (16 ноября 2013 г.). «Микробно-индуцированные осадочные структуры, регистрирующие древнюю экосистему в формации Дрессера возрастом около 3,48 миллиардов лет, Пилбара, Западная Австралия» . Астробиология . 13 (12): 1103–1124. Bibcode : 2013AsBio..13.1103N . DOI : 10.1089 / ast.2013.1030 . ISSN  1531-1074 . PMC  3870916 . PMID  24205812 .
  18. ^ Futuyma 2004 , стр. 33
  19. ^ Панно 2005 , стр. XV-16
  20. Перейти ↑ NAS 2008 , p. 17 Архивировано 30 июня 2015 в Wayback Machine.
  21. ^ Футуйма, Дуглас Дж. , Изд. (1999). «Эволюция, наука и общество: эволюционная биология и национальная программа исследований» (PDF) (Резюме). Нью-Брансуик, Нью-Джерси: Управление университетских публикаций, Рутгерс, Государственный университет Нью-Джерси . OCLC  43422991 . Архивировано 31 января 2012 года из оригинального (PDF) . Проверено 24 ноября 2014 .
  22. ^ Дарвин 1909 , стр. 53
  23. ^ Кирк, Raven & Шофилд 1983 , стр. 100-142, 280-321
  24. ^ Лукреций
  25. ^ Седли, Дэвид (2003). «Лукреций и Новый Эмпедокл» (PDF) . Лидс Международные классические исследования . 2 (4). ISSN  1477-3643 . Архивировано из оригинального (PDF) 23 августа 2014 года . Проверено 25 ноября 2014 .
  26. ^ Торри, Гарри Бил; Фелин, Фрэнсис (март 1937 г.). «Был ли Аристотель эволюционистом?». Ежеквартальный обзор биологии . 12 (1): 1–18. DOI : 10.1086 / 394520 . ISSN  0033-5770 . JSTOR  2808399 . S2CID  170831302 .
  27. ^ Халл, Дэвид Л. (декабрь 1967). «Метафизика эволюции». Британский журнал истории науки . Кембридж : Издательство Кембриджского университета от имени Британского общества истории науки . 3 (4): 309–337. DOI : 10.1017 / S0007087400002892 . JSTOR  4024958 .
  28. Перейти ↑ Mason 1962 , pp. 43–44
  29. Перейти ↑ Mayr 1982 , pp. 256–257
    • Луч 1686
  30. ^ Ваггонер, Бен (7 июля 2000 г.). «Карл Линней (1707–1778)» . Эволюция (онлайн-выставка). Беркли, Калифорния: Музей палеонтологии Калифорнийского университета . Архивировано 30 апреля 2011 года . Проверено 11 февраля 2012 .
  31. Перейти ↑ Bowler 2003 , pp. 73–75
  32. ^ «Эразм Дарвин (1731–1802)» . Эволюция (онлайн-выставка). Беркли, Калифорния: Музей палеонтологии Калифорнийского университета. 4 октября 1995 года архивации от оригинала на 2012-01-19 . Проверено 11 февраля 2012 .
  33. ^ Ламарк 1809
  34. ^ a b Nardon & Grenier 1991 , стр. 162
  35. ^ Гизелин, Майкл Т. (сентябрь – октябрь 1994 г.). «Воображаемый Ламарк: взгляд на фальшивую историю» в школьных учебниках » . Письмо из учебника . OCLC  23228649 . Архивировано из оригинала на 2008-02-12 . Проверено 23 января 2008 .
  36. ^ Яблонька, Ева ; Лэмб, Мэрион Дж. (Август 2007 г.). «Краткая информация об эволюции в четырех измерениях». Поведенческие науки и науки о мозге . 30 (4): 353–365. DOI : 10.1017 / S0140525X07002221 . ISSN  0140-525X . PMID  18081952 . S2CID  15879804 .
  37. Перейти ↑ Burkhardt & Smith 1991
    • «Дарвин, CR в Лаббок, Джон» . Заочный проект Дарвина . Кембридж: Кембриджский университет . Архивировано 15 декабря 2014 года . Проверено 1 декабря 2014 . Письмо 2532, 22 ноября 1859 г.
  38. ^ Саллоуэй, Фрэнк Дж. (Июнь 2009 г.). «Почему Дарвин отверг разумный замысел». Журнал биологических наук . 34 (2): 173–183. DOI : 10.1007 / s12038-009-0020-8 . ISSN  0250-5991 . PMID  19550032 . S2CID  12289290 .
  39. ^ «Результаты поиска по запросу« спуск с модификацией »- Полное собрание сочинений Чарльза Дарвина в Интернете» .
  40. ^ Собер, Эллиотт (16 июня 2009 г.). «Дарвин написал« Происхождение » задом наперед?» . Proc. Natl. Акад. Sci. США 106 (Приложение 1): 10048–10055. Bibcode : 2009PNAS..10610048S . DOI : 10.1073 / pnas.0901109106 . ISSN  0027-8424 . PMC  2702806 . PMID  19528655 .
  41. Перейти ↑ Mayr 2002 , p. 165
  42. Перейти ↑ Bowler 2003 , pp. 145–146
  43. ^ Сокал, Роберт Р .; Кровелло, Теодор Дж. (Март – апрель 1970 г.). «Концепция биологических видов: критическая оценка». Американский натуралист . 104 (936): 127–153. DOI : 10.1086 / 282646 . ISSN  0003-0147 . JSTOR  2459191 . S2CID  83528114 .
  44. ^ Дарвин, Чарльз ; Уоллес, Альфред (20 августа 1858 г.). «О тенденции видов к формированию разновидностей; и о сохранении разновидностей и видов естественными средствами отбора» . Журнал трудов Линнеевского общества Лондона. Зоология . 3 (9): 45–62. DOI : 10.1111 / j.1096-3642.1858.tb02500.x . ISSN  1096-3642 . Архивировано 14 июля 2007 года . Проверено 13 мая 2007 .
  45. ^ Десмонд, Адриан Дж. (17 июля 2014 г.). «Томас Генри Хаксли» . Энциклопедия Britannica Online . Чикаго, Иллинойс: Британская энциклопедия, Inc. Архивировано 19 января 2015 года . Проверено 2 декабря 2014 .
  46. ^ Ю. -С. Лю; XM Zhou; MX Zhi; XJ Li; QL Wang (сентябрь 2009 г.). «Вклад Дарвина в генетику». Журнал прикладной генетики . 50 (3): 177–184. DOI : 10.1007 / BF03195671 . ISSN  1234-1983 . PMID  19638672 . S2CID  19919317 .
  47. ^ Вейлинг, Франц (июль 1991 г.). «Историческое исследование: Иоганн Грегор Мендель 1822–1884». Американский журнал медицинской генетики . 40 (1): 1–25, обсуждение 26. doi : 10.1002 / ajmg.1320400103 . PMID  1887835 .
  48. ↑ Райт 1984 , стр. 480
  49. ^ Провин 1971
  50. ^ Stamhuis, Ida H .; Meijer, Onno G .; Зевенхейзен, Эрик Дж. А. (июнь 1999 г.). "Гуго де Фриз о наследственности, 1889–1903: статистика, менделевские законы, пангены, мутации". Исида . 90 (2): 238–267. DOI : 10.1086 / 384323 . JSTOR  237050 . PMID  10439561 . S2CID  20200394 .
  51. ^ a b Bowler 1989 , стр. 307-318.
  52. ^ Левинсон 2019 .
  53. ^ Watson, JD ; Крик, FHC (25 апреля 1953 г.). «Молекулярная структура нуклеиновых кислот: структура нуклеиновой кислоты дезоксирибозы» (PDF) . Природа . 171 (4356): 737–738. Bibcode : 1953Natur.171..737W . DOI : 10.1038 / 171737a0 . ISSN  0028-0836 . PMID  13054692 . S2CID  4253007 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.08.2014 . Проверено 4 декабря 2014 . Мы не ускользнули от нашего внимания, что определенное спаривание, которое мы постулировали, сразу же предполагает возможный механизм копирования генетического материала.
  54. Перейти ↑ Hennig 1999 , p. 280
  55. ^ Добжанский, Феодосий (март 1973 г.). «Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции» (PDF) . Американский учитель биологии . 35 (3): 125–129. CiteSeerX  10.1.1.324.2891 . DOI : 10.2307 / 4444260 . JSTOR  4444260 . S2CID  207358177 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.10.2015.
  56. ^ а б в Кучера, Ульрих ; Никлас, Карл Дж. (Июнь 2004 г.). «Современная теория биологической эволюции: расширенный синтез». Naturwissenschaften . 91 (6): 255–276. Bibcode : 2004NW ..... 91..255K . DOI : 10.1007 / s00114-004-0515-у . ISSN  1432-1904 . PMID  15241603 . S2CID  10731711 .
  57. ^ Avise, Джон К .; Айяла, Франсиско Дж. (11 мая 2010 г.). «В свете эволюции IV: Состояние человека» (PDF) . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 107 (Приложение 2): 8897–8901. DOI : 10.1073 / pnas.1003214107 . ISSN  0027-8424 . PMC  3024015 . PMID  20460311 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.08.2014 . Проверено 29 декабря 2014 .
  58. ^ Данчен, Этьен; Шармантье, Энн; Шампанское, Frances A .; Месуди, Алекс; Пужоль, Бенуа; Бланше, Саймон (июнь 2011 г.). «За пределами ДНК: интеграция инклюзивного наследования в расширенную теорию эволюции». Природа Обзоры Генетики . 12 (7): 475–486. DOI : 10.1038 / nrg3028 . ISSN  1471-0056 . PMID  21681209 . S2CID  8837202 .
  59. ^ Пильуччи и Мюллер 2010
  60. ^ Штурм, Ричард А .; Фрудакис, Тони Н. (август 2004 г.). «Цвет глаз: порталы в гены пигментации и происхождение». Тенденции в генетике . 20 (8): 327–332. DOI : 10.1016 / j.tig.2004.06.010 . ISSN  0168-9525 . PMID  15262401 .
  61. ^ а б Пирсон, Хелен (25 мая 2006 г.). «Генетика: что такое ген?». Природа . 441 (7092): 398–401. Bibcode : 2006Natur.441..398P . DOI : 10.1038 / 441398a . ISSN  0028-0836 . PMID  16724031 . S2CID  4420674 .
  62. ^ Visscher, Peter M .; Хилл, Уильям Г .; Рэй, Наоми Р. (апрель 2008 г.). «Наследственность в эпоху геномики - концепции и заблуждения». Природа Обзоры Генетики . 9 (4): 255–266. DOI : 10.1038 / nrg2322 . ISSN  1471-0056 . PMID  18319743 . S2CID  690431 .
  63. ^ Oetting, William S .; Блестящий, Мюррей Х .; Кинг, Ричард А. (август 1996 г.). «Клинический спектр альбинизма у человека». Молекулярная медицина сегодня . 2 (8): 330–335. DOI : 10.1016 / 1357-4310 (96) 81798-9 . ISSN  1357-4310 . PMID  8796918 .
  64. ^ a b Futuyma 2005 [ необходима страница ]
  65. ^ Филлипс, Патрик С. (ноябрь 2008 г.). «Эпистаз - важнейшая роль взаимодействия генов в структуре и эволюции генетических систем» . Природа Обзоры Генетики . 9 (11): 855–867. DOI : 10.1038 / nrg2452 . ISSN  1471-0056 . PMC  2689140 . PMID  18852697 .
  66. ^ а б Ронглинг Ву; Мин Лин (март 2006 г.). «Функциональное картирование - как отображать и изучать генетическую архитектуру динамических сложных признаков». Природа Обзоры Генетики . 7 (3): 229–237. DOI : 10.1038 / nrg1804 . ISSN  1471-0056 . PMID  16485021 . S2CID  24301815 .
  67. ^ Яблонька, Ева; Раз, Гал (июнь 2009 г.). «Трансгендерное эпигенетическое наследование: распространенность, механизмы и последствия для изучения наследственности и эволюции» (PDF) . Ежеквартальный обзор биологии . 84 (2): 131–176. CiteSeerX  10.1.1.617.6333 . DOI : 10.1086 / 598822 . ISSN  0033-5770 . PMID  19606595 . S2CID  7233550 .
  68. ^ Босдорф, Оливер; Аркури, Давиде; Richards, Christina L .; Пильуччи, Массимо (май 2010 г.). «Экспериментальное изменение метилирования ДНК влияет на фенотипическую пластичность экологически значимых признаков у Arabidopsis thaliana » (PDF) . Эволюционная экология . 24 (3): 541–553. DOI : 10.1007 / s10682-010-9372-7 . ISSN  0269-7653 . S2CID  15763479 .
  69. ^ Яблонька, Ева; Лэмб, Мэрион Дж. (Декабрь 2002 г.). «Меняющаяся концепция эпигенетики». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 981 (1): 82–96. Bibcode : 2002NYASA.981 ... 82J . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.2002.tb04913.x . ISSN  0077-8923 . PMID  12547675 . S2CID  12561900 .
  70. ^ Laland, Kevin N .; Стерельный, Ким (сентябрь 2006 г.). «Перспектива: семь причин (не) игнорировать строительство ниши» . Эволюция . 60 (9): 1751–1762. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2006.tb00520.x . ISSN  0014-3820 . PMID  17089961 . S2CID  22997236 .
  71. ^ Чепмен, Майкл Дж .; Маргулис, Линн (декабрь 1998 г.). «Морфогенез путем симбиогенеза» (PDF) . Международная микробиология . 1 (4): 319–326. ISSN  1139-6709 . PMID  10943381 . Архивировано из оригинального (PDF) 23 августа 2014 года . Проверено 9 декабря 2014 .
  72. ^ Уилсон, Дэвид Слоан ; Уилсон, Эдвард О. (декабрь 2007 г.). «Переосмысление теоретических основ социобиологии» (PDF) . Ежеквартальный обзор биологии . 82 (4): 327–348. DOI : 10.1086 / 522809 . ISSN  0033-5770 . PMID  18217526 . S2CID  37774648 . Архивировано из оригинального (PDF) 11.05.2011.
  73. ^ Батлин, Роджер К .; Трегенза, Том (28 февраля 1998 г.). «Уровни генетического полиморфизма: маркерные локусы по сравнению с количественными признаками» . Философские труды Королевского общества B . 353 (1366): 187–198. DOI : 10.1098 / rstb.1998.0201 . ISSN  0962-8436 . PMC  1692210 . PMID  9533123 .
    • Батлин, Роджер К .; Трегенза, Том (29 декабря 2000 г.). «Поправка на Бутлина и Трегенза, уровни генетического полиморфизма: маркерные локусы по сравнению с количественными признаками» . Философские труды Королевского общества B . 355 (1404): 1865. DOI : 10.1098 / rstb.2000.2000 . ISSN  0962-8436 . Некоторые значения в таблице 1 на стр. 193 были даны неверно. Ошибки не влияют на выводы, сделанные в статье. Исправленная таблица воспроизводится ниже.
  74. ^ Веттербом, Анна; Севов, Мари; Кавелье, Лючия; Бергстрём, Томас Ф. (ноябрь 2006 г.). «Сравнительный геномный анализ человека и шимпанзе указывает на ключевую роль инделей в эволюции приматов». Журнал молекулярной эволюции . 63 (5): 682–690. Bibcode : 2006JMolE..63..682W . DOI : 10.1007 / s00239-006-0045-7 . ISSN  0022-2844 . PMID  17075697 . S2CID  7257193 .
  75. ^ Амос, Уильям; Харвуд, Джон (28 февраля 1998 г.). «Факторы, влияющие на уровни генетического разнообразия в естественных популяциях» . Философские труды Королевского общества B . 353 (1366): 177–186. DOI : 10.1098 / rstb.1998.0200 . ISSN  0962-8436 . PMC  1692205 . PMID  9533122 .
  76. ^ a b Ewens 2004 [ необходима страница ]
  77. ^ Сойер, Стэнли А .; Парш, Джон; Чжан Чжи; Хартл, Дэниел Л. (17 апреля 2007 г.). «Преобладание положительного отбора среди почти нейтральных аминокислотных замен у дрозофилы » . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (16): 6504–6510. Bibcode : 2007PNAS..104.6504S . DOI : 10.1073 / pnas.0701572104 . ISSN  0027-8424 . PMC  1871816 . PMID  17409186 .
  78. ^ Hastings, PJ; Лупски, Джеймс Р .; Розенберг, Сьюзен М .; Ира, Гжегож (август 2009 г.). «Механизмы изменения числа копий гена» . Природа Обзоры Генетики . 10 (8): 551–564. DOI : 10.1038 / nrg2593 . ISSN  1471-0056 . PMC  2864001 . PMID  19597530 .
  79. ^ Кэрролл, Гренье и Уэтерби 2005 [ необходима страница ]
  80. ^ Харрисон, Пол М .; Герштейн, Марк (17 мая 2002 г.). «Изучение геномов на протяжении веков: семейства белков, псевдогены и эволюция протеома». Журнал молекулярной биологии . 318 (5): 1155–1174. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (02) 00109-2 . ISSN  0022-2836 . PMID  12083509 .
  81. ^ Боумейкер, Джеймс К. (май 1998 г.). «Эволюция цветового зрения у позвоночных» . Глаз . 12 (3b): 541–547. DOI : 10.1038 / eye.1998.143 . ISSN  0950-222X . PMID  9775215 . S2CID  12851209 .
  82. ^ Грегори, Т. Райан ; Хеберт, Пол Д. Н. (апрель 1999 г.). «Модуляция содержания ДНК: приблизительные причины и конечные последствия» . Геномные исследования . 9 (4): 317–324. DOI : 10,1101 / gr.9.4.317 (неактивный 2021-01-16). ISSN  1088-9051 . PMID  10207154 . Архивировано 23 августа 2014 года . Проверено 11 декабря 2014 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
  83. ^ Херлз, Мэтью (13 июля 2004 г.). "Дублирование генов: торговля запасными частями генома" . PLOS Биология . 2 (7): e206. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020206 . ISSN  1545-7885 . PMC  449868 . PMID  15252449 .
  84. ^ Лю, На; Окамура, Кацутомо; Тайлер, Дэвид М .; и другие. (Октябрь 2008 г.). «Эволюция и функциональная диверсификация генов микроРНК животных» . Клеточные исследования . 18 (10): 985–996. DOI : 10.1038 / cr.2008.278 . ISSN  1001-0602 . PMC  2712117 . PMID  18711447 .
  85. ^ Siepel, Адам (октябрь 2009 г.). «Дарвиновская алхимия: гены человека из некодирующей ДНК» . Геномные исследования . 19 (10): 1693–1695. DOI : 10.1101 / gr.098376.109 . ISSN  1088-9051 . PMC  2765273 . PMID  19797681 .
  86. ^ Оренго, Кристина А .; Торнтон, Джанет М. (июль 2005 г.). «Семейства белков и их эволюция - структурная перспектива». Ежегодный обзор биохимии . Ежегодные обзоры . 74 : 867–900. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.74.082803.133029 . ISSN  0066-4154 . PMID  15954844 . S2CID  7483470 .
  87. ^ Лонг, Маньюань; Бетран, Эстер; Торнтон, Кевин; Ван, Вэнь (ноябрь 2003 г.). «Происхождение новых генов: взгляды молодых и старых». Природа Обзоры Генетики . 4 (11): 865–875. DOI : 10.1038 / nrg1204 . ISSN  1471-0056 . PMID  14634634 . S2CID  33999892 .
  88. ^ Ван, Минглей; Каэтано-Аноллес, Густаво (14 января 2009 г.). «Эволюционная механика организации доменов в протеомах и рост модульности в белковом мире». Структура . 17 (1): 66–78. DOI : 10.1016 / j.str.2008.11.008 . ISSN  1357-4310 . PMID  19141283 .
  89. ^ Weissman, Kira J .; Мюллер, Рольф (14 апреля 2008 г.). «Белковые взаимодействия в мультиферментных мегасинтетазах». ChemBioChem . 9 (6): 826–848. DOI : 10.1002 / cbic.200700751 . ISSN  1439-4227 . PMID  18357594 . S2CID  205552778 .
  90. ^ Раддинг, Чарльз М. (декабрь 1982 г.). «Гомологичное спаривание и обмен цепями в генетической рекомбинации». Ежегодный обзор генетики . 16 : 405–437. DOI : 10.1146 / annurev.ge.16.120182.002201 . ISSN  0066-4197 . PMID  6297377 .
  91. ^ Агравал, Анейл Ф. (5 сентября 2006 г.). «Эволюция пола: почему организмы меняют свои генотипы?». Текущая биология . 16 (17): R696 – R704. CiteSeerX  10.1.1.475.9645 . DOI : 10.1016 / j.cub.2006.07.063 . ISSN  0960-9822 . PMID  16950096 . S2CID  14739487 .
  92. ^ Питерс, Эндрю Д .; Отто, Сара П. (июнь 2003 г.). «Освобождение генетической изменчивости через пол». BioEssays . 25 (6): 533–537. DOI : 10.1002 / bies.10291 . ISSN  0265-9247 . PMID  12766942 .
  93. ^ Годдард, Мэтью Р .; Годфрей, Х. Чарльз Дж .; Берт, Остин (31 марта 2005 г.). «Секс увеличивает эффективность естественного отбора в экспериментальных популяциях дрожжей». Природа . 434 (7033): 636–640. Bibcode : 2005Natur.434..636G . DOI : 10,1038 / природа03405 . ISSN  0028-0836 . PMID  15800622 . S2CID  4397491 .
  94. ↑ Мейнард Смит, 1978 [ необходима страница ]
  95. ^ а б Ридли 2004 , стр. 314
  96. ^ Ван Вален, Ли (1973). «Новый эволюционный закон» (PDF) . Эволюционная теория . 1 : 1–30. ISSN  0093-4755 . Архивировано из оригинального (PDF) 22 декабря 2014 года . Проверено 24 декабря 2014 .
  97. ^ Гамильтон, WD ; Аксельрод, Роберт ; Танезе, Рэйко (1 мая 1990 г.). «Половое размножение как приспособление к сопротивлению паразитам (обзор)» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (9): 3566–3573. Bibcode : 1990PNAS ... 87.3566H . DOI : 10,1073 / pnas.87.9.3566 . ISSN  0027-8424 . PMC  53943 . PMID  2185476 .
  98. ^ Birdsell & Wills 2003 , стр. 113-117
  99. ^ Bernstein H, Байерли HC, Хопфа FA, Michod RE. Генетические повреждения, мутации и эволюция пола. Наука. 1985 20 сентября; 229 (4719): 1277-81. DOI: 10.1126 / science.3898363. PMID 3898363
  100. ^ Bernstein H, Хопфа FA, Michod RE. Молекулярные основы эволюции пола. Adv Genet. 1987; 24: 323-70. DOI: 10,1016 / s0065-2660 (08) 60012-7. PMID 3324702
  101. ^ а б Morjan, Carrie L .; Ризеберг, Лорен Х. (июнь 2004 г.). «Как виды развиваются коллективно: влияние потока генов и отбора на распространение выгодных аллелей» . Молекулярная экология . 13 (6): 1341–1356. DOI : 10.1111 / j.1365-294X.2004.02164.x . ISSN  0962-1083 . PMC  2600545 . PMID  15140081 .
  102. ^ Баучер, Ян; Дуади, Кристоф Дж .; Папке, Р. Тейн; и другие. (Декабрь 2003 г.). «Боковой перенос генов и происхождение прокариотических групп». Ежегодный обзор генетики . 37 : 283–328. DOI : 10.1146 / annurev.genet.37.050503.084247 . ISSN  0066-4197 . PMID  14616063 .
  103. ^ Уолш, Тимоти Р. (октябрь 2006 г.). «Комбинаторная генетическая эволюция мультирезистентности». Текущее мнение в микробиологии . 9 (5): 476–482. DOI : 10.1016 / j.mib.2006.08.009 . ISSN  1369-5274 . PMID  16942901 .
  104. ^ Кондо, Нацуко; Никох, Наруо; Иджичи, Нобуюки; и другие. (29 октября 2002 г.). «Фрагмент генома эндосимбионта Wolbachia перенесен на Х-хромосому насекомого-хозяина» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (22): 14280–14285. Bibcode : 2002PNAS ... 9914280K . DOI : 10.1073 / pnas.222228199 . ISSN  0027-8424 . PMC  137875 . PMID  12386340 .
  105. ^ Спраг, Джордж Ф. младший (декабрь 1991 г.). «Генетический обмен между царствами». Текущее мнение в области генетики и развития . 1 (4): 530–533. DOI : 10.1016 / S0959-437X (05) 80203-5 . ISSN  0959-437X . PMID  1822285 .
  106. ^ Гладышев, Евгений А .; Мезельсон, Мэтью ; Архипова Ирина Р. (30 мая 2008 г.). «Массивный горизонтальный перенос генов у Bdelloid коловраток» . Наука . 320 (5880): 1210–1213. Bibcode : 2008Sci ... 320.1210G . DOI : 10.1126 / science.1156407 . ISSN  0036-8075 . PMID  18511688 . S2CID  11862013 .
  107. ^ Бальдо, Анджела М .; МакКлюр, Марселла А. (сентябрь 1999 г.). «Эволюция и горизонтальная передача генов, кодирующих dUTPase, в вирусах и их хозяевах» . Журнал вирусологии . 73 (9): 7710–7721. DOI : 10,1128 / JVI.73.9.7710-7721.1999 . ISSN  0022-538X . PMC  104298 . PMID  10438861 .
  108. ^ Ривера, Мария Ч .; Лейк, Джеймс А. (9 сентября 2004 г.). «Кольцо жизни свидетельствует о геномном происхождении эукариот». Природа . 431 (7005): 152–155. Bibcode : 2004Natur.431..152R . DOI : 10,1038 / природа02848 . ISSN  0028-0836 . PMID  15356622 . S2CID  4349149 .
  109. ^ а б в Херст, Лоуренс Д. (февраль 2009 г.). «Фундаментальные концепции генетики: генетика и понимание отбора». Природа Обзоры Генетики . 10 (2): 83–93. DOI : 10.1038 / nrg2506 . ISSN  1471-0056 . PMID  19119264 . S2CID  1670587 .
  110. ↑ Дарвин 1859 , Глава XIV
  111. ^ Отто, Сара П .; Серведио, Мария Р .; Нуисмер, Скотт Л. (август 2008 г.). «Частотно-зависимый отбор и эволюция ассортативного спаривания» . Генетика . 179 (4): 2091–2112. DOI : 10.1534 / genetics.107.084418 . ISSN  0016-6731 . PMC  2516082 . PMID  18660541 .
  112. ^ а б в Орр, Х. Аллен (август 2009 г.). «Фитнес и его роль в эволюционной генетике» . Природа Обзоры Генетики . 10 (8): 531–539. DOI : 10.1038 / nrg2603 . ISSN  1471-0056 . PMC  2753274 . PMID  19546856 .
  113. ^ Холдейн, JBS (14 марта 1959 г.). «Теория естественного отбора сегодня». Природа . 183 (4663): 710–713. Bibcode : 1959Natur.183..710H . DOI : 10.1038 / 183710a0 . ISSN  0028-0836 . PMID  13644170 . S2CID  4185793 .
  114. ^ Ланде, Рассел ; Арнольд, Стеван Дж. (Ноябрь 1983 г.). «Измерение отбора по коррелированным персонажам» . Эволюция . 37 (6): 1210–1226. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.1983.tb00236.x . ISSN  0014-3820 . JSTOR  2408842 . PMID  28556011 . S2CID  36544045 .
  115. ^ Гольдберг, Эмма Э .; Игич, Борис (ноябрь 2008 г.). «О филогенетических тестах необратимой эволюции». Эволюция . 62 (11): 2727–2741. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2008.00505.x . ISSN  0014-3820 . PMID  18764918 . S2CID  30703407 .
  116. ^ Коллин, Рэйчел; Мильетта, Мария Пиа (ноябрь 2008 г.). «Противоречивые мнения о законе Долло». Тенденции в экологии и эволюции . 23 (11): 602–609. DOI : 10.1016 / j.tree.2008.06.013 . ISSN  0169-5347 . PMID  18814933 .
  117. ^ Томич, Ненад; Мейер-Рохов, Виктор Бенно (2011). «Атавизмы: медицинские, генетические и эволюционные последствия». Перспективы биологии и медицины . 54 (3): 332–353. DOI : 10,1353 / pbm.2011.0034 . ISSN  0031-5982 . PMID  21857125 . S2CID  40851098 .
  118. ^ Hoekstra, Hopi E .; Hoekstra, Джонатан М .; Берриган, Дэвид; и другие. (31 июля 2001 г.). «Сила и темп направленного отбора в дикой природе» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (16): 9157–9160. Bibcode : 2001PNAS ... 98.9157H . DOI : 10.1073 / pnas.161281098 . ISSN  0027-8424 . PMC  55389 . PMID  11470913 .
  119. ^ Фельзенштейн, Джозеф (ноябрь 1979 г.). «Экскурсии по границе раздела разрушительного и стабилизирующего отбора» . Генетика . 93 (3): 773–795. DOI : 10.1093 / генетика / 93.3.773 . ISSN  0016-6731 . PMC  1214112 . PMID  17248980 .
  120. ^ Одум 1971 , стр. 8
  121. ^ Окаша 2006
  122. ^ а б Гулд, Стивен Джей (28 февраля 1998 г.). «Дальнейшие путешествия Гулливера: необходимость и трудность иерархической теории отбора» . Философские труды Королевского общества B . 353 (1366): 307–314. DOI : 10.1098 / rstb.1998.0211 . ISSN  0962-8436 . PMC  1692213 . PMID  9533127 .
  123. ^ Майр, Эрнст (18 марта 1997 г.). «Объекты отбора» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (6): 2091–2094. Bibcode : 1997PNAS ... 94.2091M . DOI : 10.1073 / pnas.94.6.2091 . ISSN  0027-8424 . PMC  33654 . PMID  9122151 .
  124. Перейти ↑ Maynard Smith 1998 , pp. 203–211; обсуждение 211–217
  125. ^ Хики, Донал А. (1992). «Эволюционная динамика мобильных элементов у прокариот и эукариот». Genetica . 86 (1–3): 269–274. DOI : 10.1007 / BF00133725 . ISSN  0016-6707 . PMID  1334911 . S2CID  6583945 .
  126. ^ Гулд, Стивен Джей; Ллойд, Элизабет А. (12 октября 1999 г.). «Индивидуальность и адаптация на разных уровнях отбора: как назвать и обобщить единицу дарвинизма?» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (21): 11904–11909. Bibcode : 1999PNAS ... 9611904G . DOI : 10.1073 / pnas.96.21.11904 . ISSN  0027-8424 . PMC  18385 . PMID  10518549 .
  127. ^ Лиен, Сигбьёрн; Шида, Джоанна; Шехингер, Биргит; и другие. (Февраль 2000 г.). «Доказательства гетерогенности в рекомбинации в псевдоавтосомной области человека: анализ с высоким разрешением путем типирования сперматозоидов и радиационно-гибридного картирования» . Американский журнал генетики человека . 66 (2): 557–566. DOI : 10.1086 / 302754 . ISSN  0002-9297 . PMC  1288109 . PMID  10677316 .
  128. ^ Бартон, Николас Х. (29 ноября 2000 г.). «Генетический автостоп» . Философские труды Королевского общества B . 355 (1403): 1553–1562. DOI : 10.1098 / rstb.2000.0716 . ISSN  0962-8436 . PMC  1692896 . PMID  11127900 .
  129. ^ а б Гиллеспи, Джон Х. (ноябрь 2001 г.). «Имеет ли значение размер популяции вида для его эволюции?» . Эволюция . 55 (11): 2161–2169. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2001.tb00732.x . ISSN  0014-3820 . PMID  11794777 . S2CID  221735887 .
  130. ^ Андерссон, Мальте; Симмонс, Ли У. (июнь 2006 г.). «Половой выбор и выбор партнера» (PDF) . Тенденции в экологии и эволюции . 21 (6): 296–302. CiteSeerX  10.1.1.595.4050 . DOI : 10.1016 / j.tree.2006.03.015 . ISSN  0169-5347 . PMID  16769428 . Архивировано (PDF) из оригинала на 2013-03-09.
  131. ^ Кокко, Ханна ; Брукс, Роберт; Макнамара, Джон М .; Хьюстон, Аласдер И. (7 июля 2002 г.). «Континуум полового отбора» . Труды Королевского общества B . 269 (1498): 1331–1340. DOI : 10.1098 / rspb.2002.2020 . ISSN  0962-8452 . PMC  1691039 . PMID  12079655 .
  132. ^ Куинн, Томас П .; Хендри, Эндрю П .; Бак, Грегори Б. (2001). «Уравновешивание естественного и полового отбора у нерки: взаимосвязь между размером тела, репродуктивными возможностями и уязвимостью перед хищниками со стороны медведей» (PDF) . Исследования эволюционной экологии . 3 : 917–937. ISSN  1522-0613 . Архивировано (PDF) из оригинала 5 марта 2016 года . Проверено 15 декабря 2014 .
  133. ^ Хант, Джон; Брукс, Роберт; Дженнионс, Майкл Д .; и другие. (23 декабря 2004 г.). «Высококачественные самцы полевых сверчков вкладывают большие средства в сексуальную демонстрацию, но умирают молодыми». Природа . 432 (7020): 1024–1027. Bibcode : 2004Natur.432.1024H . DOI : 10,1038 / природа03084 . ISSN  0028-0836 . PMID  15616562 . S2CID  4417867 .
  134. ^ Futuyma & Киркпатрик 2017 , стр 55-66, гл3: Естественный отбор и адаптация
  135. ^ а б Масел, Джоанна (25 октября 2011 г.). «Генетический дрейф» . Текущая биология . 21 (20): R837 – R838. DOI : 10.1016 / j.cub.2011.08.007 . ISSN  0960-9822 . PMID  22032182 . S2CID  17619958 .
  136. ^ Ланде, Рассел (1989). "Фишерианская и райтовская теории видообразования". Геном . 31 (1): 221–227. DOI : 10.1139 / g89-037 . ISSN  0831-2796 . PMID  2687093 .
  137. ^ Кимура, Мотоо (1991). «Нейтральная теория молекулярной эволюции: обзор последних данных» . Японский журнал генетики человека . 66 (4): 367–386. DOI : 10.1266 / jjg.66.367 . ISSN  0021-504X . PMID  1954033 .
  138. ^ Кимура, Мотоо (1989). «Нейтральная теория молекулярной эволюции и мировоззрение нейтралистов». Геном . 31 (1): 24–31. DOI : 10.1139 / g89-009 . ISSN  0831-2796 . PMID  2687096 .
  139. ^ Крейтман, Мартин (август 1996). «Нейтральная теория мертва. Да здравствует нейтральная теория». BioEssays . 18 (8): 678–683, обсуждение 683. doi : 10.1002 / bies.950180812 . ISSN  0265-9247 . PMID  8760341 .
  140. ^ Ли, EG, младший (ноябрь 2007 г.). «Нейтральная теория: историческая перспектива» . Журнал эволюционной биологии . 20 (6): 2075–2091. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2007.01410.x . ISSN  1010-061X . PMID  17956380 . S2CID  2081042 .
  141. ^ Neher, Richard A .; Шрайман, Борис I. (август 2011 г.). «Генетический проект и квазинейтральность в больших факультативно сексуальных популяциях» . Генетика . 188 (4): 975–996. arXiv : 1108,1635 . Bibcode : 2011arXiv1108.1635N . DOI : 10.1534 / genetics.111.128876 . ISSN  0016-6731 . PMC  3176096 . PMID  21625002 .
  142. ^ Отто, Сара П .; Уитлок, Майкл С. (июнь 1997 г.). «Вероятность фиксации в популяциях изменяющегося размера» (PDF) . Генетика . 146 (2): 723–733. DOI : 10.1093 / генетика / 146.2.723 . ISSN  0016-6731 . PMC  1208011 . PMID  9178020 . Архивировано (PDF) из оригинала 19 марта 2015 года . Проверено 18 декабря 2014 .
  143. ^ а б Чарльзуорт, Брайан (март 2009 г.). «Фундаментальные концепции в генетике: эффективный размер популяции и закономерности молекулярной эволюции и вариации». Природа Обзоры Генетики . 10 (3): 195–205. DOI : 10.1038 / nrg2526 . ISSN  1471-0056 . PMID  19204717 . S2CID  205484393 .
  144. ^ Каттер, Ашер Д .; Чхве, Джэ Ён (август 2010 г.). «Естественный отбор формирует нуклеотидный полиморфизм в геноме нематоды Caenorhabditis briggsae » . Геномные исследования . 20 (8): 1103–1111. DOI : 10.1101 / gr.104331.109 . ISSN  1088-9051 . PMC  2909573 . PMID  20508143 .
  145. ^ Митчелл-Олдс, Томас; Уиллис, Джон Х .; Гольдштейн, Дэвид Б. (ноябрь 2007 г.). «Какие эволюционные процессы влияют на естественную генетическую изменчивость фенотипических признаков?». Природа Обзоры Генетики . 8 (11): 845–856. DOI : 10.1038 / nrg2207 . ISSN  1471-0056 . PMID  17943192 . S2CID  14914998 .
  146. ^ Неи, Масатоши (декабрь 2005 г.). «Селекционизм и нейтрализм в молекулярной эволюции» . Молекулярная биология и эволюция . 22 (12): 2318–2342. DOI : 10.1093 / molbev / msi242 . ISSN  0737-4038 . PMC  1513187 . PMID  16120807 .
    • Неи, Масатоши (май 2006 г.). «Селекционизм и нейтрализм в молекулярной эволюции» . Молекулярная биология и эволюция (Erratum). 23 (5): 2318–42. DOI : 10.1093 / molbev / msk009 . ISSN  0737-4038 . PMC  1513187 . PMID  16120807 .
  147. ^ Райт, Сьюэлл (1932). «Роли мутации, инбридинга, скрещивания и отбора в эволюции» . Материалы VI Международного конгресса генетиков . 1 : 356–366. Архивировано 23 августа 2014 года . Проверено 18 декабря 2014 .
  148. ^ Койн, Джерри А .; Бартон, Николас Х .; Турелли, Майкл (июнь 1997 г.). «Перспектива: критика теории эволюции смещения баланса Сьюэла Райта». Эволюция . 51 (3): 643–671. DOI : 10.2307 / 2411143 . ISSN  0014-3820 . JSTOR  2411143 . PMID  28568586 .
  149. ^ Холдейн, JBS (июль 1927 г.). «Математическая теория естественного и искусственного отбора, часть V: отбор и мутация». Труды Кембриджского философского общества . 26 (7): 838–844. Bibcode : 1927PCPS ... 23..838H . DOI : 10.1017 / S0305004100015644 .
  150. ^ Фишер 1930
  151. ^ а б Ямпольский, Лев Ю .; Штольцфус, Арлин (20 декабря 2001 г.). «Предвзятость во введении вариации как ориентирующего фактора эволюции». Эволюция и развитие . 3 (2): 73–83. DOI : 10.1046 / j.1525-142x.2001.003002073.x . PMID  11341676 . S2CID  26956345 .
  152. ^ Суэока, Нобору (1 апреля 1962 г.). «О генетической основе вариабельности и неоднородности состава оснований ДНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 48 (4): 582–592. Bibcode : 1962PNAS ... 48..582S . DOI : 10.1073 / pnas.48.4.582 . PMC  220819 . PMID  13918161 .
  153. ^ Фриз, Эрнст (июль 1962 г.). «Об эволюции базового состава ДНК». Журнал теоретической биологии . 3 (1): 82–101. DOI : 10.1016 / S0022-5193 (62) 80005-8 .
  154. ^ Кокс, Эдвард С .; Яновский, Чарльз (1 ноября 1967 г.). «Измененные соотношения оснований в ДНК штамма-мутатора Escherichia coli» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 58 (5): 1895–1902. Bibcode : 1967PNAS ... 58.1895C . DOI : 10.1073 / pnas.58.5.1895 . PMC  223881 . PMID  4866980 .
  155. ^ Шах, Премаль; Гилкрист, Майкл А. (21 июня 2011 г.). «Объяснение сложных моделей использования кодонов с отбором на эффективность трансляции, смещение мутаций и генетический дрейф» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 108 (25): 10231–10236. Bibcode : 2011PNAS..10810231S . DOI : 10.1073 / pnas.1016719108 . PMC  3121864 . PMID  21646514 .
  156. ^ Балмер, Майкл Г. (ноябрь 1991 г.). "Теория выбора-мутации-дрейфа использования синонимичных кодонов" . Генетика . 129 (3): 897–907. DOI : 10.1093 / генетика / 129.3.897 . PMC  1204756 . PMID  1752426 .
  157. ^ Fryxell, Karl J .; Цукеркандль, Эмиль (сентябрь 2000 г.). «Дезаминирование цитозина играет главную роль в эволюции изохор млекопитающих» . Молекулярная биология и эволюция . 17 (9): 1371–1383. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a026420 . PMID  10958853 .
  158. ^ Петров, Дмитрий А .; Сангстер, Тодд А .; Джонстон, Дж. Спенсер; и другие. (11 февраля 2000 г.). «Доказательства потери ДНК как фактор, определяющий размер генома». Наука . 287 (5455): 1060–1062. Bibcode : 2000Sci ... 287.1060P . DOI : 10.1126 / science.287.5455.1060 . ISSN  0036-8075 . PMID  10669421 . S2CID  12021662 .
  159. ^ Петров, Дмитрий А. (май 2002 г.). «Потеря ДНК и эволюция размера генома у дрозофилы ». Genetica . 115 (1): 81–91. DOI : 10,1023 / A: 1016076215168 . ISSN  0016-6707 . PMID  12188050 . S2CID  5314242 .
  160. ^ Дюре, Лоран; Гальтье, Николя (сентябрь 2009 г.). «Предвзятая конверсия генов и эволюция геномных ландшафтов млекопитающих». Ежегодный обзор геномики и генетики человека . Ежегодные обзоры. 10 : 285–311. DOI : 10.1146 / annurev-genom-082908-150001 . ISSN  1527-8204 . PMID  19630562 . S2CID  9126286 .
  161. ^ Хершберг, Рут; Петров, Дмитрий Анатольевич (9 сентября 2010 г.). «Доказательства того, что мутации повсеместно склонны к AT у бактерий» . PLOS Genetics . 6 (9): e1001115. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001115 . PMC  2936535 . PMID  20838599 .
  162. ^ Штольцфус, Арлин; Маккэндлиш, Дэвид М. (сентябрь 2017 г.). «Мутационные предубеждения влияют на параллельную адаптацию» . Молекулярная биология и эволюция . 34 (9): 2163–2172. DOI : 10.1093 / molbev / msx180 . PMC  5850294 . PMID  28645195 .
  163. ^ Пейн, Джошуа Л .; Менардо, Фабрицио; Траунер, Андрей; и другие. (13 мая 2019 г.). «Смещение перехода влияет на эволюцию устойчивости Mycobacterium tuberculosis к антибиотикам » . PLOS Биология . 17 (5): e3000265. DOI : 10.1371 / journal.pbio.3000265 . PMC  6532934 . PMID  31083647 .
  164. ^ Сторц, Джей Ф .; Натараджан, Чандрасекар; Синьор, Энтони В .; и другие. (22 июля 2019 г.). «Роль смещения мутации в адаптивной молекулярной эволюции: понимание конвергентных изменений в функции белков» . Философские труды Королевского общества B . 374 (1777): 20180238. DOI : 10.1098 / rstb.2018.0238 . PMC  6560279 . PMID  31154983 .
  165. ^ Свенссон, Эрик I .; Бергер, Дэвид (1 мая 2019 г.). «Роль мутационного уклона в адаптивной эволюции». Тенденции в экологии и эволюции . 34 (5): 422–434. DOI : 10.1016 / j.tree.2019.01.015 . PMID  31003616 .
  166. ^ Байм, Михаил; Либерман, Тами Д .; Келсич, Эрик Д .; и другие. (9 сентября 2016 г.). «Пространственно-временная микробная эволюция на антибиотических ландшафтах» . Наука . 353 (6304): 1147–1151. Bibcode : 2016Sci ... 353.1147B . DOI : 10.1126 / science.aag0822 . ISSN  0036-8075 . PMC  5534434 . PMID  27609891 .
  167. ^ а б в Скотт, Евгения К .; Мацке, Николас Дж. (15 мая 2007 г.). «Биологический дизайн в научных классах» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (Приложение 1): 8669–8676. Bibcode : 2007PNAS..104.8669S . DOI : 10.1073 / pnas.0701505104 . ISSN  0027-8424 . PMC  1876445 . PMID  17494747 .
  168. ^ Хендри, Эндрю Пол; Киннисон, Майкл Т. (ноябрь 2001 г.). «Введение в микроэволюцию: скорость, закономерность, процесс». Genetica . 112–113 (1): 1–8. DOI : 10,1023 / A: 1013368628607 . ISSN  0016-6707 . PMID  11838760 . S2CID  24485535 .
  169. ^ Леруа, Арманд М. (март – апрель 2000 г.). «Масштабная независимость эволюции». Эволюция и развитие . 2 (2): 67–77. CiteSeerX  10.1.1.120.1020 . DOI : 10.1046 / j.1525-142x.2000.00044.x . ISSN  1520-541X . PMID  11258392 . S2CID  17289010 .
  170. ^ Gould 2002 , стр. 657-658.
  171. ^ а б Гулд, Стивен Джей (19 июля 1994 г.). «Темп и мода в макроэволюционной реконструкции дарвинизма» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 6764–6771. Bibcode : 1994PNAS ... 91.6764G . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.6764 . ISSN  0027-8424 . PMC  44281 . PMID  8041695 .
  172. ^ Яблонски, Дэвид (2000). «Микро- и макроэволюция: масштабы и иерархия в эволюционной биологии и палеобиологии». Палеобиология . 26 (sp4): 15–52. DOI : 10,1666 / 0094-8373 (2000) 26 [15: MAMSAH] 2.0.CO; 2 . ISSN  0094-8373 .
  173. ^ Догерти, Майкл Дж. (20 июля 1998 г.). «Человеческая раса развивается или эволюционирует?» . Scientific American . ISSN  0036-8733 . Архивировано 06 мая 2014 года . Проверено 11 сентября 2015 .
  174. ^ Исаак, Марк, изд. (22 июля 2003 г.). «Утверждение CB932: Эволюция вырожденных форм» . Архив TalkOrigins . Хьюстон, Техас: The TalkOrigins Foundation, Inc. Архивировано 23 августа 2014 года . Проверено 19 декабря 2014 .
  175. Перейти ↑ Lane 1996 , p. 61
  176. ^ Кэрролл, Шон Б. (22 февраля 2001 г.). «Случайность и необходимость: эволюция морфологической сложности и разнообразия». Природа . 409 (6823): 1102–1109. Bibcode : 2001Natur.409.1102C . DOI : 10.1038 / 35059227 . ISSN  0028-0836 . PMID  11234024 . S2CID  4319886 .
  177. ^ Уитмен, Уильям Б.; Коулман, Дэвид С .; Вибе, Уильям Дж. (9 июня 1998 г.). «Прокариоты: невидимое большинство» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (12): 6578–6583. Bibcode : 1998PNAS ... 95.6578W . DOI : 10.1073 / pnas.95.12.6578 . ISSN  0027-8424 . PMC  33863 . PMID  9618454 .
  178. ^ а б Schloss, Patrick D .; Хандельсман, Джо (декабрь 2004 г.). «Статус микробной переписи» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 68 (4): 686–691. DOI : 10.1128 / MMBR.68.4.686-691.2004 . ISSN  1092-2172 . PMC  539005 . PMID  15590780 .
  179. ^ Нилсон, Кеннет Х. (январь 1999 г.). «Поствикингская микробиология: новые подходы, новые данные, новые идеи». Истоки жизни и эволюция биосфер . 29 (1): 73–93. Bibcode : 1999OLEB ... 29 ... 73N . DOI : 10,1023 / A: 1006515817767 . ISSN  0169-6149 . PMID  11536899 . S2CID  12289639 .
  180. ^ Buckling, Ангус; Маклин, Р. Крейг; Брокхерст, Майкл А .; Колгрейв, Ник (12 февраля 2009 г.). «Бигль в бутылке». Природа . 457 (7231): 824–829. Bibcode : 2009Natur.457..824B . DOI : 10,1038 / природа07892 . ISSN  0028-0836 . PMID  19212400 . S2CID  205216404 .
  181. ^ Елена, Сантьяго Ф .; Ленски, Ричард Э. (июнь 2003 г.). «Эволюционные эксперименты с микроорганизмами: динамика и генетические основы адаптации». Природа Обзоры Генетики . 4 (6): 457–469. DOI : 10.1038 / nrg1088 . ISSN  1471-0056 . PMID  12776215 . S2CID  209727 .
  182. Перейти ↑ Mayr 1982 , p. 483: «Адаптация ... больше не могла считаться статичным состоянием, продуктом творческого прошлого, а превратилась в непрерывный динамический процесс».
  183. ^ Шестое издание Оксфордского научного словаря (2010) определяет адаптацию как «любое изменение в структуре или функционировании последовательных поколений населения, которое делает его более приспособленным к окружающей среде».
  184. ^ Орр, Х. Аллен (февраль 2005 г.). «Генетическая теория адаптации: краткая история». Природа Обзоры Генетики . 6 (2): 119–127. DOI : 10.1038 / nrg1523 . ISSN  1471-0056 . PMID  15716908 . S2CID  17772950 .
  185. ↑ Добжанский, 1968 , с. 1–34.
  186. ↑ Добжанский, 1970 , стр. 4–6, 79–82, 84–87
  187. ^ Добжанский, Феодосий (март 1956 г.). "Генетика природных популяций. XXV. Генетические изменения в популяциях Drosophila pseudoobscura и Drosophila persimilis в некоторых местах в Калифорнии". Эволюция . 10 (1): 82–92. DOI : 10.2307 / 2406099 . ISSN  0014-3820 . JSTOR  2406099 .
  188. ^ Накадзима, Акира; Сугимото, Ёко; Йонеяма, Хироши; Накаэ, Тайцзи (июнь 2002 г.). «Высокая устойчивость к фторхинолонам у синегнойной палочки из-за взаимодействия насоса оттока MexAB-OprM и мутации ДНК-гиразы». Микробиология и иммунология . 46 (6): 391–395. DOI : 10.1111 / j.1348-0421.2002.tb02711.x . ISSN  1348-0421 . PMID  12153116 . S2CID  22593331 .
  189. ^ Блаунт, Захари Д.; Borland, Christina Z .; Ленски, Ричард Э. (10 июня 2008 г.). «Первая статья: историческая случайность и эволюция ключевого нововведения в экспериментальной популяции Escherichia coli » . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 105 (23): 7899–7906. Bibcode : 2008PNAS..105.7899B . DOI : 10.1073 / pnas.0803151105 . ISSN  0027-8424 . PMC  2430337 . PMID  18524956 .
  190. ^ Окада, Хиросуке; Негоро, Сейджи; Кимура, Хироюки; Накамура, Шуничи (10 ноября 1983 г.). «Эволюционная адаптация ферментов, кодируемых плазмидами, для разложения олигомеров нейлона». Природа . 306 (5939): 203–206. Bibcode : 1983Natur.306..203O . DOI : 10.1038 / 306203a0 . ISSN  0028-0836 . PMID  6646204 . S2CID  4364682 .
  191. ^ Оно, Сусуму (апрель 1984 г.). «Рождение уникального фермента из альтернативной рамки считывания ранее существовавшей, внутренне повторяющейся кодирующей последовательности» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 81 (8): 2421–2425. Bibcode : 1984PNAS ... 81.2421O . DOI : 10.1073 / pnas.81.8.2421 . ISSN  0027-8424 . PMC  345072 . PMID  6585807 .
  192. ^ Копли, Шелли Д. (июнь 2000 г.). «Эволюция метаболического пути деградации токсичных ксенобиотиков: лоскутный подход». Направления биохимических наук . 25 (6): 261–265. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (00) 01562-0 . ISSN  0968-0004 . PMID  10838562 .
  193. ^ Кроуфорд, Рональд Л .; Юнг, Карина М .; Ремень, Дженис Л. (октябрь 2007 г.). «Недавняя эволюция пентахлорфенол (PCP) -4-монооксигеназы (PcpB) и связанные с ними пути бактериальной деградации PCP». Биоразложение . 18 (5): 525–539. DOI : 10.1007 / s10532-006-9090-6 . ISSN  0923-9820 . PMID  17123025 . S2CID  8174462 .
  194. ^ Эшель, Илан (декабрь 1973 г.). «Выбор клонов и оптимальные скорости мутации». Журнал прикладной теории вероятностей . 10 (4): 728–738. DOI : 10.2307 / 3212376 . ISSN  1475-6072 . JSTOR  3212376 .
  195. ^ Альтенберг 1995 , стр. 205-259
  196. ^ Масел, Джоанна; Бергман, Авив (июль 2003 г.). «Эволюция свойств эволюционируемости приона дрожжей [PSI +]». Эволюция . 57 (7): 1498–1512. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2003.tb00358.x . ISSN  0014-3820 . PMID  12940355 . S2CID  30954684 .
  197. ^ Ланкастер, Алекс К .; Бардилл, Дж. Патрик; Верно, Хизер Л .; Масел, Джоанна (февраль 2010 г.). «Скорость спонтанного появления дрожжевого приона [ PSI +] и его значение для эволюции свойств эволюционируемости системы [ PSI +]» . Генетика . 184 (2): 393–400. DOI : 10.1534 / genetics.109.110213 . ISSN  0016-6731 . PMC  2828720 . PMID  19917766 .
  198. ^ Драги, Джереми; Вагнер, Гюнтер П. (февраль 2008 г.). «Эволюция эволюционируемости в модели развития» . Эволюция . 62 (2): 301–315. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2007.00303.x . ISSN  0014-3820 . PMID  18031304 . S2CID  11560256 .
  199. ^ а б Бейдер, Ларс; Холл, Брайан К. (ноябрь 2002 г.). «Конечности у китов и безконечность у других позвоночных: механизмы эволюционной трансформации и эволюции и потери». Эволюция и развитие . 4 (6): 445–458. DOI : 10.1046 / j.1525-142X.2002.02033.x . ISSN  1520-541X . PMID  12492145 . S2CID  8448387 .
  200. ^ Янг, Натан М .; Халльгремссон, Бенедикт (декабрь 2005 г.). «Последовательная гомология и эволюция ковариационной структуры конечностей млекопитающих». Эволюция . 59 (12): 2691–2704. DOI : 10.1554 / 05-233.1 . ISSN  0014-3820 . PMID  16526515 . S2CID  198156135 .
  201. ^ а б Пенни, Дэвид; Пул, Энтони (декабрь 1999 г.). «Природа последнего универсального общего предка». Текущее мнение в области генетики и развития . 9 (6): 672–677. DOI : 10.1016 / S0959-437X (99) 00020-9 . ISSN  0959-437X . PMID  10607605 .
  202. ^ Холл, Брайан К. (август 2003 г.). «Происхождение с модификацией: единство, лежащее в основе гомологии и гомоплазии, как видно через анализ развития и эволюции». Биологические обзоры . 78 (3): 409–433. DOI : 10.1017 / S1464793102006097 . ISSN  1464-7931 . PMID  14558591 . S2CID  22142786 .
  203. ^ Шубин, Нил ; Табин, Клиффорд Дж .; Кэрролл, Шон Б. (12 февраля 2009 г.). «Глубокая гомология и истоки эволюционной новизны». Природа . 457 (7231): 818–823. Bibcode : 2009Natur.457..818S . DOI : 10,1038 / природа07891 . ISSN  0028-0836 . PMID  19212399 . S2CID  205216390 .
  204. ^ а б в Фонг, Даниэль Ф .; Кейн, Томас С .; Калвер, Дэвид К. (ноябрь 1995 г.). «Рудигиализация и утрата нефункциональных персонажей». Ежегодный обзор экологии и систематики . 26 : 249–268. DOI : 10.1146 / annurev.es.26.110195.001341 . ISSN  1545-2069 .
  205. ^ ЧжаоЛэй Чжан; Герштейн, Марк (август 2004 г.). «Масштабный анализ псевдогенов в геноме человека». Текущее мнение в области генетики и развития . 14 (4): 328–335. DOI : 10.1016 / j.gde.2004.06.003 . ISSN  0959-437X . PMID  15261647 .
  206. ^ Джеффри, Уильям Р. (май – июнь 2005 г.). «Адаптивная эволюция дегенерации глаз у мексиканской слепой пещерной рыбы». Журнал наследственности . 96 (3): 185–196. CiteSeerX  10.1.1.572.6605 . DOI : 10.1093 / jhered / esi028 . ISSN  0022-1503 . PMID  15653557 .
  207. ^ Максвелл, Эрин Э .; Ларссон, Ханс CE (май 2007 г.). «Остеология и миология крыла эму ( Dromaius novaehollandiae ) и ее влияние на эволюцию рудиментарных структур». Журнал морфологии . 268 (5): 423–441. DOI : 10.1002 / jmor.10527 . ISSN  0362-2525 . PMID  17390336 . S2CID  12494187 .
  208. ^ van der Kooi, Casper J .; Швандер, Таня (ноябрь 2014 г.). «О судьбе половых признаков при асексуальности» (PDF) . Биологические обзоры . 89 (4): 805–819. DOI : 10.1111 / brv.12078 . ISSN  1464-7931 . PMID  24443922 . S2CID  33644494 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.07.2015 . Проверено 5 августа 2015 .
  209. ^ Сильвестри, Энтони Р., младший; Сингх, Икбал (апрель 2003 г.). «Нерешенная проблема третьего моляра: будет ли людям лучше без него?» . Журнал Американской стоматологической ассоциации . 134 (4): 450–455. DOI : 10,14219 / jada.archive.2003.0194 . ISSN  0002-8177 . PMID  12733778 . Архивировано из оригинала на 2014-08-23.
  210. Перейти ↑ Coyne 2009 , p. 62
  211. Перейти ↑ Darwin 1872 , pp. 101, 103
  212. Перейти ↑ Gray 2007 , p. 66
  213. Перейти ↑ Coyne 2009 , pp. 85–86
  214. Перейти ↑ Stevens 1982 , p. 87
  215. ^ a b Gould 2002 , стр. 1235–1236.
  216. ^ Паллен, Марк Дж .; Мацке, Николас Дж. (Октябрь 2006 г.). «От происхождения видов до происхождения жгутиков бактерий» (PDF) . Обзоры природы микробиологии (PDF). 4 (10): 784–790. DOI : 10.1038 / nrmicro1493 . ISSN  1740-1526 . PMID  16953248 . S2CID  24057949 . Архивировано из оригинального (PDF) 26 декабря 2014 года . Проверено 25 декабря 2014 .
  217. ^ Клементс, Эбигейл; Бурзак, Деян; Гацос, Ксения; и другие. (15 сентября 2009 г.). «Снижаемая сложность митохондриальной молекулярной машины» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 106 (37): 15791–15795. Bibcode : 2009PNAS..10615791C . DOI : 10.1073 / pnas.0908264106 . ISSN  0027-8424 . PMC  2747197 . PMID  19717453 .
  218. ^ Пятигорский и др. 1994 , с. 241–250.
  219. ^ Вистоу, Грэм (август 1993). «Линзовые кристаллины: набор генов и эволюционный динамизм». Направления биохимических наук . 18 (8): 301–306. DOI : 10.1016 / 0968-0004 (93) 90041-K . ISSN  0968-0004 . PMID  8236445 .
  220. ^ Джонсон, Норман А .; Портер, Адам Х. (ноябрь 2001 г.). «К новому синтезу: популяционная генетика и эволюционная биология развития». Genetica . 112–113 (1): 45–58. DOI : 10,1023 / A: 1013371201773 . ISSN  0016-6707 . PMID  11838782 . S2CID  1651351 .
  221. ^ Багуна, Хауме; Гарсия-Фернандес, Хорди (2003). «Эво-Дево: долгая и извилистая дорога» . Международный журнал биологии развития . 47 (7–8): 705–713. ISSN  0214-6282 . PMID  14756346 . Архивировано 28 ноября 2014 года.
    • С любовью, Алан С. (март 2003 г.). «Эволюционная морфология, инновации и синтез эволюционной биологии и биологии развития». Биология и философия . 18 (2): 309–345. DOI : 10,1023 / A: 1023940220348 . ISSN  0169-3867 . S2CID  82307503 .
  222. ^ Аллин, Эдгар Ф. (декабрь 1975 г.). «Эволюция среднего уха млекопитающих». Журнал морфологии . 147 (4): 403–437. DOI : 10.1002 / jmor.1051470404 . ISSN  0362-2525 . PMID  1202224 . S2CID  25886311 .
  223. ^ Харрис, Мэтью П .; Хассо, Шон М .; Фергюсон, Марк В.Дж.; Фэллон, Джон Ф. (21 февраля 2006 г.). «Развитие зубов первого поколения архозавров у куриного мутанта». Текущая биология . 16 (4): 371–377. DOI : 10.1016 / j.cub.2005.12.047 . ISSN  0960-9822 . PMID  16488870 . S2CID  15733491 .
  224. ^ Кэрролл, Шон Б. (11 июля 2008 г.). "Evo-Devo и расширяющийся эволюционный синтез: генетическая теория морфологической эволюции". Cell . 134 (1): 25–36. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.06.030 . ISSN  0092-8674 . PMID  18614008 . S2CID  2513041 .
  225. ^ Уэйд, Майкл Дж. (Март 2007 г.). «Коэволюционная генетика экологических сообществ». Природа Обзоры Генетики . 8 (3): 185–195. DOI : 10.1038 / nrg2031 . ISSN  1471-0056 . PMID  17279094 . S2CID  36705246 .
  226. ^ Геффени, Шана; Броди, Эдмунд Д., младший; Рубен, Питер С .; Броди, Эдмунд Д., III (23 августа 2002 г.). «Механизмы адаптации в гонке вооружений хищник-жертва: ТТХ-устойчивые натриевые каналы». Наука . 297 (5585): 1336–1339. Bibcode : 2002Sci ... 297.1336G . DOI : 10.1126 / science.1074310 . ISSN  0036-8075 . PMID  12193784 . S2CID  8816337 .
    • Броди, Эдмунд Д., младший; Риденхур, Бенджамин Дж .; Броди, Эдмунд Д., III (октябрь 2002 г.). «Эволюционная реакция хищников на опасную добычу: горячие и холодные точки в географической мозаике совместной эволюции подвязочных змей и тритонов». Эволюция . 56 (10): 2067–2082. DOI : 10.1554 / 0014-3820 (2002) 056 [2067: teropt] 2.0.co; 2 . ISSN  0014-3820 . PMID  12449493 .
    • Кэрролл, Шон Б. (21 декабря 2009 г.). «Все, что не убивает некоторых животных, может сделать их смертельными» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк. ISSN  0362-4331 . Архивировано 23 апреля 2015 года . Проверено 26 декабря 2014 .
  227. ^ Сакс, Джоэл Л. (сентябрь 2006 г.). «Сотрудничество внутри и между видами» . Журнал эволюционной биологии . 19 (5): 1415–1418, обсуждение 1426–1436. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2006.01152.x . ISSN  1010-061X . PMID  16910971 . S2CID  4828678 .
    • Новак, Мартин А. (8 декабря 2006 г.). «Пять правил развития сотрудничества» . Наука . 314 (5805): 1560–1563. Bibcode : 2006Sci ... 314.1560N . DOI : 10.1126 / science.1133755 . ISSN  0036-8075 . PMC  3279745 . PMID  17158317 .
  228. ^ Пашковски, Ута (август 2006 г.). «Мутуализм и паразитизм: инь и янь растительных симбиозов». Текущее мнение в биологии растений . 9 (4): 364–370. DOI : 10.1016 / j.pbi.2006.05.008 . ISSN  1369-5266 . PMID  16713732 .
  229. ^ Хаус, Беттина; Фестер, Томас (май 2005 г.). «Молекулярная и клеточная биология арбускулярного микоризного симбиоза». Planta . 221 (2): 184–196. DOI : 10.1007 / s00425-004-1436-х . ISSN  0032-0935 . PMID  15871030 . S2CID  20082902 .
  230. ^ Бертрам, Джон С. (декабрь 2000 г.). «Молекулярная биология рака». Молекулярные аспекты медицины . 21 (6): 167–223. DOI : 10.1016 / S0098-2997 (00) 00007-8 . ISSN  0098-2997 . PMID  11173079 .
  231. ^ Рив, Х. Керн; Хельдоблер, Берт (5 июня 2007 г.). «Возникновение суперорганизма через межгрупповую конкуренцию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (23): 9736–9740. Bibcode : 2007PNAS..104.9736R . DOI : 10.1073 / pnas.0703466104 . ISSN  0027-8424 . PMC  1887545 . PMID  17517608 .
  232. ^ Аксельрод, Роберт; Гамильтон, WD (27 марта 1981 г.). «Эволюция сотрудничества». Наука . 211 (4489): 1390–1396. Bibcode : 1981Sci ... 211.1390A . DOI : 10.1126 / science.7466396 . ISSN  0036-8075 . PMID  7466396 .
  233. ^ Уилсон, Эдвард О .; Хельдоблер, Берт (20 сентября 2005 г.). «Эусоциальность: происхождение и последствия» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (38): 13367–1371. Bibcode : 2005PNAS..10213367W . DOI : 10.1073 / pnas.0505858102 . ISSN  0027-8424 . PMC  1224642 . PMID  16157878 .
  234. ^ а б Гаврилец, Сергей (октябрь 2003 г.). «Перспектива: модели видообразования: чему мы научились за 40 лет?». Эволюция . 57 (10): 2197–2215. DOI : 10.1554 / 02-727 . ISSN  0014-3820 . PMID  14628909 . S2CID  198158082 .
  235. ^ а б в де Кейруш, Кевин (3 мая 2005 г.). «Эрнст Майр и современная концепция видов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (Приложение 1): 6600–6607. Bibcode : 2005PNAS..102.6600D . DOI : 10.1073 / pnas.0502030102 . ISSN  0027-8424 . PMC  1131873 . PMID  15851674 .
  236. ^ а б Ерешефский, Марк (декабрь 1992 г.). «Исключительный плюрализм». Философия науки . 59 (4): 671–690. DOI : 10.1086 / 289701 . ISSN  0031-8248 . JSTOR  188136 . S2CID  224829314 .
  237. Перейти ↑ Mayr 1942 , p. 120
  238. ^ Фрейзер, Кристоф; Альм, Эрик Дж .; Польз, Мартин Ф .; и другие. (6 февраля 2009 г.). «Проблема бактериальных видов: понимание генетического и экологического разнообразия». Наука . 323 (5915): 741–746. Bibcode : 2009Sci ... 323..741F . DOI : 10.1126 / science.1159388 . ISSN  0036-8075 . PMID  19197054 . S2CID  15763831 .
  239. ^ Коротко, Роджер Валентайн (октябрь 1975 г.). «Вклад мула в научную мысль». Журнал репродукции и фертильности. Приложение (23): 359–364. ISSN  0449-3087 . OCLC  1639439 . PMID  1107543 .
  240. ^ Gross, Briana L .; Ризеберг, Лорен Х. (май – июнь 2005 г.). "Экологическая генетика видообразования гомоплоидных гибридов" . Журнал наследственности . 96 (3): 241–252. DOI : 10.1093 / jhered / esi026 . ISSN  0022-1503 . PMC  2517139 . PMID  15618301 .
  241. ^ Берк, Джон М .; Арнольд, Майкл Л. (декабрь 2001 г.). «Генетика и приспособленность гибридов». Ежегодный обзор генетики . 35 : 31–52. DOI : 10.1146 / annurev.genet.35.102401.085719 . ISSN  0066-4197 . PMID  11700276 . S2CID  26683922 .
  242. ^ Вриенхук, Роберт К. (4 апреля 2006 г.). «Полиплоидные гибриды: множественное происхождение видов древесных лягушек» . Текущая биология . 16 (7): R245 – R247. DOI : 10.1016 / j.cub.2006.03.005 . ISSN  0960-9822 . PMID  16581499 . S2CID  11657663 .
  243. ^ Райс, Уильям Р .; Хостерт, Эллен Э. (декабрь 1993 г.). «Лабораторные эксперименты по видообразованию: чему мы научились за 40 лет?». Эволюция . 47 (6): 1637–1653. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.1993.tb01257.x . ISSN  0014-3820 . JSTOR  2410209 . PMID  28568007 . S2CID  42100751 .
    • Джиггинс, Крис Д .; Уздечка, Джон Р. (март 2004 г.). «Видообразование в яблочной мухе личинки: смесь винтажей?». Тенденции в экологии и эволюции . 19 (3): 111–114. DOI : 10.1016 / j.tree.2003.12.008 . ISSN  0169-5347 . PMID  16701238 .
    • Боксхорн, Джозеф (1 сентября 1995 г.). «Наблюдаемые экземпляры видообразования» . Архив TalkOrigins . Хьюстон, Техас: The TalkOrigins Foundation, Inc. Архивировано 22 января 2009 года . Проверено 26 декабря 2008 .
    • Вайнберг, Джеймс Р .; Старчак, Виктория Р .; Йорг, Даниэле (август 1992 г.). «Доказательства быстрого видообразования после события основания в лаборатории». Эволюция . 46 (4): 1214–1220. DOI : 10.2307 / 2409766 . ISSN  0014-3820 . JSTOR  2409766 . PMID  28564398 .
  244. ^ Херрел, Энтони; Хайге, Катлин; Vanhooydonck, Bieke; и другие. (25 марта 2008 г.). «Быстрое крупномасштабное эволюционное расхождение в морфологии и производительности, связанное с использованием другого пищевого ресурса» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 105 (12): 4792–4795. Bibcode : 2008PNAS..105.4792H . DOI : 10.1073 / pnas.0711998105 . ISSN  0027-8424 . PMC  2290806 . PMID  18344323 .
  245. ^ Лосос, Джонатан Б.; Уорхелт, Кеннет I .; Шенер, Томас В. (1 мая 1997 г.). «Адаптивная дифференциация после экспериментальной колонизации острова у ящериц анолиса ». Природа . 387 (6628): 70–73. Bibcode : 1997Natur.387 ... 70L . DOI : 10.1038 / 387070a0 . ISSN  0028-0836 . S2CID  4242248 .
  246. ^ Хоскин, Конрад Дж .; Хиггл, Меган; Макдональд, Кейт Р .; Мориц, Крейг (27 октября 2005 г.). «Армирование приводит к быстрому аллопатрическому видообразованию». Природа . 437 (7063): 1353–1356. Bibcode : 2005Natur.437.1353H . DOI : 10,1038 / природа04004 . ISSN  0028-0836 . PMID  16251964 . S2CID  4417281 .
  247. ^ Темплтон, Алан Р. (апрель 1980 г.). «Теория видообразования VIA Основатель Принцип» . Генетика . 94 (4): 1011–1038. DOI : 10.1093 / генетика / 94.4.1011 . ISSN  0016-6731 . PMC  1214177 . PMID  6777243 . Архивировано 23 августа 2014 года . Проверено 29 декабря 2014 .
  248. ^ Антоновичс, Янис (июль 2006 г.). «Эволюция в близко прилегающих популяциях растений X: длительное сохранение предпродуктивной изоляции на границе шахты». Наследственность . 97 (1): 33–37. DOI : 10.1038 / sj.hdy.6800835 . ISSN  0018-067X . PMID  16639420 . S2CID  12291411 .
  249. ^ Носил, Патрик; Креспи, Бернард Дж .; Грис, Регина; Грис, Герхард (март 2007 г.). «Естественный отбор и расхождение в предпочтениях партнера во время видообразования». Genetica . 129 (3): 309–327. DOI : 10.1007 / s10709-006-0013-6 . ISSN  0016-6707 . PMID  16900317 . S2CID  10808041 .
  250. ^ Саволайнен, Винсент; Анстетт, Мари-Шарлотта; Лексер, Кристиан; и другие. (11 мая 2006 г.). «Симпатрическое видообразование в пальмах на океаническом острове». Природа . 441 (7090): 210–213. Bibcode : 2006Natur.441..210S . DOI : 10,1038 / природа04566 . ISSN  0028-0836 . PMID  16467788 . S2CID  867216 .
    • Барлуенга, Марта; Stölting, Kai N .; Зальцбургер, Вальтер; и другие. (9 февраля 2006 г.). «Симпатрическое видообразование в никарагуанской кратерной озере цихлид» . Природа . 439 (7077): 719–23. Bibcode : 2006Natur.439..719B . DOI : 10,1038 / природа04325 . ISSN  0028-0836 . PMID  16467837 . S2CID  3165729 .
  251. ^ Гаврилец, Сергей (21 марта 2006 г.). "Модель симпатрического видообразования Мейнарда Смита". Журнал теоретической биологии . 239 (2): 172–182. DOI : 10.1016 / j.jtbi.2005.08.041 . ISSN  0022-5193 . PMID  16242727 .
  252. ^ Wood, Troy E .; Такебаяси, Наоки; Баркер, Майкл С .; и другие. (18 августа 2009 г.). «Частота видообразования полиплоидов у сосудистых растений» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 106 (33): 13875–13879. Bibcode : 2009PNAS..10613875W . DOI : 10.1073 / pnas.0811575106 . ISSN  0027-8424 . PMC  2728988 . PMID  19667210 .
  253. ^ Хегарти, Мэтью Дж .; Хискок, Саймон Дж. (20 мая 2008 г.). «Геномные ключи к эволюционному успеху полиплоидных растений». Текущая биология . 18 (10): R435 – R444. DOI : 10.1016 / j.cub.2008.03.043 . ISSN  0960-9822 . PMID  18492478 . S2CID  1584282 .
  254. ^ Якобссон, Маттиас; Хагенблад, Дженни; Таваре, Симон ; и другие. (Июнь 2006 г.). «Уникальное недавнее происхождение аллотетраплоидных видов Arabidopsis suecica : данные ядерных маркеров ДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (6): 1217–1231. DOI : 10.1093 / molbev / msk006 . ISSN  0737-4038 . PMID  16549398 .
  255. ^ Сэлль, Торбьорн; Якобссон, Маттиас; Линд-Халлден, Кристина; Холлден, Кристер (сентябрь 2003 г.). «ДНК хлоропластов указывает на единственное происхождение аллотетраплоида Arabidopsis suecica ». Журнал эволюционной биологии . 16 (5): 1019–1029. DOI : 10,1046 / j.1420-9101.2003.00554.x . ISSN  1010-061X . PMID  14635917 . S2CID  29281998 .
  256. ^ Бомблис, Кирстен ; Вайгель, Детлеф (декабрь 2007 г.). « Arabidopsis - модельный род для видообразования». Текущее мнение в области генетики и развития . 17 (6): 500–504. DOI : 10.1016 / j.gde.2007.09.006 . ISSN  0959-437X . PMID  18006296 .
  257. ^ Семон, Мари; Вулф, Кеннет Х. (декабрь 2007 г.). «Последствия дупликации генома». Текущее мнение в области генетики и развития . 17 (6): 505–512. DOI : 10.1016 / j.gde.2007.09.007 . ISSN  0959-437X . PMID  18006297 .
  258. ^ Элдридж и Гулд 1972 , стр. 82-115
  259. ^ Бентон, Майкл Дж. (7 апреля 1995 г.). «Диверсификация и вымирание в истории жизни». Наука . 268 (5207): 52–58. Bibcode : 1995Sci ... 268 ... 52B . DOI : 10.1126 / science.7701342 . ISSN  0036-8075 . PMID  7701342 .
  260. ^ Рауп, Дэвид М. (28 марта 1986 г.). «Биологическое вымирание в истории Земли». Наука . 231 (4745): 1528–1533. Bibcode : 1986Sci ... 231.1528R . DOI : 10.1126 / science.11542058 . ISSN  0036-8075 . PMID  11542058 . S2CID  23012011 .
  261. ^ Avise, John C .; Хаббелл, Стивен П .; Айяла, Франсиско Дж. (12 августа 2008 г.). «В свете эволюции II: биоразнообразие и исчезновение» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 105 (Приложение 1): 11453–11457. Bibcode : 2008PNAS..10511453A . DOI : 10.1073 / pnas.0802504105 . ISSN  0027-8424 . PMC  2556414 . PMID  18695213 .
  262. ^ а б в Рауп, Дэвид М. (19 июля 1994 г.). «Роль вымирания в эволюции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 6758–6763. Bibcode : 1994PNAS ... 91.6758R . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.6758 . ISSN  0027-8424 . PMC  44280 . PMID  8041694 .
  263. ^ Новачек, Майкл Дж .; Клеланд, Эльза Э. (8 мая 2001 г.). «Текущее событие исчезновения биоразнообразия: сценарии смягчения последствий и восстановления» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (10): 5466–5470. Bibcode : 2001PNAS ... 98.5466N . DOI : 10.1073 / pnas.091093698 . ISSN  0027-8424 . PMC  33235 . PMID  11344295 .
  264. ^ Пимм, Стюарт ; Ворон, Питер ; Петерсон, Алан; и другие. (18 июля 2006 г.). «Влияние человека на скорость недавнего, настоящего и будущего исчезновения птиц» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 103 (29): 10941–10946. Bibcode : 2006PNAS..10310941P . DOI : 10.1073 / pnas.0604181103 . ISSN  0027-8424 . PMC  1544153 . PMID  16829570 .
  265. ^ Барноски, Энтони Д .; Koch, Paul L .; Feranec, Robert S .; и другие. (1 октября 2004 г.). «Оценка причин позднего плейстоценового вымирания на континентах». Наука . 306 (5693): 70–75. Bibcode : 2004Sci ... 306 ... 70B . CiteSeerX  10.1.1.574.332 . DOI : 10.1126 / science.1101476 . ISSN  0036-8075 . PMID  15459379 . S2CID  36156087 .
  266. ^ Льюис, Оуэн Т. (29 января 2006 г.). «Изменение климата, кривые вид – ареал и кризис вымирания» . Философские труды Королевского общества B . 361 (1465): 163–171. DOI : 10.1098 / rstb.2005.1712 . ISSN  0962-8436 . PMC  1831839 . PMID  16553315 .
  267. ^ a b Stearns & Stearns 1999 , стр. Икс
  268. ^ а б Новачек, Майкл Дж. (8 ноября 2014 г.). «Блестящее будущее предыстории» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк. ISSN  0362-4331 . Архивировано 29 декабря 2014 года . Проверено 25 декабря 2014 .
  269. ^ «Исследователи обнаружили, что Земля может быть домом для 1 триллиона видов» . Национальный научный фонд . Округ Арлингтон, Вирджиния. 2 мая 2016 года архивации от оригинала на 2016-05-04 . Проверено 6 мая 2016 .
  270. ^ Яблонски, Дэвид (8 мая 2001 г.). «Уроки прошлого: эволюционные последствия массовых вымираний» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (10): 5393–5398. Bibcode : 2001PNAS ... 98.5393J . DOI : 10.1073 / pnas.101092598 . ISSN  0027-8424 . PMC  33224 . PMID  11344284 .
  271. ^ «Возраст Земли» . Геологическая служба США . 9 июля 2007 года архивации от оригинала на 2005-12-23 . Проверено 31 мая 2015 .
  272. ^ Дэлримпл 2001 , стр. 205-221
  273. ^ Манхеса, Жерар; Аллегр, Клод Ж .; Дюпреа, Бернар; Хамелин, Бруно (май 1980). «Свинцовые изотопные исследования базовых-ультраосновных слоистых комплексов: предположения о возрасте Земли и характеристиках примитивной мантии». Письма о Земле и планетах . 47 (3): 370–382. Bibcode : 1980E & PSL..47..370M . DOI : 10.1016 / 0012-821X (80) 90024-2 . ISSN  0012-821X .
  274. Перейти ↑ Raven & Johnson 2002 , p. 68
  275. ^ а б Боренштейн, Сет (19 октября 2015 г.). «Намеки на жизнь на том, что считалось пустынной на ранней Земле» . Волнуйтесь . Йонкерс, штат Нью-Йорк: Интерактивная сеть Mindspark . Ассошиэйтед Пресс . Архивировано из оригинального 23 октября 2015 года . Проверено 8 октября 2018 года .
  276. ^ Белл, Элизабет А .; Бохнике, Патрик; Харрисон, Т. Марк; Мао, Венди Л. (24 ноября 2015 г.). «Потенциально биогенный углерод, сохранившийся в цирконе возрастом 4,1 миллиарда лет» (PDF) . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 112 (47): 14518–14521. Bibcode : 2015PNAS..11214518B . DOI : 10.1073 / pnas.1517557112 . ISSN  0027-8424 . PMC  4664351 . PMID  26483481 . Архивировано (PDF) из оригинала 06.11.2015 . Проверено 30 декабря 2015 .
  277. ^ Схоутен, Люси (20 октября 2015 г.). «Когда на Земле впервые появилась жизнь? Может, намного раньше, чем мы думали» . Монитор христианской науки . Бостон, Массачусетс: Издательское общество Христианской науки . ISSN  0882-7729 . Архивировано 22 марта 2016 года . Проверено 11 июля 2018 .
  278. ^ Уэйд, Николас (25 июля 2016 г.). «Познакомьтесь с Лукой, прародителем всего живого» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк. ISSN  0362-4331 . Архивировано 28 июля 2016 года . Проверено 25 июля 2016 .
  279. Перейти ↑ McKinney 1997 , p. 110
  280. ^ Мора, Камило; Tittensor, Дерек П .; Адл, Сина; и другие. (23 августа 2011 г.). «Сколько видов существует на Земле и в океане?» . PLOS Биология . 9 (8): e1001127. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1001127 . ISSN  1545-7885 . PMC  3160336 . PMID  21886479 .
  281. ^ Miller & Spoolman 2012 , стр. 62
  282. ^ Чепмен 2009
  283. ^ Росков, Ю .; Abucay, L .; Оррелл, Т .; Николсон, Д .; и др., ред. (2016). "Species 2000 & ITIS Catalog of Life, Annual Checklist 2016" . Виды 2000 . Лейден, Нидерланды: Центр биоразнообразия Naturalis . ISSN  2405-884X . Архивировано 12 ноября 2016 года . Проверено 6 ноября 2016 .
  284. ^ Перето, Хули (март 2005 г.). «Споры о происхождении жизни» (PDF) . Международная микробиология . 8 (1): 23–31. ISSN  1139-6709 . PMID  15906258 . Архивировано из оригинального (PDF) 24 августа 2015 года.
  285. ^ Маршалл, Майкл (11 ноября 2020 г.). «Предчувствие Чарльза Дарвина относительно ранней жизни, вероятно, было правильным - в нескольких нацарапанных заметках другу биолог Чарльз Дарвин предположил, как зародилась жизнь. Мало того, что это, вероятно, было правильным, его теория опередила свое время на столетие» . BBC News . Проверено 11 ноября 2020 .
  286. ^ Джойс, Джеральд Ф. (11 июля 2002 г.). «Древность эволюции на основе РНК». Природа . 418 (6894): 214–221. Bibcode : 2002Natur.418..214J . DOI : 10.1038 / 418214a . ISSN  0028-0836 . PMID  12110897 . S2CID  4331004 .
  287. ^ Треворс, Джек Т .; Псеннер, Роланд (декабрь 2001 г.). «От самосборки жизни до современных бактерий: возможная роль наноэлементов» . FEMS Microbiology Reviews . 25 (5): 573–582. DOI : 10.1111 / j.1574-6976.2001.tb00592.x . ISSN  1574-6976 . PMID  11742692 .
  288. ^ Теобальд, Дуглас Л. (13 мая 2010 г.). «Формальный тест теории всеобщего общего предка». Природа . 465 (7295): 219–222. Bibcode : 2010Natur.465..219T . DOI : 10,1038 / природа09014 . ISSN  0028-0836 . PMID  20463738 . S2CID  4422345 .
  289. ^ Батест, Эрик; Уолш, Дэвид А. (июнь 2005 г.). «Верно ли« Кольцо жизни »?». Тенденции в микробиологии . 13 (6): 256–261. DOI : 10.1016 / j.tim.2005.03.012 . ISSN  0966-842X . PMID  15936656 .
  290. ^ Дарвин 1859 , стр. 1
  291. ^ Дулиттл, У. Форд; Батест, Эрик (13 февраля 2007 г.). «Паттерн плюрализм и гипотеза Древа жизни» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (7): 2043–2049. Bibcode : 2007PNAS..104.2043D . DOI : 10.1073 / pnas.0610699104 . ISSN  0027-8424 . PMC  1892968 . PMID  17261804 .
  292. ^ Кунин Виктор; Голдовский, Леон; Дарзентас, Никос; Узунис, Христос А. (июль 2005 г.). «Сеть жизни: реконструкция микробной филогенетической сети» . Геномные исследования . 15 (7): 954–959. DOI : 10.1101 / gr.3666505 . ISSN  1088-9051 . PMC  1172039 . PMID  15965028 .
  293. ^ Дарвин 1837 , стр. 25
  294. ^ Яблонски, Дэвид (25 июня 1999 г.). «Будущее летописи окаменелостей». Наука . 284 (5423): 2114–2116. DOI : 10.1126 / science.284.5423.2114 . ISSN  0036-8075 . PMID  10381868 . S2CID  43388925 .
  295. ^ Мейсон, Стивен Ф. (6 сентября 1984 г.). «Истоки биомолекулярной руки». Природа . 311 (5981): 19–23. Bibcode : 1984Natur.311 ... 19M . DOI : 10.1038 / 311019a0 . ISSN  0028-0836 . PMID  6472461 . S2CID  103653 .
  296. ^ Волк, Юрий I .; Рогозин, Игорь Б .; Гришин, Ник В .; Кунин, Евгений В. (1 сентября 2002 г.). «Геномные деревья и древо жизни». Тенденции в генетике . 18 (9): 472–479. DOI : 10.1016 / S0168-9525 (02) 02744-0 . ISSN  0168-9525 . PMID  12175808 .
  297. ^ Варки, Аджит ; Альтейде, Таша К. (декабрь 2005 г.). «Сравнение геномов человека и шимпанзе: поиск иголок в стоге сена». Геномные исследования . 15 (12): 1746–1758. CiteSeerX  10.1.1.673.9212 . DOI : 10.1101 / gr.3737405 . ISSN  1088-9051 . PMID  16339373 .
  298. ^ Ciccarelli, Francesca D .; Доеркс, Тобиас; фон Меринг, Кристиан; и другие. (3 марта 2006 г.). «На пути к автоматической реконструкции древо жизни с высоким разрешением» (PDF) . Наука . 311 (5765): 1283–1287. Bibcode : 2006Sci ... 311.1283C . CiteSeerX  10.1.1.381.95 14 . DOI : 10.1126 / science.1123061 . ISSN  0036-8075 . PMID  16513982 . S2CID  1615592 . Архивировано (PDF) из оригинала 04.03.2016.
  299. ^ а б Кавальер-Смит, Томас (29 июня 2006 г.). «Клеточная эволюция и история Земли: застой и революция» . Философские труды Королевского общества B . 361 (1470): 969–1006. DOI : 10.1098 / rstb.2006.1842 . ISSN  0962-8436 . PMC  1578732 . PMID  16754610 .
  300. ^ Шопф, Дж. Уильям (29 июня 2006 г.). «Ископаемые свидетельства архейской жизни» . Философские труды Королевского общества B . 361 (1470): 869–885. DOI : 10.1098 / rstb.2006.1834 . ISSN  0962-8436 . PMC  1578735 . PMID  16754604 .
    • Альтерманн, Владислав; Казмерчак, Юзеф (ноябрь 2003 г.). «Архейские микрофоссилии: переоценка ранней жизни на Земле». Исследования в области микробиологии . 154 (9): 611–617. DOI : 10.1016 / j.resmic.2003.08.006 . ISSN  0923-2508 . PMID  14596897 .
  301. ^ Шопф, Дж. Уильям (19 июля 1994 г.). «Несопоставимые скорости, разные судьбы: темп и способ эволюции изменились от докембрия к фанерозою» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 6735–6742. Bibcode : 1994PNAS ... 91.6735S . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.6735 . ISSN  0027-8424 . PMC  44277 . PMID  8041691 .
  302. ^ Пул, Энтони М .; Пенни, Дэвид (январь 2007 г.). «Оценка гипотез происхождения эукариот». BioEssays . 29 (1): 74–84. DOI : 10.1002 / bies.20516 . ISSN  0265-9247 . PMID  17187354 .
  303. ^ Dyall, Sabrina D .; Браун, Марк Т .; Джонсон, Патрисия Дж. (9 апреля 2004 г.). «Древние вторжения: от эндосимбионтов до органелл». Наука . 304 (5668): 253–257. Bibcode : 2004Sci ... 304..253D . DOI : 10.1126 / science.1094884 . ISSN  0036-8075 . PMID  15073369 . S2CID  19424594 .
  304. ^ Мартин, Уильям (октябрь 2005 г.). «Недостающее звено между гидрогеносомами и митохондриями». Тенденции в микробиологии . 13 (10): 457–459. DOI : 10.1016 / j.tim.2005.08.005 . ISSN  0966-842X . PMID  16109488 .
  305. ^ Ланг, Б. Франц; Грей, Майкл В .; Бургер, Гертрауд (декабрь 1999 г.). «Эволюция митохондриального генома и происхождение эукариот». Ежегодный обзор генетики . 33 : 351–397. DOI : 10.1146 / annurev.genet.33.1.351 . ISSN  0066-4197 . PMID  10690412 .
    • Макфадден, Джеффри Ян (1 декабря 1999 г.). «Эндосимбиоз и эволюция растительной клетки». Текущее мнение в биологии растений . 2 (6): 513–519. DOI : 10.1016 / S1369-5266 (99) 00025-4 . ISSN  1369-5266 . PMID  10607659 .
  306. ^ ДеЛонг, Эдвард Ф .; Пейс, Норман Р. (1 августа 2001 г.). «Экологическое разнообразие бактерий и архей». Систематическая биология . 50 (4): 470–478. CiteSeerX  10.1.1.321.8828 . DOI : 10.1080 / 106351501750435040 . ISSN  1063-5157 . PMID  12116647 .
  307. ^ Кайзер, Дейл (декабрь 2001 г.). «Построение многоклеточного организма». Ежегодный обзор генетики . 35 : 103–123. DOI : 10.1146 / annurev.genet.35.102401.090145 . ISSN  0066-4197 . PMID  11700279 . S2CID  18276422 .
  308. ^ Циммер, Карл (7 января 2016 г.). «Генетический переворот помог организмам перейти от одной клетки ко многим» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк. ISSN  0362-4331 . Архивировано 07 января 2016 года . Проверено 7 января 2016 .
  309. ^ Валентин, Джеймс У .; Яблонски, Дэвид; Эрвин, Дуглас Х. (1 марта 1999 г.). «Окаменелости, молекулы и эмбрионы: новые взгляды на кембрийский взрыв» . Развитие . 126 (5): 851–859. DOI : 10.1242 / dev.126.5.851 . ISSN  0950-1991 . PMID  9927587 . Архивировано 01 марта 2015 года . Проверено 30 декабря 2014 .
  310. ^ Оно, Сусуму (январь 1997 г.). «Причина, а также следствие кембрийского взрыва в эволюции животных». Журнал молекулярной эволюции . 44 (Приложение 1): S23 – S27. Bibcode : 1997JMolE..44S..23O . DOI : 10.1007 / PL00000055 . ISSN  0022-2844 . PMID  9071008 . S2CID  21879320 .
    • Валентин, Джеймс В .; Яблонски, Дэвид (2003). «Морфологическая и эволюционная макроэволюция: палеонтологическая перспектива» . Международный журнал биологии развития . 47 (7–8): 517–522. ISSN  0214-6282 . PMID  14756327 . Архивировано 24 октября 2014 года . Проверено 30 декабря 2014 .
  311. ^ Уотерс, Элизабет Р. (декабрь 2003 г.). «Молекулярная адаптация и происхождение наземных растений». Молекулярная филогенетика и эволюция . 29 (3): 456–463. DOI : 10.1016 / j.ympev.2003.07.018 . ISSN  1055-7903 . PMID  14615186 .
  312. ^ Мэйхью, Питер Дж. (Август 2007 г.). «Почему существует так много видов насекомых? Взгляды на окаменелости и филогении». Биологические обзоры . 82 (3): 425–454. DOI : 10.1111 / j.1469-185X.2007.00018.x . ISSN  1464-7931 . PMID  17624962 . S2CID  9356614 .
  313. ^ Кэрролл, Роберт Л. (май 2007 г.). «Палеозойское происхождение саламандр, лягушек и цецилий» . Зоологический журнал Линнеевского общества . 150 (Приложение s1): 1–140. DOI : 10.1111 / j.1096-3642.2007.00246.x . ISSN  1096-3642 .
  314. ^ Wible, John R .; Rougier, Guillermo W .; Новачек, Майкл Дж .; Ашер, Роберт Дж. (21 июня 2007 г.). «Меловые эвтерианы и лавразийское происхождение плацентарных млекопитающих вблизи границы К / Т». Природа . 447 (7147): 1003–1006. Bibcode : 2007Natur.447.1003W . DOI : 10,1038 / природа05854 . ISSN  0028-0836 . PMID  17581585 . S2CID  4334424 .
  315. ^ Уитмер, Лоуренс М. (28 июля 2011 г.). «Палеонтология: икона, сбитая с места». Природа . 475 (7357): 458–459. DOI : 10.1038 / 475458a . ISSN  0028-0836 . PMID  21796198 . S2CID  205066360 .
  316. ^ Бык, Джеймс Дж .; Вичман, Холли А. (ноябрь 2001 г.). «Прикладная эволюция». Ежегодный обзор экологии и систематики . 32 : 183–217. DOI : 10.1146 / annurev.ecolsys.32.081501.114020 . ISSN  1545-2069 .
  317. ^ Добли, Джон Ф .; Gaut, Brandon S .; Смит, Брюс Д. (29 декабря 2006 г.). «Молекулярная генетика одомашнивания сельскохозяйственных культур». Cell . 127 (7): 1309–1321. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.006 . ISSN  0092-8674 . PMID  17190597 . S2CID  278993 .
  318. ^ Якель, Кристиан; Каст, Питер; Хилверт, Дональд (июнь 2008 г.). «Белковый дизайн направленной эволюцией». Ежегодный обзор биофизики . 37 : 153–173. DOI : 10.1146 / annurev.biophys.37.032807.125832 . ISSN  1936-122X . PMID  18573077 .
  319. ^ Махер, Брендан (8 апреля 2009 г.). "Эволюция: следующая топ-модель биологии?" . Природа . 458 (7239): 695–698. DOI : 10.1038 / 458695a . ISSN  0028-0836 . PMID  19360058 . S2CID  41648315 .
  320. ^ Боровски, Ричард (8 января 2008 г.). «Восстановление зрения у слепых пещерных рыб». Текущая биология . 18 (1): R23 – R24. DOI : 10.1016 / j.cub.2007.11.023 . ISSN  0960-9822 . PMID  18177707 . S2CID  16967690 .
  321. ^ Гросс, Джошуа Б .; Боровски, Ричард; Табин, Клиффорд Дж. (2 января 2009 г.). Барш, Грегори С. (ред.). «Новая роль Mc1r в параллельной эволюции депигментации в независимых популяциях пещерной рыбы Astyanax mexicanus » . PLOS Genetics . 5 (1): e1000326. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1000326 . ISSN  1553-7390 . PMC  2603666 . PMID  19119422 .
  322. ^ Мерло, Лорен MF; Пеппер, Джон В .; Рид, Брайан Дж .; Малей, Карло С. (декабрь 2006 г.). «Рак как эволюционно-экологический процесс». Обзоры природы Рак . 6 (12): 924–935. DOI : 10.1038 / nrc2013 . ISSN  1474-175X . PMID  17109012 . S2CID  8040576 .
  323. ^ Пан, Дабо; Вэйвэй Сюэ; Венци Чжан; и другие. (Октябрь 2012 г.). «Понимание механизма лекарственной устойчивости вируса гепатита C NS3 / 4A к ITMN-191 из-за мутаций R155K, A156V, D168A / E: компьютерное исследование». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Общие предметы . 1820 (10): 1526–1534. DOI : 10.1016 / j.bbagen.2012.06.001 . ISSN  0304-4165 . PMID  22698669 .
  324. ^ Вудфорд, Нил; Эллингтон, Мэтью Дж. (Январь 2007 г.). «Возникновение устойчивости к антибиотикам путем мутации». Клиническая микробиология и инфекции . 13 (1): 5–18. DOI : 10.1111 / j.1469-0691.2006.01492.x . ISSN  1198-743X . PMID  17184282 .
  325. ^ Лаббе, Пьеррик; Бертикат, Клэр; Бертомье, Арно; и другие. (16 ноября 2007 г.). «Сорок лет неустойчивой эволюции устойчивости к инсектицидам у Mosquito Culex pipiens » . PLOS Genetics . 3 (11): e205. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0030205 . ISSN  1553-7390 . PMC  2077897 . PMID  18020711 .
  326. ^ Неве, Пол (октябрь 2007 г.). «Проблемы эволюции и управления устойчивостью к гербицидам: 50 лет после Харпера» . Исследования сорняков . 47 (5): 365–369. DOI : 10.1111 / j.1365-3180.2007.00581.x . ISSN  0043-1737 .
  327. ^ Родригес-Рохас, Александро; Родригес-Бельтран, Херонимо; Couce, Алехандро; Бласкес, Хесус (август 2013 г.). «Антибиотики и устойчивость к антибиотикам: ожесточенная борьба с эволюцией» . Международный журнал медицинской микробиологии . 303 (6–7): 293–297. DOI : 10.1016 / j.ijmm.2013.02.004 . ISSN  1438-4221 . PMID  23517688 .
  328. ^ Schenk, Martijn F .; Сендро, Иван Г .; Круг, Иоахим; де Виссер, Дж. Арьян GM (28 июня 2012 г.). «Количественная оценка адаптивного потенциала фермента устойчивости к антибиотикам» . PLOS Genetics . 8 (6): e1002783. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1002783 . ISSN  1553-7390 . PMC  3386231 . PMID  22761587 .
  329. ^ Прочтите, Эндрю Ф .; Линч, Пенелопа А .; Томас, Мэтью Б. (7 апреля 2009 г.). «Как сделать устойчивые к эволюции инсектициды для борьбы с малярией» . PLOS Биология . 7 (4): e1000058. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000058 . ISSN  1545-7885 . PMC  3279047 . PMID  19355786 .
  330. ^ Фрейзер, Алекс С. (18 января 1958 г.). "Монте-Карло анализ генетических моделей". Природа . 181 (4603): 208–209. Bibcode : 1958Natur.181..208F . DOI : 10.1038 / 181208a0 . ISSN  0028-0836 . PMID  13504138 . S2CID  4211563 .
  331. ^ Рехенберг 1973
  332. ^ Голландия 1975
  333. ^ Koza 1992
  334. ^ Джамшиди, Миссури (15 августа 2003 г.). «Инструменты интеллектуального управления: нечеткие контроллеры, нейронные сети и генетические алгоритмы». Философские труды Королевского общества А . 361 (1809): 1781–1808. Bibcode : 2003RSPTA.361.1781J . DOI : 10,1098 / rsta.2003.1225 . ISSN  1364-503X . PMID  12952685 . S2CID  34259612 .
  335. ^ Browne 2003 , стр. 376-379
  336. ^ Обзор философских, религиозных и космологических противоречий см .:
    • Деннет 1995
    О научном и социальном восприятии эволюции в 19-м и начале 20-го веков см .:
    • Джонстон, Ян К. (1999). «Раздел третий: истоки эволюционной теории» . ... И все же мы развиваемся: Справочник по ранней истории современной науки (3-е исправленное издание). Нанаймо, Британская Колумбия: Отделение гуманитарных исследований, Университет-колледж Маласпины . Архивировано 16 апреля 2016 года . Проверено 1 января 2015 .
    • Боулер 2003
    • Цукеркандль, Эмиль (30 декабря 2006 г.). «Интеллектуальный дизайн и биологическая сложность». Джин . 385 : 2–18. DOI : 10.1016 / j.gene.2006.03.025 . ISSN  0378-1119 . PMID  17011142 .
  337. ^ Росс, Маркус Р. (май 2005 г.). «Кто во что верит? Устранение путаницы по поводу разумного замысла и креационизма молодой Земли» (PDF) . Журнал геолого-геофизического образования . 53 (3): 319–323. Bibcode : 2005JGeEd..53..319R . CiteSeerX  10.1.1.404.1340 . DOI : 10.5408 / 1089-9995-53.3.319 . ISSN  1089-9995 . S2CID  14208021 . Архивировано (PDF) из оригинала 11 мая 2008 года . Проверено 28 апреля 2008 .
  338. ^ Хамид, Салман (12 декабря 2008 г.). «Поддержка исламского креационизма» (PDF) . Наука . 322 (5908): 1637–1638. DOI : 10.1126 / science.1163672 . ISSN  0036-8075 . PMID  19074331 . S2CID  206515329 . Архивировано из оригинального (PDF) 10 ноября 2014 года.
  339. ^ Боулер 2003
  340. ^ Миллер, Джон Д .; Скотт, Eugenie C .; Окамото, Синдзи (11 августа 2006 г.). «Общественное признание эволюции». Наука . 313 (5788): 765–766. DOI : 10.1126 / science.1126746 . ISSN  0036-8075 . PMID  16902112 . S2CID  152990938 .
  341. ^ Спергель, Давид Натаниэль ; Верде, Лисия; Пейрис, Хиранья V .; и другие. (2003). "Первый год наблюдений зонда Уилкинсона микроволновой анизотропии (WMAP): определение космологических параметров". Серия дополнений к астрофизическому журналу . 148 (1): 175–194. arXiv : astro-ph / 0302209 . Bibcode : 2003ApJS..148..175S . DOI : 10.1086 / 377226 . S2CID  10794058 .
  342. ^ Уайльд, Саймон А .; Вэлли, Джон В .; Пек, Уильям Х .; Грэм, Колин М. (11 января 2001 г.). «Доказательства существования континентальной коры и океанов на Земле 4,4 млрд лет назад по детритовым цирконам». Природа . 409 (6817): 175–178. Bibcode : 2001Natur.409..175W . DOI : 10.1038 / 35051550 . ISSN  0028-0836 . PMID  11196637 . S2CID  4319774 .
  343. ^ Бранч, Гленн (март 2007 г.). «Понимание креационизма после Китцмиллера » . Биология . 57 (3): 278–284. DOI : 10.1641 / B570313 . ISSN  0006-3568 . S2CID  86665329 .
  344. ^ Сяосин Цзинь (март 2019 г.). «Перевод и трансмутация: происхождение видов в Китае». Британский журнал истории науки . Кембридж: Издательство Кембриджского университета от имени Британского общества истории науки. 52 (1): 117–141. DOI : 10.1017 / S0007087418000808 . PMID  30587253 . S2CID  58605626 .

  • Альтенберг, Ли (1995). «Рост генома и эволюция карты генотип-фенотип». В Банцафе, Вольфганг; Экман, Фрэнк Х. (ред.). Эволюция и биокомпьютеры: вычислительные модели эволюции . Конспект лекций по информатике. 899 . Берлин; Нью-Йорк: Springer-Verlag Berlin Heidelberg . С. 205–259. CiteSeerX  10.1.1.493.6534 . DOI : 10.1007 / 3-540-59046-3_11 . ISBN 978-3-540-59046-0. ISSN  0302-9743 . LCCN  95005970 . OCLC  32049812 .
  • Айяла, Франсиско Дж .; Avise, Джон К. , ред. (2014). Основные материалы по эволюционной биологии . Балтимор, Мэриленд: Издательство Университета Джона Хопкинса. ISBN 978-1-4214-1305-1. LCCN  2013027718 . OCLC  854285705 .
  • Бердселл, Джон А .; Уиллс, Кристофер (2003). «Эволюционное происхождение и поддержание сексуальной рекомбинации: обзор современных моделей». В MacIntyre, Ross J .; Клегг, Майкл Т. (ред.). Эволюционная биология . Эволюционная биология. 33 . Нью-Йорк: Springer Science + Business Media . ISBN 978-1-4419-3385-0. ISSN  0071-3260 . OCLC  751583918 .
  • Боулер, Питер Дж. (1989). Менделирующая революция: появление наследственных концепций в современной науке и обществе . Балтимор, Мэриленд: Издательство Университета Джона Хопкинса. ISBN 978-0-8018-3888-0. LCCN  89030914 . OCLC  19322402 .
  • Боулер, Питер Дж. (2003). Эволюция: История идеи (3-е полностью исправленное и расширенное изд.). Беркли, Калифорния: Калифорнийский университет Press . ISBN 978-0-520-23693-6. LCCN  2002007569 . OCLC  49824702 .
  • Браун, Джанет (2003). Чарльз Дарвин: Сила места . 2 . Лондон: Пимлико . ISBN 978-0-7126-6837-8. LCCN  94006598 . OCLC  52327000 .
  • Буркхардт, Фредерик ; Смит, Сидней, ред. (1991). Переписка Чарльза Дарвина . Переписка Чарльза Дарвина. 7 : 1858–1859. Кембридж: Издательство Кембриджского университета . ISBN 978-0-521-38564-0. LCCN  84045347 . OCLC  185662993 .
  • Кэрролл, Шон Б .; Гренье, Дженнифер К .; Уэтерби, Скотт Д. (2005). От ДНК к разнообразию: молекулярная генетика и эволюция дизайна животных (2-е изд.). Молден, Массачусетс: издательство Blackwell Publishing . ISBN 978-1-4051-1950-4. LCCN  2003027991 . OCLC  53972564 .
  • Чепмен, Артур Д. (2009). Численность живых видов в Австралии и мире (2-е изд.). Канберра: Департамент окружающей среды, водных ресурсов, наследия и искусства : Австралийское исследование биологических ресурсов . ISBN 978-0-642-56860-1. OCLC  780539206 . Архивировано 25 декабря 2016 года . Проверено 6 ноября 2016 .
  • Койн, Джерри А. (2009). Почему эволюция верна . Нью-Йорк: Викинг . ISBN 978-0-670-02053-9. LCCN  2008033973 . OCLC  233549529 .
  • Крафт, Джоэл ; Байби, Роджер В., ред. (2005). Эволюционная наука и общество: образование нового поколения (PDF) . Колорадо-Спрингс, Колорадо: Изучение учебной программы по биологическим наукам . ISBN 978-1-929614-23-3. OCLC  64228003 . Архивировано из оригинального (PDF) 18 июля 2015 года . Проверено 6 декабря 2014 . «Пересмотренные материалы симпозиума BSCS, AIBS, ноябрь 2004 г., Чикаго, Иллинойс»
  • Далримпл, Дж. Брент (2001). «Возраст Земли в двадцатом веке: проблема (в основном) решена». В Льюисе, CLE; Knell, SJ (ред.). Возраст Земли: от 4004 г. до н.э. до н.э. 2002 . Геологическое общество, Лондон, специальные публикации . Специальное издание Геологического общества. 190 . С. 205–221. Bibcode : 2001GSLSP.190..205D . DOI : 10,1144 / gsl.sp.2001.190.01.14 . ISBN 978-1-86239-093-5. LCCN  2003464816 . OCLC  48570033 . S2CID  130092094 .
  • Дарвин, Чарльз (1837). Блокнот «Б» .Записную книжку можно получить на сайте The Complete Work of Charles Darwin Online . Проверено 9 октября 2019.
  • Дарвин, Чарльз (1859). О происхождении видов путем естественного отбора или о сохранении благоприятных рас в борьбе за жизнь (1-е изд.). Лондон: Джон Мюррей . LCCN  06017473 . OCLC  741260650 .Книгу можно найти на сайте The Complete Work of Charles Darwin Online . Проверено 21 ноября 2014.
  • Дарвин, Чарльз (1872). Выражение эмоций у человека и животных . Лондон: Джон Мюррей. LCCN  04002793 . OCLC  1102785 .
  • Дарвин, Фрэнсис , изд. (1909). Основы происхождения видов, очерк 1842 г. (PDF) . Кембридж: Напечатано в University Press. LCCN  61057537 . OCLC  1184581 . Проверено 27 ноября 2014 .
  • Докинз, Ричард (1990). Слепой часовщик . Наука о пингвинах. Лондон: Книги Пингвинов . ISBN 978-0-14-014481-9. OCLC  60143870 .
  • Деннет, Дэниел (1995). Опасная идея Дарвина: эволюция и смысл жизни . Нью-Йорк: Саймон и Шустер . ISBN 978-0-684-80290-9. LCCN  94049158 . OCLC  31867409 .
  • Добжанский, Феодосий (1968). «О некоторых фундаментальных концепциях дарвиновской биологии». У Добжанского, Феодосия; Hecht, Max K .; Стир, Уильям К. (ред.). Эволюционная биология. Том 2 (1-е изд.). Нью-Йорк: Appleton-Century-Crofts . С. 1–34. DOI : 10.1007 / 978-1-4684-8094-8_1 . ISBN 978-1-4684-8096-2. OCLC  24875357 .
  • Добжанский, Феодосий (1970). Генетика эволюционного процесса . Нью-Йорк: издательство Колумбийского университета . ISBN 978-0-231-02837-0. LCCN  72127363 . OCLC  97663 .
  • Элдридж, Найлз ; Гулд, Стивен Джей (1972). «Прерывистое равновесие: альтернатива филетической постепенности». В Schopf, Thomas JM (ред.). Модели в палеобиологии . Сан-Франциско, Калифорния: Фриман, Купер. ISBN 978-0-87735-325-6. LCCN  72078387 . OCLC  572084 .
    • Элдридж, Найлз (1985). Временные рамки: переосмысление дарвиновской эволюции и теории прерывистых равновесий . Нью-Йорк: Саймон и Шустер . ISBN 978-0-671-49555-8. LCCN  84023632 . OCLC  11443805 .
  • Юенс, Уоррен Дж. (2004). Математическая популяционная генетика . Междисциплинарная прикладная математика. Я . Теоретическое введение (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer-Verlag New York . ISBN 978-0-387-20191-7. LCCN  2003065728 . OCLC  53231891 .
  • Фишер, Рональд А. (1930). Генетическая теория естественного отбора . Оксфорд: The Clarendon Press . ISBN 978-0-19-850440-5. LCCN  30029177 . OCLC  18500548 .
  • Футуйма, Дуглас Дж. (2004). «Плод древа жизни: взгляд на эволюцию и экологию». In Cracraft, Джоэл; Донохью, Майкл Дж. (Ред.). Сборка Древа Жизни . Оксфорд; Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета . ISBN 978-0-19-517234-8. LCCN  2003058012 . OCLC  61342697 . "Труды симпозиума, проведенного в Американском музее естественной истории в Нью-Йорке, 2002 г."
  • Футуйма, Дуглас Дж. (2005). Эволюция . Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates . ISBN 978-0-87893-187-3. LCCN  2004029808 . OCLC  57311264 .
  • Футуйма, Дуглас Дж .; Киркпатрик, Марк (2017). Эволюция (Четвертое изд.). Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates. ISBN 978-1-60535-605-1. LCCN  2017000562 . OCLC  969439375 .
  • Гулд, Стивен Джей (2002). Структура эволюционной теории . Кембридж, Массачусетс : Belknap Press of Harvard University Press . ISBN 978-0-674-00613-3. LCCN  2001043556 . OCLC  47869352 .
  • Грей, Питер (2007). Психология (5-е изд.). Нью-Йорк: Издательство Worth . ISBN 978-0-7167-0617-5. LCCN  2006921149 . OCLC  76872504 .
  • Холл, Брайан К .; Халльгримссон, Бенедикт (2008). Эволюция Стрикбергера (4-е изд.). Садбери, Массачусетс: издательство «Джонс и Бартлетт». ISBN 978-0-7637-0066-9. LCCN  2007008981 . OCLC  85814089 .
  • Хенниг, Вилли (1999) [Первоначально опубликовано в 1966 году (переиздано в 1979 году); перевод неопубликованной редакции автора Grundzüge einer Theorie der phylogenetischen Systematik , опубликованной в 1950 г.]. Филогенетическая систематика . Перевод Д. Дуайта Дэвиса и Райнера Зангерля; предисловие Донна Э. Розена, Гарета Нельсона и Колина Паттерсона (переиздание). Урбана, Иллинойс: Университет Иллинойса Press . ISBN 978-0-252-06814-0. LCCN  78031969 . OCLC  722701473 .
  • Голландия, Джон Х. (1975). Адаптация в естественных и искусственных системах: вводный анализ с приложениями к биологии, контролю и искусственному интеллекту . Анн-Арбор, Мичиган: Мичиганский университет Press . ISBN 978-0-472-08460-9. LCCN  74078988 . OCLC  1531617 .
  • Яблонька, Ева ; Лэмб, Мэрион Дж. (2005). Эволюция в четырех измерениях: генетические, эпигенетические, поведенческие и символические вариации в истории жизни . Иллюстрации Анны Зелиговски. Кембридж, Массачусетс: MIT Press . ISBN 978-0-262-10107-3. LCCN  2004058193 . OCLC  61896061 .
  • Кампуракис, Костас (2014). Понимание эволюции . Кембридж; Нью-Йорк: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-1-107-03491-4. LCCN  2013034917 . OCLC  855585457 .
  • Кирк, Джеффри ; Рэйвен, Джон ; Шофилд, Малкольм (1983). Досократические философы: критическая история с подборкой текстов (2-е изд.). Кембридж; Нью-Йорк: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-27455-5. LCCN  82023505 . OCLC  9081712 .
  • Коза, Джон Р. (1992). Генетическое программирование: о программировании компьютеров посредством естественного отбора . Сложные адаптивные системы. Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-11170-6. LCCN  92025785 . OCLC  26263956 .
  • Ламарк, Жан-Батист (1809). Philosophie Zoologique . Париж: Dentu et L'Auteur. OCLC  2210044 . Philosophie zoologique (1809) в Интернет-архиве . Проверено 29 ноября 2014.
  • Лейн, Дэвид Х. (1996). Феномен Тейяра: пророк новой эпохи (1-е изд.). Мейкон, Джорджия: Издательство Университета Мерсер . ISBN 978-0-86554-498-7. LCCN  96008777 . OCLC  34710780 .
  • Левинсон, Джин (2019). Переосмысление эволюции: революция, которая скрывается на виду . Хакенсак, Нью-Джерси: World Scientific . ISBN 978-1-78634-726-8. LCCN  2019013762 . OCLC  1138095098 .
  • Лукреций . «Книга V, строки 855–877» . De Rerum Natura . Цифровая библиотека Персея . Отредактировано и переведено Уильямом Эллери Леонардом (1916). Медфорд / Сомервилль, Массачусетс: Университет Тафтса . OCLC  33233743 . Архивировано 4 сентября 2014 года . Проверено 25 ноября 2014 .
  • Мейсон, Стивен Ф. (1962). История наук . Книги Кольера. Научная библиотека, CS9 (Новая редакция). Нью-Йорк: Книги Кольера . LCCN  62003378 . OCLC  568032626 .
  • Мэйнард Смит, Джон (1978). Эволюция секса . Кембридж; Нью-Йорк: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-29302-0. LCCN  77085689 . OCLC  3413793 .
  • Мейнард Смит, Джон (1998). «Единицы отбора». In Bock, Gregory R .; Гуд, Джейми А. (ред.). Пределы редукционизма в биологии . Симпозиум Фонда Новартис . Симпозиумы Фонда Новартис. 213 . Чичестер ; Нью-Йорк: Джон Вили и сыновья . С. 203–221. DOI : 10.1002 / 9780470515488.ch15 . ISBN 978-0-471-97770-4. LCCN  98002779 . OCLC  38311600 . PMID  9653725 . «Доклады симпозиума о границах редукционизма в биологии, состоявшегося в Фонде Новартис, Лондон, 13–15 мая 1997 г.».
  • Майр, Эрнст (1942). Систематика и происхождение видов с точки зрения зоолога . Колумбийская биологическая серия. 13 . Нью-Йорк: издательство Колумбийского университета. LCCN  43001098 . OCLC  766053 .
  • Майр, Эрнст (1982). Рост биологической мысли: разнообразие, эволюция и наследование . Перевод Джона Рэя Э. Силка. Кембридж, Массачусетс: Belknap Press . ISBN 978-0-674-36445-5. LCCN  81013204 . OCLC  7875904 .
  • Майр, Эрнст (2002) [Первоначально опубликовано в 2001 году; Нью-Йорк: Основные книги ]. Что такое эволюция . Мастера наук. Лондон: Вайденфельд и Николсон . ISBN 978-0-297-60741-0. LCCN  2001036562 . OCLC  248107061 .
  • Маккинни, Майкл Л. (1997). «Как редкие виды избегают исчезновения? Палеонтологический взгляд». В Kunin, William E .; Гастон, Кевин Дж. (Ред.). Биология редкости: причины и последствия редких — общих различий (1-е изд.). Лондон; Нью-Йорк: Чепмен и Холл . ISBN 978-0-412-63380-5. LCCN  96071014 . OCLC  36442106 .
  • Миллер, Дж. Тайлер; Спулмен, Скотт Э. (2012). Наука об окружающей среде (14-е изд.). Белмонт, Калифорния: Брукс / Коул . ISBN 978-1-111-98893-7. LCCN  2011934330 . OCLC  741539226 . Проверено 27 декабря 2014 .
  • Мур, Рэнди; Декер, Марк; Котнер, Сехоя (2010). Хронология противоречий между эволюцией и креационизмом . Санта-Барбара, Калифорния: Greenwood Press / ABC-CLIO . ISBN 978-0-313-36287-3. LCCN  2009039784 . OCLC  422757410 .
  • Нардон, Пол; Гренье, Анн-Мари (1991). "Теория серийного эндосимбиоза и эволюция долгоносиков: роль симбиоза". В Маргулисе, Линн; Фестер, Рене (ред.). Симбиоз как источник эволюционных инноваций: видообразование и морфогенез . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-13269-5. LCCN  90020439 . OCLC  22597587 . "На основе конференции, состоявшейся в Белладжио, Италия, 25–30 июня 1989 г."
  • Национальная академия наук ; Институт медицины (2008 г.). Наука, эволюция и креационизм . Вашингтон, округ Колумбия: Национальная академия прессы. ISBN 978-0-309-10586-6. LCCN  2007015904 . OCLC  123539346 . Проверено 22 ноября 2014 .
  • Одум, Евгений П. (1971). Основы экологии (3-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Сондерс . ISBN 978-0-7216-6941-0. LCCN  76081826 . OCLC  154846 .
  • Окаша, Самир (2006). Эволюция и уровни отбора . Оксфорд; Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-926797-2. LCCN  2006039679 . OCLC  70985413 .
  • Панно, Джозеф (2005). Клетка: эволюция первого организма . Факты о файловой библиотеке. Нью-Йорк: факты в файле . ISBN 978-0-8160-4946-2. LCCN  2003025841 . OCLC  53901436 .
  • Пятигорский, Иорам; Канторов, Марк; Гопал-Шривастава, Рашми; Томарев, Станислав И. (1994). «Рекрутирование ферментов и стрессовых белков в качестве кристаллинов хрусталика». Янссон, Бенгт; Йорнвалль, Ганс; Ридберг, Ульф; и другие. (ред.). К молекулярным основам употребления и злоупотребления алкоголем . Exs . Experientia. 71 . Базель; Бостон: Birkhäuser Verlag . С. 241–50. DOI : 10.1007 / 978-3-0348-7330-7_24 . ISBN 978-3-7643-2940-2. LCCN  94010167 . OCLC  30030941 . PMID  8032155 .
  • Пильуччи, Массимо ; Мюллер, Герд Б. , ред. (2010). Эволюция, расширенный синтез . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-51367-8. LCCN  2009024587 . OCLC  804875316 . Архивировано 18 сентября 2015 года.
  • Почевиль, Арно; Данчин, Этьен (2017). «Глава 3: Генетическая ассимиляция и парадокс слепой вариации» . В Huneman, Филипп; Уолш, Денис М. (ред.). Бросая вызов современному синтезу . Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-937717-6. LCCN  2017448929 . OCLC  1001337947 .
  • Provine, Уильям Б. (1971). Истоки теоретической популяционной генетики . Чикагская история науки и медицины (2-е изд.). Чикаго, Иллинойс: Издательство Чикагского университета . ISBN 978-0-226-68464-2. LCCN  2001027561 . OCLC  46660910 .
  • Рэйвен, Питер Х .; Джонсон, Джордж Б. (2002). Биология (6-е изд.). Бостон, Массачусетс: Макгроу-Хилл . ISBN 978-0-07-112261-0. LCCN  2001030052 . OCLC  45806501 .
  • Рэй, Джон (1686). Historia Plantarum [ История растений ]. Я . Londini: Typis Mari Clark. LCCN  agr11000774 . OCLC  2126030 .
  • Рехенберг, Инго (1973). Evolutionsstrategie; Optimierung technischer Systeme nach Prinzipien der biologischen Evolution (кандидатская диссертация). Problemata (на немецком языке). 15 . Послесловие Манфреда Эйгена . Штутгарт-Бад-Каннштатт: Фромманн-Хольцбуг. ISBN 978-3-7728-0373-4. LCCN  74320689 . OCLC  9020616 .
  • Ридли, Марк (2004). Эволюция . Оксфорд: Блэквелл. ISBN 978-1405103459.
  • Стернс, Беверли Петерсон; Стернс, Стивен С. (1999). Наблюдая с края вымирания . Нью-Хейвен, Коннектикут: Издательство Йельского университета . ISBN 978-0-300-08469-6. LCCN  98034087 . OCLC  803522914 .
  • Стивенс, Энтони (1982). Архетип: естественная история личности . Лондон: Рутледж и Кеган Пол . ISBN 978-0-7100-0980-7. LCCN  84672250 . OCLC  10458367 .
  • Воет, Дональд ; Воет, Джудит Г .; Пратт, Шарлотта В. (2016). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (Пятое изд.). Хобокен, Нью-Джерси : John Wiley & Sons . ISBN 978-1-11-891840-1. LCCN  2016002847 . OCLC  939245154 .
  • Вест-Эберхард, Мэри Джейн (2003). Пластичность развития и эволюция . Оксфорд; Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-512235-0. LCCN  2001055164 . OCLC  48398911 .
  • Wiley, EO ; Либерман, Брюс С. (2011). Филогенетика: теория и практика филогенетической систематики (2-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли-Блэквелл . DOI : 10.1002 / 9781118017883 . ISBN 978-0-470-90596-8. LCCN  2010044283 . OCLC  741259265 .
  • Райт, Сьюэлл (1984). Генетические и биометрические основы . Эволюция и генетика популяций. 1 . Чикаго, Иллинойс: Издательство Чикагского университета. ISBN 978-0-226-91038-3. LCCN  67025533 . OCLC  246124737 .

Вступительное чтение

  • Барретт, Пол Х .; Weinshank, Donald J .; Готтлебер, Тимоти Т., ред. (1981). Соответствие Дарвиновскому "Происхождению видов", первое издание . Итака, Нью-Йорк: Издательство Корнельского университета . ISBN 978-0-8014-1319-3. LCCN  80066893 . OCLC  610057960 .
  • Кэрролл, Шон Б. (2005). Бесконечные самые красивые формы: новая наука о Evo Devo и создание животного царства . иллюстрации Джейми В. Кэрролла, Джоша П. Клэйсса, Линн М. Олдс (1-е изд.). Нью-Йорк: WW Norton & Company. ISBN 978-0-393-06016-4. LCCN  2004029388 . OCLC  57316841 .
  • Чарльзуорт, Брайан ; Чарльзуорт, Дебора (2003). Эволюция: очень краткое введение . Очень короткие введения. Оксфорд; Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-280251-4. LCCN  2003272247 . OCLC  51668497 .
  • Гулд, Стивен Джей (1989). Замечательная жизнь: сланцы Берджесс и природа истории (1-е изд.). Нью-Йорк: WW Norton & Company. ISBN 978-0-393-02705-1. LCCN  88037469 . OCLC  18983518 .
  • Джонс, Стив (1999). Почти как кит: обновлено происхождение видов . Лондон; Нью-Йорк: Даблдей . ISBN 978-0-385-40985-8. LCCN  2002391059 . OCLC  41420544 .
    • —— (2000). Призрак Дарвина: обновленное происхождение видов (1-е изд.). Нью-Йорк: Рэндом Хаус . ISBN 978-0-375-50103-6. LCCN  99053246 . OCLC  42690131 . Американская версия.
  • Мадер, Сильвия С. (2007). Биология . Значительный вклад Мюррей П. Пендарвис (9-е изд.). Бостон, Массачусетс: Высшее образование Макгроу-Хилла . ISBN 978-0-07-246463-4. LCCN  2005027781 . OCLC  61748307 .
  • Мэйнард Смит, Джон (1993). Теория эволюции (Canto ed.). Кембридж; Нью-Йорк: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-45128-4. LCCN  93020358 . OCLC  27676642 .
  • Паллен, Марк Дж. (2009). Грубый путеводитель по эволюции . Rough Guides Справочные руководства. Лондон; Нью-Йорк: грубые путеводители . ISBN 978-1-85828-946-5. LCCN  2009288090 . OCLC  233547316 .

Расширенное чтение

  • Бартон, Николас Х .; Бриггс, Дерек Э.Г . ; Эйзен, Джонатан А .; и другие. (2007). Эволюция . Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк: Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. ISBN 978-0-87969-684-9. LCCN  2007010767 . OCLC  86090399 .
  • Койн, Джерри А .; Орр, Х. Аллен (2004). Видообразование . Сандерленд, Массачусетс: Sinauer Associates. ISBN 978-0-87893-089-0. LCCN  2004009505 . OCLC  55078441 .
  • Бергстром, Карл Т .; Дугаткин, Ли Алан (2012). Эволюция (1-е изд.). Нью-Йорк: WW Norton & Company. ISBN 978-0-393-91341-5. LCCN  2011036572 . OCLC  729341924 .
  • Холл, Брайан К .; Олсон, Венди, ред. (2003). Ключевые слова и понятия в эволюционной биологии развития . Кембридж, Массачусетс: Издательство Гарвардского университета. ISBN 978-0-674-00904-2. LCCN  2002192201 . OCLC  50761342 .
  • Кауфман, Стюарт А. (1993). Истоки порядка: самоорганизация и отбор в эволюции . Нью-Йорк; Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-507951-7. LCCN  91011148 . OCLC  895048122 .
  • Мэйнард Смит, Джон; Szathmáry, Eörs (1995). Основные переходы в эволюции . Оксфорд; Нью-Йорк: WH Freeman Spektrum. ISBN 978-0-7167-4525-9. LCCN  94026965 . OCLC  30894392 .
  • Майр, Эрнст (2001). Что такое эволюция . Нью-Йорк: Основные книги. ISBN 978-0-465-04426-9. LCCN  2001036562 . OCLC  47443814 .
  • Минелли, Алессандро (2009). Формы становления: эволюционная биология развития . Перевод Марка Эпштейна. Принстон, Нью-Джерси; Оксфорд: Издательство Принстонского университета . ISBN 978-0-691-13568-7. LCCN  2008028825 . OCLC  233030259 .

Послушайте эту статью ( 34 минуты )
Spoken Wikipedia icon
Этот аудиофайл был создан на основе редакции этой статьи от 18 апреля 2005 г.  ( 2005-04-18 ), и не отражает последующих изменений.
( Аудио справка  · Больше устных статей )

Основная информация

  • «Эволюция» на канале In Our Time на BBC
  • «Эволюционные ресурсы национальных академий» . Вашингтон, округ Колумбия: Национальная академия наук . Проверено 30 мая 2011 .
  • «Понимание эволюции: ваш универсальный ресурс для получения информации об эволюции» . Беркли, Калифорния: Калифорнийский университет в Беркли . Проверено 30 мая 2011 .
  • «Эволюция эволюции - 150 лет книги Дарвина« Происхождение видов » » . Округ Арлингтон, Вирджиния: Национальный научный фонд . Проверено 30 мая 2011 .
  • "Интерактивная хронология эволюции человека" . Смитсоновский институт , Национальный музей естественной истории . 2010-01-28 . Проверено 14 июля 2018 . Требуется Adobe Flash.

Эксперименты

  • Ленский, Richard E . «Экспериментальная эволюция» . Ист-Лансинг, Мичиган: Университет штата Мичиган . Проверено 31 июля 2013 .
  • Честейн, Эрик; Ливнат, Ади; Пападимитриу, Христос ; Вазирани, Умеш (22 июля 2014 г.). «Алгоритмы, игры и эволюция» . Proc. Natl. Акад. Sci. США 111 (29): 10620–10623. Bibcode : 2014PNAS..11110620C . DOI : 10.1073 / pnas.1406556111 . ISSN  0027-8424 . PMC  4115542 . PMID  24979793 .

Онлайн-лекции

  • «Серия лекций по вопросам эволюции» . Портал онлайн-обучения Гарварда . Кембридж, Массачусетс: Гарвардский университет . Архивировано из оригинала на 2017-12-18 . Проверено 15 июля 2018 .
  • Стернс, Стивен К. "EEB 122: принципы эволюции, экологии и поведения" . Открытые курсы Йельского университета . Нью-Хейвен, Коннектикут: Йельский университет . Архивировано 01 декабря 2017 года . Проверено 14 июля 2018 .